Result of FASTA (ccds) for
pF1KB6591
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB6591, 380 aa
1>>>pF1KB6591 380 - 380 aa - 380 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0141+/-0.00104; mu= 14.1899+/- 0.063
mean_var=129.4697+/-31.775, 0's: 0 Z-trim(107.6): 404 B-trim: 1111 in 2/48
Lambda= 0.112717
statistics sampled from 9031 (9664) to 9031 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.653), E-opt: 0.2 (0.297), width: 16
Scan time: 2.760
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS6152.1 OPRK1 gene_id:4986|Hs108|chr8 ( 380) 2539 424.5 7.7e-119
CCDS64895.1 OPRK1 gene_id:4986|Hs108|chr8 ( 291) 1927 324.8 5.9e-89
CCDS47508.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 392) 1467 250.2 2.4e-66
CCDS47507.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 420) 1467 250.2 2.5e-66
CCDS55069.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 389) 1463 249.5 3.7e-66
CCDS47505.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 397) 1463 249.5 3.7e-66
CCDS55070.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 400) 1463 249.5 3.8e-66
CCDS47506.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 403) 1463 249.5 3.8e-66
CCDS47504.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 406) 1463 249.5 3.8e-66
CCDS43517.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 418) 1463 249.6 3.9e-66
CCDS43518.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 446) 1463 249.6 4.1e-66
CCDS47503.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 493) 1463 249.6 4.3e-66
CCDS329.1 OPRD1 gene_id:4985|Hs108|chr1 ( 372) 1395 238.4 7.6e-63
CCDS55068.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 319) 1348 230.7 1.4e-60
CCDS55071.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 300) 1322 226.5 2.5e-59
CCDS13556.1 OPRL1 gene_id:4987|Hs108|chr20 ( 370) 1259 216.3 3.5e-56
CCDS9666.1 SSTR1 gene_id:6751|Hs108|chr14 ( 391) 878 154.4 1.6e-37
CCDS42856.1 SSTR4 gene_id:6754|Hs108|chr20 ( 388) 870 153.1 3.9e-37
CCDS11691.1 SSTR2 gene_id:6752|Hs108|chr17 ( 369) 829 146.4 3.9e-35
CCDS13557.1 NPBWR2 gene_id:2832|Hs108|chr20 ( 333) 769 136.6 3.1e-32
CCDS13944.1 SSTR3 gene_id:6753|Hs108|chr22 ( 418) 769 136.7 3.6e-32
CCDS10429.1 SSTR5 gene_id:6755|Hs108|chr16 ( 364) 746 132.9 4.4e-31
CCDS6151.1 NPBWR1 gene_id:2831|Hs108|chr8 ( 328) 718 128.3 9.7e-30
CCDS3137.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 359) 584 106.5 3.7e-23
CCDS82855.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 388) 584 106.6 3.9e-23
CCDS82854.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 394) 584 106.6 4e-23
