Result of FASTA (ccds) for pF1KE0075
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE0075, 1447 aa
  1>>>pF1KE0075 1447 - 1447 aa - 1447 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.3381+/-0.00108; mu= 5.9438+/- 0.065
 mean_var=233.6026+/-46.568, 0's: 0 Z-trim(111.6): 33  B-trim: 0 in 0/51
 Lambda= 0.083914
 statistics sampled from 12489 (12507) to 12489 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.702), E-opt: 0.2 (0.384), width:  16
 Scan time:  4.270

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS6714.1 PTCH1 gene_id:5727|Hs108|chr9           (1447) 9793 1199.8       0
CCDS47995.1 PTCH1 gene_id:5727|Hs108|chr9          (1446) 9327 1143.4       0
CCDS47996.1 PTCH1 gene_id:5727|Hs108|chr9          (1381) 9321 1142.7       0
CCDS43851.1 PTCH1 gene_id:5727|Hs108|chr9          (1296) 8768 1075.7       0
CCDS53312.1 PTCH2 gene_id:8643|Hs108|chr1          (1146) 2010 257.5 1.6e-67
CCDS516.1 PTCH2 gene_id:8643|Hs108|chr1            (1203) 2010 257.5 1.7e-67


>>CCDS6714.1 PTCH1 gene_id:5727|Hs108|chr9                (1447 aa)
 initn: 9793 init1: 9793 opt: 9793  Z-score: 6416.4  bits: 1199.8 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 9793; 100.0% identity (100.0% similar) in 1447 aa overlap (1-1447:1-1447)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MASAGNAAEPQDRGGGGSGCIGAPGRPAGGGRRRRTGGLRRAAAPDRDYLHRPSYCDAAF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 MASAGNAAEPQDRGGGGSGCIGAPGRPAGGGRRRRTGGLRRAAAPDRDYLHRPSYCDAAF
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE0 ALEQISKGKATGRKAPLWLRAKFQRLLFKLGCYIQKNCGKFLVVGLLIFGAFAVGLKAAN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 ALEQISKGKATGRKAPLWLRAKFQRLLFKLGCYIQKNCGKFLVVGLLIFGAFAVGLKAAN
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE0 LETNVEELWVEVGGRVSRELNYTRQKIGEEAMFNPQLMIQTPKEEGANVLTTEALLQHLD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 LETNVEELWVEVGGRVSRELNYTRQKIGEEAMFNPQLMIQTPKEEGANVLTTEALLQHLD
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE0 SALQASRVHVYMYNRQWKLEHLCYKSGELITETGYMDQIIEYLYPCLIITPLDCFWEGAK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 SALQASRVHVYMYNRQWKLEHLCYKSGELITETGYMDQIIEYLYPCLIITPLDCFWEGAK
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE0 LQSGTAYLLGKPPLRWTNFDPLEFLEELKKINYQVDSWEEMLNKAEVGHGYMDRPCLNPA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 LQSGTAYLLGKPPLRWTNFDPLEFLEELKKINYQVDSWEEMLNKAEVGHGYMDRPCLNPA
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE0 DPDCPATAPNKNSTKPLDMALVLNGGCHGLSRKYMHWQEELIVGGTVKNSTGKLVSAHAL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 DPDCPATAPNKNSTKPLDMALVLNGGCHGLSRKYMHWQEELIVGGTVKNSTGKLVSAHAL
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE0 QTMFQLMTPKQMYEHFKGYEYVSHINWNEDKAAAILEAWQRTYVEVVHQSVAQNSTQKVL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 QTMFQLMTPKQMYEHFKGYEYVSHINWNEDKAAAILEAWQRTYVEVVHQSVAQNSTQKVL
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE0 SFTTTTLDDILKSFSDVSVIRVASGYLLMLAYACLTMLRWDCSKSQGAVGLAGVLLVALS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 SFTTTTLDDILKSFSDVSVIRVASGYLLMLAYACLTMLRWDCSKSQGAVGLAGVLLVALS
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE0 VAAGLGLCSLIGISFNAATTQVLPFLALGVGVDDVFLLAHAFSETGQNKRIPFEDRTGEC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 VAAGLGLCSLIGISFNAATTQVLPFLALGVGVDDVFLLAHAFSETGQNKRIPFEDRTGEC
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE0 LKRTGASVALTSISNVTAFFMAALIPIPALRAFSLQAAVVVVFNFAMVLLIFPAILSMDL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 LKRTGASVALTSISNVTAFFMAALIPIPALRAFSLQAAVVVVFNFAMVLLIFPAILSMDL
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KE0 YRREDRRLDIFCCFTSPCVSRVIQVEPQAYTDTHDNTRYSPPPPYSSHSFAHETQITMQS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 YRREDRRLDIFCCFTSPCVSRVIQVEPQAYTDTHDNTRYSPPPPYSSHSFAHETQITMQS
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KE0 TVQLRTEYDPHTHVYYTTAEPRSEISVQPVTVTQDTLSCQSPESTSSTRDLLSQFSDSSL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 TVQLRTEYDPHTHVYYTTAEPRSEISVQPVTVTQDTLSCQSPESTSSTRDLLSQFSDSSL
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KE0 HCLEPPCTKWTLSSFAEKHYAPFLLKPKAKVVVIFLFLGLLGVSLYGTTRVRDGLDLTDI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 HCLEPPCTKWTLSSFAEKHYAPFLLKPKAKVVVIFLFLGLLGVSLYGTTRVRDGLDLTDI
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KE0 VPRETREYDFIAAQFKYFSFYNMYIVTQKADYPNIQHLLYDLHRSFSNVKYVMLEENKQL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 VPRETREYDFIAAQFKYFSFYNMYIVTQKADYPNIQHLLYDLHRSFSNVKYVMLEENKQL
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KE0 PKMWLHYFRDWLQGLQDAFDSDWETGKIMPNNYKNGSDDGVLAYKLLVQTGSRDKPIDIS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 PKMWLHYFRDWLQGLQDAFDSDWETGKIMPNNYKNGSDDGVLAYKLLVQTGSRDKPIDIS
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KE0 QLTKQRLVDADGIINPSAFYIYLTAWVSNDPVAYAASQANIRPHRPEWVHDKADYMPETR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 QLTKQRLVDADGIINPSAFYIYLTAWVSNDPVAYAASQANIRPHRPEWVHDKADYMPETR
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KE0 LRIPAAEPIEYAQFPFYLNGLRDTSDFVEAIEKVRTICSNYTSLGLSSYPNGYPFLFWEQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 LRIPAAEPIEYAQFPFYLNGLRDTSDFVEAIEKVRTICSNYTSLGLSSYPNGYPFLFWEQ
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KE0 YIGLRHWLLLFISVVLACTFLVCAVFLLNPWTAGIIVMVLALMTVELFGMMGLIGIKLSA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 YIGLRHWLLLFISVVLACTFLVCAVFLLNPWTAGIIVMVLALMTVELFGMMGLIGIKLSA
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KE0 VPVVILIASVGIGVEFTVHVALAFLTAIGDKNRRAVLALEHMFAPVLDGAVSTLLGVLML
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 VPVVILIASVGIGVEFTVHVALAFLTAIGDKNRRAVLALEHMFAPVLDGAVSTLLGVLML
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KE0 AGSEFDFIVRYFFAVLAILTILGVLNGLVLLPVLLSFFGPYPEVSPANGLNRLPTPSPEP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 AGSEFDFIVRYFFAVLAILTILGVLNGLVLLPVLLSFFGPYPEVSPANGLNRLPTPSPEP
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KE0 PPSVVRFAMPPGHTHSGSDSSDSEYSSQTTVSGLSEELRHYEAQQGAGGPAHQVIVEATE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 PPSVVRFAMPPGHTHSGSDSSDSEYSSQTTVSGLSEELRHYEAQQGAGGPAHQVIVEATE
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

