Result of FASTA (omim) for pF1KB9611
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB9611, 589 aa
  1>>>pF1KB9611 589 - 589 aa - 589 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6462+/-0.000439; mu= 16.9091+/- 0.027
 mean_var=83.9646+/-17.074, 0's: 0 Z-trim(110.6): 385  B-trim: 0 in 0/53
 Lambda= 0.139967
 statistics sampled from 18490 (18930) to 18490 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.588), E-opt: 0.2 (0.222), width:  16
 Scan time:  9.310

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_001243504 (OMIM: 605173) ectoderm-neural cortex ( 589) 3090 634.7 2.6e-181
XP_011541998 (OMIM: 605173) PREDICTED: ectoderm-ne ( 589) 3090 634.7 2.6e-181
XP_011541999 (OMIM: 605173) PREDICTED: ectoderm-ne ( 589) 3090 634.7 2.6e-181
NP_003624 (OMIM: 605173) ectoderm-neural cortex pr ( 589) 3090 634.7 2.6e-181
NP_001243503 (OMIM: 605173) ectoderm-neural cortex ( 589) 3090 634.7 2.6e-181
NP_001243505 (OMIM: 605173) ectoderm-neural cortex ( 516) 2742 564.4 3.3e-160
NP_001244123 (OMIM: 605775,614495) kelch-like prot ( 555)  928 198.1 6.5e-50
NP_059111 (OMIM: 605775,614495) kelch-like protein ( 587)  928 198.1 6.8e-50
NP_067646 (OMIM: 614522) kelch-like protein 12 iso ( 568)  910 194.5 8.2e-49
NP_001289980 (OMIM: 614522) kelch-like protein 12  ( 606)  910 194.5 8.7e-49
XP_011508137 (OMIM: 614522) PREDICTED: kelch-like  ( 623)  910 194.5 8.8e-49
XP_016863163 (OMIM: 605774) PREDICTED: kelch-like  ( 555)  897 191.8   5e-48
NP_009177 (OMIM: 605774) kelch-like protein 2 isof ( 593)  897 191.9 5.2e-48
NP_001154993 (OMIM: 605774) kelch-like protein 2 i ( 597)  897 191.9 5.3e-48
XP_011529874 (OMIM: 605774) PREDICTED: kelch-like  ( 633)  877 187.8 9.1e-47
NP_001244124 (OMIM: 605775,614495) kelch-like prot ( 505)  822 176.7 1.7e-43
NP_569713 (OMIM: 614214) kelch-like protein 6 [Hom ( 621)  808 173.9 1.4e-42
NP_001165125 (OMIM: 608064) kelch-like protein 5 i ( 568)  794 171.0 9.3e-42
NP_001007076 (OMIM: 608064) kelch-like protein 5 i ( 709)  794 171.1 1.1e-41
NP_057074 (OMIM: 608064) kelch-like protein 5 isof ( 755)  794 171.1 1.2e-41
XP_016863764 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like  ( 788)  794 171.1 1.2e-41
XP_005262712 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like  ( 789)  794 171.1 1.2e-41
XP_016863762 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like  ( 804)  794 171.1 1.2e-41
XP_016863763 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like  ( 804)  794 171.1 1.2e-41
XP_011512001 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like  ( 804)  794 171.1 1.2e-41
XP_011512002 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like  ( 788)  793 170.9 1.4e-41
XP_011512003 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like  ( 788)  793 170.9 1.4e-41
XP_016863765 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like  ( 788)  793 170.9 1.4e-41
NP_001154994 (OMIM: 605774) kelch-like protein 2 i ( 505)  781 168.4 5.2e-41
XP_016863165 (OMIM: 605774) PREDICTED: kelch-like  ( 505)  781 168.4 5.2e-41
XP_016857484 (OMIM: 614522) PREDICTED: kelch-like  ( 471)  746 161.3 6.6e-39
XP_011508138 (OMIM: 614522) PREDICTED: kelch-like  ( 526)  746 161.3 7.2e-39
NP_001138821 (OMIM: 147485) actin-binding protein  ( 582)  733 158.7 4.8e-38
NP_005888 (OMIM: 147485) actin-binding protein IPP ( 584)  733 158.7 4.8e-38
NP_061990 (OMIM: 300348) kelch-like protein 4 isof ( 718)  732 158.6 6.5e-38
NP_476503 (OMIM: 300348) kelch-like protein 4 isof ( 720)  731 158.4 7.5e-38
NP_065854 (OMIM: 611967) kelch-like protein 8 isof ( 620)  728 157.7   1e-37
NP_001278932 (OMIM: 611967) kelch-like protein 8 i ( 620)  728 157.7   1e-37
XP_011529878 (OMIM: 605774) PREDICTED: kelch-like  ( 496)  716 155.3 4.6e-37
NP_001317953 (OMIM: 605774) kelch-like protein 2 i ( 496)  716 155.3 4.6e-37
NP_950240 (OMIM: 608064) kelch-like protein 5 isof ( 694)  711 154.3 1.2e-36
XP_005247612 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like  ( 600)  702 152.5 3.8e-36
XP_016862149 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like  ( 600)  702 152.5 3.8e-36
XP_016862148 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like  ( 600)  702 152.5 3.8e-36
XP_005247609 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like  ( 600)  702 152.5 3.8e-36
XP_005247610 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like  ( 600)  702 152.5 3.8e-36
XP_005247611 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like  ( 600)  702 152.5 3.8e-36
XP_005247613 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like  ( 600)  702 152.5 3.8e-36
XP_011511240 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like  ( 600)  702 152.5 3.8e-36
NP_060114 (OMIM: 611295) kelch-like protein 24 [Ho ( 600)  702 152.5 3.8e-36


