Result of FASTA (ccds) for pF1KB5507
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB5507, 596 aa
  1>>>pF1KB5507 596 - 596 aa - 596 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.5848+/-0.000891; mu= 12.8776+/- 0.054
 mean_var=88.4685+/-17.669, 0's: 0 Z-trim(108.1): 116  B-trim: 215 in 2/49
 Lambda= 0.136358
 statistics sampled from 9850 (9972) to 9850 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.676), E-opt: 0.2 (0.306), width:  16
 Scan time:  2.790

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS41483.1 NET1 gene_id:10276|Hs108|chr10         ( 596) 3947 786.6       0
CCDS7067.1 NET1 gene_id:10276|Hs108|chr10          ( 542) 3393 677.6 1.1e-194
CCDS46854.1 ARHGEF3 gene_id:50650|Hs108|chr3       ( 558) 1957 395.1 1.2e-109
CCDS74948.1 ARHGEF3 gene_id:50650|Hs108|chr3       ( 532) 1936 391.0  2e-108
CCDS2878.1 ARHGEF3 gene_id:50650|Hs108|chr3        ( 526) 1873 378.6 1.1e-104
CCDS46855.1 ARHGEF3 gene_id:50650|Hs108|chr3       ( 532) 1867 377.4 2.5e-104
CCDS82664.1 ITSN1 gene_id:6453|Hs108|chr21         (1716)  366 82.3 5.5e-15
CCDS33545.1 ITSN1 gene_id:6453|Hs108|chr21         (1721)  366 82.3 5.5e-15
CCDS1711.2 ITSN2 gene_id:50618|Hs108|chr2          (1670)  316 72.5 4.9e-12
CCDS1710.2 ITSN2 gene_id:50618|Hs108|chr2          (1697)  316 72.5   5e-12
CCDS6201.1 PREX2 gene_id:80243|Hs108|chr8          (1606)  305 70.3 2.1e-11
CCDS12592.1 ARHGEF1 gene_id:9138|Hs108|chr19       ( 879)  293 67.9 6.3e-11
CCDS12591.1 ARHGEF1 gene_id:9138|Hs108|chr19       ( 912)  293 67.9 6.6e-11
CCDS12590.1 ARHGEF1 gene_id:9138|Hs108|chr19       ( 927)  293 67.9 6.7e-11


>>CCDS41483.1 NET1 gene_id:10276|Hs108|chr10              (596 aa)
 initn: 3947 init1: 3947 opt: 3947  Z-score: 4197.2  bits: 786.6 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 3947; 100.0% identity (100.0% similar) in 596 aa overlap (1-596:1-596)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MEPELAAQKQPRPRRRSRRASGLSTEGATGPSADTSGSELDGRCSLRRGSSFTFLTPGPN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 MEPELAAQKQPRPRRRSRRASGLSTEGATGPSADTSGSELDGRCSLRRGSSFTFLTPGPN
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 WDFTLKRKRREKDDDVVSLSSLDLKEPSNKRVRPLARVTSLANLISPVRNGAVRRFGQTI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 WDFTLKRKRREKDDDVVSLSSLDLKEPSNKRVRPLARVTSLANLISPVRNGAVRRFGQTI
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB5 QSFTLRGDHRSPASAQKFSSRSTVPTPAKRRSSALWSEMLDITMKESLTTREIRRQEAIY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 QSFTLRGDHRSPASAQKFSSRSTVPTPAKRRSSALWSEMLDITMKESLTTREIRRQEAIY
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB5 EMSRGEQDLIEDLKLARKAYHDPMLKLSIMSEEELTHIFGDLDSYIPLHEDLLTRIGEAT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 EMSRGEQDLIEDLKLARKAYHDPMLKLSIMSEEELTHIFGDLDSYIPLHEDLLTRIGEAT
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB5 KPDGTVEQIGHILVSWLPRLNAYRGYCSNQLAAKALLDQKKQDPRVQDFLQRCLESPFSR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 KPDGTVEQIGHILVSWLPRLNAYRGYCSNQLAAKALLDQKKQDPRVQDFLQRCLESPFSR
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB5 KLDLWSFLDIPRSRLVKYPLLLKEILKHTPKEHPDVQLLEDAILIIQGVLSDINLKKGES
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 KLDLWSFLDIPRSRLVKYPLLLKEILKHTPKEHPDVQLLEDAILIIQGVLSDINLKKGES
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB5 ECQYYIDKLEYLDEKQRDPRIEASKVLLCHGELRSKSGHKLYIFLFQDILVLTRPVTRNE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 ECQYYIDKLEYLDEKQRDPRIEASKVLLCHGELRSKSGHKLYIFLFQDILVLTRPVTRNE
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB5 RHSYQVYRQPIPVQELVLEDLQDGDVRMGGSFRGAFSNSEKAKNIFRIRFHDPSPAQSHT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 RHSYQVYRQPIPVQELVLEDLQDGDVRMGGSFRGAFSNSEKAKNIFRIRFHDPSPAQSHT
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB5 LQANDVFHKQQWFNCIRAAIAPFQSAGSPPELQGLPELHEECEGNHPSARKLTAQRRAST
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 LQANDVFHKQQWFNCIRAAIAPFQSAGSPPELQGLPELHEECEGNHPSARKLTAQRRAST
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590      
pF1KB5 VSSVTQVEVDENAYRCGSGMQMAEDSKSLKTHQTQPGIRRARDKALSGGKRKETLV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 VSSVTQVEVDENAYRCGSGMQMAEDSKSLKTHQTQPGIRRARDKALSGGKRKETLV
              550       560       570       580       590      

