Result of FASTA (ccds) for pF1KE0246
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE0246, 418 aa
  1>>>pF1KE0246 418 - 418 aa - 418 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4627+/-0.000941; mu= 16.9023+/- 0.058
 mean_var=169.1166+/-73.545, 0's: 0 Z-trim(106.6): 227  B-trim: 1147 in 2/48
 Lambda= 0.098624
 statistics sampled from 8532 (9064) to 8532 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.619), E-opt: 0.2 (0.278), width:  16
 Scan time:  2.680

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS13502.1 NTSR1 gene_id:4923|Hs108|chr20         ( 418) 2743 403.3 2.3e-112
CCDS2486.1 NMUR1 gene_id:10316|Hs108|chr2          ( 426)  621 101.4 1.8e-21
CCDS1681.1 NTSR2 gene_id:23620|Hs108|chr2          ( 410)  609 99.6 5.7e-21
CCDS46959.1 GHSR gene_id:2693|Hs108|chr3           ( 289)  443 75.8 6.1e-14
CCDS3218.1 GHSR gene_id:2693|Hs108|chr3            ( 366)  440 75.5 9.2e-14
CCDS4321.1 NMUR2 gene_id:56923|Hs108|chr5          ( 415)  433 74.6   2e-13
CCDS9414.1 MLNR gene_id:2862|Hs108|chr13           ( 412)  419 72.6 7.8e-13
CCDS2170.1 GPR39 gene_id:2863|Hs108|chr2           ( 453)  408 71.1 2.4e-12
CCDS6311.1 TRHR gene_id:7201|Hs108|chr8            ( 398)  393 68.9   1e-11


>>CCDS13502.1 NTSR1 gene_id:4923|Hs108|chr20              (418 aa)
 initn: 2743 init1: 2743 opt: 2743  Z-score: 2130.9  bits: 403.3 E(32554): 2.3e-112
Smith-Waterman score: 2743; 100.0% identity (100.0% similar) in 418 aa overlap (1-418:1-418)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MRLNSSAPGTPGTPAADPFQRAQAGLEEALLAPGFGNASGNASERVLAAPSSELDVNTDI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 MRLNSSAPGTPGTPAADPFQRAQAGLEEALLAPGFGNASGNASERVLAAPSSELDVNTDI
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE0 YSKVLVTAVYLALFVVGTVGNTVTAFTLARKKSLQSLQSTVHYHLGSLALSDLLTLLLAM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 YSKVLVTAVYLALFVVGTVGNTVTAFTLARKKSLQSLQSTVHYHLGSLALSDLLTLLLAM
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE0 PVELYNFIWVHHPWAFGDAGCRGYYFLRDACTYATALNVASLSVERYLAICHPFKAKTLM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 PVELYNFIWVHHPWAFGDAGCRGYYFLRDACTYATALNVASLSVERYLAICHPFKAKTLM
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE0 SRSRTKKFISAIWLASALLAVPMLFTMGEQNRSADGQHAGGLVCTPTIHTATVKVVIQVN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 SRSRTKKFISAIWLASALLAVPMLFTMGEQNRSADGQHAGGLVCTPTIHTATVKVVIQVN
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE0 TFMSFIFPMVVISVLNTIIANKLTVMVRQAAEQGQVCTVGGEHSTFSMAIEPGRVQALRH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 TFMSFIFPMVVISVLNTIIANKLTVMVRQAAEQGQVCTVGGEHSTFSMAIEPGRVQALRH
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE0 GVRVLRAVVIAFVVCWLPYHVRRLMFCYISDEQWTPFLYDFYHYFYMVTNALFYVSSTIN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 GVRVLRAVVIAFVVCWLPYHVRRLMFCYISDEQWTPFLYDFYHYFYMVTNALFYVSSTIN
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410        
pF1KE0 PILYNLVSANFRHIFLATLACLCPVWRRRRKRPAFSRKADSVSSNHTLSSNATRETLY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 PILYNLVSANFRHIFLATLACLCPVWRRRRKRPAFSRKADSVSSNHTLSSNATRETLY
              370       380       390       400       410        

