Result of FASTA (ccds) for
pF1KE0837
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0837, 318 aa
1>>>pF1KE0837 318 - 318 aa - 318 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.0679+/-0.00117; mu= 16.8865+/- 0.070
mean_var=68.1634+/-15.736, 0's: 0 Z-trim(101.8): 66 B-trim: 899 in 2/46
Lambda= 0.155345
statistics sampled from 6602 (6666) to 6602 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.54), E-opt: 0.2 (0.205), width: 16
Scan time: 2.060
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS8631.1 TAS2R7 gene_id:50837|Hs108|chr12 ( 318) 2103 480.7 6.3e-136
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CCDS8634.1 TAS2R10 gene_id:50839|Hs108|chr12 ( 307) 795 187.6 1.1e-47
CCDS31747.1 TAS2R42 gene_id:353164|Hs108|chr12 ( 314) 790 186.5 2.4e-47
CCDS8635.1 TAS2R13 gene_id:50838|Hs108|chr12 ( 303) 761 180.0 2.1e-45
CCDS8637.1 TAS2R14 gene_id:50840|Hs108|chr12 ( 317) 722 171.2 9.4e-43
CCDS53750.1 TAS2R30 gene_id:259293|Hs108|chr12 ( 319) 692 164.5 9.9e-41
CCDS53748.1 TAS2R46 gene_id:259292|Hs108|chr12 ( 309) 690 164.0 1.3e-40
CCDS8639.1 TAS2R20 gene_id:259295|Hs108|chr12 ( 309) 690 164.0 1.3e-40
CCDS53749.1 TAS2R43 gene_id:259289|Hs108|chr12 ( 309) 686 163.2 2.5e-40
CCDS8640.1 TAS2R19 gene_id:259294|Hs108|chr12 ( 299) 678 161.3 8.3e-40
CCDS53747.1 TAS2R31 gene_id:259290|Hs108|chr12 ( 309) 655 156.2 3e-38
CCDS8638.1 TAS2R50 gene_id:259296|Hs108|chr12 ( 299) 618 147.9 9.3e-36
CCDS43663.1 TAS2R41 gene_id:259287|Hs108|chr7 ( 307) 536 129.5 3.2e-30
CCDS47729.1 TAS2R39 gene_id:259285|Hs108|chr7 ( 338) 520 126.0 4.2e-29
CCDS34765.1 TAS2R38 gene_id:5726|Hs108|chr7 ( 333) 514 124.6 1e-28
CCDS43662.1 TAS2R40 gene_id:259286|Hs108|chr7 ( 323) 512 124.2 1.4e-28
CCDS3876.1 TAS2R1 gene_id:50834|Hs108|chr5 ( 299) 503 122.1 5.3e-28
CCDS5885.1 TAS2R60 gene_id:338398|Hs108|chr7 ( 318) 500 121.5 8.9e-28
CCDS5868.1 TAS2R4 gene_id:50832|Hs108|chr7 ( 299) 478 116.5 2.6e-26
CCDS5785.1 TAS2R16 gene_id:50833|Hs108|chr7 ( 291) 383 95.2 6.5e-20
CCDS5869.1 TAS2R5 gene_id:54429|Hs108|chr7 ( 299) 263 68.3 8.3e-12
>>CCDS8631.1 TAS2R7 gene_id:50837|Hs108|chr12 (318 aa)
initn: 2103 init1: 2103 opt: 2103 Z-score: 2553.7 bits: 480.7 E(32554): 6.3e-136
Smith-Waterman score: 2103; 100.0% identity (100.0% similar) in 318 aa overlap (1-318:1-318)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MADKVQTTLLFLAVGEFSVGILGNAFIGLVNCMDWVKKRKIASIDLILTSLAISRICLLC
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CCDS86 MADKVQTTLLFLAVGEFSVGILGNAFIGLVNCMDWVKKRKIASIDLILTSLAISRICLLC
