Result of FASTA (ccds) for pF1KB5943
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB5943, 508 aa
  1>>>pF1KB5943 508 - 508 aa - 508 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1749+/-0.000769; mu= 18.8434+/- 0.047
 mean_var=65.5997+/-12.462, 0's: 0 Z-trim(107.4): 10  B-trim: 0 in 0/51
 Lambda= 0.158352
 statistics sampled from 9525 (9533) to 9525 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.661), E-opt: 0.2 (0.293), width:  16
 Scan time:  3.320

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS44465.1 DNTT gene_id:1791|Hs108|chr10          ( 508) 3362 777.0       0
CCDS7447.1 DNTT gene_id:1791|Hs108|chr10           ( 509) 3350 774.2       0
CCDS34625.1 POLM gene_id:27434|Hs108|chr7          ( 494) 1183 279.2 7.5e-75
CCDS64635.1 POLM gene_id:27434|Hs108|chr7          ( 457)  583 142.1 1.3e-33
CCDS64636.1 POLM gene_id:27434|Hs108|chr7          ( 508)  414 103.5 5.9e-22
CCDS7513.1 POLL gene_id:27343|Hs108|chr10          ( 575)  344 87.5 4.3e-17
CCDS76332.1 POLL gene_id:27343|Hs108|chr10         ( 300)  293 75.7   8e-14
CCDS6129.1 POLB gene_id:5423|Hs108|chr8            ( 335)  281 73.0 5.9e-13


>>CCDS44465.1 DNTT gene_id:1791|Hs108|chr10               (508 aa)
 initn: 3362 init1: 3362 opt: 3362  Z-score: 4147.4  bits: 777.0 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 3362; 99.8% identity (99.8% similar) in 508 aa overlap (1-508:1-508)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MDPPRASHLSPRKKRPRQTGALMASSPQDIKFQDLVVFILEKKMGTTRRAFLMELARRKG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MDPPRASHLSPRKKRPRQTGALMASSPQDIKFQDLVVFILEKKMGTTRRAFLMELARRKG
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 FRVENELSDSVTHIVAENNSGSDVLEWLQAQKVQVSSQPELLDVSWLIECIGAGKPVEMT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::
CCDS44 FRVENELSDSVTHIVAENNSGSDVLEWLQAQKVQVSSQPELLDVSWLIECIRAGKPVEMT
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB5 GKHQLVVRRDYSDSTNPGPPKTPPIAVQKISQYACQRRTTLNNCNQIFTDAFDILAENCE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 GKHQLVVRRDYSDSTNPGPPKTPPIAVQKISQYACQRRTTLNNCNQIFTDAFDILAENCE
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB5 FRENEDSCVTFMRAASVLKSLPFTIISMKDTEGIPCLGSKVKGIIEEIIEDGESSEVKAV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 FRENEDSCVTFMRAASVLKSLPFTIISMKDTEGIPCLGSKVKGIIEEIIEDGESSEVKAV
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB5 LNDERYQSFKLFTSVFGVGLKTSEKWFRMGFRTLSKVRSDKSLKFTRMQKAGFLYYEDLV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 LNDERYQSFKLFTSVFGVGLKTSEKWFRMGFRTLSKVRSDKSLKFTRMQKAGFLYYEDLV
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB5 SCVTRAEAEAVSVLVKEAVWAFLPDAFVTMTGGFRRGKKMGHDVDFLITSPGSTEDEEQL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SCVTRAEAEAVSVLVKEAVWAFLPDAFVTMTGGFRRGKKMGHDVDFLITSPGSTEDEEQL
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB5 LQKVMNLWEKKGLLLYYDLVESTFEKLRLPSRKVDALDHFQKCFLIFKLPRQRVDSDQSS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 LQKVMNLWEKKGLLLYYDLVESTFEKLRLPSRKVDALDHFQKCFLIFKLPRQRVDSDQSS
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB5 WQEGKTWKAIRVDLVLCPYERRAFALLGWTGSRFERDLRRYATHERKMILDNHALYDKTK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 WQEGKTWKAIRVDLVLCPYERRAFALLGWTGSRFERDLRRYATHERKMILDNHALYDKTK
              430       440       450       460       470       480

