Result of FASTA (ccds) for
pF1KB3024
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB3024, 1352 aa
1>>>pF1KB3024 1352 - 1352 aa - 1352 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.6462+/-0.00127; mu= 12.9761+/- 0.076
mean_var=469.1342+/-102.548, 0's: 0 Z-trim(113.1): 435 B-trim: 777 in 1/52
Lambda= 0.059214
statistics sampled from 13279 (13779) to 13279 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.739), E-opt: 0.2 (0.423), width: 16
Scan time: 5.420
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS32642.1 ERBB2 gene_id:2064|Hs108|chr17 (1255) 8835 771.1 0
CCDS74052.1 ERBB2 gene_id:2064|Hs108|chr17 (1240) 8696 759.3 1.5e-218
CCDS45667.1 ERBB2 gene_id:2064|Hs108|chr17 (1225) 8630 753.6 7.4e-217
CCDS77016.1 ERBB2 gene_id:2064|Hs108|chr17 (1055) 7402 648.6 2.6e-185
CCDS77017.1 ERBB2 gene_id:2064|Hs108|chr17 ( 603) 4364 388.7 2.6e-107
CCDS42811.1 ERBB4 gene_id:2066|Hs108|chr2 (1292) 3921 351.4 9.6e-96
CCDS2394.1 ERBB4 gene_id:2066|Hs108|chr2 (1308) 3812 342.1 6.1e-93
CCDS5514.1 EGFR gene_id:1956|Hs108|chr7 (1210) 3748 336.5 2.6e-91
CCDS31833.1 ERBB3 gene_id:2065|Hs108|chr12 (1342) 2998 272.5 5.3e-72
CCDS5516.1 EGFR gene_id:1956|Hs108|chr7 ( 628) 1721 162.9 2.5e-39
CCDS5515.1 EGFR gene_id:1956|Hs108|chr7 ( 705) 1721 163.0 2.6e-39
CCDS47587.1 EGFR gene_id:1956|Hs108|chr7 ( 405) 948 96.6 1.5e-19
CCDS5706.1 EPHB4 gene_id:2050|Hs108|chr7 ( 987) 743 79.7 4.4e-14
CCDS46921.1 EPHB1 gene_id:2047|Hs108|chr3 ( 984) 727 78.3 1.1e-13
CCDS6381.1 PTK2 gene_id:5747|Hs108|chr8 (1052) 724 78.1 1.4e-13
CCDS2447.1 EPHA4 gene_id:2043|Hs108|chr2 ( 986) 718 77.6 2e-13
CCDS56557.1 PTK2 gene_id:5747|Hs108|chr8 (1065) 718 77.6 2e-13
CCDS75132.1 EPHA5 gene_id:2044|Hs108|chr4 (1004) 709 76.8 3.4e-13
CCDS3514.1 EPHA5 gene_id:2044|Hs108|chr4 (1015) 709 76.8 3.4e-13
CCDS75131.1 EPHA5 gene_id:2044|Hs108|chr4 (1016) 709 76.8 3.4e-13
CCDS3513.1 EPHA5 gene_id:2044|Hs108|chr4 (1037) 709 76.8 3.4e-13
CCDS75133.1 EPHA5 gene_id:2044|Hs108|chr4 (1038) 709 76.8 3.4e-13
CCDS6058.1 PTK2B gene_id:2185|Hs108|chr8 ( 967) 705 76.4 4.2e-13
CCDS6057.1 PTK2B gene_id:2185|Hs108|chr8 (1009) 705 76.5 4.3e-13
CCDS3268.1 EPHB3 gene_id:2049|Hs108|chr3 ( 998) 704 76.4 4.5e-13
CCDS229.2 EPHB2 gene_id:2048|Hs108|chr1 ( 986) 703 76.3 4.7e-13
CCDS230.1 EPHB2 gene_id:2048|Hs108|chr1 ( 987) 703 76.3 4.7e-13
CCDS81279.1 EPHB2 gene_id:2048|Hs108|chr1 (1055) 703 76.3 4.9e-13
CCDS33928.1 TNK2 gene_id:10188|Hs108|chr3 (1038) 700 76.1 5.8e-13
CCDS77875.1 TNK2 gene_id:10188|Hs108|chr3 (1040) 700 76.1 5.8e-13
CCDS33927.1 TNK2 gene_id:10188|Hs108|chr3 (1086) 700 76.1 6e-13
CCDS169.1 EPHA2 gene_id:1969|Hs108|chr1 ( 976) 696 75.7 7.1e-13
CCDS44283.1 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1 ( 542) 686 74.4 9.6e-13
CCDS2922.1 EPHA3 gene_id:2042|Hs108|chr3 ( 983) 690 75.2 1e-12
CCDS53435.1 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1 (1043) 688 75.0 1.2e-12
CCDS53437.1 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1 (1058) 688 75.0 1.2e-12
