Result of FASTA (ccds) for pF1KE0841
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE0841, 342 aa
  1>>>pF1KE0841 342 - 342 aa - 342 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2696+/-0.00113; mu= 16.5343+/- 0.067
 mean_var=159.3864+/-69.064, 0's: 0 Z-trim(103.6): 264  B-trim: 991 in 2/46
 Lambda= 0.101589
 statistics sampled from 6989 (7507) to 6989 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.568), E-opt: 0.2 (0.231), width:  16
 Scan time:  2.320

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS5154.1 TAAR8 gene_id:83551|Hs108|chr6          ( 342) 2255 343.4 1.7e-94
CCDS5155.1 TAAR6 gene_id:319100|Hs108|chr6         ( 345) 1880 288.4 5.9e-78
CCDS75520.1 TAAR9 gene_id:134860|Hs108|chr6        ( 348) 1625 251.0   1e-66
CCDS5156.1 TAAR5 gene_id:9038|Hs108|chr6           ( 337) 1019 162.2 5.6e-40
CCDS5158.1 TAAR1 gene_id:134864|Hs108|chr6         ( 339)  920 147.7 1.3e-35
CCDS34541.1 TAAR2 gene_id:9287|Hs108|chr6          ( 351)  851 137.6 1.5e-32
CCDS5157.1 TAAR2 gene_id:9287|Hs108|chr6           ( 306)  800 130.0 2.5e-30
CCDS34273.2 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5           ( 360)  405 72.2 7.1e-13
CCDS34271.1 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5           ( 378)  405 72.3 7.3e-13
CCDS34270.1 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5           ( 387)  405 72.3 7.4e-13
CCDS4291.1 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5            ( 388)  405 72.3 7.4e-13
CCDS75353.1 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5           ( 411)  405 72.3 7.7e-13
CCDS34272.1 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5           ( 428)  405 72.4 7.8e-13
CCDS83269.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8          ( 342)  403 71.9 8.5e-13
CCDS6052.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8           ( 429)  403 72.1 9.6e-13
CCDS6053.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8           ( 455)  403 72.1 9.9e-13
CCDS6054.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8           ( 466)  403 72.1   1e-12
CCDS34869.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8          ( 475)  403 72.1   1e-12
CCDS4395.1 HRH2 gene_id:3274|Hs108|chr5            ( 359)  383 69.0 6.7e-12
CCDS47344.1 HRH2 gene_id:3274|Hs108|chr5           ( 397)  383 69.1   7e-12
CCDS8297.1 GPR83 gene_id:10888|Hs108|chr11         ( 423)  377 68.3 1.3e-11
CCDS4986.1 HTR1B gene_id:3351|Hs108|chr6           ( 390)  375 67.9 1.6e-11
CCDS7569.2 ADRA2A gene_id:150|Hs108|chr10          ( 465)  375 68.0 1.7e-11
CCDS7376.1 OPN4 gene_id:94233|Hs108|chr10          ( 478)  374 67.9 1.9e-11
CCDS231.1 HTR1D gene_id:3352|Hs108|chr1            ( 377)  370 67.1 2.6e-11
CCDS13826.1 ADORA2A gene_id:135|Hs108|chr22        ( 412)  369 67.1   3e-11
CCDS4292.1 ADRB2 gene_id:154|Hs108|chr5            ( 413)  369 67.1   3e-11
CCDS56129.1 ADRA2B gene_id:151|Hs108|chr2          ( 450)  367 66.8 3.8e-11
CCDS2920.1 HTR1F gene_id:3355|Hs108|chr3           ( 366)  362 66.0 5.7e-11
CCDS31237.1 OPN4 gene_id:94233|Hs108|chr10         ( 489)  359 65.7   9e-11