             1270      1280      1290      1300      1310      1320
pF1KE0 NPVFAHSTVVHPESRHHPPSNPRQQPHLDSGSLPPGRQGQQPRRDPPREGLWPPPYRPRR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 NPVFAHSTVVHPESRHHPPSNPRQQPHLDSGSLPPGRQGQQPRRDPPREGLWPPPYRPRR
             1270      1280      1290      1300      1310      1320

             1330      1340      1350      1360      1370      1380
pF1KE0 DAFEISTEGHSGPSNRARWGPRGARSHNPRNPASTAMGSSVPGYCQPITTVTASASVTVA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 DAFEISTEGHSGPSNRARWGPRGARSHNPRNPASTAMGSSVPGYCQPITTVTASASVTVA
             1330      1340      1350      1360      1370      1380

             1390      1400      1410      1420      1430      1440
pF1KE0 VHPPPVPGPGRNPRGGLCPGYPETDHGLFEDPHVPFHVRCERRDSKVEVIELQDVECEER
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 VHPPPVPGPGRNPRGGLCPGYPETDHGLFEDPHVPFHVRCERRDSKVEVIELQDVECEER
             1390      1400      1410      1420      1430      1440

              
pF1KE0 PRGSSSN
       :::::::
CCDS67 PRGSSSN
              

>>CCDS47995.1 PTCH1 gene_id:5727|Hs108|chr9               (1446 aa)
 initn: 9327 init1: 9327 opt: 9327  Z-score: 6111.5  bits: 1143.4 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 9327; 100.0% identity (100.0% similar) in 1381 aa overlap (67-1447:66-1446)

         40        50        60        70        80        90      
pF1KE0 GGLRRAAAPDRDYLHRPSYCDAAFALEQISKGKATGRKAPLWLRAKFQRLLFKLGCYIQK
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 FCKDGGGGEEEEENGGEEKDDRGDKETRSDKGKATGRKAPLWLRAKFQRLLFKLGCYIQK
          40        50        60        70        80        90     

        100       110       120       130       140       150      
pF1KE0 NCGKFLVVGLLIFGAFAVGLKAANLETNVEELWVEVGGRVSRELNYTRQKIGEEAMFNPQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 NCGKFLVVGLLIFGAFAVGLKAANLETNVEELWVEVGGRVSRELNYTRQKIGEEAMFNPQ
         100       110       120       130       140       150     