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 VILLDCFILVLYPDVYATGKEMRIIDFFWTLTNHLSIWFATCLSIYYFFKIGNFFHPLFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 VILLDCFILVLYPDVYATGKEMRIIDFFWTLTNHLSIWFATCLSIYYFFKIGNFFHPLFL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 WMKWRIDRVISWILLGCVVLSVFISLPATENLNADFRFCVKAKRKTNLTWSCRVNKTQHA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 WMKWRIDRVISWILLGCVVLSVFISLPATENLNADFRFCVKAKRKTNLTWSCRVNKTQHA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 STKLFLNLATLLPFCVCLMSFFLLILSLRRHIRRMQLSATGCRDPSTEAHVRALKAVISF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 STKLFLNLATLLPFCVCLMSFFLLILSLRRHIRRMQLSATGCRDPSTEAHVRALKAVISF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 LLLFIAYYLSFLIATSSYFMPETELAVIFGESIALIYPSSHSFILILGNNKLRHASLKVI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 LLLFIAYYLSFLIATSSYFMPETELAVIFGESIALIYPSSHSFILILGNNKLRHASLKVI
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE0 WKVMSILKGRKFQQHKQI
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CCDS86 WKVMSILKGRKFQQHKQI
310
>>CCDS8633.1 TAS2R9 gene_id:50835|Hs108|chr12 (312 aa)
initn: 1035 init1: 538 opt: 1029 Z-score: 1253.0 bits: 240.0 E(32554): 1.8e-63
Smith-Waterman score: 1029; 48.2% identity (81.0% similar) in 311 aa overlap (1-311:1-308)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MADKVQTTLLFLAVGEFSVGILGNAFIGLVNCMDWVKKRKIASIDLILTSLAISRICLLC
: . ... ..: .::...:: ::.:: ::::.::.:.: :. ::.:: :::::::::::
CCDS86 MPSAIEAIYIILIAGELTIGIWGNGFIVLVNCIDWLKRRDISLIDIILISLAISRICLLC
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 VILLDCFILVLYPDVYATGKEMRIIDFFWTLTNHLSIWFATCLSIYYFFKIGNFFHPLFL
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CCDS86 VISLDGFFMLLFPGTYGNSVLVSIVNVVWTFANNSSLWFTSCLSIFYLLKIANISHPFFF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 WMKWRIDRVISWILLGCVVLSVFISLPATENLNADFRFCVKAKRKTNLTWSCRVNKTQHA
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CCDS86 WLKLKINKVMLAILLGSFLISLIISVPKNDDM---WYHLFKVSHEENITWKFKVSKIPGT
130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 STKLFLNLATLLPFCVCLMSFFLLILSLRRHIRRMQLSATGCRDPSTEAHVRALKAVISF
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CCDS86 FKQLTLNLGVMVPFILCLISFFLLLFSLVRHTKQIRLHATGFRDPSTEAHMRAIKAVIIF
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 LLLFIAYYLSFLIATSSYFMPETELAVIFGESIALIYPSSHSFILILGNNKLRHASLKVI
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CCDS86 LLLLIVYYPVFLVMTSSALIPQGKLVLMIGDIVTVIFPSSHSFILIMGNSKLREAFLKML
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE0 WKVMSILKGRKFQQHKQI
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CCDS86 RFVKCFLRRRKPFVP
300 310
>>CCDS8632.1 TAS2R8 gene_id:50836|Hs108|chr12 (309 aa)
initn: 1006 init1: 980 opt: 989 Z-score: 1204.6 bits: 231.1 E(32554): 8.9e-61
Smith-Waterman score: 989; 47.7% identity (81.0% similar) in 300 aa overlap (1-300:1-300)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MADKVQTTLLFLAVGEFSVGILGNAFIGLVNCMDWVKKRKIASIDLILTSLAISRICLLC
: . ... ...: .::: .:::::..:.::: .::.::.::...: :::.:.:.::::.