>>CCDS5154.1 TAAR8 gene_id:83551|Hs108|chr6               (342 aa)
 initn: 2255 init1: 2255 opt: 2255  Z-score: 1810.1  bits: 343.4 E(32554): 1.7e-94
Smith-Waterman score: 2255; 100.0% identity (100.0% similar) in 342 aa overlap (1-342:1-342)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MTSNFSQPVVQLCYEDVNGSCIETPYSPGSRVILYTAFSFGSLLAVFGNLLVMTSVLHFK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS51 MTSNFSQPVVQLCYEDVNGSCIETPYSPGSRVILYTAFSFGSLLAVFGNLLVMTSVLHFK
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE0 QLHSPTNFLIASLACADFLVGVTVMLFSMVRTVESCWYFGAKFCTLHSCCDVAFCYSSVL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS51 QLHSPTNFLIASLACADFLVGVTVMLFSMVRTVESCWYFGAKFCTLHSCCDVAFCYSSVL
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE0 HLCFICIDRYIVVTDPLVYATKFTVSVSGICISVSWILPLTYSGAVFYTGVNDDGLEELV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS51 HLCFICIDRYIVVTDPLVYATKFTVSVSGICISVSWILPLTYSGAVFYTGVNDDGLEELV
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE0 SALNCVGGCQIIVSQGWVLIDFLLFFIPTLVMIILYSKIFLIAKQQAIKIETTSSKVESS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS51 SALNCVGGCQIIVSQGWVLIDFLLFFIPTLVMIILYSKIFLIAKQQAIKIETTSSKVESS
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE0 SESYKIRVAKRERKAAKTLGVTVLAFVISWLPYTVDILIDAFMGFLTPAYIYEICCWSAY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS51 SESYKIRVAKRERKAAKTLGVTVLAFVISWLPYTVDILIDAFMGFLTPAYIYEICCWSAY
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340  
pF1KE0 YNSAMNPLIYALFYPWFRKAIKLILSGDVLKASSSTISLFLE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS51 YNSAMNPLIYALFYPWFRKAIKLILSGDVLKASSSTISLFLE
              310       320       330       340  

>>CCDS5155.1 TAAR6 gene_id:319100|Hs108|chr6              (345 aa)
 initn: 1890 init1: 1870 opt: 1880  Z-score: 1513.1  bits: 288.4 E(32554): 5.9e-78
Smith-Waterman score: 1880; 79.6% identity (92.7% similar) in 343 aa overlap (1-342:1-343)

                10        20        30        40        50         
pF1KE0 MTSNFSQPV-VQLCYEDVNGSCIETPYSPGSRVILYTAFSFGSLLAVFGNLLVMTSVLHF
       :.:: :  : ::::: .:::::.. :.::::::::: .:.::..:::::::::: :.:::
CCDS51 MSSNSSLLVAVQLCYANVNGSCVKIPFSPGSRVILYIVFGFGAVLAVFGNLLVMISILHF
               10        20        30        40        50        60

      60        70        80        90       100       110         
pF1KE0 KQLHSPTNFLIASLACADFLVGVTVMLFSMVRTVESCWYFGAKFCTLHSCCDVAFCYSSV
       ::::::::::.::::::::::::::: :::::::::::::: .:::.:.::::::::::.
CCDS51 KQLHSPTNFLVASLACADFLVGVTVMPFSMVRTVESCWYFGRSFCTFHTCCDVAFCYSSL
               70        80        90       100       110       120

     120       130       140       150       160       170         
pF1KE0 LHLCFICIDRYIVVTDPLVYATKFTVSVSGICISVSWILPLTYSGAVFYTGVNDDGLEEL
       .::::: :::::.::::::: :::::::::::::::::::: :::::::::: :::::::
CCDS51 FHLCFISIDRYIAVTDPLVYPTKFTVSVSGICISVSWILPLMYSGAVFYTGVYDDGLEEL
              130       140       150       160       170       180

     180       190       200       210       220       230         
pF1KE0 VSALNCVGGCQIIVSQGWVLIDFLLFFIPTLVMIILYSKIFLIAKQQAIKIETTSSKVES
        .::::.:::: .:.:.::: ::: :::::..:::::..:::.:..:: :::.:.::.::
CCDS51 SDALNCIGGCQTVVNQNWVLTDFLSFFIPTFIMIILYGNIFLVARRQAKKIENTGSKTES
              190       200       210       220       230       240

     240       250       260       270       280       290         
pF1KE0 SSESYKIRVAKRERKAAKTLGVTVLAFVISWLPYTVDILIDAFMGFLTPAYIYEICCWSA
       :::::: :::.:::::::::::::.::.::::::..: ::::::::.::: ::::::: :
CCDS51 SSESYKARVARRERKAAKTLGVTVVAFMISWLPYSIDSLIDAFMGFITPACIYEICCWCA
              250       260       270       280       290       300

