Result of FASTA (ccds) for pF1KB8470
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB8470, 822 aa
  1>>>pF1KB8470 822 - 822 aa - 822 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 13.0124+/-0.00193; mu= -18.2095+/- 0.106
 mean_var=633.9392+/-147.817, 0's: 0 Z-trim(105.4): 324  B-trim: 0 in 0/53
 Lambda= 0.050939
 statistics sampled from 8120 (8394) to 8120 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.607), E-opt: 0.2 (0.258), width:  16
 Scan time:  3.980

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS35050.1 NTRK2 gene_id:4915|Hs108|chr9          ( 822) 5638 431.4  3e-120
CCDS35052.1 NTRK2 gene_id:4915|Hs108|chr9          ( 537) 3621 283.0 9.4e-76
CCDS35053.1 NTRK2 gene_id:4915|Hs108|chr9          ( 477) 3209 252.6 1.1e-66
CCDS35051.1 NTRK2 gene_id:4915|Hs108|chr9          ( 553) 3204 252.3 1.6e-66
CCDS6671.1 NTRK2 gene_id:4915|Hs108|chr9           ( 838) 3204 252.5 2.1e-66
CCDS10340.1 NTRK3 gene_id:4916|Hs108|chr15         ( 825) 2118 172.7 2.2e-42
CCDS58399.1 NTRK3 gene_id:4916|Hs108|chr15         ( 817) 2104 171.7 4.5e-42
CCDS30890.1 NTRK1 gene_id:4914|Hs108|chr1          ( 760) 1622 136.2   2e-31
CCDS30891.1 NTRK1 gene_id:4914|Hs108|chr1          ( 790) 1622 136.3   2e-31
CCDS1161.1 NTRK1 gene_id:4914|Hs108|chr1           ( 796) 1615 135.7 2.9e-31
CCDS32322.1 NTRK3 gene_id:4916|Hs108|chr15         ( 839) 1425 121.8 4.8e-27
CCDS81916.1 NTRK3 gene_id:4916|Hs108|chr15         ( 617) 1385 118.7   3e-26
CCDS626.1 ROR1 gene_id:4919|Hs108|chr1             ( 937)  860 80.3 1.6e-14
CCDS73785.1 IGF1R gene_id:3480|Hs108|chr15         (1366)  847 79.6 4.1e-14
CCDS10378.1 IGF1R gene_id:3480|Hs108|chr15         (1367)  847 79.6 4.1e-14
CCDS42487.1 INSR gene_id:3643|Hs108|chr19          (1370)  847 79.6 4.1e-14
CCDS12176.1 INSR gene_id:3643|Hs108|chr19          (1382)  847 79.6 4.1e-14
CCDS75419.1 DDR1 gene_id:780|Hs108|chr6            ( 767)  831 78.1 6.3e-14
CCDS4690.1 DDR1 gene_id:780|Hs108|chr6             ( 876)  831 78.2 6.9e-14
CCDS56411.1 DDR1 gene_id:780|Hs108|chr6            ( 894)  831 78.2   7e-14
CCDS34385.1 DDR1 gene_id:780|Hs108|chr6            ( 913)  831 78.2 7.1e-14
CCDS6691.1 ROR2 gene_id:4920|Hs108|chr9            ( 943)  820 77.4 1.3e-13
CCDS1160.1 INSRR gene_id:3645|Hs108|chr1           (1297)  822 77.7 1.4e-13
CCDS1241.1 DDR2 gene_id:4921|Hs108|chr1            ( 855)  808 76.5 2.2e-13
CCDS33172.1 ALK gene_id:238|Hs108|chr2             (1620)  793 75.7 7.2e-13
CCDS47396.1 DDR1 gene_id:780|Hs108|chr6            ( 919)  783 74.7 8.2e-13
CCDS3353.1 FGFR3 gene_id:2261|Hs108|chr4           ( 806)  764 73.2   2e-12
CCDS10078.1 LTK gene_id:4058|Hs108|chr15           ( 803)  761 73.0 2.3e-12
CCDS10077.1 LTK gene_id:4058|Hs108|chr15           ( 864)  761 73.0 2.4e-12
CCDS54706.1 FGFR3 gene_id:2261|Hs108|chr4          ( 808)  757 72.7 2.8e-12
CCDS44486.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10         ( 709)  752 72.3 3.3e-12
CCDS4886.1 PTK7 gene_id:5754|Hs108|chr6            ( 940)  749 72.2 4.7e-12
CCDS3354.1 FGFR3 gene_id:2261|Hs108|chr4           ( 694)  732 70.8 9.1e-12
CCDS4885.1 PTK7 gene_id:5754|Hs108|chr6            (1030)  734 71.1 1.1e-11
CCDS4410.1 FGFR4 gene_id:2264|Hs108|chr5           ( 802)  730 70.7 1.1e-11
CCDS81514.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10         ( 593)  724 70.1 1.2e-11
CCDS43731.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8          ( 731)  726 70.4 1.3e-11
CCDS43730.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8          ( 733)  726 70.4 1.3e-11
CCDS44488.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10         ( 680)  725 70.3 1.3e-11
CCDS43732.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8          ( 820)  726 70.4 1.4e-11
CCDS6107.2 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8           ( 822)  726 70.4 1.4e-11
CCDS53584.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10         ( 707)  724 70.2 1.4e-11
CCDS44489.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10         ( 769)  725 70.3 1.4e-11
CCDS55223.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8          ( 853)  726 70.4 1.4e-11
CCDS73210.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10         ( 732)  724 70.2 1.4e-11
CCDS55221.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8          ( 812)  725 70.3 1.4e-11
CCDS55222.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8          ( 820)  725 70.4 1.5e-11
CCDS7620.2 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10          ( 822)  725 70.4 1.5e-11
CCDS31298.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10         ( 821)  724 70.3 1.5e-11
CCDS44487.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10         ( 705)  720 69.9 1.7e-11