        160       170       180       190       200       210      
pF1KE0 LMIQTPKEEGANVLTTEALLQHLDSALQASRVHVYMYNRQWKLEHLCYKSGELITETGYM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LMIQTPKEEGANVLTTEALLQHLDSALQASRVHVYMYNRQWKLEHLCYKSGELITETGYM
         160       170       180       190       200       210     

        220       230       240       250       260       270      
pF1KE0 DQIIEYLYPCLIITPLDCFWEGAKLQSGTAYLLGKPPLRWTNFDPLEFLEELKKINYQVD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 DQIIEYLYPCLIITPLDCFWEGAKLQSGTAYLLGKPPLRWTNFDPLEFLEELKKINYQVD
         220       230       240       250       260       270     

        280       290       300       310       320       330      
pF1KE0 SWEEMLNKAEVGHGYMDRPCLNPADPDCPATAPNKNSTKPLDMALVLNGGCHGLSRKYMH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 SWEEMLNKAEVGHGYMDRPCLNPADPDCPATAPNKNSTKPLDMALVLNGGCHGLSRKYMH
         280       290       300       310       320       330     

        340       350       360       370       380       390      
pF1KE0 WQEELIVGGTVKNSTGKLVSAHALQTMFQLMTPKQMYEHFKGYEYVSHINWNEDKAAAIL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 WQEELIVGGTVKNSTGKLVSAHALQTMFQLMTPKQMYEHFKGYEYVSHINWNEDKAAAIL
         340       350       360       370       380       390     

        400       410       420       430       440       450      
pF1KE0 EAWQRTYVEVVHQSVAQNSTQKVLSFTTTTLDDILKSFSDVSVIRVASGYLLMLAYACLT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 EAWQRTYVEVVHQSVAQNSTQKVLSFTTTTLDDILKSFSDVSVIRVASGYLLMLAYACLT
         400       410       420       430       440       450     

        460       470       480       490       500       510      
pF1KE0 MLRWDCSKSQGAVGLAGVLLVALSVAAGLGLCSLIGISFNAATTQVLPFLALGVGVDDVF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MLRWDCSKSQGAVGLAGVLLVALSVAAGLGLCSLIGISFNAATTQVLPFLALGVGVDDVF
         460       470       480       490       500       510     

        520       530       540       550       560       570      
pF1KE0 LLAHAFSETGQNKRIPFEDRTGECLKRTGASVALTSISNVTAFFMAALIPIPALRAFSLQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LLAHAFSETGQNKRIPFEDRTGECLKRTGASVALTSISNVTAFFMAALIPIPALRAFSLQ
         520       530       540       550       560       570     

        580       590       600       610       620       630      
pF1KE0 AAVVVVFNFAMVLLIFPAILSMDLYRREDRRLDIFCCFTSPCVSRVIQVEPQAYTDTHDN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 AAVVVVFNFAMVLLIFPAILSMDLYRREDRRLDIFCCFTSPCVSRVIQVEPQAYTDTHDN
         580       590       600       610       620       630     

        640       650       660       670       680       690      
pF1KE0 TRYSPPPPYSSHSFAHETQITMQSTVQLRTEYDPHTHVYYTTAEPRSEISVQPVTVTQDT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 TRYSPPPPYSSHSFAHETQITMQSTVQLRTEYDPHTHVYYTTAEPRSEISVQPVTVTQDT
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        700       710       720       730       740       750      
pF1KE0 LSCQSPESTSSTRDLLSQFSDSSLHCLEPPCTKWTLSSFAEKHYAPFLLKPKAKVVVIFL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LSCQSPESTSSTRDLLSQFSDSSLHCLEPPCTKWTLSSFAEKHYAPFLLKPKAKVVVIFL
         700       710       720       730       740       750     

        760       770       780       790       800       810      
pF1KE0 FLGLLGVSLYGTTRVRDGLDLTDIVPRETREYDFIAAQFKYFSFYNMYIVTQKADYPNIQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 FLGLLGVSLYGTTRVRDGLDLTDIVPRETREYDFIAAQFKYFSFYNMYIVTQKADYPNIQ
         760       770       780       790       800       810     

        820       830       840       850       860       870      
pF1KE0 HLLYDLHRSFSNVKYVMLEENKQLPKMWLHYFRDWLQGLQDAFDSDWETGKIMPNNYKNG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 HLLYDLHRSFSNVKYVMLEENKQLPKMWLHYFRDWLQGLQDAFDSDWETGKIMPNNYKNG
         820       830       840       850       860       870     

        880       890       900       910       920       930      
pF1KE0 SDDGVLAYKLLVQTGSRDKPIDISQLTKQRLVDADGIINPSAFYIYLTAWVSNDPVAYAA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 SDDGVLAYKLLVQTGSRDKPIDISQLTKQRLVDADGIINPSAFYIYLTAWVSNDPVAYAA
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        940       950       960       970       980       990      
pF1KE0 SQANIRPHRPEWVHDKADYMPETRLRIPAAEPIEYAQFPFYLNGLRDTSDFVEAIEKVRT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 SQANIRPHRPEWVHDKADYMPETRLRIPAAEPIEYAQFPFYLNGLRDTSDFVEAIEKVRT
         940       950       960       970       980       990     

