Result of FASTA (ccds) for pF1KE0707
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE0707, 426 aa
  1>>>pF1KE0707 426 - 426 aa - 426 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3126+/-0.000831; mu= 17.2289+/- 0.050
 mean_var=129.1864+/-48.325, 0's: 0 Z-trim(107.7): 336  B-trim: 1147 in 2/48
 Lambda= 0.112841
 statistics sampled from 9149 (9765) to 9149 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.657), E-opt: 0.2 (0.3), width:  16
 Scan time:  3.040

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS2486.1 NMUR1 gene_id:10316|Hs108|chr2          ( 426) 2912 486.1 2.8e-137
CCDS4321.1 NMUR2 gene_id:56923|Hs108|chr5          ( 415)  898 158.2 1.4e-38
CCDS13502.1 NTSR1 gene_id:4923|Hs108|chr20         ( 418)  621 113.1 5.3e-25
CCDS6311.1 TRHR gene_id:7201|Hs108|chr8            ( 398)  448 84.9 1.5e-16
CCDS46959.1 GHSR gene_id:2693|Hs108|chr3           ( 289)  425 81.0 1.7e-15
CCDS3218.1 GHSR gene_id:2693|Hs108|chr3            ( 366)  425 81.1   2e-15
CCDS9414.1 MLNR gene_id:2862|Hs108|chr13           ( 412)  407 78.2 1.6e-14
CCDS1681.1 NTSR2 gene_id:23620|Hs108|chr2          ( 410)  391 75.6 9.7e-14
CCDS3552.1 NPFFR2 gene_id:10886|Hs108|chr4         ( 420)  388 75.2 1.4e-13
CCDS47072.1 NPFFR2 gene_id:10886|Hs108|chr4        ( 423)  388 75.2 1.4e-13
CCDS3551.1 NPFFR2 gene_id:10886|Hs108|chr4         ( 522)  388 75.3 1.6e-13
CCDS3438.1 CCKAR gene_id:886|Hs108|chr4            ( 428)  341 67.5 2.8e-11
CCDS197.1 HTR6 gene_id:3362|Hs108|chr1             ( 440)  331 65.9 8.9e-11


>>CCDS2486.1 NMUR1 gene_id:10316|Hs108|chr2               (426 aa)
 initn: 2912 init1: 2912 opt: 2912  Z-score: 2578.0  bits: 486.1 E(32554): 2.8e-137
Smith-Waterman score: 2912; 100.0% identity (100.0% similar) in 426 aa overlap (1-426:1-426)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MTPLCLNCSVLPGDLYPGGARNPMACNGSAARGHFDPEDLNLTDEALRLKYLGPQQTELF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 MTPLCLNCSVLPGDLYPGGARNPMACNGSAARGHFDPEDLNLTDEALRLKYLGPQQTELF
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE0 MPICATYLLIFVVGAVGNGLTCLVILRHKAMRTPTNYYLFSLAVSDLLVLLVGLPLELYE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 MPICATYLLIFVVGAVGNGLTCLVILRHKAMRTPTNYYLFSLAVSDLLVLLVGLPLELYE
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE0 MWHNYPFLLGVGGCYFRTLLFEMVCLASVLNVTALSVERYVAVVHPLQARSMVTRAHVRR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 MWHNYPFLLGVGGCYFRTLLFEMVCLASVLNVTALSVERYVAVVHPLQARSMVTRAHVRR
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE0 VLGAVWGLAMLCSLPNTSLHGIRQLHVPCRGPVPDSAVCMLVRPRALYNMVVQTTALLFF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 VLGAVWGLAMLCSLPNTSLHGIRQLHVPCRGPVPDSAVCMLVRPRALYNMVVQTTALLFF
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE0 CLPMAIMSVLYLLIGLRLRRERLLLMQEAKGRGSAAARSRYTCRLQQHDRGRRQVTKMLF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 CLPMAIMSVLYLLIGLRLRRERLLLMQEAKGRGSAAARSRYTCRLQQHDRGRRQVTKMLF
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE0 VLVVVFGICWAPFHADRVMWSVVSQWTDGLHLAFQHVHVISGIFFYLGSAANPVLYSLMS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 VLVVVFGICWAPFHADRVMWSVVSQWTDGLHLAFQHVHVISGIFFYLGSAANPVLYSLMS
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE0 SRFRETFQEALCLGACCHRLRPRHSSHSLSRMTTGSTLCDVGSLGSWVHPLAGNDGPEAQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 SRFRETFQEALCLGACCHRLRPRHSSHSLSRMTTGSTLCDVGSLGSWVHPLAGNDGPEAQ
              370       380       390       400       410       420