>>CCDS35050.1 NTRK2 gene_id:4915|Hs108|chr9               (822 aa)
 initn: 5638 init1: 5638 opt: 5638  Z-score: 2272.4  bits: 431.4 E(32554): 3e-120
Smith-Waterman score: 5638; 100.0% identity (100.0% similar) in 822 aa overlap (1-822:1-822)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MSSWIRWHGPAMARLWGFCWLVVGFWRAAFACPTSCKCSASRIWCSDPSPGIVAFPRLEP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 MSSWIRWHGPAMARLWGFCWLVVGFWRAAFACPTSCKCSASRIWCSDPSPGIVAFPRLEP
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB8 NSVDPENITEIFIANQKRLEIINEDDVEAYVGLRNLTIVDSGLKFVAHKAFLKNSNLQHI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 NSVDPENITEIFIANQKRLEIINEDDVEAYVGLRNLTIVDSGLKFVAHKAFLKNSNLQHI
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB8 NFTRNKLTSLSRKHFRHLDLSELILVGNPFTCSCDIMWIKTLQEAKSSPDTQDLYCLNES
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 NFTRNKLTSLSRKHFRHLDLSELILVGNPFTCSCDIMWIKTLQEAKSSPDTQDLYCLNES
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB8 SKNIPLANLQIPNCGLPSANLAAPNLTVEEGKSITLSCSVAGDPVPNMYWDVGNLVSKHM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 SKNIPLANLQIPNCGLPSANLAAPNLTVEEGKSITLSCSVAGDPVPNMYWDVGNLVSKHM
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB8 NETSHTQGSLRITNISSDDSGKQISCVAENLVGEDQDSVNLTVHFAPTITFLESPTSDHH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 NETSHTQGSLRITNISSDDSGKQISCVAENLVGEDQDSVNLTVHFAPTITFLESPTSDHH
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB8 WCIPFTVKGNPKPALQWFYNGAILNESKYICTKIHVTNHTEYHGCLQLDNPTHMNNGDYT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 WCIPFTVKGNPKPALQWFYNGAILNESKYICTKIHVTNHTEYHGCLQLDNPTHMNNGDYT
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB8 LIAKNEYGKDEKQISAHFMGWPGIDDGANPNYPDVIYEDYGTAANDIGDTTNRSNEIPST
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 LIAKNEYGKDEKQISAHFMGWPGIDDGANPNYPDVIYEDYGTAANDIGDTTNRSNEIPST
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB8 DVTDKTGREHLSVYAVVVIASVVGFCLLVMLFLLKLARHSKFGMKGPASVISNDDDSASP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 DVTDKTGREHLSVYAVVVIASVVGFCLLVMLFLLKLARHSKFGMKGPASVISNDDDSASP
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB8 LHHISNGSNTPSSSEGGPDAVIIGMTKIPVIENPQYFGITNSQLKPDTFVQHIKRHNIVL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 LHHISNGSNTPSSSEGGPDAVIIGMTKIPVIENPQYFGITNSQLKPDTFVQHIKRHNIVL
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB8 KRELGEGAFGKVFLAECYNLCPEQDKILVAVKTLKDASDNARKDFHREAELLTNLQHEHI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 KRELGEGAFGKVFLAECYNLCPEQDKILVAVKTLKDASDNARKDFHREAELLTNLQHEHI
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB8 VKFYGVCVEGDPLIMVFEYMKHGDLNKFLRAHGPDAVLMAEGNPPTELTQSQMLHIAQQI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 VKFYGVCVEGDPLIMVFEYMKHGDLNKFLRAHGPDAVLMAEGNPPTELTQSQMLHIAQQI
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB8 AAGMVYLASQHFVHRDLATRNCLVGENLLVKIGDFGMSRDVYSTDYYRVGGHTMLPIRWM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 AAGMVYLASQHFVHRDLATRNCLVGENLLVKIGDFGMSRDVYSTDYYRVGGHTMLPIRWM
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KB8 PPESIMYRKFTTESDVWSLGVVLWEIFTYGKQPWYQLSNNEVIECITQGRVLQRPRTCPQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 PPESIMYRKFTTESDVWSLGVVLWEIFTYGKQPWYQLSNNEVIECITQGRVLQRPRTCPQ
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820  
pF1KB8 EVYELMLGCWQREPHMRKNIKGIHTLLQNLAKASPVYLDILG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 EVYELMLGCWQREPHMRKNIKGIHTLLQNLAKASPVYLDILG
              790       800       810       820  

>>CCDS35052.1 NTRK2 gene_id:4915|Hs108|chr9               (537 aa)
 initn: 3649 init1: 3621 opt: 3621  Z-score: 1473.5  bits: 283.0 E(32554): 9.4e-76
Smith-Waterman score: 3621; 99.8% identity (100.0% similar) in 529 aa overlap (1-529:1-529)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MSSWIRWHGPAMARLWGFCWLVVGFWRAAFACPTSCKCSASRIWCSDPSPGIVAFPRLEP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 MSSWIRWHGPAMARLWGFCWLVVGFWRAAFACPTSCKCSASRIWCSDPSPGIVAFPRLEP
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB8 NSVDPENITEIFIANQKRLEIINEDDVEAYVGLRNLTIVDSGLKFVAHKAFLKNSNLQHI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 NSVDPENITEIFIANQKRLEIINEDDVEAYVGLRNLTIVDSGLKFVAHKAFLKNSNLQHI
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB8 NFTRNKLTSLSRKHFRHLDLSELILVGNPFTCSCDIMWIKTLQEAKSSPDTQDLYCLNES
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 NFTRNKLTSLSRKHFRHLDLSELILVGNPFTCSCDIMWIKTLQEAKSSPDTQDLYCLNES
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB8 SKNIPLANLQIPNCGLPSANLAAPNLTVEEGKSITLSCSVAGDPVPNMYWDVGNLVSKHM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 SKNIPLANLQIPNCGLPSANLAAPNLTVEEGKSITLSCSVAGDPVPNMYWDVGNLVSKHM
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB8 NETSHTQGSLRITNISSDDSGKQISCVAENLVGEDQDSVNLTVHFAPTITFLESPTSDHH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 NETSHTQGSLRITNISSDDSGKQISCVAENLVGEDQDSVNLTVHFAPTITFLESPTSDHH
              250       260       270       280       290       300

