Result of FASTA (ccds) for pF1KB3324
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB3324, 605 aa
  1>>>pF1KB3324 605 - 605 aa - 605 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.7695+/-0.0012; mu= 11.0693+/- 0.070
 mean_var=129.5059+/-28.296, 0's: 0 Z-trim(105.8): 167  B-trim: 340 in 2/48
 Lambda= 0.112701
 statistics sampled from 8393 (8612) to 8393 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.626), E-opt: 0.2 (0.265), width:  16
 Scan time:  3.090

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS7512.1 BTRC gene_id:8945|Hs108|chr10           ( 605) 4142 685.8 4.1e-197
CCDS7511.1 BTRC gene_id:8945|Hs108|chr10           ( 569) 3790 628.6 6.7e-180
CCDS73183.1 BTRC gene_id:8945|Hs108|chr10          ( 579) 3608 599.0 5.5e-171
CCDS34289.1 FBXW11 gene_id:23291|Hs108|chr5        ( 542) 3049 508.1 1.2e-143
CCDS47340.1 FBXW11 gene_id:23291|Hs108|chr5        ( 508) 3026 504.3 1.5e-142
CCDS47341.1 FBXW11 gene_id:23291|Hs108|chr5        ( 529) 3026 504.3 1.6e-142
CCDS2470.1 DAW1 gene_id:164781|Hs108|chr2          ( 415)  458 86.7 6.4e-17
CCDS34078.1 FBXW7 gene_id:55294|Hs108|chr4         ( 589)  450 85.5 2.1e-16
CCDS3778.1 FBXW7 gene_id:55294|Hs108|chr4          ( 627)  450 85.6 2.2e-16
CCDS3777.1 FBXW7 gene_id:55294|Hs108|chr4          ( 707)  450 85.6 2.4e-16
CCDS75680.1 WDR86 gene_id:349136|Hs108|chr7        ( 248)  386 74.8 1.4e-13
CCDS5925.2 WDR86 gene_id:349136|Hs108|chr7         ( 376)  386 75.0   2e-13
CCDS7547.1 TAF5 gene_id:6877|Hs108|chr10           ( 800)  378 73.9 8.7e-13
CCDS1581.1 TAF5L gene_id:27097|Hs108|chr1          ( 589)  374 73.2 1.1e-12
CCDS6981.1 WDR5 gene_id:11091|Hs108|chr9           ( 334)  369 72.2 1.2e-12
CCDS3108.1 COPB2 gene_id:9276|Hs108|chr3           ( 906)  354 70.1 1.4e-11
CCDS10788.1 KATNB1 gene_id:10300|Hs108|chr16       ( 655)  348 69.0 2.2e-11
CCDS45619.1 CDRT1 gene_id:374286|Hs108|chr17       ( 752)  339 67.6 6.7e-11
CCDS11291.1 NLE1 gene_id:54475|Hs108|chr17         ( 485)  335 66.8 7.6e-11
CCDS11199.3 FBXW10 gene_id:10517|Hs108|chr17       (1052)  340 67.9 7.8e-11
CCDS73996.1 CDRT1 gene_id:374286|Hs108|chr17       ( 714)  337 67.2 8.1e-11


>>CCDS7512.1 BTRC gene_id:8945|Hs108|chr10                (605 aa)
 initn: 4142 init1: 4142 opt: 4142  Z-score: 3652.2  bits: 685.8 E(32554): 4.1e-197
Smith-Waterman score: 4142; 100.0% identity (100.0% similar) in 605 aa overlap (1-605:1-605)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB3 MDPAEAVLQEKALKFMCSMPRSLWLGCSSLADSMPSLRCLYNPGTGALTAFQNSSEREDC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 MDPAEAVLQEKALKFMCSMPRSLWLGCSSLADSMPSLRCLYNPGTGALTAFQNSSEREDC
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB3 NNGEPPRKIIPEKNSLRQTYNSCARLCLNQETVCLASTAMKTENCVAKTKLANGTSSMIV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 NNGEPPRKIIPEKNSLRQTYNSCARLCLNQETVCLASTAMKTENCVAKTKLANGTSSMIV
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB3 PKQRKLSASYEKEKELCVKYFEQWSESDQVEFVEHLISQMCHYQHGHINSYLKPMLQRDF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 PKQRKLSASYEKEKELCVKYFEQWSESDQVEFVEHLISQMCHYQHGHINSYLKPMLQRDF
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB3 ITALPARGLDHIAENILSYLDAKSLCAAELVCKEWYRVTSDGMLWKKLIERMVRTDSLWR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 ITALPARGLDHIAENILSYLDAKSLCAAELVCKEWYRVTSDGMLWKKLIERMVRTDSLWR
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB3 GLAERRGWGQYLFKNKPPDGNAPPNSFYRALYPKIIQDIETIESNWRCGRHSLQRIHCRS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 GLAERRGWGQYLFKNKPPDGNAPPNSFYRALYPKIIQDIETIESNWRCGRHSLQRIHCRS
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB3 ETSKGVYCLQYDDQKIVSGLRDNTIKIWDKNTLECKRILTGHTGSVLCLQYDERVIITGS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 ETSKGVYCLQYDDQKIVSGLRDNTIKIWDKNTLECKRILTGHTGSVLCLQYDERVIITGS
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB3 SDSTVRVWDVNTGEMLNTLIHHCEAVLHLRFNNGMMVTCSKDRSIAVWDMASPTDITLRR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 SDSTVRVWDVNTGEMLNTLIHHCEAVLHLRFNNGMMVTCSKDRSIAVWDMASPTDITLRR
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB3 VLVGHRAAVNVVDFDDKYIVSASGDRTIKVWNTSTCEFVRTLNGHKRGIACLQYRDRLVV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 VLVGHRAAVNVVDFDDKYIVSASGDRTIKVWNTSTCEFVRTLNGHKRGIACLQYRDRLVV
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB3 SGSSDNTIRLWDIECGACLRVLEGHEELVRCIRFDNKRIVSGAYDGKIKVWDLVAALDPR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 SGSSDNTIRLWDIECGACLRVLEGHEELVRCIRFDNKRIVSGAYDGKIKVWDLVAALDPR
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB3 APAGTLCLRTLVEHSGRVFRLQFDEFQIVSSSHDDTILIWDFLNDPAAQAEPPRSPSRTY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 APAGTLCLRTLVEHSGRVFRLQFDEFQIVSSSHDDTILIWDFLNDPAAQAEPPRSPSRTY
              550       560       570       580       590       600

