Result of FASTA (omim) for pF1KB7338
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB7338, 1063 aa
  1>>>pF1KB7338 1063 - 1063 aa - 1063 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6406+/-0.000442; mu= 20.3220+/- 0.028
 mean_var=72.8445+/-14.626, 0's: 0 Z-trim(110.3): 97  B-trim: 0 in 0/53
 Lambda= 0.150271
 statistics sampled from 18548 (18645) to 18548 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.57), E-opt: 0.2 (0.219), width:  16
 Scan time: 13.780

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_003629 (OMIM: 191830,604063) integrin alpha-8 I (1063) 7153 1560.9       0
XP_011518054 (OMIM: 191830,604063) PREDICTED: inte ( 799) 5316 1162.6       0
NP_001278423 (OMIM: 191830,604063) integrin alpha- (1048) 5206 1138.8       0
NP_002201 (OMIM: 193210) integrin alpha-V isoform  (1048) 3346 735.6 3.5e-211
NP_001138471 (OMIM: 193210) integrin alpha-V isofo (1002) 3189 701.6 5.9e-201
NP_002196 (OMIM: 135620) integrin alpha-5 precurso (1049) 2840 625.9 3.7e-178
NP_001138472 (OMIM: 193210) integrin alpha-V isofo (1012) 2587 571.0 1.1e-161
NP_000410 (OMIM: 187800,273800,607759) integrin al (1039) 2229 493.4 2.7e-138
XP_011523052 (OMIM: 187800,273800,607759) PREDICTE (1000) 2069 458.7 7.3e-128
XP_011523051 (OMIM: 187800,273800,607759) PREDICTE (1005) 1993 442.3 6.7e-123
XP_006712574 (OMIM: 147556,226730) PREDICTED: inte (1058) 1108 250.4   4e-65
XP_006712573 (OMIM: 147556,226730) PREDICTED: inte (1076) 1105 249.8 6.3e-65
XP_016859497 (OMIM: 147556,226730) PREDICTED: inte ( 944) 1021 231.5 1.7e-59
XP_016859495 (OMIM: 147556,226730) PREDICTED: inte ( 962) 1018 230.9 2.7e-59
NP_002195 (OMIM: 605025,614748) integrin alpha-3 p (1051)  864 197.5 3.3e-49
NP_000876 (OMIM: 192975) integrin alpha-4 isoform  (1032)  798 183.2 6.6e-45
NP_002198 (OMIM: 603963) integrin alpha-9 precurso (1035)  717 165.6 1.3e-39
XP_005257365 (OMIM: 605025,614748) PREDICTED: inte ( 916)  601 140.5 4.3e-32
XP_011544152 (OMIM: 120980,609939) PREDICTED: inte (1091)  555 130.5   5e-29
NP_001139280 (OMIM: 120980,609939) integrin alpha- (1153)  555 130.5 5.3e-29
NP_000623 (OMIM: 120980,609939) integrin alpha-M i (1152)  551 129.7 9.6e-29
XP_011544139 (OMIM: 602453) PREDICTED: integrin al (1189)  545 128.4 2.4e-28
XP_011544143 (OMIM: 602453) PREDICTED: integrin al (1160)  542 127.7 3.7e-28
XP_011544145 (OMIM: 602453) PREDICTED: integrin al (1028)  538 126.8 6.1e-28
XP_016878704 (OMIM: 602453) PREDICTED: integrin al (1164)  538 126.9 6.8e-28
XP_011544140 (OMIM: 602453) PREDICTED: integrin al (1179)  538 126.9 6.9e-28
XP_011544138 (OMIM: 602453) PREDICTED: integrin al (1189)  538 126.9 6.9e-28
XP_011544137 (OMIM: 602453) PREDICTED: integrin al (1190)  538 126.9   7e-28
NP_005344 (OMIM: 602453) integrin alpha-D isoform  (1161)  535 126.2 1.1e-27
NP_001305114 (OMIM: 602453) integrin alpha-D isofo (1162)  535 126.2 1.1e-27
XP_011544141 (OMIM: 602453) PREDICTED: integrin al (1173)  535 126.2 1.1e-27
XP_016878705 (OMIM: 120980,609939) PREDICTED: inte ( 917)  523 123.6 5.3e-27
XP_011544151 (OMIM: 153370) PREDICTED: integrin al (1074)  519 122.7 1.1e-26
XP_006721107 (OMIM: 153370) PREDICTED: integrin al (1087)  519 122.7 1.1e-26
NP_002200 (OMIM: 153370) integrin alpha-L isoform  (1170)  519 122.7 1.2e-26
NP_001107852 (OMIM: 153370) integrin alpha-L isofo (1086)  512 121.2 3.2e-26