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pF1KB8 WCIPFTVKGNPKPALQWFYNGAILNESKYICTKIHVTNHTEYHGCLQLDNPTHMNNGDYT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 WCIPFTVKGNPKPALQWFYNGAILNESKYICTKIHVTNHTEYHGCLQLDNPTHMNNGDYT
              310       320       330       340       350       360

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pF1KB8 LIAKNEYGKDEKQISAHFMGWPGIDDGANPNYPDVIYEDYGTAANDIGDTTNRSNEIPST
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 LIAKNEYGKDEKQISAHFMGWPGIDDGANPNYPDVIYEDYGTAANDIGDTTNRSNEIPST
              370       380       390       400       410       420

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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 DVTDKTGREHLSVYAVVVIASVVGFCLLVMLFLLKLARHSKFGMKGPASVISNDDDSASP
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pF1KB8 LHHISNGSNTPSSSEGGPDAVIIGMTKIPVIENPQYFGITNSQLKPDTFVQHIKRHNIVL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.           
CCDS35 LHHISNGSNTPSSSEGGPDAVIIGMTKIPVIENPQYFGITNSQLKPDTWPRGSPKTA   
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pF1KB8 KRELGEGAFGKVFLAECYNLCPEQDKILVAVKTLKDASDNARKDFHREAELLTNLQHEHI

>>CCDS35053.1 NTRK2 gene_id:4915|Hs108|chr9               (477 aa)
 initn: 3209 init1: 3209 opt: 3209  Z-score: 1310.4  bits: 252.6 E(32554): 1.1e-66
Smith-Waterman score: 3209; 100.0% identity (100.0% similar) in 466 aa overlap (1-466:1-466)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MSSWIRWHGPAMARLWGFCWLVVGFWRAAFACPTSCKCSASRIWCSDPSPGIVAFPRLEP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 MSSWIRWHGPAMARLWGFCWLVVGFWRAAFACPTSCKCSASRIWCSDPSPGIVAFPRLEP
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 NSVDPENITEIFIANQKRLEIINEDDVEAYVGLRNLTIVDSGLKFVAHKAFLKNSNLQHI
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 NFTRNKLTSLSRKHFRHLDLSELILVGNPFTCSCDIMWIKTLQEAKSSPDTQDLYCLNES
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KB8 NETSHTQGSLRITNISSDDSGKQISCVAENLVGEDQDSVNLTVHFAPTITFLESPTSDHH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 NETSHTQGSLRITNISSDDSGKQISCVAENLVGEDQDSVNLTVHFAPTITFLESPTSDHH
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pF1KB8 WCIPFTVKGNPKPALQWFYNGAILNESKYICTKIHVTNHTEYHGCLQLDNPTHMNNGDYT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 WCIPFTVKGNPKPALQWFYNGAILNESKYICTKIHVTNHTEYHGCLQLDNPTHMNNGDYT
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 LIAKNEYGKDEKQISAHFMGWPGIDDGANPNYPDVIYEDYGTAANDIGDTTNRSNEIPST
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::              
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pF1KB8 LHHISNGSNTPSSSEGGPDAVIIGMTKIPVIENPQYFGITNSQLKPDTFVQHIKRHNIVL

>>CCDS35051.1 NTRK2 gene_id:4915|Hs108|chr9               (553 aa)
 initn: 3607 init1: 3201 opt: 3204  Z-score: 1307.7  bits: 252.3 E(32554): 1.6e-66
Smith-Waterman score: 3579; 96.9% identity (97.1% similar) in 545 aa overlap (1-529:1-545)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MSSWIRWHGPAMARLWGFCWLVVGFWRAAFACPTSCKCSASRIWCSDPSPGIVAFPRLEP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 MSSWIRWHGPAMARLWGFCWLVVGFWRAAFACPTSCKCSASRIWCSDPSPGIVAFPRLEP
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pF1KB8 NSVDPENITEIFIANQKRLEIINEDDVEAYVGLRNLTIVDSGLKFVAHKAFLKNSNLQHI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 NSVDPENITEIFIANQKRLEIINEDDVEAYVGLRNLTIVDSGLKFVAHKAFLKNSNLQHI
               70        80        90       100       110       120

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pF1KB8 NFTRNKLTSLSRKHFRHLDLSELILVGNPFTCSCDIMWIKTLQEAKSSPDTQDLYCLNES
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 NFTRNKLTSLSRKHFRHLDLSELILVGNPFTCSCDIMWIKTLQEAKSSPDTQDLYCLNES
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pF1KB8 SKNIPLANLQIPNCGLPSANLAAPNLTVEEGKSITLSCSVAGDPVPNMYWDVGNLVSKHM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 SKNIPLANLQIPNCGLPSANLAAPNLTVEEGKSITLSCSVAGDPVPNMYWDVGNLVSKHM
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pF1KB8 NETSHTQGSLRITNISSDDSGKQISCVAENLVGEDQDSVNLTVHFAPTITFLESPTSDHH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 NETSHTQGSLRITNISSDDSGKQISCVAENLVGEDQDSVNLTVHFAPTITFLESPTSDHH
              250       260       270       280       290       300