CCDS86 MFSPADNIFIILITGEFILGILGNGYIALVNWIDWIKKKKISTVDYILTNLVIARICLIS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 VILLDCFILVLYPDVYATGKEMRIIDFFWTLTNHLSIWFATCLSIYYFFKIGNFFHPLFL
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CCDS86 VMVVNGIVIVLNPDVYTKNKQQIVIFTFWTFANYLNMWITTCLNVFYFLKIASSSHPLFL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 WMKWRIDRVISWILLGCVVLSVFISLPATENLNADFRFCVKAKRKTNLTWSCRVNKTQHA
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CCDS86 WLKWKIDMVVHWILLGCFAISLLVSLIAAIVLSCDYRFHAIAKHKRNITEMFHVSKIPYF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 STKLFLNLATLLPFCVCLMSFFLLILSLRRHIRRMQLSATGCRDPSTEAHVRALKAVISF
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CCDS86 EPLTLFNLFAIVPFIVSLISFFLLVRSLWRHTKQIKLYATGSRDPSTEVHVRAIKTMTSF
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250 260 270 280 290 300
pF1KE0 LLLFIAYYLSFLIATSSYFMPETELAVIFGESIALIYPSSHSFILILGNNKLRHASLKVI
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CCDS86 IFFFFLYYISSILMTFSYLMTKYKLAVEFGEIAAILYPLGHSLILIVLNNKLRQTFVRML
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE0 WKVMSILKGRKFQQHKQI
CCDS86 TCRKIACMI
>>CCDS5867.1 TAS2R3 gene_id:50831|Hs108|chr7 (316 aa)
initn: 824 init1: 476 opt: 844 Z-score: 1028.9 bits: 198.6 E(32554): 5.5e-51
Smith-Waterman score: 844; 44.6% identity (74.7% similar) in 296 aa overlap (1-294:1-293)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MADKVQTTLLFLAVGEFSVGILGNAFIGLVNCMDWVKKRKIASIDLILTSLAISRICLLC
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CCDS58 MMGLTEGVFLILSGTQFTLGILVNCFIELVNGSSWFKTKRMSLSDFIITTLALLRIILLC
10 20 30 40 50 60
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pF1KE0 VILLDCFILVLYPDVYATGKEMRIIDFFWTLTNHLSIWFATCLSIYYFFKIGNFFHPLFL
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CCDS58 IILTDSFLIEFSPNTHDSGIIMQIIDVSWTFTNHLSIWLATCLGVLYCLKIASFSHPTFL
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pF1KE0 WMKWRIDRVISWILLGCVVLSV--FISLPATENLNADFRFCVKAKRKTNLTWSCRVNKTQ
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CCDS58 WLKWRVSRVMVWMLLGALLLSCGSTASLINEFKLYSVFR-GIEATR--NVTEHFRKKRSE
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pF1KE0 HASTKLFLNLATLLPFCVCLMSFFLLILSLRRHIRRMQLSATGCRDPSTEAHVRALKAVI
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CCDS58 YYLIHVLGTLWYLPPLIVSLASYSLLIFSLGRHTRQMLQNGTSSRDPTTEAHKRAIRIIL
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 SFLLLFIAYYLSFLIATSSYFMPETELAVIFGESIALIYPSSHSFILILGNNKLRHASLK
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CCDS58 SFFFLFLLYFLAFLIASFGNFLPKTKMAKMIGEVMTMFYPAGHSFILILGNSKLKQTFVV
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE0 VIWKVMSILKGRKFQQHKQI
CCDS58 MLRCESGHLKPGSKGPIFS
300 310
>>CCDS8634.1 TAS2R10 gene_id:50839|Hs108|chr12 (307 aa)
initn: 738 init1: 362 opt: 795 Z-score: 969.7 bits: 187.6 E(32554): 1.1e-47
Smith-Waterman score: 795; 41.1% identity (75.9% similar) in 299 aa overlap (5-303:5-295)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MADKVQTTLLFLAVGEFSVGILGNAFIGLVNCMDWVKKRKIASIDLILTSLAISRICLLC
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CCDS86 MLRVVEGIFIFVVVSESVFGVLGNGFIGLVNCID-CAKNKLSTIGFILTGLAISRIFLIW
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pF1KE0 VILLDCFILVLYPDVYATGKEMRIIDFFWTLTNHLSIWFATCLSIYYFFKIGNFFHPLFL
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CCDS86 IIITDGFIQIFSPNIYASGNLIEYISYFWVIGNQSSMWFATSLSIFYFLKIANFSNYIFL
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pF1KE0 WMKWRIDRVISWILLGCVVLSVFISLPATENLNADFRFCVKAKRKTNLTWSCRVNKTQHA
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CCDS86 WLKSRTNMVLPFMIV-FLLISSLLNFAYIAKILNDY------KTKNDTVWDLNMYKSEYF
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pF1KE0 STKLFLNLATLLPFCVCLMSFFLLILSLRRHIRRMQLSATGCRDPSTEAHVRALKAVISF
...:::.... : . :.. ..::.:: :: :.:: ..:: :: .:::::.:.:..:::
CCDS86 IKQILLNLGVIFFFTLSLITCIFLIISLWRHNRQMQSNVTGLRDSNTEAHVKAMKVLISF
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250 260 270 280 290 300
pF1KE0 LLLFIAYYLSFLIATSSYFMPETELAVIFGESIALIYPSSHSFILILGNNKLRHASLKVI
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CCDS86 IILFILYFIGMAIEISCFTVRENKLLLMFGMTTTAIYPWGHSFILILGNSKLKQASLRVL
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE0 WKVMSILKGRKFQQHKQI
..