     300       310       320       330       340    
pF1KE0 YYNSAMNPLIYALFYPWFRKAIKLILSGDVLKASSSTISLFLE  
       :::::::::::::::::::::::.:..:.::: ::.:..:: :  
CCDS51 YYNSAMNPLIYALFYPWFRKAIKVIVTGQVLKNSSATMNLFSEHI
              310       320       330       340     

>>CCDS75520.1 TAAR9 gene_id:134860|Hs108|chr6             (348 aa)
 initn: 1657 init1: 1596 opt: 1625  Z-score: 1311.1  bits: 251.0 E(32554): 1e-66
Smith-Waterman score: 1625; 67.6% identity (89.8% similar) in 343 aa overlap (1-342:1-343)

                10        20        30        40        50         
pF1KE0 MTSNFSQP-VVQLCYEDVNGSCIETPYSPGSRVILYTAFSFGSLLAVFGNLLVMTSVLHF
       :..::::  .:.:::..:: :::.:::::: : :::....::..::.::::::: ..:::
CCDS75 MVNNFSQAEAVELCYKNVNESCIKTPYSPGPRSILYAVLGFGAVLAAFGNLLVMIAILHF
               10        20        30        40        50        60

      60        70        80        90       100       110         
pF1KE0 KQLHSPTNFLIASLACADFLVGVTVMLFSMVRTVESCWYFGAKFCTLHSCCDVAFCYSSV
       ::::.::::::::::::::::::::: :: ::.:::::::: ..: .:.: :..::..:.
CCDS75 KQLHTPTNFLIASLACADFLVGVTVMPFSTVRSVESCWYFGDSYCKFHTCFDTSFCFASL
               70        80        90       100       110       120

     120       130       140       150       160       170         
pF1KE0 LHLCFICIDRYIVVTDPLVYATKFTVSVSGICISVSWILPLTYSGAVFYTGVNDDGLEEL
       .::: : .::::.:::::.: :::::::::::: .::.. .::: ..::::.:..:.:::
CCDS75 FHLCCISVDRYIAVTDPLTYPTKFTVSVSGICIVLSWFFSVTYSFSIFYTGANEEGIEEL
              130       140       150       160       170       180

     180       190       200       210       220       230         
pF1KE0 VSALNCVGGCQIIVSQGWVLIDFLLFFIPTLVMIILYSKIFLIAKQQAIKIETTSSKVES
       : ::.::::::  ..:.:::. :::::::...:...::::::.::.:: :::.:.:...:
CCDS75 VVALTCVGGCQAPLNQNWVLLCFLLFFIPNVAMVFIYSKIFLVAKHQARKIESTASQAQS
              190       200       210       220       230       240

     240       250       260       270       280       290         
pF1KE0 SSESYKIRVAKRERKAAKTLGVTVLAFVISWLPYTVDILIDAFMGFLTPAYIYEICCWSA
       :::::: ::::::::::::::... ::..::::: :: .:::.:.:.:: :.:::  : .
CCDS75 SSESYKERVAKRERKAAKTLGIAMAAFLVSWLPYLVDAVIDAYMNFITPPYVYEILVWCV
              250       260       270       280       290       300

     300       310       320       330       340       
pF1KE0 YYNSAMNPLIYALFYPWFRKAIKLILSGDVLKASSSTISLFLE     
       ::::::::::::.:: :: ::::::.:: ::...::: .:: :     
CCDS75 YYNSAMNPLIYAFFYQWFGKAIKLIVSGKVLRTDSSTTNLFSEEVETD
              310       320       330       340        

>>CCDS5156.1 TAAR5 gene_id:9038|Hs108|chr6                (337 aa)
 initn: 1063 init1: 690 opt: 1019  Z-score: 831.2  bits: 162.2 E(32554): 5.6e-40
Smith-Waterman score: 1019; 44.1% identity (73.7% similar) in 331 aa overlap (12-342:16-337)