>>CCDS2486.1 NMUR1 gene_id:10316|Hs108|chr2               (426 aa)
 initn: 431 init1: 162 opt: 621  Z-score: 499.1  bits: 101.4 E(32554): 1.8e-21
Smith-Waterman score: 621; 31.5% identity (67.6% similar) in 340 aa overlap (66-397:63-391)

          40        50        60        70        80        90     
pF1KE0 GNASGNASERVLAAPSSELDVNTDIYSKVLVTAVYLALFVVGTVGNTVTAFTLARKKSLQ
                                     . :.:: .::::.::: .: ... :.:...
CCDS24 GHFDPEDLNLTDEALRLKYLGPQQTELFMPICATYLLIFVVGAVGNGLTCLVILRHKAMR
             40        50        60        70        80        90  

         100       110       120       130       140       150     
pF1KE0 SLQSTVHYHLGSLALSDLLTLLLAMPVELYNFIWVHHPWAFGDAGCRGYYFLRDACTYAT
       .    ..:.: :::.::::.::...:.:::. .: ..:. .: .::    .: .    :.
CCDS24 T---PTNYYLFSLAVSDLLVLLVGLPLELYE-MWHNYPFLLGVGGCYFRTLLFEMVCLAS
               100       110       120        130       140        

         160       170       180       190       200         210   
pF1KE0 ALNVASLSVERYLAICHPFKAKTLMSRSRTKKFISAIWLASALLAVPMLFTMG--EQNRS
       .:::..::::::.:. ::..:.....:..... ..:.:  . : ..:     :  . .  
CCDS24 VLNVTALSVERYVAVVHPLQARSMVTRAHVRRVLGAVWGLAMLCSLPNTSLHGIRQLHVP
      150       160       170       180       190       200        

           220       230       240       250       260          270
pF1KE0 ADGQHAGGLVCTPTIHTATVKVVIQVNTFMSFIFPMVVISVLNTIIANKLT---VMVRQA
         :    . ::  .   :  ..:.:..... : .::...:::  .:. .:    ... : 
CCDS24 CRGPVPDSAVCMLVRPRALYNMVVQTTALLFFCLPMAIMSVLYLLIGLRLRRERLLLMQE
      210       220       230       240       250       260        

              280       290       300       310       320       330
pF1KE0 AEQGQVCTVGGEHSTFSMAIEPGRVQALRHGVRVLRAVVIAFVVCWLPYHVRRLMFCYIS
       :.     .. ....   .  . ::    :. ...: ..:..: .:: :.:. :.:.  .:
CCDS24 AKGRGSAAARSRYTCRLQQHDRGR----RQVTKMLFVLVVVFGICWAPFHADRVMWSVVS
      270       280       290           300       310       320    

              340       350       360       370          380       
pF1KE0 DEQWTPFLYDFYHYFYMVTNALFYVSSTINPILYNLVSANFRHIFLATL---ACLCPVWR
         :::  :.  ... ..... .::..:. ::.::.:.:. ::. :  .:   :: :   :
CCDS24 --QWTDGLHLAFQHVHVISGIFFYLGSAANPVLYSLMSSRFRETFQEALCLGAC-CHRLR
            330       340       350       360       370        380 

       390       400       410                      
pF1KE0 RRRKRPAFSRKADSVSSNHTLSSNATRETLY              
        :..  ..::                                   
CCDS24 PRHSSHSLSRMTTGSTLCDVGSLGSWVHPLAGNDGPEAQQETDPS
             390       400       410       420      

>>CCDS1681.1 NTSR2 gene_id:23620|Hs108|chr2               (410 aa)
 initn: 1019 init1: 431 opt: 609  Z-score: 490.0  bits: 99.6 E(32554): 5.7e-21
Smith-Waterman score: 986; 39.6% identity (72.4% similar) in 384 aa overlap (52-403:21-400)