       1000      1010      1020      1030      1040      1050      
pF1KE0 ICSNYTSLGLSSYPNGYPFLFWEQYIGLRHWLLLFISVVLACTFLVCAVFLLNPWTAGII
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 ICSNYTSLGLSSYPNGYPFLFWEQYIGLRHWLLLFISVVLACTFLVCAVFLLNPWTAGII
        1000      1010      1020      1030      1040      1050     

       1060      1070      1080      1090      1100      1110      
pF1KE0 VMVLALMTVELFGMMGLIGIKLSAVPVVILIASVGIGVEFTVHVALAFLTAIGDKNRRAV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 VMVLALMTVELFGMMGLIGIKLSAVPVVILIASVGIGVEFTVHVALAFLTAIGDKNRRAV
        1060      1070      1080      1090      1100      1110     

       1120      1130      1140      1150      1160      1170      
pF1KE0 LALEHMFAPVLDGAVSTLLGVLMLAGSEFDFIVRYFFAVLAILTILGVLNGLVLLPVLLS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LALEHMFAPVLDGAVSTLLGVLMLAGSEFDFIVRYFFAVLAILTILGVLNGLVLLPVLLS
        1120      1130      1140      1150      1160      1170     

       1180      1190      1200      1210      1220      1230      
pF1KE0 FFGPYPEVSPANGLNRLPTPSPEPPPSVVRFAMPPGHTHSGSDSSDSEYSSQTTVSGLSE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 FFGPYPEVSPANGLNRLPTPSPEPPPSVVRFAMPPGHTHSGSDSSDSEYSSQTTVSGLSE
        1180      1190      1200      1210      1220      1230     

       1240      1250      1260      1270      1280      1290      
pF1KE0 ELRHYEAQQGAGGPAHQVIVEATENPVFAHSTVVHPESRHHPPSNPRQQPHLDSGSLPPG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 ELRHYEAQQGAGGPAHQVIVEATENPVFAHSTVVHPESRHHPPSNPRQQPHLDSGSLPPG
        1240      1250      1260      1270      1280      1290     

       1300      1310      1320      1330      1340      1350      
pF1KE0 RQGQQPRRDPPREGLWPPPYRPRRDAFEISTEGHSGPSNRARWGPRGARSHNPRNPASTA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 RQGQQPRRDPPREGLWPPPYRPRRDAFEISTEGHSGPSNRARWGPRGARSHNPRNPASTA
        1300      1310      1320      1330      1340      1350     

       1360      1370      1380      1390      1400      1410      
pF1KE0 MGSSVPGYCQPITTVTASASVTVAVHPPPVPGPGRNPRGGLCPGYPETDHGLFEDPHVPF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MGSSVPGYCQPITTVTASASVTVAVHPPPVPGPGRNPRGGLCPGYPETDHGLFEDPHVPF
        1360      1370      1380      1390      1400      1410     

       1420      1430      1440       
pF1KE0 HVRCERRDSKVEVIELQDVECEERPRGSSSN
       :::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 HVRCERRDSKVEVIELQDVECEERPRGSSSN
        1420      1430      1440      

>>CCDS47996.1 PTCH1 gene_id:5727|Hs108|chr9               (1381 aa)
 initn: 9321 init1: 9321 opt: 9321  Z-score: 6107.9  bits: 1142.7 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 9321; 100.0% identity (100.0% similar) in 1380 aa overlap (68-1447:2-1381)

        40        50        60        70        80        90       
pF1KE0 GLRRAAAPDRDYLHRPSYCDAAFALEQISKGKATGRKAPLWLRAKFQRLLFKLGCYIQKN
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47                              MGKATGRKAPLWLRAKFQRLLFKLGCYIQKN
                                            10        20        30 

       100       110       120       130       140       150       
pF1KE0 CGKFLVVGLLIFGAFAVGLKAANLETNVEELWVEVGGRVSRELNYTRQKIGEEAMFNPQL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 CGKFLVVGLLIFGAFAVGLKAANLETNVEELWVEVGGRVSRELNYTRQKIGEEAMFNPQL
              40        50        60        70        80        90 

       160       170       180       190       200       210       
pF1KE0 MIQTPKEEGANVLTTEALLQHLDSALQASRVHVYMYNRQWKLEHLCYKSGELITETGYMD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MIQTPKEEGANVLTTEALLQHLDSALQASRVHVYMYNRQWKLEHLCYKSGELITETGYMD
             100       110       120       130       140       150 

       220       230       240       250       260       270       
pF1KE0 QIIEYLYPCLIITPLDCFWEGAKLQSGTAYLLGKPPLRWTNFDPLEFLEELKKINYQVDS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 QIIEYLYPCLIITPLDCFWEGAKLQSGTAYLLGKPPLRWTNFDPLEFLEELKKINYQVDS
             160       170       180       190       200       210 

