Result of FASTA (ccds) for pF1KB3331
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB3331, 514 aa
  1>>>pF1KB3331 514 - 514 aa - 514 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.0369+/-0.00118; mu= 5.0900+/- 0.069
 mean_var=178.8258+/-38.102, 0's: 0 Z-trim(107.5): 191  B-trim: 6 in 1/50
 Lambda= 0.095909
 statistics sampled from 9367 (9587) to 9367 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.659), E-opt: 0.2 (0.294), width:  16
 Scan time:  3.260

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS34083.1 PLRG1 gene_id:5356|Hs108|chr4          ( 514) 3484 495.0 8.2e-140
CCDS56341.1 PLRG1 gene_id:5356|Hs108|chr4          ( 505) 2770 396.2 4.5e-110
CCDS6981.1 WDR5 gene_id:11091|Hs108|chr9           ( 334)  501 82.1   1e-15
CCDS3012.1 WDR5B gene_id:54554|Hs108|chr3          ( 330)  486 80.1 4.4e-15
CCDS10788.1 KATNB1 gene_id:10300|Hs108|chr16       ( 655)  462 77.0 7.4e-14
CCDS43876.1 WDR38 gene_id:401551|Hs108|chr9        ( 314)  431 72.4 8.2e-13
CCDS75898.1 WDR38 gene_id:401551|Hs108|chr9        ( 315)  419 70.8 2.6e-12
CCDS32528.1 PAFAH1B1 gene_id:5048|Hs108|chr17      ( 410)  392 67.1 4.3e-11
CCDS34078.1 FBXW7 gene_id:55294|Hs108|chr4         ( 589)  390 67.0 6.8e-11
CCDS3778.1 FBXW7 gene_id:55294|Hs108|chr4          ( 627)  390 67.0 7.2e-11
CCDS59142.1 PRPF4 gene_id:9128|Hs108|chr9          ( 521)  388 66.7 7.5e-11
CCDS6791.1 PRPF4 gene_id:9128|Hs108|chr9           ( 522)  388 66.7 7.5e-11
CCDS3777.1 FBXW7 gene_id:55294|Hs108|chr4          ( 707)  390 67.0 7.8e-11


>>CCDS34083.1 PLRG1 gene_id:5356|Hs108|chr4               (514 aa)
 initn: 3484 init1: 3484 opt: 3484  Z-score: 2623.5  bits: 495.0 E(32554): 8.2e-140
Smith-Waterman score: 3484; 100.0% identity (100.0% similar) in 514 aa overlap (1-514:1-514)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB3 MVEEVQKHSVHTLVFRSLKRTHDMFVADNGKPVPLDEESHKRKMAIKLRNEYGPVLHMPT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MVEEVQKHSVHTLVFRSLKRTHDMFVADNGKPVPLDEESHKRKMAIKLRNEYGPVLHMPT
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB3 SKENLKEKGPQNATDSYVHKQYPANQGQEVEYFVAGTHPYPPGPGVALTADTKIQRMPSE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 SKENLKEKGPQNATDSYVHKQYPANQGQEVEYFVAGTHPYPPGPGVALTADTKIQRMPSE
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB3 SAAQSLAVALPLQTKADANRTAPSGSEYRHPGASDRPQPTAMNSIVMETGNTKNSALMAK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 SAAQSLAVALPLQTKADANRTAPSGSEYRHPGASDRPQPTAMNSIVMETGNTKNSALMAK
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB3 KAPTMPKPQWHPPWKLYRVISGHLGWVRCIAVEPGNQWFVTGSADRTIKIWDLASGKLKL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 KAPTMPKPQWHPPWKLYRVISGHLGWVRCIAVEPGNQWFVTGSADRTIKIWDLASGKLKL
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB3 SLTGHISTVRGVIVSTRSPYLFSCGEDKQVKCWDLEYNKVIRHYHGHLSAVYGLDLHPTI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 SLTGHISTVRGVIVSTRSPYLFSCGEDKQVKCWDLEYNKVIRHYHGHLSAVYGLDLHPTI
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB3 DVLVTCSRDSTARIWDVRTKASVHTLSGHTNAVATVRCQAAEPQIITGSHDTTIRLWDLV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 DVLVTCSRDSTARIWDVRTKASVHTLSGHTNAVATVRCQAAEPQIITGSHDTTIRLWDLV
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB3 AGKTRVTLTNHKKSVRAVVLHPRHYTFASGSPDNIKQWKFPDGSFIQNLSGHNAIINTLT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 AGKTRVTLTNHKKSVRAVVLHPRHYTFASGSPDNIKQWKFPDGSFIQNLSGHNAIINTLT
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB3 VNSDGVLVSGADNGTMHLWDWRTGYNFQRVHAAVQPGSLDSESGIFACAFDQSESRLLTA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 VNSDGVLVSGADNGTMHLWDWRTGYNFQRVHAAVQPGSLDSESGIFACAFDQSESRLLTA
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510    
pF1KB3 EADKTIKVYREDDTATEETHPVSWKPEIIKRKRF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 EADKTIKVYREDDTATEETHPVSWKPEIIKRKRF
              490       500       510    