CCDS44282.1 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1 (1064) 688 75.0 1.2e-12
CCDS53438.1 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1 (1079) 688 75.1 1.2e-12
CCDS53436.1 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1 (1161) 688 75.1 1.3e-12
CCDS41441.2 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1 (1167) 688 75.1 1.3e-12
CCDS30947.1 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1 (1182) 688 75.1 1.3e-12
CCDS47992.1 SYK gene_id:6850|Hs108|chr9 ( 612) 671 73.2 2.5e-12
CCDS6688.1 SYK gene_id:6850|Hs108|chr9 ( 635) 671 73.2 2.5e-12
CCDS5031.1 EPHA7 gene_id:2045|Hs108|chr6 ( 998) 674 73.8 2.7e-12
CCDS35166.1 ABL1 gene_id:25|Hs108|chr9 (1130) 670 73.6 3.6e-12
CCDS35165.1 ABL1 gene_id:25|Hs108|chr9 (1149) 670 73.6 3.6e-12
CCDS43636.1 MET gene_id:4233|Hs108|chr7 (1390) 666 73.4 5.1e-12
CCDS47689.1 MET gene_id:4233|Hs108|chr7 (1408) 666 73.4 5.1e-12
CCDS5884.1 EPHA1 gene_id:2041|Hs108|chr7 ( 976) 658 72.4 6.8e-12
CCDS82777.1 MST1R gene_id:4486|Hs108|chr3 (1294) 660 72.8 7e-12
>>CCDS32642.1 ERBB2 gene_id:2064|Hs108|chr17 (1255 aa)
initn: 8835 init1: 8835 opt: 8835 Z-score: 4101.3 bits: 771.1 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 8835; 100.0% identity (100.0% similar) in 1255 aa overlap (98-1352:1-1255)
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 PGPHPSQHPAPRALPAGSSRSHGAGAAVSTMELAALCRWGLLLALLPPGAASTQVCTGTD
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MELAALCRWGLLLALLPPGAASTQVCTGTD
10 20 30
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 MKLRLPASPETHLDMLRHLYQGCQVVQGNLELTYLPTNASLSFLQDIQEVQGYVLIAHNQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MKLRLPASPETHLDMLRHLYQGCQVVQGNLELTYLPTNASLSFLQDIQEVQGYVLIAHNQ
40 50 60 70 80 90
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 VRQVPLQRLRIVRGTQLFEDNYALAVLDNGDPLNNTTPVTGASPGGLRELQLRSLTEILK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 VRQVPLQRLRIVRGTQLFEDNYALAVLDNGDPLNNTTPVTGASPGGLRELQLRSLTEILK
100 110 120 130 140 150
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 GGVLIQRNPQLCYQDTILWKDIFHKNNQLALTLIDTNRSRACHPCSPMCKGSRCWGESSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 GGVLIQRNPQLCYQDTILWKDIFHKNNQLALTLIDTNRSRACHPCSPMCKGSRCWGESSE
160 170 180 190 200 210
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 DCQSLTRTVCAGGCARCKGPLPTDCCHEQCAAGCTGPKHSDCLACLHFNHSGICELHCPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 DCQSLTRTVCAGGCARCKGPLPTDCCHEQCAAGCTGPKHSDCLACLHFNHSGICELHCPA
220 230 240 250 260 270
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 LVTYNTDTFESMPNPEGRYTFGASCVTACPYNYLSTDVGSCTLVCPLHNQEVTAEDGTQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LVTYNTDTFESMPNPEGRYTFGASCVTACPYNYLSTDVGSCTLVCPLHNQEVTAEDGTQR
280 290 300 310 320 330
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 CEKCSKPCARVCYGLGMEHLREVRAVTSANIQEFAGCKKIFGSLAFLPESFDGDPASNTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 CEKCSKPCARVCYGLGMEHLREVRAVTSANIQEFAGCKKIFGSLAFLPESFDGDPASNTA