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pF1KB8 WCIPFTVKGNPKPALQWFYNGAILNESKYICTKIHVTNHTEYHGCLQLDNPTHMNNGDYT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 WCIPFTVKGNPKPALQWFYNGAILNESKYICTKIHVTNHTEYHGCLQLDNPTHMNNGDYT
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pF1KB8 LIAKNEYGKDEKQISAHFMGWPGIDDGANPNYPDVIYEDYGTAANDIGDTTNRSNEIPST
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 LIAKNEYGKDEKQISAHFMGWPGIDDGANPNYPDVIYEDYGTAANDIGDTTNRSNEIPST
              370       380       390       400       410       420

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pF1KB8 DVTDKTGREHLSVYAVVVIASVVGFCLLVMLFLLKLARHSKFGMK---------------
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::               
CCDS35 DVTDKTGREHLSVYAVVVIASVVGFCLLVMLFLLKLARHSKFGMKDFSWFGFGKVKSRQG
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pF1KB8 -GPASVISNDDDSASPLHHISNGSNTPSSSEGGPDAVIIGMTKIPVIENPQYFGITNSQL
        :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 VGPASVISNDDDSASPLHHISNGSNTPSSSEGGPDAVIIGMTKIPVIENPQYFGITNSQL
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          530       540       550       560       570       580    
pF1KB8 KPDTFVQHIKRHNIVLKRELGEGAFGKVFLAECYNLCPEQDKILVAVKTLKDASDNARKD
       ::::.                                                       
CCDS35 KPDTWPRGSPKTA                                               
              550                                                  

>>CCDS6671.1 NTRK2 gene_id:4915|Hs108|chr9                (838 aa)
 initn: 5624 init1: 3201 opt: 3204  Z-score: 1305.5  bits: 252.5 E(32554): 2.1e-66
Smith-Waterman score: 5596; 98.1% identity (98.1% similar) in 838 aa overlap (1-822:1-838)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MSSWIRWHGPAMARLWGFCWLVVGFWRAAFACPTSCKCSASRIWCSDPSPGIVAFPRLEP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 MSSWIRWHGPAMARLWGFCWLVVGFWRAAFACPTSCKCSASRIWCSDPSPGIVAFPRLEP
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB8 NSVDPENITEIFIANQKRLEIINEDDVEAYVGLRNLTIVDSGLKFVAHKAFLKNSNLQHI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 NSVDPENITEIFIANQKRLEIINEDDVEAYVGLRNLTIVDSGLKFVAHKAFLKNSNLQHI
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pF1KB8 NFTRNKLTSLSRKHFRHLDLSELILVGNPFTCSCDIMWIKTLQEAKSSPDTQDLYCLNES
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 NFTRNKLTSLSRKHFRHLDLSELILVGNPFTCSCDIMWIKTLQEAKSSPDTQDLYCLNES
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pF1KB8 SKNIPLANLQIPNCGLPSANLAAPNLTVEEGKSITLSCSVAGDPVPNMYWDVGNLVSKHM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 SKNIPLANLQIPNCGLPSANLAAPNLTVEEGKSITLSCSVAGDPVPNMYWDVGNLVSKHM
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pF1KB8 NETSHTQGSLRITNISSDDSGKQISCVAENLVGEDQDSVNLTVHFAPTITFLESPTSDHH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 NETSHTQGSLRITNISSDDSGKQISCVAENLVGEDQDSVNLTVHFAPTITFLESPTSDHH
              250       260       270       280       290       300