>>CCDS56341.1 PLRG1 gene_id:5356|Hs108|chr4               (505 aa)
 initn: 2770 init1: 2770 opt: 2770  Z-score: 2089.7  bits: 396.2 E(32554): 4.5e-110
Smith-Waterman score: 3377; 98.2% identity (98.2% similar) in 514 aa overlap (1-514:1-505)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB3 MVEEVQKHSVHTLVFRSLKRTHDMFVADNGKPVPLDEESHKRKMAIKLRNEYGPVLHMPT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 MVEEVQKHSVHTLVFRSLKRTHDMFVADNGKPVPLDEESHKRKMAIKLRNEYGPVLHMPT
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB3 SKENLKEKGPQNATDSYVHKQYPANQGQEVEYFVAGTHPYPPGPGVALTADTKIQRMPSE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::         :::::::::::::::
CCDS56 SKENLKEKGPQNATDSYVHKQYPANQGQEVEYFVAG---------VALTADTKIQRMPSE
               70        80        90                100       110 

              130       140       150       160       170       180
pF1KB3 SAAQSLAVALPLQTKADANRTAPSGSEYRHPGASDRPQPTAMNSIVMETGNTKNSALMAK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 SAAQSLAVALPLQTKADANRTAPSGSEYRHPGASDRPQPTAMNSIVMETGNTKNSALMAK
             120       130       140       150       160       170 

              190       200       210       220       230       240
pF1KB3 KAPTMPKPQWHPPWKLYRVISGHLGWVRCIAVEPGNQWFVTGSADRTIKIWDLASGKLKL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 KAPTMPKPQWHPPWKLYRVISGHLGWVRCIAVEPGNQWFVTGSADRTIKIWDLASGKLKL
             180       190       200       210       220       230 

              250       260       270       280       290       300
pF1KB3 SLTGHISTVRGVIVSTRSPYLFSCGEDKQVKCWDLEYNKVIRHYHGHLSAVYGLDLHPTI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 SLTGHISTVRGVIVSTRSPYLFSCGEDKQVKCWDLEYNKVIRHYHGHLSAVYGLDLHPTI
             240       250       260       270       280       290 

              310       320       330       340       350       360
pF1KB3 DVLVTCSRDSTARIWDVRTKASVHTLSGHTNAVATVRCQAAEPQIITGSHDTTIRLWDLV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 DVLVTCSRDSTARIWDVRTKASVHTLSGHTNAVATVRCQAAEPQIITGSHDTTIRLWDLV
             300       310       320       330       340       350 

              370       380       390       400       410       420
pF1KB3 AGKTRVTLTNHKKSVRAVVLHPRHYTFASGSPDNIKQWKFPDGSFIQNLSGHNAIINTLT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 AGKTRVTLTNHKKSVRAVVLHPRHYTFASGSPDNIKQWKFPDGSFIQNLSGHNAIINTLT
             360       370       380       390       400       410 

