Result of FASTA (omim) for
pF1KE0837
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0837, 318 aa
1>>>pF1KE0837 318 - 318 aa - 318 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.3942+/-0.000508; mu= 20.9083+/- 0.031
mean_var=73.2224+/-16.440, 0's: 0 Z-trim(107.4): 107 B-trim: 873 in 1/48
Lambda= 0.149883
statistics sampled from 15354 (15460) to 15354 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.507), E-opt: 0.2 (0.181), width: 16
Scan time: 6.870
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_076408 (OMIM: 604793) taste receptor type 2 mem ( 318) 2103 464.7 1.1e-130
NP_076406 (OMIM: 604795) taste receptor type 2 mem ( 312) 1029 232.4 9.1e-61
NP_076407 (OMIM: 604794) taste receptor type 2 mem ( 309) 989 223.8 3.6e-58
NP_058639 (OMIM: 604868) taste receptor type 2 mem ( 316) 844 192.4 1e-48
NP_076410 (OMIM: 604791) taste receptor type 2 mem ( 307) 795 181.8 1.5e-45
NP_852094 (OMIM: 613966) taste receptor type 2 mem ( 314) 790 180.7 3.3e-45
NP_076409 (OMIM: 604792) taste receptor type 2 mem ( 303) 761 174.5 2.5e-43
NP_076411 (OMIM: 604790) taste receptor type 2 mem ( 317) 722 166.0 8.9e-41
NP_001091112 (OMIM: 613963) taste receptor type 2 ( 319) 692 159.6 8e-39
NP_795370 (OMIM: 613962) taste receptor type 2 mem ( 309) 690 159.1 1.1e-38
NP_795368 (OMIM: 612774) taste receptor type 2 mem ( 309) 690 159.1 1.1e-38
NP_795365 (OMIM: 612668) taste receptor type 2 mem ( 309) 686 158.2 1.9e-38
NP_795369 (OMIM: 613961) taste receptor type 2 mem ( 299) 678 156.5 6.3e-38
NP_795367 (OMIM: 613967) taste receptor type 2 mem ( 299) 659 152.4 1.1e-36
XP_006726600 (OMIM: 612668) PREDICTED: taste recep ( 299) 659 152.4 1.1e-36
XP_003961040 (OMIM: 612668) PREDICTED: taste recep ( 299) 659 152.4 1.1e-36
NP_795366 (OMIM: 612669) taste receptor type 2 mem ( 309) 655 151.5 2e-36
NP_795371 (OMIM: 609627) taste receptor type 2 mem ( 299) 618 143.5 5e-34
NP_795364 (OMIM: 613965) taste receptor type 2 mem ( 307) 536 125.8 1.1e-28
NP_795363 (OMIM: 613964) taste receptor type 2 mem ( 323) 512 120.6 4.2e-27
NP_789787 (OMIM: 171200,607751) taste receptor typ ( 333) 511 120.4 5e-27
NP_062545 (OMIM: 604796) taste receptor type 2 mem ( 299) 503 118.7 1.5e-26
NP_803186 (OMIM: 613968) taste receptor type 2 mem ( 318) 500 118.0 2.5e-26
NP_058640 (OMIM: 604869) taste receptor type 2 mem ( 299) 478 113.3 6.5e-25
NP_058641 (OMIM: 103780,604867) taste receptor typ ( 291) 383 92.7 9.8e-19
NP_061853 (OMIM: 605062) taste receptor type 2 mem ( 299) 263 66.8 6.5e-11
NP_065684 (OMIM: 605234) vomeronasal type-1 recept ( 353) 156 43.7 0.00067
NP_001041 (OMIM: 182452) somatostatin receptor typ ( 369) 147 41.8 0.0026
NP_033611 (OMIM: 106165,145500,267430) type-1 angi ( 359) 146 41.6 0.003
NP_000676 (OMIM: 106165,145500,267430) type-1 angi ( 359) 146 41.6 0.003
NP_114438 (OMIM: 106165,145500,267430) type-1 angi ( 388) 146 41.6 0.0032
NP_004826 (OMIM: 106165,145500,267430) type-1 angi ( 394) 146 41.6 0.0032
NP_114038 (OMIM: 106165,145500,267430) type-1 angi ( 394) 146 41.6 0.0032
>>NP_076408 (OMIM: 604793) taste receptor type 2 member (318 aa)
initn: 2103 init1: 2103 opt: 2103 Z-score: 2466.9 bits: 464.7 E(85289): 1.1e-130
Smith-Waterman score: 2103; 100.0% identity (100.0% similar) in 318 aa overlap (1-318:1-318)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MADKVQTTLLFLAVGEFSVGILGNAFIGLVNCMDWVKKRKIASIDLILTSLAISRICLLC
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NP_076 MADKVQTTLLFLAVGEFSVGILGNAFIGLVNCMDWVKKRKIASIDLILTSLAISRICLLC
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 VILLDCFILVLYPDVYATGKEMRIIDFFWTLTNHLSIWFATCLSIYYFFKIGNFFHPLFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_076 VILLDCFILVLYPDVYATGKEMRIIDFFWTLTNHLSIWFATCLSIYYFFKIGNFFHPLFL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 WMKWRIDRVISWILLGCVVLSVFISLPATENLNADFRFCVKAKRKTNLTWSCRVNKTQHA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_076 WMKWRIDRVISWILLGCVVLSVFISLPATENLNADFRFCVKAKRKTNLTWSCRVNKTQHA