                   10        20        30        40        50      
pF1KE0     MTSNFSQPVVQLCYEDVNGSCIETPYSPGSRVILYTAFSFGSLLAVFGNLLVMTSV
                      .::. ::::: .: .. : ....: : . : :. :.::..:  .:
CCDS51 MRAVFIQGAEEHPAAFCYQ-VNGSCPRTVHTLGIQLVIYLACAAGMLIIVLGNVFVAFAV
               10         20        30        40        50         

         60        70        80        90       100       110      
pF1KE0 LHFKQLHSPTNFLIASLACADFLVGVTVMLFSMVRTVESCWYFGAKFCTLHSCCDVAFCY
        .:: ::.:::::. ::: ::...:. :. .: .:.:::::.::  .: ::.  :. :: 
CCDS51 SYFKALHTPTNFLLLSLALADMFLGLLVLPLSTIRSVESCWFFGDFLCRLHTYLDTLFCL
      60        70        80        90       100       110         

        120       130       140       150       160       170      
pF1KE0 SSVLHLCFICIDRYIVVTDPLVYATKFTVSVSGICISVSWILPLTYSGAVFYTGVNDDGL
       .:..::::: :::. .. :::.: .:::: :.   : ..: .: .:..  .:: : .  :
CCDS51 TSIFHLCFISIDRHCAICDPLLYPSKFTVRVALRYILAGWGVPAAYTSLFLYTDVVETRL
     120       130       140       150       160       170         

        180       190       200       210       220       230      
pF1KE0 EELVSALNCVGGCQIIVSQGWVLIDFLLFFIPTLVMIILYSKIFLIAKQQAIKIETTSSK
        . .  . :::.::..... :  ..: :::.: :.:: :: :::..: .:: .: : :..
CCDS51 SQWLEEMPCVGSCQLLLNKFWGWLNFPLFFVPCLIMISLYVKIFVVATRQAQQITTLSKS
     180       190       200       210       220       230         

        240       250       260       270       280       290      
pF1KE0 VESSSESYKIRVAKRERKAAKTLGVTVLAFVISWLPYTVDILIDAFMGFLTPAYIYEICC
       . ..        ::.:::::::::..:  ... :::.:.: ..:... :.::  ...:  
CCDS51 LAGA--------AKHERKAAKTLGIAVGIYLLCWLPFTIDTMVDSLLHFITPPLVFDIFI
     240               250       260       270       280       290 

        300       310       320       330       340  
pF1KE0 WSAYYNSAMNPLIYALFYPWFRKAIKLILSGDVLKASSSTISLFLE
       : ::.::: ::.::.. : :::::.:: ::  :.. .. :..:. :
CCDS51 WFAYFNSACNPIIYVFSYQWFRKALKLTLSQKVFSPQTRTVDLYQE
             300       310       320       330       

>>CCDS5158.1 TAAR1 gene_id:134864|Hs108|chr6              (339 aa)
 initn: 887 init1: 481 opt: 920  Z-score: 752.7  bits: 147.7 E(32554): 1.3e-35
Smith-Waterman score: 920; 39.3% identity (71.4% similar) in 336 aa overlap (9-342:1-336)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MTSNFSQPVVQLCYEDVNGSCIETPYSPGSRVILYTAFSFGSLLAVFGNLLVMTSVLHFK
               .. .:.. .: ::... .:   :. ::. . .  : .. :::.:..:. :::
CCDS51         MMPFCHNIINISCVKNNWSNDVRASLYSLMVLIILTTLVGNLIVIVSISHFK
                       10        20        30        40        50  

               70        80        90       100       110       120
pF1KE0 QLHSPTNFLIASLACADFLVGVTVMLFSMVRTVESCWYFGAKFCTLHSCCDVAFCYSSVL
       :::.:::.:: :.: .:::.:  :: .::::..: :::::  :: .:.  :. .  .:..
CCDS51 QLHTPTNWLIHSMATVDFLLGCLVMPYSMVRSAEHCWYFGEVFCKIHTSTDIMLSSASIF
             60        70        80        90       100       110  