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pF1KB8 WCIPFTVKGNPKPALQWFYNGAILNESKYICTKIHVTNHTEYHGCLQLDNPTHMNNGDYT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 WCIPFTVKGNPKPALQWFYNGAILNESKYICTKIHVTNHTEYHGCLQLDNPTHMNNGDYT
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pF1KB8 LIAKNEYGKDEKQISAHFMGWPGIDDGANPNYPDVIYEDYGTAANDIGDTTNRSNEIPST
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 LIAKNEYGKDEKQISAHFMGWPGIDDGANPNYPDVIYEDYGTAANDIGDTTNRSNEIPST
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pF1KB8 DVTDKTGREHLSVYAVVVIASVVGFCLLVMLFLLKLARHSKFGMK---------------
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::               
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pF1KB8 -GPASVISNDDDSASPLHHISNGSNTPSSSEGGPDAVIIGMTKIPVIENPQYFGITNSQL
        :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 VGPASVISNDDDSASPLHHISNGSNTPSSSEGGPDAVIIGMTKIPVIENPQYFGITNSQL
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pF1KB8 KPDTFVQHIKRHNIVLKRELGEGAFGKVFLAECYNLCPEQDKILVAVKTLKDASDNARKD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 KPDTFVQHIKRHNIVLKRELGEGAFGKVFLAECYNLCPEQDKILVAVKTLKDASDNARKD
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 FHREAELLTNLQHEHIVKFYGVCVEGDPLIMVFEYMKHGDLNKFLRAHGPDAVLMAEGNP
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 PTELTQSQMLHIAQQIAAGMVYLASQHFVHRDLATRNCLVGENLLVKIGDFGMSRDVYST
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pF1KB8 DYYRVGGHTMLPIRWMPPESIMYRKFTTESDVWSLGVVLWEIFTYGKQPWYQLSNNEVIE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 DYYRVGGHTMLPIRWMPPESIMYRKFTTESDVWSLGVVLWEIFTYGKQPWYQLSNNEVIE
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 CITQGRVLQRPRTCPQEVYELMLGCWQREPHMRKNIKGIHTLLQNLAKASPVYLDILG
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>>CCDS10340.1 NTRK3 gene_id:4916|Hs108|chr15              (825 aa)
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                ::   .:     :  ::  ::   ...:::..: :: ..: :  :. : . 
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       :: ::             : .:  .::: : : : . :. .:  :.: :.::..::: .:
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       ::. .  .:: :: .:..::.. :.::.:: . :. :.: :: :  : :.::::: :.. 
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        :: .... ..:.:::.: .....::  ..: .: ::  ...  ::::.:: . ...:. 
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       .:.:.:.. : : .:  .. :   .: :.    .: ..:..:.:.:  ..:.:::.:: .
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       . :: :::.. : .. :: :    . :: :.:.::: :.:.:..::  : ::: :    :
CCDS10 NASVALTVYYPPRVVSLEEPELRLEHCIEFVVRGNPPPTLHWLHNGQPLRESKII----H
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       :  . :    .::: ...:::.:::.:::::::  :  .. :..::.  :         .
CCDS10 VEYYQEGEISEGCLLFNKPTHYNNGNYTLIAKNPLGTANQTINGHFLKEP---------F
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       :.    :     .... :       :   :: :  .. ..:  .: .:. .  : :::.:
CCDS10 PEST--DNFILFDEVSPT-------PPITVTHKPEEDTFGVSIAVGLAAFA--CVLLVVL
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pF1KB8 FLL--KLARHSKFGMKGPASVISNDDDSASPLHHISNGSNTPSSSEGGPDAVIIGMTKIP
       :..  : .:.::::::::..:::...:::::::::..: .:::: ..:::.:.::::.::
CCDS10 FVMINKYGRRSKFGMKGPVAVISGEEDSASPLHHINHGITTPSSLDAGPDTVVIGMTRIP
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pF1KB8 VIENPQYFGITNSQLKPDTFVQHIKRHNIVLKRELGEGAFGKVFLAECYNLCPEQDKILV
       ::::::::   ..  ::::.::::::..::::::::::::::::::::::: : .::.::
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       :::.::: .  :::::.::::::::::::::::::::: .::::::::::::::::::::
CCDS10 AVKALKDPTLAARKDFQREAELLTNLQHEHIVKFYGVCGDGDPLIMVFEYMKHGDLNKFL
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pF1KB8 RAHGPDAVLMAEGNP---PTELTQSQMLHIAQQIAAGMVYLASQHFVHRDLATRNCLVGE
       :::::::.....:.:     ::  :::::::.:::.::::::::::::::::::::::: 
CCDS10 RAHGPDAMILVDGQPRQAKGELGLSQMLHIASQIASGMVYLASQHFVHRDLATRNCLVGA
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::.::::
CCDS10 NLLVKIGDFGMSRDVYSTDYYRVGGHTMLPIRWMPPESIMYRKFTTESDVWSFGVILWEI
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pF1KB8 FTYGKQPWYQLSNNEVIECITQGRVLQRPRTCPQEVYELMLGCWQREPHMRKNIKGIHTL
       ::::::::.::::.::::::::::::.:::.::.:::..:::::::::..: ::: :. .
CCDS10 FTYGKQPWFQLSNTEVIECITQGRVLERPRVCPKEVYDVMLGCWQREPQQRLNIKEIYKI
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pF1KB8 LQNLAKASPVYLDILG
       :. :.::.:.::::::
CCDS10 LHALGKATPIYLDILG
     810       820     

>>CCDS58399.1 NTRK3 gene_id:4916|Hs108|chr15              (817 aa)
 initn: 2720 init1: 1066 opt: 2104  Z-score: 868.8  bits: 171.7 E(32554): 4.5e-42
Smith-Waterman score: 2945; 55.3% identity (75.9% similar) in 847 aa overlap (10-822:7-817)

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pF1KB8 MSSWIRWHGPAMARLW-----GFCWL-VVGFWRAAFACPTSCKCSASRIWCSDPSPGIVA
                ::   .:     :  ::  ::   ...:::..: :: ..: :  :. : . 
CCDS58    MDVSLCPAKCSFWRIFLLGSVWLDYVG---SVLACPANCVCSKTEINCRRPDDGNL-
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pF1KB8 FPRLEP------------NSVD-PENITEIFIANQKRLEIINEDDVEAYVGLRNLTIVDS
       :: ::             : .:  .::: : : : . :. .:  :.: :.::..::: .:
CCDS58 FPLLEGQDSGNSNGNASINITDISRNITSIHIENWRSLHTLNAVDMELYTGLQKLTIKNS
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pF1KB8 GLKFVAHKAFLKNSNLQHINFTRNKLTSLSRKHFRHLDLSELILVGNPFTCSCDIMWIKT
       ::. .  .:: :: .:..::.. :.::.:: . :. :.: :: :  : :.::::: :.. 
CCDS58 GLRSIQPRAFAKNPHLRYINLSSNRLTTLSWQLFQTLSLRELQLEQNFFNCSCDIRWMQL
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              170       180       190       200       210       220
pF1KB8 LQE-AKSSPDTQDLYCLNESSKNIPLANLQIPNCGLPSANLAAPNLTVEEGKSITLSCSV
        :: .... ..:.:::.: .....::  ..: .: ::  ...  ::::.:: . ...:. 
CCDS58 WQEQGEAKLNSQNLYCINADGSQLPLFRMNISQCDLPEISVSHVNLTVREGDNAVITCNG
           180       190       200       210       220       230   