       280       290       300       310       320       330       
pF1KE0 WEEMLNKAEVGHGYMDRPCLNPADPDCPATAPNKNSTKPLDMALVLNGGCHGLSRKYMHW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 WEEMLNKAEVGHGYMDRPCLNPADPDCPATAPNKNSTKPLDMALVLNGGCHGLSRKYMHW
             220       230       240       250       260       270 

       340       350       360       370       380       390       
pF1KE0 QEELIVGGTVKNSTGKLVSAHALQTMFQLMTPKQMYEHFKGYEYVSHINWNEDKAAAILE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 QEELIVGGTVKNSTGKLVSAHALQTMFQLMTPKQMYEHFKGYEYVSHINWNEDKAAAILE
             280       290       300       310       320       330 

       400       410       420       430       440       450       
pF1KE0 AWQRTYVEVVHQSVAQNSTQKVLSFTTTTLDDILKSFSDVSVIRVASGYLLMLAYACLTM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 AWQRTYVEVVHQSVAQNSTQKVLSFTTTTLDDILKSFSDVSVIRVASGYLLMLAYACLTM
             340       350       360       370       380       390 

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pF1KE0 LRWDCSKSQGAVGLAGVLLVALSVAAGLGLCSLIGISFNAATTQVLPFLALGVGVDDVFL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LRWDCSKSQGAVGLAGVLLVALSVAAGLGLCSLIGISFNAATTQVLPFLALGVGVDDVFL
             400       410       420       430       440       450 

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pF1KE0 LAHAFSETGQNKRIPFEDRTGECLKRTGASVALTSISNVTAFFMAALIPIPALRAFSLQA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LAHAFSETGQNKRIPFEDRTGECLKRTGASVALTSISNVTAFFMAALIPIPALRAFSLQA
             460       470       480       490       500       510 

       580       590       600       610       620       630       
pF1KE0 AVVVVFNFAMVLLIFPAILSMDLYRREDRRLDIFCCFTSPCVSRVIQVEPQAYTDTHDNT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 AVVVVFNFAMVLLIFPAILSMDLYRREDRRLDIFCCFTSPCVSRVIQVEPQAYTDTHDNT
             520       530       540       550       560       570 

       640       650       660       670       680       690       
pF1KE0 RYSPPPPYSSHSFAHETQITMQSTVQLRTEYDPHTHVYYTTAEPRSEISVQPVTVTQDTL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 RYSPPPPYSSHSFAHETQITMQSTVQLRTEYDPHTHVYYTTAEPRSEISVQPVTVTQDTL
             580       590       600       610       620       630 

       700       710       720       730       740       750       
pF1KE0 SCQSPESTSSTRDLLSQFSDSSLHCLEPPCTKWTLSSFAEKHYAPFLLKPKAKVVVIFLF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 SCQSPESTSSTRDLLSQFSDSSLHCLEPPCTKWTLSSFAEKHYAPFLLKPKAKVVVIFLF
             640       650       660       670       680       690 

       760       770       780       790       800       810       
pF1KE0 LGLLGVSLYGTTRVRDGLDLTDIVPRETREYDFIAAQFKYFSFYNMYIVTQKADYPNIQH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LGLLGVSLYGTTRVRDGLDLTDIVPRETREYDFIAAQFKYFSFYNMYIVTQKADYPNIQH
             700       710       720       730       740       750 

       820       830       840       850       860       870       
pF1KE0 LLYDLHRSFSNVKYVMLEENKQLPKMWLHYFRDWLQGLQDAFDSDWETGKIMPNNYKNGS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LLYDLHRSFSNVKYVMLEENKQLPKMWLHYFRDWLQGLQDAFDSDWETGKIMPNNYKNGS
             760       770       780       790       800       810 

       880       890       900       910       920       930       
pF1KE0 DDGVLAYKLLVQTGSRDKPIDISQLTKQRLVDADGIINPSAFYIYLTAWVSNDPVAYAAS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 DDGVLAYKLLVQTGSRDKPIDISQLTKQRLVDADGIINPSAFYIYLTAWVSNDPVAYAAS
             820       830       840       850       860       870 

       940       950       960       970       980       990       
pF1KE0 QANIRPHRPEWVHDKADYMPETRLRIPAAEPIEYAQFPFYLNGLRDTSDFVEAIEKVRTI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 QANIRPHRPEWVHDKADYMPETRLRIPAAEPIEYAQFPFYLNGLRDTSDFVEAIEKVRTI
             880       890       900       910       920       930 

      1000      1010      1020      1030      1040      1050       
pF1KE0 CSNYTSLGLSSYPNGYPFLFWEQYIGLRHWLLLFISVVLACTFLVCAVFLLNPWTAGIIV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 CSNYTSLGLSSYPNGYPFLFWEQYIGLRHWLLLFISVVLACTFLVCAVFLLNPWTAGIIV
             940       950       960       970       980       990 

      1060      1070      1080      1090      1100      1110       
pF1KE0 MVLALMTVELFGMMGLIGIKLSAVPVVILIASVGIGVEFTVHVALAFLTAIGDKNRRAVL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MVLALMTVELFGMMGLIGIKLSAVPVVILIASVGIGVEFTVHVALAFLTAIGDKNRRAVL
            1000      1010      1020      1030      1040      1050 

