Result of FASTA (ccds) for pF1KB3472
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB3472, 783 aa
  1>>>pF1KB3472 783 - 783 aa - 783 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.6244+/-0.00135; mu= 1.6126+/- 0.081
 mean_var=275.1613+/-54.609, 0's: 0 Z-trim(108.5): 75  B-trim: 14 in 1/52
 Lambda= 0.077318
 statistics sampled from 10218 (10278) to 10218 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.653), E-opt: 0.2 (0.316), width:  16
 Scan time:  3.720

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS31211.1 DDX21 gene_id:9188|Hs108|chr10         ( 783) 5128 586.4  6e-167
CCDS73144.1 DDX21 gene_id:9188|Hs108|chr10         ( 715) 4703 539.0  1e-152
CCDS7283.1 DDX50 gene_id:79009|Hs108|chr10         ( 737) 2676 312.9 1.2e-84
CCDS33646.1 DDX17 gene_id:10521|Hs108|chr22        ( 729)  732 96.0 2.3e-19
CCDS46706.1 DDX17 gene_id:10521|Hs108|chr22        ( 731)  732 96.0 2.3e-19
CCDS82190.1 DDX5 gene_id:1655|Hs108|chr17          ( 614)  725 95.2 3.5e-19
CCDS11659.1 DDX5 gene_id:1655|Hs108|chr17          ( 614)  725 95.2 3.5e-19
CCDS54855.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5          ( 575)  696 91.9 3.1e-18
CCDS47208.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5          ( 690)  696 92.0 3.6e-18
CCDS54854.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5          ( 704)  696 92.0 3.7e-18
CCDS3969.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5           ( 724)  696 92.0 3.7e-18
CCDS34240.1 DDX46 gene_id:9879|Hs108|chr5          (1031)  694 91.9 5.7e-18
CCDS75306.1 DDX46 gene_id:9879|Hs108|chr5          (1032)  694 91.9 5.7e-18
CCDS4977.1 DDX43 gene_id:55510|Hs108|chr6          ( 648)  686 90.8 7.5e-18
CCDS35214.1 DDX53 gene_id:168400|Hs108|chrX        ( 631)  661 88.0 5.1e-17
CCDS2120.1 DDX18 gene_id:8886|Hs108|chr2           ( 670)  650 86.8 1.2e-16
CCDS8342.1 DDX10 gene_id:1662|Hs108|chr11          ( 875)  632 84.9 6.1e-16
CCDS32704.1 DDX42 gene_id:11325|Hs108|chr17        ( 938)  629 84.6 8.1e-16
CCDS13416.1 DDX27 gene_id:55661|Hs108|chr20        ( 796)  618 83.3 1.7e-15
CCDS11767.1 EIF4A3 gene_id:9775|Hs108|chr17        ( 411)  591 80.1 8.2e-15
CCDS31907.1 DDX54 gene_id:79039|Hs108|chr12        ( 881)  596 80.9 9.9e-15
CCDS44984.1 DDX54 gene_id:79039|Hs108|chr12        ( 882)  596 80.9 9.9e-15
CCDS55404.1 DDX3X gene_id:1654|Hs108|chrX          ( 646)  566 77.5   8e-14
CCDS14782.1 DDX3Y gene_id:8653|Hs108|chrY          ( 660)  566 77.5 8.1e-14
CCDS43931.1 DDX3X gene_id:1654|Hs108|chrX          ( 662)  566 77.5 8.1e-14
CCDS11113.1 EIF4A1 gene_id:1973|Hs108|chr17        ( 406)  543 74.7 3.3e-13
CCDS3282.1 EIF4A2 gene_id:1974|Hs108|chr3          ( 407)  536 73.9 5.7e-13
CCDS30964.1 DDX59 gene_id:83479|Hs108|chr1         ( 619)  534 73.9 9.2e-13
CCDS842.1 DDX20 gene_id:11218|Hs108|chr1           ( 824)  526 73.1 2.1e-12
CCDS12390.1 DDX49 gene_id:54555|Hs108|chr19        ( 483)  504 70.4 7.7e-12
CCDS9251.1 DDX55 gene_id:57696|Hs108|chr12         ( 600)  504 70.5 9.1e-12
CCDS4427.1 DDX41 gene_id:51428|Hs108|chr5          ( 622)  484 68.3 4.4e-11
CCDS11323.1 DDX52 gene_id:11056|Hs108|chr17        ( 599)  479 67.7 6.3e-11