             
pF1KE0 QETDPS
       ::::::
CCDS24 QETDPS
             

>>CCDS4321.1 NMUR2 gene_id:56923|Hs108|chr5               (415 aa)
 initn: 1199 init1: 885 opt: 898  Z-score: 806.1  bits: 158.2 E(32554): 1.4e-38
Smith-Waterman score: 1209; 50.7% identity (79.9% similar) in 353 aa overlap (36-387:20-353)

          10        20        30        40        50         60    
pF1KE0 LNCSVLPGDLYPGGARNPMACNGSAARGHFDPEDLNLTDEALRLKYL-GPQQTELFMPIC
                                     :: . .:..    : .: ::.....:.:. 
CCDS43            MSGMEKLQNASWIYQQKLEDPFQKHLNSTEEYLAFLCGPRRSHFFLPVS
                          10        20        30        40         

           70        80        90       100       110       120    
pF1KE0 ATYLLIFVVGAVGNGLTCLVILRHKAMRTPTNYYLFSLAVSDLLVLLVGLPLELYEMWHN
       ..:. :::::..:: :.:::::.:.::.:::::::::::::::::::.:.:::.::::.:
CCDS43 VVYVPIFVVGVIGNVLVCLVILQHQAMKTPTNYYLFSLAVSDLLVLLLGMPLEVYEMWRN
      50        60        70        80        90       100         

          130       140       150       160       170       180    
pF1KE0 YPFLLGVGGCYFRTLLFEMVCLASVLNVTALSVERYVAVVHPLQARSMVTRAHVRRVLGA
       ::::.:  ::::.: ::: ::.::.:..:..:::::::..::..:. . :: .. :.:: 
CCDS43 YPFLFGPVGCYFKTALFETVCFASILSITTVSVERYVAILHPFRAKLQSTRRRALRILGI
     110       120       130       140       150       160         

          190       200       210       220       230       240    
pF1KE0 VWGLAMLCSLPNTSLHGIRQLHVPCRGPVPDSAVCMLVRPRALYNMVVQTTALLFFCLPM
       :::...: ::::::.:::.  . :  . :: ::.: ...:  .::...:.:..::. :::
CCDS43 VWGFSVLFSLPNTSIHGIKFHYFPNGSLVPGSATCTVIKPMWIYNFIIQVTSFLFYLLPM
     170       180       190       200       210       220         

          250       260       270       280       290       300    
pF1KE0 AIMSVLYLLIGLRLRRERLLLMQEAKGRGSAAARSRYTCRLQQHDRGRRQVTKMLFVLVV
       ...:::: :..:::.... :  .:    :.:  .    ::        ..:.:::::::.
CCDS43 TVISVLYYLMALRLKKDKSLEADE----GNANIQR--PCR--------KSVNKMLFVLVL
     230       240       250           260                 270     

          310       320       330       340       350       360    
pF1KE0 VFGICWAPFHADRVMWSVVSQWTDGLHLAFQHVHVISGIFFYLGSAANPVLYSLMSSRFR
       ::.::::::: ::...: : .:...:  .:. :::.::.::::.::.::..:.:.: ::.
CCDS43 VFAICWAPFHIDRLFFSFVEEWSESLAAVFNLVHVVSGVFFYLSSAVNPIIYNLLSRRFQ
         280       290       300       310       320       330     

          370       380       390       400       410       420    
pF1KE0 ETFQEALCLGACCHRLRPRHSSHSLSRMTTGSTLCDVGSLGSWVHPLAGNDGPEAQQETD
        .::...   .  :.    ::.:                                     
CCDS43 AAFQNVI---SSFHK--QWHSQHDPQLPPAQRNIFLTECHFVELTEDIGPQFPCQSSMHN
         340            350       360       370       380       390