>>CCDS7067.1 NET1 gene_id:10276|Hs108|chr10               (542 aa)
 initn: 3393 init1: 3393 opt: 3393  Z-score: 3608.8  bits: 677.6 E(32554): 1.1e-194
Smith-Waterman score: 3393; 97.5% identity (98.3% similar) in 529 aa overlap (68-596:14-542)

        40        50        60        70        80        90       
pF1KB5 SELDGRCSLRRGSSFTFLTPGPNWDFTLKRKRREKDDDVVSLSSLDLKEPSNKRVRPLAR
                                     ::  .  :: . :  . .::::::::::::
CCDS70                  MVAHDETGGLLPIKRTIRVLDVNNQSFREQEEPSNKRVRPLAR
                                10        20        30        40   

       100       110       120       130       140       150       
pF1KB5 VTSLANLISPVRNGAVRRFGQTIQSFTLRGDHRSPASAQKFSSRSTVPTPAKRRSSALWS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 VTSLANLISPVRNGAVRRFGQTIQSFTLRGDHRSPASAQKFSSRSTVPTPAKRRSSALWS
            50        60        70        80        90       100   

       160       170       180       190       200       210       
pF1KB5 EMLDITMKESLTTREIRRQEAIYEMSRGEQDLIEDLKLARKAYHDPMLKLSIMSEEELTH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 EMLDITMKESLTTREIRRQEAIYEMSRGEQDLIEDLKLARKAYHDPMLKLSIMSEEELTH
           110       120       130       140       150       160   

       220       230       240       250       260       270       
pF1KB5 IFGDLDSYIPLHEDLLTRIGEATKPDGTVEQIGHILVSWLPRLNAYRGYCSNQLAAKALL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 IFGDLDSYIPLHEDLLTRIGEATKPDGTVEQIGHILVSWLPRLNAYRGYCSNQLAAKALL
           170       180       190       200       210       220   

       280       290       300       310       320       330       
pF1KB5 DQKKQDPRVQDFLQRCLESPFSRKLDLWSFLDIPRSRLVKYPLLLKEILKHTPKEHPDVQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 DQKKQDPRVQDFLQRCLESPFSRKLDLWSFLDIPRSRLVKYPLLLKEILKHTPKEHPDVQ
           230       240       250       260       270       280   

       340       350       360       370       380       390       
pF1KB5 LLEDAILIIQGVLSDINLKKGESECQYYIDKLEYLDEKQRDPRIEASKVLLCHGELRSKS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 LLEDAILIIQGVLSDINLKKGESECQYYIDKLEYLDEKQRDPRIEASKVLLCHGELRSKS
           290       300       310       320       330       340   

       400       410       420       430       440       450       
pF1KB5 GHKLYIFLFQDILVLTRPVTRNERHSYQVYRQPIPVQELVLEDLQDGDVRMGGSFRGAFS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 GHKLYIFLFQDILVLTRPVTRNERHSYQVYRQPIPVQELVLEDLQDGDVRMGGSFRGAFS
           350       360       370       380       390       400   

       460       470       480       490       500       510       
pF1KB5 NSEKAKNIFRIRFHDPSPAQSHTLQANDVFHKQQWFNCIRAAIAPFQSAGSPPELQGLPE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 NSEKAKNIFRIRFHDPSPAQSHTLQANDVFHKQQWFNCIRAAIAPFQSAGSPPELQGLPE
           410       420       430       440       450       460   

       520       530       540       550       560       570       
pF1KB5 LHEECEGNHPSARKLTAQRRASTVSSVTQVEVDENAYRCGSGMQMAEDSKSLKTHQTQPG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 LHEECEGNHPSARKLTAQRRASTVSSVTQVEVDENAYRCGSGMQMAEDSKSLKTHQTQPG
           470       480       490       500       510       520   

       580       590      
pF1KB5 IRRARDKALSGGKRKETLV
       :::::::::::::::::::
CCDS70 IRRARDKALSGGKRKETLV
           530       540  

>>CCDS46854.1 ARHGEF3 gene_id:50650|Hs108|chr3            (558 aa)
 initn: 1918 init1: 1693 opt: 1957  Z-score: 2081.9  bits: 395.1 E(32554): 1.2e-109
Smith-Waterman score: 1957; 62.5% identity (87.3% similar) in 456 aa overlap (47-499:25-479)

