Result of FASTA (ccds) for pF1KB3919
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB3919, 579 aa
  1>>>pF1KB3919 579 - 579 aa - 579 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.6083+/-0.000883; mu= 10.0561+/- 0.054
 mean_var=142.7385+/-29.549, 0's: 0 Z-trim(111.0): 47  B-trim: 0 in 0/52
 Lambda= 0.107350
 statistics sampled from 12011 (12054) to 12011 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.695), E-opt: 0.2 (0.37), width:  16
 Scan time:  3.920

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS5382.1 IGF2BP3 gene_id:10643|Hs108|chr7        ( 579) 3772 595.8  5e-170
CCDS11543.1 IGF2BP1 gene_id:10642|Hs108|chr17      ( 577) 2815 447.5 2.1e-125
CCDS3273.2 IGF2BP2 gene_id:10644|Hs108|chr3        ( 599) 1676 271.1 2.7e-72
CCDS77870.1 IGF2BP2 gene_id:10644|Hs108|chr3       ( 605) 1654 267.7 2.9e-71
CCDS33903.1 IGF2BP2 gene_id:10644|Hs108|chr3       ( 556) 1573 255.2 1.6e-67
CCDS54138.1 IGF2BP1 gene_id:10642|Hs108|chr17      ( 438) 1529 248.3 1.5e-65
CCDS77869.1 IGF2BP2 gene_id:10644|Hs108|chr3       ( 536) 1351 220.8 3.5e-57


>>CCDS5382.1 IGF2BP3 gene_id:10643|Hs108|chr7             (579 aa)
 initn: 3772 init1: 3772 opt: 3772  Z-score: 3166.0  bits: 595.8 E(32554): 5e-170
Smith-Waterman score: 3772; 100.0% identity (100.0% similar) in 579 aa overlap (1-579:1-579)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB3 MNKLYIGNLSENAAPSDLESIFKDAKIPVSGPFLVKTGYAFVDCPDESWALKAIEALSGK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 MNKLYIGNLSENAAPSDLESIFKDAKIPVSGPFLVKTGYAFVDCPDESWALKAIEALSGK
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB3 IELHGKPIEVEHSVPKRQRIRKLQIRNIPPHLQWEVLDSLLVQYGVVESCEQVNTDSETA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 IELHGKPIEVEHSVPKRQRIRKLQIRNIPPHLQWEVLDSLLVQYGVVESCEQVNTDSETA
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB3 VVNVTYSSKDQARQALDKLNGFQLENFTLKVAYIPDEMAAQQNPLQQPRGRRGLGQRGSS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 VVNVTYSSKDQARQALDKLNGFQLENFTLKVAYIPDEMAAQQNPLQQPRGRRGLGQRGSS
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB3 RQGSPGSVSKQKPCDLPLRLLVPTQFVGAIIGKEGATIRNITKQTQSKIDVHRKENAGAA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 RQGSPGSVSKQKPCDLPLRLLVPTQFVGAIIGKEGATIRNITKQTQSKIDVHRKENAGAA
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB3 EKSITILSTPEGTSAACKSILEIMHKEAQDIKFTEEIPLKILAHNNFVGRLIGKEGRNLK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 EKSITILSTPEGTSAACKSILEIMHKEAQDIKFTEEIPLKILAHNNFVGRLIGKEGRNLK
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB3 KIEQDTDTKITISPLQELTLYNPERTITVKGNVETCAKAEEEIMKKIRESYENDIASMNL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 KIEQDTDTKITISPLQELTLYNPERTITVKGNVETCAKAEEEIMKKIRESYENDIASMNL
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB3 QAHLIPGLNLNALGLFPPTSGMPPPTSGPPSAMTPPYPQFEQSETETVHLFIPALSVGAI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 QAHLIPGLNLNALGLFPPTSGMPPPTSGPPSAMTPPYPQFEQSETETVHLFIPALSVGAI
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB3 IGKQGQHIKQLSRFAGASIKIAPAEAPDAKVRMVIITGPPEAQFKAQGRIYGKIKEENFV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 IGKQGQHIKQLSRFAGASIKIAPAEAPDAKVRMVIITGPPEAQFKAQGRIYGKIKEENFV
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB3 SPKEEVKLEAHIRVPSFAAGRVIGKGGKTVNELQNLSSAEVVVPRDQTPDENDQVVVKIT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 SPKEEVKLEAHIRVPSFAAGRVIGKGGKTVNELQNLSSAEVVVPRDQTPDENDQVVVKIT
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570         
pF1KB3 GHFYACQVAQRKIQEILTQVKQHQQQKALQSGPPQSRRK
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 GHFYACQVAQRKIQEILTQVKQHQQQKALQSGPPQSRRK
              550       560       570         