CCDS11739.1 GALR2 gene_id:8811|Hs108|chr17 ( 387) 582 106.3 4.9e-23
CCDS14004.1 MCHR1 gene_id:2847|Hs108|chr22 ( 422) 578 105.6 8.2e-23
CCDS12012.1 GALR1 gene_id:2587|Hs108|chr18 ( 349) 574 104.9 1.1e-22
CCDS14569.1 AGTR2 gene_id:186|Hs108|chrX ( 363) 552 101.4 1.4e-21
CCDS2737.1 CCR1 gene_id:1230|Hs108|chr3 ( 355) 540 99.4 5.3e-21
CCDS7950.1 APLNR gene_id:187|Hs108|chr11 ( 380) 539 99.3 6.2e-21
CCDS5044.1 MCHR2 gene_id:84539|Hs108|chr6 ( 340) 527 97.3 2.2e-20
CCDS14441.1 LPAR4 gene_id:2846|Hs108|chrX ( 370) 516 95.5 8.1e-20
CCDS9410.1 LPAR6 gene_id:10161|Hs108|chr13 ( 344) 508 94.2 1.9e-19
CCDS13958.1 GALR3 gene_id:8484|Hs108|chr22 ( 368) 504 93.6 3.1e-19
CCDS2739.1 CCR5 gene_id:1234|Hs108|chr3 ( 352) 502 93.2 3.8e-19
CCDS2684.1 CCR8 gene_id:1237|Hs108|chr3 ( 355) 496 92.2 7.5e-19
CCDS3218.1 GHSR gene_id:2693|Hs108|chr3 ( 366) 496 92.2 7.7e-19
CCDS2368.1 GPR1 gene_id:2825|Hs108|chr2 ( 355) 488 90.9 1.9e-18
CCDS7606.1 PRLHR gene_id:2834|Hs108|chr10 ( 370) 488 91.0 1.9e-18
CCDS2738.1 CCR3 gene_id:1232|Hs108|chr3 ( 355) 487 90.8 2.1e-18
CCDS54574.1 CCR3 gene_id:1232|Hs108|chr3 ( 376) 487 90.8 2.2e-18
CCDS5298.1 CCR6 gene_id:1235|Hs108|chr6 ( 374) 486 90.6 2.4e-18
CCDS1958.1 TACR1 gene_id:6869|Hs108|chr2 ( 407) 486 90.7 2.6e-18
CCDS9492.1 GPR183 gene_id:1880|Hs108|chr13 ( 361) 479 89.5 5.2e-18
CCDS14398.1 P2RY4 gene_id:5030|Hs108|chrX ( 365) 478 89.3 5.8e-18
CCDS14439.1 CYSLTR1 gene_id:10800|Hs108|chrX ( 337) 477 89.1 6.2e-18
CCDS2733.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3 ( 357) 475 88.8 8.1e-18
CCDS2516.1 ACKR3 gene_id:57007|Hs108|chr2 ( 362) 475 88.8 8.2e-18
>>CCDS6152.1 OPRK1 gene_id:4986|Hs108|chr8 (380 aa)
initn: 2539 init1: 2539 opt: 2539 Z-score: 2247.0 bits: 424.5 E(32554): 7.7e-119
Smith-Waterman score: 2539; 100.0% identity (100.0% similar) in 380 aa overlap (1-380:1-380)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MDSPIQIFRGEPGPTCAPSACLPPNSSAWFPGWAEPDSNGSAGSEDAQLEPAHISPAIPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 MDSPIQIFRGEPGPTCAPSACLPPNSSAWFPGWAEPDSNGSAGSEDAQLEPAHISPAIPV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 IITAVYSVVFVVGLVGNSLVMFVIIRYTKMKTATNIYIFNLALADALVTTTMPFQSTVYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 IITAVYSVVFVVGLVGNSLVMFVIIRYTKMKTATNIYIFNLALADALVTTTMPFQSTVYL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 MNSWPFGDVLCKIVISIDYYNMFTSIFTLTMMSVDRYIAVCHPVKALDFRTPLKAKIINI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 MNSWPFGDVLCKIVISIDYYNMFTSIFTLTMMSVDRYIAVCHPVKALDFRTPLKAKIINI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 