Result of FASTA (ccds) for pF1KB5776
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB5776, 766 aa
  1>>>pF1KB5776 766 - 766 aa - 766 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.0357+/-0.00104; mu= 3.5337+/- 0.061
 mean_var=269.8502+/-61.465, 0's: 0 Z-trim(112.1): 667  B-trim: 756 in 1/51
 Lambda= 0.078075
 statistics sampled from 12079 (12888) to 12079 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.722), E-opt: 0.2 (0.396), width:  16
 Scan time:  3.710

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS5863.1 BRAF gene_id:673|Hs108|chr7             ( 766) 5139 593.0 5.8e-169
CCDS75970.1 ARAF gene_id:369|Hs108|chrX            ( 609) 2341 277.8 3.7e-74
CCDS2612.1 RAF1 gene_id:5894|Hs108|chr3            ( 648) 1797 216.5 1.1e-55
CCDS35232.1 ARAF gene_id:369|Hs108|chrX            ( 606) 1781 214.7 3.6e-55
CCDS59164.1 ARAF gene_id:369|Hs108|chrX            ( 186)  614 82.7 5.8e-16
CCDS61250.1 KSR2 gene_id:283455|Hs108|chr12        ( 921)  595 81.3 7.9e-15
CCDS5094.1 FYN gene_id:2534|Hs108|chr6             ( 537)  512 71.7 3.5e-12
CCDS58532.1 KSR1 gene_id:8844|Hs108|chr17          ( 762)  514 72.1 3.8e-12
CCDS47859.1 LYN gene_id:4067|Hs108|chr8            ( 491)  506 71.0 5.3e-12
CCDS6162.1 LYN gene_id:4067|Hs108|chr8             ( 512)  506 71.0 5.4e-12
CCDS11824.1 YES1 gene_id:7525|Hs108|chr18          ( 543)  503 70.7 7.1e-12
CCDS13294.1 SRC gene_id:6714|Hs108|chr20           ( 536)  501 70.5 8.3e-12
CCDS5103.1 FRK gene_id:2444|Hs108|chr6             ( 505)  499 70.2 9.3e-12
CCDS359.1 LCK gene_id:3932|Hs108|chr1              ( 509)  499 70.2 9.3e-12
CCDS5095.1 FYN gene_id:2534|Hs108|chr6             ( 534)  486 68.8 2.7e-11
CCDS305.1 FGR gene_id:2268|Hs108|chr1              ( 529)  482 68.3 3.6e-11
CCDS54456.1 HCK gene_id:3055|Hs108|chr20           ( 504)  481 68.2 3.8e-11
CCDS54455.1 HCK gene_id:3055|Hs108|chr20           ( 505)  481 68.2 3.8e-11
CCDS54453.1 HCK gene_id:3055|Hs108|chr20           ( 525)  481 68.2 3.9e-11
CCDS33460.1 HCK gene_id:3055|Hs108|chr20           ( 526)  481 68.2 3.9e-11
CCDS2922.1 EPHA3 gene_id:2042|Hs108|chr3           ( 983)  484 68.8 4.8e-11
CCDS225.1 EPHA8 gene_id:2046|Hs108|chr1            (1005)  481 68.5 6.1e-11


>>CCDS5863.1 BRAF gene_id:673|Hs108|chr7                  (766 aa)
 initn: 5139 init1: 5139 opt: 5139  Z-score: 3146.9  bits: 593.0 E(32554): 5.8e-169
Smith-Waterman score: 5139; 100.0% identity (100.0% similar) in 766 aa overlap (1-766:1-766)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MAALSGGGGGGAEPGQALFNGDMEPEAGAGAGAAASSAADPAIPEEVWNIKQMIKLTQEH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MAALSGGGGGGAEPGQALFNGDMEPEAGAGAGAAASSAADPAIPEEVWNIKQMIKLTQEH
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 IEALLDKFGGEHNPPSIYLEAYEEYTSKLDALQQREQQLLESLGNGTDFSVSSSASMDTV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 IEALLDKFGGEHNPPSIYLEAYEEYTSKLDALQQREQQLLESLGNGTDFSVSSSASMDTV
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB5 TSSSSSSLSVLPSSLSVFQNPTDVARSNPKSPQKPIVRVFLPNKQRTVVPARCGVTVRDS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 TSSSSSSLSVLPSSLSVFQNPTDVARSNPKSPQKPIVRVFLPNKQRTVVPARCGVTVRDS
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB5 LKKALMMRGLIPECCAVYRIQDGEKKPIGWDTDISWLTGEELHVEVLENVPLTTHNFVRK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LKKALMMRGLIPECCAVYRIQDGEKKPIGWDTDISWLTGEELHVEVLENVPLTTHNFVRK
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB5 TFFTLAFCDFCRKLLFQGFRCQTCGYKFHQRCSTEVPLMCVNYDQLDLLFVSKFFEHHPI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 TFFTLAFCDFCRKLLFQGFRCQTCGYKFHQRCSTEVPLMCVNYDQLDLLFVSKFFEHHPI
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB5 PQEEASLAETALTSGSSPSAPASDSIGPQILTSPSPSKSIPIPQPFRPADEDHRNQFGQR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 PQEEASLAETALTSGSSPSAPASDSIGPQILTSPSPSKSIPIPQPFRPADEDHRNQFGQR
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB5 DRSSSAPNVHINTIEPVNIDDLIRDQGFRGDGGSTTGLSATPPASLPGSLTNVKALQKSP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 DRSSSAPNVHINTIEPVNIDDLIRDQGFRGDGGSTTGLSATPPASLPGSLTNVKALQKSP
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB5 GPQRERKSSSSSEDRNRMKTLGRRDSSDDWEIPDGQITVGQRIGSGSFGTVYKGKWHGDV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 GPQRERKSSSSSEDRNRMKTLGRRDSSDDWEIPDGQITVGQRIGSGSFGTVYKGKWHGDV
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB5 AVKMLNVTAPTPQQLQAFKNEVGVLRKTRHVNILLFMGYSTKPQLAIVTQWCEGSSLYHH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 AVKMLNVTAPTPQQLQAFKNEVGVLRKTRHVNILLFMGYSTKPQLAIVTQWCEGSSLYHH
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB5 LHIIETKFEMIKLIDIARQTAQGMDYLHAKSIIHRDLKSNNIFLHEDLTVKIGDFGLATV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LHIIETKFEMIKLIDIARQTAQGMDYLHAKSIIHRDLKSNNIFLHEDLTVKIGDFGLATV
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB5 KSRWSGSHQFEQLSGSILWMAPEVIRMQDKNPYSFQSDVYAFGIVLYELMTGQLPYSNIN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 KSRWSGSHQFEQLSGSILWMAPEVIRMQDKNPYSFQSDVYAFGIVLYELMTGQLPYSNIN
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB5 NRDQIIFMVGRGYLSPDLSKVRSNCPKAMKRLMAECLKKKRDERPLFPQILASIELLARS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 NRDQIIFMVGRGYLSPDLSKVRSNCPKAMKRLMAECLKKKRDERPLFPQILASIELLARS
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760      
pF1KB5 LPKIHRSASEPSLNRAGFQTEDFSLYACASPKTPIQAGGYGAFPVH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LPKIHRSASEPSLNRAGFQTEDFSLYACASPKTPIQAGGYGAFPVH
              730       740       750       760      

