Result of FASTA (ccds) for pF1KB4653
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB4653, 200 aa
  1>>>pF1KB4653 200 - 200 aa - 200 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7211+/-0.00103; mu= 10.8116+/- 0.062
 mean_var=70.4805+/-14.124, 0's: 0 Z-trim(104.5): 210  B-trim: 312 in 2/47
 Lambda= 0.152771
 statistics sampled from 7704 (7936) to 7704 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.622), E-opt: 0.2 (0.244), width:  16
 Scan time:  1.730

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS1720.1 RAB10 gene_id:10890|Hs108|chr2          ( 200) 1320 300.0 6.3e-82
CCDS10183.1 RAB8B gene_id:51762|Hs108|chr15        ( 207)  902 207.9 3.5e-54
CCDS12339.1 RAB8A gene_id:4218|Hs108|chr19         ( 207)  892 205.7 1.6e-53
CCDS1058.1 RAB13 gene_id:5872|Hs108|chr1           ( 203)  819 189.6 1.1e-48
CCDS46306.1 RAB1A gene_id:5861|Hs108|chr2          ( 205)  708 165.1 2.6e-41
CCDS31613.1 RAB1B gene_id:81876|Hs108|chr11        ( 201)  699 163.2   1e-40
CCDS76691.1 RAB15 gene_id:376267|Hs108|chr14       ( 212)  679 158.8 2.2e-39
CCDS41846.1 RAB35 gene_id:11021|Hs108|chr12        ( 201)  653 153.0 1.1e-37
CCDS12257.1 RAB3D gene_id:9545|Hs108|chr19         ( 219)  652 152.8 1.4e-37
CCDS10460.1 RAB26 gene_id:25837|Hs108|chr16        ( 256)  646 151.5 4.1e-37
CCDS12372.1 RAB3A gene_id:5864|Hs108|chr19         ( 220)  643 150.8 5.7e-37
CCDS560.1 RAB3B gene_id:5865|Hs108|chr1            ( 219)  638 149.7 1.2e-36
CCDS3976.1 RAB3C gene_id:115827|Hs108|chr5         ( 227)  635 149.1   2e-36
CCDS32722.1 RAB37 gene_id:326624|Hs108|chr17       ( 223)  633 148.6 2.6e-36
CCDS42410.1 RAB12 gene_id:201475|Hs108|chr18       ( 244)  630 148.0 4.5e-36
CCDS76806.1 RAB26 gene_id:25837|Hs108|chr16        ( 190)  616 144.9 3.1e-35
CCDS82198.1 RAB37 gene_id:326624|Hs108|chr17       ( 196)  615 144.6 3.7e-35
CCDS54161.1 RAB37 gene_id:326624|Hs108|chr17       ( 228)  615 144.7 4.2e-35
CCDS9570.1 RAB2B gene_id:84932|Hs108|chr14         ( 216)  593 139.8 1.2e-33
CCDS6175.1 RAB2A gene_id:5862|Hs108|chr8           ( 212)  588 138.7 2.4e-33
CCDS33850.1 RAB43 gene_id:339122|Hs108|chr3        ( 212)  573 135.4 2.4e-32
CCDS11703.1 RAB37 gene_id:326624|Hs108|chr17       ( 216)  568 134.3 5.3e-32
CCDS10212.1 RAB11A gene_id:8766|Hs108|chr15        ( 216)  564 133.4 9.7e-32
CCDS8264.1 RAB30 gene_id:27314|Hs108|chr11         ( 203)  562 133.0 1.2e-31
CCDS12201.1 RAB11B gene_id:9230|Hs108|chr19        ( 218)  552 130.8 6.1e-31
CCDS7155.1 RAB18 gene_id:22931|Hs108|chr10         ( 206)  539 127.9 4.2e-30
CCDS14766.1 RAB39B gene_id:116442|Hs108|chrX       ( 213)  529 125.7   2e-29
CCDS34762.2 RAB19 gene_id:401409|Hs108|chr7        ( 217)  523 124.4 5.1e-29
CCDS6827.1 RAB14 gene_id:51552|Hs108|chr9          ( 215)  517 123.1 1.3e-28
CCDS33030.1 RAB4B gene_id:53916|Hs108|chr19        ( 213)  512 122.0 2.7e-28
CCDS41413.1 RAB25 gene_id:57111|Hs108|chr1         ( 213)  509 121.3 4.3e-28
CCDS31050.1 RAB4A gene_id:5867|Hs108|chr1          ( 218)  505 120.4   8e-28
CCDS53836.1 RAB35 gene_id:11021|Hs108|chr12        ( 152)  497 118.6   2e-27
CCDS11816.1 RAB40B gene_id:10966|Hs108|chr17       ( 278)  497 118.7 3.4e-27
CCDS10413.1 RAB40C gene_id:57799|Hs108|chr16       ( 281)  492 117.6 7.3e-27
CCDS44803.1 CRACR2A gene_id:84766|Hs108|chr12      ( 731)  497 118.9 7.8e-27
CCDS9768.1 RAB15 gene_id:376267|Hs108|chr14        ( 208)  487 116.4 1.2e-26
CCDS3082.1 RAB6B gene_id:51560|Hs108|chr3          ( 208)  485 116.0 1.6e-26
CCDS58373.1 RAB11A gene_id:8766|Hs108|chr15        ( 155)  482 115.3   2e-26
CCDS35357.1 RAB40A gene_id:142684|Hs108|chrX       ( 277)  482 115.4 3.3e-26
CCDS8223.1 RAB6A gene_id:5870|Hs108|chr11          ( 208)  479 114.7 4.1e-26
CCDS3747.1 RAB33B gene_id:83452|Hs108|chr4         ( 229)  478 114.5 5.2e-26
CCDS14621.1 RAB33A gene_id:9363|Hs108|chrX         ( 237)  478 114.5 5.3e-26
CCDS8338.1 RAB39A gene_id:54734|Hs108|chr11        ( 217)  477 114.2 5.8e-26
CCDS35353.1 RAB40AL gene_id:282808|Hs108|chrX      ( 278)  477 114.3 7.2e-26
CCDS8224.1 RAB6A gene_id:5870|Hs108|chr11          ( 208)  474 113.6 8.8e-26
CCDS56537.1 RAB2A gene_id:5862|Hs108|chr8          ( 188)  472 113.1 1.1e-25
CCDS6662.1 RASEF gene_id:158158|Hs108|chr9         ( 740)  477 114.5 1.7e-25
CCDS45826.1 RAB31 gene_id:11031|Hs108|chr18        ( 195)  465 111.6 3.3e-25
CCDS2633.1 RAB5A gene_id:5868|Hs108|chr3           ( 215)  463 111.2 4.9e-25


