Result of FASTA (ccds) for pF1KE0840
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE0840, 345 aa
  1>>>pF1KE0840 345 - 345 aa - 345 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2863+/-0.00124; mu= 16.6076+/- 0.073
 mean_var=179.5253+/-76.222, 0's: 0 Z-trim(103.3): 332  B-trim: 963 in 2/47
 Lambda= 0.095722
 statistics sampled from 6769 (7366) to 6769 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.57), E-opt: 0.2 (0.226), width:  16
 Scan time:  2.200

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS5155.1 TAAR6 gene_id:319100|Hs108|chr6         ( 345) 2317 333.3 1.9e-91
CCDS5154.1 TAAR8 gene_id:83551|Hs108|chr6          ( 342) 1880 272.9 2.7e-73
CCDS75520.1 TAAR9 gene_id:134860|Hs108|chr6        ( 348) 1690 246.7 2.2e-65
CCDS5156.1 TAAR5 gene_id:9038|Hs108|chr6           ( 337) 1025 154.8 9.4e-38
CCDS5158.1 TAAR1 gene_id:134864|Hs108|chr6         ( 339)  941 143.2 2.9e-34
CCDS34541.1 TAAR2 gene_id:9287|Hs108|chr6          ( 351)  894 136.7 2.7e-32
CCDS5157.1 TAAR2 gene_id:9287|Hs108|chr6           ( 306)  861 132.1 5.9e-31
CCDS83269.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8          ( 342)  468 77.9 1.4e-14
CCDS6052.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8           ( 429)  468 78.1 1.5e-14
CCDS6053.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8           ( 455)  468 78.1 1.6e-14
CCDS6054.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8           ( 466)  468 78.1 1.6e-14
CCDS34869.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8          ( 475)  468 78.1 1.6e-14
CCDS4395.1 HRH2 gene_id:3274|Hs108|chr5            ( 359)  429 72.6 5.8e-13
CCDS47344.1 HRH2 gene_id:3274|Hs108|chr5           ( 397)  429 72.6 6.1e-13
CCDS13826.1 ADORA2A gene_id:135|Hs108|chr22        ( 412)  427 72.4 7.6e-13
CCDS34273.2 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5           ( 360)  418 71.0 1.7e-12
CCDS34271.1 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5           ( 378)  418 71.1 1.7e-12
CCDS34270.1 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5           ( 387)  418 71.1 1.7e-12
CCDS4291.1 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5            ( 388)  418 71.1 1.7e-12
CCDS75353.1 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5           ( 411)  418 71.1 1.8e-12
CCDS34272.1 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5           ( 428)  418 71.2 1.8e-12
CCDS4292.1 ADRB2 gene_id:154|Hs108|chr5            ( 413)  414 70.6 2.6e-12
CCDS7569.2 ADRA2A gene_id:150|Hs108|chr10          ( 465)  403 69.1   8e-12
CCDS4986.1 HTR1B gene_id:3351|Hs108|chr6           ( 390)  400 68.6 9.8e-12
CCDS56129.1 ADRA2B gene_id:151|Hs108|chr2          ( 450)  397 68.3 1.4e-11
CCDS231.1 HTR1D gene_id:3352|Hs108|chr1            ( 377)  395 67.9 1.5e-11
CCDS47004.1 ADRA2C gene_id:152|Hs108|chr4          ( 462)  390 67.3 2.8e-11
CCDS7376.1 OPN4 gene_id:94233|Hs108|chr10          ( 478)  387 67.0 3.8e-11
CCDS8297.1 GPR83 gene_id:10888|Hs108|chr11         ( 423)  385 66.6 4.3e-11
CCDS4347.1 ADRA1B gene_id:147|Hs108|chr5           ( 520)  386 66.9 4.3e-11
CCDS34168.1 HTR1A gene_id:3350|Hs108|chr5          ( 422)  380 65.9 6.9e-11
CCDS4393.1 DRD1 gene_id:1812|Hs108|chr5            ( 446)  378 65.7 8.6e-11