            
pF1KB3 TYISR
       :::::
CCDS75 TYISR
            

>>CCDS7511.1 BTRC gene_id:8945|Hs108|chr10                (569 aa)
 initn: 3790 init1: 3790 opt: 3790  Z-score: 3343.3  bits: 628.6 E(32554): 6.7e-180
Smith-Waterman score: 3801; 94.0% identity (94.0% similar) in 605 aa overlap (1-605:1-569)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB3 MDPAEAVLQEKALKFMCSMPRSLWLGCSSLADSMPSLRCLYNPGTGALTAFQNSSEREDC
       ::::::::::::::::                                    ::::::::
CCDS75 MDPAEAVLQEKALKFM------------------------------------NSSEREDC
               10                                            20    

               70        80        90       100       110       120
pF1KB3 NNGEPPRKIIPEKNSLRQTYNSCARLCLNQETVCLASTAMKTENCVAKTKLANGTSSMIV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 NNGEPPRKIIPEKNSLRQTYNSCARLCLNQETVCLASTAMKTENCVAKTKLANGTSSMIV
           30        40        50        60        70        80    

              130       140       150       160       170       180
pF1KB3 PKQRKLSASYEKEKELCVKYFEQWSESDQVEFVEHLISQMCHYQHGHINSYLKPMLQRDF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 PKQRKLSASYEKEKELCVKYFEQWSESDQVEFVEHLISQMCHYQHGHINSYLKPMLQRDF
           90       100       110       120       130       140    

              190       200       210       220       230       240
pF1KB3 ITALPARGLDHIAENILSYLDAKSLCAAELVCKEWYRVTSDGMLWKKLIERMVRTDSLWR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 ITALPARGLDHIAENILSYLDAKSLCAAELVCKEWYRVTSDGMLWKKLIERMVRTDSLWR
          150       160       170       180       190       200    

              250       260       270       280       290       300
pF1KB3 GLAERRGWGQYLFKNKPPDGNAPPNSFYRALYPKIIQDIETIESNWRCGRHSLQRIHCRS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 GLAERRGWGQYLFKNKPPDGNAPPNSFYRALYPKIIQDIETIESNWRCGRHSLQRIHCRS
          210       220       230       240       250       260    

              310       320       330       340       350       360
pF1KB3 ETSKGVYCLQYDDQKIVSGLRDNTIKIWDKNTLECKRILTGHTGSVLCLQYDERVIITGS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 ETSKGVYCLQYDDQKIVSGLRDNTIKIWDKNTLECKRILTGHTGSVLCLQYDERVIITGS
          270       280       290       300       310       320    

              370       380       390       400       410       420
pF1KB3 SDSTVRVWDVNTGEMLNTLIHHCEAVLHLRFNNGMMVTCSKDRSIAVWDMASPTDITLRR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 SDSTVRVWDVNTGEMLNTLIHHCEAVLHLRFNNGMMVTCSKDRSIAVWDMASPTDITLRR
          330       340       350       360       370       380    

              430       440       450       460       470       480
pF1KB3 VLVGHRAAVNVVDFDDKYIVSASGDRTIKVWNTSTCEFVRTLNGHKRGIACLQYRDRLVV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 VLVGHRAAVNVVDFDDKYIVSASGDRTIKVWNTSTCEFVRTLNGHKRGIACLQYRDRLVV
          390       400       410       420       430       440    

              490       500       510       520       530       540
pF1KB3 SGSSDNTIRLWDIECGACLRVLEGHEELVRCIRFDNKRIVSGAYDGKIKVWDLVAALDPR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 SGSSDNTIRLWDIECGACLRVLEGHEELVRCIRFDNKRIVSGAYDGKIKVWDLVAALDPR
          450       460       470       480       490       500    