>>CCDS75970.1 ARAF gene_id:369|Hs108|chrX                 (609 aa)
 initn: 2289 init1: 1587 opt: 2341  Z-score: 1444.9  bits: 277.8 E(32554): 3.7e-74
Smith-Waterman score: 2341; 60.4% identity (79.9% similar) in 618 aa overlap (147-748:9-600)

        120       130       140       150         160       170    
pF1KB5 MDTVTSSSSSSLSVLPSSLSVFQNPTDVARSNPKSPQKPI--VRVFLPNKQRTVVPARCG
                                     .:   :.. .  :.:.::::::::: .: :
CCDS75                       MEPPRGPPANGAEPSRAVGTVKVYLPNKQRTVVTVRDG
                                     10        20        30        

          180       190       200       210       220       230    
pF1KB5 VTVRDSLKKALMMRGLIPECCAVYRIQDGEKKPIGWDTDISWLTGEELHVEVLENVPLTT
       ..: ::: ::: .:::  .::.:::.  :.:   .::: :. : :::: :::::.:::: 
CCDS75 MSVYDSLDKALKVRGLNQDCCVVYRLIKGRKTVTAWDTAIAPLDGEELIVEVLEDVPLTM
       40        50        60        70        80        90        

          240       250       260       270       280       290    
pF1KB5 HNFVRKTFFTLAFCDFCRKLLFQGFRCQTCGYKFHQRCSTEVPLMCVNYDQLDLLFVSKF
       :::::::::.::::::: :.::.:::::::::::::.::..:: .::...  .    :.:
CCDS75 HNFVRKTFFSLAFCDFCLKFLFHGFRCQTCGYKFHQHCSSKVPTVCVDMST-NRQQPSRF
      100       110       120       130       140        150       

          300       310           320        330       340         
pF1KB5 FEHHPIPQEEASLAETALTSGS----SPSA-PASDSIGPQILTSPSPSKSIPIPQ--PFR
       .  : . :.        :..::    .::  : .. . ::   .:::  .   :.  :: 
CCDS75 Y--HSV-QD--------LSGGSRQHEAPSNRPLNELLTPQ---GPSPRTQHCDPEHFPF-
         160                170       180          190       200   

       350       360       370        380         390        400   
pF1KB5 PADEDHRNQFGQRDRSSSAPNVH-INTIEPVNIDDLIR--DQGFRGDG-GSTTGLSATPP
       ::     :   :: ::.:.:::: ..:  :.. ..::.   :.:  :. ::  : ..:: 
CCDS75 PAPA---NAPLQRIRSTSTPNVHMVSTTAPMD-SNLIQLTGQSFSTDAAGSRGGSDGTPR
               210       220       230        240       250        

            410         420       430       440       450       460
pF1KB5 AS-LPGSLTNVKAL--QKSPGPQRERKSSSSSEDRNRMKTLGRRDSSDDWEIPDGQITVG
       .:  :.:... .    .:::. :::::: .  .:....:.:: :::.  ::.: ... . 
CCDS75 GSPSPASVSSGRKSPHSKSPAEQRERKSLA--DDKKKVKNLGYRDSGYYWEVPPSEVQLL
      260       270       280         290       300       310      