>>CCDS1720.1 RAB10 gene_id:10890|Hs108|chr2               (200 aa)
 initn: 1320 init1: 1320 opt: 1320  Z-score: 1584.3  bits: 300.0 E(32554): 6.3e-82
Smith-Waterman score: 1320; 100.0% identity (100.0% similar) in 200 aa overlap (1-200:1-200)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB4 MAKKTYDLLFKLLLIGDSGVGKTCVLFRFSDDAFNTTFISTIGIDFKIKTVELQGKKIKL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 MAKKTYDLLFKLLLIGDSGVGKTCVLFRFSDDAFNTTFISTIGIDFKIKTVELQGKKIKL
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB4 QIWDTAGQERFHTITTSYYRGAMGIMLVYDITNGKSFENISKWLRNIDEHANEDVERMLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 QIWDTAGQERFHTITTSYYRGAMGIMLVYDITNGKSFENISKWLRNIDEHANEDVERMLL
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB4 GNKCDMDDKRVVPKGKGEQIAREHGIRFFETSAKANINIEKAFLTLAEDILRKTPVKEPN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 GNKCDMDDKRVVPKGKGEQIAREHGIRFFETSAKANINIEKAFLTLAEDILRKTPVKEPN
              130       140       150       160       170       180

              190       200
pF1KB4 SENVDISSGGGVTGWKSKCC
       ::::::::::::::::::::
CCDS17 SENVDISSGGGVTGWKSKCC
              190       200