340 350 360 370 380 390
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 PLQPEQLQVFETLEEITGYLYISAWPDSLPDLSVFQNLQVIRGRILHNGAYSLTLQGLGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 PLQPEQLQVFETLEEITGYLYISAWPDSLPDLSVFQNLQVIRGRILHNGAYSLTLQGLGI
400 410 420 430 440 450
550 560 570 580 590 600
pF1KB3 SWLGLRSLRELGSGLALIHHNTHLCFVHTVPWDQLFRNPHQALLHTANRPEDECVGEGLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SWLGLRSLRELGSGLALIHHNTHLCFVHTVPWDQLFRNPHQALLHTANRPEDECVGEGLA
460 470 480 490 500 510
610 620 630 640 650 660
pF1KB3 CHQLCARGHCWGPGPTQCVNCSQFLRGQECVEECRVLQGLPREYVNARHCLPCHPECQPQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 CHQLCARGHCWGPGPTQCVNCSQFLRGQECVEECRVLQGLPREYVNARHCLPCHPECQPQ
520 530 540 550 560 570
670 680 690 700 710 720
pF1KB3 NGSVTCFGPEADQCVACAHYKDPPFCVARCPSGVKPDLSYMPIWKFPDEEGACQPCPINC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 NGSVTCFGPEADQCVACAHYKDPPFCVARCPSGVKPDLSYMPIWKFPDEEGACQPCPINC
580 590 600 610 620 630
730 740 750 760 770 780
pF1KB3 THSCVDLDDKGCPAEQRASPLTSIISAVVGILLVVVLGVVFGILIKRRQQKIRKYTMRRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 THSCVDLDDKGCPAEQRASPLTSIISAVVGILLVVVLGVVFGILIKRRQQKIRKYTMRRL
640 650 660 670 680 690
790 800 810 820 830 840
pF1KB3 LQETELVEPLTPSGAMPNQAQMRILKETELRKVKVLGSGAFGTVYKGIWIPDGENVKIPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LQETELVEPLTPSGAMPNQAQMRILKETELRKVKVLGSGAFGTVYKGIWIPDGENVKIPV
700 710 720 730 740 750
850 860 870 880 890 900
pF1KB3 AIKVLRENTSPKANKEILDEAYVMAGVGSPYVSRLLGICLTSTVQLVTQLMPYGCLLDHV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 AIKVLRENTSPKANKEILDEAYVMAGVGSPYVSRLLGICLTSTVQLVTQLMPYGCLLDHV
760 770 780 790 800 810
910 920 930 940 950 960
pF1KB3 RENRGRLGSQDLLNWCMQIAKGMSYLEDVRLVHRDLAARNVLVKSPNHVKITDFGLARLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 RENRGRLGSQDLLNWCMQIAKGMSYLEDVRLVHRDLAARNVLVKSPNHVKITDFGLARLL
820 830 840 850 860 870
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KB3 DIDETEYHADGGKVPIKWMALESILRRRFTHQSDVWSYGVTVWELMTFGAKPYDGIPARE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 DIDETEYHADGGKVPIKWMALESILRRRFTHQSDVWSYGVTVWELMTFGAKPYDGIPARE
880 890 900 910 920 930
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KB3 IPDLLEKGERLPQPPICTIDVYMIMVKCWMIDSECRPRFRELVSEFSRMARDPQRFVVIQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 IPDLLEKGERLPQPPICTIDVYMIMVKCWMIDSECRPRFRELVSEFSRMARDPQRFVVIQ
940 950 960 970 980 990
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KB3 NEDLGPASPLDSTFYRSLLEDDDMGDLVDAEEYLVPQQGFFCPDPAPGAGGMVHHRHRSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 NEDLGPASPLDSTFYRSLLEDDDMGDLVDAEEYLVPQQGFFCPDPAPGAGGMVHHRHRSS
1000 1010 1020 1030 1040 1050
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KB3 STRSGGGDLTLGLEPSEEEAPRSPLAPSEGAGSDVFDGDLGMGAAKGLQSLPTHDPSPLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 STRSGGGDLTLGLEPSEEEAPRSPLAPSEGAGSDVFDGDLGMGAAKGLQSLPTHDPSPLQ
1060 1070 1080 1090 1100 1110