              490       500        
pF1KB5 RIFLKAESEEEIFAHLGLDYIEPWERNA
       ::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 RIFLKAESEEEIFAHLGLDYIEPWERNA
              490       500        

>>CCDS7447.1 DNTT gene_id:1791|Hs108|chr10                (509 aa)
 initn: 2994 init1: 2994 opt: 3350  Z-score: 4132.6  bits: 774.2 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 3350; 99.6% identity (99.6% similar) in 509 aa overlap (1-508:1-509)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MDPPRASHLSPRKKRPRQTGALMASSPQDIKFQDLVVFILEKKMGTTRRAFLMELARRKG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 MDPPRASHLSPRKKRPRQTGALMASSPQDIKFQDLVVFILEKKMGTTRRAFLMELARRKG
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 FRVENELSDSVTHIVAENNSGSDVLEWLQAQKVQVSSQPELLDVSWLIECIGAGKPVEMT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::
CCDS74 FRVENELSDSVTHIVAENNSGSDVLEWLQAQKVQVSSQPELLDVSWLIECIRAGKPVEMT
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB5 GKHQLVVRRDYSDSTNPGPPKTPPIAVQKISQYACQRRTTLNNCNQIFTDAFDILAENCE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 GKHQLVVRRDYSDSTNPGPPKTPPIAVQKISQYACQRRTTLNNCNQIFTDAFDILAENCE
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB5 FRENEDSCVTFMRAASVLKSLPFTIISMKDTEGIPCLGSKVKGIIEEIIEDGESSEVKAV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 FRENEDSCVTFMRAASVLKSLPFTIISMKDTEGIPCLGSKVKGIIEEIIEDGESSEVKAV
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB5 LNDERYQSFKLFTSVFGVGLKTSEKWFRMGFRTLSKVRSDKSLKFTRMQKAGFLYYEDLV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 LNDERYQSFKLFTSVFGVGLKTSEKWFRMGFRTLSKVRSDKSLKFTRMQKAGFLYYEDLV
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB5 SCVTRAEAEAVSVLVKEAVWAFLPDAFVTMTGGFRRGKKMGHDVDFLITSPGSTEDEEQL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 SCVTRAEAEAVSVLVKEAVWAFLPDAFVTMTGGFRRGKKMGHDVDFLITSPGSTEDEEQL
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB5 LQKVMNLWEKKGLLLYYDLVESTFEKLRLPSRKVDALDHFQKCFLIFKLPRQRVDSDQSS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 LQKVMNLWEKKGLLLYYDLVESTFEKLRLPSRKVDALDHFQKCFLIFKLPRQRVDSDQSS
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450        460       470         
pF1KB5 WQEGKTWKAIRVDLVLCPYERRAFALLGWTGSR-FERDLRRYATHERKMILDNHALYDKT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 WQEGKTWKAIRVDLVLCPYERRAFALLGWTGSRQFERDLRRYATHERKMILDNHALYDKT
              430       440       450       460       470       480

     480       490       500        
pF1KB5 KRIFLKAESEEEIFAHLGLDYIEPWERNA
       :::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 KRIFLKAESEEEIFAHLGLDYIEPWERNA
              490       500         

>>CCDS34625.1 POLM gene_id:27434|Hs108|chr7               (494 aa)
 initn: 1013 init1: 375 opt: 1183  Z-score: 1457.3  bits: 279.2 E(32554): 7.5e-75
Smith-Waterman score: 1287; 41.3% identity (69.9% similar) in 508 aa overlap (11-508:3-494)