      1120      1130      1140      1150      1160      1170       
pF1KE0 ALEHMFAPVLDGAVSTLLGVLMLAGSEFDFIVRYFFAVLAILTILGVLNGLVLLPVLLSF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 ALEHMFAPVLDGAVSTLLGVLMLAGSEFDFIVRYFFAVLAILTILGVLNGLVLLPVLLSF
            1060      1070      1080      1090      1100      1110 

      1180      1190      1200      1210      1220      1230       
pF1KE0 FGPYPEVSPANGLNRLPTPSPEPPPSVVRFAMPPGHTHSGSDSSDSEYSSQTTVSGLSEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 FGPYPEVSPANGLNRLPTPSPEPPPSVVRFAMPPGHTHSGSDSSDSEYSSQTTVSGLSEE
            1120      1130      1140      1150      1160      1170 

      1240      1250      1260      1270      1280      1290       
pF1KE0 LRHYEAQQGAGGPAHQVIVEATENPVFAHSTVVHPESRHHPPSNPRQQPHLDSGSLPPGR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LRHYEAQQGAGGPAHQVIVEATENPVFAHSTVVHPESRHHPPSNPRQQPHLDSGSLPPGR
            1180      1190      1200      1210      1220      1230 

      1300      1310      1320      1330      1340      1350       
pF1KE0 QGQQPRRDPPREGLWPPPYRPRRDAFEISTEGHSGPSNRARWGPRGARSHNPRNPASTAM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 QGQQPRRDPPREGLWPPPYRPRRDAFEISTEGHSGPSNRARWGPRGARSHNPRNPASTAM
            1240      1250      1260      1270      1280      1290 

      1360      1370      1380      1390      1400      1410       
pF1KE0 GSSVPGYCQPITTVTASASVTVAVHPPPVPGPGRNPRGGLCPGYPETDHGLFEDPHVPFH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 GSSVPGYCQPITTVTASASVTVAVHPPPVPGPGRNPRGGLCPGYPETDHGLFEDPHVPFH
            1300      1310      1320      1330      1340      1350 

      1420      1430      1440       
pF1KE0 VRCERRDSKVEVIELQDVECEERPRGSSSN
       ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 VRCERRDSKVEVIELQDVECEERPRGSSSN
            1360      1370      1380 

>>CCDS43851.1 PTCH1 gene_id:5727|Hs108|chr9               (1296 aa)
 initn: 8768 init1: 8768 opt: 8768  Z-score: 5746.5  bits: 1075.7 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 8768; 100.0% identity (100.0% similar) in 1296 aa overlap (152-1447:1-1296)

             130       140       150       160       170       180 
pF1KE0 ETNVEELWVEVGGRVSRELNYTRQKIGEEAMFNPQLMIQTPKEEGANVLTTEALLQHLDS
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43                               MFNPQLMIQTPKEEGANVLTTEALLQHLDS
                                             10        20        30

             190       200       210       220       230       240 
pF1KE0 ALQASRVHVYMYNRQWKLEHLCYKSGELITETGYMDQIIEYLYPCLIITPLDCFWEGAKL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 ALQASRVHVYMYNRQWKLEHLCYKSGELITETGYMDQIIEYLYPCLIITPLDCFWEGAKL
               40        50        60        70        80        90

             250       260       270       280       290       300 
pF1KE0 QSGTAYLLGKPPLRWTNFDPLEFLEELKKINYQVDSWEEMLNKAEVGHGYMDRPCLNPAD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 QSGTAYLLGKPPLRWTNFDPLEFLEELKKINYQVDSWEEMLNKAEVGHGYMDRPCLNPAD
              100       110       120       130       140       150

             310       320       330       340       350       360 
pF1KE0 PDCPATAPNKNSTKPLDMALVLNGGCHGLSRKYMHWQEELIVGGTVKNSTGKLVSAHALQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 PDCPATAPNKNSTKPLDMALVLNGGCHGLSRKYMHWQEELIVGGTVKNSTGKLVSAHALQ
              160       170       180       190       200       210

             370       380       390       400       410       420 
pF1KE0 TMFQLMTPKQMYEHFKGYEYVSHINWNEDKAAAILEAWQRTYVEVVHQSVAQNSTQKVLS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 TMFQLMTPKQMYEHFKGYEYVSHINWNEDKAAAILEAWQRTYVEVVHQSVAQNSTQKVLS
              220       230       240       250       260       270

             430       440       450       460       470       480 
pF1KE0 FTTTTLDDILKSFSDVSVIRVASGYLLMLAYACLTMLRWDCSKSQGAVGLAGVLLVALSV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 FTTTTLDDILKSFSDVSVIRVASGYLLMLAYACLTMLRWDCSKSQGAVGLAGVLLVALSV
              280       290       300       310       320       330

             490       500       510       520       530       540 
pF1KE0 AAGLGLCSLIGISFNAATTQVLPFLALGVGVDDVFLLAHAFSETGQNKRIPFEDRTGECL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 AAGLGLCSLIGISFNAATTQVLPFLALGVGVDDVFLLAHAFSETGQNKRIPFEDRTGECL
              340       350       360       370       380       390