              130       140       150       160       170       180
pF1KE0 HLCFICIDRYIVVTDPLVYATKFTVSVSGICISVSWILPLTYSGAVFYTGVNDDGLEELV
       :: :: :::: .: ::: : .:... :  . : .:: .: ... ....  .:  : ::. 
CCDS51 HLSFISIDRYYAVCDPLRYKAKMNILVICVMIFISWSVPAVFAFGMIFLELNFKGAEEIY
            120       130       140       150       160       170  

               190       200        210       220       230        
pF1KE0 -SALNCVGGCQIIVSQGWVLIDFLL-FFIPTLVMIILYSKIFLIAKQQAIKIETTSSKVE
        . ..: :::... :.   .. :.  :.::  .:. .: .:.::::.::  :  ...:..
CCDS51 YKHVHCRGGCSVFFSKISGVLTFMTSFYIPGSIMLCVYYRIYLIAKEQARLISDANQKLQ
            180       190       200       210       220       230  

      240       250       260       270       280       290        
pF1KE0 SSSESYKIRVAKRERKAAKTLGVTVLAFVISWLPYTVDILIDAFMGFLTPAYIYEICCWS
        . :  .    ..::::.::::... .:.: : :. .  ..: :. .. :  . ..  : 
CCDS51 IGLEMKNGISQSKERKAVKTLGIVMGVFLICWCPFFICTVMDPFLHYIIPPTLNDVLIWF
            240       250       260       270       280       290  

      300       310       320       330       340     
pF1KE0 AYYNSAMNPLIYALFYPWFRKAIKLILSGDVLKASSSTISLFLE   
       .: ::..::..::.::::::::.:..: : ... .::  .::::   
CCDS51 GYLNSTFNPMVYAFFYPWFRKALKMMLFGKIFQKDSSRCKLFLELSS
            300       310       320       330         

>>CCDS34541.1 TAAR2 gene_id:9287|Hs108|chr6               (351 aa)
 initn: 846 init1: 516 opt: 851  Z-score: 697.9  bits: 137.6 E(32554): 1.5e-32
Smith-Waterman score: 851; 38.5% identity (68.6% similar) in 322 aa overlap (13-332:25-337)

                           10        20        30        40        
pF1KE0             MTSNFSQPVVQLCYEDVNGSCIETPYSPGSRVILYTAFSFGSL-LAVF
                               : :  : :: :.  : : :: .:. :  ::. ...:
CCDS34 MAVSSEQHELSHFKRTQTKKEKFNCSEYGNRSCPENERSLGVRVAMYS-FMAGSIFITIF
               10        20        30        40         50         

        50        60        70        80        90       100       
pF1KE0 GNLLVMTSVLHFKQLHSPTNFLIASLACADFLVGVTVMLFSMVRTVESCWYFGAKFCTLH
       ::: .. :. .:::::.:::::: :.: .:::.: :.: .::.:.::.:::::  :: ..
CCDS34 GNLAMIISISYFKQLHTPTNFLILSMAITDFLLGFTIMPYSMIRSVENCWYFGLTFCKIY
      60        70        80        90       100       110         

       110       120       130       140       150       160       
pF1KE0 SCCDVAFCYSSVLHLCFICIDRYIVVTDPLVYATKFTVSVSGICISVSWILPLTYSGAVF
          :. .  .:..::: . :::. ..  ::.:.::.:. :    . . : .: ... .: 
CCDS34 YSFDLMLSITSIFHLCSVAIDRFYAICYPLLYSTKITIPVIKRLLLLCWSVPGAFAFGVV
     120       130       140       150       160       170         

       170       180       190       200        210       220      
pF1KE0 YTGVNDDGLEELVSALNCVGGCQIIVSQGWVLIDFLL-FFIPTLVMIILYSKIFLIAKQQ
       .. .  ::.:     . : ..: .. .. :    :.  :: :  .:. .:.::: .....
CCDS34 FSEAYADGIEGYDILVACSSSCPVMFNKLWGTTLFMAGFFTPGSMMVGIYGKIFAVSRKH
     180       190       200       210       220       230         

        230       240       250       260       270       280      
pF1KE0 AIKIETTSSKVESSSESYKIRVAKRERKAAKTLGVTVLAFVISWLPYTVDILIDAFMGFL
       :         ...  :. . .: :...:::::::... .:.. :.:    ::.: :..: 
CCDS34 A-------HAINNLRENQNNQV-KKDKKAAKTLGIVIGVFLLCWFPCFFTILLDPFLNFS
     240              250        260       270       280       290 