               10           20        30        40        50       
pF1KB5 MDPPRASHLSPRKKRPR---QTGALMASSPQDIKFQDLVVFILEKKMGTTRRAFLMELAR
                 :...: :    .:   .:.: . .:  ......: .:: .:::::  :::
CCDS34         MLPKRRRARVGSPSGDAASSTPPSTRFPGVAIYLVEPRMGRSRRAFLTGLAR
                       10        20        30        40        50  

        60        70        80        90           100       110   
pF1KB5 RKGFRVENELSDSVTHIVAENNSGSDVLEWLQAQKVQVS----SQPELLDVSWLIECIGA
        ::::: .  :. .::.: :..:. ... : : ... ..    . : :::.::: : .::
CCDS34 SKGFRVLDACSSEATHVVMEETSAEEAVSW-QERRMAAAPPGCTPPALLDISWLTESLGA
             60        70        80         90       100       110 

           120       130       140       150       160       170   
pF1KB5 GKPVEMTGKHQLVVRRDYSDSTNPGPPKTPPIAVQKISQYACQRRTTLNNCNQIFTDAFD
       :.:: .  .:.: :          :: : : ..   .  ::::: : :.. :  ...:..
CCDS34 GQPVPVECRHRLEV---------AGPRKGP-LSPAWMPAYACQRPTPLTHHNTGLSEALE
             120                130        140       150       160 

           180       190       200       210       220       230   
pF1KB5 ILAENCEFRENEDSCVTFMRAASVLKSLPFTIISMKDTEGIPCLGSKVKGIIEEIIEDGE
       ::::   :. .:   .:: :::::::.::  . .... .:.: .: . . ...:..: : 
CCDS34 ILAEAAGFEGSEGRLLTFCRAASVLKALPSPVTTLSQLQGLPHFGEHSSRVVQELLEHGV
             170       180       190       200       210       220 

           240       250       260       270       280       290   
pF1KB5 SSEVKAVLNDERYQSFKLFTSVFGVGLKTSEKWFRMGFRTLSKVRSDKSLKFTRMQKAGF
         ::. :  .::::..::::..::::.::...:.: :.:::. .: ..  :.:..::::.
CCDS34 CEEVERVRRSERYQTMKLFTQIFGVGVKTADRWYREGLRTLDDLR-EQPQKLTQQQKAGL
             230       240       250       260        270       280

           300       310       320       330       340       350   
pF1KB5 LYYEDLVSCVTRAEAEAVSVLVKEAVWAFLPDAFVTMTGGFRRGKKMGHDVDFLITSPGS
        ...:: . : :....:.. .:.:::   :: : ::.:::::::: .::::::::: :  
CCDS34 QHHQDLSTPVLRSDVDALQQVVEEAVGQALPGATVTLTGGFRRGKLQGHDVDFLITHPKE
              290       300       310       320       330       340

           360       370       380       390         400       410 
pF1KB5 TEDEEQLLQKVMNLWEKKGLLLYYDLVESTFEKLRLPSR--KVDALDHFQKCFLIFKLPR
        . :  :: .::   . .::.::..  .:  :.   :.:  . . .: :.. : ::.::.
CCDS34 GQ-EAGLLPRVMCRLQDQGLILYHQHQHSCCES---PTRLAQQSHMDAFERSFCIFRLPQ
               350       360       370          380       390      

             420       430       440       450        460       470
pF1KB5 QRVDSDQSSWQEGKTWKAIRVDLVLCPYERRAFALLGWTGSR-FERDLRRYATHERKMIL
           .  .: .   .:::.:::::. :  .  :::::::::. :.:.:::.. .:. . :
CCDS34 PPGAAVGGSTRPCPSWKAVRVDLVVAPVSQFPFALLGWTGSKLFQRELRRFSRKEKGLWL
        400       410       420       430       440       450      

              480       490       500        
pF1KB5 DNHALYDKTKRIFLKAESEEEIFAHLGLDYIEPWERNA
       ..:.:.:  .. :..: :::.:: ::::.:. : .:::
CCDS34 NSHGLFDPEQKTFFQAASEEDIFRHLGLEYLPPEQRNA
        460       470       480       490    