>>NP_001243504 (OMIM: 605173) ectoderm-neural cortex pro  (589 aa)
 initn: 3249 init1: 3090 opt: 3090  Z-score: 3376.2  bits: 634.7 E(85289): 2.6e-181
Smith-Waterman score: 3090; 74.7% identity (91.2% similar) in 589 aa overlap (1-589:1-589)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MSVSVHETRKSRSSTGSMNVTLFHKASHPDCVLAHLNTLRKHCMFTDVTLWAGDRAFPCH
       :::::::.::::.:.::.:. ::::.:. : ::.::: ::.. .:::: : ::.:.::::
NP_001 MSVSVHENRKSRASSGSINIYLFHKSSYADSVLTHLNLLRQQRLFTDVLLHAGNRTFPCH
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB9 RAVLAASSRYFEAMFSHGLRESRDDTVNFQDNLHPEVLELLLDFAYSSRIAINEENAESL
       :::::: ::::::::: ::.::.:. :::....::::::::::.:::::. :::::::::
NP_001 RAVLAACSRYFEAMFSGGLKESQDSEVNFDNSIHPEVLELLLDYAYSSRVIINEENAESL
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB9 LEAGDMLQFHDVRDAAAEFLEKNLFPSNCLGMMLLSDAHQCRRLYEFSWRMCLVHFETVR
       :::::::.:.:.::: :::::::: :.:::::.:::::::: .:::.:::::: .:.:.:
NP_001 LEAGDMLEFQDIRDACAEFLEKNLHPTNCLGMLLLSDAHQCTKLYELSWRMCLSNFQTIR
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB9 QSEDFNSLSKDTLLDLISSDELETEDERVVFEAILQWVKHDLEPRKVHLPELLRSVRLAL
       ..::: .: .: ...:.::.::::::::.:.:. ..:...::. :  .:::::..:::::
NP_001 KNEDFLQLPQDMVVQLLSSEELETEDERLVYESAINWISYDLKKRYCYLPELLQTVRLAL
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB9 LPSDCLQEAVSSEALLMADERTKLIMDEALRCKTRILQNDGVVTSPCARPRKAGHTLLIL
       ::.  :.: :. : :.  ....: :..::.::: .:::::::::: ::::::.::.:..:
NP_001 LPAIYLMENVAMEELITKQRKSKEIVEEAIRCKLKILQNDGVVTSLCARPRKTGHALFLL
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB9 GGQTFMCDKIYQVDHKAKEIIPKADLPSPRKEFSASAIGCKVYVTGGRGSENGVSKDVWV
       :::::::::.: ::.::::::::::.::::::::: :::::::.::::::::::::::::
NP_001 GGQTFMCDKLYLVDQKAKEIIPKADIPSPRKEFSACAIGCKVYITGGRGSENGVSKDVWV
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB9 YDTVHEEWSKAAPMLIARFGHGSAELENCLYVVGGHTSLAGVFPASPSVSLKQVEKYDPG
       :::.:::::::::::.::::::::::..:::::::::. .: .::::::::::::.::: 
NP_001 YDTLHEEWSKAAPMLVARFGHGSAELKHCLYVVGGHTAATGCLPASPSVSLKQVEHYDPT
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB9 ANKWMMVAPLRDGVSNAAVVSAKLKLFVFGGTSIHRDMVSKVQCYDPSENRWTIKAECPQ
        ::: ::::::.:::::::::::::::.:::::. .: . ::::::  :::::. : :::
NP_001 INKWTMVAPLREGVSNAAVVSAKLKLFAFGGTSVSHDKLPKVQCYDQCENRWTVPATCPQ
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB9 PWRYTAAAVLGSQIFIMGGDTEFTAASAYRFDCETNQWTRIGDMTAKRMSCHALASGNKL
       :::::::::::.:::::::::::.: :::.:. :: :::..::.:::::::::.::::::
NP_001 PWRYTAAAVLGNQIFIMGGDTEFSACSAYKFNSETYQWTKVGDVTAKRMSCHAVASGNKL
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580         
pF1KB9 YVVGGYFGTQRCKTLDCYDPTSDTWNCITTVPYSLIPTAFVSTWKHLPA
       :::::::: :::::::::::: :.:: :::::::::::::::::::::.
NP_001 YVVGGYFGIQRCKTLDCYDPTLDVWNSITTVPYSLIPTAFVSTWKHLPS
              550       560       570       580         