CCDS86 QQLKCCEKRKNLRVT
300
>>CCDS31747.1 TAS2R42 gene_id:353164|Hs108|chr12 (314 aa)
initn: 795 init1: 465 opt: 790 Z-score: 963.5 bits: 186.5 E(32554): 2.4e-47
Smith-Waterman score: 790; 41.8% identity (71.7% similar) in 311 aa overlap (1-308:1-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MADKVQTTLLFLAVGEFSVGILGNAFIGLVNCMDWVKKRKIASIDLILTSLAISRICLLC
:: ... .:.::..:: ...:::.::::::: . .:..:. : :.::: :::: : :
CCDS31 MATELDKIFLILAIAEFIISMLGNVFIGLVNCSEGIKNQKVFSADFILTCLAISTIGQLL
10 20 30 40 50 60
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pF1KE0 VILLDCFILVLYPDVYATGKEMRIIDFFWTLTNHLSIWFATCLSIYYFFKIGNFFHPLFL
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CCDS31 VILFDSFLVGLASHLYTTYRLGKTVIMLWHMTNHLTTWLATCLSIFYFFKIAHFPHSLFL
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pF1KE0 WMKWRIDRVISWILLGCVVLSVFISLPATENLNADFRFCVKAKRKTNLTWSCRVNKTQHA
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CCDS31 WLRWRMNGMIVMLLILSLFLLIFDSL--VLEIFIDISLNIIDK--SNLTLYLDESKTLYD
130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
pF1KE0 ST---KLFLNLATLLPFCVCLMSFFLLILSLRRHIRRMQLSATGCRDPSTEAHVRALKAV
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CCDS31 KLSILKTLLSLTSFIPFSLFLTSLLFLFLSLVRHTRNLKLSSLGSRDSSTEAHRRAMKMV
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 ISFLLLFIAYYLSFLIATSSYFMPETELAVIFGESIALIYPSSHSFILILGNNKLRHASL
.:::.:::....:. .:. .:: .. . : .:: :::::::::.::.....
CCDS31 MSFLFLFIVHFFSLQVANWIFFMLWNNKCIKFVMLALNAFPSCHSFILILGNSKLQQTAV
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE0 KVIWKVMSILKGRKFQQHKQI
...:.. . :
CCDS31 RLLWHLRNYTKTPNPLPL
300 310
>>CCDS8635.1 TAS2R13 gene_id:50838|Hs108|chr12 (303 aa)
initn: 673 init1: 420 opt: 761 Z-score: 928.6 bits: 180.0 E(32554): 2.1e-45
Smith-Waterman score: 761; 40.7% identity (72.8% similar) in 305 aa overlap (1-303:1-299)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MADKVQTTLLFLAVGEFSVGILGNAFIGLVNCMDWVKKRKIASIDLILTSLAISRICLLC
: . . . . .. ..:: .: :.:.:: :.::.:::.::...:.: .: :::::: :.