              550       560       570       580       590       600
pF1KB3 APAGTLCLRTLVEHSGRVFRLQFDEFQIVSSSHDDTILIWDFLNDPAAQAEPPRSPSRTY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 APAGTLCLRTLVEHSGRVFRLQFDEFQIVSSSHDDTILIWDFLNDPAAQAEPPRSPSRTY
          510       520       530       540       550       560    

            
pF1KB3 TYISR
       :::::
CCDS75 TYISR
            

>>CCDS73183.1 BTRC gene_id:8945|Hs108|chr10               (579 aa)
 initn: 3608 init1: 3608 opt: 3608  Z-score: 3183.3  bits: 599.0 E(32554): 5.5e-171
Smith-Waterman score: 3899; 95.7% identity (95.7% similar) in 605 aa overlap (1-605:1-579)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB3 MDPAEAVLQEKALKFMCSMPRSLWLGCSSLADSMPSLRCLYNPGTGALTAFQNSSEREDC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::        
CCDS73 MDPAEAVLQEKALKFMCSMPRSLWLGCSSLADSMPSLRCLYNPGTGALTAFQ--------
               10        20        30        40        50          

               70        80        90       100       110       120
pF1KB3 NNGEPPRKIIPEKNSLRQTYNSCARLCLNQETVCLASTAMKTENCVAKTKLANGTSSMIV
                         ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 ------------------TYNSCARLCLNQETVCLASTAMKTENCVAKTKLANGTSSMIV
                               60        70        80        90    

              130       140       150       160       170       180
pF1KB3 PKQRKLSASYEKEKELCVKYFEQWSESDQVEFVEHLISQMCHYQHGHINSYLKPMLQRDF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 PKQRKLSASYEKEKELCVKYFEQWSESDQVEFVEHLISQMCHYQHGHINSYLKPMLQRDF
          100       110       120       130       140       150    

              190       200       210       220       230       240
pF1KB3 ITALPARGLDHIAENILSYLDAKSLCAAELVCKEWYRVTSDGMLWKKLIERMVRTDSLWR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 ITALPARGLDHIAENILSYLDAKSLCAAELVCKEWYRVTSDGMLWKKLIERMVRTDSLWR
          160       170       180       190       200       210    

              250       260       270       280       290       300
pF1KB3 GLAERRGWGQYLFKNKPPDGNAPPNSFYRALYPKIIQDIETIESNWRCGRHSLQRIHCRS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 GLAERRGWGQYLFKNKPPDGNAPPNSFYRALYPKIIQDIETIESNWRCGRHSLQRIHCRS
          220       230       240       250       260       270    

              310       320       330       340       350       360
pF1KB3 ETSKGVYCLQYDDQKIVSGLRDNTIKIWDKNTLECKRILTGHTGSVLCLQYDERVIITGS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 ETSKGVYCLQYDDQKIVSGLRDNTIKIWDKNTLECKRILTGHTGSVLCLQYDERVIITGS
          280       290       300       310       320       330    

              370       380       390       400       410       420
pF1KB3 SDSTVRVWDVNTGEMLNTLIHHCEAVLHLRFNNGMMVTCSKDRSIAVWDMASPTDITLRR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 SDSTVRVWDVNTGEMLNTLIHHCEAVLHLRFNNGMMVTCSKDRSIAVWDMASPTDITLRR
          340       350       360       370       380       390    

              430       440       450       460       470       480
pF1KB3 VLVGHRAAVNVVDFDDKYIVSASGDRTIKVWNTSTCEFVRTLNGHKRGIACLQYRDRLVV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 VLVGHRAAVNVVDFDDKYIVSASGDRTIKVWNTSTCEFVRTLNGHKRGIACLQYRDRLVV
          400       410       420       430       440       450    

              490       500       510       520       530       540
pF1KB3 SGSSDNTIRLWDIECGACLRVLEGHEELVRCIRFDNKRIVSGAYDGKIKVWDLVAALDPR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 SGSSDNTIRLWDIECGACLRVLEGHEELVRCIRFDNKRIVSGAYDGKIKVWDLVAALDPR
          460       470       480       490       500       510    

              550       560       570       580       590       600
pF1KB3 APAGTLCLRTLVEHSGRVFRLQFDEFQIVSSSHDDTILIWDFLNDPAAQAEPPRSPSRTY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 APAGTLCLRTLVEHSGRVFRLQFDEFQIVSSSHDDTILIWDFLNDPAAQAEPPRSPSRTY
          520       530       540       550       560       570    

            
pF1KB3 TYISR
       :::::
CCDS73 TYISR
            

>>CCDS34289.1 FBXW11 gene_id:23291|Hs108|chr5             (542 aa)
 initn: 2304 init1: 2160 opt: 3049  Z-score: 2692.4  bits: 508.1 E(32554): 1.2e-143
Smith-Waterman score: 3074; 76.2% identity (85.8% similar) in 605 aa overlap (1-605:1-542)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB3 MDPAEAVLQEKALKFMCSMPRSLWLGCSSLADSMPSLRCLYNPGTGALTAFQNSSEREDC
       :.: ..:...:....:::.::::::::..:..:: .: :: .                  
CCDS34 MEP-DSVIEDKTIELMCSVPRSLWLGCANLVESMCALSCLQS------------------
                10        20        30        40                   