              470       480       490       500       510       520
pF1KB5 QRIGSGSFGTVYKGKWHGDVAVKMLNVTAPTPQQLQAFKNEVGVLRKTRHVNILLFMGYS
       .:::.::::::..:.::::::::.:.:. :: .: ::::::. :::::::::::::::. 
CCDS75 KRIGTGSFGTVFRGRWHGDVAVKVLKVSQPTAEQAQAFKNEMQVLRKTRHVNILLFMGFM
        320       330       340       350       360       370      

              530       540       550       560       570       580
pF1KB5 TKPQLAIVTQWCEGSSLYHHLHIIETKFEMIKLIDIARQTAQGMDYLHAKSIIHRDLKSN
       :.: .::.::::::::::::::. .:.:.:..:::.::::::::::::::.:::::::::
CCDS75 TRPGFAIITQWCEGSSLYHHLHVADTRFDMVQLIDVARQTAQGMDYLHAKNIIHRDLKSN
        380       390       400       410       420       430      

              590       600       610       620       630       640
pF1KB5 NIFLHEDLTVKIGDFGLATVKSRWSGSHQFEQLSGSILWMAPEVIRMQDKNPYSFQSDVY
       :::::: ::::::::::::::.::::.. .:: :::.:::: ::::::: ::::::::::
CCDS75 NIFLHEGLTVKIGDFGLATVKTRWSGAQPLEQPSGSVLWMAAEVIRMQDPNPYSFQSDVY
        440       450       460       470       480       490      

              650       660       670       680       690       700
pF1KB5 AFGIVLYELMTGQLPYSNINNRDQIIFMVGRGYLSPDLSKVRSNCPKAMKRLMAECLKKK
       :.:.::::::::.::::.:. :::::::::::::::::::. :::::::.::...::: .
CCDS75 AYGVVLYELMTGSLPYSHIGCRDQIIFMVGRGYLSPDLSKISSNCPKAMRRLLSDCLKFQ
        500       510       520       530       540       550      

              710       720       730       740       750       760
pF1KB5 RDERPLFPQILASIELLARSLPKIHRSASEPSLNRAGFQTEDFSLYACASPKTPIQAGGY
       :.::::::::::.:::: ::::::.::::::::.:.  :...  : ::            
CCDS75 REERPLFPQILATIELLQRSLPKIERSASEPSLHRT--QADE--LPACLLSAARLVP   
        560       570       580       590           600            

             
pF1KB5 GAFPVH

>>CCDS2612.1 RAF1 gene_id:5894|Hs108|chr3                 (648 aa)
 initn: 2298 init1: 1666 opt: 1797  Z-score: 1113.4  bits: 216.5 E(32554): 1.1e-55
Smith-Waterman score: 2368; 56.5% identity (78.1% similar) in 672 aa overlap (97-755:5-647)

         70        80        90       100       110       120      
pF1KB5 KFGGEHNPPSIYLEAYEEYTSKLDALQQREQQLLESLGNGTDFSVSSSASMDTVTSSSSS
                                     :   ....::  :.       :.: ..:: 
CCDS26                           MEHIQGAWKTISNGFGFK-------DAVFDGSSC
                                         10               20       

        130       140       150       160       170       180      
pF1KB5 SLSVLPSSLSVFQNPTDVARSNPKSPQKPIVRVFLPNKQRTVVPARCGVTVRDSLKKALM
          .. ....  .  .: .. .  :  .  .:::::::::::: .: :....: : ::: 
CCDS26 ISPTIVQQFGYQRRASDDGKLTDPSKTSNTIRVFLPNKQRTVVNVRNGMSLHDCLMKALK
        30        40        50        60        70        80       

        190       200          210       220       230       240   
pF1KB5 MRGLIPECCAVYRI---QDGEKKPIGWDTDISWLTGEELHVEVLENVPLTTHNFVRKTFF
       .::: ::::::.:.   . :.:  . :.:: . : ::::.:. :..::::::::.::::.
CCDS26 VRGLQPECCAVFRLLHEHKGKKARLDWNTDAASLIGEELQVDFLDHVPLTTHNFARKTFL
        90       100       110       120       130       140       

           250       260       270       280         290       300 
pF1KB5 TLAFCDFCRKLLFQGFRCQTCGYKFHQRCSTEVPLMCVNYDQLD--LLFVSKFFEHHPIP
        :::::.:.:.:..::::::::::::..:::.:: :::.....   ::: .. .    .:
CCDS26 KLAFCDICQKFLLNGFRCQTCGYKFHEHCSTKVPTMCVDWSNIRQLLLFPNSTIGDSGVP
       150       160       170       180       190       200       

             310       320       330       340       350       360 
pF1KB5 QEEASLAETALTSGSSPSAPASDSIGPQILTSPSPSKSIPIPQPFRPADEDHRNQFGQRD
                :: : .      : :  :   .: .   : :    :  .. . .....::.
CCDS26 ---------ALPSLTMRRMRESVSRMP---VSSQHRYSTPHAFTFNTSSPSSEGSLSQRQ
                210       220          230       240       250     

             370           380       390       400       410       
pF1KB5 RSSSAPNVH-INTIEPVN---IDDLIRDQGFRGDGGSTTGLSATPPASLPGSLTNVKALQ
       ::.:.:::: ..:  ::.   :.: ::...   ...: ..::..:    : . ..     
CCDS26 RSTSTPNVHMVSTTLPVDSRMIEDAIRSHS---ESASPSALSSSPNNLSPTGWSQ----P
         260       270       280          290       300            