>>CCDS11543.1 IGF2BP1 gene_id:10642|Hs108|chr17           (577 aa)
 initn: 2949 init1: 2709 opt: 2815  Z-score: 2365.0  bits: 447.5 E(32554): 2.1e-125
Smith-Waterman score: 2815; 74.4% identity (90.1% similar) in 585 aa overlap (1-579:1-577)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB3 MNKLYIGNLSENAAPSDLESIFKDAKIPVSGPFLVKTGYAFVDCPDESWALKAIEALSGK
       :::::::::.:...:.:::..: . ::  :: ::::.:::::::::: ::.::::..:::
CCDS11 MNKLYIGNLNESVTPADLEKVFAEHKISYSGQFLVKSGYAFVDCPDEHWAMKAIETFSGK
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB3 IELHGKPIEVEHSVPKRQRIRKLQIRNIPPHLQWEVLDSLLVQYGVVESCEQVNTDSETA
       .::.:: .:.::::::.:: ::.:::::::.:.::::::::.:::.::.::::::.::::
CCDS11 VELQGKRLEIEHSVPKKQRSRKIQIRNIPPQLRWEVLDSLLAQYGTVENCEQVNTESETA
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB3 VVNVTYSSKDQARQALDKLNGFQLENFTLKVAYIPDEMAAQQNPLQQPRGRRGLGQRGSS
       :::::::...:.:::. :::: :::: .:::.:::::. :: .: .  ::  :.:.::. 
CCDS11 VVNVTYSNREQTRQAIMKLNGHQLENHALKVSYIPDEQIAQ-GPENGRRG--GFGSRGQP
              130       140       150       160          170       

                 190       200       210       220       230       
pF1KB3 RQGSP---GSVSKQKPCDLPLRLLVPTQFVGAIIGKEGATIRNITKQTQSKIDVHRKENA
       :::::   :. .::.  :.:::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 RQGSPVAAGAPAKQQQVDIPLRLLVPTQYVGAIIGKEGATIRNITKQTQSKIDVHRKENA
       180       190       200       210       220       230       

       240       250       260       270       280       290       
pF1KB3 GAAEKSITILSTPEGTSAACKSILEIMHKEAQDIKFTEEIPLKILAHNNFVGRLIGKEGR
       :::::.:.. ::::: :.::: :::::::::.: : ..:.::::::::::::::::::::
CCDS11 GAAEKAISVHSTPEGCSSACKMILEIMHKEAKDTKTADEVPLKILAHNNFVGRLIGKEGR
       240       250       260       270       280       290       

       300       310       320       330       340       350       
pF1KB3 NLKKIEQDTDTKITISPLQELTLYNPERTITVKGNVETCAKAEEEIMKKIRESYENDIAS
       ::::.::::.:::::: ::.:::::::::::::: .:.: .::.:::::.::.::::.:.
CCDS11 NLKKVEQDTETKITISSLQDLTLYNPERTITVKGAIENCCRAEQEIMKKVREAYENDVAA
       300       310       320       330       340       350       

       360       370       380       390         400        410    
pF1KB3 MNLQAHLIPGLNLNALGLFPPTSGMPPPTSGPPSAMT--PPYPQFEQS-ETETVHLFIPA
       :.::.:::::::: :.:::: .:.  ::   :::..:   :: .: :. : : :..::::
CCDS11 MSLQSHLIPGLNLAAVGLFPASSSAVPP---PPSSVTGAAPYSSFMQAPEQEMVQVFIPA
       360       370       380          390       400       410    

          420       430       440       450       460       470    
pF1KB3 LSVGAIIGKQGQHIKQLSRFAGASIKIAPAEAPDAKVRMVIITGPPEAQFKAQGRIYGKI
        .:::::::.:::::::::::.::::::: :.::.::::::::::::::::::::::::.
CCDS11 QAVGAIIGKKGQHIKQLSRFASASIKIAPPETPDSKVRMVIITGPPEAQFKAQGRIYGKL
          420       430       440       450       460       470    