CCDS86 MESALPSIFTLVIIAEFIIGNLSNGFIVLINCIDWVSKRELSSVDKLLIILAISRIGLIW
10 20 30 40 50 60
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pF1KE0 VILLDCFILVLYPDVYATGKEMRIIDFFWTLTNHLSIWFATCLSIYYFFKIGNFFHPLFL
::.. :. . : ....: .::. : : ..::...:.:: .::.:..::..: : ::
CCDS86 EILVSWFLALHYLAIFVSGTGLRIMIFSWIVSNHFNLWLATIFSIFYLLKIASFSSPAFL
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pF1KE0 WMKWRIDRVISWILLGCVVLSVFISLPATENLNADFRFCVKAKRKTNLTWSCRVN--KTQ
..:::...:: :::: .:. .:..: . :. . . : ::. .. .:
CCDS86 YLKWRVNKVILMILLGTLVF-LFLNLIQINMHIKDW----LDRYERNTTWNFSMSDFETF
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 HASTKLFLNLATLLPFCVCLMSFFLLILSLRRHIRRMQLSATGCRDPSTEAHVRALKAVI
.:.:. ... .: :: : ..::.:::.::..:...:::. : ::: :..:. ::: ::
CCDS86 SVSVKFTMTMFSLTPFTVAFISFLLLIFSLQKHLQKMQLNYKGHRDPRTKVHTNALKIVI
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 SFLLLFIAYYLSFLIATSSYFMPETELAVIFGESIALIYPSSHSFILILGNNKLRHASLK
::::.. ...: ::. : .. .: . .. :.:... ::::::.::::: :::.: :
CCDS86 SFLLFYASFFLCVLISWISELYQNT-VIYMLCETIGVFSPSSHSFLLILGNAKLRQAFLL
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE0 VIWKVMSILKGRKFQQHKQI
: ::
CCDS86 VAAKVWAKR
300
>>CCDS8637.1 TAS2R14 gene_id:50840|Hs108|chr12 (317 aa)
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10 20 30 40 50 60
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10 20 30 40 50 60
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CCDS86 LIFGSWCVSVFFPALFATEKMFRMLTNIWTVINHFSVWLATGLGTFYFLKIANFSNSIFL
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..:::. .:. .:: : :::. : . .: . ... :... : : :. .
CCDS86 YLKWRVKKVVLVLLL---VTSVFLFLNIAL-INIHINASINGYRRNKTCSSDSSNFTRFS
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CCDS86 LLWLRYMFKDGEPSGHKEFRESS
300 310
>>CCDS53750.1 TAS2R30 gene_id:259293|Hs108|chr12 (319 aa)
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: : : .: ..:.::.::: ..:::..::. .: :::.::.::. ::
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CCDS53 LRIKRRVKSVVLVILLGPLLFLVCHLFV-------INMDETVWTK-EYEGNVTWKIKLRS
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... :. . ::...:. . :.::.::: :: .:...::: . : .::::..:..::..
CCDS53 AMYHSNMTLTMLANFVPLTLTLISFLLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKVHIKALQT
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CCDS53 VTSFLLLCAIYFLSMIISVCNFGRLEKQPVFMFCQAIIFSYPSTHPFILILGNKKLKQIF
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CCDS53 LSVLRHVRYWVKDRSLRLHRFTRGALCVF
300 310
>>CCDS53748.1 TAS2R46 gene_id:259292|Hs108|chr12 (309 aa)
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CCDS53 MITFLPIIFSILIVVTFVIGNFANGFIALVNSIEWFKRQKISFADQILTALAVSRVGLLW
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CCDS53 VLVLNWYATELNPAFNSI--EVRITAYNVWAVINHFSNWLATSLSIFYLLKIANFSNLIF
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CCDS53 LHLKRRVKSVVLVILLGPLLF--LVCHLFVINMN---QIIWTKEYEGNMTWKIKLRSAMY
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CCDS53 FLLLCAIYFLSIIMSVWSFESLENKPVFMFCEAIAFSYPSTHPFILIWGNKKLKQTFLSV
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pF1KE0 IWKVMSILKGRKFQQHKQI
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CCDS53 LWHVRYWVKGEKPSSS
300
318 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]