               70        80        90       100       110       120
pF1KB3 NNGEPPRKIIPEKNSLRQTYNSCARLCLNQETVCLASTAMKTENCVAKTKLANGTSSMIV
                .:   :.:                ::              ...:::::.::
CCDS34 ---------MP---SVR----------------CL--------------QISNGTSSVIV
                                                        50         

              130       140       150       160       170       180
pF1KB3 PKQRKLSASYEKEKELCVKYFEQWSESDQVEFVEHLISQMCHYQHGHINSYLKPMLQRDF
        ..:   ..:.:::.::.:::.::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::
CCDS34 SRKRPSEGNYQKEKDLCIKYFDQWSESDQVEFVEHLISRMCHYQHGHINSYLKPMLQRDF
      60        70        80        90       100       110         

              190       200       210       220       230       240
pF1KB3 ITALPARGLDHIAENILSYLDAKSLCAAELVCKEWYRVTSDGMLWKKLIERMVRTDSLWR
       ::::: .:::::::::::::::.:::::::::::: :: :.::::::::::::::: ::.
CCDS34 ITALPEQGLDHIAENILSYLDARSLCAAELVCKEWQRVISEGMLWKKLIERMVRTDPLWK
     120       130       140       150       160       170         

              250       260       270       280       290       300
pF1KB3 GLAERRGWGQYLFKNKPPDGNAPPNSFYRALYPKIIQDIETIESNWRCGRHSLQRIHCRS
       ::.::::: ::::::.: ::  :::::::.:::::::::::::::::::::.::::.:::
CCDS34 GLSERRGWDQYLFKNRPTDG--PPNSFYRSLYPKIIQDIETIESNWRCGRHNLQRIQCRS
     180       190         200       210       220       230       

              310       320       330       340       350       360
pF1KB3 ETSKGVYCLQYDDQKIVSGLRDNTIKIWDKNTLECKRILTGHTGSVLCLQYDERVIITGS
       :.:::::::::::.::.::::::.::::::..::: ..::::::::::::::::::.:::
CCDS34 ENSKGVYCLQYDDEKIISGLRDNSIKIWDKTSLECLKVLTGHTGSVLCLQYDERVIVTGS
       240       250       260       270       280       290       

              370       380       390       400       410       420
pF1KB3 SDSTVRVWDVNTGEMLNTLIHHCEAVLHLRFNNGMMVTCSKDRSIAVWDMASPTDITLRR
       ::::::::::::::.::::::: ::::::::.::.::::::::::::::::: :::::::
CCDS34 SDSTVRVWDVNTGEVLNTLIHHNEAVLHLRFSNGLMVTCSKDRSIAVWDMASATDITLRR
       300       310       320       330       340       350       

              430       440       450       460       470       480
pF1KB3 VLVGHRAAVNVVDFDDKYIVSASGDRTIKVWNTSTCEFVRTLNGHKRGIACLQYRDRLVV
       :::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 VLVGHRAAVNVVDFDDKYIVSASGDRTIKVWSTSTCEFVRTLNGHKRGIACLQYRDRLVV
       360       370       380       390       400       410       

              490       500       510       520       530       540
pF1KB3 SGSSDNTIRLWDIECGACLRVLEGHEELVRCIRFDNKRIVSGAYDGKIKVWDLVAALDPR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::
CCDS34 SGSSDNTIRLWDIECGACLRVLEGHEELVRCIRFDNKRIVSGAYDGKIKVWDLQAALDPR
       420       430       440       450       460       470       

              550       560       570       580       590       600
pF1KB3 APAGTLCLRTLVEHSGRVFRLQFDEFQIVSSSHDDTILIWDFLNDPAAQAEPPRSPSRTY
       :::.::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::: : .  .  :::::::
CCDS34 APASTLCLRTLVEHSGRVFRLQFDEFQIISSSHDDTILIWDFLNVPPSAQNETRSPSRTY
       480       490       500       510       520       530       

            
pF1KB3 TYISR
       :::::
CCDS34 TYISR
       540  

>>CCDS47340.1 FBXW11 gene_id:23291|Hs108|chr5             (508 aa)
 initn: 2160 init1: 2160 opt: 3026  Z-score: 2672.6  bits: 504.3 E(32554): 1.5e-142
Smith-Waterman score: 3026; 86.7% identity (94.8% similar) in 503 aa overlap (103-605:8-508)

             80        90       100       110       120       130  
pF1KB3 KNSLRQTYNSCARLCLNQETVCLASTAMKTENCVAKTKLANGTSSMIVPKQRKLSASYEK
                                     :. . .  ..:::::.:: ..:   ..:.:
CCDS47                        MEPDSVIEDKTIELMISNGTSSVIVSRKRPSEGNYQK
                                      10        20        30       

            140       150       160       170       180       190  
pF1KB3 EKELCVKYFEQWSESDQVEFVEHLISQMCHYQHGHINSYLKPMLQRDFITALPARGLDHI
       ::.::.:::.::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::: .:::::
CCDS47 EKDLCIKYFDQWSESDQVEFVEHLISRMCHYQHGHINSYLKPMLQRDFITALPEQGLDHI
        40        50        60        70        80        90       

            200       210       220       230       240       250  
pF1KB3 AENILSYLDAKSLCAAELVCKEWYRVTSDGMLWKKLIERMVRTDSLWRGLAERRGWGQYL
       ::::::::::.:::::::::::: :: :.::::::::::::::: ::.::.::::: :::
CCDS47 AENILSYLDARSLCAAELVCKEWQRVISEGMLWKKLIERMVRTDPLWKGLSERRGWDQYL
       100       110       120       130       140       150       