XP_005255370 (OMIM: 153370) PREDICTED: integrin al (1169)  512 121.2 3.4e-26
XP_011544144 (OMIM: 602453) PREDICTED: integrin al (1103)  485 115.4 1.9e-24
NP_000878 (OMIM: 151510) integrin alpha-X isoform  (1163)  478 113.9 5.6e-24
NP_001273304 (OMIM: 151510) integrin alpha-X isofo (1169)  478 113.9 5.6e-24
NP_002194 (OMIM: 192974,614200) integrin alpha-2 p (1181)  459 109.7 9.9e-23
XP_016858112 (OMIM: 604042) PREDICTED: integrin al (1180)  449 107.6 4.4e-22
XP_016858116 (OMIM: 604042) PREDICTED: integrin al ( 835)  439 105.3 1.5e-21
XP_011544154 (OMIM: 151510) PREDICTED: integrin al ( 798)  433 104.0 3.5e-21
XP_011544148 (OMIM: 602453) PREDICTED: integrin al ( 790)  430 103.4 5.5e-21
XP_005268907 (OMIM: 600536,613204) PREDICTED: inte ( 979)  428 103.0 8.9e-21
XP_005268905 (OMIM: 600536,613204) PREDICTED: inte (1023)  428 103.0 9.2e-21
XP_005268906 (OMIM: 600536,613204) PREDICTED: inte (1023)  428 103.0 9.2e-21
XP_005268903 (OMIM: 600536,613204) PREDICTED: inte (1024)  428 103.0 9.2e-21
NP_001138469 (OMIM: 600536,613204) integrin alpha- (1044)  428 103.0 9.4e-21


>>NP_003629 (OMIM: 191830,604063) integrin alpha-8 Isofo  (1063 aa)
 initn: 7153 init1: 7153 opt: 7153  Z-score: 8372.9  bits: 1560.9 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 7153; 99.9% identity (100.0% similar) in 1063 aa overlap (1-1063:1-1063)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MSPGASRGPRGSQAPLIAPLCCAAAALGMLLWSPACQAFNLDVEKLTVYSGPKGSYFGYA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 MSPGASRGPRGSQAPLIAPLCCAAAALGMLLWSPACQAFNLDVEKLTVYSGPKGSYFGYA
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB7 VDFHIPDARTASVLVGAPKANTSQPDIVEGGAVYYCPWPAEGSAQCRQIPFDTTNNRKIR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 VDFHIPDARTASVLVGAPKANTSQPDIVEGGAVYYCPWPAEGSAQCRQIPFDTTNNRKIR
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB7 VNGTKEPIEFKSNQWFGATVKAHKGKVVACAPLYHWRTLKPTPEKDPVGTCYVAIQNFSA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 VNGTKEPIEFKSNQWFGATVKAHKGKVVACAPLYHWRTLKPTPEKDPVGTCYVAIQNFSA
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB7 YAEFSPCRNSNADPEGQGYCQAGFSLDFYKNGDLIVGGPGSFYWQGQVITASVADIIANY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 YAEFSPCRNSNADPEGQGYCQAGFSLDFYKNGDLIVGGPGSFYWQGQVITASVADIIANY
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB7 SFKDILRKLAGEKQTEVAPASYDDSYLGYSVAAGEFTGDSQQELVAGIPRGAQNFGYVSI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 SFKDILRKLAGEKQTEVAPASYDDSYLGYSVAAGEFTGDSQQELVAGIPRGAQNFGYVSI
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB7 INSTDMTFIQNFTGEQMASYFGYTVVVSDVNSDGLDDVLVGAPLFMEREFESNPREVGQI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 INSTDMTFIQNFTGEQMASYFGYTVVVSDVNSDGLDDVLVGAPLFMEREFESNPREVGQI
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB7 YLYLQVSSLLFRDPQILTGTETFGRFGSAMAHLGDLNQDGYNDIAIGVPFAGKDQRGKVL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 YLYLQVSSLLFRDPQILTGTETFGRFGSAMAHLGDLNQDGYNDIAIGVPFAGKDQRGKVL
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB7 IYNGNKDGLNTKPSQVLQGVWASHAVPSGFGFTLRGDSDIDKNDYPDLIVGAFGTGKVAV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 IYNGNKDGLNTKPSQVLQGVWASHAVPSGFGFTLRGDSDIDKNDYPDLIVGAFGTGKVAV
