Result of SIM4 for pF1KB6259

seq1 = pF1KB6259.tfa, 2292 bp
seq2 = pF1KB6259/gi568815591r_107667577.tfa (gi568815591r:107667577_107894509), 226933 bp

>pF1KB6259 2292
>gi568815591r:107667577_107894509 (Chr7)

(complement)

1-131  (100001-100131)   100% ->
132-271  (100629-100768)   100% ->
272-382  (102570-102680)   100% ->
383-570  (103275-103462)   100% ->
571-735  (104822-104986)   100% ->
736-888  (107001-107153)   100% ->
889-971  (107601-107683)   100% ->
972-1119  (111158-111305)   100% ->
1120-1233  (111417-111530)   100% ->
1234-1311  (111636-111713)   100% ->
1312-1407  (114747-114842)   100% ->
1408-1514  (116229-116335)   100% ->
1515-1584  (117804-117873)   100% ->
1585-1677  (117966-118058)   100% ->
1678-1773  (119638-119733)   100% ->
1774-2007  (120357-120590)   99% ->
2008-2062  (122402-122456)   100% ->
2063-2205  (126602-126744)   100% ->
2206-2271  (126866-126931)   100% ->
2272-2292  (128632-128652)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGATTGAACCCTTTGGGAATCAGTATATTGTGGCCAGGCCAGTGTATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGATTGAACCCTTTGGGAATCAGTATATTGTGGCCAGGCCAGTGTATTC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TACAAATGCTTTTGAGGAAAATCATAAAAAGACAGGAAGACATCATAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TACAAATGCTTTTGAGGAAAATCATAAAAAGACAGGAAGACATCATAAGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CATTTCTGGATCATCTCAAAGTGTGTTGTAG         CTGTTCCCCA
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 100101 CATTTCTGGATCATCTCAAAGTGTGTTGTAGGTA...CAGCTGTTCCCCA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CAAAAGGCCAAGAGAATTGTCCTCTCTTTGTTCCCCATAGCATCTTGGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100639 CAAAAGGCCAAGAGAATTGTCCTCTCTTTGTTCCCCATAGCATCTTGGTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GCCAGCATACCGGCTTAAAGAATGGTTGCTCAGTGATATTGTTTCTGGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100689 GCCAGCATACCGGCTTAAAGAATGGTTGCTCAGTGATATTGTTTCTGGTA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TCAGCACAGGGATTGTGGCCGTACTACAAG         GTTTAGCATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 100739 TCAGCACAGGGATTGTGGCCGTACTACAAGGTA...CAGGTTTAGCATTT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GCTCTGCTGGTCGACATTCCCCCAGTCTATGGGTTGTATGCATCCTTTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102581 GCTCTGCTGGTCGACATTCCCCCAGTCTATGGGTTGTATGCATCCTTTTT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CCCAGCCATAATCTACCTTTTCTTCGGCACTTCCAGACACATATCCGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102631 CCCAGCCATAATCTACCTTTTCTTCGGCACTTCCAGACACATATCCGTGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383          GTCCGTTTCCGATTCTGAGTATGATGGTGGGACTAGCAGTT
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102681 GTA...TAGGTCCGTTTCCGATTCTGAGTATGATGGTGGGACTAGCAGTT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 TCAGGAGCAGTTTCAAAAGCAGTCCCAGATCGCAATGCAACTACTTTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103316 TCAGGAGCAGTTTCAAAAGCAGTCCCAGATCGCAATGCAACTACTTTGGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 ATTGCCTAACAACTCGAATAATTCTTCACTACTGGATGACGAGAGGGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103366 ATTGCCTAACAACTCGAATAATTCTTCACTACTGGATGACGAGAGGGTGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 GGGTGGCGGCGGCGGCATCAGTCACAGTGCTTTCTGGAATCATCCAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 103416 GGGTGGCGGCGGCGGCATCAGTCACAGTGCTTTCTGGAATCATCCAGGTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    571       TTGGCTTTTGGGATTCTGCGGATTGGATTTGTAGTGATATACCT