>>CCDS13502.1 NTSR1 gene_id:4923|Hs108|chr20              (418 aa)
 initn: 431 init1: 162 opt: 621  Z-score: 562.4  bits: 113.1 E(32554): 5.3e-25
Smith-Waterman score: 621; 31.5% identity (67.6% similar) in 340 aa overlap (63-391:66-397)

             40        50        60        70        80        90  
pF1KE0 GHFDPEDLNLTDEALRLKYLGPQQTELFMPICATYLLIFVVGAVGNGLTCLVILRHKAMR
                                     . :.:: .::::.::: .: ... :.:...
CCDS13 GNASGNASERVLAAPSSELDVNTDIYSKVLVTAVYLALFVVGTVGNTVTAFTLARKKSLQ
          40        50        60        70        80        90     

               100       110       120        130       140        
pF1KE0 T---PTNYYLFSLAVSDLLVLLVGLPLELYE-MWHNYPFLLGVGGCYFRTLLFEMVCLAS
       .    ..:.: :::.::::.::...:.:::. .: ..:. .: .::    .: .    :.
CCDS13 SLQSTVHYHLGSLALSDLLTLLLAMPVELYNFIWVHHPWAFGDAGCRGYYFLRDACTYAT
         100       110       120       130       140       150     

      150       160       170       180       190       200        
pF1KE0 VLNVTALSVERYVAVVHPLQARSMVTRAHVRRVLGAVWGLAMLCSLPNTSLHGIRQLHVP
       .:::..::::::.:. ::..:.....:..... ..:.:  . : ..:     :  . .  
CCDS13 ALNVASLSVERYLAICHPFKAKTLMSRSRTKKFISAIWLASALLAVPMLFTMG--EQNRS
         160       170       180       190       200         210   

      210       220       230       240       250       260        
pF1KE0 CRGPVPDSAVCMLVRPRALYNMVVQTTALLFFCLPMAIMSVLYLLIGLRLRRERLLLMQE
         :    . ::  .   :  ..:.:..... : .::...:::  .:. .:    ... : 
CCDS13 ADGQHAGGLVCTPTIHTATVKVVIQVNTFMSFIFPMVVISVLNTIIANKL---TVMVRQA
           220       230       240       250       260          270

      270       280       290           300       310       320    
pF1KE0 AKGRGSAAARSRYTCRLQQHDRGRRQV----TKMLFVLVVVFGICWAPFHADRVMWSVVS
       :.     .. ....   .  . :: :.    ...: ..:..: .:: :.:. :.:.  .:
CCDS13 AEQGQVCTVGGEHSTFSMAIEPGRVQALRHGVRVLRAVVIAFVVCWLPYHVRRLMFCYIS
              280       290       300       310       320       330

            330       340       350       360       370        380 
pF1KE0 --QWTDGLHLAFQHVHVISGIFFYLGSAANPVLYSLMSSRFRETFQEALCLGAC-CHRLR
         :::  :.  ... ..... .::..:. ::.::.:.:. ::. :  .:   :: :   :
CCDS13 DEQWTPFLYDFYHYFYMVTNALFYVSSTINPILYNLVSANFRHIFLATL---ACLCPVWR
              340       350       360       370          380       

             390       400       410       420      
pF1KE0 PRHSSHSLSRMTTGSTLCDVGSLGSWVHPLAGNDGPEAQQETDPS
        :..  ..::                                   
CCDS13 RRRKRPAFSRKADSVSSNHTLSSNATRETLY              
       390       400       410                      

>>CCDS6311.1 TRHR gene_id:7201|Hs108|chr8                 (398 aa)
 initn: 367 init1: 150 opt: 448  Z-score: 410.4  bits: 84.9 E(32554): 1.5e-16
Smith-Waterman score: 449; 29.2% identity (57.6% similar) in 373 aa overlap (41-390:3-351)