         20        30        40        50        60          70    
pF1KB5 SRRASGLSTEGATGPSADTSGSELDGRCSLRRGSSFTFLTPGPN-WDFT-LKRKRREKDD
                                     .: ..:  . :.:. :.:   :::.  .:.
CCDS46       MDSSTAMNQCSCRGMEENKERPKRQRQNNFP-MFPSPKAWNFRGRKRKQSTQDE
                     10        20        30         40        50   

           80        90       100       110       120        130   
pF1KB5 DVVSLSSLDLKEPSNKRVRPLARVTSLANLISPVRNGAVRRFGQTIQ-SFTLRGDHRSPA
       :.::: :::..:::::::.::.::::::::: ::.   ..::.::.: :...:.. :   
CCDS46 DAVSLCSLDISEPSNKRVKPLSRVTSLANLIPPVKATPLKRFSQTLQRSISFRSESRPDI
            60        70        80        90       100       110   

           140       150       160       170       180       190   
pF1KB5 SAQKFSSRSTVPTPAKRRSSALWSEMLDITMKESLTTREIRRQEAIYEMSRGEQDLIEDL
        : .  ::...:. .:::.: :::: .:. ... ::..::.:::::.:.:.::.::::::
CCDS46 LAPRPWSRNAAPSSTKRRDSKLWSETFDVCVNQMLTSKEIKRQEAIFELSQGEEDLIEDL
           120       130       140       150       160       170   

           200       210       220       230       240       250   
pF1KB5 KLARKAYHDPMLKLSIMSEEELTHIFGDLDSYIPLHEDLLTRIGEATKPDGTVEQIGHIL
       :::.:::::::::::::.:.::..::: ::: :::::.::... .. ::::..:..: ::
CCDS46 KLAKKAYHDPMLKLSIMTEQELNQIFGTLDSLIPLHEELLSQLRDVRKPDGSTEHVGPIL
           180       190       200       210       220       230   

           260       270       280       290       300       310   
pF1KB5 VSWLPRLNAYRGYCSNQLAAKALLDQKKQDPRVQDFLQRCLESPFSRKLDLWSFLDIPRS
       :.::: :..: .:::::.:::::::.:::: :::::::::::::::::::::.:::::::
CCDS46 VGWLPCLSSYDSYCSNQVAAKALLDHKKQDHRVQDFLQRCLESPFSRKLDLWNFLDIPRS
           240       250       260       270       280       290   

           320       330       340       350       360       370   
pF1KB5 RLVKYPLLLKEILKHTPKEHPDVQLLEDAILIIQGVLSDINLKKGESECQYYIDKLEYLD
       :::::::::.:::.:::...:: : ::.:: ::::....:: : :::::.:: ..: ::.
CCDS46 RLVKYPLLLREILRHTPNDNPDQQHLEEAINIIQGIVAEINTKTGESECRYYKERLLYLE
           300       310       320       330       340       350   

           380       390       400       410       420       430   
pF1KB5 EKQRDPRIEASKVLLCHGELRSKSGHKLYIFLFQDILVLTRPVTRNERHSYQVYRQPIPV
       : :.:  :..:.:: :::::... : ::..::::..::.:: ::.::.  ::.:::::::
CCDS46 EGQKDSLIDSSRVLCCHGELKNNRGVKLHVFLFQEVLVITRAVTHNEQLCYQLYRQPIPV
           360       370       380       390       400       410   

           440       450       460       470       480       490   
pF1KB5 QELVLEDLQDGDVRMGGSFRGAFSNSEKAKNIFRIRFHDPSPAQSHTLQANDVFHKQQWF
       ..:.:::::::.::.:::.::::::.:. ::.::. :.. : .:.:.:::::.:.::::.
CCDS46 KDLLLEDLQDGEVRLGGSLRGAFSNNERIKNFFRVSFKNGSQSQTHSLQANDTFNKQQWL
           420       430       440       450       460       470   

           500       510       520       530       540       550   
pF1KB5 NCIRAAIAPFQSAGSPPELQGLPELHEECEGNHPSARKLTAQRRASTVSSVTQVEVDENA
       :::: :                                                      
CCDS46 NCIRQAKETVLCAAGQAGVLDSEGSFLNPTTGSRELQGETKLEQMDQSDSESDCSMDTSE
           480       490       500       510       520       530   

>>CCDS74948.1 ARHGEF3 gene_id:50650|Hs108|chr3            (532 aa)
 initn: 1918 init1: 1693 opt: 1936  Z-score: 2059.9  bits: 391.0 E(32554): 2e-108
Smith-Waterman score: 1936; 64.1% identity (88.5% similar) in 435 aa overlap (66-499:19-453)

          40        50        60        70        80        90     
pF1KB5 SGSELDGRCSLRRGSSFTFLTPGPNWDFTLKRKRREKDDDVVSLSSLDLKEPSNKRVRPL
                                     :::.  .:.:.::: :::..:::::::.::
CCDS74             MRSERPMVWCCLFVRSQRKRKQSTQDEDAVSLCSLDISEPSNKRVKPL
                           10        20        30        40        