             550       560       570       580       590       600 
pF1KE0 KRTGASVALTSISNVTAFFMAALIPIPALRAFSLQAAVVVVFNFAMVLLIFPAILSMDLY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 KRTGASVALTSISNVTAFFMAALIPIPALRAFSLQAAVVVVFNFAMVLLIFPAILSMDLY
              400       410       420       430       440       450

             610       620       630       640       650       660 
pF1KE0 RREDRRLDIFCCFTSPCVSRVIQVEPQAYTDTHDNTRYSPPPPYSSHSFAHETQITMQST
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 RREDRRLDIFCCFTSPCVSRVIQVEPQAYTDTHDNTRYSPPPPYSSHSFAHETQITMQST
              460       470       480       490       500       510

             670       680       690       700       710       720 
pF1KE0 VQLRTEYDPHTHVYYTTAEPRSEISVQPVTVTQDTLSCQSPESTSSTRDLLSQFSDSSLH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 VQLRTEYDPHTHVYYTTAEPRSEISVQPVTVTQDTLSCQSPESTSSTRDLLSQFSDSSLH
              520       530       540       550       560       570

             730       740       750       760       770       780 
pF1KE0 CLEPPCTKWTLSSFAEKHYAPFLLKPKAKVVVIFLFLGLLGVSLYGTTRVRDGLDLTDIV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 CLEPPCTKWTLSSFAEKHYAPFLLKPKAKVVVIFLFLGLLGVSLYGTTRVRDGLDLTDIV
              580       590       600       610       620       630

             790       800       810       820       830       840 
pF1KE0 PRETREYDFIAAQFKYFSFYNMYIVTQKADYPNIQHLLYDLHRSFSNVKYVMLEENKQLP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 PRETREYDFIAAQFKYFSFYNMYIVTQKADYPNIQHLLYDLHRSFSNVKYVMLEENKQLP
              640       650       660       670       680       690

             850       860       870       880       890       900 
pF1KE0 KMWLHYFRDWLQGLQDAFDSDWETGKIMPNNYKNGSDDGVLAYKLLVQTGSRDKPIDISQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 KMWLHYFRDWLQGLQDAFDSDWETGKIMPNNYKNGSDDGVLAYKLLVQTGSRDKPIDISQ
              700       710       720       730       740       750

             910       920       930       940       950       960 
pF1KE0 LTKQRLVDADGIINPSAFYIYLTAWVSNDPVAYAASQANIRPHRPEWVHDKADYMPETRL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LTKQRLVDADGIINPSAFYIYLTAWVSNDPVAYAASQANIRPHRPEWVHDKADYMPETRL
              760       770       780       790       800       810

             970       980       990      1000      1010      1020 
pF1KE0 RIPAAEPIEYAQFPFYLNGLRDTSDFVEAIEKVRTICSNYTSLGLSSYPNGYPFLFWEQY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 RIPAAEPIEYAQFPFYLNGLRDTSDFVEAIEKVRTICSNYTSLGLSSYPNGYPFLFWEQY
              820       830       840       850       860       870

            1030      1040      1050      1060      1070      1080 
pF1KE0 IGLRHWLLLFISVVLACTFLVCAVFLLNPWTAGIIVMVLALMTVELFGMMGLIGIKLSAV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 IGLRHWLLLFISVVLACTFLVCAVFLLNPWTAGIIVMVLALMTVELFGMMGLIGIKLSAV
              880       890       900       910       920       930

            1090      1100      1110      1120      1130      1140 
pF1KE0 PVVILIASVGIGVEFTVHVALAFLTAIGDKNRRAVLALEHMFAPVLDGAVSTLLGVLMLA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 PVVILIASVGIGVEFTVHVALAFLTAIGDKNRRAVLALEHMFAPVLDGAVSTLLGVLMLA
              940       950       960       970       980       990

            1150      1160      1170      1180      1190      1200 
pF1KE0 GSEFDFIVRYFFAVLAILTILGVLNGLVLLPVLLSFFGPYPEVSPANGLNRLPTPSPEPP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 GSEFDFIVRYFFAVLAILTILGVLNGLVLLPVLLSFFGPYPEVSPANGLNRLPTPSPEPP
             1000      1010      1020      1030      1040      1050

            1210      1220      1230      1240      1250      1260 
pF1KE0 PSVVRFAMPPGHTHSGSDSSDSEYSSQTTVSGLSEELRHYEAQQGAGGPAHQVIVEATEN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 PSVVRFAMPPGHTHSGSDSSDSEYSSQTTVSGLSEELRHYEAQQGAGGPAHQVIVEATEN
             1060      1070      1080      1090      1100      1110

            1270      1280      1290      1300      1310      1320 
pF1KE0 PVFAHSTVVHPESRHHPPSNPRQQPHLDSGSLPPGRQGQQPRRDPPREGLWPPPYRPRRD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 PVFAHSTVVHPESRHHPPSNPRQQPHLDSGSLPPGRQGQQPRRDPPREGLWPPPYRPRRD
             1120      1130      1140      1150      1160      1170