              430       440       450       460       470       480
pF1KB3 VNSDGVLVSGADNGTMHLWDWRTGYNFQRVHAAVQPGSLDSESGIFACAFDQSESRLLTA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 VNSDGVLVSGADNGTMHLWDWRTGYNFQRVHAAVQPGSLDSESGIFACAFDQSESRLLTA
             420       430       440       450       460       470 

              490       500       510    
pF1KB3 EADKTIKVYREDDTATEETHPVSWKPEIIKRKRF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 EADKTIKVYREDDTATEETHPVSWKPEIIKRKRF
             480       490       500     

>>CCDS6981.1 WDR5 gene_id:11091|Hs108|chr9                (334 aa)
 initn: 371 init1: 371 opt: 501  Z-score: 395.4  bits: 82.1 E(32554): 1e-15
Smith-Waterman score: 501; 26.7% identity (60.6% similar) in 348 aa overlap (153-492:2-333)

            130       140       150       160       170       180  
pF1KB3 AQSLAVALPLQTKADANRTAPSGSEYRHPGASDRPQPTAMNSIVMETGNTKNSALMAKKA
                                     :... .: .  . .. : ..  :: ..: .
CCDS69                              MATEEKKPETEAARAQPTPSS--SATQSKPT
                                            10        20           

            190       200       210       220       230       240  
pF1KB3 PTMPKPQWHPPWKLYRVISGHLGWVRCIAVEPGNQWFVTGSADRTIKIWDLASGKLKLSL
       :. :.      . :  ...::   :  .   :...:....:::. ::::   .::.. ..
CCDS69 PVKPN------YALKFTLAGHTKAVSSVKFSPNGEWLASSSADKLIKIWGAYDGKFEKTI
      30              40        50        60        70        80   

            250       260       270       280       290       300  
pF1KB3 TGHISTVRGVIVSTRSPYLFSCGEDKQVKCWDLEYNKVIRHYHGHLSAVYGLDLHPTIDV
       .::   .  :  :. :  : : ..:: .: ::.  .: ..  .:: . :.  ...:  ..
CCDS69 SGHKLGISDVAWSSDSNLLVSASDDKTLKIWDVSSGKCLKTLKGHSNYVFCCNFNPQSNL
            90       100       110       120       130       140   

            310       320       330       340       350       360  
pF1KB3 LVTCSRDSTARIWDVRTKASVHTLSGHTNAVATVRCQAAEPQIITGSHDTTIRLWDLVAG
       .:. : : ..:::::.:   ..:: .:.. :..:. .     :...:.:   :.:: ..:
CCDS69 IVSGSFDESVRIWDVKTGKCLKTLPAHSDPVSAVHFNRDGSLIVSSSYDGLCRIWDTASG
           150       160       170       180       190       200   

            370        380        390       400       410          
pF1KB3 KTRVTLTNHKKS-VRAVVLHPR-HYTFASGSPDNIKQWKFPDGSFIQNLSGHNA----II
       .   :: .  .  :  : . :  .: .:.   ...: : .  :. ... .::.     :.
CCDS69 QCLKTLIDDDNPPVSFVKFSPNGKYILAATLDNTLKLWDYSKGKCLKTYTGHKNEKYCIF
           210       220       230       240       250       260   

        420       430       440       450       460       470      
pF1KB3 NTLTVNSDGVLVSGADNGTMHLWDWRTGYNFQRVHAAVQPGSLDSESGIFACAFDQSESR
        ...:..   .:::.... ...:. .:    :...     :  :    ... :   .:. 
CCDS69 ANFSVTGGKWIVSGSEDNLVYIWNLQTKEIVQKLQ-----GHTDV---VISTACHPTENI
           270       280       290            300          310     

        480         490       500       510    
pF1KB3 LLTA--EADKTIKVYREDDTATEETHPVSWKPEIIKRKRF
       . .:  : :::::... :                      
CCDS69 IASAALENDKTIKLWKSDC                     
         320       330                         