>>CCDS10183.1 RAB8B gene_id:51762|Hs108|chr15             (207 aa)
 initn: 902 init1: 902 opt: 902  Z-score: 1086.2  bits: 207.9 E(32554): 3.5e-54
Smith-Waterman score: 902; 72.5% identity (91.0% similar) in 189 aa overlap (4-192:3-189)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB4 MAKKTYDLLFKLLLIGDSGVGKTCVLFRFSDDAFNTTFISTIGIDFKIKTVELQGKKIKL
          :::: ::::::::::::::::.:::::.:::::::::::::::::.:.::.::::::
CCDS10  MAKTYDYLFKLLLIGDSGVGKTCLLFRFSEDAFNTTFISTIGIDFKIRTIELDGKKIKL
                10        20        30        40        50         

               70        80        90       100       110       120
pF1KB4 QIWDTAGQERFHTITTSYYRGAMGIMLVYDITNGKSFENISKWLRNIDEHANEDVERMLL
       :::::::::::.::::.:::::::::::::::: :::.::..:.:::.:::. :::::.:
CCDS10 QIWDTAGQERFRTITTAYYRGAMGIMLVYDITNEKSFDNIKNWIRNIEEHASSDVERMIL
      60        70        80        90       100       110         

              130       140       150       160       170       180
pF1KB4 GNKCDMDDKRVVPKGKGEQIAREHGIRFFETSAKANINIEKAFLTLAEDILRKTPVKEPN
       ::::::.::: : : .::..: ..::.:.:::::.. :.:.::.:::.::. :   :  .
CCDS10 GNKCDMNDKRQVSKERGEKLAIDYGIKFLETSAKSSANVEEAFFTLARDIMTKLNRKMND
     120       130       140       150       160       170         

              190       200          
pF1KB4 SENVDISSGGGVTGWKSKCC          
       :...  ..:: :                  
CCDS10 SNSA--GAGGPVKITENRSKKTSFFRCSLL
     180         190       200       

>>CCDS12339.1 RAB8A gene_id:4218|Hs108|chr19              (207 aa)
 initn: 886 init1: 886 opt: 892  Z-score: 1074.3  bits: 205.7 E(32554): 1.6e-53
Smith-Waterman score: 892; 76.0% identity (91.6% similar) in 179 aa overlap (4-181:3-181)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB4 MAKKTYDLLFKLLLIGDSGVGKTCVLFRFSDDAFNTTFISTIGIDFKIKTVELQGKKIKL
          :::: ::::::::::::::::::::::.::::.::::::::::::.:.::.::.:::
CCDS12  MAKTYDYLFKLLLIGDSGVGKTCVLFRFSEDAFNSTFISTIGIDFKIRTIELDGKRIKL
                10        20        30        40        50         

               70        80        90       100       110       120
pF1KB4 QIWDTAGQERFHTITTSYYRGAMGIMLVYDITNGKSFENISKWLRNIDEHANEDVERMLL
       :::::::::::.::::.:::::::::::::::: :::.:: .:.:::.:::. :::.:.:
CCDS12 QIWDTAGQERFRTITTAYYRGAMGIMLVYDITNEKSFDNIRNWIRNIEEHASADVEKMIL
      60        70        80        90       100       110         

              130       140       150       160       170          
pF1KB4 GNKCDMDDKRVVPKGKGEQIAREHGIRFFETSAKANINIEKAFLTLAEDILRKTPVK-EP
       :::::..::: : : .::..: ..::.:.:::::::::.:.::.:::.::  :   : : 
CCDS12 GNKCDVNDKRQVSKERGEKLALDYGIKFMETSAKANINVENAFFTLARDIKAKMDKKLEG
     120       130       140       150       160       170         

     180       190       200       
pF1KB4 NSENVDISSGGGVTGWKSKCC       
       ::                          
CCDS12 NSPQGSNQGVKITPDQQKRSSFFRCVLL
     180       190       200       

>>CCDS1058.1 RAB13 gene_id:5872|Hs108|chr1                (203 aa)
 initn: 833 init1: 812 opt: 819  Z-score: 987.5  bits: 189.6 E(32554): 1.1e-48
Smith-Waterman score: 819; 66.7% identity (91.1% similar) in 180 aa overlap (4-183:3-182)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB4 MAKKTYDLLFKLLLIGDSGVGKTCVLFRFSDDAFNTTFISTIGIDFKIKTVELQGKKIKL
          :.:: ::::::::::::::::...::..: ::.:.::::::::::.::...::::::
CCDS10  MAKAYDHLFKLLLIGDSGVGKTCLIIRFAEDNFNNTYISTIGIDFKIRTVDIEGKKIKL
                10        20        30        40        50         