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KB3 RYSEDPTVPLPSETDGYVAPLTCSPQPEYVNQPDVRPQPPSPREGPLPAARPAGATLERP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 RYSEDPTVPLPSETDGYVAPLTCSPQPEYVNQPDVRPQPPSPREGPLPAARPAGATLERP
1120 1130 1140 1150 1160 1170
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KB3 KTLSPGKNGVVKDVFAFGGAVENPEYLTPQGGAAPQPHPPPAFSPAFDNLYYWDQDPPER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 KTLSPGKNGVVKDVFAFGGAVENPEYLTPQGGAAPQPHPPPAFSPAFDNLYYWDQDPPER
1180 1190 1200 1210 1220 1230
1330 1340 1350
pF1KB3 GAPPSTFKGTPTAENPEYLGLDVPV
:::::::::::::::::::::::::
CCDS32 GAPPSTFKGTPTAENPEYLGLDVPV
1240 1250
>>CCDS74052.1 ERBB2 gene_id:2064|Hs108|chr17 (1240 aa)
initn: 8696 init1: 8696 opt: 8696 Z-score: 4037.1 bits: 759.3 E(32554): 1.5e-218
Smith-Waterman score: 8696; 99.5% identity (99.8% similar) in 1240 aa overlap (113-1352:1-1240)
90 100 110 120 130 140
pF1KB3 AGSSRSHGAGAAVSTMELAALCRWGLLLALLPPGAASTQVCTGTDMKLRLPASPETHLDM
.: :. . ::::::::::::::::::::::
CCDS74 MPRGSWKPQVCTGTDMKLRLPASPETHLDM
10 20 30
150 160 170 180 190 200
pF1KB3 LRHLYQGCQVVQGNLELTYLPTNASLSFLQDIQEVQGYVLIAHNQVRQVPLQRLRIVRGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 LRHLYQGCQVVQGNLELTYLPTNASLSFLQDIQEVQGYVLIAHNQVRQVPLQRLRIVRGT
40 50 60 70 80 90
210 220 230 240 250 260
pF1KB3 QLFEDNYALAVLDNGDPLNNTTPVTGASPGGLRELQLRSLTEILKGGVLIQRNPQLCYQD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 QLFEDNYALAVLDNGDPLNNTTPVTGASPGGLRELQLRSLTEILKGGVLIQRNPQLCYQD
100 110 120 130 140 150
270 280 290 300 310 320
pF1KB3 TILWKDIFHKNNQLALTLIDTNRSRACHPCSPMCKGSRCWGESSEDCQSLTRTVCAGGCA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 TILWKDIFHKNNQLALTLIDTNRSRACHPCSPMCKGSRCWGESSEDCQSLTRTVCAGGCA
160 170 180 190 200 210
330 340 350 360 370 380
pF1KB3 RCKGPLPTDCCHEQCAAGCTGPKHSDCLACLHFNHSGICELHCPALVTYNTDTFESMPNP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 RCKGPLPTDCCHEQCAAGCTGPKHSDCLACLHFNHSGICELHCPALVTYNTDTFESMPNP
220 230 240 250 260 270
390 400 410 420 430 440
pF1KB3 EGRYTFGASCVTACPYNYLSTDVGSCTLVCPLHNQEVTAEDGTQRCEKCSKPCARVCYGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 EGRYTFGASCVTACPYNYLSTDVGSCTLVCPLHNQEVTAEDGTQRCEKCSKPCARVCYGL
280 290 300 310 320 330
450 460 470 480 490 500
pF1KB3 GMEHLREVRAVTSANIQEFAGCKKIFGSLAFLPESFDGDPASNTAPLQPEQLQVFETLEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 GMEHLREVRAVTSANIQEFAGCKKIFGSLAFLPESFDGDPASNTAPLQPEQLQVFETLEE
340 350 360 370 380 390
510 520 530 540 550 560
pF1KB3 ITGYLYISAWPDSLPDLSVFQNLQVIRGRILHNGAYSLTLQGLGISWLGLRSLRELGSGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 ITGYLYISAWPDSLPDLSVFQNLQVIRGRILHNGAYSLTLQGLGISWLGLRSLRELGSGL
400 410 420 430 440 450
570 580 590 600 610 620
pF1KB3 ALIHHNTHLCFVHTVPWDQLFRNPHQALLHTANRPEDECVGEGLACHQLCARGHCWGPGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 ALIHHNTHLCFVHTVPWDQLFRNPHQALLHTANRPEDECVGEGLACHQLCARGHCWGPGP
460 470 480 490 500 510
630 640 650 660 670 680