         100       110       120        130       140       150    
pF1KB5 ARVTSLANLISPVRNGAVRRFGQTIQ-SFTLRGDHRSPASAQKFSSRSTVPTPAKRRSSA
       .::::::::: ::.   ..::.::.: :...:.. :    : .  ::...:. .:::.: 
CCDS74 SRVTSLANLIPPVKATPLKRFSQTLQRSISFRSESRPDILAPRPWSRNAAPSSTKRRDSK
       50        60        70        80        90       100        

          160       170       180       190       200       210    
pF1KB5 LWSEMLDITMKESLTTREIRRQEAIYEMSRGEQDLIEDLKLARKAYHDPMLKLSIMSEEE
       :::: .:. ... ::..::.:::::.:.:.::.:::::::::.:::::::::::::.:.:
CCDS74 LWSETFDVCVNQMLTSKEIKRQEAIFELSQGEEDLIEDLKLAKKAYHDPMLKLSIMTEQE
      110       120       130       140       150       160        

          220       230       240       250       260       270    
pF1KB5 LTHIFGDLDSYIPLHEDLLTRIGEATKPDGTVEQIGHILVSWLPRLNAYRGYCSNQLAAK
       :..::: ::: :::::.::... .. ::::..:..: :::.::: :..: .:::::.:::
CCDS74 LNQIFGTLDSLIPLHEELLSQLRDVRKPDGSTEHVGPILVGWLPCLSSYDSYCSNQVAAK
      170       180       190       200       210       220        

          280       290       300       310       320       330    
pF1KB5 ALLDQKKQDPRVQDFLQRCLESPFSRKLDLWSFLDIPRSRLVKYPLLLKEILKHTPKEHP
       ::::.:::: :::::::::::::::::::::.::::::::::::::::.:::.:::...:
CCDS74 ALLDHKKQDHRVQDFLQRCLESPFSRKLDLWNFLDIPRSRLVKYPLLLREILRHTPNDNP
      230       240       250       260       270       280        

          340       350       360       370       380       390    
pF1KB5 DVQLLEDAILIIQGVLSDINLKKGESECQYYIDKLEYLDEKQRDPRIEASKVLLCHGELR
       : : ::.:: ::::....:: : :::::.:: ..: ::.: :.:  :..:.:: :::::.
CCDS74 DQQHLEEAINIIQGIVAEINTKTGESECRYYKERLLYLEEGQKDSLIDSSRVLCCHGELK
      290       300       310       320       330       340        

          400       410       420       430       440       450    
pF1KB5 SKSGHKLYIFLFQDILVLTRPVTRNERHSYQVYRQPIPVQELVLEDLQDGDVRMGGSFRG
       .. : ::..::::..::.:: ::.::.  ::.:::::::..:.:::::::.::.:::.::
CCDS74 NNRGVKLHVFLFQEVLVITRAVTHNEQLCYQLYRQPIPVKDLLLEDLQDGEVRLGGSLRG
      350       360       370       380       390       400        

          460       470       480       490       500       510    
pF1KB5 AFSNSEKAKNIFRIRFHDPSPAQSHTLQANDVFHKQQWFNCIRAAIAPFQSAGSPPELQG
       ::::.:. ::.::. :.. : .:.:.:::::.:.::::.:::: :               
CCDS74 AFSNNERIKNFFRVSFKNGSQSQTHSLQANDTFNKQQWLNCIRQAKETVLCAAGQAGVLD
      410       420       430       440       450       460        

          520       530       540       550       560       570    
pF1KB5 LPELHEECEGNHPSARKLTAQRRASTVSSVTQVEVDENAYRCGSGMQMAEDSKSLKTHQT
                                                                   
CCDS74 SEGSFLNPTTGSRELQGETKLEQMDQSDSESDCSMDTSEVSLDCERMEQTDSSCGNSRHG
      470       480       490       500       510       520        

>>CCDS2878.1 ARHGEF3 gene_id:50650|Hs108|chr3             (526 aa)
 initn: 1853 init1: 1693 opt: 1873  Z-score: 1993.0  bits: 378.6 E(32554): 1.1e-104
Smith-Waterman score: 1873; 62.3% identity (86.5% similar) in 438 aa overlap (63-499:10-447)

             40        50        60        70        80        90  
pF1KB5 ADTSGSELDGRCSLRRGSSFTFLTPGPNWDFTLKRKRREKDDDVVSLSSLDLKEPSNKRV
                                     .:.::     .   .:  . : .:::::::
CCDS28                      MVAKDYPFYLTVKRANCSLELPPASGPAKDAEEPSNKRV
                                    10        20        30         

            100       110       120        130       140       150 
pF1KB5 RPLARVTSLANLISPVRNGAVRRFGQTIQ-SFTLRGDHRSPASAQKFSSRSTVPTPAKRR
       .::.::::::::: ::.   ..::.::.: :...:.. :    : .  ::...:. .:::
CCDS28 KPLSRVTSLANLIPPVKATPLKRFSQTLQRSISFRSESRPDILAPRPWSRNAAPSSTKRR
      40        50        60        70        80        90         