>>CCDS31211.1 DDX21 gene_id:9188|Hs108|chr10              (783 aa)
 initn: 5128 init1: 5128 opt: 5128  Z-score: 3110.8  bits: 586.4 E(32554): 6e-167
Smith-Waterman score: 5128; 100.0% identity (100.0% similar) in 783 aa overlap (1-783:1-783)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB3 MPGKLRSDAGLESDTAMKKGETLRKQTEEKEKKEKPKSDKTEEIAEEEETVFPKAKQVKK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MPGKLRSDAGLESDTAMKKGETLRKQTEEKEKKEKPKSDKTEEIAEEEETVFPKAKQVKK
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB3 KAEPSEVDMNSPKSKKAKKKEEPSQNDISPKTKSLRKKKEPIEKKVVSSKTKKVTKNEEP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 KAEPSEVDMNSPKSKKAKKKEEPSQNDISPKTKSLRKKKEPIEKKVVSSKTKKVTKNEEP
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB3 SEEEIDAPKPKKMKKEKEMNGETREKSPKLKNGFPHPEPDCNPSEAASEESNSEIEQEIP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 SEEEIDAPKPKKMKKEKEMNGETREKSPKLKNGFPHPEPDCNPSEAASEESNSEIEQEIP
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB3 VEQKEGAFSNFPISEETIKLLKGRGVTFLFPIQAKTFHHVYSGKDLIAQARTGTGKTFSF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 VEQKEGAFSNFPISEETIKLLKGRGVTFLFPIQAKTFHHVYSGKDLIAQARTGTGKTFSF
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB3 AIPLIEKLHGELQDRKRGRAPQVLVLAPTRELANQVSKDFSDITKKLSVACFYGGTPYGG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 AIPLIEKLHGELQDRKRGRAPQVLVLAPTRELANQVSKDFSDITKKLSVACFYGGTPYGG
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB3 QFERMRNGIDILVGTPGRIKDHIQNGKLDLTKLKHVVLDEVDQMLDMGFADQVEEILSVA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 QFERMRNGIDILVGTPGRIKDHIQNGKLDLTKLKHVVLDEVDQMLDMGFADQVEEILSVA
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB3 YKKDSEDNPQTLLFSATCPHWVFNVAKKYMKSTYEQVDLIGKKTQKTAITVEHLAIKCHW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 YKKDSEDNPQTLLFSATCPHWVFNVAKKYMKSTYEQVDLIGKKTQKTAITVEHLAIKCHW
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB3 TQRAAVIGDVIRVYSGHQGRTIIFCETKKEAQELSQNSAIKQDAQSLHGDIPQKQREITL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 TQRAAVIGDVIRVYSGHQGRTIIFCETKKEAQELSQNSAIKQDAQSLHGDIPQKQREITL
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB3 KGFRNGSFGVLVATNVAARGLDIPEVDLVIQSSPPKDVESYIHRSGRTGRAGRTGVCICF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 KGFRNGSFGVLVATNVAARGLDIPEVDLVIQSSPPKDVESYIHRSGRTGRAGRTGVCICF
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB3 YQHKEEYQLVQVEQKAGIKFKRIGVPSATEIIKASSKDAIRLLDSVPPTAISHFKQSAEK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 YQHKEEYQLVQVEQKAGIKFKRIGVPSATEIIKASSKDAIRLLDSVPPTAISHFKQSAEK
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB3 LIEEKGAVEALAAALAHISGATSVDQRSLINSNVGFVTMILQCSIEMPNISYAWKELKEQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LIEEKGAVEALAAALAHISGATSVDQRSLINSNVGFVTMILQCSIEMPNISYAWKELKEQ
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB3 LGEEIDSKVKGMVFLKGKLGVCFDVPTASVTEIQEKWHDSRRWQLSVATEQPELEGPREG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LGEEIDSKVKGMVFLKGKLGVCFDVPTASVTEIQEKWHDSRRWQLSVATEQPELEGPREG
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KB3 YGGFRGQREGSRGFRGQRDGNRRFRGQREGSRGPRGQRSGGGNKSNRSQNKGQKRSFSKA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 YGGFRGQREGSRGFRGQRDGNRRFRGQREGSRGPRGQRSGGGNKSNRSQNKGQKRSFSKA
              730       740       750       760       770       780

          
pF1KB3 FGQ
       :::
CCDS31 FGQ
          

>>CCDS73144.1 DDX21 gene_id:9188|Hs108|chr10              (715 aa)
 initn: 4703 init1: 4703 opt: 4703  Z-score: 2855.1  bits: 539.0 E(32554): 1e-152
Smith-Waterman score: 4703; 100.0% identity (100.0% similar) in 715 aa overlap (69-783:1-715)

       40        50        60        70        80        90        
pF1KB3 DKTEEIAEEEETVFPKAKQVKKKAEPSEVDMNSPKSKKAKKKEEPSQNDISPKTKSLRKK
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73                               MNSPKSKKAKKKEEPSQNDISPKTKSLRKK
                                             10        20        30

      100       110       120       130       140       150        
pF1KB3 KEPIEKKVVSSKTKKVTKNEEPSEEEIDAPKPKKMKKEKEMNGETREKSPKLKNGFPHPE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 KEPIEKKVVSSKTKKVTKNEEPSEEEIDAPKPKKMKKEKEMNGETREKSPKLKNGFPHPE
               40        50        60        70        80        90

      160       170       180       190       200       210        
pF1KB3 PDCNPSEAASEESNSEIEQEIPVEQKEGAFSNFPISEETIKLLKGRGVTFLFPIQAKTFH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 PDCNPSEAASEESNSEIEQEIPVEQKEGAFSNFPISEETIKLLKGRGVTFLFPIQAKTFH
              100       110       120       130       140       150

      220       230       240       250       260       270        
pF1KB3 HVYSGKDLIAQARTGTGKTFSFAIPLIEKLHGELQDRKRGRAPQVLVLAPTRELANQVSK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 HVYSGKDLIAQARTGTGKTFSFAIPLIEKLHGELQDRKRGRAPQVLVLAPTRELANQVSK
              160       170       180       190       200       210

      280       290       300       310       320       330        
pF1KB3 DFSDITKKLSVACFYGGTPYGGQFERMRNGIDILVGTPGRIKDHIQNGKLDLTKLKHVVL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 DFSDITKKLSVACFYGGTPYGGQFERMRNGIDILVGTPGRIKDHIQNGKLDLTKLKHVVL
              220       230       240       250       260       270