            260       270       280       290       300       310  
pF1KB3 FKNKPPDGNAPPNSFYRALYPKIIQDIETIESNWRCGRHSLQRIHCRSETSKGVYCLQYD
       :::.: ::  :::::::.:::::::::::::::::::::.::::.::::.::::::::::
CCDS47 FKNRPTDG--PPNSFYRSLYPKIIQDIETIESNWRCGRHNLQRIQCRSENSKGVYCLQYD
       160         170       180       190       200       210     

            320       330       340       350       360       370  
pF1KB3 DQKIVSGLRDNTIKIWDKNTLECKRILTGHTGSVLCLQYDERVIITGSSDSTVRVWDVNT
       :.::.::::::.::::::..::: ..::::::::::::::::::.:::::::::::::::
CCDS47 DEKIISGLRDNSIKIWDKTSLECLKVLTGHTGSVLCLQYDERVIVTGSSDSTVRVWDVNT
         220       230       240       250       260       270     

            380       390       400       410       420       430  
pF1KB3 GEMLNTLIHHCEAVLHLRFNNGMMVTCSKDRSIAVWDMASPTDITLRRVLVGHRAAVNVV
       ::.::::::: ::::::::.::.::::::::::::::::: :::::::::::::::::::
CCDS47 GEVLNTLIHHNEAVLHLRFSNGLMVTCSKDRSIAVWDMASATDITLRRVLVGHRAAVNVV
         280       290       300       310       320       330     

            440       450       460       470       480       490  
pF1KB3 DFDDKYIVSASGDRTIKVWNTSTCEFVRTLNGHKRGIACLQYRDRLVVSGSSDNTIRLWD
       :::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 DFDDKYIVSASGDRTIKVWSTSTCEFVRTLNGHKRGIACLQYRDRLVVSGSSDNTIRLWD
         340       350       360       370       380       390     

            500       510       520       530       540       550  
pF1KB3 IECGACLRVLEGHEELVRCIRFDNKRIVSGAYDGKIKVWDLVAALDPRAPAGTLCLRTLV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::.::::::::
CCDS47 IECGACLRVLEGHEELVRCIRFDNKRIVSGAYDGKIKVWDLQAALDPRAPASTLCLRTLV
         400       410       420       430       440       450     

            560       570       580       590       600     
pF1KB3 EHSGRVFRLQFDEFQIVSSSHDDTILIWDFLNDPAAQAEPPRSPSRTYTYISR
       ::::::::::::::::.::::::::::::::: : .  .  ::::::::::::
CCDS47 EHSGRVFRLQFDEFQIISSSHDDTILIWDFLNVPPSAQNETRSPSRTYTYISR
         460       470       480       490       500        

>>CCDS47341.1 FBXW11 gene_id:23291|Hs108|chr5             (529 aa)
 initn: 2160 init1: 2160 opt: 3026  Z-score: 2672.4  bits: 504.3 E(32554): 1.6e-142
Smith-Waterman score: 3026; 87.7% identity (95.6% similar) in 496 aa overlap (110-605:36-529)

      80        90       100       110       120       130         
pF1KB3 YNSCARLCLNQETVCLASTAMKTENCVAKTKLANGTSSMIVPKQRKLSASYEKEKELCVK
                                     ...:::::.:: ..:   ..:.:::.::.:
CCDS47 VIEDKTIELMNTSVMEDQNEDESPKKNTLWQISNGTSSVIVSRKRPSEGNYQKEKDLCIK
          10        20        30        40        50        60     

     140       150       160       170       180       190         
pF1KB3 YFEQWSESDQVEFVEHLISQMCHYQHGHINSYLKPMLQRDFITALPARGLDHIAENILSY
       ::.::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::: .::::::::::::
CCDS47 YFDQWSESDQVEFVEHLISRMCHYQHGHINSYLKPMLQRDFITALPEQGLDHIAENILSY
          70        80        90       100       110       120     

     200       210       220       230       240       250         
pF1KB3 LDAKSLCAAELVCKEWYRVTSDGMLWKKLIERMVRTDSLWRGLAERRGWGQYLFKNKPPD
       :::.:::::::::::: :: :.::::::::::::::: ::.::.::::: ::::::.: :
CCDS47 LDARSLCAAELVCKEWQRVISEGMLWKKLIERMVRTDPLWKGLSERRGWDQYLFKNRPTD
         130       140       150       160       170       180     

     260       270       280       290       300       310         
pF1KB3 GNAPPNSFYRALYPKIIQDIETIESNWRCGRHSLQRIHCRSETSKGVYCLQYDDQKIVSG
       :  :::::::.:::::::::::::::::::::.::::.::::.:::::::::::.::.::
CCDS47 G--PPNSFYRSLYPKIIQDIETIESNWRCGRHNLQRIQCRSENSKGVYCLQYDDEKIISG
           190       200       210       220       230       240   