>>CCDS5155.1 TAAR6 gene_id:319100|Hs108|chr6              (345 aa)
 initn: 2317 init1: 2317 opt: 2317  Z-score: 1755.4  bits: 333.3 E(32554): 1.9e-91
Smith-Waterman score: 2317; 100.0% identity (100.0% similar) in 345 aa overlap (1-345:1-345)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MSSNSSLLVAVQLCYANVNGSCVKIPFSPGSRVILYIVFGFGAVLAVFGNLLVMISILHF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS51 MSSNSSLLVAVQLCYANVNGSCVKIPFSPGSRVILYIVFGFGAVLAVFGNLLVMISILHF
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE0 KQLHSPTNFLVASLACADFLVGVTVMPFSMVRTVESCWYFGRSFCTFHTCCDVAFCYSSL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS51 KQLHSPTNFLVASLACADFLVGVTVMPFSMVRTVESCWYFGRSFCTFHTCCDVAFCYSSL
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE0 FHLCFISIDRYIAVTDPLVYPTKFTVSVSGICISVSWILPLMYSGAVFYTGVYDDGLEEL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS51 FHLCFISIDRYIAVTDPLVYPTKFTVSVSGICISVSWILPLMYSGAVFYTGVYDDGLEEL
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE0 SDALNCIGGCQTVVNQNWVLTDFLSFFIPTFIMIILYGNIFLVARRQAKKIENTGSKTES
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS51 SDALNCIGGCQTVVNQNWVLTDFLSFFIPTFIMIILYGNIFLVARRQAKKIENTGSKTES
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE0 SSESYKARVARRERKAAKTLGVTVVAFMISWLPYSIDSLIDAFMGFITPACIYEICCWCA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS51 SSESYKARVARRERKAAKTLGVTVVAFMISWLPYSIDSLIDAFMGFITPACIYEICCWCA
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340     
pF1KE0 YYNSAMNPLIYALFYPWFRKAIKVIVTGQVLKNSSATMNLFSEHI
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS51 YYNSAMNPLIYALFYPWFRKAIKVIVTGQVLKNSSATMNLFSEHI
              310       320       330       340     

>>CCDS5154.1 TAAR8 gene_id:83551|Hs108|chr6               (342 aa)
 initn: 1890 init1: 1870 opt: 1880  Z-score: 1429.3  bits: 272.9 E(32554): 2.7e-73
Smith-Waterman score: 1880; 79.6% identity (92.7% similar) in 343 aa overlap (1-343:1-342)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MSSNSSLLVAVQLCYANVNGSCVKIPFSPGSRVILYIVFGFGAVLAVFGNLLVMISILHF
       :.:: :  : ::::: .:::::.. :.::::::::: .:.::..:::::::::: :.:::
CCDS51 MTSNFSQPV-VQLCYEDVNGSCIETPYSPGSRVILYTAFSFGSLLAVFGNLLVMTSVLHF
                10        20        30        40        50         

               70        80        90       100       110       120
pF1KE0 KQLHSPTNFLVASLACADFLVGVTVMPFSMVRTVESCWYFGRSFCTFHTCCDVAFCYSSL
       ::::::::::.::::::::::::::: :::::::::::::: .:::.:.::::::::::.
CCDS51 KQLHSPTNFLIASLACADFLVGVTVMLFSMVRTVESCWYFGAKFCTLHSCCDVAFCYSSV
      60        70        80        90       100       110         

              130       140       150       160       170       180
pF1KE0 FHLCFISIDRYIAVTDPLVYPTKFTVSVSGICISVSWILPLMYSGAVFYTGVYDDGLEEL
       .::::: :::::.::::::: :::::::::::::::::::: :::::::::: :::::::
CCDS51 LHLCFICIDRYIVVTDPLVYATKFTVSVSGICISVSWILPLTYSGAVFYTGVNDDGLEEL
     120       130       140       150       160       170         

              190       200       210       220       230       240
pF1KE0 SDALNCIGGCQTVVNQNWVLTDFLSFFIPTFIMIILYGNIFLVARRQAKKIENTGSKTES
        .::::.:::: .:.:.::: ::: :::::..:::::..:::.:..:: :::.:.::.::
CCDS51 VSALNCVGGCQIIVSQGWVLIDFLLFFIPTLVMIILYSKIFLIAKQQAIKIETTSSKVES
     180       190       200       210       220       230         