>>XP_011541998 (OMIM: 605173) PREDICTED: ectoderm-neural  (589 aa)
 initn: 3249 init1: 3090 opt: 3090  Z-score: 3376.2  bits: 634.7 E(85289): 2.6e-181
Smith-Waterman score: 3090; 74.7% identity (91.2% similar) in 589 aa overlap (1-589:1-589)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MSVSVHETRKSRSSTGSMNVTLFHKASHPDCVLAHLNTLRKHCMFTDVTLWAGDRAFPCH
       :::::::.::::.:.::.:. ::::.:. : ::.::: ::.. .:::: : ::.:.::::
XP_011 MSVSVHENRKSRASSGSINIYLFHKSSYADSVLTHLNLLRQQRLFTDVLLHAGNRTFPCH
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB9 RAVLAASSRYFEAMFSHGLRESRDDTVNFQDNLHPEVLELLLDFAYSSRIAINEENAESL
       :::::: ::::::::: ::.::.:. :::....::::::::::.:::::. :::::::::
XP_011 RAVLAACSRYFEAMFSGGLKESQDSEVNFDNSIHPEVLELLLDYAYSSRVIINEENAESL
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB9 LEAGDMLQFHDVRDAAAEFLEKNLFPSNCLGMMLLSDAHQCRRLYEFSWRMCLVHFETVR
       :::::::.:.:.::: :::::::: :.:::::.:::::::: .:::.:::::: .:.:.:
XP_011 LEAGDMLEFQDIRDACAEFLEKNLHPTNCLGMLLLSDAHQCTKLYELSWRMCLSNFQTIR
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB9 QSEDFNSLSKDTLLDLISSDELETEDERVVFEAILQWVKHDLEPRKVHLPELLRSVRLAL
       ..::: .: .: ...:.::.::::::::.:.:. ..:...::. :  .:::::..:::::
XP_011 KNEDFLQLPQDMVVQLLSSEELETEDERLVYESAINWISYDLKKRYCYLPELLQTVRLAL
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB9 LPSDCLQEAVSSEALLMADERTKLIMDEALRCKTRILQNDGVVTSPCARPRKAGHTLLIL
       ::.  :.: :. : :.  ....: :..::.::: .:::::::::: ::::::.::.:..:
XP_011 LPAIYLMENVAMEELITKQRKSKEIVEEAIRCKLKILQNDGVVTSLCARPRKTGHALFLL
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB9 GGQTFMCDKIYQVDHKAKEIIPKADLPSPRKEFSASAIGCKVYVTGGRGSENGVSKDVWV
       :::::::::.: ::.::::::::::.::::::::: :::::::.::::::::::::::::
XP_011 GGQTFMCDKLYLVDQKAKEIIPKADIPSPRKEFSACAIGCKVYITGGRGSENGVSKDVWV
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB9 YDTVHEEWSKAAPMLIARFGHGSAELENCLYVVGGHTSLAGVFPASPSVSLKQVEKYDPG
       :::.:::::::::::.::::::::::..:::::::::. .: .::::::::::::.::: 
XP_011 YDTLHEEWSKAAPMLVARFGHGSAELKHCLYVVGGHTAATGCLPASPSVSLKQVEHYDPT
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB9 ANKWMMVAPLRDGVSNAAVVSAKLKLFVFGGTSIHRDMVSKVQCYDPSENRWTIKAECPQ
        ::: ::::::.:::::::::::::::.:::::. .: . ::::::  :::::. : :::
XP_011 INKWTMVAPLREGVSNAAVVSAKLKLFAFGGTSVSHDKLPKVQCYDQCENRWTVPATCPQ
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB9 PWRYTAAAVLGSQIFIMGGDTEFTAASAYRFDCETNQWTRIGDMTAKRMSCHALASGNKL
       :::::::::::.:::::::::::.: :::.:. :: :::..::.:::::::::.::::::
XP_011 PWRYTAAAVLGNQIFIMGGDTEFSACSAYKFNSETYQWTKVGDVTAKRMSCHAVASGNKL
              490       500       510       520       530       540

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pF1KB9 YVVGGYFGTQRCKTLDCYDPTSDTWNCITTVPYSLIPTAFVSTWKHLPA
       :::::::: :::::::::::: :.:: :::::::::::::::::::::.
XP_011 YVVGGYFGIQRCKTLDCYDPTLDVWNSITTVPYSLIPTAFVSTWKHLPS
              550       560       570       580         

>>XP_011541999 (OMIM: 605173) PREDICTED: ectoderm-neural  (589 aa)
 initn: 3249 init1: 3090 opt: 3090  Z-score: 3376.2  bits: 634.7 E(85289): 2.6e-181
Smith-Waterman score: 3090; 74.7% identity (91.2% similar) in 589 aa overlap (1-589:1-589)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MSVSVHETRKSRSSTGSMNVTLFHKASHPDCVLAHLNTLRKHCMFTDVTLWAGDRAFPCH
       :::::::.::::.:.::.:. ::::.:. : ::.::: ::.. .:::: : ::.:.::::
XP_011 MSVSVHENRKSRASSGSINIYLFHKSSYADSVLTHLNLLRQQRLFTDVLLHAGNRTFPCH
               10        20        30        40        50        60