             160       170       180       190       200       210 
pF1KB5 SSALWSEMLDITMKESLTTREIRRQEAIYEMSRGEQDLIEDLKLARKAYHDPMLKLSIMS
       .: :::: .:. ... ::..::.:::::.:.:.::.:::::::::.:::::::::::::.
CCDS28 DSKLWSETFDVCVNQMLTSKEIKRQEAIFELSQGEEDLIEDLKLAKKAYHDPMLKLSIMT
     100       110       120       130       140       150         

             220       230       240       250       260       270 
pF1KB5 EEELTHIFGDLDSYIPLHEDLLTRIGEATKPDGTVEQIGHILVSWLPRLNAYRGYCSNQL
       :.::..::: ::: :::::.::... .. ::::..:..: :::.::: :..: .:::::.
CCDS28 EQELNQIFGTLDSLIPLHEELLSQLRDVRKPDGSTEHVGPILVGWLPCLSSYDSYCSNQV
     160       170       180       190       200       210         

             280       290       300       310       320       330 
pF1KB5 AAKALLDQKKQDPRVQDFLQRCLESPFSRKLDLWSFLDIPRSRLVKYPLLLKEILKHTPK
       :::::::.:::: :::::::::::::::::::::.::::::::::::::::.:::.:::.
CCDS28 AAKALLDHKKQDHRVQDFLQRCLESPFSRKLDLWNFLDIPRSRLVKYPLLLREILRHTPN
     220       230       240       250       260       270         

             340       350       360       370       380       390 
pF1KB5 EHPDVQLLEDAILIIQGVLSDINLKKGESECQYYIDKLEYLDEKQRDPRIEASKVLLCHG
       ..:: : ::.:: ::::....:: : :::::.:: ..: ::.: :.:  :..:.:: :::
CCDS28 DNPDQQHLEEAINIIQGIVAEINTKTGESECRYYKERLLYLEEGQKDSLIDSSRVLCCHG
     280       290       300       310       320       330         

             400       410       420       430       440       450 
pF1KB5 ELRSKSGHKLYIFLFQDILVLTRPVTRNERHSYQVYRQPIPVQELVLEDLQDGDVRMGGS
       ::... : ::..::::..::.:: ::.::.  ::.:::::::..:.:::::::.::.:::
CCDS28 ELKNNRGVKLHVFLFQEVLVITRAVTHNEQLCYQLYRQPIPVKDLLLEDLQDGEVRLGGS
     340       350       360       370       380       390         

             460       470       480       490       500       510 
pF1KB5 FRGAFSNSEKAKNIFRIRFHDPSPAQSHTLQANDVFHKQQWFNCIRAAIAPFQSAGSPPE
       .::::::.:. ::.::. :.. : .:.:.:::::.:.::::.:::: :            
CCDS28 LRGAFSNNERIKNFFRVSFKNGSQSQTHSLQANDTFNKQQWLNCIRQAKETVLCAAGQAG
     400       410       420       430       440       450         

             520       530       540       550       560       570 
pF1KB5 LQGLPELHEECEGNHPSARKLTAQRRASTVSSVTQVEVDENAYRCGSGMQMAEDSKSLKT
                                                                   
CCDS28 VLDSEGSFLNPTTGSRELQGETKLEQMDQSDSESDCSMDTSEVSLDCERMEQTDSSCGNS
     460       470       480       490       500       510         

>>CCDS46855.1 ARHGEF3 gene_id:50650|Hs108|chr3            (532 aa)
 initn: 1849 init1: 1693 opt: 1867  Z-score: 1986.5  bits: 377.4 E(32554): 2.5e-104
Smith-Waterman score: 1867; 64.4% identity (88.7% similar) in 416 aa overlap (85-499:38-453)

           60        70        80        90       100       110    
pF1KB5 LTPGPNWDFTLKRKRREKDDDVVSLSSLDLKEPSNKRVRPLARVTSLANLISPVRNGAVR
                                     .:::::::.::.::::::::: ::.   ..
CCDS46 NWLLWLCPSKFGIFMCCLASTTGQMELRRTREPSNKRVKPLSRVTSLANLIPPVKATPLK
        10        20        30        40        50        60       

          120        130       140       150       160       170   
pF1KB5 RFGQTIQ-SFTLRGDHRSPASAQKFSSRSTVPTPAKRRSSALWSEMLDITMKESLTTREI
       ::.::.: :...:.. :    : .  ::...:. .:::.: :::: .:. ... ::..::
CCDS46 RFSQTLQRSISFRSESRPDILAPRPWSRNAAPSSTKRRDSKLWSETFDVCVNQMLTSKEI
        70        80        90       100       110       120       

           180       190       200       210       220       230   
pF1KB5 RRQEAIYEMSRGEQDLIEDLKLARKAYHDPMLKLSIMSEEELTHIFGDLDSYIPLHEDLL
       .:::::.:.:.::.:::::::::.:::::::::::::.:.::..::: ::: :::::.::
CCDS46 KRQEAIFELSQGEEDLIEDLKLAKKAYHDPMLKLSIMTEQELNQIFGTLDSLIPLHEELL
       130       140       150       160       170       180       