pF1KB3 TQCVNCSQFLRGQECVEECRVLQGLPREYVNARHCLPCHPECQPQNGSVTCFGPEADQCV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 TQCVNCSQFLRGQECVEECRVLQGLPREYVNARHCLPCHPECQPQNGSVTCFGPEADQCV
520 530 540 550 560 570
690 700 710 720 730 740
pF1KB3 ACAHYKDPPFCVARCPSGVKPDLSYMPIWKFPDEEGACQPCPINCTHSCVDLDDKGCPAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 ACAHYKDPPFCVARCPSGVKPDLSYMPIWKFPDEEGACQPCPINCTHSCVDLDDKGCPAE
580 590 600 610 620 630
750 760 770 780 790 800
pF1KB3 QRASPLTSIISAVVGILLVVVLGVVFGILIKRRQQKIRKYTMRRLLQETELVEPLTPSGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 QRASPLTSIISAVVGILLVVVLGVVFGILIKRRQQKIRKYTMRRLLQETELVEPLTPSGA
640 650 660 670 680 690
810 820 830 840 850 860
pF1KB3 MPNQAQMRILKETELRKVKVLGSGAFGTVYKGIWIPDGENVKIPVAIKVLRENTSPKANK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 MPNQAQMRILKETELRKVKVLGSGAFGTVYKGIWIPDGENVKIPVAIKVLRENTSPKANK
700 710 720 730 740 750
870 880 890 900 910 920
pF1KB3 EILDEAYVMAGVGSPYVSRLLGICLTSTVQLVTQLMPYGCLLDHVRENRGRLGSQDLLNW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 EILDEAYVMAGVGSPYVSRLLGICLTSTVQLVTQLMPYGCLLDHVRENRGRLGSQDLLNW
760 770 780 790 800 810
930 940 950 960 970 980
pF1KB3 CMQIAKGMSYLEDVRLVHRDLAARNVLVKSPNHVKITDFGLARLLDIDETEYHADGGKVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 CMQIAKGMSYLEDVRLVHRDLAARNVLVKSPNHVKITDFGLARLLDIDETEYHADGGKVP
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 IKWMALESILRRRFTHQSDVWSYGVTVWELMTFGAKPYDGIPAREIPDLLEKGERLPQPP
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 SEEEAPRSPLAPSEGAGSDVFDGDLGMGAAKGLQSLPTHDPSPLQRYSEDPTVPLPSETD
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 GYVAPLTCSPQPEYVNQPDVRPQPPSPREGPLPAARPAGATLERPKTLSPGKNGVVKDVF
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 AFGGAVENPEYLTPQGGAAPQPHPPPAFSPAFDNLYYWDQDPPERGAPPSTFKGTPTAEN
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1350
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::::::::::
CCDS74 PEYLGLDVPV
1240
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 ELTYLPTNASLSFLQDIQEVQGYVLIAHNQVRQVPLQRLRIVRGTQLFEDNYALAVLDNG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 ILLVVVLGVVFGILIKRRQQKIRKYTMRRLLQETELVEPLTPSGAMPNQAQMRILKETEL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 GGAAPQPHPPPAFSPAFDNLYYWDQDPPERGAPPSTFKGTPTAENPEYLGLDVPV
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::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 MELAALCRWGLLLALLPPGAASTQVCTGTD
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 MKLRLPASPETHLDMLRHLYQGCQVVQGNLELTYLPTNASLSFLQDIQEVQGYVLIAHNQ
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 GGVLIQRNPQLCYQDTILWKDIFHKNNQLALTLIDTNRSRACHPCSPMCKGSRCWGESSE
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pF1KB3 DCQSLTRTVCAGGCARCKGPLPTDCCHEQCAAGCTGPKHSDCLACLHFNHSGICELHCPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 DCQSLTRTVCAGGCARCKGPLPTDCCHEQCAAGCTGPKHSDCLACLHFNHSGICELHCPA