          480       490       500       510       520       530    
pF1KB3 KEENFVSPKEEVKLEAHIRVPSFAAGRVIGKGGKTVNELQNLSSAEVVVPRDQTPDENDQ
       ::::: .::::::::.:::::. :::::::::::::::::::..::::::::::::::::
CCDS11 KEENFFGPKEEVKLETHIRVPASAAGRVIGKGGKTVNELQNLTAAEVVVPRDQTPDENDQ
          480       490       500       510       520       530    

          540       550       560       570         
pF1KB3 VVVKITGHFYACQVAQRKIQEILTQVKQHQQQKALQSGPPQSRRK
       :.::: ::::: :.:::::..::.:::: :.::. ::.  :.:::
CCDS11 VIVKIIGHFYASQMAQRKIRDILAQVKQ-QHQKG-QSNQAQARRK
          540       550       560         570       

>>CCDS3273.2 IGF2BP2 gene_id:10644|Hs108|chr3             (599 aa)
 initn: 2569 init1: 942 opt: 1676  Z-score: 1411.4  bits: 271.1 E(32554): 2.7e-72
Smith-Waterman score: 2496; 65.1% identity (85.8% similar) in 604 aa overlap (1-579:2-599)

                10        20        30        40        50         
pF1KB3  MNKLYIGNLSENAAPSDLESIFKDAKIPVSGPFLVKTGYAFVDCPDESWALKAIEALSG
        ::::::::::  .. .::...: : :.:..:  :.:.:::::: ::..::..:::.:::
CCDS32 MMNKLYIGNLSPAVTADDLRQLFGDRKLPLAGQVLLKSGYAFVDYPDQNWAIRAIETLSG
               10        20        30        40        50        60

      60        70        80        90       100       110         
pF1KB3 KIELHGKPIEVEHSVPKRQRIRKLQIRNIPPHLQWEVLDSLLVQYGVVESCEQVNTDSET
       :.::::: .::..:: :. : ::.:::::::::::::::.::.:::.::. ::::::.::
CCDS32 KVELHGKIMEVDYSVSKKLRSRKIQIRNIPPHLQWEVLDGLLAQYGTVENVEQVNTDTET
               70        80        90       100       110       120

     120       130       140       150       160       170         
pF1KB3 AVVNVTYSSKDQARQALDKLNGFQLENFTLKVAYIPDEMAAQQNPLQQPRGRRGLGQRGS
       :::::::.....:. :..::.: :.::...:..::::: ... .: :  :..::  ...:
CCDS32 AVVNVTYATREEAKIAMEKLSGHQFENYSFKISYIPDEEVSSPSPPQ--RAQRG--DHSS
              130       140       150       160         170        

     180        190       200       210       220       230        
pF1KB3 SRQG-SPGSVSKQKPCDLPLRLLVPTQFVGAIIGKEGATIRNITKQTQSKIDVHRKENAG
        .:: .::..:. .  :.:::.::::::::::::::: ::.::::::::..:.:::::.:
CCDS32 REQGHAPGGTSQARQIDFPLRILVPTQFVGAIIGKEGLTIKNITKQTQSRVDIHRKENSG
        180       190       200       210       220       230      

      240       250       260       270       280       290        
pF1KB3 AAEKSITILSTPEGTSAACKSILEIMHKEAQDIKFTEEIPLKILAHNNFVGRLIGKEGRN
       :::: .:: .:::::: ::. :::::.:::.. :..:::::::::::..:::::::::::
CCDS32 AAEKPVTIHATPEGTSEACRMILEIMQKEADETKLAEEIPLKILAHNGLVGRLIGKEGRN
        240       250       260       270       280       290      

      300       310       320       330       340       350        
pF1KB3 LKKIEQDTDTKITISPLQELTLYNPERTITVKGNVETCAKAEEEIMKKIRESYENDIASM
       :::::..: :::::: ::.:..:::::::::::.::.::.:: :::::.::..:::. ..
CCDS32 LKKIEHETGTKITISSLQDLSIYNPERTITVKGTVEACASAEIEIMKKLREAFENDMLAV
        300       310       320       330       340       350      