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB7 YRARPVVTVDAQLLLHPMIINLENKTCQVPDSMTSAACFSLRVCASVTGQSIANTIVLMA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 YRARPVVTVDAQLLLHPMIINLENKTCQVPDSMTSAACFSLRVCASVTGQSIANTIVLMA
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB7 EVQLDSLKQKGAIKRTLFLDNHQAHRVFPLVIKRQKSHQCQDFIVYLRDETEFRDKLSPI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 EVQLDSLKQKGAIKRTLFLDNHQAHRVFPLVIKRQKSHQCQDFIVYLRDETEFRDKLSPI
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB7 NISLNYSLDESTFKEGLEVKPILNYYRENIVSEQAHILVDCGEDNLCVPDLKLSARPDKH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 NISLNYSLDESTFKEGLEVKPILNYYRENIVSEQAHILVDCGEDNLCVPDLKLSARPDKH
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB7 QVIIGDENHLMLIINARNEGEGAYEAELFVMIPEEADYVGIERNNKGFRPLSCEYKMENV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 QVIIGDENHLMLIINARNEGEGAYEAELFVMIPEEADYVGIERNNKGFRPLSCEYKMENV
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KB7 TRMVVCDLGNPMVSGTNYSLGLRFAVPRLEKTNMSINFDLQIRSSNKDNPDSNFVSLQIN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 TRMVVCDLGNPMVSGTNYSLGLRFAVPRLEKTNMSINFDLQIRSSNKDNPDSNFVSLQIN
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KB7 ITAVAQVEIRGVSHPPQIVLPIHNWEPEEEPHKEEEVGPLVEHIYELHNIGPSTISDTIL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 ITAVAQVEIRGVSHPPQIVLPIHNWEPEEEPHKEEEVGPLVEHIYELHNIGPSTISDTIL
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KB7 EVGWPFSARDEFLLYIFHIQTLGPLQCQPNPNINPQDIKPAASPEDTPELSAFLRNSTIP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 EVGWPFSARDEFLLYIFHIQTLGPLQCQPNPNINPQDIKPAASPEDTPELSAFLRNSTIP
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KB7 HLVRKRDVHVVEFHRQSPAKILNCTNIECLQISCAVGRLEGGESAVLKVRSRLWAHTFLQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 HLVRKRDVHVVEFHRQSPAKILNCTNIECLQISCAVGRLEGGESAVLKVRSRLWAHTFLQ
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KB7 RKNDPYALASLVSFEVKKMPYTDQPAKLPEGSIAIKTSVIWATPNVSFSIPLWVIILAIL
       :::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::
NP_003 RKNDPYALASLVSFEVKKMPYTDQPAKLPEGSIVIKTSVIWATPNVSFSIPLWVIILAIL
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060   
pF1KB7 LGLLVLAILTLALWKCGFFDRARPPQEDMTDREQLTNDKTPEA
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 LGLLVLAILTLALWKCGFFDRARPPQEDMTDREQLTNDKTPEA
             1030      1040      1050      1060   

>>XP_011518054 (OMIM: 191830,604063) PREDICTED: integrin  (799 aa)
 initn: 5315 init1: 5315 opt: 5316  Z-score: 6222.4  bits: 1162.6 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 5316; 99.6% identity (99.9% similar) in 796 aa overlap (1-796:1-795)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MSPGASRGPRGSQAPLIAPLCCAAAALGMLLWSPACQAFNLDVEKLTVYSGPKGSYFGYA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MSPGASRGPRGSQAPLIAPLCCAAAALGMLLWSPACQAFNLDVEKLTVYSGPKGSYFGYA
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB7 VDFHIPDARTASVLVGAPKANTSQPDIVEGGAVYYCPWPAEGSAQCRQIPFDTTNNRKIR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VDFHIPDARTASVLVGAPKANTSQPDIVEGGAVYYCPWPAEGSAQCRQIPFDTTNNRKIR
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NP_001 LGLLVLAILTLALWKCGFFDRARPPQEDMTDREQLTNDKTPEA
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pF1KB7 FGYAVDFHIPDARTAS-VLVGAPKANTSQPDIVEGGAVYYCPWPAEGSAQCRQIPFDTTN
       ::.:::: .:.: .   .:::::::::.:: ::::: :  : : .  . .:. : ::.:.