       420        430       440       450       460       470      
pF1KB5 KSPGP-QRERKSSSSSEDRNRMKTLGRRDSSDDWEIPDGQITVGQRIGSGSFGTVYKGKW
       :.: : ::::   :.....:...  :.::::  :::  ... .. :::::::::::::::
CCDS26 KTPVPAQRERAPVSGTQEKNKIRPRGQRDSSYYWEIEASEVMLSTRIGSGSFGTVYKGKW
      310       320       330       340       350       360        

        480       490       500       510       520       530      
pF1KB5 HGDVAVKMLNVTAPTPQQLQAFKNEVGVLRKTRHVNILLFMGYSTKPQLAIVTQWCEGSS
       :::::::.:.:. :::.:.:::.:::.:::::::::::::::: :: .::::::::::::
CCDS26 HGDVAVKILKVVDPTPEQFQAFRNEVAVLRKTRHVNILLFMGYMTKDNLAIVTQWCEGSS
      370       380       390       400       410       420        

        540       550       560       570       580       590      
pF1KB5 LYHHLHIIETKFEMIKLIDIARQTAQGMDYLHAKSIIHRDLKSNNIFLHEDLTVKIGDFG
       ::.:::. ::::.:..::::::::::::::::::.:::::.::::::::: :::::::::
CCDS26 LYKHLHVQETKFQMFQLIDIARQTAQGMDYLHAKNIIHRDMKSNNIFLHEGLTVKIGDFG
      430       440       450       460       470       480        

        600       610       620       630       640       650      
pF1KB5 LATVKSRWSGSHQFEQLSGSILWMAPEVIRMQDKNPYSFQSDVYAFGIVLYELMTGQLPY
       :::::::::::.: :: .::.::::::::::::.::.:::::::..::::::::::.:::
CCDS26 LATVKSRWSGSQQVEQPTGSVLWMAPEVIRMQDNNPFSFQSDVYSYGIVLYELMTGELPY
      490       500       510       520       530       540        

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pF1KB5 SNINNRDQIIFMVGRGYLSPDLSKVRSNCPKAMKRLMAECLKKKRDERPLFPQILASIEL
       :.::::::::::::::: ::::::. .:::::::::.:.:.:: ..:::::::::.::::
CCDS26 SHINNRDQIIFMVGRGYASPDLSKLYKNCPKAMKRLVADCVKKVKEERPLFPQILSSIEL
      550       560       570       580       590       600        

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pF1KB5 LARSLPKIHRSASEPSLNRAGFQTEDFSLYACA---SPKTPIQAGGYGAFPVH
       : .:::::.::::::::.::. .:::..  ::.   ::. :.           
CCDS26 LQHSLPKINRSASEPSLHRAA-HTEDIN--ACTLTTSPRLPVF          
      610       620        630         640                  

>>CCDS35232.1 ARAF gene_id:369|Hs108|chrX                 (606 aa)
 initn: 2289 init1: 1587 opt: 1781  Z-score: 1104.0  bits: 214.7 E(32554): 3.6e-55
Smith-Waterman score: 2335; 60.0% identity (79.3% similar) in 618 aa overlap (147-748:9-597)

        120       130       140       150         160       170    
pF1KB5 MDTVTSSSSSSLSVLPSSLSVFQNPTDVARSNPKSPQKPI--VRVFLPNKQRTVVPARCG
                                     .:   :.. .  :.:.::::::::: .: :
CCDS35                       MEPPRGPPANGAEPSRAVGTVKVYLPNKQRTVVTVRDG
                                     10        20        30        

          180       190       200       210       220       230    
pF1KB5 VTVRDSLKKALMMRGLIPECCAVYRIQDGEKKPIGWDTDISWLTGEELHVEVLENVPLTT
       ..: ::: ::: .:::  .::.:::.  :.:   .::: :. : :::: :::::.:::: 
CCDS35 MSVYDSLDKALKVRGLNQDCCVVYRLIKGRKTVTAWDTAIAPLDGEELIVEVLEDVPLTM
       40        50        60        70        80        90        

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pF1KB5 HNFVRKTFFTLAFCDFCRKLLFQGFRCQTCGYKFHQRCSTEVPLMCVNYDQLDLLFVSKF
       :::::::::.::::::: :.::.:::::::::::::.::..:: .::...     :    
CCDS35 HNFVRKTFFSLAFCDFCLKFLFHGFRCQTCGYKFHQHCSSKVPTVCVDMSTNRQQF----
      100       110       120       130       140       150        

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pF1KB5 FEHHPIPQEEASLAETALTSGS----SPSA-PASDSIGPQILTSPSPSKSIPIPQ--PFR
         .: . .         :..::    .::  : .. . ::   .:::  .   :.  :: 
CCDS35 --YHSVQD---------LSGGSRQHEAPSNRPLNELLTPQ---GPSPRTQHCDPEHFPF-
            160                170       180          190          

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pF1KB5 PADEDHRNQFGQRDRSSSAPNVH-INTIEPVNIDDLIR--DQGFRGDG-GSTTGLSATPP
       ::     :   :: ::.:.:::: ..:  :.. ..::.   :.:  :. ::  : ..:: 
CCDS35 PAPA---NAPLQRIRSTSTPNVHMVSTTAPMD-SNLIQLTGQSFSTDAAGSRGGSDGTPR
     200          210       220        230       240       250     