      340       350       360       370       380       390        
pF1KB3 DEVDQMLDMGFADQVEEILSVAYKKDSEDNPQTLLFSATCPHWVFNVAKKYMKSTYEQVD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 DEVDQMLDMGFADQVEEILSVAYKKDSEDNPQTLLFSATCPHWVFNVAKKYMKSTYEQVD
              280       290       300       310       320       330

      400       410       420       430       440       450        
pF1KB3 LIGKKTQKTAITVEHLAIKCHWTQRAAVIGDVIRVYSGHQGRTIIFCETKKEAQELSQNS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 LIGKKTQKTAITVEHLAIKCHWTQRAAVIGDVIRVYSGHQGRTIIFCETKKEAQELSQNS
              340       350       360       370       380       390

      460       470       480       490       500       510        
pF1KB3 AIKQDAQSLHGDIPQKQREITLKGFRNGSFGVLVATNVAARGLDIPEVDLVIQSSPPKDV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 AIKQDAQSLHGDIPQKQREITLKGFRNGSFGVLVATNVAARGLDIPEVDLVIQSSPPKDV
              400       410       420       430       440       450

      520       530       540       550       560       570        
pF1KB3 ESYIHRSGRTGRAGRTGVCICFYQHKEEYQLVQVEQKAGIKFKRIGVPSATEIIKASSKD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 ESYIHRSGRTGRAGRTGVCICFYQHKEEYQLVQVEQKAGIKFKRIGVPSATEIIKASSKD
              460       470       480       490       500       510

      580       590       600       610       620       630        
pF1KB3 AIRLLDSVPPTAISHFKQSAEKLIEEKGAVEALAAALAHISGATSVDQRSLINSNVGFVT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 AIRLLDSVPPTAISHFKQSAEKLIEEKGAVEALAAALAHISGATSVDQRSLINSNVGFVT
              520       530       540       550       560       570

      640       650       660       670       680       690        
pF1KB3 MILQCSIEMPNISYAWKELKEQLGEEIDSKVKGMVFLKGKLGVCFDVPTASVTEIQEKWH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 MILQCSIEMPNISYAWKELKEQLGEEIDSKVKGMVFLKGKLGVCFDVPTASVTEIQEKWH
              580       590       600       610       620       630

      700       710       720       730       740       750        
pF1KB3 DSRRWQLSVATEQPELEGPREGYGGFRGQREGSRGFRGQRDGNRRFRGQREGSRGPRGQR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 DSRRWQLSVATEQPELEGPREGYGGFRGQREGSRGFRGQRDGNRRFRGQREGSRGPRGQR
              640       650       660       670       680       690

      760       770       780   
pF1KB3 SGGGNKSNRSQNKGQKRSFSKAFGQ
       :::::::::::::::::::::::::
CCDS73 SGGGNKSNRSQNKGQKRSFSKAFGQ
              700       710     

>>CCDS7283.1 DDX50 gene_id:79009|Hs108|chr10              (737 aa)
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Smith-Waterman score: 2735; 60.7% identity (79.9% similar) in 727 aa overlap (82-777:18-736)

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pF1KB3 FPKAKQVKKKAEPSEVDMNSPKSKKAKKKEEPSQNDISPKTKSLRKKKEPIEKKVVSSKT
                                     : :... . . :: :.:.    ..  .:  
CCDS72              MPGKLLWGDIMELEAPLEESESQKKERQKSDRRKS----RHHYDSDE
                            10        20        30            40   

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pF1KB3 KKVTKNEEPSEEEIDAPKPKKMKKEKEMNGETREKSPKLKNGFPH---------PEPDCN
       :. :. :.   ...:::: :: : ....::.:.:   .:.. : .         :. : .
CCDS72 KSETR-ENGVTDDLDAPKAKKSKMKEKLNGDTEEGFNRLSDEFSKSHKSRRKDLPNGDID
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pF1KB3 PSEAASEE-----------SNSEIEQEIPVEQKEGAFSNFPISEETIKLLKGRGVTFLFP
         :  :..           :....:. .  ::::::::::::::::::::::::::.:::
CCDS72 EYEKKSKRVSSLDTSTHKSSDNKLEETLTREQKEGAFSNFPISEETIKLLKGRGVTYLFP
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pF1KB3 IQAKTFHHVYSGKDLIAQARTGTGKTFSFAIPLIEKLHGELQDRKRGRAPQVLVLAPTRE
       ::.:::  :: ::::::::::::::::::::::::.:. . .  :..:.:.:::::::::
CCDS72 IQVKTFGPVYEGKDLIAQARTGTGKTFSFAIPLIERLQRNQETIKKSRSPKVLVLAPTRE
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pF1KB3 LANQVSKDFSDITKKLSVACFYGGTPYGGQFERMRNGIDILVGTPGRIKDHIQNGKLDLT
       :::::.:::.:::.::::::::::: : .:....:::::::::::::::::.:.:.:::.
CCDS72 LANQVAKDFKDITRKLSVACFYGGTSYQSQINHIRNGIDILVGTPGRIKDHLQSGRLDLS
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pF1KB3 KLKHVVLDEVDQMLDMGFADQVEEILSVAYKKDSEDNPQTLLFSATCPHWVFNVAKKYMK
       ::.::::::::::::.:::.:::.:.  .:: ::::::::::::::::.::..:::::::
CCDS72 KLRHVVLDEVDQMLDLGFAEQVEDIIHESYKTDSEDNPQTLLFSATCPQWVYKVAKKYMK
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             400       410       420       430       440       450 
pF1KB3 STYEQVDLIGKKTQKTAITVEHLAIKCHWTQRAAVIGDVIRVYSGHQGRTIIFCETKKEA
       : ::::::.:: :::.: :::::::.:::.:: ::::::..:::: .::.::::::::..
CCDS72 SRYEQVDLVGKMTQKAATTVEHLAIQCHWSQRPAVIGDVLQVYSGSEGRAIIFCETKKNV
            350       360       370       380       390       400  