NP_002 FGFAVDFFVPSASSRMFLLVGAPKANTTQPGIVEGGQVLKCDWSS--TRRCQPIEFDATG
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pF1KB7 NRKIRVNGTKEPIEFKSNQWFGATVKAHKGKVVACAPLYHWRTLKPTPEKDPVGTCYVAI
       ::     .  .:.::::.:::::.:.... :..:::::::::: .   :..:::::.  .
NP_002 NRDY---AKDDPLEFKSHQWFGASVRSKQDKILACAPLYHWRT-EMKQEREPVGTCF--L
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NP_001 NGEGNSET
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>>NP_002196 (OMIM: 135620) integrin alpha-5 precursor [H  (1049 aa)
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       :: ::.::..:.:. : .  .:::::::::::::: ...::::: ::: : . .::  : 
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       ::. ..: .. . .    .::.:.:: :::::::.:: ....:::::: ::: :  : .:
NP_002 FDSKGSRLLESSLSSSEGEEPVEYKSLQWFGATVRAHGSSILACAPLYSWRTEKE-PLSD
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       ::::::.. .::.   :..:::.. .   ::::::.::: .: :.: ...:::::..:::
NP_002 PVGTCYLSTDNFTRILEYAPCRSDFSWAAGQGYCQGGFSAEFTKTGRVVLGGPGSYFWQG
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       :...:.  .:  .:  . ..  . :. ::. : . :::::::::::.:::.::. ...::
NP_002 QILSATQEQIAESYYPEYLINLVQGQLQTRQASSIYDDSYLGYSVAVGEFSGDDTEDFVA
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       :.:.:  ..:::.:.:..:.  . ::.::::::::::.:...:::.:::::.::::::.:
NP_002 GVPKGNLTYGYVTILNGSDIRSLYNFSGEQMASYFGYAVAATDVNGDGLDDLLVGAPLLM
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pF1KB7 EREFESNPREVGQIYLYLQVSSLLFRDPQI-LTGTETFGRFGSAMAHLGDLNQDGYNDIA
       .:  .. :.:::..:.:::  . .   : . ::: . ::::::... ::::.::::::.:
NP_002 DRTPDGRPQEVGRVYVYLQHPAGIEPTPTLTLTGHDEFGRFGSSLTPLGDLDQDGYNDVA
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       ::.::.:. :.: :... :.  ::..::::::: .::.  .:. :: .:::  :.: : :
NP_002 IGAPFGGETQQGVVFVFPGGPGGLGSKPSQVLQPLWAASHTPDFFGSALRGGRDLDGNGY
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       ::::::.::. :..:::.::.:...:.: . : ..: :...:..  .   .::..:  : 
NP_002 PDLIVGSFGVDKAVVYRGRPIVSASASLTIFPAMFNPEERSCSLEGN--PVACINLSFCL
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       ...:. .:..: . .:.:::  ::::...:.::: ..::  .  :.:.    ..:... .