               70        80        90       100       110       120
pF1KB4 QIWDTAGQERFHTITTSYYRGAMGIMLVYDITNGKSFENISKWLRNIDEHANEDVERMLL
       :.:::::::::.::::.::::::::.::::::. ::::::..:...: :.:.  :::.::
CCDS10 QVWDTAGQERFKTITTAYYRGAMGIILVYDITDEKSFENIQNWMKSIKENASAGVERLLL
      60        70        80        90       100       110         

              130       140       150       160       170       180
pF1KB4 GNKCDMDDKRVVPKGKGEQIAREHGIRFFETSAKANINIEKAFLTLAEDILRKTPVKEPN
       ::::::. :: : : .....::::::::::::::...:...:: .::.::: :.  .. .
CCDS10 GNKCDMEAKRKVQKEQADKLAREHGIRFFETSAKSSMNVDEAFSSLARDILLKSGGRRSG
     120       130       140       150       160       170         

              190       200    
pF1KB4 SENVDISSGGGVTGWKSKCC    
       . :                     
CCDS10 NGNKPPSTDLKTCDKKNTNKCSLG
     180       190       200   

>>CCDS46306.1 RAB1A gene_id:5861|Hs108|chr2               (205 aa)
 initn: 723 init1: 708 opt: 708  Z-score: 855.2  bits: 165.1 E(32554): 2.6e-41
Smith-Waterman score: 708; 58.9% identity (88.1% similar) in 168 aa overlap (6-173:8-175)

                 10        20        30        40        50        
pF1KB4   MAKKTYDLLFKLLLIGDSGVGKTCVLFRFSDDAFNTTFISTIGIDFKIKTVELQGKKI
              :: ::::::::::::::.:.:.::.::... ..:::::.::::.:.::.:: :
CCDS46 MSSMNPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDTYTESYISTIGVDFKIRTIELDGKTI
               10        20        30        40        50        60

       60        70        80        90       100       110        
pF1KB4 KLQIWDTAGQERFHTITTSYYRGAMGIMLVYDITNGKSFENISKWLRNIDEHANEDVERM
       :::::::::::::.:::.:::::: ::..:::.:. .::.:...::..::..:.:.:...
CCDS46 KLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQESFNNVKQWLQEIDRYASENVNKL
               70        80        90       100       110       120

      120       130       140       150       160       170        
pF1KB4 LLGNKCDMDDKRVVPKGKGEQIAREHGIRFFETSAKANINIEKAFLTLAEDILRKTPVKE
       :.:::::.  :.::    ....:   :: :.:::::   :.:..:.:.: .: ..     
CCDS46 LVGNKCDLTTKKVVDYTTAKEFADSLGIPFLETSAKNATNVEQSFMTMAAEIKKRMGPGA
              130       140       150       160       170       180

      180       190       200   
pF1KB4 PNSENVDISSGGGVTGWKSKCC   
                                
CCDS46 TAGGAEKSNVKIQSTPVKQSGGGCC
              190       200     

>>CCDS31613.1 RAB1B gene_id:81876|Hs108|chr11             (201 aa)
 initn: 695 init1: 695 opt: 699  Z-score: 844.6  bits: 163.2 E(32554): 1e-40
Smith-Waterman score: 699; 53.5% identity (80.8% similar) in 198 aa overlap (6-200:5-201)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB4 MAKKTYDLLFKLLLIGDSGVGKTCVLFRFSDDAFNTTFISTIGIDFKIKTVELQGKKIKL
            :: ::::::::::::::.:.:.::.::... ..:::::.::::.:.::.:: :::
CCDS31  MNPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDTYTESYISTIGVDFKIRTIELDGKTIKL
                10        20        30        40        50         

               70        80        90       100       110       120
pF1KB4 QIWDTAGQERFHTITTSYYRGAMGIMLVYDITNGKSFENISKWLRNIDEHANEDVERMLL
       :::::::::::.:::.:::::: ::..:::.:. .:. :...::..::..:.:.:...:.
CCDS31 QIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQESYANVKQWLQEIDRYASENVNKLLV
      60        70        80        90       100       110         