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pF1KB3 QELSQNSAIKQDAQSLHGDIPQKQREITLKGFRNGSFGVLVATNVAARGLDIPEVDLVIQ
        :...:  :::.:: ::::: :.::::::::::.::: ::::::::::::::::::::::
CCDS72 TEMAMNPHIKQNAQCLHGDIAQSQREITLKGFREGSFKVLVATNVAARGLDIPEVDLVIQ
            410       420       430       440       450       460  

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pF1KB3 SSPPKDVESYIHRSGRTGRAGRTGVCICFYQHKEEYQLVQVEQKAGIKFKRIGVPSATEI
       ::::.:::::::::::::::::::.:::::: .:. ::  ::::::: :::.::::. ..
CCDS72 SSPPQDVESYIHRSGRTGRAGRTGICICFYQPRERGQLRYVEQKAGITFKRVGVPSTMDL
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pF1KB3 IKASSKDAIRLLDSVPPTAISHFKQSAEKLIEEKGAVEALAAALAHISGATSVDQRSLIN
       .:..: :::: : ::  .:.. :. ::..::::::::.::::::::::::.: . ::::.
CCDS72 VKSKSMDAIRSLASVSYAAVDFFRPSAQRLIEEKGAVDALAAALAHISGASSFEPRSLIT
            530       540       550       560       570       580  

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pF1KB3 SNVGFVTMILQCSIEMPNISYAWKELKEQLGEEIDSKVKGMVFLKGKLGVCFDVPTASVT
       :. ::::: :.   :. ..: :::::...:. .  :..  : .:::..::::::::.   
CCDS72 SDKGFVTMTLESLEEIQDVSCAWKELNRKLSSNAVSQITRMCLLKGNMGVCFDVPTTESE
            590       600       610       620       630       640  

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pF1KB3 EIQEKWHDSRRWQLSVATEQPELEGPREG--------YGGFRGQREGSRGFRGQRDGNRR
       ..: .::::  : ::: .. ::.:   .:         .:. . : :  :  : :.:.: 
CCDS72 RLQAEWHDSD-WILSVPAKLPEIEEYYDGNTSSNSRQRSGWSSGRSGRSGRSGGRSGGRS
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pF1KB3 FRGQREGSR-GPR--GQRSGGGNKSNRSQNKGQKRSFSKAFGQ
        : .:.::: : :  :.: .: :. :::.. :.::::      
CCDS72 GRQSRQGSRSGSRQDGRRRSG-NR-NRSRSGGHKRSFD     
             710       720         730            

>>CCDS33646.1 DDX17 gene_id:10521|Hs108|chr22             (729 aa)
 initn: 737 init1: 240 opt: 732  Z-score: 461.1  bits: 96.0 E(32554): 2.3e-19
Smith-Waterman score: 732; 30.2% identity (61.7% similar) in 533 aa overlap (41-556:28-540)

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pF1KB3 LESDTAMKKGETLRKQTEEKEKKEKPKSDKTEEIAEEEETVFPKAKQVKKKAEPSEVDMN
                                     : . : :.:.. : :  . .   :: :   
CCDS33    MPTGFVAPILCVLLPSPTREAATVASATGDSASERESAAPAAAPTAEAPPPSVVTRP
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pF1KB3 SPKSKKAKKKEEPSQNDISPKTKSLRKKKEPIEKKVVSSKTKKVTKNEEPSEEEIDAPKP
        :..  .   . :   :. :   ..:      . .  .     .  .     ...  :  
CCDS33 EPQALPSPAIRAP-LPDLYP-FGTMRGGGFGDRDRDRDRGGFGARGGGGLPPKKFGNPGE
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pF1KB3 KKMKKEKEMNGETREKSPKLKNGF--PHPE-PDCNPSEAASEESNSEIE-QEIPVEQKEG
       .  ::. ...     . ::....:   :::    .: :.   . ..::  .   :  :  
CCDS33 RLRKKKWDLS-----ELPKFEKNFYVEHPEVARLTPYEVDELRRKKEITVRGGDVCPKPV
         120            130       140       150       160       170

           190       200       210       220       230       240   
pF1KB3 -AF--SNFPISEETIKLLKGRGVTFLFPIQAKTFHHVYSGKDLIAQARTGTGKTFSFAIP
        ::  .:::  . .. .:  .  :   ::: . :  . ::.:... :.::.:::... .:
CCDS33 FAFHHANFP--QYVMDVLMDQHFTEPTPIQCQGFPLALSGRDMVGIAQTGSGKTLAYLLP
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pF1KB3 LIEKLHGELQDR-KRGRAPQVLVLAPTRELANQVSKDFSDITK--KLSVACFYGGTPYGG
        :  .: . :   .:: .:  ::::::::::.::..  .:  :  .:. .:.:::.: : 
CCDS33 AI--VHINHQPYLERGDGPICLVLAPTRELAQQVQQVADDYGKCSRLKSTCIYGGAPKGP
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              310       320       330       340       350       360
pF1KB3 QFERMRNGIDILVGTPGRIKDHIQNGKLDLTKLKHVVLDEVDQMLDMGFADQVEEILSVA
       :.. .. :..: ..::::. : ...:: .: .  ..::::.:.::::::  :...:..  
CCDS33 QIRDLERGVEICIATPGRLIDFLESGKTNLRRCTYLVLDEADRMLDMGFEPQIRKIVD-Q
        290       300       310       320       330       340      