              30        40        50        60        70        80 
pF1KE0 AQAGLEEALLAPGFGNASGNASERVLAAPSSELDVNTDIYSKVLVTAVYLALFVVGTVGN
                                     ..: :.: ...::: ::.:  ....:..::
CCDS16           METSSPRPPRPSSNPGLSLDARLGVDTRLWAKVLFTALYALIWALGAAGN
                         10        20        30        40        50

              90       100       110       120       130       140 
pF1KE0 TVTAFTLARKKSLQSLQSTVHYHLGSLALSDLLTLLLAMPVELYNFIWVHHPWAFGDAGC
       ...: .. . .. ..  . ...:. ::::. :: ::...:::::.:.: :.::.::: ::
CCDS16 ALSAHVVLKARAGRA--GRLRHHVLSLALAGLLLLLVGVPVELYSFVWFHYPWVFGDLGC
               60          70        80        90       100        

             150       160       170       180       190       200 
pF1KE0 RGYYFLRDACTYATALNVASLSVERYLAICHPFKAKTLMSRSRTKKFISAIWLASALLAV
       :::::... :.:::.:.::.::.:: ::.:.:..:..:..  ::. ...  : ::  ::.
CCDS16 RGYYFVHELCAYATVLSVAGLSAERCLAVCQPLRARSLLTPRRTRWLVALSWAASLGLAL
      110       120       130       140       150       160        

             210          220       230       240       250        
pF1KE0 PMLFTMGEQNR--SADGQ-HAGGLVCTPTIHTATVKVVIQVNTFMSFIFPMVVISVLNTI
       ::   ::....  .:::. . .. :::  .  ....: ::::...::..:... . :: .
CCDS16 PMAVIMGQKHELETADGEPEPASRVCTVLVSRTALQVFIQVNVLVSFVLPLALTAFLNGV
      170       180       190       200       210       220        

      260       270                                280       290   
pF1KE0 IANKLTVMVRQA-----------------AEQGQVCTV--------GGEHSTFSMAIEPG
        ...: ..  :.                 .:.: .  .        ::. :      .  
CCDS16 TVSHLLALCSQVPSTSTPGSSTPSRLELLSEEGLLSFIVWKKTFIQGGQVSLVRHK-DVR
      230       240       250       260       270       280        

           300       310       320       330       340       350   
pF1KE0 RVQALRHGVRVLRAVVIAFVVCWLPYHVRRLMFCYISDEQWTPFLYDFYHYFYMVTNALF
       :...:...:.::::.:. .:.::::::.::::.::. :. ::  ::.::::::::::.::
CCDS16 RIRSLQRSVQVLRAIVVMYVICWLPYHARRLMYCYVPDDAWTDPLYNFYHYFYMVTNTLF
       290       300       310       320       330       340       

           360       370       380           390       400         
pF1KE0 YVSSTINPILYNLVSANFRHIFLATLACLC----PVWRRRRKRPAFSRKADSVSSNHTLS
       ::::...:.::: ::..::..:: ... ::    :. .:   .:      :..:      
CCDS16 YVSSAVTPLLYNAVSSSFRKLFLEAVSSLCGEHHPM-KRLPPKPQSPTLMDTASGFGDPP
       350       360       370       380        390       400      

     410        
pF1KE0 SNATRETLY
                
CCDS16 ETRT     
        410     

>>CCDS46959.1 GHSR gene_id:2693|Hs108|chr3                (289 aa)
 initn: 412 init1: 252 opt: 443  Z-score: 363.8  bits: 75.8 E(32554): 6.1e-14
Smith-Waterman score: 443; 33.9% identity (68.1% similar) in 257 aa overlap (66-318:46-287)

          40        50        60        70        80        90     
pF1KE0 GNASGNASERVLAAPSSELDVNTDIYSKVLVTAVYLALFVVGTVGNTVTAFTLARKKSLQ
                                     :::. .:::::: .:: .: ....:   ..
CCDS46 LADLDWDASPGNDSLGDELLQLFPAPLLAGVTATCVALFVVGIAGNLLTMLVVSR---FR
          20        30        40        50        60        70     