              250       260       270       280       290       300
pF1KE0 SSESYKARVARRERKAAKTLGVTVVAFMISWLPYSIDSLIDAFMGFITPACIYEICCWCA
       :::::: :::.:::::::::::::.::.::::::..: ::::::::.::: ::::::: :
CCDS51 SSESYKIRVAKRERKAAKTLGVTVLAFVISWLPYTVDILIDAFMGFLTPAYIYEICCWSA
     240       250       260       270       280       290         

              310       320       330       340     
pF1KE0 YYNSAMNPLIYALFYPWFRKAIKVIVTGQVLKNSSATMNLFSEHI
       :::::::::::::::::::::::.:..:.::: ::.:..:: :  
CCDS51 YYNSAMNPLIYALFYPWFRKAIKLILSGDVLKASSSTISLFLE  
     300       310       320       330       340    

>>CCDS75520.1 TAAR9 gene_id:134860|Hs108|chr6             (348 aa)
 initn: 1730 init1: 1682 opt: 1690  Z-score: 1287.4  bits: 246.7 E(32554): 2.2e-65
Smith-Waterman score: 1690; 69.0% identity (89.0% similar) in 345 aa overlap (1-345:1-345)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MSSNSSLLVAVQLCYANVNGSCVKIPFSPGSRVILYIVFGFGAVLAVFGNLLVMISILHF
       : .: :   ::.::: ::: ::.: :.::: : ::: :.:::::::.::::::::.::::
CCDS75 MVNNFSQAEAVELCYKNVNESCIKTPYSPGPRSILYAVLGFGAVLAAFGNLLVMIAILHF
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE0 KQLHSPTNFLVASLACADFLVGVTVMPFSMVRTVESCWYFGRSFCTFHTCCDVAFCYSSL
       ::::.:::::.:::::::::::::::::: ::.:::::::: :.: :::: :..::..::
CCDS75 KQLHTPTNFLIASLACADFLVGVTVMPFSTVRSVESCWYFGDSYCKFHTCFDTSFCFASL
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE0 FHLCFISIDRYIAVTDPLVYPTKFTVSVSGICISVSWILPLMYSGAVFYTGVYDDGLEEL
       :::: ::.::::::::::.:::::::::::::: .::.. . :: ..::::. ..:.:::
CCDS75 FHLCCISVDRYIAVTDPLTYPTKFTVSVSGICIVLSWFFSVTYSFSIFYTGANEEGIEEL
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE0 SDALNCIGGCQTVVNQNWVLTDFLSFFIPTFIMIILYGNIFLVARRQAKKIENTGSKTES
         ::.:.::::. .::::::  :: ::::.  :...:..:::::..::.:::.:.:...:
CCDS75 VVALTCVGGCQAPLNQNWVLLCFLLFFIPNVAMVFIYSKIFLVAKHQARKIESTASQAQS
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE0 SSESYKARVARRERKAAKTLGVTVVAFMISWLPYSIDSLIDAFMGFITPACIYEICCWCA
       :::::: :::.::::::::::....::..::::: .:..:::.:.::::  .:::  ::.
CCDS75 SSESYKERVAKRERKAAKTLGIAMAAFLVSWLPYLVDAVIDAYMNFITPPYVYEILVWCV
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340        
pF1KE0 YYNSAMNPLIYALFYPWFRKAIKVIVTGQVLKNSSATMNLFSEHI   
       ::::::::::::.:: :: ::::.::.:.::...:.: :::::..   
CCDS75 YYNSAMNPLIYAFFYQWFGKAIKLIVSGKVLRTDSSTTNLFSEEVETD
              310       320       330       340        

>>CCDS5156.1 TAAR5 gene_id:9038|Hs108|chr6                (337 aa)
 initn: 1037 init1: 699 opt: 1025  Z-score: 791.2  bits: 154.8 E(32554): 9.4e-38
Smith-Waterman score: 1025; 43.8% identity (74.9% similar) in 331 aa overlap (13-343:16-337)