              370       380       390       400       410       420
pF1KB3 YKKDSEDNPQTLLFSATCPHWVFNVAKKYMKSTYEQVDLIGKKTQKTAITVEHLAIKCHW
        . :     :::..::: :. : ..:. .... : :.. .:.   ..  .. ...  :  
CCDS33 IRPDR----QTLMWSATWPKEVRQLAEDFLRD-YTQIN-VGNLELSANHNILQIVDVCME
         350           360       370         380       390         

              430        440       450       460          470      
pF1KB3 TQRAAVIGDVIR-VYSGHQGRTIIFCETKKEAQELSQNSAIKQD---AQSLHGDIPQKQR
       ...   . .... ... ....:::: :::.. ..:..   ...:   :. .:::  : .:
CCDS33 SEKDHKLIQLMEEIMAEKENKTIIFVETKRRCDDLTRR--MRRDGWPAMCIHGDKSQPER
     400       410       420       430         440       450       

        480       490       500       510       520       530      
pF1KB3 EITLKGFRNGSFGVLVATNVAARGLDIPEVDLVIQSSPPKDVESYIHRSGRTGRAGRTGV
       . .:. ::.:.  .:.::.::.::::. .: .::. . :.. :.:.:: :::.:.   :.
CCDS33 DWVLNEFRSGKAPILIATDVASRGLDVEDVKFVINYDYPNSSEDYVHRIGRTARSTNKGT
       460       470       480       490       500       510       

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pF1KB3 CICFYQH---KEEYQLVQVEQKAGIKFKRIGVPSATEIIKASSKDAIRLLDSVPPTAISH
          :.     :.  .:..: ..:                                     
CCDS33 AYTFFTPGNLKQARELIKVLEEANQAINPKLMQLVDHRGGGGGGGGRSRYRTTSSANNPN
       520       530       540       550       560       570       

>>CCDS46706.1 DDX17 gene_id:10521|Hs108|chr22             (731 aa)
 initn: 708 init1: 240 opt: 732  Z-score: 461.0  bits: 96.0 E(32554): 2.3e-19
Smith-Waterman score: 732; 30.2% identity (61.7% similar) in 533 aa overlap (41-556:28-540)

               20        30        40        50        60        70
pF1KB3 LESDTAMKKGETLRKQTEEKEKKEKPKSDKTEEIAEEEETVFPKAKQVKKKAEPSEVDMN
                                     : . : :.:.. : :  . .   :: :   
CCDS46    MPTGFVAPILCVLLPSPTREAATVASATGDSASERESAAPAAAPTAEAPPPSVVTRP
                  10        20        30        40        50       

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pF1KB3 SPKSKKAKKKEEPSQNDISPKTKSLRKKKEPIEKKVVSSKTKKVTKNEEPSEEEIDAPKP
        :..  .   . :   :. :   ..:      . .  .     .  .     ...  :  
CCDS46 EPQALPSPAIRAP-LPDLYP-FGTMRGGGFGDRDRDRDRGGFGARGGGGLPPKKFGNPGE
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              140       150          160       170        180      
pF1KB3 KKMKKEKEMNGETREKSPKLKNGF--PHPE-PDCNPSEAASEESNSEIE-QEIPVEQKEG
       .  ::. ...     . ::....:   :::    .: :.   . ..::  .   :  :  
CCDS46 RLRKKKWDLS-----ELPKFEKNFYVEHPEVARLTPYEVDELRRKKEITVRGGDVCPKPV
         120            130       140       150       160       170

           190       200       210       220       230       240   
pF1KB3 -AF--SNFPISEETIKLLKGRGVTFLFPIQAKTFHHVYSGKDLIAQARTGTGKTFSFAIP
        ::  .:::  . .. .:  .  :   ::: . :  . ::.:... :.::.:::... .:
CCDS46 FAFHHANFP--QYVMDVLMDQHFTEPTPIQCQGFPLALSGRDMVGIAQTGSGKTLAYLLP
                180       190       200       210       220        