               20        30        40        50        60        70
pF1KE0 LPGDLYPGGARNPMACNGSAARGHFDPEDLNLTDEALRLKYLGPQQTELFMPICATYLLI
                                     : :   :    : :. .  .    .: ::.
CCDS63                             MENETVSELNQTQLQPRAVVALEYQVVTILLV
                                           10        20        30  

                  80        90       100       110        120      
pF1KE0 FVV---GAVGNGLTCLVILRHKAMRTPTNYYLFSLAVSDLLVLLV-GLPLELYEMWHNYP
       ...   : ::: .. ::..: : :::::: :: ::::.::.::.. :::     .. .. 
CCDS63 LIICGLGIVGNIMVVLVVMRTKHMRTPTNCYLVSLAVADLMVLVAAGLPNITDSIYGSWV
             40        50        60        70        80        90  

        130       140       150       160       170       180      
pF1KE0 FLLGVGGCYFRTLLFEMVCLASVLNVTALSVERYVAVVHPLQARSMVTRAHVRRVLGAVW
       .  :  ::   : :  .   ::  ..::...:::.:. ::..:. . : .......  ::
CCDS63 Y--GYVGCLCITYLQYLGINASSCSITAFTIERYIAICHPIKAQFLCTFSRAKKIIIFVW
              100       110       120       130       140       150

        190        200       210         220       230       240   
pF1KE0 GLAML-CSLPNTSLHGIRQLHVPCRGPVPDSAV--CMLVRPRALYNMVVQTTALLFFCLP
       ... : : :       . .:..   .   :. :  :     :  :. .      .:. .:
CCDS63 AFTSLYCML----WFFLLDLNI---STYKDAIVISCGYKISRNYYSPIYLMDFGVFYVVP
                  160          170       180       190       200   

           250       260       270       280               290     
pF1KE0 MAIMSVLYLLIGLRLRRERLLLMQEAKGRGSAAARSRYTCRLQQH--------DR-----
       : . .::: .:.      :.:...   .  .  ...  .   .:.        .:     
CCDS63 MILATVLYGFIA------RILFLNPIPSDPKENSKTWKNDSTHQNTNLNVNTSNRCFNST
           210             220       230       240       250       

                300       310       320        330       340       
pF1KE0 --GRRQVTKMLFVLVVVFGICWAPFHADRVMWSVVSQ-WTDGLHLAFQHVHVISGIFFYL
         .:.:::::: :.:..:.. : :...  :. : .:. . ..  : : .. .      ::
CCDS63 VSSRKQVTKMLAVVVILFALLWMPYRTLVVVNSFLSSPFQENWFLLFCRICI------YL
       260       270       280       290       300             310 

       350       360       370       380       390       400       
pF1KE0 GSAANPVLYSLMSSRFRETFQEALCLGACCHRLRPRHSSHSLSRMTTGSTLCDVGSLGSW
       .:: :::.:.:::..:: .:.. ::   : ..   . ...:..                 
CCDS63 NSAINPVIYNLMSQKFRAAFRK-LC--NCKQKPTEKPANYSVALNYSVIKESDHFSTELD
             320       330          340       350       360        

       410       420                 
pF1KE0 VHPLAGNDGPEAQQETDPS           
                                     
CCDS63 DITVTDTYLSATKVSFDDTCLASEVSFSQS
      370       380       390        

>>CCDS46959.1 GHSR gene_id:2693|Hs108|chr3                (289 aa)
 initn: 361 init1: 157 opt: 425  Z-score: 391.7  bits: 81.0 E(32554): 1.7e-15
Smith-Waterman score: 431; 36.2% identity (63.4% similar) in 268 aa overlap (37-299:25-265)

         10        20        30        40        50        60      
pF1KE0 NCSVLPGDLYPGGARNPMACNGSAARGHFDPEDLNLTDEALRLKYLGPQQTELFMPICAT
                                     : . .: :: :.: . .:    :.  . ::
CCDS46       MWNATPSEEPGFNLTLADLDWDASPGNDSLGDELLQL-FPAP----LLAGVTAT
                     10        20        30         40             