                  10        20        30        40        50       
pF1KE0    MSSNSSLLVAVQLCYANVNGSCVKIPFSPGSRVILYIVFGFGAVLAVFGNLLVMISI
                      .:: .::::: .   . : ....:.. . : .. :.::..: ...
CCDS51 MRAVFIQGAEEHPAAFCY-QVNGSCPRTVHTLGIQLVIYLACAAGMLIIVLGNVFVAFAV
               10         20        30        40        50         

        60        70        80        90       100       110       
pF1KE0 LHFKQLHSPTNFLVASLACADFLVGVTVMPFSMVRTVESCWYFGRSFCTFHTCCDVAFCY
        .:: ::.:::::. ::: ::...:. :.:.: .:.:::::.::  .: .::  :. :: 
CCDS51 SYFKALHTPTNFLLLSLALADMFLGLLVLPLSTIRSVESCWFFGDFLCRLHTYLDTLFCL
      60        70        80        90       100       110         

       120       130       140       150       160       170       
pF1KE0 SSLFHLCFISIDRYIAVTDPLVYPTKFTVSVSGICISVSWILPLMYSGAVFYTGVYDDGL
       .:.::::::::::. :. :::.::.:::: :.   : ..: .:  :..  .:: : .  :
CCDS51 TSIFHLCFISIDRHCAICDPLLYPSKFTVRVALRYILAGWGVPAAYTSLFLYTDVVETRL
     120       130       140       150       160       170         

       180       190       200       210       220       230       
pF1KE0 EELSDALNCIGGCQTVVNQNWVLTDFLSFFIPTFIMIILYGNIFLVARRQAKKIENTGSK
        .  . . :.:.:: ..:. :   .:  ::.: .::: :: .::.:: :::..: .: ::
CCDS51 SQWLEEMPCVGSCQLLLNKFWGWLNFPLFFVPCLIMISLYVKIFVVATRQAQQI-TTLSK
     180       190       200       210       220       230         

       240       250       260       270       280       290       
pF1KE0 TESSSESYKARVARRERKAAKTLGVTVVAFMISWLPYSIDSLIDAFMGFITPACIYEICC
       . ...       :..:::::::::..:  ... :::..::...:... ::::  ...:  
CCDS51 SLAGA-------AKHERKAAKTLGIAVGIYLLCWLPFTIDTMVDSLLHFITPPLVFDIFI
      240              250       260       270       280       290 

       300       310       320       330       340     
pF1KE0 WCAYYNSAMNPLIYALFYPWFRKAIKVIVTGQVLKNSSATMNLFSEHI
       : ::.::: ::.::.. : :::::.:. .. .:.. .. :..:..:  
CCDS51 WFAYFNSACNPIIYVFSYQWFRKALKLTLSQKVFSPQTRTVDLYQE  
             300       310       320       330         

>>CCDS5158.1 TAAR1 gene_id:134864|Hs108|chr6              (339 aa)
 initn: 932 init1: 506 opt: 941  Z-score: 728.5  bits: 143.2 E(32554): 2.9e-34
Smith-Waterman score: 941; 41.1% identity (72.1% similar) in 333 aa overlap (13-343:4-336)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MSSNSSLLVAVQLCYANVNGSCVKIPFSPGSRVILYIVFGFGAVLAVFGNLLVMISILHF
                   .:.  .: ::::  .:   :. :: .. .  . .. :::.:..:: ::
CCDS51          MMPFCHNIINISCVKNNWSNDVRASLYSLMVLIILTTLVGNLIVIVSISHF
                        10        20        30        40        50 

               70        80        90       100       110       120
pF1KE0 KQLHSPTNFLVASLACADFLVGVTVMPFSMVRTVESCWYFGRSFCTFHTCCDVAFCYSSL
       ::::.:::.:. :.: .:::.:  :::.::::..: :::::. :: .::  :. .  .:.
CCDS51 KQLHTPTNWLIHSMATVDFLLGCLVMPYSMVRSAEHCWYFGEVFCKIHTSTDIMLSSASI
              60        70        80        90       100       110 

              130       140       150       160       170       180
pF1KE0 FHLCFISIDRYIAVTDPLVYPTKFTVSVSGICISVSWILPLMYSGAVFYTGVYDDGLEEL
       ::: ::::::: :: ::: : .:... :  . : .:: .: ... ....  .   : ::.
CCDS51 FHLSFISIDRYYAVCDPLRYKAKMNILVICVMIFISWSVPAVFAFGMIFLELNFKGAEEI
             120       130       140       150       160       170 