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pF1KB3 LVTYNTDTFESMPNPEGRYTFGASCVTACPYNYLSTDVGSCTLVCPLHNQEVTAEDGTQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 LVTYNTDTFESMPNPEGRYTFGASCVTACPYNYLSTDVGSCTLVCPLHNQEVTAEDGTQR
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pF1KB3 CEKCSKPCARVCYGLGMEHLREVRAVTSANIQEFAGCKKIFGSLAFLPESFDGDPASNTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 CEKCSKPCARVCYGLGMEHLREVRAVTSANIQEFAGCKKIFGSLAFLPESFDGDPASNTA
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pF1KB3 PLQPEQLQVFETLEEITGYLYISAWPDSLPDLSVFQNLQVIRGRILHNGAYSLTLQGLGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 PLQPEQLQVFETLEEITGYLYISAWPDSLPDLSVFQNLQVIRGRILHNGAYSLTLQGLGI
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pF1KB3 SWLGLRSLRELGSGLALIHHNTHLCFVHTVPWDQLFRNPHQALLHTANRPEDECVGEGLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 SWLGLRSLRELGSGLALIHHNTHLCFVHTVPWDQLFRNPHQALLHTANRPEDECVGEGLA
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pF1KB3 CHQLCARGHCWGPGPTQCVNCSQFLRGQECVEECRVLQGLPREYVNARHCLPCHPECQPQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 CHQLCARGHCWGPGPTQCVNCSQFLRGQECVEECRVLQGLPREYVNARHCLPCHPECQPQ
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 NGSVTCFGPEADQCVACAHYKDPPFCVARCPSGVKPDLSYMPIWKFPDEEGACQPCPINC
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pF1KB3 THSCVDLDDKGCPAEQRASPLTSIISAVVGILLVVVLGVVFGILIKRRQQKIRKYTMRRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 THSCVDLDDKGCPAEQRASPLTSIISAVVGILLVVVLGVVFGILIKRRQQKIRKYTMRRL
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pF1KB3 LQETELVEPLTPSGAMPNQAQMRILKETELRKVKVLGSGAFGTVYKGIWIPDGENVKIPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 LQETELVEPLTPSGAMPNQAQMRILKETELRKVKVLGSGAFGTVYKGIWIPDGENVKIPV
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pF1KB3 AIKVLRENTSPKANKEILDEAYVMAGVGSPYVSRLLGICLTSTVQLVTQLMPYGCLLDHV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 AIKVLRENTSPKANKEILDEAYVMAGVGSPYVSRLLGICLTSTVQLVTQLMPYGCLLDHV
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pF1KB3 RENRGRLGSQDLLNWCMQIAKGMSYLEDVRLVHRDLAARNVLVKSPNHVKITDFGLARLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 RENRGRLGSQDLLNWCMQIAKGMSYLEDVRLVHRDLAARNVLVKSPNHVKITDFGLARLL
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pF1KB3 DIDETEYHADGGKVPIKWMALESILRRRFTHQSDVWSYGVTVWELMTFGAKPYDGIPARE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 DIDETEYHADGGKVPIKWMALESILRRRFTHQSDVWSYGVTVWELMTFGAKPYDGIPARE
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pF1KB3 IPDLLEKGERLPQPPICTIDVYMIMVKCWMIDSECRPRFRELVSEFSRMARDPQRFVVIQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 IPDLLEKGERLPQPPICTIDVYMIMVKCWMIDSECRPRFRELVSEFSRMARDPQRFVVIQ
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pF1KB3 NEDLGPASPLDSTFYRSLLEDDDMGDLVDAEEYLVPQQGFFCPDPAPGAGGMVHHRHRSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 NEDLGPASPLDSTFYRSLLEDDDMGDLVDAEEYLVPQQGFFCPDPAPGAGGMVHHRHRSS
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pF1KB3 STRSGGGDLTLGLEPSEEEAPRSPLAPSEGAGSDVFDGDLGMGAAKGLQSLPTHDPSPLQ
:::.