>>CCDS3012.1 WDR5B gene_id:54554|Hs108|chr3               (330 aa)
 initn: 372 init1: 372 opt: 486  Z-score: 384.3  bits: 80.1 E(32554): 4.4e-15
Smith-Waterman score: 486; 27.0% identity (60.0% similar) in 330 aa overlap (168-489:5-326)

       140       150       160       170       180       190       
pF1KB3 ANRTAPSGSEYRHPGASDRPQPTAMNSIVMETGNTKNSALMAKKAPTMPKPQWHPPWKLY
                                     :. ..: .  ....:    .   .: . : 
CCDS30                           MATKESRDAKAQLALSSSANQSKEVPENPNYALK
                                         10        20        30    

       200       210       220       230       240       250       
pF1KB3 RVISGHLGWVRCIAVEPGNQWFVTGSADRTIKIWDLASGKLKLSLTGHISTVRGVIVSTR
        .. ::   :  .   :...:....:::: : ::   .:: . .: ::   .  :  :. 
CCDS30 CTLVGHTEAVSSVKFSPNGEWLASSSADRLIIIWGAYDGKYEKTLYGHNLEISDVAWSSD
           40        50        60        70        80        90    

       260       270       280       290       300       310       
pF1KB3 SPYLFSCGEDKQVKCWDLEYNKVIRHYHGHLSAVYGLDLHPTIDVLVTCSRDSTARIWDV
       :  : : ..:: .: ::.. .: ..  .:: . :.  ...:  ..... : : :..::.:
CCDS30 SSRLVSASDDKTLKLWDVRSGKCLKTLKGHSNYVFCCNFNPPSNLIISGSFDETVKIWEV
          100       110       120       130       140       150    

       320       330       340       350       360       370       
pF1KB3 RTKASVHTLSGHTNAVATVRCQAAEPQIITGSHDTTIRLWDLVAGKTRVTLTNHKKS-VR
       .:   ..:::.:.. :..:. . .   :..::.:   :.:: ..:.   ::..  .  : 
CCDS30 KTGKCLKTLSAHSDPVSAVHFNCSGSLIVSGSYDGLCRIWDAASGQCLKTLVDDDNPPVS
          160       170       180       190       200       210    

        380       390        400       410           420       430 
pF1KB3 AVVLHPRHYTFASGSPDN-IKQWKFPDGSFIQNLSGHNA----IINTLTVNSDGVLVSGA
        : . :    . ... :: .: : .  :  ... .::.     :. ...:..   .:::.
CCDS30 FVKFSPNGKYILTATLDNTLKLWDYSRGRCLKTYTGHKNEKYCIFANFSVTGGKWIVSGS
          220       230       240       250       260       270    

             440       450       460       470       480           
pF1KB3 DNGTMHLWDWRTGYNFQRVHAAVQPGSLDSESGIFACAFDQSESRLLTA--EADKTIKVY
       ... ...:. .:    :...     :  :    ... :   .:. . .:  : :::::..
CCDS30 EDNLVYIWNLQTKEIVQKLQ-----GHTDV---VISAACHPTENLIASAALENDKTIKLW
          280       290               300       310       320      

     490       500       510    
pF1KB3 REDDTATEETHPVSWKPEIIKRKRF
                                
CCDS30 MSNH                     
        330                     

>>CCDS10788.1 KATNB1 gene_id:10300|Hs108|chr16            (655 aa)
 initn: 728 init1: 409 opt: 462  Z-score: 362.2  bits: 77.0 E(32554): 7.4e-14
Smith-Waterman score: 462; 28.5% identity (63.1% similar) in 260 aa overlap (194-450:11-268)

           170       180       190       200       210        220  
pF1KB3 SIVMETGNTKNSALMAKKAPTMPKPQWHPPWKLYRVISGHLGWVRCIAV-EPGNQWFVTG
                                     ::: .... : . :  ... . ... ..::
CCDS10                     MATPVVTKTAWKLQEIVA-HASNVSSLVLGKASGRLLATG
                                   10         20        30         