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pF1KB8 AGDPVPNMYWDVGNL--VSKH---MNETSHTQGSLRITNISSDDSGKQISCVAENLVGED
       .:.:.:.. : : .:  .. :   .: :.    .: ..:..:.:.:  ..:.:::.:: .
CCDS58 SGSPLPDVDWIVTGLQSINTHQTNLNWTNVHAINLTLVNVTSEDNGFTLTCIAENVVGMS
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pF1KB8 QDSVNLTVHFAPTITFLESPTSDHHWCIPFTVKGNPKPALQWFYNGAILNESKYICTKIH
       . :: :::.. : .. :: :    . :: :.:.::: :.:.:..::  : ::: :    :
CCDS58 NASVALTVYYPPRVVSLEEPELRLEHCIEFVVRGNPPPTLHWLHNGQPLRESKII----H
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         340          350       360       370       380       390  
pF1KB8 VTNHTE---YHGCLQLDNPTHMNNGDYTLIAKNEYGKDEKQISAHFMGWPGIDDGANPNY
       :  . :    .::: ...:::.:::.:::::::  :  .. :..::.  :         .
CCDS58 VEYYQEGEISEGCLLFNKPTHYNNGNYTLIAKNPLGTANQTINGHFLKEP---------F
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pF1KB8 PDVIYEDYGTAANDIGDTTNRSNEIPSTDVTDKTGREHLSVYAVVVIASVVGFC-LLVML
       :          ..... :       :   :: :  .. ..:  .: .:. .  : :::.:
CCDS58 P----------VDEVSPT-------PPITVTHKPEEDTFGVSIAVGLAAFA--CVLLVVL
                               410       420       430         440 

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pF1KB8 FLL--KLARHSKFGMKGPASVISNDDDSASPLHHISNGSNTPSSSEGGPDAVIIGMTKIP
       :..  : .:.::::::::..:::...:::::::::..: .:::: ..:::.:.::::.::
CCDS58 FVMINKYGRRSKFGMKGPVAVISGEEDSASPLHHINHGITTPSSLDAGPDTVVIGMTRIP
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pF1KB8 VIENPQYFGITNSQLKPDTFVQHIKRHNIVLKRELGEGAFGKVFLAECYNLCPEQDKILV
       ::::::::   ..  ::::.::::::..::::::::::::::::::::::: : .::.::
CCDS58 VIENPQYFRQGHNCHKPDTYVQHIKRRDIVLKRELGEGAFGKVFLAECYNLSPTKDKMLV
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       :::.::: .  :::::.::::::::::::::::::::: .::::::::::::::::::::
CCDS58 AVKALKDPTLAARKDFQREAELLTNLQHEHIVKFYGVCGDGDPLIMVFEYMKHGDLNKFL
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pF1KB8 RAHGPDAVLMAEGNP---PTELTQSQMLHIAQQIAAGMVYLASQHFVHRDLATRNCLVGE
       :::::::.....:.:     ::  :::::::.:::.::::::::::::::::::::::: 
CCDS58 RAHGPDAMILVDGQPRQAKGELGLSQMLHIASQIASGMVYLASQHFVHRDLATRNCLVGA
             630       640       650       660       670       680 

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pF1KB8 NLLVKIGDFGMSRDVYSTDYYRVGGHTMLPIRWMPPESIMYRKFTTESDVWSLGVVLWEI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::.::::
CCDS58 NLLVKIGDFGMSRDVYSTDYYRVGGHTMLPIRWMPPESIMYRKFTTESDVWSFGVILWEI
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pF1KB8 FTYGKQPWYQLSNNEVIECITQGRVLQRPRTCPQEVYELMLGCWQREPHMRKNIKGIHTL
       ::::::::.::::.::::::::::::.:::.::.:::..:::::::::..: ::: :. .
CCDS58 FTYGKQPWFQLSNTEVIECITQGRVLERPRVCPKEVYDVMLGCWQREPQQRLNIKEIYKI
             750       760       770       780       790       800 

        810       820  
pF1KB8 LQNLAKASPVYLDILG
       :. :.::.:.::::::
CCDS58 LHALGKATPIYLDILG
             810       

>>CCDS30890.1 NTRK1 gene_id:4914|Hs108|chr1               (760 aa)
 initn: 2188 init1: 992 opt: 1622  Z-score: 677.7  bits: 136.2 E(32554): 2e-31
Smith-Waterman score: 2426; 51.3% identity (74.8% similar) in 759 aa overlap (72-822:42-760)

              50        60        70        80        90       100 
pF1KB8 RIWCSDPSPGIVAFPRLEPNSVDPENITEIFIANQKRLEIINEDDVEAYVGLRNLTIVDS
                                     .: ::..:. ..  :...   ::::::: :
CCDS30 SVPPILTVKSWDTMQLRAARSRCTNLLAASYIENQQHLQHLELRDLRGLGELRNLTIVKS
              20        30        40        50        60        70 

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pF1KB8 GLKFVAHKAFLKNSNLQHINFTRNKLTSLSRKHFRHLDLSELILVGNPFTCSCDIMWIKT
       ::.:::  ::  .  :...:.. : : ::: :  . :.:.::.: :::. ::: . :.. 
CCDS30 GLRFVAPDAFHFTPRLSRLNLSFNALESLSWKTVQGLSLQELVLSGNPLHCSCALRWLQR
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pF1KB8 LQEAK--SSPDTQDLYCLNESSKNIPLANLQIPNCGLPSANLAAPNLTVEEGKSITLSCS
        .:    . :. : : : ...    :::..   .::.:. .. .:: .:. : .. : :.
CCDS30 WEEEGLGGVPE-QKLQCHGQG----PLAHMPNASCGVPTLKVQVPNASVDVGDDVLLRCQ
             140        150           160       170       180      