              130       140       150       160       170          
pF1KB4 GNKCDMDDKRVVPKGKGEQIAREHGIRFFETSAKANINIEKAFLTLAEDILRKT-PVKEP
       ::: :.  :.:: .  ....:   :: :.:::::   :.:.::.:.: .: ..  :    
CCDS31 GNKSDLTTKKVVDNTTAKEFADSLGIPFLETSAKNATNVEQAFMTMAAEIKKRMGPGAAS
     120       130       140       150       160       170         

     180         190       200
pF1KB4 NSE--NVDISSGGGVTGWKSKCC
       ..:  :. :.:   :    . ::
CCDS31 GGERPNLKIDSTP-VKPAGGGCC
     180       190        200 

>>CCDS76691.1 RAB15 gene_id:376267|Hs108|chr14            (212 aa)
 initn: 671 init1: 671 opt: 679  Z-score: 820.4  bits: 158.8 E(32554): 2.2e-39
Smith-Waterman score: 679; 55.8% identity (87.2% similar) in 172 aa overlap (1-172:1-171)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB4 MAKKTYDLLFKLLLIGDSGVGKTCVLFRFSDDAFNTTFISTIGIDFKIKTVELQGKKIKL
       :::. ::.::.:::::::::::::.: ::.:. :... :::::.:::.::.:..: :...
CCDS76 MAKQ-YDVLFRLLLIGDSGVGKTCLLCRFTDNEFHSSHISTIGVDFKMKTIEVDGIKVRI
                10        20        30        40        50         

               70        80        90       100       110       120
pF1KB4 QIWDTAGQERFHTITTSYYRGAMGIMLVYDITNGKSFENISKWLRNIDEHANEDVERMLL
       ::::::::::..::: .::: :.::.:::::.. .:...: ::. ..::.: : :...:.
CCDS76 QIWDTAGQERYQTITKQYYRRAQGIFLVYDISSERSYQHIMKWVSDVDEYAPEGVQKILI
      60        70        80        90       100       110         

              130       140       150       160       170       180
pF1KB4 GNKCDMDDKRVVPKGKGEQIAREHGIRFFETSAKANINIEKAFLTLAEDILRKTPVKEPN
       ::: : ..:: : . .:.:.:.:.:. :.:::: .:.::...:  :.: .:.        
CCDS76 GNKADEEQKRQVGREQGQQLAKEYGMDFYETSACTNLNIKESFTRLTELVLQAHRKELEG
     120       130       140       150       160       170         

              190       200             
pF1KB4 SENVDISSGGGVTGWKSKCC             
                                        
CCDS76 LRMRASNELALAELEEEEGKPEGPANSSKTCWC
     180       190       200       210  

>>CCDS41846.1 RAB35 gene_id:11021|Hs108|chr12             (201 aa)
 initn: 506 init1: 485 opt: 653  Z-score: 789.8  bits: 153.0 E(32554): 1.1e-37
Smith-Waterman score: 653; 47.5% identity (80.5% similar) in 200 aa overlap (4-200:3-201)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB4 MAKKTYDLLFKLLLIGDSGVGKTCVLFRFSDDAFNTTFISTIGIDFKIKTVELQGKKIKL
          . :: :::::.::::::::. .:.::.:..:. ..:.:::.::::.:::..:.:.::
CCDS41  MARDYDHLFKLLIIGDSGVGKSSLLLRFADNTFSGSYITTIGVDFKIRTVEINGEKVKL
                10        20        30        40        50         

               70        80        90       100       110       120
pF1KB4 QIWDTAGQERFHTITTSYYRGAMGIMLVYDITNGKSFENISKWLRNIDEHANEDVERMLL
       :::::::::::.:::..::::. :...:::.:...:: :...::..:... . :: :.:.
CCDS41 QIWDTAGQERFRTITSTYYRGTHGVIVVYDVTSAESFVNVKRWLHEINQNCD-DVCRILV
      60        70        80        90       100       110         

              130       140       150       160       170          
pF1KB4 GNKCDMDDKRVVPKGKGEQIAREHGIRFFETSAKANINIEKAFLTLAEDILRKTP---VK
       ::: :  ...::    . ..: . ::..:::::: :.:.:. :  ..: .::      .:
CCDS41 GNKNDDPERKVVETEDAYKFAGQMGIQLFETSAKENVNVEEMFNCITELVLRAKKDNLAK
      120       130       140       150       160       170        