         70        80        90       100       110       120      
pF1KE0 YLLIFVVGAVGNGLTCLVILRHKAMRTPTNYYLFSLAVSDLLVLLVGLPLELYEMWHNYP
        . .:::: .:: :: ::. : . .:: :: :: :.: ::::..:  .::.: ..:.  :
CCDS46 CVALFVVGIAGNLLTMLVVSRFRELRTTTNLYLSSMAFSDLLIFLC-MPLDLVRLWQYRP
      50        60        70        80        90        100        

        130       140       150       160       170       180      
pF1KE0 FLLGVGGCYFRTLLFEMVCLASVLNVTALSVERYVAVVHPLQARSMVTRAHVRRVLGAVW
       . .:   : .  .. :    :.::..:::::::: :.  ::.:. .::...:. :. ..:
CCDS46 WNFGDLLCKLFQFVSESCTYATVLTITALSVERYFAICFPLRAKVVVTKGRVKLVIFVIW
      110       120       130       140       150       160        

        190       200       210            220       230       240 
pF1KE0 GLAMLCSLPNTSLHGIRQLHVPCRGPVP-DSAVC----MLVRPRALYNMVVQTTALLFFC
       ..:.  . :   : :... .    :  : :.  :    . ::  .: ...: .....:: 
CCDS46 AVAFCSAGPIFVLVGVEHEN----GTDPWDTNECRPTEFAVRS-GLLTVMVWVSSIFFF-
      170       180           190       200        210       220   

             250       260       270       280       290       300 
pF1KE0 LPMAIMSVLYLLIGLRLRRERLLLMQEAKGRGSAAARSRYTCRLQQHDRGRRQVTKMLFV
       ::.  ..::: ::: .: :.:         ::.:.. .  . : :.:    .:..:::  
CCDS46 LPVFCLTVLYSLIGRKLWRRR---------RGDAVVGA--SLRDQNH----KQTVKMLGG
            230       240                250             260       

             310       320       330       340       350       360 
pF1KE0 LVVVFGICWAPFHADRVMWSVVSQWTDGLHLAFQHVHVISGIFFYLGSAANPVLYSLMSS
                                                                   
CCDS46 SQRALRLSLAGPILSLCLLPSL                                      
       270       280                                               

>>CCDS3218.1 GHSR gene_id:2693|Hs108|chr3                 (366 aa)
 initn: 540 init1: 157 opt: 425  Z-score: 390.6  bits: 81.1 E(32554): 2e-15
Smith-Waterman score: 597; 36.6% identity (65.8% similar) in 336 aa overlap (37-364:25-331)

         10        20        30        40        50        60      
pF1KE0 NCSVLPGDLYPGGARNPMACNGSAARGHFDPEDLNLTDEALRLKYLGPQQTELFMPICAT
                                     : . .: :: :.: . .:    :.  . ::
CCDS32       MWNATPSEEPGFNLTLADLDWDASPGNDSLGDELLQL-FPAP----LLAGVTAT
                     10        20        30         40             

         70        80        90       100       110       120      
pF1KE0 YLLIFVVGAVGNGLTCLVILRHKAMRTPTNYYLFSLAVSDLLVLLVGLPLELYEMWHNYP
        . .:::: .:: :: ::. : . .:: :: :: :.: ::::..:  .::.: ..:.  :
CCDS32 CVALFVVGIAGNLLTMLVVSRFRELRTTTNLYLSSMAFSDLLIFLC-MPLDLVRLWQYRP
      50        60        70        80        90        100        

        130       140       150       160       170       180      
pF1KE0 FLLGVGGCYFRTLLFEMVCLASVLNVTALSVERYVAVVHPLQARSMVTRAHVRRVLGAVW
       . .:   : .  .. :    :.::..:::::::: :.  ::.:. .::...:. :. ..:
CCDS32 WNFGDLLCKLFQFVSESCTYATVLTITALSVERYFAICFPLRAKVVVTKGRVKLVIFVIW
      110       120       130       140       150       160        