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pF1KB9 RAVLAASSRYFEAMFSHGLRESRDDTVNFQDNLHPEVLELLLDFAYSSRIAINEENAESL
       :::::: ::::::::: ::.::.:. :::....::::::::::.:::::. :::::::::
XP_011 RAVLAACSRYFEAMFSGGLKESQDSEVNFDNSIHPEVLELLLDYAYSSRVIINEENAESL
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       :::::::.:.:.::: :::::::: :.:::::.:::::::: .:::.:::::: .:.:.:
XP_011 LEAGDMLEFQDIRDACAEFLEKNLHPTNCLGMLLLSDAHQCTKLYELSWRMCLSNFQTIR
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pF1KB9 QSEDFNSLSKDTLLDLISSDELETEDERVVFEAILQWVKHDLEPRKVHLPELLRSVRLAL
       ..::: .: .: ...:.::.::::::::.:.:. ..:...::. :  .:::::..:::::
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pF1KB9 LPSDCLQEAVSSEALLMADERTKLIMDEALRCKTRILQNDGVVTSPCARPRKAGHTLLIL
       ::.  :.: :. : :.  ....: :..::.::: .:::::::::: ::::::.::.:..:
XP_011 LPAIYLMENVAMEELITKQRKSKEIVEEAIRCKLKILQNDGVVTSLCARPRKTGHALFLL
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pF1KB9 GGQTFMCDKIYQVDHKAKEIIPKADLPSPRKEFSASAIGCKVYVTGGRGSENGVSKDVWV
       :::::::::.: ::.::::::::::.::::::::: :::::::.::::::::::::::::
XP_011 GGQTFMCDKLYLVDQKAKEIIPKADIPSPRKEFSACAIGCKVYITGGRGSENGVSKDVWV
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pF1KB9 YDTVHEEWSKAAPMLIARFGHGSAELENCLYVVGGHTSLAGVFPASPSVSLKQVEKYDPG
       :::.:::::::::::.::::::::::..:::::::::. .: .::::::::::::.::: 
XP_011 YDTLHEEWSKAAPMLVARFGHGSAELKHCLYVVGGHTAATGCLPASPSVSLKQVEHYDPT
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pF1KB9 ANKWMMVAPLRDGVSNAAVVSAKLKLFVFGGTSIHRDMVSKVQCYDPSENRWTIKAECPQ
        ::: ::::::.:::::::::::::::.:::::. .: . ::::::  :::::. : :::
XP_011 INKWTMVAPLREGVSNAAVVSAKLKLFAFGGTSVSHDKLPKVQCYDQCENRWTVPATCPQ
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pF1KB9 PWRYTAAAVLGSQIFIMGGDTEFTAASAYRFDCETNQWTRIGDMTAKRMSCHALASGNKL
       :::::::::::.:::::::::::.: :::.:. :: :::..::.:::::::::.::::::
XP_011 PWRYTAAAVLGNQIFIMGGDTEFSACSAYKFNSETYQWTKVGDVTAKRMSCHAVASGNKL
              490       500       510       520       530       540

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pF1KB9 YVVGGYFGTQRCKTLDCYDPTSDTWNCITTVPYSLIPTAFVSTWKHLPA
       :::::::: :::::::::::: :.:: :::::::::::::::::::::.
XP_011 YVVGGYFGIQRCKTLDCYDPTLDVWNSITTVPYSLIPTAFVSTWKHLPS
              550       560       570       580         

>>NP_003624 (OMIM: 605173) ectoderm-neural cortex protei  (589 aa)
 initn: 3249 init1: 3090 opt: 3090  Z-score: 3376.2  bits: 634.7 E(85289): 2.6e-181
Smith-Waterman score: 3090; 74.7% identity (91.2% similar) in 589 aa overlap (1-589:1-589)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MSVSVHETRKSRSSTGSMNVTLFHKASHPDCVLAHLNTLRKHCMFTDVTLWAGDRAFPCH
       :::::::.::::.:.::.:. ::::.:. : ::.::: ::.. .:::: : ::.:.::::
NP_003 MSVSVHENRKSRASSGSINIYLFHKSSYADSVLTHLNLLRQQRLFTDVLLHAGNRTFPCH
               10        20        30        40        50        60

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pF1KB9 RAVLAASSRYFEAMFSHGLRESRDDTVNFQDNLHPEVLELLLDFAYSSRIAINEENAESL
       :::::: ::::::::: ::.::.:. :::....::::::::::.:::::. :::::::::
NP_003 RAVLAACSRYFEAMFSGGLKESQDSEVNFDNSIHPEVLELLLDYAYSSRVIINEENAESL
               70        80        90       100       110       120

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pF1KB9 LEAGDMLQFHDVRDAAAEFLEKNLFPSNCLGMMLLSDAHQCRRLYEFSWRMCLVHFETVR
       :::::::.:.:.::: :::::::: :.:::::.:::::::: .:::.:::::: .:.:.:
NP_003 LEAGDMLEFQDIRDACAEFLEKNLHPTNCLGMLLLSDAHQCTKLYELSWRMCLSNFQTIR
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pF1KB9 QSEDFNSLSKDTLLDLISSDELETEDERVVFEAILQWVKHDLEPRKVHLPELLRSVRLAL
       ..::: .: .: ...:.::.::::::::.:.:. ..:...::. :  .:::::..:::::
NP_003 KNEDFLQLPQDMVVQLLSSEELETEDERLVYESAINWISYDLKKRYCYLPELLQTVRLAL
              190       200       210       220       230       240

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pF1KB9 LPSDCLQEAVSSEALLMADERTKLIMDEALRCKTRILQNDGVVTSPCARPRKAGHTLLIL
       ::.  :.: :. : :.  ....: :..::.::: .:::::::::: ::::::.::.:..:
NP_003 LPAIYLMENVAMEELITKQRKSKEIVEEAIRCKLKILQNDGVVTSLCARPRKTGHALFLL
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pF1KB9 GGQTFMCDKIYQVDHKAKEIIPKADLPSPRKEFSASAIGCKVYVTGGRGSENGVSKDVWV
       :::::::::.: ::.::::::::::.::::::::: :::::::.::::::::::::::::
NP_003 GGQTFMCDKLYLVDQKAKEIIPKADIPSPRKEFSACAIGCKVYITGGRGSENGVSKDVWV
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pF1KB9 YDTVHEEWSKAAPMLIARFGHGSAELENCLYVVGGHTSLAGVFPASPSVSLKQVEKYDPG
       :::.:::::::::::.::::::::::..:::::::::. .: .::::::::::::.::: 
NP_003 YDTLHEEWSKAAPMLVARFGHGSAELKHCLYVVGGHTAATGCLPASPSVSLKQVEHYDPT
              370       380       390       400       410       420