CCDS77 STRNM
>>CCDS77017.1 ERBB2 gene_id:2064|Hs108|chr17 (603 aa)
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pF1KB3 MELAALCRWGLLLALLPPGAASTQVCTGTDMKLRLPASPETHLDMLRHLYQGCQVVQGNL
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 MKLRLPASPETHLDMLRHLYQGCQVVQGNL
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160 170 180 190 200 210
pF1KB3 ELTYLPTNASLSFLQDIQEVQGYVLIAHNQVRQVPLQRLRIVRGTQLFEDNYALAVLDNG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 ELTYLPTNASLSFLQDIQEVQGYVLIAHNQVRQVPLQRLRIVRGTQLFEDNYALAVLDNG
40 50 60 70 80 90
220 230 240 250 260 270
pF1KB3 DPLNNTTPVTGASPGGLRELQLRSLTEILKGGVLIQRNPQLCYQDTILWKDIFHKNNQLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 DPLNNTTPVTGASPGGLRELQLRSLTEILKGGVLIQRNPQLCYQDTILWKDIFHKNNQLA
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pF1KB3 LTLIDTNRSRACHPCSPMCKGSRCWGESSEDCQSLTRTVCAGGCARCKGPLPTDCCHEQC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 LTLIDTNRSRACHPCSPMCKGSRCWGESSEDCQSLTRTVCAGGCARCKGPLPTDCCHEQC
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pF1KB3 AAGCTGPKHSDCLACLHFNHSGICELHCPALVTYNTDTFESMPNPEGRYTFGASCVTACP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 AAGCTGPKHSDCLACLHFNHSGICELHCPALVTYNTDTFESMPNPEGRYTFGASCVTACP
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pF1KB3 YNYLSTDVGSCTLVCPLHNQEVTAEDGTQRCEKCSKPCARVCYGLGMEHLREVRAVTSAN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 YNYLSTDVGSCTLVCPLHNQEVTAEDGTQRCEKCSKPCARVCYGLGMEHLREVRAVTSAN
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pF1KB3 IQEFAGCKKIFGSLAFLPESFDGDPASNTAPLQPEQLQVFETLEEITGYLYISAWPDSLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 IQEFAGCKKIFGSLAFLPESFDGDPASNTAPLQPEQLQVFETLEEITGYLYISAWPDSLP
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pF1KB3 DLSVFQNLQVIRGRILHNGAYSLTLQGLGISWLGLRSLRELGSGLALIHHNTHLCFVHTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 DLSVFQNLQVIRGRILHNGAYSLTLQGLGISWLGLRSLRELGSGLALIHHNTHLCFVHTV
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pF1KB3 PWDQLFRNPHQALLHTANRPEDECVGEGLACHQLCARGHCWGPGPTQCVNCSQFLRGQEC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 PWDQLFRNPHQALLHTANRPEDECVGEGLACHQLCARGHCWGPGPTQCVNCSQFLRGQEC
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pF1KB3 VEECRVLQGLPREYVNARHCLPCHPECQPQNGSVTCFGPEADQCVACAHYKDPPFCVARC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 VEECRVLQGLPREYVNARHCLPCHPECQPQNGSVTCFGPEADQCVACAHYKDPPFCVARC
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pF1KB3 PSGVKPDLSYMPIWKFPDEEGACQPCPINCTHSCVDLDDKGCPAEQRASPLTSIISAVVG
:::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 PSGVKPDLSYMPIWKFPDEEGACQPCPINCTHS
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CCDS42 SLKPGTVLPPPPYRHRNTVV
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CCDS23 MKPATGLWVWVSLLVAAGTVQP-SDSQSVCAGTENKLSS
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CCDS23 LSDLEQQYRALRKYYENCEVVMGNLEITSIEHNRDLSFLRSVREVTGYVLVALNQFRYLP
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CCDS23 LENLRIIRGTKLYEDRYALAIFLNYRKDGNF---------GLQELGLKNLTEILNGGVYV
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CCDS23 DQNKFLCYADTIHWQDIVRNPWPSNLTLVSTNGSSGCGRCHKSCTG-RCWGPTENHCQTL