      360       370               380                 390          
pF1KB3 NLQAHLIPGLNLNALGLF--------PPTS--GMPPPT--------SGPPSAMTP-----
       : ::.:::::::.:::.:        ::..  : :: .        ::  :.. :     
CCDS32 NQQANLIPGLNLSALGIFSTGLSVLSPPAGPRGAPPAAPYHPFTTHSGYFSSLYPHHQFG
        360       370       380       390       400       410      

         400        410       420       430       440       450    
pF1KB3 PYPQFEQ-SETETVHLFIPALSVGAIIGKQGQHIKQLSRFAGASIKIAPAEAPDAKVRMV
       :.:. ..  : : :.::::. .:::::::.: :::::.:::::::::::::.::.. :::
CCDS32 PFPHHHSYPEQEIVNLFIPTQAVGAIIGKKGAHIKQLARFAGASIKIAPAEGPDVSERMV
        420       430       440       450       460       470      

          460       470       480       490       500       510    
pF1KB3 IITGPPEAQFKAQGRIYGKIKEENFVSPKEEVKLEAHIRVPSFAAGRVIGKGGKTVNELQ
       ::::::::::::::::.::.::::: .::::::::::::::: .::::::::::::::::
CCDS32 IITGPPEAQFKAQGRIFGKLKEENFFNPKEEVKLEAHIRVPSSTAGRVIGKGGKTVNELQ
        480       490       500       510       520       530      

          520       530       540       550       560       570    
pF1KB3 NLSSAEVVVPRDQTPDENDQVVVKITGHFYACQVAQRKIQEILTQVKQHQQQKALQSGPP
       ::.::::.::::::::::..:.:.: :::.: :.:::::.::. :::: :.::  : :  
CCDS32 NLTSAEVIVPRDQTPDENEEVIVRIIGHFFASQTAQRKIREIVQQVKQ-QEQKYPQ-GVA
        540       550       560       570       580        590     

            
pF1KB3 QSRRK
       ..: :
CCDS32 SQRSK
            

>>CCDS77870.1 IGF2BP2 gene_id:10644|Hs108|chr3            (605 aa)
 initn: 2560 init1: 942 opt: 1654  Z-score: 1393.0  bits: 267.7 E(32554): 2.9e-71
Smith-Waterman score: 2474; 64.4% identity (84.9% similar) in 610 aa overlap (1-579:2-605)

                10        20        30        40        50         
pF1KB3  MNKLYIGNLSENAAPSDLESIFKDAKIPVSGPFLVKTGYAFVDCPDESWALKAIEALSG
        ::::::::::  .. .::...: : :.:..:  :.:.:::::: ::..::..:::.:::
CCDS77 MMNKLYIGNLSPAVTADDLRQLFGDRKLPLAGQVLLKSGYAFVDYPDQNWAIRAIETLSG
               10        20        30        40        50        60

      60        70        80        90       100       110         
pF1KB3 KIELHGKPIEVEHSVPKRQRIRKLQIRNIPPHLQWEVLDSLLVQYGVVESCEQV------
       :.::::: .::..:: :. : ::.:::::::::::::::.::.:::.::. :::      
CCDS77 KVELHGKIMEVDYSVSKKLRSRKIQIRNIPPHLQWEVLDGLLAQYGTVENVEQVFAFSLV
               70        80        90       100       110       120

           120       130       140       150       160       170   
pF1KB3 NTDSETAVVNVTYSSKDQARQALDKLNGFQLENFTLKVAYIPDEMAAQQNPLQQPRGRRG
       :::.:::::::::.....:. :..::.: :.::...:..::::: ... .: :  :..::
CCDS77 NTDTETAVVNVTYATREEAKIAMEKLSGHQFENYSFKISYIPDEEVSSPSPPQ--RAQRG
              130       140       150       160       170          

           180        190       200       210       220       230  
pF1KB3 LGQRGSSRQG-SPGSVSKQKPCDLPLRLLVPTQFVGAIIGKEGATIRNITKQTQSKIDVH
         ...: .:: .::..:. .  :.:::.::::::::::::::: ::.::::::::..:.:
CCDS77 --DHSSREQGHAPGGTSQARQIDFPLRILVPTQFVGAIIGKEGLTIKNITKQTQSRVDIH
        180       190       200       210       220       230      