CIWLLSSSVGISAIVLGGTKVREDVDVIECSLQFPDDDYSWWDLFMKICVFIFAFVIPVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 CIWLLSSSVGISAIVLGGTKVREDVDVIECSLQFPDDDYSWWDLFMKICVFIFAFVIPVL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 IIIVCYTLMILRLKSVRLLSGSREKDRNLRRITRLVLVVVAVFVVCWTPIHIFILVEALG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 IIIVCYTLMILRLKSVRLLSGSREKDRNLRRITRLVLVVVAVFVVCWTPIHIFILVEALG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 STSHSTAALSSYYFCIALGYTNSSLNPILYAFLDENFKRCFRDFCFPLKMRMERQSTSRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 STSHSTAALSSYYFCIALGYTNSSLNPILYAFLDENFKRCFRDFCFPLKMRMERQSTSRV
310 320 330 340 350 360
370 380
pF1KB6 RNTVQDPAYLRDIDGMNKPV
::::::::::::::::::::
CCDS61 RNTVQDPAYLRDIDGMNKPV
370 380
>>CCDS64895.1 OPRK1 gene_id:4986|Hs108|chr8 (291 aa)
initn: 1927 init1: 1927 opt: 1927 Z-score: 1710.6 bits: 324.8 E(32554): 5.9e-89
Smith-Waterman score: 1927; 100.0% identity (100.0% similar) in 291 aa overlap (90-380:1-291)
60 70 80 90 100 110
pF1KB6 VIITAVYSVVFVVGLVGNSLVMFVIIRYTKMKTATNIYIFNLALADALVTTTMPFQSTVY
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 MKTATNIYIFNLALADALVTTTMPFQSTVY
10 20 30
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 LMNSWPFGDVLCKIVISIDYYNMFTSIFTLTMMSVDRYIAVCHPVKALDFRTPLKAKIIN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 LMNSWPFGDVLCKIVISIDYYNMFTSIFTLTMMSVDRYIAVCHPVKALDFRTPLKAKIIN
40 50 60 70 80 90
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 ICIWLLSSSVGISAIVLGGTKVREDVDVIECSLQFPDDDYSWWDLFMKICVFIFAFVIPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 ICIWLLSSSVGISAIVLGGTKVREDVDVIECSLQFPDDDYSWWDLFMKICVFIFAFVIPV
100 110 120 130 140 150
240 250 260 270 280 290
pF1KB6 LIIIVCYTLMILRLKSVRLLSGSREKDRNLRRITRLVLVVVAVFVVCWTPIHIFILVEAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 LIIIVCYTLMILRLKSVRLLSGSREKDRNLRRITRLVLVVVAVFVVCWTPIHIFILVEAL
160 170 180 190 200 210
300 310 320 330 340 350
pF1KB6 GSTSHSTAALSSYYFCIALGYTNSSLNPILYAFLDENFKRCFRDFCFPLKMRMERQSTSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 GSTSHSTAALSSYYFCIALGYTNSSLNPILYAFLDENFKRCFRDFCFPLKMRMERQSTSR
220 230 240 250 260 270
360 370 380
pF1KB6 VRNTVQDPAYLRDIDGMNKPV
:::::::::::::::::::::
CCDS64 VRNTVQDPAYLRDIDGMNKPV
280 290
>>CCDS47508.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 (392 aa)
initn: 1392 init1: 708 opt: 1467 Z-score: 1304.7 bits: 250.2 E(32554): 2.4e-66
Smith-Waterman score: 1477; 60.7% identity (80.4% similar) in 377 aa overlap (17-380:18-389)
10 20 30 40
pF1KB6 MDSPIQIFRGEPGPTCAPSACLP-PNSSAWFPGWAEPDSNGSA---------GSEDAQL
: :.: : :. ..: . .. :.: : :..:. :
CCDS47 MDSSAAPTNASNCTDALAYSSCSPAPSPGSWV-NLSHLDGNLSDPCGPNRTDLGGRDS-L