NP_002 NASGKHVADSIGFTVELQLDWQKQKGGVRRALFLASRQATLTQTLLIQNGAREDCREMKI
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pF1KB7 YLRDETEFRDKLSPINISLNYSLDESTFKEGLEVKPILNYYRENIVSEQAHILVDCGEDN
       :::.:.:::::::::.:.::.::: ..  ..  ..: :.:  .. . ..:.::.::::::
NP_002 YLRNESEFRDKLSPIHIALNFSLDPQAPVDSHGLRPALHYQSKSRIEDKAQILLDCGEDN
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pF1KB7 LCVPDLKLSARPDKHQVIIGDENHLMLIINARNEGEG-AYEAELFVMIPEEADYVGIERN
       .:::::.: .  ....: .::.: : : ..:.: ::: :::::: :  : ::.: :. :.
NP_002 ICVPDLQLEVFGEQNHVYLGDKNALNLTFHAQNVGEGGAYEAELRVTAPPEAEYSGLVRH
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pF1KB7 NKGFRPLSCEYKMENVTRMVVCDLGNPMVSGTNYSLGLRFAVPRLEKTNMSINFDLQIRS
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NP_002 PGNFSSLSCDYFAVNQSRLLVCDLGNPMKAGASLWGGLRFTVPHLRDTKKTIQFDFQILS
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pF1KB7 SNKDNPDSNFVSLQINITAVAQVEIRGVSHPPQIVLPIHNWEPEEEPHKEEEVGPLVEHI
       .: .: .:. ::..... : ::: . :::.:  ...:. .:.:...:.:::..:: :.:.
NP_002 KNLNNSQSDVVSFRLSVEAQAQVTLNGVSKPEAVLFPVSDWHPRDQPQKEEDLGPAVHHV
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pF1KB7 YELHNIGPSTISDTILEVGWPFSARDEFLLYIFHIQTLGPLQCQPNPNINPQDIKPAASP
       ::: : :::.::. .::.. : . . . :::. ..  :   .:  :  :::. .      
NP_002 YELINQGPSSISQGVLELSCPQALEGQQLLYVTRVTGL---NCTTNHPINPKGL------
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pF1KB7 EDTPELSAFLRNSTIPHLVRKRDVHVVEFHRQSPAKILNCTNIECLQISCAVGRLEGGES
       :  :: :         :  .::..       ..: .::.: . ::... : .: :.  ::
NP_002 ELDPEGSL--------HHQQKREAPSRSSASSGP-QILKCPEAECFRLRCELGPLHQQES
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pF1KB7 AVLKVRSRLWAHTFLQRKNDPYALASLVSFEVKKMPYTDQPAKLPEGSIAIKTSVIWATP
         :... :.::.:::::...:..:   . ... ::::   : .::.    . :.: :.  
NP_002 QSLQLHFRVWAKTFLQREHQPFSLQCEAVYKALKMPYRILPRQLPQKERQVATAVQWTKA
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pF1KB7 NVSFSIPLWVIILAILLGLLVLAILTLALWKCGFFDRARPPQEDMTDREQLTNDKTPEA
       . :...:::.::::::.:::.:..:   :.: ::: :. :    : .. ::    : .:
NP_002 EGSYGVPLWIIILAILFGLLLLGLLIYILYKLGFFKRSLPYGTAM-EKAQLKPPATSDA
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>>NP_001138472 (OMIM: 193210) integrin alpha-V isoform 3  (1012 aa)
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NP_001 MAFPPRRRLRLGPRG--LPLLLS--------GLLL--PLCRAFNLDVDSPAEYSGPEGSY
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       ::.:::: .:.: .   .:::::::::.:: ::::: :  : : .  . .:. : ::.:.
NP_001 FGFAVDFFVPSASSRMFLLVGAPKANTTQPGIVEGGQVLKCDWSS--TRRCQPIEFDATG
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pF1KB7 NRKIRVNGTKEPIEFKSNQWFGATVKAHKGKVVACAPLYHWRTLKPTPEKDPVGTCYVAI
       ::     .  .:.::::.:::::.:.... :..:::::::::: .   :..:::::.  .
NP_001 NRDY---AKDDPLEFKSHQWFGASVRSKQDKILACAPLYHWRT-EMKQEREPVGTCF--L
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       :. .  .:..:::.                                     :.:. .::.