            230       240       250       260       270       280  
pF1KB3 SADRTIKIWDLASGKLKLSLTGHISTVRGVIVSTRSPYLFSCGEDKQVKCWDLEYNKVIR
       . :  ...:.. . .  .::::: : :..: ..:    . . ... ... ::::  :..:
CCDS10 GDDCRVNLWSINKPNCIMSLTGHTSPVESVRLNTPEELIVAGSQSGSIRVWDLEAAKILR
      40        50        60        70        80        90         

            290       300       310       320       330       340  
pF1KB3 HYHGHLSAVYGLDLHPTIDVLVTCSRDSTARIWDVRTKASVHTLSGHTNAVATVRCQAAE
          :: . . .::.::  . ... :.:.. ..::.: :. :    ::..::  .: .   
CCDS10 TLMGHKANICSLDFHPYGEFVASGSQDTNIKLWDIRRKGCVFRYRGHSQAVRCLRFSPDG
     100       110       120       130       140       150         

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pF1KB3 PQIITGSHDTTIRLWDLVAGKTRVTLTNHKKSVRAVVLHPRHYTFASGSPD-NIKQWKFP
         . ... : :..::::.:::    . .:   : .: .:: .: .:::: : .:. : . 
CCDS10 KWLASAADDHTVKLWDLTAGKMMSEFPGHTGPVNVVEFHPNEYLLASGSSDRTIRFWDLE
     160       170       180       190       200       210         

             410       420        430       440       450       460
pF1KB3 DGSFIQNLSGHNAIINTLTVNSDGV-LVSGADNGTMHLWDWRTGYNFQRVHAAVQPGSLD
         . .. . :. . . ..  : ::  : :: .. ..... :.    :. :          
CCDS10 KFQVVSCIEGEPGPVRSVLFNPDGCCLYSGCQD-SLRVYGWEPERCFDVVLVNWGKVADL
     220       230       240       250        260       270        

              470       480       490       500       510          
pF1KB3 SESGIFACAFDQSESRLLTAEADKTIKVYREDDTATEETHPVSWKPEIIKRKRF      
                                                                   
CCDS10 AICNDQLIGVAFSQSNVSSYVVDLTRVTRTGTVARDPVQDHRPLAQPLPNPSAPLRRIYE
      280       290       300       310       320       330        

>>CCDS43876.1 WDR38 gene_id:401551|Hs108|chr9             (314 aa)
 initn: 435 init1: 272 opt: 431  Z-score: 343.5  bits: 72.4 E(32554): 8.2e-13
Smith-Waterman score: 431; 32.8% identity (60.3% similar) in 247 aa overlap (194-435:57-298)

           170       180       190       200       210       220   
pF1KB3 SIVMETGNTKNSALMAKKAPTMPKPQWHPPWKLYRVISGHLGWVRCIAVEPGNQWFVTGS
                                     :.:    .:: : :.     : .. :...:
CCDS43 SAFSPDGQMLLTGSEDGCVYGWETRSGQLLWRL----GGHTGPVKFCRFSPDGHLFASAS
         30        40        50            60        70        80  

           230       240       250       260       270       280   
pF1KB3 ADRTIKIWDLASGKLKLSLTGHISTVRGVIVSTRSPYLFSCGEDKQVKCWDLEYNKVIRH
        : :...::.: .:    : ::  .:. :  :  :  : : : ::.:  ::.. ....: 
CCDS43 CDCTVRLWDVARAKCLRVLKGHQRSVETVSFSPDSRQLASGGWDKRVMLWDVQSGQMLRL
             90       100       110       120       130       140  