            240       250       260       270       280       290  
pF1KB3 RKENAGAAEKSITILSTPEGTSAACKSILEIMHKEAQDIKFTEEIPLKILAHNNFVGRLI
       ::::.::::: .:: .:::::: ::. :::::.:::.. :..:::::::::::..:::::
CCDS77 RKENSGAAEKPVTIHATPEGTSEACRMILEIMQKEADETKLAEEIPLKILAHNGLVGRLI
        240       250       260       270       280       290      

            300       310       320       330       340       350  
pF1KB3 GKEGRNLKKIEQDTDTKITISPLQELTLYNPERTITVKGNVETCAKAEEEIMKKIRESYE
       :::::::::::..: :::::: ::.:..:::::::::::.::.::.:: :::::.::..:
CCDS77 GKEGRNLKKIEHETGTKITISSLQDLSIYNPERTITVKGTVEACASAEIEIMKKLREAFE
        300       310       320       330       340       350      

            360       370               380                 390    
pF1KB3 NDIASMNLQAHLIPGLNLNALGLF--------PPTS--GMPPPT--------SGPPSAMT
       ::. ..: ::.:::::::.:::.:        ::..  : :: .        ::  :.. 
CCDS77 NDMLAVNQQANLIPGLNLSALGIFSTGLSVLSPPAGPRGAPPAAPYHPFTTHSGYFSSLY
        360       370       380       390       400       410      

               400        410       420       430       440        
pF1KB3 P-----PYPQFEQ-SETETVHLFIPALSVGAIIGKQGQHIKQLSRFAGASIKIAPAEAPD
       :     :.:. ..  : : :.::::. .:::::::.: :::::.:::::::::::::.::
CCDS77 PHHQFGPFPHHHSYPEQEIVNLFIPTQAVGAIIGKKGAHIKQLARFAGASIKIAPAEGPD
        420       430       440       450       460       470      

      450       460       470       480       490       500        
pF1KB3 AKVRMVIITGPPEAQFKAQGRIYGKIKEENFVSPKEEVKLEAHIRVPSFAAGRVIGKGGK
       .. :::::::::::::::::::.::.::::: .::::::::::::::: .::::::::::
CCDS77 VSERMVIITGPPEAQFKAQGRIFGKLKEENFFNPKEEVKLEAHIRVPSSTAGRVIGKGGK
        480       490       500       510       520       530      

      510       520       530       540       550       560        
pF1KB3 TVNELQNLSSAEVVVPRDQTPDENDQVVVKITGHFYACQVAQRKIQEILTQVKQHQQQKA
       ::::::::.::::.::::::::::..:.:.: :::.: :.:::::.::. :::: :.:: 
CCDS77 TVNELQNLTSAEVIVPRDQTPDENEEVIVRIIGHFFASQTAQRKIREIVQQVKQ-QEQKY
        540       550       560       570       580       590      

      570         
pF1KB3 LQSGPPQSRRK
        : :  ..: :
CCDS77 PQ-GVASQRSK
          600     

>>CCDS33903.1 IGF2BP2 gene_id:10644|Hs108|chr3            (556 aa)
 initn: 2371 init1: 841 opt: 1573  Z-score: 1325.7  bits: 255.2 E(32554): 1.6e-67
Smith-Waterman score: 2390; 65.1% identity (85.4% similar) in 581 aa overlap (1-579:2-556)

                10        20        30        40        50         
pF1KB3  MNKLYIGNLSENAAPSDLESIFKDAKIPVSGPFLVKTGYAFVDCPDESWALKAIEALSG
        ::::::::::  .. .::...: : :.:..:  :.:.:::::: ::..::..:::.:::
CCDS33 MMNKLYIGNLSPAVTADDLRQLFGDRKLPLAGQVLLKSGYAFVDYPDQNWAIRAIETLSG
               10        20        30        40        50        60

      60        70        80        90       100       110         
pF1KB3 KIELHGKPIEVEHSVPKRQRIRKLQIRNIPPHLQWEVLDSLLVQYGVVESCEQVNTDSET
       :.::::: .::..:: :. : ::.:::::::::::::::.::.:::.::. ::::::.::
CCDS33 KVELHGKIMEVDYSVSKKLRSRKIQIRNIPPHLQWEVLDGLLAQYGTVENVEQVNTDTET
               70        80        90       100       110       120