         100       110       120       130       140       150     
pF1KE0 SLQSTVHYHLGSLALSDLLTLLLAMPVELYNFIWVHHPWAFGDAGCRGYYFLRDACTYAT
        :..:.. .:.:.:.:::: ..: ::..:   .: ..:: :::  :. . :. ..:::::
CCDS46 ELRTTTNLYLSSMAFSDLL-IFLCMPLDLVR-LWQYRPWNFGDLLCKLFQFVSESCTYAT
             80        90        100        110       120       130

         160       170       180       190       200        210    
pF1KE0 ALNVASLSVERYLAICHPFKAKTLMSRSRTKKFISAIWLASALLAVPMLFTMG-EQNRSA
       .:....::::::.::: :..::......:.:  : .:: ..   : :..  .: :.. ..
CCDS46 VLTITALSVERYFAICFPLRAKVVVTKGRVKLVIFVIWAVAFCSAGPIFVLVGVEHENGT
              140       150       160       170       180       190

          220          230       240       250       260       270 
pF1KE0 DGQHAGGLVCTPT---IHTATVKVVIQVNTFMSFIFPMVVISVLNTIIANKLTVMVRQAA
       :   ..   : ::   .... . :.. :.... :..:.  ..:: ..:. ::    :  :
CCDS46 DPWDTN--ECRPTEFAVRSGLLTVMVWVSSIF-FFLPVFCLTVLYSLIGRKLWRRRRGDA
                200       210       220        230       240       

             280       290       300       310       320       330 
pF1KE0 EQGQVCTVGGEHSTFSMAIEPGRVQALRHGVRVLRAVVIAFVVCWLPYHVRRLMFCYISD
         :      ....: .:    :  .::: .   : . ....  : ::             
CCDS46 VVGASLRDQNHKQTVKML--GGSQRALRLS---LAGPILSL--CLLPSL           
       250       260         270          280                      

             340       350       360       370       380       390 
pF1KE0 EQWTPFLYDFYHYFYMVTNALFYVSSTINPILYNLVSANFRHIFLATLACLCPVWRRRRK

>>CCDS3218.1 GHSR gene_id:2693|Hs108|chr3                 (366 aa)
 initn: 521 init1: 252 opt: 440  Z-score: 360.5  bits: 75.5 E(32554): 9.2e-14
Smith-Waterman score: 604; 36.0% identity (69.5% similar) in 311 aa overlap (66-372:46-331)

          40        50        60        70        80        90     
pF1KE0 GNASGNASERVLAAPSSELDVNTDIYSKVLVTAVYLALFVVGTVGNTVTAFTLARKKSLQ
                                     :::. .:::::: .:: .: ....:   ..
CCDS32 LADLDWDASPGNDSLGDELLQLFPAPLLAGVTATCVALFVVGIAGNLLTMLVVSR---FR
          20        30        40        50        60        70     

         100       110       120       130       140       150     
pF1KE0 SLQSTVHYHLGSLALSDLLTLLLAMPVELYNFIWVHHPWAFGDAGCRGYYFLRDACTYAT
        :..:.. .:.:.:.:::: ..: ::..:   .: ..:: :::  :. . :. ..:::::
CCDS32 ELRTTTNLYLSSMAFSDLL-IFLCMPLDLVR-LWQYRPWNFGDLLCKLFQFVSESCTYAT
             80        90        100        110       120       130

         160       170       180       190       200        210    
pF1KE0 ALNVASLSVERYLAICHPFKAKTLMSRSRTKKFISAIWLASALLAVPMLFTMG-EQNRSA
       .:....::::::.::: :..::......:.:  : .:: ..   : :..  .: :.. ..
CCDS32 VLTITALSVERYFAICFPLRAKVVVTKGRVKLVIFVIWAVAFCSAGPIFVLVGVEHENGT
              140       150       160       170       180       190

          220          230       240       250       260       270 
pF1KE0 DGQHAGGLVCTPT---IHTATVKVVIQVNTFMSFIFPMVVISVLNTIIANKLTVMVRQAA
       :   ..   : ::   .... . :.. :.... :..:.  ..:: ..:. ::    :  :
CCDS32 DPWDTN--ECRPTEFAVRSGLLTVMVWVSSIF-FFLPVFCLTVLYSLIGRKLWRRRRGDA
                200       210       220        230       240       