           290       300       310         320        330       340
pF1KB3 YHGHLSAVYGLDLHPTIDVLVTCSRDSTARIWDVR--TKASVH-TLSGHTNAVATVRCQA
         :: ... . :. ::.. :.: : :::..:::.:  : :  : .: ::.  .. . : .
CCDS43 LVGHRDSIQSSDFSPTVNCLATGSWDSTVHIWDLRMVTPAVSHQALEGHSANISCL-CYS
            150       160       170       180       190        200 

              350       360       370       380        390         
pF1KB3 AEPQIITGSHDTTIRLWDLVAGKTRVTLTNHKKSVRAVVLHPRHYTFAS-GSPDNIKQWK
       :   . .:: : ::..:  ....  . : .:   :..... : .  .:: :    .: : 
CCDS43 ASGLLASGSWDKTIHIWKPTTSSLLIQLKGHVTWVKSIAFSPDELWLASAGYSRMVKVWD
             210       220       230       240       250       260 

     400       410       420        430       440       450        
pF1KB3 FPDGSFIQNLSGHNAIINTLTVNSDG-VLVSGADNGTMHLWDWRTGYNFQRVHAAVQPGS
          :. ...:.:   . .: . . :: .::::: . :                       
CCDS43 CNTGKCLETLKGVLDVAHTCAFTPDGKILVSGAADQTRRQISRTSKSPRDPQT       
             270       280       290       300       310           

      460       470       480       490       500       510    
pF1KB3 LDSESGIFACAFDQSESRLLTAEADKTIKVYREDDTATEETHPVSWKPEIIKRKRF

>>CCDS75898.1 WDR38 gene_id:401551|Hs108|chr9             (315 aa)
 initn: 272 init1: 272 opt: 419  Z-score: 334.5  bits: 70.8 E(32554): 2.6e-12
Smith-Waterman score: 419; 32.7% identity (60.1% similar) in 248 aa overlap (194-435:57-299)

           170       180       190       200       210       220   
pF1KB3 SIVMETGNTKNSALMAKKAPTMPKPQWHPPWKLYRVISGHLGWVRCIAVEPGNQWFVTGS
                                     :.:    .:: : :.     : .. :...:
CCDS75 SAFSPDGQMLLTGSEDGCVYGWETRSGQLLWRL----GGHTGPVKFCRFSPDGHLFASAS
         30        40        50            60        70        80  

           230       240       250       260       270       280   
pF1KB3 ADRTIKIWDLASGKLKLSLTGHISTVRGVIVSTRSPYLFSCGEDKQVKCWDLEYNKVIRH
        : :...::.: .:    : ::  .:. :  :  :  : : : ::.:  ::.. ....: 
CCDS75 CDCTVRLWDVARAKCLRVLKGHQRSVETVSFSPDSRQLASGGWDKRVMLWDVQSGQMLRL
             90       100       110       120       130       140  

           290       300       310         320        330       340
pF1KB3 YHGHLSAVYGLDLHPTIDVLVTCSRDSTARIWDVR--TKASVH-TLSGHTNAVATVRCQA
         :: ... . :. ::.. :.: : :::..:::.:  : :  : .: ::.  .. . : .
CCDS75 LVGHRDSIQSSDFSPTVNCLATGSWDSTVHIWDLRMVTPAVSHQALEGHSANISCL-CYS
            150       160       170       180       190        200 

              350       360       370       380        390         
pF1KB3 AEPQIITGSHDTTIRLWDLVAGKTRVTLTNHKKSVRAVVLHPRHYTFAS-GSPDNIKQWK
       :   . .:: : ::..:  ....  . : .:   :..... : .  .:: :    .: : 
CCDS75 ASGLLASGSWDKTIHIWKPTTSSLLIQLKGHVTWVKSIAFSPDELWLASAGYSRMVKVWD
             210       220       230       240       250       260 

     400       410        420        430       440       450       
pF1KB3 FPDGSFIQNLS-GHNAIINTLTVNSDG-VLVSGADNGTMHLWDWRTGYNFQRVHAAVQPG
          :. ...:. :   . .: . . :: .::::: . :                      
CCDS75 CNTGKCLETLKQGVLDVAHTCAFTPDGKILVSGAADQTRRQISRTSKSPRDPQT      
             270       280       290       300       310           