       180       190       200
pF1KB4 EPNSENVDISSGGGVTGWKSKCC
       . .... :. .    .  :..::
CCDS41 QQQQQQNDVVKLTKNSKRKKRCC
      180       190       200 

>>CCDS12257.1 RAB3D gene_id:9545|Hs108|chr19              (219 aa)
 initn: 645 init1: 623 opt: 652  Z-score: 788.0  bits: 152.8 E(32554): 1.4e-37
Smith-Waterman score: 652; 50.3% identity (80.8% similar) in 193 aa overlap (2-194:15-201)

                            10        20        30        40       
pF1KB4              MAKKTYDLLFKLLLIGDSGVGKTCVLFRFSDDAFNTTFISTIGIDFK
                     : ...: .:::::::.:.::::  :::..::.:. .:.::.:::::
CCDS12 MASAGDTQAGPRDAADQNFDYMFKLLLIGNSSVGKTSFLFRYADDSFTPAFVSTVGIDFK
               10        20        30        40        50        60

        50        60        70        80        90       100       
pF1KB4 IKTVELQGKKIKLQIWDTAGQERFHTITTSYYRGAMGIMLVYDITNGKSFENISKWLRNI
       .:::  . :.:::::::::::::..::::.:::::::..:.:::.: .::  .. :  .:
CCDS12 VKTVYRHDKRIKLQIWDTAGQERYRTITTAYYRGAMGFLLMYDIANQESFAAVQDWATQI
               70        80        90       100       110       120

       110       120       130       140       150       160       
pF1KB4 DEHANEDVERMLLGNKCDMDDKRVVPKGKGEQIAREHGIRFFETSAKANINIEKAFLTLA
         .. .... .:.:::::..:.::::   :...: . :..:::.::: :::....:  :.
CCDS12 KTYSWDNAQVILVGNKCDLEDERVVPAEDGRRLADDLGFEFFEASAKENINVKQVFERLV
              130       140       150       160       170       180

       170       180       190       200            
pF1KB4 EDILRKTPVKEPNSENVDISSGGGVTGWKSKCC            
        :.     . :  .:... ::..: .:                  
CCDS12 -DV-----ICEKMNESLEPSSSSGSNGKGPAVGDAPAPQPSSCSC
                    190       200       210         

>>CCDS10460.1 RAB26 gene_id:25837|Hs108|chr16             (256 aa)
 initn: 646 init1: 493 opt: 646  Z-score: 779.8  bits: 151.5 E(32554): 4.1e-37
Smith-Waterman score: 646; 49.0% identity (77.0% similar) in 196 aa overlap (6-200:60-254)

                                        10        20        30     
pF1KB4                          MAKKTYDLLFKLLLIGDSGVGKTCVLFRFSDDAF-
                                     ::. ::..:.:::::::::.: ::.: :: 
CCDS10 RSGTALSGPDAPPNGPLQPGRPSLGGGVDFYDVAFKVMLVGDSGVGKTCLLVRFKDGAFL
      30        40        50        60        70        80         

           40        50        60        70        80        90    
pF1KB4 NTTFISTIGIDFKIKTVELQGKKIKLQIWDTAGQERFHTITTSYYRGAMGIMLVYDITNG
         :::::.::::. :.....: :.:::.:::::::::...: .::: : ...:.::.:: 
CCDS10 AGTFISTVGIDFRNKVLDVDGVKVKLQMWDTAGQERFRSVTHAYYRDAHALLLLYDVTNK
      90       100       110       120       130       140         

          100       110       120       130       140       150    
pF1KB4 KSFENISKWLRNIDEHANEDVERMLLGNKCDMDDKRVVPKGKGEQIAREHGIRFFETSAK
        ::.::. :: .: :.:..::  :::::: :   .::: .  ::..:.:.:. :.:::::
CCDS10 ASFDNIQAWLTEIHEYAQHDVALMLLGNKVDSAHERVVKREDGEKLAKEYGLPFMETSAK
     150       160       170       180       190       200         

          160       170       180       190       200  
pF1KB4 ANINIEKAFLTLAEDILRKTPVKEPNSENVDISSGGGVTGWKSKCC  
       ...:.. :: ..:.. :..  .: :.     . .     :  ..::  
CCDS10 TGLNVDLAFTAIAKE-LKQRSMKAPSEPRFRLHDYVKREGRGASCCRP
     210       220        230       240       250      




200 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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