        190       200       210            220       230       240 
pF1KE0 GLAMLCSLPNTSLHGIRQLHVPCRGPVP-DSAVC----MLVRPRALYNMVVQTTALLFFC
       ..:.  . :   : :... .    :  : :.  :    . ::  .: ...: .....:: 
CCDS32 AVAFCSAGPIFVLVGVEHEN----GTDPWDTNECRPTEFAVRS-GLLTVMVWVSSIFFF-
      170       180           190       200        210       220   

             250       260       270       280       290       300 
pF1KE0 LPMAIMSVLYLLIGLRLRRERLLLMQEAKGRGSAAARSRYTCRLQQHDRGRRQVTKMLFV
       ::.  ..::: ::: .: :.:         ::.:.. .  . : :.:    .:..::: :
CCDS32 LPVFCLTVLYSLIGRKLWRRR---------RGDAVVGA--SLRDQNH----KQTVKMLAV
            230       240                250             260       

             310       320        330         340       350        
pF1KE0 LVVVFGICWAPFHADRVMWSVVSQWTDG-LHLA--FQHVHVISGIFFYLGSAANPVLYSL
       .: .: .:: :::. : ..:  ...  : :..:   :. ...: ..:::..: ::.::..
CCDS32 VVFAFILCWLPFHVGRYLFS--KSFEPGSLEIAQISQYCNLVSFVLFYLSAAINPILYNI
       270       280         290       300       310       320     

      360       370       380       390       400       410        
pF1KE0 MSSRFRETFQEALCLGACCHRLRPRHSSHSLSRMTTGSTLCDVGSLGSWVHPLAGNDGPE
       ::...:                                                      
CCDS32 MSKKYRVAVFRLLGFEPFSQRKLSTLKDESSRAWTESSINT                   
         330       340       350       360                         

>>CCDS9414.1 MLNR gene_id:2862|Hs108|chr13                (412 aa)
 initn: 496 init1: 263 opt: 407  Z-score: 374.2  bits: 78.2 E(32554): 1.6e-14
Smith-Waterman score: 592; 34.3% identity (60.8% similar) in 385 aa overlap (60-402:38-395)

      30        40        50        60        70        80         
pF1KE0 AARGHFDPEDLNLTDEALRLKYLGPQQTELFMPICATYLLIFVVGAVGNGLTCLVILRHK
                                     ..:. :. : .::::. :: .: ..: :..
CCDS94 SDGPEGAREPPWPALPPCDERRCSPFPLGALVPVTAVCLCLFVVGVSGNVVTVMLIGRYR
        10        20        30        40        50        60       

      90       100       110       120       130       140         
pF1KE0 AMRTPTNYYLFSLAVSDLLVLLVGLPLELYEMWHNYPFLLGVGGCYFRTLLFEMVCLASV
        ::: :: :: :.::::::.:: :::..::..:.. :...:   : .   . :    :..
CCDS94 DMRTTTNLYLGSMAVSDLLILL-GLPFDLYRLWRSRPWVFGPLLCRLSLYVGEGCTYATL
        70        80         90       100       110       120      

     150       160       170       180       190       200         
pF1KE0 LNVTALSVERYVAVVHPLQARSMVTRAHVRRVLGAVWGLAMLCSLPNTSLHGIRQ---LH
       :..::::::::.:. .::.:: .::: .:: .....:..:.: . :   : :..:   . 
CCDS94 LHMTALSVERYLAICRPLRARVLVTRRRVRALIAVLWAVALLSAGPFLFLVGVEQDPGIS
        130       140       150       160       170       180      

                                      210       220                
pF1KE0 V------------------------------PCRGPVPDSAVCML---VRPR-----ALY
       :                              :  ::    :. ..    ::      :: 
CCDS94 VVPGLNGTARIASSPLASSPPLWLSRAPPPSPPSGPETAEAAALFSRECRPSPAQLGALR
        190       200       210       220       230       240      

      230       240       250       260       270       280        
pF1KE0 NMVVQTTALLFFCLPMAIMSVLYLLIGLRLRRERLLLMQEAKGRGSAAARSRYTCRLQQH
        :.  :::  .: ::.  .:.:: ::: .:   :  :      :: ::.          .
CCDS94 VMLWVTTA--YFFLPFLCLSILYGLIGRELWSSRRPL------RGPAAS---------GR
        250         260       270       280                        