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190 200 210 220 230 240
pF1KE0 STKLFLNLATLLPFCVCLMSFFLLILSLRRHIRRMQLSATGCRDPSTEAHVRALKAVISF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_076 STKLFLNLATLLPFCVCLMSFFLLILSLRRHIRRMQLSATGCRDPSTEAHVRALKAVISF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 LLLFIAYYLSFLIATSSYFMPETELAVIFGESIALIYPSSHSFILILGNNKLRHASLKVI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_076 LLLFIAYYLSFLIATSSYFMPETELAVIFGESIALIYPSSHSFILILGNNKLRHASLKVI
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE0 WKVMSILKGRKFQQHKQI
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NP_076 WKVMSILKGRKFQQHKQI
310
>>NP_076406 (OMIM: 604795) taste receptor type 2 member (312 aa)
initn: 1035 init1: 538 opt: 1029 Z-score: 1211.9 bits: 232.4 E(85289): 9.1e-61
Smith-Waterman score: 1029; 48.2% identity (81.0% similar) in 311 aa overlap (1-311:1-308)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MADKVQTTLLFLAVGEFSVGILGNAFIGLVNCMDWVKKRKIASIDLILTSLAISRICLLC
: . ... ..: .::...:: ::.:: ::::.::.:.: :. ::.:: :::::::::::
NP_076 MPSAIEAIYIILIAGELTIGIWGNGFIVLVNCIDWLKRRDISLIDIILISLAISRICLLC
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 VILLDCFILVLYPDVYATGKEMRIIDFFWTLTNHLSIWFATCLSIYYFFKIGNFFHPLFL
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NP_076 VISLDGFFMLLFPGTYGNSVLVSIVNVVWTFANNSSLWFTSCLSIFYLLKIANISHPFFF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 WMKWRIDRVISWILLGCVVLSVFISLPATENLNADFRFCVKAKRKTNLTWSCRVNKTQHA
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NP_076 WLKLKINKVMLAILLGSFLISLIISVPKNDDM---WYHLFKVSHEENITWKFKVSKIPGT
130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 STKLFLNLATLLPFCVCLMSFFLLILSLRRHIRRMQLSATGCRDPSTEAHVRALKAVISF
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NP_076 FKQLTLNLGVMVPFILCLISFFLLLFSLVRHTKQIRLHATGFRDPSTEAHMRAIKAVIIF
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 LLLFIAYYLSFLIATSSYFMPETELAVIFGESIALIYPSSHSFILILGNNKLRHASLKVI
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NP_076 LLLLIVYYPVFLVMTSSALIPQGKLVLMIGDIVTVIFPSSHSFILIMGNSKLREAFLKML
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE0 WKVMSILKGRKFQQHKQI
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NP_076 RFVKCFLRRRKPFVP
300 310
>>NP_076407 (OMIM: 604794) taste receptor type 2 member (309 aa)
initn: 1006 init1: 980 opt: 989 Z-score: 1165.2 bits: 223.8 E(85289): 3.6e-58
Smith-Waterman score: 989; 47.7% identity (81.0% similar) in 300 aa overlap (1-300:1-300)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MADKVQTTLLFLAVGEFSVGILGNAFIGLVNCMDWVKKRKIASIDLILTSLAISRICLLC
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NP_076 MFSPADNIFIILITGEFILGILGNGYIALVNWIDWIKKKKISTVDYILTNLVIARICLIS
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pF1KE0 VILLDCFILVLYPDVYATGKEMRIIDFFWTLTNHLSIWFATCLSIYYFFKIGNFFHPLFL
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NP_076 VMVVNGIVIVLNPDVYTKNKQQIVIFTFWTFANYLNMWITTCLNVFYFLKIASSSHPLFL
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pF1KE0 WMKWRIDRVISWILLGCVVLSVFISLPATENLNADFRFCVKAKRKTNLTWSCRVNKTQHA
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NP_076 WLKWKIDMVVHWILLGCFAISLLVSLIAAIVLSCDYRFHAIAKHKRNITEMFHVSKIPYF
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pF1KE0 STKLFLNLATLLPFCVCLMSFFLLILSLRRHIRRMQLSATGCRDPSTEAHVRALKAVISF
..:: ...:: : :.:::::. :: :: ....: ::: ::::::.::::.:.. ::
NP_076 EPLTLFNLFAIVPFIVSLISFFLLVRSLWRHTKQIKLYATGSRDPSTEVHVRAIKTMTSF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 LLLFIAYYLSFLIATSSYFMPETELAVIFGESIALIYPSSHSFILILGNNKLRHASLKVI
...:. ::.: .. : ::.: . .::: ::: :..:: .::.:::. :::::.. ....