       460       470       480       490       500       510    
pF1KB3 SLDSESGIFACAFDQSESRLLTAEADKTIKVYREDDTATEETHPVSWKPEIIKRKRF

>>CCDS32528.1 PAFAH1B1 gene_id:5048|Hs108|chr17           (410 aa)
 initn: 505 init1: 307 opt: 392  Z-score: 312.7  bits: 67.1 E(32554): 4.3e-11
Smith-Waterman score: 464; 27.6% identity (56.5% similar) in 340 aa overlap (172-489:80-407)

             150       160       170       180       190       200 
pF1KB3 APSGSEYRHPGASDRPQPTAMNSIVMETGNTKNSALMAKKAPTMPKPQWHPPWKLYRVIS
                                     :... :  :. :    :.  :: :   ..:
CCDS32 LLEKKWTSVIRLQKKVMELESKLNEAKEEFTSGGPLGQKRDPKEWIPR--PPEK--YALS
      50        60        70        80        90         100       

             210       220       230       240       250       260 
pF1KB3 GHLGWVRCIAVEPGNQWFVTGSADRTIKIWDLASGKLKLSLTGHISTVRGVIVSTRSPYL
       :: . :  .  .:  . .:..: : :::.::  .: .. .: :: ..:. .  .  .  :
CCDS32 GHRSPVTRVIFHPVFSVMVSASEDATIKVWDYETGDFERTLKGHTDSVQDISFDHSGKLL
         110       120       130       140       150       160     

             270       280       290       300       310       320 
pF1KB3 FSCGEDKQVKCWDLEYNKVIRHYHGHLSAVYGLDLHPTIDVLVTCSRDSTARIWDVRTKA
        ::. :  .: ::..  . :: .:::   : .. . :. : .:. :::.: ..:.:.:  
CCDS32 ASCSADMTIKLWDFQGFECIRTMHGHDHNVSSVAIMPNGDHIVSASRDKTIKMWEVQTGY
         170       180       190       200       210       220     

             330       340       350       360       370       380 
pF1KB3 SVHTLSGHTNAVATVRCQAAEPQIITGSHDTTIRLWDLVAGKTRVTLTNHKKSVRAVVLH
        :.:..:: . :  :: .     : . :.: :.:.: ... . .. : .:.. :. .   
CCDS32 CVKTFTGHREWVRMVRPNQDGTLIASCSNDQTVRVWVVATKECKAELREHEHVVECISWA
         230       240       250       260       270       280     

                                 390        400       410       420
pF1KB3 PRH-YT-------------------FASGSPDN-IKQWKFPDGSFIQNLSGHNAIINTLT
       :.  :.                   . ::: :. ::.:    :  ...: ::.  .  . 
CCDS32 PESSYSSISEATGSETKKSGKPGPFLLSGSRDKTIKMWDVSTGMCLMTLVGHDNWVRGVL
         290       300       310       320       330       340     

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pF1KB3 VNSDGVLV-SGADNGTMHLWDWRTGYNFQRVHAAVQPGSLDSESGIFACAFDQSESRLLT
        .: : .. : ::. :...::...   .. ..:         :  . .  : ..   ..:
CCDS32 FHSGGKFILSCADDKTLRVWDYKNKRCMKTLNA--------HEHFVTSLDFHKTAPYVVT
         350       360       370               380       390       

     480       490       500       510    
pF1KB3 AEADKTIKVYREDDTATEETHPVSWKPEIIKRKRF
       . .:.:.::.                         
CCDS32 GSVDQTVKVWECR                      
       400       410                      

>>CCDS34078.1 FBXW7 gene_id:55294|Hs108|chr4              (589 aa)
 initn: 487 init1: 122 opt: 390  Z-score: 309.0  bits: 67.0 E(32554): 6.8e-11
Smith-Waterman score: 457; 31.1% identity (61.1% similar) in 296 aa overlap (198-489:256-531)

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