>>CCDS64635.1 POLM gene_id:27434|Hs108|chr7               (457 aa)
 initn: 783 init1: 375 opt: 583  Z-score: 717.0  bits: 142.1 E(32554): 1.3e-33
Smith-Waterman score: 979; 36.2% identity (62.4% similar) in 508 aa overlap (11-508:3-457)

               10           20        30        40        50       
pF1KB5 MDPPRASHLSPRKKRPR---QTGALMASSPQDIKFQDLVVFILEKKMGTTRRAFLMELAR
                 :...: :    .:   .:.: . .:  ......: .:: .:::::  :::
CCDS64         MLPKRRRARVGSPSGDAASSTPPSTRFPGVAIYLVEPRMGRSRRAFLTGLAR
                       10        20        30        40        50  

        60        70        80        90           100       110   
pF1KB5 RKGFRVENELSDSVTHIVAENNSGSDVLEWLQAQKVQVS----SQPELLDVSWLIECIGA
        ::::: .  :. .::.: :..:. ... : : ... ..    . : :::.::: : .::
CCDS64 SKGFRVLDACSSEATHVVMEETSAEEAVSW-QERRMAAAPPGCTPPALLDISWLTESLGA
             60        70        80         90       100       110 

           120       130       140       150       160       170   
pF1KB5 GKPVEMTGKHQLVVRRDYSDSTNPGPPKTPPIAVQKISQYACQRRTTLNNCNQIFTDAFD
       :.:: .  .:.: :          :: : : ..   .  ::::: : :.. :  ...:..
CCDS64 GQPVPVECRHRLEV---------AGPRKGP-LSPAWMPAYACQRPTPLTHHNTGLSEALE
             120                130        140       150       160 

           180       190       200       210       220       230   
pF1KB5 ILAENCEFRENEDSCVTFMRAASVLKSLPFTIISMKDTEGIPCLGSKVKGIIEEIIEDGE
       ::::   :. .:   .:: :::::::.::  . .... .:.: .: . . ...:..: : 
CCDS64 ILAEAAGFEGSEGRLLTFCRAASVLKALPSPVTTLSQLQGLPHFGEHSSRVVQELLEHGV
             170       180       190       200       210       220 

           240       250       260       270       280       290   
pF1KB5 SSEVKAVLNDERYQSFKLFTSVFGVGLKTSEKWFRMGFRTLSKVRSDKSLKFTRMQKAGF
         ::. :  .::::..::::..::::.::...:.: :.:::. .: ..  :.:..:::  
CCDS64 CEEVERVRRSERYQTMKLFTQIFGVGVKTADRWYREGLRTLDDLR-EQPQKLTQQQKA--
             230       240       250       260        270          

           300       310       320       330       340       350   
pF1KB5 LYYEDLVSCVTRAEAEAVSVLVKEAVWAFLPDAFVTMTGGFRRGKKMGHDVDFLITSPGS
                     :       . ::    : :     ::   : . :    .     : 
CCDS64 --------------APPGPEHPSPAVRCRCPAA-----GG---GGSCGAGPAW-----GH
                    280       290               300            310 

           360       370       380       390         400       410 
pF1KB5 TEDEEQLLQKVMNLWEKKGLLLYYDLVESTFEKLRLPSR--KVDALDHFQKCFLIFKLPR
        . ...: :         ::.::..  .:  :.   :.:  . . .: :.. : ::.::.
CCDS64 RHADRRLPQ---------GLILYHQHQHSCCES---PTRLAQQSHMDAFERSFCIFRLPQ
             320                330          340       350         

             420       430       440       450        460       470
pF1KB5 QRVDSDQSSWQEGKTWKAIRVDLVLCPYERRAFALLGWTGSR-FERDLRRYATHERKMIL
           .  .: .   .:::.:::::. :  .  :::::::::. :.:.:::.. .:. . :
CCDS64 PPGAAVGGSTRPCPSWKAVRVDLVVAPVSQFPFALLGWTGSKLFQRELRRFSRKEKGLWL
     360       370       380       390       400       410         