            410         420       430       440       450       460
pF1KB5 AS-LPGSLTNVKAL--QKSPGPQRERKSSSSSEDRNRMKTLGRRDSSDDWEIPDGQITVG
       .:  :.:... .    .:::. :::::: .  .:....:.:: :::.  ::.: ... . 
CCDS35 GSPSPASVSSGRKSPHSKSPAEQRERKSLA--DDKKKVKNLGYRDSGYYWEVPPSEVQLL
         260       270       280         290       300       310   

              470       480       490       500       510       520
pF1KB5 QRIGSGSFGTVYKGKWHGDVAVKMLNVTAPTPQQLQAFKNEVGVLRKTRHVNILLFMGYS
       .:::.::::::..:.::::::::.:.:. :: .: ::::::. :::::::::::::::. 
CCDS35 KRIGTGSFGTVFRGRWHGDVAVKVLKVSQPTAEQAQAFKNEMQVLRKTRHVNILLFMGFM
           320       330       340       350       360       370   

              530       540       550       560       570       580
pF1KB5 TKPQLAIVTQWCEGSSLYHHLHIIETKFEMIKLIDIARQTAQGMDYLHAKSIIHRDLKSN
       :.: .::.::::::::::::::. .:.:.:..:::.::::::::::::::.:::::::::
CCDS35 TRPGFAIITQWCEGSSLYHHLHVADTRFDMVQLIDVARQTAQGMDYLHAKNIIHRDLKSN
           380       390       400       410       420       430   

              590       600       610       620       630       640
pF1KB5 NIFLHEDLTVKIGDFGLATVKSRWSGSHQFEQLSGSILWMAPEVIRMQDKNPYSFQSDVY
       :::::: ::::::::::::::.::::.. .:: :::.:::: ::::::: ::::::::::
CCDS35 NIFLHEGLTVKIGDFGLATVKTRWSGAQPLEQPSGSVLWMAAEVIRMQDPNPYSFQSDVY
           440       450       460       470       480       490   

              650       660       670       680       690       700
pF1KB5 AFGIVLYELMTGQLPYSNINNRDQIIFMVGRGYLSPDLSKVRSNCPKAMKRLMAECLKKK
       :.:.::::::::.::::.:. :::::::::::::::::::. :::::::.::...::: .
CCDS35 AYGVVLYELMTGSLPYSHIGCRDQIIFMVGRGYLSPDLSKISSNCPKAMRRLLSDCLKFQ
           500       510       520       530       540       550   

              710       720       730       740       750       760
pF1KB5 RDERPLFPQILASIELLARSLPKIHRSASEPSLNRAGFQTEDFSLYACASPKTPIQAGGY
       :.::::::::::.:::: ::::::.::::::::.:.  :...  : ::            
CCDS35 REERPLFPQILATIELLQRSLPKIERSASEPSLHRT--QADE--LPACLLSAARLVP   
           560       570       580         590         600         

             
pF1KB5 GAFPVH

>>CCDS59164.1 ARAF gene_id:369|Hs108|chrX                 (186 aa)
 initn: 613 init1: 591 opt: 614  Z-score: 400.1  bits: 82.7 E(32554): 5.8e-16
Smith-Waterman score: 614; 63.8% identity (81.9% similar) in 138 aa overlap (147-282:9-146)

        120       130       140       150         160       170    
pF1KB5 MDTVTSSSSSSLSVLPSSLSVFQNPTDVARSNPKSPQKPI--VRVFLPNKQRTVVPARCG
                                     .:   :.. .  :.:.::::::::: .: :
CCDS59                       MEPPRGPPANGAEPSRAVGTVKVYLPNKQRTVVTVRDG
                                     10        20        30        

          180       190       200       210       220       230    
pF1KB5 VTVRDSLKKALMMRGLIPECCAVYRIQDGEKKPIGWDTDISWLTGEELHVEVLENVPLTT
       ..: ::: ::: .:::  .::.:::.  :.:   .::: :. : :::: :::::.:::: 
CCDS59 MSVYDSLDKALKVRGLNQDCCVVYRLIKGRKTVTAWDTAIAPLDGEELIVEVLEDVPLTM
       40        50        60        70        80        90        

          240       250       260       270       280       290    
pF1KB5 HNFVRKTFFTLAFCDFCRKLLFQGFRCQTCGYKFHQRCSTEVPLMCVNYDQLDLLFVSKF
       :::::::::.::::::: :.::.:::::::::::::.::..:: .::.            
CCDS59 HNFVRKTFFSLAFCDFCLKFLFHGFRCQTCGYKFHQHCSSKVPTVCVDMSTNRQQFYHSV
      100       110       120       130       140       150        

          300       310       320       330       340       350    
pF1KB5 FEHHPIPQEEASLAETALTSGSSPSAPASDSIGPQILTSPSPSKSIPIPQPFRPADEDHR
                                                                   
CCDS59 QDLSGGSRQHEAPSNRPLNELLTPQGPR                                
      160       170       180                                      

>>CCDS61250.1 KSR2 gene_id:283455|Hs108|chr12             (921 aa)
 initn: 402 init1: 275 opt: 595  Z-score: 379.7  bits: 81.3 E(32554): 7.9e-15
Smith-Waterman score: 746; 28.7% identity (59.0% similar) in 554 aa overlap (235-731:384-912)

          210       220       230       240       250       260    
pF1KB5 KKPIGWDTDISWLTGEELHVEVLENVPLTTHNFVRKTFFTLAFCDFCRKLLFQGFRCQTC
                                     : :  : ... . :  : : .. :..:..:
CCDS61 HTEANFSANTLSVPRWSPQIPRRDLGNSIKHRFSTKYWMSQT-CTVCGKGMLFGLKCKNC
           360       370       380       390        400       410  