     120       130       140       150       160       170         
pF1KB3 AVVNVTYSSKDQARQALDKLNGFQLENFTLKVAYIPDEMAAQQNPLQQPRGRRGLGQRGS
       :::::::.....:. :..::.: :.::...:..::::: ... .: :  :..::  ...:
CCDS33 AVVNVTYATREEAKIAMEKLSGHQFENYSFKISYIPDEEVSSPSPPQ--RAQRG--DHSS
              130       140       150       160         170        

     180        190       200       210       220       230        
pF1KB3 SRQG-SPGSVSKQKPCDLPLRLLVPTQFVGAIIGKEGATIRNITKQTQSKIDVHRKENAG
        .:: .::..:. .  :.:::.::::::::::::::: ::.::::::::..:.:::::.:
CCDS33 REQGHAPGGTSQARQIDFPLRILVPTQFVGAIIGKEGLTIKNITKQTQSRVDIHRKENSG
        180       190       200       210       220       230      

      240       250       260       270       280       290        
pF1KB3 AAEKSITILSTPEGTSAACKSILEIMHKEAQDIKFTEEIPLKILAHNNFVGRLIGKEGRN
       :::: .:: .:::::: ::. :::::.:::.. :..:::::::::::..:::::::::::
CCDS33 AAEKPVTIHATPEGTSEACRMILEIMQKEADETKLAEEIPLKILAHNGLVGRLIGKEGRN
        240       250       260       270       280       290      

      300       310       320       330       340       350        
pF1KB3 LKKIEQDTDTKITISPLQELTLYNPERTITVKGNVETCAKAEEEIMKKIRESYENDIASM
       :::::..: :::::: ::.:..:::::::::::.::.::.:: :::::.::..:::. ..
CCDS33 LKKIEHETGTKITISSLQDLSIYNPERTITVKGTVEACASAEIEIMKKLREAFENDMLAV
        300       310       320       330       340       350      

      360       370       380        390       400       410       
pF1KB3 NLQAHLIPGLNLNALGLFPPTSGMPPPTSGP-PSAMTPPYPQFEQSETETVHLFIPALSV
       : ..           : :  .: .:    :: :   .  ::     : : :.::::. .:
CCDS33 NTHS-----------GYF--SSLYPHHQFGPFPHHHS--YP-----EQEIVNLFIPTQAV
        360                    370       380              390      

       420       430       440       450       460       470       
pF1KB3 GAIIGKQGQHIKQLSRFAGASIKIAPAEAPDAKVRMVIITGPPEAQFKAQGRIYGKIKEE
       ::::::.: :::::.:::::::::::::.::.. :::::::::::::::::::.::.:::
CCDS33 GAIIGKKGAHIKQLARFAGASIKIAPAEGPDVSERMVIITGPPEAQFKAQGRIFGKLKEE
        400       410       420       430       440       450      

       480       490       500       510       520       530       
pF1KB3 NFVSPKEEVKLEAHIRVPSFAAGRVIGKGGKTVNELQNLSSAEVVVPRDQTPDENDQVVV
       :: .::::::::::::::: .::::::::::::::::::.::::.::::::::::..:.:
CCDS33 NFFNPKEEVKLEAHIRVPSSTAGRVIGKGGKTVNELQNLTSAEVIVPRDQTPDENEEVIV
        460       470       480       490       500       510      

       540       550       560       570         
pF1KB3 KITGHFYACQVAQRKIQEILTQVKQHQQQKALQSGPPQSRRK
       .: :::.: :.:::::.::. :::: :.::  : :  ..: :
CCDS33 RIIGHFFASQTAQRKIREIVQQVKQ-QEQKYPQ-GVASQRSK
        520       530       540         550      

>>CCDS54138.1 IGF2BP1 gene_id:10642|Hs108|chr17           (438 aa)
 initn: 2316 init1: 1456 opt: 1529  Z-score: 1290.4  bits: 248.3 E(32554): 1.5e-65
Smith-Waterman score: 1921; 57.6% identity (69.9% similar) in 582 aa overlap (1-579:1-438)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB3 MNKLYIGNLSENAAPSDLESIFKDAKIPVSGPFLVKTGYAFVDCPDESWALKAIEALSGK
       :::::::::.:...:.:::..: . ::  :: ::::.:::::::::: ::.::::..:::
CCDS54 MNKLYIGNLNESVTPADLEKVFAEHKISYSGQFLVKSGYAFVDCPDEHWAMKAIETFSGK
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB3 IELHGKPIEVEHSVPKRQRIRKLQIRNIPPHLQWEVLDSLLVQYGVVESCEQVNTDSETA
       .::.:: .:.::::::.:: ::.:::::::.:.::::::::.:::.::.::::::.::::
CCDS54 VELQGKRLEIEHSVPKKQRSRKIQIRNIPPQLRWEVLDSLLAQYGTVENCEQVNTESETA
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB3 VVNVTYSSKDQARQALDKLNGFQLENFTLKVAYIPDEMAAQQNPLQQPRGRRGLGQRGSS
       :::::::...:.:::                                             
CCDS54 VVNVTYSNREQTRQA---------------------------------------------
              130                                                  