           250        260       270       280         290       300
pF1KB3 LIEKLHGELQDR-KRGRAPQVLVLAPTRELANQVSKDFSDITK--KLSVACFYGGTPYGG
        :  .: . :   .:: .:  ::::::::::.::..  .:  :  .:. .:.:::.: : 
CCDS46 AI--VHINHQPYLERGDGPICLVLAPTRELAQQVQQVADDYGKCSRLKSTCIYGGAPKGP
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       :.. .. :..: ..::::. : ...:: .: .  ..::::.:.::::::  :...:..  
CCDS46 QIRDLERGVEICIATPGRLIDFLESGKTNLRRCTYLVLDEADRMLDMGFEPQIRKIVD-Q
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        . :     :::..::: :. : ..:. .... : :.. .:.   ..  .. ...  :  
CCDS46 IRPDR----QTLMWSATWPKEVRQLAEDFLRD-YTQIN-VGNLELSANHNILQIVDVCME
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       ...   . .... ... ....:::: :::.. ..:..   ...:   :. .:::  : .:
CCDS46 SEKDHKLIQLMEEIMAEKENKTIIFVETKRRCDDLTRR--MRRDGWPAMCIHGDKSQPER
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pF1KB3 EITLKGFRNGSFGVLVATNVAARGLDIPEVDLVIQSSPPKDVESYIHRSGRTGRAGRTGV
       . .:. ::.:.  .:.::.::.::::. .: .::. . :.. :.:.:: :::.:.   :.
CCDS46 DWVLNEFRSGKAPILIATDVASRGLDVEDVKFVINYDYPNSSEDYVHRIGRTARSTNKGT
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          :.     :.  .:..: ..:                                     
CCDS46 AYTFFTPGNLKQARELIKVLEEANQAINPKLMQLVDHRGGGGGGGKGGRSRYRTTSSANN
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>>CCDS82190.1 DDX5 gene_id:1655|Hs108|chr17               (614 aa)
 initn: 650 init1: 238 opt: 725  Z-score: 457.8  bits: 95.2 E(32554): 3.5e-19
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CCDS82  MKAGRFEADEGTSVRFGAPRFGGSRAGPLSGKKFGNPGEKLVKKKWNLD-----ELPKF
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       ...: . .::    . .:. . . ..::    .. :    .   .::: .  .. ..  .
CCDS82 EKNFYQEHPDLARRTAQEVETYRRSKEITVRGHNCPKPVLNFYEANFPAN--VMDVIARQ
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       . :    :::. .  . :: :... :.::.:::.:. .: :  .: . :   .:: .:  
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       ::::::::::.::..  ..  .  .:. .:.:::.: : :.. .. :..: ..::::. :
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CCDS82 FLECGKTNLRRTTYLVLDEADRMLDMGFEPQIRKIVD-QIRPDR----QTLMWSATWPKE
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CCDS82 VRQLAEDFLKD-YIHIN-IGALELSANHNILQIVDVCHDVEKDEKLIRLMEEIMSEKENK
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CCDS82 EANQAINPKLLQLVEDRGSGRSRGRGGMKDDRRDRYSAGKRGGFNTFRDRENYDRGYSSL
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>>CCDS11659.1 DDX5 gene_id:1655|Hs108|chr17               (614 aa)
 initn: 650 init1: 238 opt: 725  Z-score: 457.8  bits: 95.2 E(32554): 3.5e-19
Smith-Waterman score: 725; 32.3% identity (67.0% similar) in 452 aa overlap (121-556:30-463)