     320       330       340       350       360       370         
pF1KB3 LRDNTIKIWDKNTLECKRILTGHTGSVLCLQYDERVIITGSSDSTVRVWDVNTGEMLNTL
       ::::.::::::..::: ..::::::::::::::::::.:::::::::::::::::.::::
CCDS47 LRDNSIKIWDKTSLECLKVLTGHTGSVLCLQYDERVIVTGSSDSTVRVWDVNTGEVLNTL
           250       260       270       280       290       300   

     380       390       400       410       420       430         
pF1KB3 IHHCEAVLHLRFNNGMMVTCSKDRSIAVWDMASPTDITLRRVLVGHRAAVNVVDFDDKYI
       ::: ::::::::.::.::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 IHHNEAVLHLRFSNGLMVTCSKDRSIAVWDMASATDITLRRVLVGHRAAVNVVDFDDKYI
           310       320       330       340       350       360   

     440       450       460       470       480       490         
pF1KB3 VSASGDRTIKVWNTSTCEFVRTLNGHKRGIACLQYRDRLVVSGSSDNTIRLWDIECGACL
       ::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 VSASGDRTIKVWSTSTCEFVRTLNGHKRGIACLQYRDRLVVSGSSDNTIRLWDIECGACL
           370       380       390       400       410       420   

     500       510       520       530       540       550         
pF1KB3 RVLEGHEELVRCIRFDNKRIVSGAYDGKIKVWDLVAALDPRAPAGTLCLRTLVEHSGRVF
       :::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::.:::::::::::::::
CCDS47 RVLEGHEELVRCIRFDNKRIVSGAYDGKIKVWDLQAALDPRAPASTLCLRTLVEHSGRVF
           430       440       450       460       470       480   

     560       570       580       590       600     
pF1KB3 RLQFDEFQIVSSSHDDTILIWDFLNDPAAQAEPPRSPSRTYTYISR
       :::::::::.::::::::::::::: : .  .  ::::::::::::
CCDS47 RLQFDEFQIISSSHDDTILIWDFLNVPPSAQNETRSPSRTYTYISR
           490       500       510       520         

>>CCDS2470.1 DAW1 gene_id:164781|Hs108|chr2               (415 aa)
 initn: 406 init1: 128 opt: 458  Z-score: 417.2  bits: 86.7 E(32554): 6.4e-17
Smith-Waterman score: 507; 29.9% identity (64.6% similar) in 291 aa overlap (306-580:137-414)

         280       290       300       310          320       330  
pF1KB3 IQDIETIESNWRCGRHSLQRIHCRSETSKGVYCLQYDD---QKIVSGLRDNTIKIWDKNT
                                     :: . ...   .::..:  :.: :.:. .:
CCDS24 FITGSYDRTCKLWDTASGEELNTLEGHRNVVYAIAFNNPYGDKIATGSFDKTCKLWSVET
        110       120       130       140       150       160      

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pF1KB3 LECKRILTGHTGSVLCLQYDER--VIITGSSDSTVRVWDVNTGEMLNTLIHHCEAVLHLR
        .: . . :::. ..::... .  .. ::: :.:...::...:: . ::  :   .. : 
CCDS24 GKCYHTFRGHTAEIVCLSFNPQSTLVATGSMDTTAKLWDIQNGEEVYTLRGHSAEIISLS
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pF1KB3 FNNG--MMVTCSKDRSIAVWDMASPTDITLRRVLVGHRAAVNVVDF--DDKYIVSASGDR
       ::..   ..: : :....:::  .   ..   .:.:: : .. ..:  : . :...: :.
CCDS24 FNTSGDRIITGSFDHTVVVWDADTGRKVN---ILIGHCAEISSASFNWDCSLILTGSMDK
        230       240       250          260       270       280   

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pF1KB3 TIKVWNTSTCEFVRTLNGHKRGI--ACLQYRDRLVVSGSSDNTIRLWDIECGACLRVLEG
       : :.:.... . : ::.::   :  .:..:  .:....:.:.: :...     :.  :::
CCDS24 TCKLWDATNGKCVATLTGHDDEILDSCFDYTGKLIATASADGTARIFSAATRKCIAKLEG
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pF1KB3 HEELVRCIRFDNK--RIVSGAYDGKIKVWDLVAALDPRAPAGTLCLRTLVEHSGRVFRLQ
       ::  .  : :. .  ....:. :   ..::        : .:  ::..:  :. ..:   
CCDS24 HEGEISKISFNPQGNHLLTGSSDKTARIWD--------AQTGQ-CLQVLEGHTDEIFSCA
           350       360       370                380       390    

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pF1KB3 FDEFQ---IVSSSHDDTILIWDFLNDPAAQAEPPRSPSRTYTYISR
       :. ..   ....:.:.:  ::                         
CCDS24 FN-YKGNIVITGSKDNTCRIWR                        
           400       410                             

>>CCDS34078.1 FBXW7 gene_id:55294|Hs108|chr4              (589 aa)
 initn: 1016 init1: 413 opt: 450  Z-score: 408.1  bits: 85.5 E(32554): 2.1e-16
Smith-Waterman score: 776; 32.7% identity (63.1% similar) in 447 aa overlap (122-563:102-514)