           240       250       260       270       280       290   
pF1KB5 TRIGEATKPDGTVEQIGHILVSWLPRLNAYRGYCSNQLAAKALLDQKKQDPRVQDFLQRC
       ... .. ::::..:..: :::.::: :..: .:::::.:::::::.:::: :::::::::
CCDS46 SQLRDVRKPDGSTEHVGPILVGWLPCLSSYDSYCSNQVAAKALLDHKKQDHRVQDFLQRC
       190       200       210       220       230       240       

           300       310       320       330       340       350   
pF1KB5 LESPFSRKLDLWSFLDIPRSRLVKYPLLLKEILKHTPKEHPDVQLLEDAILIIQGVLSDI
       ::::::::::::.::::::::::::::::.:::.:::...:: : ::.:: ::::....:
CCDS46 LESPFSRKLDLWNFLDIPRSRLVKYPLLLREILRHTPNDNPDQQHLEEAINIIQGIVAEI
       250       260       270       280       290       300       

           360       370       380       390       400       410   
pF1KB5 NLKKGESECQYYIDKLEYLDEKQRDPRIEASKVLLCHGELRSKSGHKLYIFLFQDILVLT
       : : :::::.:: ..: ::.: :.:  :..:.:: :::::... : ::..::::..::.:
CCDS46 NTKTGESECRYYKERLLYLEEGQKDSLIDSSRVLCCHGELKNNRGVKLHVFLFQEVLVIT
       310       320       330       340       350       360       

           420       430       440       450       460       470   
pF1KB5 RPVTRNERHSYQVYRQPIPVQELVLEDLQDGDVRMGGSFRGAFSNSEKAKNIFRIRFHDP
       : ::.::.  ::.:::::::..:.:::::::.::.:::.::::::.:. ::.::. :.. 
CCDS46 RAVTHNEQLCYQLYRQPIPVKDLLLEDLQDGEVRLGGSLRGAFSNNERIKNFFRVSFKNG
       370       380       390       400       410       420       

           480       490       500       510       520       530   
pF1KB5 SPAQSHTLQANDVFHKQQWFNCIRAAIAPFQSAGSPPELQGLPELHEECEGNHPSARKLT
       : .:.:.:::::.:.::::.:::: :                                  
CCDS46 SQSQTHSLQANDTFNKQQWLNCIRQAKETVLCAAGQAGVLDSEGSFLNPTTGSRELQGET
       430       440       450       460       470       480       

>>CCDS82664.1 ITSN1 gene_id:6453|Hs108|chr21              (1716 aa)
 initn: 260 init1: 126 opt: 366  Z-score: 382.5  bits: 82.3 E(32554): 5.5e-15
Smith-Waterman score: 415; 25.1% identity (54.8% similar) in 529 aa overlap (15-499:1069-1564)

                               10        20        30        40    
pF1KB5                 MEPELAAQKQPRPRRRSRRASGLSTEGATGPSADTSGSELDGRC
                                     .. . :. ...  ::::   : .    :. 
CCDS82 GDKAGVFPSNYVRLKDSEGSGTAGKTGSLGKKPEIAQVIASYTATGPEQLTLA---PGQL
     1040      1050      1060      1070      1080      1090        

           50        60        70        80        90         100  
pF1KB5 SLRRGSSFTFLTPGPNWDFTLKRKRREKDDDVVSLSSLDLKEPSNKRVRPLA--RVTSLA
        : : ..     ::  :.  :. . ....      . . :  :..... :    . :.::
CCDS82 ILIRKKN-----PGGWWEGELQARGKKRQIGWFPANYVKLLSPGTSKITPTEPPKSTALA
        1100           1110      1120      1130      1140      1150

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pF1KB5 NLISPV-------RNGAVRRF--GQTIQSFTLRGDH--RSPASAQK--FSSRSTVPTPAK
        . . .       .:     :  :: :. .. .     .. ...:   : : . :   . 
CCDS82 AVCQVIGMYDYTAQNDDELAFNKGQIINVLNKEDPDWWKGEVNGQVGLFPS-NYVKLTTD
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pF1KB5 RRSSALWSEMLDITMKESLTTREIRRQEAIYEMSRGEQDLIEDLKLARKAYHDPMLKLSI
          :  :    :. . . ::  : .::  :.:.   :.. ..::.:. . .. :...  .
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pF1KB5 MSEEELTHIFGDLDSYIPLHEDLLTRIGEATKPDGT---VEQIGHILVSWLPRLNAYRGY
       ..:.:.. :: .    :  .  ::  .    : .:    :..:: :: . ::... :  .
CCDS82 LTEKEVAMIFVNWKELIMCNIKLLKALRVRKKMSGEKMPVKMIGDILSAQLPHMQPYIRF
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       :: :: . ::..:: .. :  ..:..:   .:  . . : ::.  : .:...:::..:.:
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pF1KB5 LKHTPKEHPDVQLLEDAILIIQGVLSDINLKKGESECQYYIDKLEYLDEKQR----DPRI
       :..::..::: . :. :.   . . :..:    :.: .   :.::... . .    . ..
CCDS82 LENTPENHPDHSHLKHALEKAEELCSQVNEGVREKENS---DRLEWIQAHVQCEGLSEQL
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         ..:  :       : :.: ..::...:: :::.:.:.::   .:.         . . 
CCDS82 VFNSVTNCLGPRKFLHSGKLYKAKSNKELYGFLFNDFLLLTQITKPLGSSGTDKVFSPKS
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pF1KB5 RHSYQVYRQPIPVQELVLEDLQDGDVRMGGSFRGAFSNSEKAKNIFRIRFHDPSPAQSHT
         .:..:. :: ..:....   :             :..:    ::.:   :    . .:
CCDS82 NLQYKMYKTPIFLNEVLVKLPTDP------------SGDEP---IFHISHID----RVYT
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pF1KB5 LQANDVFHKQQWFNCIRAAIAPFQSAGSPPELQGLPELHEECEGNHPSARKLTAQRRAST
       :.:... ..  : . :.::                                         
CCDS82 LRAESINERTAWVQKIKAASELYIETEKKKREKAYLVRSQRATGIGRLMVNVVEGIELKP
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>>CCDS33545.1 ITSN1 gene_id:6453|Hs108|chr21              (1721 aa)
 initn: 260 init1: 126 opt: 366  Z-score: 382.5  bits: 82.3 E(32554): 5.5e-15
Smith-Waterman score: 415; 25.1% identity (54.8% similar) in 529 aa overlap (15-499:1074-1569)