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KB6 EPAHISPAIPVIIT--AVYSVVFVVGLVGNSLVMFVIIRYTKMKTATNIYIFNLALADAL
: ::.. . :: :.::.: :::: :: :::.::.::::::::::::::::::::::
CCDS47 CPPTGSPSMITAITIMALYSIVCVVGLFGNFLVMYVIVRYTKMKTATNIYIFNLALADAL
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KB6 VTTTMPFQSTVYLMNSWPFGDVLCKIVISIDYYNMFTSIFTLTMMSVDRYIAVCHPVKAL
.:.:.::::. :::..:::: .:::::::::::::::::::: ::::::::::::::::
CCDS47 ATSTLPFQSVNYLMGTWPFGTILCKIVISIDYYNMFTSIFTLCTMSVDRYIAVCHPVKAL
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KB6 DFRTPLKAKIINICIWLLSSSVGISAIVLGGTKVREDVDVIECSLQFPDDDYSWWDLFMK
::::: .:::::.: :.:::..:. .. .. :: :. :.:.: : . : .: .:
CCDS47 DFRTPRNAKIINVCNWILSSAIGLPVMFMATTKYRQG--SIDCTLTFSHPTWYWENL-LK
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB6 ICVFIFAFVIPVLIIIVCYTLMILRLKSVRLLSGSREKDRNLRRITRLVLVVVAVFVVCW
::::::::..::::: ::: ::::::::::.::::.:::::::::::.::::::::.:::
CCDS47 ICVFIFAFIMPVLIITVCYGLMILRLKSVRMLSGSKEKDRNLRRITRMVLVVVAVFIVCW
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB6 TPIHIFILVEALGSTSHSTAALSSYYFCIALGYTNSSLNPILYAFLDENFKRCFRDFCFP
:::::.....:: . ..: :..:::::::::: :::.::::::::::::::.::.:
CCDS47 TPIHIYVIIKALVTIPETTFQTVSWHFCIALGYTNSCLNPVLYAFLDENFKRCFREFCIP
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380
pF1KB6 LKMRMERQSTSRVRNTVQD-PAYLRDIDGMNKPV
. .:.:...:.:....: :. .: :. :
CCDS47 TSSNIEQQNSTRIRQNTRDHPSTANTVDRTNHQVRSL
360 370 380 390
>>CCDS47507.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 (420 aa)
initn: 1392 init1: 708 opt: 1467 Z-score: 1304.3 bits: 250.2 E(32554): 2.5e-66
Smith-Waterman score: 1477; 60.7% identity (80.4% similar) in 377 aa overlap (17-380:18-389)
10 20 30 40
pF1KB6 MDSPIQIFRGEPGPTCAPSACLP-PNSSAWFPGWAEPDSNGSA---------GSEDAQL
: :.: : :. ..: . .. :.: : :..:. :
CCDS47 MDSSAAPTNASNCTDALAYSSCSPAPSPGSWV-NLSHLDGNLSDPCGPNRTDLGGRDS-L
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KB6 EPAHISPAIPVIIT--AVYSVVFVVGLVGNSLVMFVIIRYTKMKTATNIYIFNLALADAL
: ::.. . :: :.::.: :::: :: :::.::.::::::::::::::::::::::
CCDS47 CPPTGSPSMITAITIMALYSIVCVVGLFGNFLVMYVIVRYTKMKTATNIYIFNLALADAL
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KB6 VTTTMPFQSTVYLMNSWPFGDVLCKIVISIDYYNMFTSIFTLTMMSVDRYIAVCHPVKAL
.:.:.::::. :::..:::: .:::::::::::::::::::: ::::::::::::::::
CCDS47 ATSTLPFQSVNYLMGTWPFGTILCKIVISIDYYNMFTSIFTLCTMSVDRYIAVCHPVKAL
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KB6 DFRTPLKAKIINICIWLLSSSVGISAIVLGGTKVREDVDVIECSLQFPDDDYSWWDLFMK
::::: .:::::.: :.:::..:. .. .. :: :. :.:.: : . : .: .:
CCDS47 DFRTPRNAKIINVCNWILSSAIGLPVMFMATTKYRQG--SIDCTLTFSHPTWYWENL-LK