               190        200       210       220       230        
pF1KE0 S-DALNCIGGCQTVVNQ-NWVLTDFLSFFIPTFIMIILYGNIFLVARRQAKKIENTGSKT
           ..: :::..  .. . ::: . ::.::  ::. .:  :.:.:..::. : ....: 
CCDS51 YYKHVHCRGGCSVFFSKISGVLTFMTSFYIPGSIMLCVYYRIYLIAKEQARLISDANQKL
             180       190       200       210       220       230 

      240       250       260       270       280       290        
pF1KE0 ESSSESYKARVARRERKAAKTLGVTVVAFMISWLPYSIDSLIDAFMGFITPACIYEICCW
       . . :  ..    .::::.::::... .:.: : :. : ...: :. .: :  . ..  :
CCDS51 QIGLEMKNGISQSKERKAVKTLGIVMGVFLICWCPFFICTVMDPFLHYIIPPTLNDVLIW
             240       250       260       270       280       290 

      300       310       320       330       340      
pF1KE0 CAYYNSAMNPLIYALFYPWFRKAIKVIVTGQVLKNSSATMNLFSEHI 
        .: ::..::..::.::::::::.:... :......:.  .:: :   
CCDS51 FGYLNSTFNPMVYAFFYPWFRKALKMMLFGKIFQKDSSRCKLFLELSS
             300       310       320       330         

>>CCDS34541.1 TAAR2 gene_id:9287|Hs108|chr6               (351 aa)
 initn: 867 init1: 500 opt: 894  Z-score: 693.3  bits: 136.7 E(32554): 2.7e-32
Smith-Waterman score: 894; 39.6% identity (70.1% similar) in 321 aa overlap (14-333:25-337)

                          10        20        30        40         
pF1KE0            MSSNSSLLVAVQLCYANVNGSCVKIPFSPGSRVILYIVFGFGAVLAVFG
                               :    : :: .   : : :: .:  .. .  ...::
CCDS34 MAVSSEQHELSHFKRTQTKKEKFNCSEYGNRSCPENERSLGVRVAMYSFMAGSIFITIFG
               10        20        30        40        50        60

      50        60        70        80        90       100         
pF1KE0 NLLVMISILHFKQLHSPTNFLVASLACADFLVGVTVMPFSMVRTVESCWYFGRSFCTFHT
       :: ..::: .:::::.:::::. :.: .:::.: :.::.::.:.::.::::: .:: .. 
CCDS34 NLAMIISISYFKQLHTPTNFLILSMAITDFLLGFTIMPYSMIRSVENCWYFGLTFCKIYY
               70        80        90       100       110       120

     110       120       130       140       150       160         
pF1KE0 CCDVAFCYSSLFHLCFISIDRYIAVTDPLVYPTKFTVSVSGICISVSWILPLMYSGAVFY
         :. .  .:.:::: ..:::. :.  ::.: ::.:. :    . . : .:  .. .: .
CCDS34 SFDLMLSITSIFHLCSVAIDRFYAICYPLLYSTKITIPVIKRLLLLCWSVPGAFAFGVVF
              130       140       150       160       170       180

     170       180       190       200        210       220        
pF1KE0 TGVYDDGLEELSDALNCIGGCQTVVNQNWVLTDFLS-FFIPTFIMIILYGNIFLVARRQA
       . .: ::.:  .  . : ..: .. :. :  : :.. :: :  .:. .::.:: :.:..:
CCDS34 SEAYADGIEGYDILVACSSSCPVMFNKLWGTTLFMAGFFTPGSMMVGIYGKIFAVSRKHA
              190       200       210       220       230       240

      230       240       250       260       270       280        
pF1KE0 KKIENTGSKTESSSESYKARVARRERKAAKTLGVTVVAFMISWLPYSIDSLIDAFMGFIT
       . :.:         :. . .: ....:::::::... .:.. :.:  .  :.: :..: :
CCDS34 HAINNL-------RENQNNQV-KKDKKAAKTLGIVIGVFLLCWFPCFFTILLDPFLNFST
                     250        260       270       280       290  