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103466 ...CAGTTGGCTTTTGGGATTCTGCGGATTGGATTTGTAGTGATATACCT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 GTCTGAGTCCCTCATCAGTGGCTTCACTACTGCTGCTGCTGTTCATGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104866 GTCTGAGTCCCTCATCAGTGGCTTCACTACTGCTGCTGCTGTTCATGTTT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 TGGTTTCCCAACTCAAATTCATTTTTCAGTTGACAGTCCCGTCACACACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104916 TGGTTTCCCAACTCAAATTCATTTTTCAGTTGACAGTCCCGTCACACACT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 GATCCAGTTTCAATTTTCAAA         GTACTATACTCTGTATTCTC
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 104966 GATCCAGTTTCAATTTTCAAAGTA...TAGGTACTATACTCTGTATTCTC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 ACAAATAGAGAAGACTAATATTGCAGACCTGGTGACAGCTCTGATTGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107021 ACAAATAGAGAAGACTAATATTGCAGACCTGGTGACAGCTCTGATTGTCC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 TTTTGGTTGTATCCATTGTTAAAGAAATAAATCAGCGCTTCAAAGACAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107071 TTTTGGTTGTATCCATTGTTAAAGAAATAAATCAGCGCTTCAAAGACAAA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 CTTCCAGTGCCCATTCCAATCGAATTCATTATG         ACCGTGAT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 107121 CTTCCAGTGCCCATTCCAATCGAATTCATTATGGTA...CAGACCGTGAT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 TGCAGCAGGTGTATCCTACGGCTGTGACTTTAAAAACAGGTTTAAAGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107609 TGCAGCAGGTGTATCCTACGGCTGTGACTTTAAAAACAGGTTTAAAGTGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 CTGTGGTTGGGGACATGAATCCTGG         ATTTCAGCCCCCTATT
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 107659 CTGTGGTTGGGGACATGAATCCTGGGTA...TAGATTTCAGCCCCCTATT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 ACACCTGACGTGGAGACTTTCCAAAACACCGTAGGAGATTGCTTCGGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111174 ACACCTGACGTGGAGACTTTCCAAAACACCGTAGGAGATTGCTTCGGCAT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 CGCAATGGTTGCATTTGCAGTGGCCTTTTCAGTTGCCAGCGTCTATTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111224 CGCAATGGTTGCATTTGCAGTGGCCTTTTCAGTTGCCAGCGTCTATTCCC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 TCAAATACGATTATCCACTTGATGGCAATCAG         GAGTTAATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 111274 TCAAATACGATTATCCACTTGATGGCAATCAGGTA...CAGGAGTTAATA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 GCCTTGGGACTGGGTAACATAGTCTGTGGAGTATTCAGAGGATTTGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111426 GCCTTGGGACTGGGTAACATAGTCTGTGGAGTATTCAGAGGATTTGCTGG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1179 GAGTACTGCCCTCTCCAGATCAGCAGTTCAGGAGAGCACAGGAGGCAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111476 GAGTACTGCCCTCTCCAGATCAGCAGTTCAGGAGAGCACAGGAGGCAAAA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229 CACAG         ATTGCTGGGCTTATTGGTGCCATCATCGTGCTGATT
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111526 CACAGGTA...CAGATTGCTGGGCTTATTGGTGCCATCATCGTGCTGATT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1270 GTCGTTCTAGCCATTGGATTTCTCCTGGCGCCTCTACAAAAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 111672 GTCGTTCTAGCCATTGGATTTCTCCTGGCGCCTCTACAAAAGGTA...CA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1312  TCCGTCCTGGCAGCTTTAGCATTGGGAAACTTAAAGGGAATGCTGATGC
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114746 GTCCGTCCTGGCAGCTTTAGCATTGGGAAACTTAAAGGGAATGCTGATGC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1361 AGTTTGCTGAAATAGGCAGATTGTGGCGAAAGGACAAATATGATTGT   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 114796 AGTTTGCTGAAATAGGCAGATTGTGGCGAAAGGACAAATATGATTGTGTA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1408       TTAATTTGGATCATGACCTTCATCTTCACCATTGTCCTGGGACT
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114846 ...CAGTTAATTTGGATCATGACCTTCATCTTCACCATTGTCCTGGGACT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1452 CGGGTTAGGCCTGGCAGCTAGTGTGGCATTTCAACTGCTAACCATCGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116273 CGGGTTAGGCCTGGCAGCTAGTGTGGCATTTCAACTGCTAACCATCGTGT