              480       490       500        
pF1KB5 DNHALYDKTKRIFLKAESEEEIFAHLGLDYIEPWERNA
       ..:.:.:  .. :..: :::.:: ::::.:. : .:::
CCDS64 NSHGLFDPEQKTFFQAASEEDIFRHLGLEYLPPEQRNA
     420       430       440       450       

>>CCDS64636.1 POLM gene_id:27434|Hs108|chr7               (508 aa)
 initn: 586 init1: 226 opt: 414  Z-score: 507.7  bits: 103.5 E(32554): 5.9e-22
Smith-Waterman score: 616; 29.6% identity (53.0% similar) in 477 aa overlap (11-477:3-383)

               10           20        30        40        50       
pF1KB5 MDPPRASHLSPRKKRPR---QTGALMASSPQDIKFQDLVVFILEKKMGTTRRAFLMELAR
                 :...: :    .:   .:.: . .:  ......: .:: .:::::  :::
CCDS64         MLPKRRRARVGSPSGDAASSTPPSTRFPGVAIYLVEPRMGRSRRAFLTGLAR
                       10        20        30        40        50  

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pF1KB5 RKGFRVENELSDSVTHIVAENNSGSDVLEWLQAQKVQVS----SQPELLDVSWLIECIGA
        ::::: .  :. .::.: :..:. ... : : ... ..    . : :::.::: : .::
CCDS64 SKGFRVLDACSSEATHVVMEETSAEEAVSW-QERRMAAAPPGCTPPALLDISWLTESLGA
             60        70        80         90       100       110 

           120       130       140       150       160       170   
pF1KB5 GKPVEMTGKHQLVVRRDYSDSTNPGPPKTPPIAVQKISQYACQRRTTLNNCNQIFTDAFD
       :.:: .  .:.: :          . :.  :..   .  ::::: : :.. :  ...:..
CCDS64 GQPVPVECRHRLEV----------AGPRKGPLSPAWMPAYACQRPTPLTHHNTGLSEALE
             120                 130       140       150       160 

           180       190       200       210       220       230   
pF1KB5 ILAENCEFRENEDSCVTFMRAASVLKSLPFTIISMKDTEGIPCLGSKVKGIIEEIIEDGE
       ::::   :. .:   .:: :::::::.::  . .... .:.: .: . . ...:..: : 
CCDS64 ILAEAAGFEGSEGRLLTFCRAASVLKALPSPVTTLSQLQGLPHFGEHSSRVVQELLEHGV
             170       180       190       200       210       220 

           240       250       260       270       280       290   
pF1KB5 SSEVKAVLNDERYQSFKLFTSVFGVGLKTSEKWFRMGFRTLSKVRSDKSLKFTRMQKAGF
         ::. :  .::  .                                           : 
CCDS64 CEEVERVRRSERAPA-----------------------------------------PPGP
             230                                                240

           300       310       320       330       340       350   
pF1KB5 LYYEDLVSCVTRAEAEAVSVLVKEAVWAFLPDAFVTMTGGFRRGKKMGHDVDFLITSPGS
        .    : :  :  : . .                   :.   :   ::           
CCDS64 EHPSPAVRC--RCPAAGGG-------------------GSCGAGPAWGH-----------
                250                          260                   

           360       370       380       390         400       410 
pF1KB5 TEDEEQLLQKVMNLWEKKGLLLYYDLVESTFEKLRLPSR--KVDALDHFQKCFLIFKLPR
        . ...: :         ::.::..  .:  :.   :.:  . . .: :.. : ::.::.
CCDS64 RHADRRLPQ---------GLILYHQHQHSCCES---PTRLAQQSHMDAFERSFCIFRLPQ
      270                280       290          300       310      