      290       300       310       320       330       340       
pF1KE0 PACIYEICCWCAYYNSAMNPLIYALFYPWFRKAIKVIVTGQVLKNSSATMNLFSEHI  
       :. ...   : .:.::. :::::..::::::.:.: :. :.....              
CCDS34 PVVLFDALTWFGYFNSTCNPLIYGFFYPWFRRALKYILLGKIFSSCFHNTILCMQKESE
            300       310       320       330       340       350 

>>CCDS5157.1 TAAR2 gene_id:9287|Hs108|chr6                (306 aa)
 initn: 833 init1: 466 opt: 861  Z-score: 669.2  bits: 132.1 E(32554): 5.9e-31
Smith-Waterman score: 861; 40.4% identity (72.4% similar) in 297 aa overlap (39-333:4-292)

       10        20        30        40         50        60       
pF1KE0 VAVQLCYANVNGSCVKIPFSPGSRVILYIVFGFGAV-LAVFGNLLVMISILHFKQLHSPT
                                     :  :.. ...:::: ..::: .:::::.::
CCDS51                            MYSFMAGSIFITIFGNLAMIISISYFKQLHTPT
                                          10        20        30   

        70        80        90       100       110       120       
pF1KE0 NFLVASLACADFLVGVTVMPFSMVRTVESCWYFGRSFCTFHTCCDVAFCYSSLFHLCFIS
       :::. :.: .:::.: :.::.::.:.::.::::: .:: ..   :. .  .:.:::: ..
CCDS51 NFLILSMAITDFLLGFTIMPYSMIRSVENCWYFGLTFCKIYYSFDLMLSITSIFHLCSVA
            40        50        60        70        80        90   

       130       140       150       160       170       180       
pF1KE0 IDRYIAVTDPLVYPTKFTVSVSGICISVSWILPLMYSGAVFYTGVYDDGLEELSDALNCI
       :::. :.  ::.: ::.:. :    . . : .:  .. .: .. .: ::.:  .  . : 
CCDS51 IDRFYAICYPLLYSTKITIPVIKRLLLLCWSVPGAFAFGVVFSEAYADGIEGYDILVACS
           100       110       120       130       140       150   

       190       200        210       220       230       240      
pF1KE0 GGCQTVVNQNWVLTDFLS-FFIPTFIMIILYGNIFLVARRQAKKIENTGSKTESSSESYK
       ..: .. :. :  : :.. :: :  .:. .::.:: :.:..:. :.:         :. .
CCDS51 SSCPVMFNKLWGTTLFMAGFFTPGSMMVGIYGKIFAVSRKHAHAINNL-------RENQN
           160       170       180       190       200             

        250       260       270       280       290       300      
pF1KE0 ARVARRERKAAKTLGVTVVAFMISWLPYSIDSLIDAFMGFITPACIYEICCWCAYYNSAM
        .: ....:::::::... .:.. :.:  .  :.: :..: ::. ...   : .:.::. 
CCDS51 NQV-KKDKKAAKTLGIVIGVFLLCWFPCFFTILLDPFLNFSTPVVLFDALTWFGYFNSTC
         210       220       230       240       250       260     

        310       320       330       340       
pF1KE0 NPLIYALFYPWFRKAIKVIVTGQVLKNSSATMNLFSEHI  
       :::::..::::::.:.: :. :.....              
CCDS51 NPLIYGFFYPWFRRALKYILLGKIFSSCFHNTILCMQKESE
         270       280       290       300      

>>CCDS83269.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8               (342 aa)
 initn: 419 init1: 327 opt: 468  Z-score: 375.5  bits: 77.9 E(32554): 1.4e-14
Smith-Waterman score: 480; 32.6% identity (60.4% similar) in 298 aa overlap (16-281:8-295)

               10        20          30        40        50        
pF1KE0 MSSNSSLLVAVQLCYANVNGSCVK--IPFSPGSRVILYIVFGFGAVLAVFGNLLVMISIL
                      :. ...:..   : . .. ..: ...:   ...:.::.::..:. 
CCDS83         MVFLSGNASDSSNCTQPPAPVNISKAILLGVILGGLILFGVLGNILVILSVA
                       10        20        30        40        50  