              190       200       210       220       230       240
pF1KB3 RQGSPGSVSKQKPCDLPLRLLVPTQFVGAIIGKEGATIRNITKQTQSKIDVHRKENAGAA
                                                                   
CCDS54 ------------------------------------------------------------
                                                                   

              250       260       270       280       290       300
pF1KB3 EKSITILSTPEGTSAACKSILEIMHKEAQDIKFTEEIPLKILAHNNFVGRLIGKEGRNLK
                                         .:.:::::::::::::::::::::::
CCDS54 ----------------------------------DEVPLKILAHNNFVGRLIGKEGRNLK
                                           140       150       160 

              310       320       330       340       350       360
pF1KB3 KIEQDTDTKITISPLQELTLYNPERTITVKGNVETCAKAEEEIMKKIRESYENDIASMNL
       :.::::.:::::: ::.:::::::::::::: .:.: .::.:::::.::.::::.:.:.:
CCDS54 KVEQDTETKITISSLQDLTLYNPERTITVKGAIENCCRAEQEIMKKVREAYENDVAAMSL
             170       180       190       200       210       220 

              370       380       390         400        410       
pF1KB3 QAHLIPGLNLNALGLFPPTSGMPPPTSGPPSAMT--PPYPQFEQS-ETETVHLFIPALSV
       :.:::::::: :.:::: .:.  ::   :::..:   :: .: :. : : :..:::: .:
CCDS54 QSHLIPGLNLAAVGLFPASSSAVPP---PPSSVTGAAPYSSFMQAPEQEMVQVFIPAQAV
             230       240          250       260       270        

       420       430       440       450       460       470       
pF1KB3 GAIIGKQGQHIKQLSRFAGASIKIAPAEAPDAKVRMVIITGPPEAQFKAQGRIYGKIKEE
       ::::::.:::::::::::.::::::: :.::.::::::::::::::::::::::::.:::
CCDS54 GAIIGKKGQHIKQLSRFASASIKIAPPETPDSKVRMVIITGPPEAQFKAQGRIYGKLKEE
      280       290       300       310       320       330        

       480       490       500       510       520       530       
pF1KB3 NFVSPKEEVKLEAHIRVPSFAAGRVIGKGGKTVNELQNLSSAEVVVPRDQTPDENDQVVV
       :: .::::::::.:::::. :::::::::::::::::::..:::::::::::::::::.:
CCDS54 NFFGPKEEVKLETHIRVPASAAGRVIGKGGKTVNELQNLTAAEVVVPRDQTPDENDQVIV
      340       350       360       370       380       390        

       540       550       560       570         
pF1KB3 KITGHFYACQVAQRKIQEILTQVKQHQQQKALQSGPPQSRRK
       :: ::::: :.:::::..::.:::: :.::. ::.  :.:::
CCDS54 KIIGHFYASQMAQRKIRDILAQVKQ-QHQKG-QSNQAQARRK
      400       410       420         430        

>>CCDS77869.1 IGF2BP2 gene_id:10644|Hs108|chr3            (536 aa)
 initn: 2244 init1: 942 opt: 1351  Z-score: 1140.1  bits: 220.8 E(32554): 3.5e-57
Smith-Waterman score: 2171; 66.0% identity (85.9% similar) in 524 aa overlap (81-579:19-536)

               60        70        80        90       100       110
pF1KB3 LKAIEALSGKIELHGKPIEVEHSVPKRQRIRKLQIRNIPPHLQWEVLDSLLVQYGVVESC
                                     ::.:::::::::::::::.::.:::.::. 
CCDS77             MFSCPGHYHVDGFLNPGSRKIQIRNIPPHLQWEVLDGLLAQYGTVENV
                           10        20        30        40        