        290       300       310       320       330       340      
pF1KE0 TPAYIYEICCWSAYYNSAMNPLIYALFYPWFRKAIKLILSGDVLKASSSTISLFLE    
       ::. ...   : .:.::. :::::..::::::.:.: :: : ....              
CCDS34 TPVVLFDALTWFGYFNSTCNPLIYGFFYPWFRRALKYILLGKIFSSCFHNTILCMQKESE
             300       310       320       330       340       350 

>>CCDS5157.1 TAAR2 gene_id:9287|Hs108|chr6                (306 aa)
 initn: 801 init1: 471 opt: 800  Z-score: 658.1  bits: 130.0 E(32554): 2.5e-30
Smith-Waterman score: 800; 37.9% identity (69.8% similar) in 298 aa overlap (37-332:3-292)

         10        20        30        40         50        60     
pF1KE0 QPVVQLCYEDVNGSCIETPYSPGSRVILYTAFSFGSL-LAVFGNLLVMTSVLHFKQLHSP
                                     .:  ::. ...:::: .. :. .:::::.:
CCDS51                             MYSFMAGSIFITIFGNLAMIISISYFKQLHTP
                                           10        20        30  

          70        80        90       100       110       120     
pF1KE0 TNFLIASLACADFLVGVTVMLFSMVRTVESCWYFGAKFCTLHSCCDVAFCYSSVLHLCFI
       ::::: :.: .:::.: :.: .::.:.::.:::::  :: ..   :. .  .:..::: .
CCDS51 TNFLILSMAITDFLLGFTIMPYSMIRSVENCWYFGLTFCKIYYSFDLMLSITSIFHLCSV
             40        50        60        70        80        90  

         130       140       150       160       170       180     
pF1KE0 CIDRYIVVTDPLVYATKFTVSVSGICISVSWILPLTYSGAVFYTGVNDDGLEELVSALNC
        :::. ..  ::.:.::.:. :    . . : .: ... .: .. .  ::.:     . :
CCDS51 AIDRFYAICYPLLYSTKITIPVIKRLLLLCWSVPGAFAFGVVFSEAYADGIEGYDILVAC
            100       110       120       130       140       150  

         190       200        210       220       230       240    
pF1KE0 VGGCQIIVSQGWVLIDFLL-FFIPTLVMIILYSKIFLIAKQQAIKIETTSSKVESSSESY
        ..: .. .. :    :.  :: :  .:. .:.::: .....:         ...  :. 
CCDS51 SSSCPVMFNKLWGTTLFMAGFFTPGSMMVGIYGKIFAVSRKHA-------HAINNLRENQ
            160       170       180       190              200     

          250       260       270       280       290       300    
pF1KE0 KIRVAKRERKAAKTLGVTVLAFVISWLPYTVDILIDAFMGFLTPAYIYEICCWSAYYNSA
       . .: :...:::::::... .:.. :.:    ::.: :..: ::. ...   : .:.::.
CCDS51 NNQV-KKDKKAAKTLGIVIGVFLLCWFPCFFTILLDPFLNFSTPVVLFDALTWFGYFNST
          210       220       230       240       250       260    

          310       320       330       340      
pF1KE0 MNPLIYALFYPWFRKAIKLILSGDVLKASSSTISLFLE    
        :::::..::::::.:.: :: : ....              
CCDS51 CNPLIYGFFYPWFRRALKYILLGKIFSSCFHNTILCMQKESE
          270       280       290       300      

>>CCDS34273.2 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5                (360 aa)
 initn: 461 init1: 206 opt: 405  Z-score: 344.6  bits: 72.2 E(32554): 7.1e-13
Smith-Waterman score: 583; 32.1% identity (64.5% similar) in 327 aa overlap (16-328:5-330)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MTSNFSQPVVQLCYEDVNGSCIETPYSPGSRVILYTAFSFGSLLAVFGNLLVMTSVLHFK
                      :.: :  :  ..   .:.: : .:   :.:..::::::..:   .
CCDS34            MDKLDANVSS-EEGFGSVEKVVLLTFLSTVILMAILGNLLVMVAVCWDR
                          10         20        30        40        