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pF1KB9 ANKWMMVAPLRDGVSNAAVVSAKLKLFVFGGTSIHRDMVSKVQCYDPSENRWTIKAECPQ
        ::: ::::::.:::::::::::::::.:::::. .: . ::::::  :::::. : :::
NP_003 INKWTMVAPLREGVSNAAVVSAKLKLFAFGGTSVSHDKLPKVQCYDQCENRWTVPATCPQ
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pF1KB9 PWRYTAAAVLGSQIFIMGGDTEFTAASAYRFDCETNQWTRIGDMTAKRMSCHALASGNKL
       :::::::::::.:::::::::::.: :::.:. :: :::..::.:::::::::.::::::
NP_003 PWRYTAAAVLGNQIFIMGGDTEFSACSAYKFNSETYQWTKVGDVTAKRMSCHAVASGNKL
              490       500       510       520       530       540

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pF1KB9 YVVGGYFGTQRCKTLDCYDPTSDTWNCITTVPYSLIPTAFVSTWKHLPA
       :::::::: :::::::::::: :.:: :::::::::::::::::::::.
NP_003 YVVGGYFGIQRCKTLDCYDPTLDVWNSITTVPYSLIPTAFVSTWKHLPS
              550       560       570       580         

>>NP_001243503 (OMIM: 605173) ectoderm-neural cortex pro  (589 aa)
 initn: 3249 init1: 3090 opt: 3090  Z-score: 3376.2  bits: 634.7 E(85289): 2.6e-181
Smith-Waterman score: 3090; 74.7% identity (91.2% similar) in 589 aa overlap (1-589:1-589)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MSVSVHETRKSRSSTGSMNVTLFHKASHPDCVLAHLNTLRKHCMFTDVTLWAGDRAFPCH
       :::::::.::::.:.::.:. ::::.:. : ::.::: ::.. .:::: : ::.:.::::
NP_001 MSVSVHENRKSRASSGSINIYLFHKSSYADSVLTHLNLLRQQRLFTDVLLHAGNRTFPCH
               10        20        30        40        50        60

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pF1KB9 RAVLAASSRYFEAMFSHGLRESRDDTVNFQDNLHPEVLELLLDFAYSSRIAINEENAESL
       :::::: ::::::::: ::.::.:. :::....::::::::::.:::::. :::::::::
NP_001 RAVLAACSRYFEAMFSGGLKESQDSEVNFDNSIHPEVLELLLDYAYSSRVIINEENAESL
               70        80        90       100       110       120

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pF1KB9 LEAGDMLQFHDVRDAAAEFLEKNLFPSNCLGMMLLSDAHQCRRLYEFSWRMCLVHFETVR
       :::::::.:.:.::: :::::::: :.:::::.:::::::: .:::.:::::: .:.:.:
NP_001 LEAGDMLEFQDIRDACAEFLEKNLHPTNCLGMLLLSDAHQCTKLYELSWRMCLSNFQTIR
              130       140       150       160       170       180

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pF1KB9 QSEDFNSLSKDTLLDLISSDELETEDERVVFEAILQWVKHDLEPRKVHLPELLRSVRLAL
       ..::: .: .: ...:.::.::::::::.:.:. ..:...::. :  .:::::..:::::
NP_001 KNEDFLQLPQDMVVQLLSSEELETEDERLVYESAINWISYDLKKRYCYLPELLQTVRLAL
              190       200       210       220       230       240

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pF1KB9 LPSDCLQEAVSSEALLMADERTKLIMDEALRCKTRILQNDGVVTSPCARPRKAGHTLLIL
       ::.  :.: :. : :.  ....: :..::.::: .:::::::::: ::::::.::.:..:
NP_001 LPAIYLMENVAMEELITKQRKSKEIVEEAIRCKLKILQNDGVVTSLCARPRKTGHALFLL
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pF1KB9 GGQTFMCDKIYQVDHKAKEIIPKADLPSPRKEFSASAIGCKVYVTGGRGSENGVSKDVWV
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NP_001 GGQTFMCDKLYLVDQKAKEIIPKADIPSPRKEFSACAIGCKVYITGGRGSENGVSKDVWV
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pF1KB9 YDTVHEEWSKAAPMLIARFGHGSAELENCLYVVGGHTSLAGVFPASPSVSLKQVEKYDPG
       :::.:::::::::::.::::::::::..:::::::::. .: .::::::::::::.::: 
NP_001 YDTLHEEWSKAAPMLVARFGHGSAELKHCLYVVGGHTAATGCLPASPSVSLKQVEHYDPT
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pF1KB9 ANKWMMVAPLRDGVSNAAVVSAKLKLFVFGGTSIHRDMVSKVQCYDPSENRWTIKAECPQ
        ::: ::::::.:::::::::::::::.:::::. .: . ::::::  :::::. : :::
NP_001 INKWTMVAPLREGVSNAAVVSAKLKLFAFGGTSVSHDKLPKVQCYDQCENRWTVPATCPQ
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pF1KB9 PWRYTAAAVLGSQIFIMGGDTEFTAASAYRFDCETNQWTRIGDMTAKRMSCHALASGNKL
       :::::::::::.:::::::::::.: :::.:. :: :::..::.:::::::::.::::::
NP_001 PWRYTAAAVLGNQIFIMGGDTEFSACSAYKFNSETYQWTKVGDVTAKRMSCHAVASGNKL
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580         
pF1KB9 YVVGGYFGTQRCKTLDCYDPTSDTWNCITTVPYSLIPTAFVSTWKHLPA
       :::::::: :::::::::::: :.:: :::::::::::::::::::::.
NP_001 YVVGGYFGIQRCKTLDCYDPTLDVWNSITTVPYSLIPTAFVSTWKHLPS
              550       560       570       580         