             420       430       440       450        460       470
pF1KB5 QRVDSDQSSWQEGKTWKAIRVDLVLCPYERRAFALLGWTGSR-FERDLRRYATHERKMIL
           .  .: .   .:::.:::::. :  .  :::::::::. :.:.:::.. .:. . :
CCDS64 PPGAAVGGSTRPCPSWKAVRVDLVVAPVSQFPFALLGWTGSKLFQRELRRFSRKEKGLWL
        320       330       340       350       360       370      

              480       490       500                              
pF1KB5 DNHALYDKTKRIFLKAESEEEIFAHLGLDYIEPWERNA                      
       ..:.:.:                                                     
CCDS64 NSHGLFDPEQGSSSGKTPRSRKSCFCCRRHFSKRLQRKTSSDTWALSTFLQSRETPEPAC
        380       390       400       410       420       430      

>>CCDS7513.1 POLL gene_id:27343|Hs108|chr10               (575 aa)
 initn: 318 init1: 123 opt: 344  Z-score: 420.4  bits: 87.5 E(32554): 4.3e-17
Smith-Waterman score: 432; 28.1% identity (58.0% similar) in 381 aa overlap (140-507:229-574)

     110       120       130       140         150       160       
pF1KB5 CIGAGKPVEMTGKHQLVVRRDYSDSTNPGPPKTPPIAVQK--ISQYACQRRTTLNNCNQI
                                     :.  : ...:   .: . :. :   : :  
CCDS75 SDGEETQVSAADLEALISGHYPTSLEGDCEPSPAPAVLDKWVCAQPSSQKAT---NHNLH
      200       210       220       230       240       250        

       170       180       190       200       210       220       
pF1KB5 FTDAFDILAENCEFRENEDSCVTFMRAASVLKSLPFTIISMKDTEGIPCLGSKVKGIIEE
       .:. ...::.    . ..   . . .: ..:::.   . :.... .:: .:...   : :
CCDS75 ITEKLEVLAKAYSVQGDKWRALGYAKAINALKSFHKPVTSYQEACSIPGIGKRMAEKIIE
         260       270       280       290       300       310     

       230       240       250       260       270       280       
pF1KB5 IIEDGESSEVKAVLNDERYQSFKLFTSVFGVGLKTSEKWFRMGFRTLSKVRSDKSLKFTR
       :.:.:.  ..  .  .:    ..::....:.: ::.. :...:::.:  .::. ::  : 
CCDS75 ILESGHLRKLDHI--SESVPVLELFSNIWGAGTKTAQMWYQQGFRSLEDIRSQASL--TT
         320         330       340       350       360         370 

       290       300       310       320       330       340       
pF1KB5 MQKAGFLYYEDLVSCVTRAEAEAVSVLVKEAVWAFLPDAFVTMTGGFRRGKKMGHDVDFL
       .:  :. .: :..  . : ::  .   :..:. ::    . .  :..::::    ::: :
CCDS75 QQAIGLKHYSDFLERMPREEATEIEQTVQKAAQAFNSGLLCVACGSYRRGKATCGDVDVL
             380       390       400       410       420       430 

       350       360       370       380       390       400       
pF1KB5 ITSPGSTEDEEQLLQKVMNLWEKKGLLLYYDLVESTFEKLRLPSRKVDALDHFQKCFLIF
       :: : . .... .......  ...:.:   :::          :.. .. .  :: . . 
CCDS75 ITHPDG-RSHRGIFSRLLDSLRQEGFLTD-DLV----------SQEENGQQ--QKYLGVC
              440       450        460                 470         

       410       420       430       440       450        460      
pF1KB5 KLPRQRVDSDQSSWQEGKTWKAIRVDLVLCPYERRAFALLGWTGS-RFERDLRRYATHER
       .::             :   .  :.:... :: . : ::: .::: .:.:..:  : . .
CCDS75 RLP-------------GPGRRHRRLDIIVVPYSEFACALLYFTGSAHFNRSMRALA-KTK
       480                    490       500       510       520    