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CCDS11  MSGYSSDRDRGRDRGFGAPRFGGSRAGPLSGKKFGNPGEKLVKKKWNLD-----ELPKF
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pF1KB3 KNGFPHPEPDC---NPSEAASEESNSEIE---QEIPVEQKEGAFSNFPISEETIKLLKGR
       ...: . .::    . .:. . . ..::    .. :    .   .::: .  .. ..  .
CCDS11 EKNFYQEHPDLARRTAQEVETYRRSKEITVRGHNCPKPVLNFYEANFPAN--VMDVIARQ
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pF1KB3 GVTFLFPIQAKTFHHVYSGKDLIAQARTGTGKTFSFAIPLIEKLHGELQDR-KRGRAPQV
       . :    :::. .  . :: :... :.::.:::.:. .: :  .: . :   .:: .:  
CCDS11 NFTEPTAIQAQGWPVALSGLDMVGVAQTGSGKTLSYLLPAI--VHINHQPFLERGDGPIC
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pF1KB3 LVLAPTRELANQVSKDFSDITK--KLSVACFYGGTPYGGQFERMRNGIDILVGTPGRIKD
       ::::::::::.::..  ..  .  .:. .:.:::.: : :.. .. :..: ..::::. :
CCDS11 LVLAPTRELAQQVQQVAAEYCRACRLKSTCIYGGAPKGPQIRDLERGVEICIATPGRLID
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pF1KB3 HIQNGKLDLTKLKHVVLDEVDQMLDMGFADQVEEILSVAYKKDSEDNPQTLLFSATCPHW
        .. :: .: .  ..::::.:.::::::  :...:..   . :     :::..::: :. 
CCDS11 FLECGKTNLRRTTYLVLDEADRMLDMGFEPQIRKIVD-QIRPDR----QTLMWSATWPKE
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pF1KB3 VFNVAKKYMKSTYEQVDLIGKKTQKTAITVEHLAIKCHWTQR-AAVIGDVIRVYSGHQGR
       : ..:. ..:. : ... ::    ..  .. ...  :: ...   .:  . ...: ....
CCDS11 VRQLAEDFLKD-YIHIN-IGALELSANHNILQIVDVCHDVEKDEKLIRLMEEIMSEKENK
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pF1KB3 TIIFCETKKEAQELSQNSAIKQD---AQSLHGDIPQKQREITLKGFRNGSFGVLVATNVA
       ::.: :::.. .::...  ...:   :...:::  :..:. .:. :..:.  .:.::.::
CCDS11 TIVFVETKRRCDELTRK--MRRDGWPAMGIHGDKSQQERDWVLNEFKHGKAPILIATDVA
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pF1KB3 ARGLDIPEVDLVIQSSPPKDVESYIHRSGRTGRAGRTGVCICFYQH---KEEYQLVQVEQ
       .::::. .: .::. . :.. :.:::: :::.:. .::.   :.     :.  .:..: .
CCDS11 SRGLDVEDVKFVINYDYPNSSEDYIHRIGRTARSTKTGTAYTFFTPNNIKQVSDLISVLR
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pF1KB3 KAGIKFKRIGVPSATEIIKASSKDAIRLLDSVPPTAISHFKQSAEKLIEEKGAVEALAAA
       .:                                                          
CCDS11 EANQAINPKLLQLVEDRGSGRSRGRGGMKDDRRDRYSAGKRGGFNTFRDRENYDRGYSSL
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>>CCDS54855.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5               (575 aa)
 initn: 693 init1: 263 opt: 696  Z-score: 440.7  bits: 91.9 E(32554): 3.1e-18
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                                     ..:  ... .:.  ..::..:     .: .
CCDS54            MGSRNLFLTNSPESSNDCEDNPTRNRGFSKR--GDNDLDPDECMQRTGG
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pF1KB3 LRKKKEPIEKKVVSSKTKKVTKNEEPSEEEIDAPKPKKMKKEKEMNGETRE-KSPKLKNG
       :  ...:. . . .. :.. ...   ::..       . :.: : .::. . ..::. . 
CCDS54 LFGSRRPVLSGTGNGDTSQ-SRSGSGSERD-------SWKSEAE-GGESSDTQGPKV-TY
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pF1KB3 FPHPEPDCNPSEAASEESNSEIEQ------EIPVEQKEGAFSNFPISEETIKL---LKGR
       .: : :. . :  :  ... ....      :.  ..   :. .:  ..    :   .   
CCDS54 IPPPPPEDEDSIFAHYQTGINFDKYDTILVEVSGHDAPPAILTFEEANLCQTLNNNIAKA
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pF1KB3 GVTFLFPIQAKTFHHVYSGKDLIAQARTGTGKTFSFAIPLIEKL-H-GELQDR-KRGRAP
       : : : :.:  ..  . .:.::.: :.::.::: .: .:.. .. : :   .: :. . :
CCDS54 GYTKLTPVQKYSIPIILAGRDLMACAQTGSGKTAAFLLPILAHMMHDGITASRFKELQEP
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pF1KB3 QVLVLAPTRELANQV---SKDFSDITKKLSVACFYGGTPYGGQFERMRNGIDILVGTPGR
       . ...::::::.::.   .. :: .   . .. .::::  : ..... .: .:: .::::
CCDS54 ECIIVAPTRELVNQIYLEARKFS-FGTCVRAVVIYGGTQLGHSIRQIVQGCNILCATPGR
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pF1KB3 IKDHIQNGKLDLTKLKHVVLDEVDQMLDMGFADQVEEILSVAYKKDSEDNPQTLLFSATC
       . : : . :. : ..:..::::.:.::::::. ......:      :... :::.:::: 
CCDS54 LMDIIGKEKIGLKQIKYLVLDEADRMLDMGFGPEMKKLISCP-GMPSKEQRQTLMFSATF
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pF1KB3 PHWVFNVAKKYMKSTYE--QVDLIGKKTQKTAITVEHLAIKCHWTQRAAVIGDVIRVYSG
       :. .  .: ...::.:    :  .:   . .  :: ...   ....:  .. ...:  . 
CCDS54 PEEIQRLAAEFLKSNYLFVAVGQVGGACRDVQQTVLQVG---QFSKREKLV-EILRNIGD
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pF1KB3 HQGRTIIFCETKKEAQELSQN-SAIKQDAQSLHGDIPQKQREITLKGFRNGSFGVLVATN
       .  ::..: ::::.:. ..      : .. :.:::  :..:: .:  :: :.  :::::.
CCDS54 E--RTMVFVETKKKADFIATFLCQEKISTTSIHGDREQREREQALGDFRFGKCPVLVATS
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pF1KB3 VAARGLDIPEVDLVIQSSPPKDVESYIHRSGRTGRAGRTGVCICFYQHKEEYQLVQVEQK
       :::::::: .:. ::. . :. .. :.:: ::::: : ::  : :.. . . .:.:    
CCDS54 VAARGLDIENVQHVINFDLPSTIDEYVHRIGRTGRCGNTGRAISFFDLESDNHLAQPLVK
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pF1KB3 AGIKFKRIGVPSATEIIKASSKDAIRLLDSVPPTAISHFKQSAEKLIEEKGAVEALAAAL
                                                                   