       60        70        80        90       100       110        
pF1KE0 HFKQLHSPTNFLVASLACADFLVGVTVMPFSMVRTVESCWYFGRSFCTFHTCCDVAFCYS
         ..::: :.. ...:: ::.:.  ::.::: .  : . : ::: ::.. .  ::  : .
CCDS83 CHRHLHSVTHYYIVNLAVADLLLTSTVLPFSAIFEVLGYWAFGRVFCNIWAAVDVLCCTA
             60        70        80        90       100       110  

      120       130       140       150       160        170       
pF1KE0 SLFHLCFISIDRYIAVTDPLVYPTKFTVSVSGICISVSWILPLMYS-GAVFYTGVYDDGL
       :.. ::.:::::::.:. :: :::  :   . . .   : : :. : : .:       : 
CCDS83 SIMGLCIISIDRYIGVSYPLRYPTIVTQRRGLMALLCVWALSLVISIGPLF-------GW
            120       130       140       150       160            

       180       190       200        210       220       230      
pF1KE0 EELSDALNCIGGCQTVVNQNWVLTDFL-SFFIPTFIMIILYGNIFLVARRQAKKIENTGS
       .. .   . :  ::   . ..:: . : ::..:  :....:  ...::.:... .. .: 
CCDS83 RQPAPEDETI--CQINEEPGYVLFSALGSFYLPLAIILVMYCRVYVVAKRESRGLK-SGL
         170         180       190       200       210        220  

        240        250                                  260        
pF1KE0 KTESS-SESYKARVAR---------------------------RERKAAKTLGVTVVAFM
       ::..: ::.   :. :                           ::.:::::::..:  :.
CCDS83 KTDKSDSEQVTLRIHRKNAPAGGSGMASAKTKTHFSVRLLKFSREKKAAKTLGIVVGCFV
            230       240       250       260       270       280  

      270       280       290       300       310       320        
pF1KE0 ISWLPYSIDSLIDAFMGFITPACIYEICCWCAYYNSAMNPLIYALFYPWFRKAIKVIVTG
       . :::. .   ::                                               
CCDS83 LCWLPFFLVMPIDEETEAQEGKNDSPSFKQPVHHAAVLGLEVMEKENLEGVSRKDTCGVW
            290       300       310       320       330       340  

>>CCDS6052.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8                (429 aa)
 initn: 462 init1: 327 opt: 468  Z-score: 374.6  bits: 78.1 E(32554): 1.5e-14
Smith-Waterman score: 569; 31.9% identity (59.6% similar) in 364 aa overlap (16-344:8-361)

               10        20          30        40        50        
pF1KE0 MSSNSSLLVAVQLCYANVNGSCVK--IPFSPGSRVILYIVFGFGAVLAVFGNLLVMISIL
                      :. ...:..   : . .. ..: ...:   ...:.::.::..:. 
CCDS60         MVFLSGNASDSSNCTQPPAPVNISKAILLGVILGGLILFGVLGNILVILSVA
                       10        20        30        40        50  

       60        70        80        90       100       110        
pF1KE0 HFKQLHSPTNFLVASLACADFLVGVTVMPFSMVRTVESCWYFGRSFCTFHTCCDVAFCYS
         ..::: :.. ...:: ::.:.  ::.::: .  : . : ::: ::.. .  ::  : .
CCDS60 CHRHLHSVTHYYIVNLAVADLLLTSTVLPFSAIFEVLGYWAFGRVFCNIWAAVDVLCCTA
             60        70        80        90       100       110  

      120       130       140       150       160        170       
pF1KE0 SLFHLCFISIDRYIAVTDPLVYPTKFTVSVSGICISVSWILPLMYS-GAVFYTGVYDDGL
       :.. ::.:::::::.:. :: :::  :   . . .   : : :. : : .:       : 
CCDS60 SIMGLCIISIDRYIGVSYPLRYPTIVTQRRGLMALLCVWALSLVISIGPLF-------GW
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       . :::. .   : .:.  . :.  ...:  : .: :: .::.::      :.::.. .. 
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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