                70        80        90       100       110         
pF1KE0 QLHS-PTNFLIASLACADFLVGVTVMLFSMVRTVESCWYFGAKFCTLHSCCDVAFCYSSV
       ::..  ::..:.::: ::.::.: :: :. .. :.. : .:  :: ...  :: .  .:.
CCDS34 QLRKIKTNYFIVSLAFADLLVSVLVMPFGAIELVQDIWIYGEVFCLVRTSLDVLLTTASI
       50        60        70        80        90       100        

     120       130        140       150       160       170        
pF1KE0 LHLCFICIDRYIVVT-DPLVYATKFTVSVSGICISVSWILPLTYSGAVFYTGVNDDGLEE
       .::: : .::: ..  .:::: .:.:    .. ..  :..:   :   .. : :. :. .
CCDS34 FHLCCISLDRYYAICCQPLVYRNKMTPLRIALMLGGCWVIPTFISFLPIMQGWNNIGIID
      110       120       130       140       150       160        

      180            190       200        210       220       230  
pF1KE0 LVSA--LNCVGG---CQIIVSQGWVLI-DFLLFFIPTLVMIILYSKIFLIAKQQAIKIE-
       :.    .:  ..   : ..:.. ...  . . :.:: :.:.. : .:.. ::..: .:. 
CCDS34 LIEKRKFNQNSNSTYCVFMVNKPYAITCSVVAFYIPFLLMVLAYYRIYVTAKEHAHQIQM
      170       180       190       200       210       220        

                  240       250       260       270       280      
pF1KE0 -----TTSSKVESSSESYKIRVAKRERKAAKTLGVTVLAFVISWLPYTVDILIDAFMGFL
            ..: .  .:..... .  . : :::::: . .  : . : :. :  ..: :. . 
CCDS34 LQRAGASSESRPQSADQHSTHRMRTETKAAKTLCIIMGCFCLCWAPFFVTNIVDPFIDYT
      230       240       250       260       270       280        

        290       300       310       320       330       340      
pF1KE0 TPAYIYEICCWSAYYNSAMNPLIYALFYPWFRKAIKLILSGDVLKASSSTISLFLE    
       .:. ..    : .: ::..::..::..   ::.:. .::  :                  
CCDS34 VPGQVWTAFLWLGYINSGLNPFLYAFLNKSFRRAFLIILCCDDERYRRPSILGQTVPCST
      290       300       310       320       330       340        

CCDS34 TTINGSTHVLRF
      350       360

>>CCDS34271.1 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5                (378 aa)
 initn: 438 init1: 206 opt: 405  Z-score: 344.4  bits: 72.3 E(32554): 7.3e-13
Smith-Waterman score: 583; 32.1% identity (64.5% similar) in 327 aa overlap (16-328:5-330)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MTSNFSQPVVQLCYEDVNGSCIETPYSPGSRVILYTAFSFGSLLAVFGNLLVMTSVLHFK
                      :.: :  :  ..   .:.: : .:   :.:..::::::..:   .
CCDS34            MDKLDANVSS-EEGFGSVEKVVLLTFLSTVILMAILGNLLVMVAVCWDR
                          10         20        30        40        

                70        80        90       100       110         
pF1KE0 QLHS-PTNFLIASLACADFLVGVTVMLFSMVRTVESCWYFGAKFCTLHSCCDVAFCYSSV
       ::..  ::..:.::: ::.::.: :: :. .. :.. : .:  :: ...  :: .  .:.
CCDS34 QLRKIKTNYFIVSLAFADLLVSVLVMPFGAIELVQDIWIYGEVFCLVRTSLDVLLTTASI
       50        60        70        80        90       100        

     120       130        140       150       160       170        
pF1KE0 LHLCFICIDRYIVVT-DPLVYATKFTVSVSGICISVSWILPLTYSGAVFYTGVNDDGLEE
       .::: : .::: ..  .:::: .:.:    .. ..  :..:   :   .. : :. :. .
CCDS34 FHLCCISLDRYYAICCQPLVYRNKMTPLRIALMLGGCWVIPTFISFLPIMQGWNNIGIID
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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