NP_076 IFFFFLYYISSILMTFSYLMTKYKLAVEFGEIAAILYPLGHSLILIVLNNKLRQTFVRML
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE0 WKVMSILKGRKFQQHKQI
NP_076 TCRKIACMI
>>NP_058639 (OMIM: 604868) taste receptor type 2 member (316 aa)
initn: 824 init1: 476 opt: 844 Z-score: 995.7 bits: 192.4 E(85289): 1e-48
Smith-Waterman score: 844; 44.6% identity (74.7% similar) in 296 aa overlap (1-294:1-293)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MADKVQTTLLFLAVGEFSVGILGNAFIGLVNCMDWVKKRKIASIDLILTSLAISRICLLC
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NP_058 MMGLTEGVFLILSGTQFTLGILVNCFIELVNGSSWFKTKRMSLSDFIITTLALLRIILLC
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pF1KE0 VILLDCFILVLYPDVYATGKEMRIIDFFWTLTNHLSIWFATCLSIYYFFKIGNFFHPLFL
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pF1KE0 WMKWRIDRVISWILLGCVVLSV--FISLPATENLNADFRFCVKAKRKTNLTWSCRVNKTQ
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NP_058 WLKWRVSRVMVWMLLGALLLSCGSTASLINEFKLYSVFR-GIEATR--NVTEHFRKKRSE
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pF1KE0 HASTKLFLNLATLLPFCVCLMSFFLLILSLRRHIRRMQLSATGCRDPSTEAHVRALKAVI
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NP_058 YYLIHVLGTLWYLPPLIVSLASYSLLIFSLGRHTRQMLQNGTSSRDPTTEAHKRAIRIIL
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pF1KE0 SFLLLFIAYYLSFLIATSSYFMPETELAVIFGESIALIYPSSHSFILILGNNKLRHASLK
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NP_058 SFFFLFLLYFLAFLIASFGNFLPKTKMAKMIGEVMTMFYPAGHSFILILGNSKLKQTFVV
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE0 VIWKVMSILKGRKFQQHKQI
NP_058 MLRCESGHLKPGSKGPIFS
300 310
>>NP_076410 (OMIM: 604791) taste receptor type 2 member (307 aa)
initn: 738 init1: 362 opt: 795 Z-score: 938.5 bits: 181.8 E(85289): 1.5e-45
Smith-Waterman score: 795; 41.1% identity (75.9% similar) in 299 aa overlap (5-303:5-295)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MADKVQTTLLFLAVGEFSVGILGNAFIGLVNCMDWVKKRKIASIDLILTSLAISRICLLC
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NP_076 MLRVVEGIFIFVVVSESVFGVLGNGFIGLVNCID-CAKNKLSTIGFILTGLAISRIFLIW
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pF1KE0 VILLDCFILVLYPDVYATGKEMRIIDFFWTLTNHLSIWFATCLSIYYFFKIGNFFHPLFL
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NP_076 IIITDGFIQIFSPNIYASGNLIEYISYFWVIGNQSSMWFATSLSIFYFLKIANFSNYIFL
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pF1KE0 WMKWRIDRVISWILLGCVVLSVFISLPATENLNADFRFCVKAKRKTNLTWSCRVNKTQHA
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NP_076 WLKSRTNMVLPFMIV-FLLISSLLNFAYIAKILNDY------KTKNDTVWDLNMYKSEYF
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pF1KE0 STKLFLNLATLLPFCVCLMSFFLLILSLRRHIRRMQLSATGCRDPSTEAHVRALKAVISF
...:::.... : . :.. ..::.:: :: :.:: ..:: :: .:::::.:.:..:::
NP_076 IKQILLNLGVIFFFTLSLITCIFLIISLWRHNRQMQSNVTGLRDSNTEAHVKAMKVLISF
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pF1KE0 LLLFIAYYLSFLIATSSYFMPETELAVIFGESIALIYPSSHSFILILGNNKLRHASLKVI
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NP_076 IILFILYFIGMAIEISCFTVRENKLLLMFGMTTTAIYPWGHSFILILGNSKLKQASLRVL
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE0 WKVMSILKGRKFQQHKQI
..