          270          280                              290        
pF1KB5 GYKFHQRCSTEVP---LMCVNY-DQLDL----------------------LFVSKFF---
         : :..:. :.:   :. ..  :   :                      : .:. .   
CCDS61 KLKCHNKCTKEAPPCHLLIIHRGDPARLVRTESVPCDINNPLRKPPRYSDLHISQTLPKT
            420       430       440       450       460       470  

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pF1KB5 -----EHHPIPQEEASLAETALTSGSSPSAPASDSIGPQILTSPSPSKSIPIPQPFRPAD
            .: :.: .  : .. . :..:.::.::     :     : : .. : :.:..:. 
CCDS61 NKINKDHIPVPYQPDSSSNPSSTTSSTPSSPA-----P-----PLPPSATP-PSPLHPSP
            480       490       500                 510        520 

              360       370       380       390       400          
pF1KB5 EDHRNQFGQRDRSSSAPNVHINTIEPVNIDDLIRDQGFRGDGGSTTGLSATPPASLPGS-
       .  :.: .    .:   . . . : :  .   . .   :.       ....:   : :. 
CCDS61 QCTRQQKNFNLPASHYYKYKQQFIFPDVVP--VPETPTRAPQVILHPVTSNP--ILEGNP
             530       540       550         560       570         

     410       420       430              440            450       
pF1KB5 LTNVKALQKSPGPQRERKSSSSSEDRNRM-------KTLGRRDSS-----DDWEIPDGQI
       : ....   : . . . ..  : .: ..:       ... :. :.     ..:.::  :.
CCDS61 LLQIEVEPTSENEEVHDEAEESEDDFEEMNLSLLSARSFPRKASQTSIFLQEWDIPFEQL
       580       590       600       610       620       630       

       460       470       480       490       500       510       
pF1KB5 TVGQRIGSGSFGTVYKGKWHGDVAVKMLNVTAPTPQQLQAFKNEVGVLRKTRHVNILLFM
        .:. ::.: :: ::.:.:::.::......   . .::.::: :: . :.::: :..:::
CCDS61 EIGELIGKGRFGQVYHGRWHGEVAIRLIDIERDNEDQLKAFKREVMAYRQTRHENVVLFM
       640       650       660       670       680       690       

       520        530       540       550       560       570      
pF1KB5 GYS-TKPQLAIVTQWCEGSSLYHHLHIIETKFEMIKLIDIARQTAQGMDYLHAKSIIHRD
       :   . :.:::.:. :.: .::  ..  .  ... :  .::.. ..:: :::::.:.:.:
CCDS61 GACMSPPHLAIITSLCKGRTLYSVVRDAKIVLDVNKTRQIAQEIVKGMGYLHAKGILHKD
       700       710       720       730       740       750       

        580       590       600       610       620                
pF1KB5 LKSNNIFLHEDLTVKIGDFGLATVKSRWSGSHQFEQLSGSILWM---APEVIRM------
       :::.:.: ...  : : :::: ....  ..... ..:  .  :.   :::.::.      
CCDS61 LKSKNVF-YDNGKVVITDFGLFSISGVLQAGRREDKLRIQNGWLCHLAPEIIRQLSPDTE
       760        770       780       790       800       810      

       630       640       650       660       670       680       
pF1KB5 QDKNPYSFQSDVYAFGIVLYELMTGQLPYSNINNRDQIIFMVGRGYLSPDLSKVRSNCPK
       .:: :.: .:::.:.: . ::: . . :... .  . ::...: : ..:.::..  .  :
CCDS61 EDKLPFSKHSDVFALGTIWYELHAREWPFKT-QPAEAIIWQMGTG-MKPNLSQI--GMGK
        820       830       840        850       860          870  

       690       700       710       720       730       740       
pF1KB5 AMKRLMAECLKKKRDERPLFPQILASIELLARSLPKIHRSASEPSLNRAGFQTEDFSLYA
        .. ..  :   ...::: : ...  .:    .::: .:  :.:                
CCDS61 EISDILLFCWAFEQEERPTFTKLMDMLE----KLPKRNRRLSHPGHFWKSAEL       
            880       890       900           910       920        

       750       760      
pF1KB5 CASPKTPIQAGGYGAFPVH

>>CCDS5094.1 FYN gene_id:2534|Hs108|chr6                  (537 aa)
 initn: 398 init1: 254 opt: 512  Z-score: 332.2  bits: 71.7 E(32554): 3.5e-12
Smith-Waterman score: 512; 33.6% identity (66.1% similar) in 286 aa overlap (437-715:252-521)

        410       420       430       440       450       460      
pF1KB5 PGSLTNVKALQKSPGPQRERKSSSSSEDRNRMKTLGRRDSSDDWEIPDGQITVGQRIGSG
                                     :.  :. . ..: ::::  .. . .:.:.:
CCDS50 ETLQQLVQHYSERAAGLCCRLVVPCHKGMPRLTDLSVK-TKDVWEIPRESLQLIKRLGNG
             230       240       250        260       270       280