             100       110       120       130         140         
pF1KB3 TVCLASTAMKTENCVAKTKLANGTSSMIVPKQRKLSASYEKEKELC--VKYFEQWSESDQ
                                     .::.  .: .    :   .:.:..::  ..
CCDS34 VSEYTSTTGLVPCSATPTTFGDLRAANGQGQQRRRITSVQPPTGLQEWLKMFQSWSGPEK
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     150       160       170       180       190       200         
pF1KB3 VEFVEHLISQMCHYQHGHINSYLKPMLQRDFITALPARGLDHIAENILSYLDAKSLCAAE
       .  ...::..    :  :. . ..:..:::::. ::     ..:  .::.:. :.:  : 
CCDS34 LLALDELIDSCEPTQVKHMMQVIEPQFQRDFISLLP----KELALYVLSFLEPKDLLQAA
             140       150       160           170       180       

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pF1KB3 LVCKEWYRVTSDGMLWKKLIERMVRTDSLWRGLAERRGWGQYLFKNKPPDGNAPPNSFYR
        .:. :  .. :..::.   :.  . ... . :  .:   . ..:  :   ..: .: : 
CCDS34 QTCRYWRILAEDNLLWR---EK-CKEEGIDEPLHIKR---RKVIK--PGFIHSPWKSAY-
       190       200           210       220            230        

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pF1KB3 ALYPKIIQDIETIESNWRCGRHSLQRIHCRSETSKGVYCLQYDDQKIVSGLRDNTIKIWD
            : :  . :..::: :. .  ..  ... .. . :::.  ..::::  :::.:.:.
CCDS34 -----IRQ--HRIDTNWRRGELKSPKV-LKGHDDHVITCLQFCGNRIVSGSDDNTLKVWS
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     330       340       350       360       370       380         
pF1KB3 KNTLECKRILTGHTGSVLCLQYDERVIITGSSDSTVRVWDVNTGEMLNTLIHHCEAVLHL
         : .: : :.::::.:   :. . .::.::.: :..::...::: ..::  :  .:  .
CCDS34 AVTGKCLRTLVGHTGGVWSSQMRDNIIISGSTDRTLKVWNAETGECIHTLYGHTSTVRCM
     290       300       310       320       330       340         

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pF1KB3 RFNNGMMVTCSKDRSIAVWDMASPTDITLRRVLVGHRAAVNVVDFDDKYIVSASGDRTIK
       ....  .:. :.: .. :::. .   .   .::.:: :::  :..: . .::.. :  .:
CCDS34 HLHEKRVVSGSRDATLRVWDIETGQCL---HVLMGHVAAVRCVQYDGRRVVSGAYDFMVK
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pF1KB3 VWNTSTCEFVRTLNGHKRGIACLQYRDRLVVSGSSDNTIRLWDIECGACLRVLEGHEELV
       ::.  :   ..::.::   .  ::.    ::::: :..::.::.: : :...: ::. :.
CCDS34 VWDPETETCLHTLQGHTNRVYSLQFDGIHVVSGSLDTSIRVWDVETGNCIHTLTGHQSLT
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pF1KB3 RCIRFDNKRIVSGAYDGKIKVWDLVAALDPRAPAGTLCLRTLV---EHSGRVFRLQFDEF
         ... .. .:::  :. .:.::.         .:  ::.::    .:.. :  :::   
CCDS34 SGMELKDNILVSGNADSTVKIWDI--------KTGQ-CLQTLQGPNKHQSAVTCLQFNKN
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pF1KB3 QIVSSSHDDTILIWDFLNDPAAQAEPPRSPSRTYTYISR                     
                                                                   
CCDS34 FVITSSDDGTVKLWDLKTGEFIRNLVTLESGGSGGVVWRIRASNTKLVCAVGSRNGTEET
       520       530       540       550       560       570       

>>CCDS3778.1 FBXW7 gene_id:55294|Hs108|chr4               (627 aa)
 initn: 1016 init1: 413 opt: 450  Z-score: 407.8  bits: 85.6 E(32554): 2.2e-16
Smith-Waterman score: 778; 29.7% identity (58.7% similar) in 562 aa overlap (19-563:25-552)

                     10        20        30               40       
pF1KB3       MDPAEAVLQEKALKFMCSMPRSLWLGCSSLAD-----SMP--SLRCLYNPGTGA
                               .:   .: : :..       .:  .: :   :.. .
CCDS37 MCVPRSGLILSCICLYCGVLLPVLLPNLPFLTCLSMSTLESVTYLPEKGLYCQRLPSSRT
               10        20        30        40        50        60

        50        60         70        80        90       100      
pF1KB3 LTAFQNSSEREDCNNG-EPPRKIIPEKNSLRQTYNSCARLCLNQETVCLASTAMKTEN--
         . .. . ..  : :     :.:  : . .  ..: .:     .  : .:   .: .  
CCDS37 HGGTESLKGKNTENMGFYGTLKMIFYKMKRKLDHGSEVRSFSLGKKPCKVSEYTSTTGLV
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            110       120       130         140       150       160
pF1KB3 -CVAK-TKLANGTSSMIVPKQRKLSASYEKEKELC--VKYFEQWSESDQVEFVEHLISQM
        : :  : ...  ..    .::.  .: .    :   .:.:..::  ...  ...::.. 
CCDS37 PCSATPTTFGDLRAANGQGQQRRRITSVQPPTGLQEWLKMFQSWSGPEKLLALDELIDSC
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pF1KB3 CHYQHGHINSYLKPMLQRDFITALPARGLDHIAENILSYLDAKSLCAAELVCKEWYRVTS
          :  :. . ..:..:::::. :: .    .:  .::.:. :.:  :  .:. :  .. 
CCDS37 EPTQVKHMMQVIEPQFQRDFISLLPKE----LALYVLSFLEPKDLLQAAQTCRYWRILAE
              190       200           210       220       230      