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CCDS23 TRTVCAEQCDGRCYGPYVSDCCHRECAGGCSGPKDTDCFACMNFNDSGACVTQCPQTFVY
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CCDS23 TDICPKACDGIGTGSLMSAQTVDSSNIDKFINCTKINGNLIFLVTGIHGDPYNAIEAIDP
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CCDS23 -KKRALRRFL-ETELVEPLTPSGTAPNQAQLRILKETELKRVKVLGSGAFGTVYKGIWVP
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CCDS23 EGETVKIPVAIKILNETTGPKANVEFMDEALIMASMDHPHLVRLLGVCLSPTIQLVTQLM
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CCDS23 PHGCLLEYVHEHKDNIGSQLLLNWCVQIAKGMMYLEERRLVHRDLAARNVLVKSPNHVKI
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CCDS23 TDFGLARLLEGDEKEYNADGGKMPIKWMALECIHYRKFTHQSDVWSYGVTIWELMTFGGK
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CCDS23 PYDGIPTREIPDLLEKGERLPQPPICTIDVYMVMVKCWMIDADSRPKFKELAAEFSRMAR
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pF1KB3 DPQRFVVIQNED-LGPASPLDSTFYRSLLEDDDMGDLVDAEEYLVPQQGFFCPDPA----
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CCDS23 DPQRYLVIQGDDRMKLPSPNDSKFFQNLLDEEDLEDMMDAEEYLVPQ-AFNIPPPIYTSR
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CCDS23 ARIDSNRSEIGHSPPPAYTPMSGNQFVYRDGGFAAEQGVSVPYRAPTSTIPEAPVAQGAT
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pF1KB3 SDVFDGDLGMGAAKGLQSLPTHDPSPLQRYSEDPTVPLPSET-------DGYVAPLTCSP
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CCDS23 AEIFDDSCCNGTLRKPVAPHVQEDSSTQRYSADPTVFAPERSPRGELDEEGYMTPMRDKP
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pF1KB3 QPEYVNQPDVRPQPPSPREGPLPAA-RPA--GATLERPKTLSPGKNGVVKDVFAFGGAVE
. ::.: . : ..: : : : .:. ::. . : . . .:....
CCDS23 KQEYLNPVEENPFVSRRKNGDLQALDNPEYHNASNGPPKAEDEYVNEPLY-LNTFANTLG
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pF1KB3 NPEYLTPQGGAAPQPHPPPAFSPAFDNLYYWDQDPPERGA--PPSTFKGTPT--------
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CCDS23 KAEYLKNNILSMPEKA-----KKAFDNPDYWNHSLPPRSTLQHPDYLQEYSTKYFYKQNG
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CCDS23 RIRPIVAENPEYLSEFSLKPGTVLPPPPYRHRNTVV
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CCDS55 MRPSGTAGAALLAL-LAALC---------PASR
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pF1KB3 A--STQVCTGTDMKLRLPASPETHLDMLRHLYQGCQVVQGNLELTYLPTNASLSFLQDIQ
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CCDS55 ALEEKKVCQGTSNKLTQLGTFEDHFLSLQRMFNNCEVVLGNLEITYVQRNYDLSFLKTIQ
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CCDS55 PVAFRGDSFTHTPPLDPQELDILKTVKEITGFLLIQAWPENRTDLHAFENLEIIRGRTKQ
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pF1KB3 NGAYSLTLQGLGISWLGLRSLRELGSGLALIHHNTHLCFVHTVPWDQLFRNPHQALLHTA
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CCDS55 HGQFSLAVVSLNITSLGLRSLKEISDGDVIISGNKNLCYANTINWKKLFGTSGQKTKIIS
440 450 460 470 480 490
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CCDS55 NRGENSCKATGQVCHALCSPEGCWGPEPRDCVSCRNVSRGRECVDKCNLLEGEPREFVEN
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CCDS55 SECIQCHPECLPQAMNITCTGRGPDNCIQCAHYIDGPHCVKTCPAGVMGENNTL-VWKYA
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CCDS55 DAGHVCHLCHPNCTYGS
620
1352 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sat Nov 5 20:48:54 2016 done: Sat Nov 5 20:48:55 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]