NP_076 QQLKCCEKRKNLRVT
300
>>NP_852094 (OMIM: 613966) taste receptor type 2 member (314 aa)
initn: 795 init1: 465 opt: 790 Z-score: 932.6 bits: 180.7 E(85289): 3.3e-45
Smith-Waterman score: 790; 41.8% identity (71.7% similar) in 311 aa overlap (1-308:1-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MADKVQTTLLFLAVGEFSVGILGNAFIGLVNCMDWVKKRKIASIDLILTSLAISRICLLC
:: ... .:.::..:: ...:::.::::::: . .:..:. : :.::: :::: : :
NP_852 MATELDKIFLILAIAEFIISMLGNVFIGLVNCSEGIKNQKVFSADFILTCLAISTIGQLL
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70 80 90 100 110 120
pF1KE0 VILLDCFILVLYPDVYATGKEMRIIDFFWTLTNHLSIWFATCLSIYYFFKIGNFFHPLFL
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NP_852 VILFDSFLVGLASHLYTTYRLGKTVIMLWHMTNHLTTWLATCLSIFYFFKIAHFPHSLFL
70 80 90 100 110 120
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pF1KE0 WMKWRIDRVISWILLGCVVLSVFISLPATENLNADFRFCVKAKRKTNLTWSCRVNKTQHA
:..::.. .: .:. . : .: :: . .. :. . . : .::: .:: .
NP_852 WLRWRMNGMIVMLLILSLFLLIFDSL--VLEIFIDISLNIIDK--SNLTLYLDESKTLYD
130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
pF1KE0 ST---KLFLNLATLLPFCVCLMSFFLLILSLRRHIRRMQLSATGCRDPSTEAHVRALKAV
. : .:.:....:: . : :...:.::: :: : ..::. : :: ::::: ::.: :
NP_852 KLSILKTLLSLTSFIPFSLFLTSLLFLFLSLVRHTRNLKLSSLGSRDSSTEAHRRAMKMV
180 190 200 210 220 230
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pF1KE0 ISFLLLFIAYYLSFLIATSSYFMPETELAVIFGESIALIYPSSHSFILILGNNKLRHASL
.:::.:::....:. .:. .:: .. . : .:: :::::::::.::.....
NP_852 MSFLFLFIVHFFSLQVANWIFFMLWNNKCIKFVMLALNAFPSCHSFILILGNSKLQQTAV
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE0 KVIWKVMSILKGRKFQQHKQI
...:.. . :
NP_852 RLLWHLRNYTKTPNPLPL
300 310
>>NP_076409 (OMIM: 604792) taste receptor type 2 member (303 aa)
initn: 673 init1: 420 opt: 761 Z-score: 898.9 bits: 174.5 E(85289): 2.5e-43
Smith-Waterman score: 761; 40.7% identity (72.8% similar) in 305 aa overlap (1-303:1-299)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MADKVQTTLLFLAVGEFSVGILGNAFIGLVNCMDWVKKRKIASIDLILTSLAISRICLLC
: . . . . .. ..:: .: :.:.:: :.::.:::.::...:.: .: :::::: :.
NP_076 MESALPSIFTLVIIAEFIIGNLSNGFIVLINCIDWVSKRELSSVDKLLIILAISRIGLIW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 VILLDCFILVLYPDVYATGKEMRIIDFFWTLTNHLSIWFATCLSIYYFFKIGNFFHPLFL
::.. :. . : ....: .::. : : ..::...:.:: .::.:..::..: : ::
NP_076 EILVSWFLALHYLAIFVSGTGLRIMIFSWIVSNHFNLWLATIFSIFYLLKIASFSSPAFL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KE0 WMKWRIDRVISWILLGCVVLSVFISLPATENLNADFRFCVKAKRKTNLTWSCRVN--KTQ
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NP_076 YLKWRVNKVILMILLGTLVF-LFLNLIQINMHIKDW----LDRYERNTTWNFSMSDFETF
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]