NP_001 QDGTKTVEYAPCRSR------------------------------------QLISDQVAE
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pF1KB7 IIANYSFKDILRKLAGEKQTEVAPASYDDSYLGYSVAAGEFTGDSQQELVAGIPRGAQNF
       :...:. .    :  ..  :..: : .::::::::::.:.:.::. ...:.:.::.:...
NP_001 IVSKYDPNVYSIKYNNQLATRTAQAIFDDSYLGYSVAVGDFNGDGIDDFVSGVPRAARTL
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pF1KB7 GYVSIINSTDMTFIQNFTGEQMASYFGYTVVVSDVNSDGLDDVLVGAPLFMEREFESNPR
       :.: : .. .:. . ::::::::.:::..:...:.:.:   ::..::::::.:  ... .
NP_001 GMVYIYDGKNMSSLYNFTGEQMAAYFGFSVAATDINGDDYADVFIGAPLFMDRGSDGKLQ
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pF1KB7 EVGQIYLYLQVSSLLFRDPQILTGTETFGRFGSAMAHLGDLNQDGYNDIAIGVPFAGKDQ
       ::::. . :: .:  :.  . :.: :.:.:::::.: ::::.:::.:::::..:..:.:.
NP_001 EVGQVSVSLQRASGDFQTTK-LNGFEVFARFGSAIAPLGDLDQDGFNDIAIAAPYGGEDK
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pF1KB7 RGKVLIYNGNKDGLNTKPSQVLQGVWASHAVPSGFGFTLRGDSDIDKNDYPDLIVGAFGT
       .: : :.:: . :::. :::.:.: ::....: .::....: .::::: ::::::::::.
NP_001 KGIVYIFNGRSTGLNAVPSQILEGQWAARSMPPSFGYSMKGATDIDKNGYPDLIVGAFGV
           370       380       390       400       410       420   

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pF1KB7 GKVAVYRARPVVTVDAQLLLHPMIINLENKTCQVPDSMTSAACFSLRVCASVTGQSI-AN
        .. .::::::.::.: : ..: :.: .::::..: .  ...::..: : .. :...   
NP_001 DRAILYRARPVITVNAGLEVYPSILNQDNKTCSLPGTALKVSCFNVRFCLKADGKGVLPR
           430       440       450       460       470       480   

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pF1KB7 TIVLMAEVQLDSLKQKGAIKRTLFLDNHQAHRVFPLVIKRQKSHQCQDFIVYLRDETEFR
        . ...:. ::.:::::::.:.::: ...  .   ..:.:    ::...:.:::::.:::
NP_001 KLNFQVELLLDKLKQKGAIRRALFLYSRSPSHSKNMTISRGGLMQCEELIAYLRDESEFR
           490       500       510       520       530       540   

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pF1KB7 DKLSPINISLNYSLDESTFKEGLEVKPILNYYRENIVSEQAHILVDCGEDNLCVPDLKLS
       :::.::.: ..: ::  :  .   ..:::: .    .:.:::::.::::::.: : :..:
NP_001 DKLTPITIFMEYRLDYRTAADTTGLQPILNQFTPANISRQAHILLDCGEDNVCKPKLEVS
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pF1KB7 ARPDKHQVIIGDENHLMLIINARNEGEGAYEAELFVMIPEEADYVGIERNNKGFRPLSCE
       .  :.... :::.: : ::..:.:.:::::::::.: :: .::..:. :::...  ::: 
NP_001 VDSDQKKIYIGDDNPLTLIVKAQNQGEGAYEAELIVSIPLQADFIGVVRNNEALARLSCA
           610       620       630       640       650       660   

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pF1KB7 YKMENVTRMVVCDLGNPMVSGTNYSLGLRFAVPRLEKTNMSINFDLQIRSSNKDNPDSNF
       .: :: ::.::::::::: .::.   ::::.: .  . . :..:::::.:::  .  :  
NP_001 FKTENQTRQVVCDLGNPMKAGTQLLAGLRFSVHQQSEMDTSVKFDLQIQSSNLFDKVSPV
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pF1KB7 QISCAVGRLEGGESAVLKVRSRLWAHTFLQRKNDPYALASLVSFEVKKMPYTDQPAKLPE
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60827320 residues in 85289 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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