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pF1KB8 VAGDPVPNMYWDVGNLVSKHMNETSHTQGSLRIT--NISSDDSGKQISCVAENLVGEDQD
       : :  . .  : . .: ..     :    :: .:  :..:: . :...: ::: ::. . 
CCDS30 VEGRGLEQAGWILTELEQSATVMKSGGLPSLGLTLANVTSDLNRKNVTCWAENDVGRAEV
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pF1KB8 SVNLTVHFAPTITFLESPTSDHHWCIPFTVKGNPKPALQWFYNGAILNESKYICTKI--H
       ::...: : :. . :.. .  :::::::.: :.: :.:.:..::..:::...: :..   
CCDS30 SVQVNVSF-PASVQLHTAVEMHHWCIPFSVDGQPAPSLRWLFNGSVLNETSFIFTEFLEP
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pF1KB8 VTNHTEYHGCLQLDNPTHMNNGDYTLIAKNEYGKDEKQISAHFMGWPGIDDGANPNYPDV
       ..:.:  ::::.:..:::.:::.:::.: : .:.   .: : ::  :      ::. :  
CCDS30 AANETVRHGCLRLNQPTHVNNGNYTLLAANPFGQASASIMAAFMDNPF---EFNPEDP--
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pF1KB8 IYEDYGTAANDIGDTTNRSNEIPSTDVTDKTGREHLSVYAVVVIASVVGFCLLVMLFLLK
          : ....   :: .....: :   :.  .:   :.:.: . ....       .: : :
CCDS30 -IPDTNSTS---GDPVEKKDETP-FGVSVAVG---LAVFACLFLSTL-------LLVLNK
                  370        380          390              400     

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pF1KB8 LARHSKFGMKGPASVISNDDDSASPLHHISNGSNTPSSSEGGPDAVIIGMTKIPVIENPQ
        .:..:::.. :: :.. .:  :  :: .. :... : .::  .    :. .  .:::::
CCDS30 CGRRNKFGINRPA-VLAPEDGLAMSLHFMTLGGSSLSPTEGKGS----GL-QGHIIENPQ
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pF1KB8 YFGITNSQLKPDTFVQHIKRHNIVLKRELGEGAFGKVFLAECYNLCPEQDKILVAVKTLK
       ::.        :. :.::::..:::: :::::::::::::::.:: :::::.:::::.::
CCDS30 YFS--------DACVHHIKRRDIVLKWELGEGAFGKVFLAECHNLLPEQDKMLVAVKALK
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         580       590       600       610       620       630     
pF1KB8 DASDNARKDFHREAELLTNLQHEHIVKFYGVCVEGDPLIMVFEYMKHGDLNKFLRAHGPD
       .::..::.::.::::::: :::.:::.:.:::.:: ::.::::::.:::::.:::.::::
CCDS30 EASESARQDFQREAELLTMLQHQHIVRFFGVCTEGRPLLMVFEYMRHGDLNRFLRSHGPD
             520       530       540       550       560       570 

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pF1KB8 AVLMAEGNP--PTELTQSQMLHIAQQIAAGMVYLASQHFVHRDLATRNCLVGENLLVKIG
       : :.: :.   :  :  .:.: .:.:.::::::::. :::::::::::::::..:.::::
CCDS30 AKLLAGGEDVAPGPLGLGQLLAVASQVAAGMVYLAGLHFVHRDLATRNCLVGQGLVVKIG
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pF1KB8 DFGMSRDVYSTDYYRVGGHTMLPIRWMPPESIMYRKFTTESDVWSLGVVLWEIFTYGKQP
       :::::::.::::::::::.:::::::::::::.::::::::::::.::::::::::::::
CCDS30 DFGMSRDIYSTDYYRVGGRTMLPIRWMPPESILYRKFTTESDVWSFGVVLWEIFTYGKQP
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pF1KB8 WYQLSNNEVIECITQGRVLQRPRTCPQEVYELMLGCWQREPHMRKNIKGIHTLLQNLAKA
       ::::::.:.:.:::::: :.:::.:: ::: .: :::::::..:..:: .:. :: ::.:
CCDS30 WYQLSNTEAIDCITQGRELERPRACPPEVYAIMRGCWQREPQQRHSIKDVHARLQALAQA
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           820  
pF1KB8 SPVYLDILG
        :::::.::
CCDS30 PPVYLDVLG
             760

>>CCDS30891.1 NTRK1 gene_id:4914|Hs108|chr1               (790 aa)
 initn: 2216 init1: 992 opt: 1622  Z-score: 677.5  bits: 136.3 E(32554): 2e-31
Smith-Waterman score: 2489; 49.4% identity (73.1% similar) in 826 aa overlap (7-822:12-790)

                    10        20        30          40        50   
pF1KB8      MSSWIRWHGPAMARLWGFCWLVVGFWRAAFACPTSCKC--SASRIWCSDPSPGIV
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CCDS30 MLRGGRRGQLGWHSWAAGPGSLLAWLILASAGAA-PCPDAC-CPHGSSGLRCT--RDGAL
               10        20        30         40         50        

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pF1KB8 AFPRLEPNSVDPENITEIFIANQKRLEIINEDDVEAYVGLRNLTIVDSGLKFVAHKAFLK
          .  :..   ::.::..: ::..:. ..  :...   ::::::: :::.:::  ::  
CCDS30 DSLHHLPGA---ENLTELYIENQQHLQHLELRDLRGLGELRNLTIVKSGLRFVAPDAFHF
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pF1KB8 NSNLQHINFTRNKLTSLSRKHFRHLDLSELILVGNPFTCSCDIMWIKTLQEAK--SSPDT
       .  :...:.. : : ::: :  . :.:.::.: :::. ::: . :..  .:    . :. 
CCDS30 TPRLSRLNLSFNALESLSWKTVQGLSLQELVLSGNPLHCSCALRWLQRWEEEGLGGVPE-
           120       130       140       150       160       170   

             180       190       200       210       220       230 
pF1KB8 QDLYCLNESSKNIPLANLQIPNCGLPSANLAAPNLTVEEGKSITLSCSVAGDPVPNMYWD
       : : : ...    :::..   .::.:. .. .:: .:. : .. : :.: :  . .  : 
CCDS30 QKLQCHGQG----PLAHMPNASCGVPTLKVQVPNASVDVGDDVLLRCQVEGRGLEQAGWI
            180           190       200       210       220        