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pF1KB5                 MEPELAAQKQPRPRRRSRRASGLSTEGATGPSADTSGSELDGRC
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        : : ..     ::  :.  :. . ....      . . :  :..... :    . :.::
CCDS33 ILIRKKN-----PGGWWEGELQARGKKRQIGWFPANYVKLLSPGTSKITPTEPPKSTALA
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pF1KB5 NLISPV-------RNGAVRRF--GQTIQSFTLRGDH--RSPASAQK--FSSRSTVPTPAK
        . . .       .:     :  :: :. .. .     .. ...:   : : . :   . 
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pF1KB5 RRSSALWSEMLDITMKESLTTREIRRQEAIYEMSRGEQDLIEDLKLARKAYHDPMLKLSI
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CCDS33 MDPSQQWCS--DLHLLDMLTPTERKRQGYIHELIVTEENYVNDLQLVTEIFQKPLMESEL
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       ..:.:.. :: .    :  .  ::  .    : .:    :..:: :: . ::... :  .
CCDS33 LTEKEVAMIFVNWKELIMCNIKLLKALRVRKKMSGEKMPVKMIGDILSAQLPHMQPYIRF
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pF1KB5 CSNQLAAKALLDQKKQD-PRVQDFLQRCLESPFSRKLDLWSFLDIPRSRLVKYPLLLKEI
       :: :: . ::..:: .. :  ..:..:   .:  . . : ::.  : .:...:::..:.:
CCDS33 CSRQLNGAALIQQKTDEAPDFKEFVKRLAMDPRCKGMPLSSFILKPMQRVTRYPLIIKNI
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pF1KB5 LKHTPKEHPDVQLLEDAILIIQGVLSDINLKKGESECQYYIDKLEYLDEKQR----DPRI
       :..::..::: . :. :.   . . :..:    :.: .   :.::... . .    . ..
CCDS33 LENTPENHPDHSHLKHALEKAEELCSQVNEGVREKENS---DRLEWIQAHVQCEGLSEQL
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pF1KB5 EASKVLLC-------H-GEL-RSKSGHKLYIFLFQDILVLT---RPV---------TRNE
         ..:  :       : :.: ..::...:: :::.:.:.::   .:.         . . 
CCDS33 VFNSVTNCLGPRKFLHSGKLYKAKSNKELYGFLFNDFLLLTQITKPLGSSGTDKVFSPKS
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pF1KB5 RHSYQVYRQPIPVQELVLEDLQDGDVRMGGSFRGAFSNSEKAKNIFRIRFHDPSPAQSHT
         .:..:. :: ..:....   :             :..:    ::.:   :    . .:
CCDS33 NLQYKMYKTPIFLNEVLVKLPTDP------------SGDEP---IFHISHID----RVYT
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pF1KB5 LQANDVFHKQQWFNCIRAAIAPFQSAGSPPELQGLPELHEECEGNHPSARKLTAQRRAST
       :.:... ..  : . :.::                                         
CCDS33 LRAESINERTAWVQKIKAASELYIETEKKKREKAYLVRSQRATGIGRLMVNVVEGIELKP
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>>CCDS1711.2 ITSN2 gene_id:50618|Hs108|chr2               (1670 aa)
 initn: 262 init1: 130 opt: 316  Z-score: 329.5  bits: 72.5 E(32554): 4.9e-12
Smith-Waterman score: 365; 25.1% identity (53.4% similar) in 522 aa overlap (20-499:1023-1515)