              120       130       140       150       160       170
pF1KB3 EQVNTDSETAVVNVTYSSKDQARQALDKLNGFQLENFTLKVAYIPDEMAAQQNPLQQPRG
       ::::::.:::::::::.....:. :..::.: :.::...:..::::: ... .: :  :.
CCDS77 EQVNTDTETAVVNVTYATREEAKIAMEKLSGHQFENYSFKISYIPDEEVSSPSPPQ--RA
       50        60        70        80        90       100        

              180        190       200       210       220         
pF1KB3 RRGLGQRGSSRQG-SPGSVSKQKPCDLPLRLLVPTQFVGAIIGKEGATIRNITKQTQSKI
       .::  ...: .:: .::..:. .  :.:::.::::::::::::::: ::.::::::::..
CCDS77 QRG--DHSSREQGHAPGGTSQARQIDFPLRILVPTQFVGAIIGKEGLTIKNITKQTQSRV
          110       120       130       140       150       160    

     230       240       250       260       270       280         
pF1KB3 DVHRKENAGAAEKSITILSTPEGTSAACKSILEIMHKEAQDIKFTEEIPLKILAHNNFVG
       :.:::::.::::: .:: .:::::: ::. :::::.:::.. :..:::::::::::..::
CCDS77 DIHRKENSGAAEKPVTIHATPEGTSEACRMILEIMQKEADETKLAEEIPLKILAHNGLVG
          170       180       190       200       210       220    

     290       300       310       320       330       340         
pF1KB3 RLIGKEGRNLKKIEQDTDTKITISPLQELTLYNPERTITVKGNVETCAKAEEEIMKKIRE
       ::::::::::::::..: :::::: ::.:..:::::::::::.::.::.:: :::::.::
CCDS77 RLIGKEGRNLKKIEHETGTKITISSLQDLSIYNPERTITVKGTVEACASAEIEIMKKLRE
          230       240       250       260       270       280    

     350       360       370               380                 390 
pF1KB3 SYENDIASMNLQAHLIPGLNLNALGLF--------PPTS--GMPPPT--------SGPPS
       ..:::. ..: ::.:::::::.:::.:        ::..  : :: .        ::  :
CCDS77 AFENDMLAVNQQANLIPGLNLSALGIFSTGLSVLSPPAGPRGAPPAAPYHPFTTHSGYFS
          290       300       310       320       330       340    

                  400        410       420       430       440     
pF1KB3 AMTP-----PYPQFEQ-SETETVHLFIPALSVGAIIGKQGQHIKQLSRFAGASIKIAPAE
       .. :     :.:. ..  : : :.::::. .:::::::.: :::::.:::::::::::::
CCDS77 SLYPHHQFGPFPHHHSYPEQEIVNLFIPTQAVGAIIGKKGAHIKQLARFAGASIKIAPAE
          350       360       370       380       390       400    

         450       460       470       480       490       500     
pF1KB3 APDAKVRMVIITGPPEAQFKAQGRIYGKIKEENFVSPKEEVKLEAHIRVPSFAAGRVIGK
       .::.. :::::::::::::::::::.::.::::: .::::::::::::::: .:::::::
CCDS77 GPDVSERMVIITGPPEAQFKAQGRIFGKLKEENFFNPKEEVKLEAHIRVPSSTAGRVIGK
          410       420       430       440       450       460    

         510       520       530       540       550       560     
pF1KB3 GGKTVNELQNLSSAEVVVPRDQTPDENDQVVVKITGHFYACQVAQRKIQEILTQVKQHQQ
       :::::::::::.::::.::::::::::..:.:.: :::.: :.:::::.::. :::: :.
CCDS77 GGKTVNELQNLTSAEVIVPRDQTPDENEEVIVRIIGHFFASQTAQRKIREIVQQVKQ-QE
          470       480       490       500       510       520    

         570         
pF1KB3 QKALQSGPPQSRRK
       ::  : :  ..: :
CCDS77 QKYPQ-GVASQRSK
            530      




579 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Sat Nov  5 05:27:08 2016 done: Sat Nov  5 05:27:09 2016
 Total Scan time:  3.920 Total Display time:  0.100

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
Inquiries or Suggestions ?
Send a message to flexiclone AT kazusagt.com