      290       300       310       320       330       340        
pF1KE0 DRGRRQVTKMLFVLVVVFGICWAPFHADRVMWSVVSQWTDGLHLAFQHVHVISGIFFYLG
       .::.::....:.:.:..: ::: :::. :... . .. .  .... :. ....  .:::.
CCDS94 ERGHRQTVRVLLVVVLAFIICWLPFHVGRIIY-INTEDSRMMYFS-QYFNIVALQLFYLS
     290       300       310       320        330        340       

      350       360        370       380       390       400       
pF1KE0 SAANPVLYSLMSSRFRET-FQEALCLGACCHRLRPRHSSHSLSRMTTGSTLCDVGSLGSW
       .. ::.::.:.:...: . :.  :      .. ::: . :  :: :.: .  :.:     
CCDS94 ASINPILYNLISKKYRAAAFKLLLA-----RKSRPR-GFHR-SRDTAGEVAGDTGGDTVG
       350       360       370             380        390       400

       410       420      
pF1KE0 VHPLAGNDGPEAQQETDPS
                          
CCDS94 YTETSANVKTMG       
              410         

>>CCDS1681.1 NTSR2 gene_id:23620|Hs108|chr2               (410 aa)
 initn: 517 init1: 183 opt: 391  Z-score: 360.1  bits: 75.6 E(32554): 9.7e-14
Smith-Waterman score: 555; 31.9% identity (61.4% similar) in 370 aa overlap (65-400:37-404)

           40        50        60        70        80        90    
pF1KE0 FDPEDLNLTDEALRLKYLGPQQTELFMPICATYLLIFVVGAVGNGLTCLVILRHKAMRTP
                                     : : ::...::.::.:.  :.:. .: :. 
CCDS16 RPPRPSSNPGLSLDARLGVDTRLWAKVLFTALYALIWALGAAGNALSAHVVLKARAGRAG
         10        20        30        40        50        60      

           100       110       120        130       140       150  
pF1KE0 T-NYYLFSLAVSDLLVLLVGLPLELYE-MWHNYPFLLGVGGCYFRTLLFEMVCLASVLNV
          ....:::.. ::.::::.:.:::  .: .::...:  ::    .. :.   :.::.:
CCDS16 RLRHHVLSLALAGLLLLLVGVPVELYSFVWFHYPWVFGDLGCRGYYFVHELCAYATVLSV
         70        80        90       100       110       120      

            160       170       180       190       200       210  
pF1KE0 TALSVERYVAVVHPLQARSMVTRAHVRRVLGAVWGLAMLCSLPNTSLHGIRQLHVPCRG-
       ..::.:: .:: .::.:::..:  ..: ...  :. ..  .:: . . : ..      : 
CCDS16 AGLSAERCLAVCQPLRARSLLTPRRTRWLVALSWAASLGLALPMAVIMGQKHELETADGE
        130       140       150       160       170       180      

             220       230       240       250                     
pF1KE0 PVPDSAVCMLVRPRALYNMVVQTTALLFFCLPMAIMSVLY-----LLIGL----------
       : : : :: ..  :.  .. .:...:. : ::.:. . :       :..:          
CCDS16 PEPASRVCTVLVSRTALQVFIQVNVLVSFVLPLALTAFLNGVTVSHLLALCSQVPSTSTP
        190       200       210       220       230       240      

         260       270       280           290            300      
pF1KE0 -RLRRERLLLMQEAKGRGSAAARSRYT----CRLQQHDRGRR-----QVTKMLFVLVVVF
             :: :..:    .  . .. .       : .:   ::     . ...: ..::..
CCDS16 GSSTPSRLELLSEEGLLSFIVWKKTFIQGGQVSLVRHKDVRRIRSLQRSVQVLRAIVVMY
        250       260       270       280       290       300      