CCDS54 VLTDAQQDVPAWLEEIAFSTYIPGFSGSTRGNVFASVDTRKGKSTLNTAGFSSSQAPNPV
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>>CCDS47208.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5               (690 aa)
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                                     ..:  ... .:.  ..::..:     .: .
CCDS47 KSFGNRGFSNSRFEDGDSSGFWRESSNDCEDNPTRNRGFSKR--GDNDLDPDECMQRTGG
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       :  ...:. . .    .:.... . .:. .    .::. . . :.  : .  .::. . .
CCDS47 LFGSRRPVLSGTGNGDTSQSRSGSGSERGGYKGLNEEVITGSGKNSWKSEAEGGESSDTQ
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pF1KB3 SPKLKNGFPHPEPDCNPSEAASEESNSEIEQ------EIPVEQKEGAFSNFPISEETIKL
       .::. . .: : :. . :  :  ... ....      :.  ..   :. .:  ..    :
CCDS47 GPKV-TYIPPPPPEDEDSIFAHYQTGINFDKYDTILVEVSGHDAPPAILTFEEANLCQTL
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pF1KB3 ---LKGRGVTFLFPIQAKTFHHVYSGKDLIAQARTGTGKTFSFAIPLIEKL-H-GELQDR
          .   : : : :.:  ..  . .:.::.: :.::.::: .: .:.. .. : :   .:
CCDS47 NNNIAKAGYTKLTPVQKYSIPIILAGRDLMACAQTGSGKTAAFLLPILAHMMHDGITASR
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pF1KB3 -KRGRAPQVLVLAPTRELANQV---SKDFSDITKKLSVACFYGGTPYGGQFERMRNGIDI
        :. . :. ...::::::.::.   .. :: .   . .. .::::  : ..... .: .:
CCDS47 FKELQEPECIIVAPTRELVNQIYLEARKFS-FGTCVRAVVIYGGTQLGHSIRQIVQGCNI
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pF1KB3 LVGTPGRIKDHIQNGKLDLTKLKHVVLDEVDQMLDMGFADQVEEILSVAYKKDSEDNPQT
       : .::::. : : . :. : ..:..::::.:.::::::. ......:      :... ::
CCDS47 LCATPGRLMDIIGKEKIGLKQIKYLVLDEADRMLDMGFGPEMKKLISCP-GMPSKEQRQT
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pF1KB3 LLFSATCPHWVFNVAKKYMKSTYE--QVDLIGKKTQKTAITVEHLAIKCHWTQRAAVIGD
       :.:::: :. .  .: ...::.:    :  .:   . .  :: ...   ....:  .. .
CCDS47 LMFSATFPEEIQRLAAEFLKSNYLFVAVGQVGGACRDVQQTVLQVG---QFSKREKLV-E
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pF1KB3 VIRVYSGHQGRTIIFCETKKEAQELSQN-SAIKQDAQSLHGDIPQKQREITLKGFRNGSF
       ..:  . .  ::..: ::::.:. ..      : .. :.:::  :..:: .:  :: :. 
CCDS47 ILRNIGDE--RTMVFVETKKKADFIATFLCQEKISTTSIHGDREQREREQALGDFRFGKC
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pF1KB3 GVLVATNVAARGLDIPEVDLVIQSSPPKDVESYIHRSGRTGRAGRTGVCICFYQHKEEYQ
        :::::.:::::::: .:. ::. . :. .. :.:: ::::: : ::  : :.. . . .
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pF1KB3 LVQVEQKAGIKFKRIGVPSATEIIKASSKDAIRLLDSVPPTAISHFKQSAEKLIEEKGAV
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CCDS47 LAQPLVKVLTDAQQDVPAWLEEIAFSTYIPGFSGSTRGNVFASVDTRKGKSTLNTAGFSS
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>>CCDS54854.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5               (704 aa)
 initn: 633 init1: 263 opt: 696  Z-score: 439.6  bits: 92.0 E(32554): 3.7e-18
Smith-Waterman score: 711; 33.8% identity (64.7% similar) in 450 aa overlap (121-551:195-634)

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CCDS54 RRPVLSGTGNGDTSQSRSGSGSERGGYKGLNEEVITGSGKNSWKSEAE-GGESSDTQGPK
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pF1KB3 LKNGFPHPEPDCNPSEAASEESNSEIEQ------EIPVEQKEGAFSNFPISEETIKL---
       .   .: : :. . :  :  ... ....      :.  ..   :. .:  ..    :   
CCDS54 VTY-IPPPPPEDEDSIFAHYQTGINFDKYDTILVEVSGHDAPPAILTFEEANLCQTLNNN
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pF1KB3 LKGRGVTFLFPIQAKTFHHVYSGKDLIAQARTGTGKTFSFAIPLIEKL-H-GELQDR-KR
       .   : : : :.:  ..  . .:.::.: :.::.::: .: .:.. .. : :   .: :.
CCDS54 IAKAGYTKLTPVQKYSIPIILAGRDLMACAQTGSGKTAAFLLPILAHMMHDGITASRFKE
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pF1KB3 GRAPQVLVLAPTRELANQV---SKDFSDITKKLSVACFYGGTPYGGQFERMRNGIDILVG
        . :. ...::::::.::.   .. :: .   . .. .::::  : ..... .: .:: .
CCDS54 LQEPECIIVAPTRELVNQIYLEARKFS-FGTCVRAVVIYGGTQLGHSIRQIVQGCNILCA
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pF1KB3 TPGRIKDHIQNGKLDLTKLKHVVLDEVDQMLDMGFADQVEEILSVAYKKDSEDNPQTLLF
       ::::. : : . :. : ..:..::::.:.::::::. ......:      :... :::.:
CCDS54 TPGRLMDIIGKEKIGLKQIKYLVLDEADRMLDMGFGPEMKKLISCP-GMPSKEQRQTLMF
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pF1KB3 SATCPHWVFNVAKKYMKSTYE--QVDLIGKKTQKTAITVEHLAIKCHWTQRAAVIGDVIR
       ::: :. .  .: ...::.:    :  .:   . .  :: ...   ....:  .. ...:
CCDS54 SATFPEEIQRLAAEFLKSNYLFVAVGQVGGACRDVQQTVLQVG---QFSKREKLV-EILR
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pF1KB3 VYSGHQGRTIIFCETKKEAQELSQN-SAIKQDAQSLHGDIPQKQREITLKGFRNGSFGVL
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CCDS54 NI-GDE-RTMVFVETKKKADFIATFLCQEKISTTSIHGDREQREREQALGDFRFGKCPVL
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pF1KB3 VATNVAARGLDIPEVDLVIQSSPPKDVESYIHRSGRTGRAGRTGVCICFYQHKEEYQLVQ
       :::.:::::::: .:. ::. . :. .. :.:: ::::: : ::  : :.. . . .:.:
CCDS54 VATSVAARGLDIENVQHVINFDLPSTIDEYVHRIGRTGRCGNTGRAISFFDLESDNHLAQ
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pF1KB3 VEQKAGIKFKRIGVPSATEIIKASSKDAIRLLDSVPPTAISHFKQSAEKLIEEKGAVEAL
                                                                   
CCDS54 PLVKVLTDAQQDVPAWLEEIAFSTYIPGFSGSTRGNVFASVDTRKGKSTLNTAGFSSSQA
          640       650       660       670       680       690    




783 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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