             280       290       300       310       320       330 
pF1KE0 EQGQVCTVGGEHSTFSMAIEPGRVQALRHGVRVLRAVVIAFVVCWLPYHVRRLMFCYISD
             .::.     :.     : :  .. :..: .::.::..::::.:: : .:   : 
CCDS32 ------VVGA-----SL-----RDQNHKQTVKMLAVVVFAFILCWLPFHVGRYLFSK-SF
             250                 260       270       280        290

             340       350       360       370       380       390 
pF1KE0 EQWTPFLYDFYHYFYMVTNALFYVSSTINPILYNLVSANFRHIFLATLACLCPVWRRRRK
       :  .  . .. .:  .:. .:::.:..:::::::..: ..:                   
CCDS32 EPGSLEIAQISQYCNLVSFVLFYLSAAINPILYNIMSKKYRVAVFRLLGFEPFSQRKLST
              300       310       320       330       340       350

             400       410        
pF1KE0 RPAFSRKADSVSSNHTLSSNATRETLY
                                  
CCDS32 LKDESSRAWTESSINT           
              360                 

>>CCDS4321.1 NMUR2 gene_id:56923|Hs108|chr5               (415 aa)
 initn: 573 init1: 157 opt: 433  Z-score: 354.6  bits: 74.6 E(32554): 2e-13
Smith-Waterman score: 613; 31.9% identity (66.6% similar) in 323 aa overlap (66-386:48-349)

          40        50        60        70        80        90     
pF1KE0 GNASGNASERVLAAPSSELDVNTDIYSKVLVTAVYLALFVVGTVGNTVTAFTLARKKSLQ
                                     :..::. .::::..::... ... ..   :
CCDS43 LEDPFQKHLNSTEEYLAFLCGPRRSHFFLPVSVVYVPIFVVGVIGNVLVCLVILQH---Q
        20        30        40        50        60        70       

         100       110       120       130       140       150     
pF1KE0 SLQSTVHYHLGSLALSDLLTLLLAMPVELYNFIWVHHPWAFGDAGCRGYYFLRDACTYAT
       .... ..:.: :::.::::.:::.::.:.:. .: ..:. :: .::     : ..  .:.
CCDS43 AMKTPTNYYLFSLAVSDLLVLLLGMPLEVYE-MWRNYPFLFGPVGCYFKTALFETVCFAS
           80        90       100        110       120       130   

         160       170       180       190       200       210     
pF1KE0 ALNVASLSVERYLAICHPFKAKTLMSRSRTKKFISAIWLASALLAVPMLFTMGEQ-NRSA
        :.....:::::.:: :::.::   .: :. .... .:  :.:...:     : . .   
CCDS43 ILSITTVSVERYVAILHPFRAKLQSTRRRALRILGIVWGFSVLFSLPNTSIHGIKFHYFP
           140       150       160       170       180       190   

           220       230       240       250       260       270   
pF1KE0 DGQHA-GGLVCTPTIHTATVKVVIQVNTFMSFIFPMVVISVLNTIIANKLTVMVRQAAEQ
       .:. . :. .::        . .:::..:. ...::.:::::  ..: .:       :..
CCDS43 NGSLVPGSATCTVIKPMWIYNFIIQVTSFLFYLLPMTVISVLYYLMALRLKKDKSLEADE
           200       210       220       230       240       250   

           280       290       300       310       320       330   
pF1KE0 GQVCTVGGEHSTFSMAIEPGRVQALRHGVRVLRAVVIAFVVCWLPYHVRRLMFCYISDEQ
       :.           .   .: :    .   ..: ..:..:..:: :.:. ::.: ..  :.
CCDS43 GN-----------ANIQRPCR----KSVNKMLFVLVLVFAICWAPFHIDRLFFSFV--EE
                      260           270       280       290        