>>NP_001243505 (OMIM: 605173) ectoderm-neural cortex pro  (516 aa)
 initn: 2904 init1: 2742 opt: 2742  Z-score: 2997.2  bits: 564.4 E(85289): 3.3e-160
Smith-Waterman score: 2742; 75.2% identity (91.5% similar) in 516 aa overlap (74-589:1-516)

            50        60        70        80        90       100   
pF1KB9 MFTDVTLWAGDRAFPCHRAVLAASSRYFEAMFSHGLRESRDDTVNFQDNLHPEVLELLLD
                                     ::: ::.::.:. :::....::::::::::
NP_001                               MFSGGLKESQDSEVNFDNSIHPEVLELLLD
                                             10        20        30

           110       120       130       140       150       160   
pF1KB9 FAYSSRIAINEENAESLLEAGDMLQFHDVRDAAAEFLEKNLFPSNCLGMMLLSDAHQCRR
       .:::::. ::::::::::::::::.:.:.::: :::::::: :.:::::.:::::::: .
NP_001 YAYSSRVIINEENAESLLEAGDMLEFQDIRDACAEFLEKNLHPTNCLGMLLLSDAHQCTK
               40        50        60        70        80        90

           170       180       190       200       210       220   
pF1KB9 LYEFSWRMCLVHFETVRQSEDFNSLSKDTLLDLISSDELETEDERVVFEAILQWVKHDLE
       :::.:::::: .:.:.:..::: .: .: ...:.::.::::::::.:.:. ..:...::.
NP_001 LYELSWRMCLSNFQTIRKNEDFLQLPQDMVVQLLSSEELETEDERLVYESAINWISYDLK
              100       110       120       130       140       150

           230       240       250       260       270       280   
pF1KB9 PRKVHLPELLRSVRLALLPSDCLQEAVSSEALLMADERTKLIMDEALRCKTRILQNDGVV
        :  .:::::..:::::::.  :.: :. : :.  ....: :..::.::: .::::::::
NP_001 KRYCYLPELLQTVRLALLPAIYLMENVAMEELITKQRKSKEIVEEAIRCKLKILQNDGVV
              160       170       180       190       200       210

           290       300       310       320       330       340   
pF1KB9 TSPCARPRKAGHTLLILGGQTFMCDKIYQVDHKAKEIIPKADLPSPRKEFSASAIGCKVY
       :: ::::::.::.:..::::::::::.: ::.::::::::::.::::::::: :::::::
NP_001 TSLCARPRKTGHALFLLGGQTFMCDKLYLVDQKAKEIIPKADIPSPRKEFSACAIGCKVY
              220       230       240       250       260       270

           350       360       370       380       390       400   
pF1KB9 VTGGRGSENGVSKDVWVYDTVHEEWSKAAPMLIARFGHGSAELENCLYVVGGHTSLAGVF
       .:::::::::::::::::::.:::::::::::.::::::::::..:::::::::. .: .
NP_001 ITGGRGSENGVSKDVWVYDTLHEEWSKAAPMLVARFGHGSAELKHCLYVVGGHTAATGCL
              280       290       300       310       320       330

           410       420       430       440       450       460   
pF1KB9 PASPSVSLKQVEKYDPGANKWMMVAPLRDGVSNAAVVSAKLKLFVFGGTSIHRDMVSKVQ
       ::::::::::::.:::  ::: ::::::.:::::::::::::::.:::::. .: . :::
NP_001 PASPSVSLKQVEHYDPTINKWTMVAPLREGVSNAAVVSAKLKLFAFGGTSVSHDKLPKVQ
              340       350       360       370       380       390

           470       480       490       500       510       520   
pF1KB9 CYDPSENRWTIKAECPQPWRYTAAAVLGSQIFIMGGDTEFTAASAYRFDCETNQWTRIGD
       :::  :::::. : ::::::::::::::.:::::::::::.: :::.:. :: :::..::
NP_001 CYDQCENRWTVPATCPQPWRYTAAAVLGNQIFIMGGDTEFSACSAYKFNSETYQWTKVGD
              400       410       420       430       440       450

           530       540       550       560       570       580   
pF1KB9 MTAKRMSCHALASGNKLYVVGGYFGTQRCKTLDCYDPTSDTWNCITTVPYSLIPTAFVST
       .:::::::::.:::::::::::::: :::::::::::: :.:: ::::::::::::::::
NP_001 VTAKRMSCHAVASGNKLYVVGGYFGIQRCKTLDCYDPTLDVWNSITTVPYSLIPTAFVST
              460       470       480       490       500       510

             
pF1KB9 WKHLPA
       :::::.
NP_001 WKHLPS
             

>>NP_001244123 (OMIM: 605775,614495) kelch-like protein   (555 aa)
 initn: 815 init1: 446 opt: 928  Z-score: 1017.1  bits: 198.1 E(85289): 6.5e-50
Smith-Waterman score: 928; 32.5% identity (63.0% similar) in 541 aa overlap (36-570:8-537)