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB6 ICVFIFAFVIPVLIIIVCYTLMILRLKSVRLLSGSREKDRNLRRITRLVLVVVAVFVVCW
::::::::..::::: ::: ::::::::::.::::.:::::::::::.::::::::.:::
CCDS47 ICVFIFAFIMPVLIITVCYGLMILRLKSVRMLSGSKEKDRNLRRITRMVLVVVAVFIVCW
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB6 TPIHIFILVEALGSTSHSTAALSSYYFCIALGYTNSSLNPILYAFLDENFKRCFRDFCFP
:::::.....:: . ..: :..:::::::::: :::.::::::::::::::.::.:
CCDS47 TPIHIYVIIKALVTIPETTFQTVSWHFCIALGYTNSCLNPVLYAFLDENFKRCFREFCIP
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380
pF1KB6 LKMRMERQSTSRVRNTVQD-PAYLRDIDGMNKPV
. .:.:...:.:....: :. .: :. :
CCDS47 TSSNIEQQNSTRIRQNTRDHPSTANTVDRTNHQVELNLDCHCENAKPWPLSYNAGQSPFP
360 370 380 390 400 410
CCDS47 FPGRV
420
>>CCDS55069.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 (389 aa)
initn: 1392 init1: 708 opt: 1463 Z-score: 1301.2 bits: 249.5 E(32554): 3.7e-66
Smith-Waterman score: 1473; 61.0% identity (80.5% similar) in 374 aa overlap (17-377:18-386)
10 20 30 40
pF1KB6 MDSPIQIFRGEPGPTCAPSACLP-PNSSAWFPGWAEPDSNGSA---------GSEDAQL
: :.: : :. ..: . .. :.: : :..:. :
CCDS55 MDSSAAPTNASNCTDALAYSSCSPAPSPGSWV-NLSHLDGNLSDPCGPNRTDLGGRDS-L
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KB6 EPAHISPAIPVIIT--AVYSVVFVVGLVGNSLVMFVIIRYTKMKTATNIYIFNLALADAL
: ::.. . :: :.::.: :::: :: :::.::.::::::::::::::::::::::
CCDS55 CPPTGSPSMITAITIMALYSIVCVVGLFGNFLVMYVIVRYTKMKTATNIYIFNLALADAL
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KB6 VTTTMPFQSTVYLMNSWPFGDVLCKIVISIDYYNMFTSIFTLTMMSVDRYIAVCHPVKAL
.:.:.::::. :::..:::: .:::::::::::::::::::: ::::::::::::::::
CCDS55 ATSTLPFQSVNYLMGTWPFGTILCKIVISIDYYNMFTSIFTLCTMSVDRYIAVCHPVKAL
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KB6 DFRTPLKAKIINICIWLLSSSVGISAIVLGGTKVREDVDVIECSLQFPDDDYSWWDLFMK
::::: .:::::.: :.:::..:. .. .. :: :. :.:.: : . : .: .:
CCDS55 DFRTPRNAKIINVCNWILSSAIGLPVMFMATTKYRQGS--IDCTLTFSHPTWYWENL-LK
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB6 ICVFIFAFVIPVLIIIVCYTLMILRLKSVRLLSGSREKDRNLRRITRLVLVVVAVFVVCW
::::::::..::::: ::: ::::::::::.::::.:::::::::::.::::::::.:::
CCDS55 ICVFIFAFIMPVLIITVCYGLMILRLKSVRMLSGSKEKDRNLRRITRMVLVVVAVFIVCW
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB6 TPIHIFILVEALGSTSHSTAALSSYYFCIALGYTNSSLNPILYAFLDENFKRCFRDFCFP
:::::.....:: . ..: :..:::::::::: :::.::::::::::::::.::.:
CCDS55 TPIHIYVIIKALVTIPETTFQTVSWHFCIALGYTNSCLNPVLYAFLDENFKRCFREFCIP
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380
pF1KB6 LKMRMERQSTSRVRNTVQD-PAYLRDIDGMNKPV
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CCDS55 TSSNIEQQNSTRIRQNTRDHPSTANTVDRTNHQS
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]