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pF1KE0 GICWAPFHADRVMWSVVSQ--WTDGLHLAFQHVHVISGIFFYLGSAANPVLYSLMSSRFR
        ::: :.:: :.:.  : .  ::: :.  ... ..... .::..::..:.::. .:: ::
CCDS16 VICWLPYHARRLMYCYVPDDAWTDPLYNFYHYFYMVTNTLFYVSSAVTPLLYNAVSSSFR
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pF1KE0 ETFQEALCLGACCH----RLRPRHSSHSLSRMTTGSTLCDVGSLGSWVHPLAGNDGPEAQ
       . : ::.      :    :: :. .: .:  : :.: . :                    
CCDS16 KLFLEAVSSLCGEHHPMKRLPPKPQSPTL--MDTASGFGDPPETRT              
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pF1KE0 QETDPS

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                                     :    :.:.:     :.   :: . .:.  
CCDS35        MNEKWDTNSSENWHPIWNVNDTKHHLYSDINITYVNYYLHQ--PQVAAIFI--
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         .:.::: .  .:: ..:....:.: :.: :: ....::.::::: .  .:. : . . 
CCDS35 -ISYFLIFFLCMMGNTVVCFIVMRNKHMHTVTNLFILNLAISDLLVGIFCMPITLLDNII
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         .: ::.    :.. .  ...    .:   .    : :  :    :   .  .  ::.:
CCDS35 MIIWVLAITIMSPSAVMLHVQEEKYYRVRLNSQNKTSPVYWCREDWPNQEMRKIY-TTVL
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pF1KE0 L--FFCLPMAIMSVLYLLIGLRLRRERLLLMQEAKGRGSAAARSRYTCRLQQH--DRGRR
       .  ..  :.... ..:  ::. : :             .:. ..    . : :  .: ..
CCDS35 FANIYLAPLSLIVIMYGRIGISLFR-------------AAVPHTGRKNQEQWHVVSRKKQ
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pF1KE0 QVTKMLFVLVVVFGICWAPFHADRVMWSVVSQWTDGLHLAFQHVHVISGIFFY-------
       .. :::......: . : :      .:... . .:   :. .....:. :..:       
CCDS35 KIIKMLLIVALLFILSWLP------LWTLM-MLSDYADLSPNELQIIN-IYIYPFAHWLA
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CCDS35 FGNSSVNPIIYGFFNENFRRGFQEAFQLQLCQKRAKPMEAYALKAKSHVLINTSNQLVQE
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CCDS35 STFQNPHGETLLYRKSAEKPQQELVMEELKETTNSSEI
            390       400       410       420

>>CCDS47072.1 NPFFR2 gene_id:10886|Hs108|chr4             (423 aa)
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pF1KE0 LCLNCSVLPGDLYPGGARNPMACNGSAARGHFDPEDLNLTDEALRLKYLGPQQTELFMPI
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CCDS47     MFIMNEKWDTNSSENWHPIWNVNDTKHHLYSDINITYVNYYLHQ--PQVAAIFI--
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pF1KE0 CATYLLIFVVGAVGNGLTCLVILRHKAMRTPTNYYLFSLAVSDLLVLLVGLPLELYE-MW
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CCDS47 -ISYFLIFFLCMMGNTVVCFIVMRNKHMHTVTNLFILNLAISDLLVGIFCMPITLLDNII
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pF1KE0 GAVWGLAMLCSLPNTSLHGIRQ---LHVPCRGPVPDSAV--CMLVRPRALYNMVVQTTAL
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CCDS47 MIIWVLAITIMSPSAVMLHVQEEKYYRVRLNSQNKTSPVYWCREDWPNQEMRKIY-TTVL
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pF1KE0 L--FFCLPMAIMSVLYLLIGLRLRRERLLLMQEAKGRGSAAARSRYTCRLQQH--DRGRR
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CCDS47 FANIYLAPLSLIVIMYGRIGISLFR-------------AAVPHTGRKNQEQWHVVSRKKQ
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pF1KE0 QVTKMLFVLVVVFGICWAPFHADRVMWSVVSQWTDGLHLAFQHVHVISGIFFY-------
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CCDS47 KIIKMLLIVALLFILSWLP------LWTLM-MLSDYADLSPNELQIIN-IYIYPFAHWLA
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CCDS47 STFQNPHGETLLYRKSAEKPQQELVMEELKETTNSSEI
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426 residues in 1 query   sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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