           340       350       360       370       380       390   
pF1KE0 WTPFLYDFYHYFYMVTNALFYVSSTINPILYNLVSANFRHIFLATLACLCPVWRRRRKRP
       :.  :   ..  ..:....::.::..:::.:::.:  :.  :  ... .   :       
CCDS43 WSESLAAVFNLVHVVSGVFFYLSSAVNPIIYNLLSRRFQAAFQNVISSFHKQWHSQHDPQ
        300       310       320       330       340       350      

           400       410                                          
pF1KE0 AFSRKADSVSSNHTLSSNATRETLY                                  
                                                                  
CCDS43 LPPAQRNIFLTECHFVELTEDIGPQFPCQSSMHNSHLPAALSSEQMSRTNYQSFHFNKT
        360       370       380       390       400       410     

>>CCDS9414.1 MLNR gene_id:2862|Hs108|chr13                (412 aa)
 initn: 576 init1: 257 opt: 419  Z-score: 343.9  bits: 72.6 E(32554): 7.8e-13
Smith-Waterman score: 598; 34.6% identity (62.2% similar) in 381 aa overlap (64-401:39-386)

            40        50        60        70        80        90   
pF1KE0 GFGNASGNASERVLAAPSSELDVNTDIYSKVLVTAVYLALFVVGTVGNTVTAFTLARKKS
                                     : :::: : :::::. ::.::.. ..: ..
CCDS94 DGPEGAREPPWPALPPCDERRCSPFPLGALVPVTAVCLCLFVVGVSGNVVTVMLIGRYRD
       10        20        30        40        50        60        

           100       110       120       130       140       150   
pF1KE0 LQSLQSTVHYHLGSLALSDLLTLLLAMPVELYNFIWVHHPWAFGDAGCRGYYFLRDACTY
       ...   :.. .:::.:.:::: .::..: .::  .:  .::.::   ::   .. ..:::
CCDS94 MRT---TTNLYLGSMAVSDLL-ILLGLPFDLYR-LWRSRPWVFGPLLCRLSLYVGEGCTY
       70           80         90        100       110       120   

           160       170       180       190       200        210  
pF1KE0 ATALNVASLSVERYLAICHPFKAKTLMSRSRTKKFISAIWLASALLAVPMLFTMG-EQN-
       :: :....::::::::::.:..:..:..: :.. .:...: .. : : :.:: .: ::. 
CCDS94 ATLLHMTALSVERYLAICRPLRARVLVTRRRVRALIAVLWAVALLSAGPFLFLVGVEQDP
           130       140       150       160       170       180   

                                                 220           230 
pF1KE0 ------------RSADGQ------------------------HAGGLV---CTPT-IHTA
                   : :..                         .:..:    : :.  . .
CCDS94 GISVVPGLNGTARIASSPLASSPPLWLSRAPPPSPPSGPETAEAAALFSRECRPSPAQLG
           190       200       210       220       230       240   

             240       250       260       270       280       290 
pF1KE0 TVKVVIQVNTFMSFIFPMVVISVLNTIIANKLTVMVRQAAEQGQVCTVGGEHSTFSMAIE
       ...:.. :.:   :..:.. .:.:  .:. .:    :    .: . .             
CCDS94 ALRVMLWVTT-AYFFLPFLCLSILYGLIGRELWSSRRPL--RGPAAS-------------
           250        260       270       280                      

             300       310       320       330       340       350 
pF1KE0 PGRVQALRHGVRVLRAVVIAFVVCWLPYHVRRLMFCYISDEQWTPFLYDFYHYFYMVTNA
        :: .. :. :::: .::.::..::::.:: :..  ::. :. . ..: : .:: .:.  
CCDS94 -GRERGHRQTVRVLLVVVLAFIICWLPFHVGRII--YINTED-SRMMY-FSQYFNIVALQ
        290       300       310       320          330        340  

             360       370       380       390        400       410
pF1KE0 LFYVSSTINPILYNLVSANFRHIFLATLACLCPVWRRRRKRP-AFSRKADSVSSNHTLSS
       :::.:..::::::::.: ..:   .  :         :..:: .: :. :.         
CCDS94 LFYLSASINPILYNLISKKYRAAAFKLLLA-------RKSRPRGFHRSRDTAGEVAGDTG
            350       360       370              380       390     