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1502 TCAGGACCCAATT         TCCAAAATGCAGCACGCTGGCTAATATT
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 116323 TCAGGACCCAATTGTG...CAGTCCAAAATGCAGCACGCTGGCTAATATT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1543 GGAAGAACCAACATCTATAAGAATAAAAAAGATTATTATGAT        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 117832 GGAAGAACCAACATCTATAAGAATAAAAAAGATTATTATGATGTA...CA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1585  ATGTATGAGCCAGAAGGAGTGAAAATTTTCAGATGTCCATCTCCTATCT
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117965 GATGTATGAGCCAGAAGGAGTGAAAATTTTCAGATGTCCATCTCCTATCT

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1634 ACTTTGCAAACATTGGTTTCTTTAGGCGGAAACTTATCGATGCT      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 118015 ACTTTGCAAACATTGGTTTCTTTAGGCGGAAACTTATCGATGCTGTA...

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1678    GTTGGCTTTAGTCCACTTCGAATTCTACGCAAGCGCAACAAAGCTTT
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119635 CAGGTTGGCTTTAGTCCACTTCGAATTCTACGCAAGCGCAACAAAGCTTT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1725 GAGGAAAATCCGAAAACTGCAGAAGCAAGGCTTGCTACAAGTGACACCA 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 119685 GAGGAAAATCCGAAAACTGCAGAAGCAAGGCTTGCTACAAGTGACACCAG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1774         AAAGGATTTATATGTACTGTTGACACCATAAAAGATTCTGAC
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119735 TA...CAGAAAGGATTTATATGTACTGTTGACACCATAAAAGATTCTGAC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1816 GAAGAGCTGGACAACAATCAGATAGAAGTACTGGACCAGCCAATCAATAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120399 GAAGAGCTGGACAACAATCAGATAGAAGTACTGGACCAGCCAATCAATAC

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1866 CACAGACCTGCCTTTCCACATTGACTGGAATGATGATCTTCCTCTCAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120449 CACAGACCTGCCTTTCCACATTGACTGGAATGATGATCTTCCTCTCAACA

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1916 TTGAGGTCCCCAAAATCAGCCTCCACAGCCTCATTCTCGACTTTTCAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
 120499 TTGAGGTCCCCAAAATCAGCCTCCACAGCCTCATTCTTGACTTTTCAGCA

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1966 GTGTCCTTTCTTGATGTTTCTTCAGTGAGGGGCCTTAAATCG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 120549 GTGTCCTTTCTTGATGTTTCTTCAGTGAGGGGCCTTAAATCGGTA...CA

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2008  ATTTTGCAAGAATTTATCAGGATCAAGGTAGATGTGTATATCGTTGGAA
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122401 GATTTTGCAAGAATTTATCAGGATCAAGGTAGATGTGTATATCGTTGGAA

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2057 CTGATG         ATGACTTCATTGAGAAGCTTAACCGGTATGAATTT
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122451 CTGATGGTA...CAGATGACTTCATTGAGAAGCTTAACCGGTATGAATTT

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2098 TTTGATGGTGAAGTGAAAAGCTCAATATTTTTCTTAACAATCCATGATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126637 TTTGATGGTGAAGTGAAAAGCTCAATATTTTTCTTAACAATCCATGATGC

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2148 TGTTTTGCATATTTTGATGAAGAAAGATTACAGTACTTCAAAGTTTAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126687 TGTTTTGCATATTTTGATGAAGAAAGATTACAGTACTTCAAAGTTTAATC

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2198 CCAGTCAG         GAAAAAGATGGAAAAATTGATTTTACCATAAAT
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 126737 CCAGTCAGGTA...CAGGAAAAAGATGGAAAAATTGATTTTACCATAAAT

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2239 ACAAATGGAGGATTACGTAATCGGGTATATGAG         GTGCCAGT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 126899 ACAAATGGAGGATTACGTAATCGGGTATATGAGGTA...CAGGTGCCAGT

   2450     .    :
   2280 TGAAACAAAATTC
        |||||||||||||
 128640 TGAAACAAAATTC

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