              230       240       250       260       270       280
pF1KB3 DGMLWKKLIERMVRTDSLWRGLAERRGWGQYLFKNKPPDGNAPPNSFYRALYPKIIQDIE
       :..::..  ..    . :     .::   . .   ::   ..: .: :      : :  .
CCDS37 DNLLWREKCKEEGIDEPLH---IKRR---KVI---KPGFIHSPWKSAY------IRQ--H
        240       250             260          270                 

              290       300       310       320       330       340
pF1KB3 TIESNWRCGRHSLQRIHCRSETSKGVYCLQYDDQKIVSGLRDNTIKIWDKNTLECKRILT
        :..::: :. .  ..  ... .. . :::.  ..::::  :::.:.:.  : .: : :.
CCDS37 RIDTNWRRGELKSPKV-LKGHDDHVITCLQFCGNRIVSGSDDNTLKVWSAVTGKCLRTLV
     280       290        300       310       320       330        

              350       360       370       380       390       400
pF1KB3 GHTGSVLCLQYDERVIITGSSDSTVRVWDVNTGEMLNTLIHHCEAVLHLRFNNGMMVTCS
       ::::.:   :. . .::.::.: :..::...::: ..::  :  .:  .....  .:. :
CCDS37 GHTGGVWSSQMRDNIIISGSTDRTLKVWNAETGECIHTLYGHTSTVRCMHLHEKRVVSGS
      340       350       360       370       380       390        

              410       420       430       440       450       460
pF1KB3 KDRSIAVWDMASPTDITLRRVLVGHRAAVNVVDFDDKYIVSASGDRTIKVWNTSTCEFVR
       .: .. :::. .   .   .::.:: :::  :..: . .::.. :  .:::.  :   ..
CCDS37 RDATLRVWDIETGQCL---HVLMGHVAAVRCVQYDGRRVVSGAYDFMVKVWDPETETCLH
      400       410          420       430       440       450     

              470       480       490       500       510       520
pF1KB3 TLNGHKRGIACLQYRDRLVVSGSSDNTIRLWDIECGACLRVLEGHEELVRCIRFDNKRIV
       ::.::   .  ::.    ::::: :..::.::.: : :...: ::. :.  ... .. .:
CCDS37 TLQGHTNRVYSLQFDGIHVVSGSLDTSIRVWDVETGNCIHTLTGHQSLTSGMELKDNILV
         460       470       480       490       500       510     

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pF1KB3 SGAYDGKIKVWDLVAALDPRAPAGTLCLRTLV---EHSGRVFRLQFDEFQIVSSSHDDTI
       ::  :. .:.::.         .:  ::.::    .:.. :  :::              
CCDS37 SGNADSTVKIWDI--------KTGQ-CLQTLQGPNKHQSAVTCLQFNKNFVITSSDDGTV
         520               530        540       550       560      

       580       590       600                                     
pF1KB3 LIWDFLNDPAAQAEPPRSPSRTYTYISR                                
                                                                   
CCDS37 KLWDLKTGEFIRNLVTLESGGSGGVVWRIRASNTKLVCAVGSRNGTEETKLLVLDFDVDM
        570       580       590       600       610       620      

>>CCDS3777.1 FBXW7 gene_id:55294|Hs108|chr4               (707 aa)
 initn: 1016 init1: 413 opt: 450  Z-score: 407.0  bits: 85.6 E(32554): 2.4e-16
Smith-Waterman score: 776; 32.7% identity (63.1% similar) in 447 aa overlap (122-563:220-632)

             100       110       120       130         140         
pF1KB3 TVCLASTAMKTENCVAKTKLANGTSSMIVPKQRKLSASYEKEKELC--VKYFEQWSESDQ
                                     .::.  .: .    :   .:.:..::  ..
CCDS37 VSEYTSTTGLVPCSATPTTFGDLRAANGQGQQRRRITSVQPPTGLQEWLKMFQSWSGPEK
     190       200       210       220       230       240         

     150       160       170       180       190       200         
pF1KB3 VEFVEHLISQMCHYQHGHINSYLKPMLQRDFITALPARGLDHIAENILSYLDAKSLCAAE
       .  ...::..    :  :. . ..:..:::::. ::     ..:  .::.:. :.:  : 
CCDS37 LLALDELIDSCEPTQVKHMMQVIEPQFQRDFISLLP----KELALYVLSFLEPKDLLQAA
     250       260       270       280           290       300     

     210       220       230       240       250       260         
pF1KB3 LVCKEWYRVTSDGMLWKKLIERMVRTDSLWRGLAERRGWGQYLFKNKPPDGNAPPNSFYR
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CCDS37 QTCRYWRILAEDNLLWR---EK-CKEEGIDEPLHIKR---RKVIK--PGFIHSPWKSAY-
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