                        
pF1KE0 NATRETLY         
                        
CCDS94 GDTVGYTETSANVKTMG
         400       410  

>>CCDS2170.1 GPR39 gene_id:2863|Hs108|chr2                (453 aa)
 initn: 594 init1: 395 opt: 408  Z-score: 335.0  bits: 71.1 E(32554): 2.4e-12
Smith-Waterman score: 614; 32.9% identity (64.3% similar) in 347 aa overlap (53-381:22-361)

             30        40        50        60        70        80  
pF1KE0 QAGLEEALLAPGFGNASGNASERVLAAPSSELDVNTDIYSKVLVTAVYLALFVVGTVGNT
                                     :..: : :  :. .  ::: .::.: .::.
CCDS21          MASPSLPGSDCSQIIDHSHVPEFEVATWI--KITLILVYLIIFVMGLLGNS
                        10        20          30        40         

             90       100       110       120       130       140  
pF1KE0 VTAFTLARKKSLQSLQSTVHYHLGSLALSDLLTLLLAMPVELYNFIWVHHPWAFGDAGCR
       .:  .    ..   ::. :  :. ::: ::.:..:..::.:.:..::     .    .:.
CCDS21 ATIRVTQVLQKKGYLQKEVTDHMVSLACSDILVFLIGMPMEFYSIIWNPLTTSSYTLSCK
      50        60        70        80        90       100         

            150       160       170       180       190       200  
pF1KE0 GYYFLRDACTYATALNVASLSVERYLAICHPFKAKTLMSRSRTKKFISAIWLASALLAVP
        . :: .::.::: :.: .:: :::.::::::. :.. .  ..: .:. .:..:::.:.:
CCDS21 LHTFLFEACSYATLLHVLTLSFERYIAICHPFRYKAVSGPCQVKLLIGFVWVTSALVALP
     110       120       130       140       150       160         

            210       220              230                240      
pF1KE0 MLFTMGEQNRSADGQHAGGLVC--TPTIH-----TATVKV---------VIQVNTFMSFI
       .::.:: .   ..     ::.:  . : :     :.....         :.: . : .:.
CCDS21 LLFAMGTEYPLVNVPSHRGLTCNRSSTRHHEQPETSNMSICTNLSSRWTVFQSSIFGAFV
     170       180       190       200       210       220         

        250       260       270       280         290       300    
pF1KE0 FPMVVISVLNTIIANKLTVMVRQAAEQGQVCTVGGEH--STFSMAIEPGRVQALRHGVRV
         .::.  .  .  : . :...  ...:..  .:: .  .  .   : .:. : :. .  
CCDS21 VYLVVLLSVAFMCWNMMQVLMK--SQKGSL--AGGTRPPQLRKSESEESRT-ARRQTIIF
     230       240       250           260       270        280    

          310       320       330       340       350       360    
pF1KE0 LRAVVIAFVVCWLPYHVRRLMFCYISDEQWTPFLYDFYHYFYMVTNALFYVSSTINPILY
       :: .:....:::.: ..::.:      ..::   .  :  .   ....::.::.:::.::
CCDS21 LRLIVVTLAVCWMPNQIRRIMAAAKPKHDWTRSYFRAYMILLPFSETFFYLSSVINPLLY
          290       300       310       320       330       340    

          370       380       390       400       410              
pF1KE0 NLVSANFRHIFLATLACLCPVWRRRRKRPAFSRKADSVSSNHTLSSNATRETLY      
       .. : .::..:. .: :                                           
CCDS21 TVSSQQFRRVFVQVLCCRLSLQHANHEKRLRVHAHSTTDSARFVQRPLLFASRRQSSARR
          350       360       370       380       390       400    

>>CCDS6311.1 TRHR gene_id:7201|Hs108|chr8                 (398 aa)
 initn: 323 init1: 186 opt: 393  Z-score: 324.0  bits: 68.9 E(32554): 1e-11
Smith-Waterman score: 393; 24.6% identity (59.4% similar) in 362 aa overlap (43-394:3-346)

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