             240       250         260       270       280         
pF1KB8 VGNLVSKHMNETSHTQGSLRIT--NISSDDSGKQISCVAENLVGEDQDSVNLTVHFAPTI
       . .: ..     :    :: .:  :..:: . :...: ::: ::. . ::...: : :. 
CCDS30 LTELEQSATVMKSGGLPSLGLTLANVTSDLNRKNVTCWAENDVGRAEVSVQVNVSF-PAS
      230       240       250       260       270       280        

     290       300       310       320       330         340       
pF1KB8 TFLESPTSDHHWCIPFTVKGNPKPALQWFYNGAILNESKYICTKI--HVTNHTEYHGCLQ
       . :.. .  :::::::.: :.: :.:.:..::..:::...: :..   ..:.:  ::::.
CCDS30 VQLHTAVEMHHWCIPFSVDGQPAPSLRWLFNGSVLNETSFIFTEFLEPAANETVRHGCLR
       290       300       310       320       330       340       

       350       360       370       380       390       400       
pF1KB8 LDNPTHMNNGDYTLIAKNEYGKDEKQISAHFMGWPGIDDGANPNYPDVIYEDYGTAANDI
       :..:::.:::.:::.: : .:.   .: : ::     :.  . :  : : .  .:.    
CCDS30 LNQPTHVNNGNYTLLAANPFGQASASIMAAFM-----DNPFEFNPEDPIPDTNSTS----
       350       360       370            380       390            

       410       420       430       440       450       460       
pF1KB8 GDTTNRSNEIPSTDVTDKTGREHLSVYAVVVIASVVGFCLLVMLFLLKLARHSKFGMKGP
       :: .....: :   :.  .:   :.:.: . ....       .: : : .:..:::.. :
CCDS30 GDPVEKKDETP-FGVSVAVG---LAVFACLFLSTL-------LLVLNKCGRRNKFGINRP
      400        410          420              430       440       

       470       480       490       500       510       520       
pF1KB8 ASVISNDDDSASPLHHISNGSNTPSSSEGGPDAVIIGMTKIPVIENPQYFGITNSQLKPD
       : :.. .:  :  :: .. :... : .::  .    :. .  .:::::::.        :
CCDS30 A-VLAPEDGLAMSLHFMTLGGSSLSPTEGKGS----GL-QGHIIENPQYFS--------D
        450       460       470           480        490           

       530       540       550       560       570       580       
pF1KB8 TFVQHIKRHNIVLKRELGEGAFGKVFLAECYNLCPEQDKILVAVKTLKDASDNARKDFHR
       . :.::::..:::: :::::::::::::::.:: :::::.:::::.::.::..::.::.:
CCDS30 ACVHHIKRRDIVLKWELGEGAFGKVFLAECHNLLPEQDKMLVAVKALKEASESARQDFQR
           500       510       520       530       540       550   

       590       600       610       620       630       640       
pF1KB8 EAELLTNLQHEHIVKFYGVCVEGDPLIMVFEYMKHGDLNKFLRAHGPDAVLMAEGNP--P
       :::::: :::.:::.:.:::.:: ::.::::::.:::::.:::.::::: :.: :.   :
CCDS30 EAELLTMLQHQHIVRFFGVCTEGRPLLMVFEYMRHGDLNRFLRSHGPDAKLLAGGEDVAP
           560       570       580       590       600       610   

         650       660       670       680       690       700     
pF1KB8 TELTQSQMLHIAQQIAAGMVYLASQHFVHRDLATRNCLVGENLLVKIGDFGMSRDVYSTD
         :  .:.: .:.:.::::::::. :::::::::::::::..:.:::::::::::.::::
CCDS30 GPLGLGQLLAVASQVAAGMVYLAGLHFVHRDLATRNCLVGQGLVVKIGDFGMSRDIYSTD
           620       630       640       650       660       670   

         710       720       730       740       750       760     
pF1KB8 YYRVGGHTMLPIRWMPPESIMYRKFTTESDVWSLGVVLWEIFTYGKQPWYQLSNNEVIEC
       ::::::.:::::::::::::.::::::::::::.::::::::::::::::::::.:.:.:
CCDS30 YYRVGGRTMLPIRWMPPESILYRKFTTESDVWSFGVVLWEIFTYGKQPWYQLSNTEAIDC
           680       690       700       710       720       730   

         770       780       790       800       810       820  
pF1KB8 ITQGRVLQRPRTCPQEVYELMLGCWQREPHMRKNIKGIHTLLQNLAKASPVYLDILG
       ::::: :.:::.:: ::: .: :::::::..:..:: .:. :: ::.: :::::.::
CCDS30 ITQGRELERPRACPPEVYAIMRGCWQREPQQRHSIKDVHARLQALAQAPPVYLDVLG
           740       750       760       770       780       790

>>CCDS1161.1 NTRK1 gene_id:4914|Hs108|chr1                (796 aa)
 initn: 2216 init1: 992 opt: 1615  Z-score: 674.7  bits: 135.7 E(32554): 2.9e-31
Smith-Waterman score: 2496; 49.5% identity (73.2% similar) in 827 aa overlap (7-822:12-796)

                    10        20        30          40        50   
pF1KB8      MSSWIRWHGPAMARLWGFCWLVVGFWRAAFACPTSCKC--SASRIWCSDPSPGIV
                  ::. : .    . ::...   ::  :: .: :  ..: . :.    : .
CCDS11 MLRGGRRGQLGWHSWAAGPGSLLAWLILASAGAA-PCPDAC-CPHGSSGLRCT--RDGAL
               10        20        30         40         50        

            60        70        80        90       100       110   
pF1KB8 AFPRLEPNSVDPENITEIFIANQKRLEIINEDDVEAYVGLRNLTIVDSGLKFVAHKAFLK
          .  :..   ::.::..: ::..:. ..  :...   ::::::: :::.:::  ::  
CCDS11 DSLHHLPGA---ENLTELYIENQQHLQHLELRDLRGLGELRNLTIVKSGLRFVAPDAFHF
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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