          10        20        30        40        50        60     
pF1KB9 HETRKSRSSTGSMNVTLFHKASHPDCVLAHLNTLRKHCMFTDVTLWAGDRAFPCHRAVLA
                                     .: ::.. .. :: . : :  .  ::.:::
NP_001                        MGKAFKVMNELRSKQLLCDVMIVAEDVEIEAHRVVLA
                                      10        20        30       

          70        80        90       100       110       120     
pF1KB9 ASSRYFEAMFSHGLRESRDDTVNFQDNLHPEVLELLLDFAYSSRIAINEENAESLLEAGD
       : : :: :::.  . ::.   ....: .  ..:  :.:. :...: ..:::.. :: :..
NP_001 ACSPYFCAMFTGDMSESKAKKIEIKD-VDGQTLSKLIDYIYTAEIEVTEENVQVLLPAAS
        40        50        60         70        80        90      

         130       140       150       160       170       180     
pF1KB9 MLQFHDVRDAAAEFLEKNLFPSNCLGMMLLSDAHQCRRLYEFSWRMCLVHFETVRQSEDF
       .::. :::.   .::...: :.::::.  ..:.: :  : . .  .   ::  :  .:.:
NP_001 LLQLMDVRQNCCDFLQSQLHPTNCLGIRAFADVHTCTDLLQQANAYAEQHFPEVMLGEEF
        100       110       120       130       140       150      

         190       200       210       220       230       240     
pF1KB9 NSLSKDTLLDLISSDELETEDERVVFEAILQWVKHDLEPRKVHLPELLRSVRLALLPSDC
        ::: : . .:::::.: . .:. ::::...:.... : :  :. .:.. ::: ::: : 
NP_001 LSLSLDQVCSLISSDKLTVSSEEKVFEAVISWINYEKETRLEHMAKLMEHVRLPLLPRDY
        160       170       180       190       200       210      

         250       260       270       280       290          300  
pF1KB9 LQEAVSSEALLMADERTKLIMDEALRCKTRILQNDGVVTSPCARPRKA---GHTLLILGG
       : ..:  :::.  ..  : .. ::.. .   :..  .. .: ..::      ......::
NP_001 LVQTVEEEALIKNNNTCKDFLIEAMKYHLLPLDQRLLIKNPRTKPRTPVSLPKVMIVVGG
        220       230       240       250       260       270      

             310       320       330       340       350       360 
pF1KB9 QTFMCDK-IYQVDHKAKEIIPKADLPSPRKEFSASAIGCKVYVTGGRGSENGVSKDVWVY
       :.    . .   : .  .    :.::: : . ..  .. .::..:: ..   : . : ::
NP_001 QAPKAIRSVECYDFEEDRWDQIAELPSRRCRAGVVFMAGHVYAVGGFNGSLRV-RTVDVY
        280       290       300       310       320        330     

             370       380       390       400       410       420 
pF1KB9 DTVHEEWSKAAPMLIARFGHGSAELENCLYVVGGHTSLAGVFPASPSVSLKQVEKYDPGA
       : :...:.. : :   :   :.: :.. ::.:::  . .:         : .:: :.  .
NP_001 DGVKDQWTSIASMQERRSTLGAAVLNDLLYAVGGFDGSTG---------LASVEAYSYKT
         340       350       360       370                380      

             430       440       450        460       470       480
pF1KB9 NKWMMVAPLRDGVSNAAVVSAKLKLFVFGG-TSIHRDMVSKVQCYDPSENRWTIKAECPQ
       :.:..:::.    :...:  .. ::.. ::  .  :. .: :. :.:. :.:   :.   
NP_001 NEWFFVAPMNTRRSSVGVGVVEGKLYAVGGYDGASRQCLSTVEQYNPATNEWIYVADMST
        390       400       410       420       430       440      

              490        500       510       520       530         
pF1KB9 PWRYTAAAVLGSQIFIMGG-DTEFTAASAYRFDCETNQWTRIGDMTAKRMSCHALASGNK
           ....::..:..  :: :  ..  :.  .:  :: : ...::.  : .  . : .. 
NP_001 RRSGAGVGVLSGQLYATGGHDGPLVRKSVEVYDPGTNTWKQVADMNMCRRNAGVCAVNGL
        450       460       470       480       490       500      

     540       550       560       570       580         
pF1KB9 LYVVGGYFGTQRCKTLDCYDPTSDTWNCITTVPYSLIPTAFVSTWKHLPA
       ::::::  :.    ... :.:..: :. . :                   
NP_001 LYVVGGDDGSCNLASVEYYNPVTDKWTLLPTNMSTGRSYAGVAVIHKSL 
        510       520       530       540       550      

>>NP_059111 (OMIM: 605775,614495) kelch-like protein 3 i  (587 aa)
 initn: 815 init1: 446 opt: 928  Z-score: 1016.7  bits: 198.1 E(85289): 6.8e-50
Smith-Waterman score: 928; 32.5% identity (63.0% similar) in 541 aa overlap (36-570:40-569)

          10        20        30        40        50        60     
pF1KB9 HETRKSRSSTGSMNVTLFHKASHPDCVLAHLNTLRKHCMFTDVTLWAGDRAFPCHRAVLA
                                     .: ::.. .. :: . : :  .  ::.:::
NP_059 SQTLIQAGDDEKNQRTITVNPAHMGKAFKVMNELRSKQLLCDVMIVAEDVEIEAHRVVLA
      10        20        30        40        50        60         