                          10        20        30         40        
pF1KB5            MEPELAAQKQPRPRRRSRRASGLSTEGATGPSADT-SGSELDGRCSLRR
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CCDS17 GSIGDRSGIFPSNYVKPKDQESFGSASKSGASNKKPEIAQVTSAYVASGSE---QLSLAP
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pF1KB5 GSSFTFLTPGPN--WDFTLKRKRREKDDDVVSLSSLDLKEPSNKRV----RPLARVTSLA
       :. . .:  . .  :.  :. . ....      : . :  ::..:.    .:. .: .. 
CCDS17 GQLILILKKNTSGWWQGELQARGKKRQKGWFPASHVKLLGPSSERATPAFHPVCQVIAMY
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pF1KB5 NLISPVRNGAVRRFGQTIQSFTLRGDHRSPASAQKFSSRSTVPTPAKRRS-----SALWS
       .  .  ..      :: :.  ..  :  .  ...  .  .  :.   . .     :  : 
CCDS17 DYAANNEDELSFSKGQLIN--VMNKDDPDWWQGEINGVTGLFPSNYVKMTTDSDPSQQWC
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pF1KB5 EMLDITMKESLTTREIRRQEAIYEMSRGEQDLIEDLKLARKAYHDPMLKLSIMSEEELTH
          :.   ...   : .::  :.:. . :.  . ::.:. ....  : . ....: :.. 
CCDS17 A--DLQTLDTMQPIERKRQGYIHELIQTEERYMADLQLVVEVFQKRMAESGFLTEGEMAL
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pF1KB5 IFGDLDSYIPLHEDLLTRIGEATKPDGT---VEQIGHILVSWLPRLNAYRGYCSNQLAAK
       :: .    :  .  ::  .    :  :    :..:: ::.. : ...::  .:: :: . 
CCDS17 IFVNWKELIMSNTKLLKALRVRKKTGGEKMPVQMIGDILAAELSHMQAYIRFCSCQLNGA
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pF1KB5 ALLDQKK-QDPRVQDFLQRCLESPFSRKLDLWSFLDIPRSRLVKYPLLLKEILKHTPKEH
       :::.::  .:   ..::..   .:  . . : :::  : .:...::::.. ::..::. :
CCDS17 ALLQQKTDEDTDFKEFLKKLASDPRCKGMPLSSFLLKPMQRITRYPLLIRSILENTPESH
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pF1KB5 PDVQLLEDAILIIQGVLSDINLKKGESECQYYIDKLEYLD-----EKQRDPRIEAS----
        : . :. :.   . . :..:    :.: .   :.::...     :   .  :  :    
CCDS17 ADHSSLKLALERAEELCSQVNEGVREKENS---DRLEWIQAHVQCEGLAEQLIFNSLTNC
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pF1KB5 ---KVLLCHGEL-RSKSGHKLYIFLFQDILVLTRPVTR------NER-------HSYQVY
          . ::  :.: ..::...:. :::.:.:.::  : .      .:.        ....:
CCDS17 LGPRKLLHSGKLYKTKSNKELHGFLFNDFLLLTYMVKQFAVSSGSEKLFSSKSNAQFKMY
           1410      1420      1430      1440      1450      1460  

       430       440       450       460       470       480       
pF1KB5 RQPIPVQELVLEDLQDGDVRMGGSFRGAFSNSEKAKNIFRIRFHDPSPAQSHTLQANDVF
       . :: ..:....   :             :..:    .:.:   :    . .::..... 
CCDS17 KTPIFLNEVLVKLPTDP------------SSDEP---VFHISHID----RVYTLRTDNIN
           1470                  1480         1490          1500   

       490       500       510       520       530       540       
pF1KB5 HKQQWFNCIRAAIAPFQSAGSPPELQGLPELHEECEGNHPSARKLTAQRRASTVSSVTQV
       ..  : . :.::                                                
CCDS17 ERTAWVQKIKAASEQYIDTEKKKREKAYQARSQKTSGIGRLMVHVIEATELKACKPNGKS
          1510      1520      1530      1540      1550      1560   

>>CCDS1710.2 ITSN2 gene_id:50618|Hs108|chr2               (1697 aa)
 initn: 262 init1: 130 opt: 316  Z-score: 329.4  bits: 72.5 E(32554): 5e-12
Smith-Waterman score: 365; 25.1% identity (53.4% similar) in 522 aa overlap (20-499:1050-1542)

                          10        20        30         40        
pF1KB5            MEPELAAQKQPRPRRRSRRASGLSTEGATGPSADT-SGSELDGRCSLRR
                                     ::. . : :   :: . ::::   . ::  
CCDS17 GSIGDRSGIFPSNYVKPKDQESFGSASKSGASNKKPEIAQVTSAYVASGSE---QLSLAP
    1020      1030      1040      1050      1060      1070         

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       .  .  ..      :: :.  ..  :  .  ...  .  .  :.   . .     :  : 
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CCDS17 ADHSSLKLALERAEELCSQVNEGVREKENS---DRLEWIQAHVQCEGLAEQLIFNSLTNC
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CCDS17 LGPRKLLHSGKLYKTKSNKELHGFLFNDFLLLTYMVKQFAVSSGSEKLFSSKSNAQFKMY
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CCDS17 KTPIFLNEVLVKLPTDP------------SSDEP---VFHISHID----RVYTLRTDNIN
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