        470         480       490       500       510       520    
pF1KB5 SFGTVYKGKWHGD--VAVKMLNVTAPTPQQLQAFKNEVGVLRKTRHVNILLFMGYSTKPQ
       .:: :. : :.:.  ::.: :.  . .:.   .: .:. ...: .: ... ...  ..  
CCDS50 QFGEVWMGTWNGNTKVAIKTLKPGTMSPE---SFLEEAQIMKKLKHDKLVQLYAVVSEEP
              290       300          310       320       330       

          530       540        550       560       570       580   
pF1KB5 LAIVTQWCEGSSLYHHLHIIETK-FEMIKLIDIARQTAQGMDYLHAKSIIHRDLKSNNIF
       . :::.. . .::   :.  : . ... .:.:.: :.: :: :..  . :::::.: ::.
CCDS50 IYIVTEYMNKGSLLDFLKDGEGRALKLPNLVDMAAQVAAGMAYIERMNYIHRDLRSANIL
       340       350       360       370       380       390       

           590       600       610          620       630       640
pF1KB5 LHEDLTVKIGDFGLATVKSRWSGSHQFEQLSGS---ILWMAPEVIRMQDKNPYSFQSDVY
       . . :  ::.:::::    :   ....   .:.   : : :::.  .   . ....:::.
CCDS50 VGNGLICKIADFGLA----RLIEDNEYTARQGAKFPIKWTAPEAALY---GRFTIKSDVW
       400       410           420       430       440          450

              650        660       670       680       690         
pF1KB5 AFGIVLYELMT-GQLPYSNINNRDQIIFMVGRGYLSPDLSKVRSNCPKAMKRLMAECLKK
       .:::.: ::.: :..:: ..:::. .. .: :::  :      ..:: ....:: .: ::
CCDS50 SFGILLTELVTKGRVPYPGMNNRE-VLEQVERGYRMP----CPQDCPISLHELMIHCWKK
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     700       710       720       730       740       750         
pF1KB5 KRDERPLFPQILASIELLARSLPKIHRSASEPSLNRAGFQTEDFSLYACASPKTPIQAGG
         .::: :  . . .:                                            
CCDS50 DPEERPTFEYLQSFLEDYFTATEPQYQPGENL                            
         510       520       530                                   

>>CCDS58532.1 KSR1 gene_id:8844|Hs108|chr17               (762 aa)
 initn: 534 init1: 248 opt: 514  Z-score: 331.5  bits: 72.1 E(32554): 3.8e-12
Smith-Waterman score: 728; 27.0% identity (56.0% similar) in 745 aa overlap (68-731:36-753)

        40        50        60        70          80          90   
pF1KB5 AADPAIPEEVWNIKQMIKLTQEHIEALLDKFGGEHNPPSIY--LEAYEEYTS--KLDALQ
                                     .::::.  : .  :.: .:  :  . :.:.
CCDS58 VKETLRRCGASGDECGRLQYALTCLRKVTGLGGEHKEDSSWSSLDARRESGSGPSTDTLS
          10        20        30        40        50        60     

                 100           110       120         130       140 
pF1KB5 QRE------QQLLESLGNGTD----FSVSSSASMDTVTSSSSSSLS--VLPSSLSVFQNP
                .. :   ::...    .:::.  . :. : : : .::   .:   :   .:
CCDS58 AASLPWPPGSSQLGRAGNSAQGPRSISVSALPASDSPTPSFSEGLSDTCIPLHASGRLTP
          70        80        90       100       110       120     

             150       160       170       180       190       200 
pF1KB5 TDVARSNPKSPQKPIVRVFLPNKQRTVVPARCGVTVRDSLKKALMMRGLIPECCAVYRIQ
         . .:    :  : .:     ..  . : :   :     .:...   :.:   .. : .
CCDS58 RAL-HSFITPPTTPQLR-----RHTKLKPPR---TPPPPSRKVFQ---LLPSFPTLTRSK
          130       140            150          160          170   

             210       220          230        240       250       
pF1KB5 DGEKKPIGWDTDISWLTGEELHVE---VLENVPLT-THNFVRKTFFTLAFCDFCRKLLFQ
       . :..  .   :.: .  .  :     : ... :. :: :  :....   :  :.: .. 
CCDS58 SHESQLGNRIDDVSSMRFDLSHGSPQMVRRDIGLSVTHRFSTKSWLS-QVCHVCQKSMIF
           180       190       200       210       220        230  

       260       270       280       290       300       310       
pF1KB5 GFRCQTCGYKFHQRCSTEVPLMCVNYDQLDLLFVSKFFEHHPIPQEEASLAETALTS--G
       : .:. :  : :..:. :.:  :    ....: .... . . .:..  . .. :     :
CCDS58 GVKCKHCRLKCHNKCTKEAP-AC----RISFLPLTRLRRTESVPSDINNPVDRAAEPHFG
            240       250            260       270       280       

         320                  330       340         350       360  
pF1KB5 SSPSA-------PASD----SIGPQILTSPSPSKSIPIPQPFRP--ADEDHRNQFGQRDR
       . :.:       :: .    : .:.  :: .::.  :.:    :  :      . :::: 
CCDS58 TLPKALTKKEHPPAMNHLDSSSNPSSTTSSTPSSPAPFPTSSNPSSATTPPNPSPGQRDS
       290       300       310       320       330       340       

            370            380            390        400        410
pF1KB5 SSSAPNVHI-----NTIEPVNIDD-----LIRDQGFRGDGGSTTGLS-ATP-PASLPGSL
         . : ...     . : ::         :.  .... .. . .... :.: : .  :. 
CCDS58 RFNFPAAYFIHHRQQFIFPVPSAGHCWKCLLIAESLKENAFNISAFAHAAPLPEAADGTR
       350       360       370       380       390       400       