        470       480                 490       500        
pF1KB5 KMILDNHALYDKTKRI----------FLKAESEEEIFAHLGLDYIEPWERNA
        : :..:::   . :            : . .:...:  ::: : :: ::. 
CCDS75 GMSLSEHALSTAVVRNTHGCKVGPGRVLPTPTEKDVFRLLGLPYREPAERDW
           530       540       550       560       570     

>>CCDS76332.1 POLL gene_id:27343|Hs108|chr10              (300 aa)
 initn: 318 init1: 123 opt: 293  Z-score: 361.6  bits: 75.7 E(32554): 8e-14
Smith-Waterman score: 381; 29.7% identity (58.4% similar) in 310 aa overlap (209-507:22-299)

      180       190       200       210       220       230        
pF1KB5 CEFRENEDSCVTFMRAASVLKSLPFTIISMKDTEGIPCLGSKVKGIIEEIIEDGESSEVK
                                     :.. .:: .:...   : ::.:.:.  .. 
CCDS76          MLMHHQKYLQRFLGGKREKKQKEACSIPGIGKRMAEKIIEILESGHLRKLD
                        10        20        30        40        50 

      240       250       260       270       280       290        
pF1KB5 AVLNDERYQSFKLFTSVFGVGLKTSEKWFRMGFRTLSKVRSDKSLKFTRMQKAGFLYYED
        .  .:    ..::....:.: ::.. :...:::.:  .::. ::  : .:  :. .: :
CCDS76 HI--SESVPVLELFSNIWGAGTKTAQMWYQQGFRSLEDIRSQASL--TTQQAIGLKHYSD
                60        70        80        90         100       

      300       310       320       330       340       350        
pF1KB5 LVSCVTRAEAEAVSVLVKEAVWAFLPDAFVTMTGGFRRGKKMGHDVDFLITSPGSTEDEE
       ..  . : ::  .   :..:. ::    . .  :..::::    ::: ::: : . ....
CCDS76 FLERMPREEATEIEQTVQKAAQAFNSGLLCVACGSYRRGKATCGDVDVLITHPDG-RSHR
       110       120       130       140       150       160       

      360       370       380       390       400       410        
pF1KB5 QLLQKVMNLWEKKGLLLYYDLVESTFEKLRLPSRKVDALDHFQKCFLIFKLPRQRVDSDQ
        .......  ...:.:   :::          :.. .. .  :: . . .::        
CCDS76 GIFSRLLDSLRQEGFLTD-DLV----------SQEENGQQ--QKYLGVCRLP--------
        170       180                  190         200             

      420       430       440       450        460       470       
pF1KB5 SSWQEGKTWKAIRVDLVLCPYERRAFALLGWTGS-RFERDLRRYATHERKMILDNHALYD
            :   .  :.:... :: . : ::: .::: .:.:..:  : . . : :..:::  
CCDS76 -----GPGRRHRRLDIIVVPYSEFACALLYFTGSAHFNRSMRALA-KTKGMSLSEHALST
              210       220       230       240        250         

       480                 490       500        
pF1KB5 KTKRI----------FLKAESEEEIFAHLGLDYIEPWERNA
        . :            : . .:...:  ::: : :: ::. 
CCDS76 AVVRNTHGCKVGPGRVLPTPTEKDVFRLLGLPYREPAERDW
     260       270       280       290       300

>>CCDS6129.1 POLB gene_id:5423|Hs108|chr8                 (335 aa)
 initn: 127 init1:  66 opt: 281  Z-score: 346.1  bits: 73.0 E(32554): 5.9e-13
Smith-Waterman score: 317; 24.1% identity (59.7% similar) in 345 aa overlap (173-507:17-334)

            150       160       170       180           190        
pF1KB5 PPIAVQKISQYACQRRTTLNNCNQIFTDAFDILAENCEFRENEDSCV----TFMRAASVL
                                     :.:.:  .:..: .. .    .. .::::.
CCDS61               MSKRKAPQETLNGGITDMLTELANFEKNVSQAIHKYNAYRKAASVI
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CCDS61 FDYIQWKYREPKDRSE
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