          70        80        90       100       110       120     
pF1KB9 ASSRYFEAMFSHGLRESRDDTVNFQDNLHPEVLELLLDFAYSSRIAINEENAESLLEAGD
       : : :: :::.  . ::.   ....: .  ..:  :.:. :...: ..:::.. :: :..
NP_059 ACSPYFCAMFTGDMSESKAKKIEIKD-VDGQTLSKLIDYIYTAEIEVTEENVQVLLPAAS
      70        80        90        100       110       120        

         130       140       150       160       170       180     
pF1KB9 MLQFHDVRDAAAEFLEKNLFPSNCLGMMLLSDAHQCRRLYEFSWRMCLVHFETVRQSEDF
       .::. :::.   .::...: :.::::.  ..:.: :  : . .  .   ::  :  .:.:
NP_059 LLQLMDVRQNCCDFLQSQLHPTNCLGIRAFADVHTCTDLLQQANAYAEQHFPEVMLGEEF
      130       140       150       160       170       180        

         190       200       210       220       230       240     
pF1KB9 NSLSKDTLLDLISSDELETEDERVVFEAILQWVKHDLEPRKVHLPELLRSVRLALLPSDC
        ::: : . .:::::.: . .:. ::::...:.... : :  :. .:.. ::: ::: : 
NP_059 LSLSLDQVCSLISSDKLTVSSEEKVFEAVISWINYEKETRLEHMAKLMEHVRLPLLPRDY
      190       200       210       220       230       240        

         250       260       270       280       290          300  
pF1KB9 LQEAVSSEALLMADERTKLIMDEALRCKTRILQNDGVVTSPCARPRKA---GHTLLILGG
       : ..:  :::.  ..  : .. ::.. .   :..  .. .: ..::      ......::
NP_059 LVQTVEEEALIKNNNTCKDFLIEAMKYHLLPLDQRLLIKNPRTKPRTPVSLPKVMIVVGG
      250       260       270       280       290       300        

             310       320       330       340       350       360 
pF1KB9 QTFMCDK-IYQVDHKAKEIIPKADLPSPRKEFSASAIGCKVYVTGGRGSENGVSKDVWVY
       :.    . .   : .  .    :.::: : . ..  .. .::..:: ..   : . : ::
NP_059 QAPKAIRSVECYDFEEDRWDQIAELPSRRCRAGVVFMAGHVYAVGGFNGSLRV-RTVDVY
      310       320       330       340       350       360        

             370       380       390       400       410       420 
pF1KB9 DTVHEEWSKAAPMLIARFGHGSAELENCLYVVGGHTSLAGVFPASPSVSLKQVEKYDPGA
       : :...:.. : :   :   :.: :.. ::.:::  . .:         : .:: :.  .
NP_059 DGVKDQWTSIASMQERRSTLGAAVLNDLLYAVGGFDGSTG---------LASVEAYSYKT
       370       380       390       400                410        

             430       440       450        460       470       480
pF1KB9 NKWMMVAPLRDGVSNAAVVSAKLKLFVFGG-TSIHRDMVSKVQCYDPSENRWTIKAECPQ
       :.:..:::.    :...:  .. ::.. ::  .  :. .: :. :.:. :.:   :.   
NP_059 NEWFFVAPMNTRRSSVGVGVVEGKLYAVGGYDGASRQCLSTVEQYNPATNEWIYVADMST
      420       430       440       450       460       470        

              490        500       510       520       530         
pF1KB9 PWRYTAAAVLGSQIFIMGG-DTEFTAASAYRFDCETNQWTRIGDMTAKRMSCHALASGNK
           ....::..:..  :: :  ..  :.  .:  :: : ...::.  : .  . : .. 
NP_059 RRSGAGVGVLSGQLYATGGHDGPLVRKSVEVYDPGTNTWKQVADMNMCRRNAGVCAVNGL
      480       490       500       510       520       530        

     540       550       560       570       580         
pF1KB9 LYVVGGYFGTQRCKTLDCYDPTSDTWNCITTVPYSLIPTAFVSTWKHLPA
       ::::::  :.    ... :.:..: :. . :                   
NP_059 LYVVGGDDGSCNLASVEYYNPVTDKWTLLPTNMSTGRSYAGVAVIHKSL 
      540       550       560       570       580        

>>NP_067646 (OMIM: 614522) kelch-like protein 12 isoform  (568 aa)
 initn: 961 init1: 401 opt: 910  Z-score: 997.3  bits: 194.5 E(85289): 8.2e-49
Smith-Waterman score: 910; 31.2% identity (63.2% similar) in 555 aa overlap (27-571:14-553)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MSVSVHETRKSRSSTGSMNVTLFHKASHPDCVLAHLNTLRKHCMFTDVTLWAGDRAFPCH
                                 .:   .:  .:.:::   . :::: . .. :: :
NP_067              MGGIMAPKDIMTNTHAKSILNSMNSLRKSNTLCDVTLRVEQKDFPAH
                            10        20        30        40       

               70        80        90       100       110       120
pF1KB9 RAVLAASSRYFEAMFSHGLRESRDDTVNFQDNLHPEVLELLLDFAYSSRIAINEENAESL
       : :::: : :: :::.  : :.    :..: .:   ..:.::::.:.  . .. ::.. :
NP_067 RIVLAACSDYFCAMFTSELSEKGKPYVDIQ-GLTASTMEILLDFVYTETVHVTVENVQEL
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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