                    420       430       440                        
pF1KB5 ------TNVKALQKSPGPQRERKSSSSSEDRNRMKTL-----------GRRDSS-----D
             ..:   ... . . :  .: . .:....  :           .:. :.     .
CCDS58 LDDQPKADVLEAHEAEAEEPEAGKSEAEDDEDEVDDLPSSRRPWRGPISRKASQTSVYLQ
       410       420       430       440       450       460       

      450       460       470       480       490       500        
pF1KB5 DWEIPDGQITVGQRIGSGSFGTVYKGKWHGDVAVKMLNVTAPTPQQLQAFKNEVGVLRKT
       .:.::  :. .:. ::.: .: :..:.:::.::...:.. . . ..:. ::.::   :.:
CCDS58 EWDIPFEQVELGEPIGQGRWGRVHRGRWHGEVAIRLLEMDGHNQDHLKLFKKEVMNYRQT
       470       480       490       500       510       520       

      510       520        530       540       550       560       
pF1KB5 RHVNILLFMGYSTKP-QLAIVTQWCEGSSLYHHLHIIETKFEMIKLIDIARQTAQGMDYL
       :: :..::::   .: .:::.:..:.: .:.  ..  .:.... :  .::..  .:: ::
CCDS58 RHENVVLFMGACMNPPHLAIITSFCKGRTLHSFVRDPKTSLDINKTRQIAQEIIKGMGYL
       530       540       550       560       570       580       

       570       580       590       600       610       620       
pF1KB5 HAKSIIHRDLKSNNIFLHEDLTVKIGDFGLATVKSRWSGSHQFEQLSGSILWM---APEV
       :::.:.:.::::.:.: ...  : : ::::  ...    ... .::. :  :.   :::.
CCDS58 HAKGIVHKDLKSKNVF-YDNGKVVITDFGLFGISGVVREGRRENQLKLSHDWLCYLAPEI
       590       600        610       620       630       640      

                630       640       650       660       670        
pF1KB5 IRM------QDKNPYSFQSDVYAFGIVLYELMTGQLPYSNINNRDQIIFMVGRGYLSPDL
       .:       .:. :.:  .:::::: : :::.. . : .: .  .  :...: :     .
CCDS58 VREMTPGKDEDQLPFSKAADVYAFGTVWYELQARDWPLKN-QAAEASIWQIGSG---EGM
        650       660       670       680        690          700  

      680         690       700       710       720       730      
pF1KB5 SKVRSNCP--KAMKRLMAECLKKKRDERPLFPQILASIELLARSLPKIHRSASEPSLNRA
       ..: ..    : ...... :     .::: :  ..  .:    .:::..:  :.:     
CCDS58 KRVLTSVSLGKEVSEILSACWAFDLQERPSFSLLMDMLE----KLPKLNRRLSHPGHFWK
            710       720       730       740           750        

        740       750       760      
pF1KB5 GFQTEDFSLYACASPKTPIQAGGYGAFPVH
                                     
CCDS58 SAEL                          
      760                            

>>CCDS47859.1 LYN gene_id:4067|Hs108|chr8                 (491 aa)
 initn: 390 init1: 173 opt: 506  Z-score: 329.0  bits: 71.0 E(32554): 5.3e-12
Smith-Waterman score: 506; 31.2% identity (61.5% similar) in 356 aa overlap (368-715:145-477)

       340       350       360       370       380       390       
pF1KB5 KSIPIPQPFRPADEDHRNQFGQRDRSSSAPNVHINTIEPVNIDDLIRDQGFRG-DGGSTT
                                     .. .  ..::.  :.:.   .:. :.:   
CCDS47 RKDAERQLLAPGNSAGAFLIRESETLKGSFSLSVRDFDPVH-GDVIKHYKIRSLDNG---
          120       130       140       150        160       170   

        400       410       420         430       440       450    
pF1KB5 GLSATPPASLPGSLTNVKALQKSPGP--QRERKSSSSSEDRNRMKTLGRRDSSDDWEIPD
       :   .:  ..:     .:  ::.     .: .:.  : . ..         ..: :::: 
CCDS47 GYYISPRITFPCISDMIKHYQKQADGLCRRLEKACISPKPQKPW-------DKDAWEIPR
              180       190       200       210              220   

          460       470         480       490       500       510  
pF1KB5 GQITVGQRIGSGSFGTVYKGKWHGD--VAVKMLNVTAPTPQQLQAFKNEVGVLRKTRHVN
        .: . .:.:.:.:: :. : ....  :::: :.   :  ...::: .:.....  .: .
CCDS47 ESIKLVKRLGAGQFGEVWMGYYNNSTKVAVKTLK---PGTMSVQAFLEEANLMKTLQHDK
           230       240       250          260       270       280

            520        530       540        550       560       570
pF1KB5 ILLFMGYSTKPQ-LAIVTQWCEGSSLYHHLHIIET-KFEMIKLIDIARQTAQGMDYLHAK
       .. ...  :. . . :.:..   .::   :.  :  :  . ::::.. : :.:: :.. :
CCDS47 LVRLYAVVTREEPIYIITEYMAKGSLLDFLKSDEGGKVLLPKLIDFSAQIAEGMAYIERK
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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