            1330      1340      1350      1360      1370      1380 
pF1KE0 AFEISTEGHSGPSNRARWGPRGARSHNPRNPASTAMGSSVPGYCQPITTVTASASVTVAV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 AFEISTEGHSGPSNRARWGPRGARSHNPRNPASTAMGSSVPGYCQPITTVTASASVTVAV
             1180      1190      1200      1210      1220      1230

            1390      1400      1410      1420      1430      1440 
pF1KE0 HPPPVPGPGRNPRGGLCPGYPETDHGLFEDPHVPFHVRCERRDSKVEVIELQDVECEERP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 HPPPVPGPGRNPRGGLCPGYPETDHGLFEDPHVPFHVRCERRDSKVEVIELQDVECEERP
             1240      1250      1260      1270      1280      1290

             
pF1KE0 RGSSSN
       ::::::
CCDS43 RGSSSN
             

>>CCDS53312.1 PTCH2 gene_id:8643|Hs108|chr1               (1146 aa)
 initn: 3584 init1: 1216 opt: 2010  Z-score: 1325.6  bits: 257.5 E(32554): 1.6e-67
Smith-Waterman score: 4355; 56.3% identity (81.9% similar) in 1158 aa overlap (53-1203:12-1135)

             30        40        50         60        70        80 
pF1KE0 APGRPAGGGRRRRTGGLRRAAAPDRDYLHRPSYCDAA-FALEQISKGKATGRKAPLWLRA
                                     :::   :  :  ::  :.    ::::::::
CCDS53                    MTRSPPLRELPPSYTPPARTAAPQILAGSL---KAPLWLRA
                                  10        20        30           

              90       100       110       120       130       140 
pF1KE0 KFQRLLFKLGCYIQKNCGKFLVVGLLIFGAFAVGLKAANLETNVEELWVEVGGRVSRELN
        :: :::.::: ::..::: : .::: :::.:.::. : .:::.:.::::::.:::.::.
CCDS53 YFQGLLFSLGCGIQRHCGKVLFLGLLAFGALALGLRMAIIETNLEQLWVEVGSRVSQELH
       40        50        60        70        80        90        

             150       160       170       180       190       200 
pF1KE0 YTRQKIGEEAMFNPQLMIQTPKEEGANVLTTEALLQHLDSALQASRVHVYMYNRQWKLEH
       ::..:.:::: .. :..::: ..:: :.:: :::  ::..:: ::.:.: .:...: :..
CCDS53 YTKEKLGEEAAYTSQMLIQTARQEGENILTPEALGLHLQAALTASKVQVSLYGKSWDLNK
      100       110       120       130       140       150        

             210       220       230       240       250       260 
pF1KE0 LCYKSGELITETGYMDQIIEYLYPCLIITPLDCFWEGAKLQSGTAYLLGKPPLRWTNFDP
       .:::::  . :.:.....:: :.::.:.:::::::::::::.:.::: :.: ..:::.::
CCDS53 ICYKSGVPLIENGMIERMIEKLFPCVILTPLDCFWEGAKLQGGSAYLPGRPDIQWTNLDP
      160       170       180       190       200       210        

             270       280       290       300       310       320 
pF1KE0 LEFLEELKKINYQVDSWEEMLNKAEVGHGYMDRPCLNPADPDCPATAPNKNSTKPLDMAL
        ..::::  .  ......:.:.::.::..:. ::::.: :  :: .:::..: .  ..: 
CCDS53 EQLLEELGPFA-SLEGFRELLDKAQVGQAYVGRPCLHPDDLHCPPSAPNHHSRQAPNVAH
      220        230       240       250       260       270       

             330       340       350       360       370       380 
pF1KE0 VLNGGCHGLSRKYMHWQEELIVGGTVKNSTGKLVSAHALQTMFQLMTPKQMYEHFKGYEY
        :.:::::.:.:.:::::::..:: ...  :.:. :.:::. : ::.:.:.::::.: .:
CCDS53 ELSGGCHGFSHKFMHWQEELLLGGMARDPQGELLRAEALQSTFLLMSPRQLYEHFRG-DY
       280       290       300       310       320       330       

              390       400       410       420       430       440
pF1KE0 VSH-INWNEDKAAAILEAWQRTYVEVVHQSVAQNSTQKVLSFTTTTLDDILKSFSDVSVI
        .: :.:.:..:...:.:::: .:....... .:..:.. .:..:::::::..::.::. 
CCDS53 QTHDIGWSEEQASTVLQAWQRRFVQLAQEALPENASQQIHAFSSTTLDDILHAFSEVSAA
        340       350       360       370       380       390      

              450       460       470       480       490       500
pF1KE0 RVASGYLLMLAYACLTMLRWDCSKSQGAVGLAGVLLVALSVAAGLGLCSLIGISFNAATT
       ::..::::::::::.:::::::..:::.:::::::::::.::.:::::.:.::.::::::
CCDS53 RVVGGYLLMLAYACVTMLRWDCAQSQGSVGLAGVLLVALAVASGLGLCALLGITFNAATT
        400       410       420       430       440       450      

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pF1KE0 QVLPFLALGVGVDDVFLLAHAFSETGQNKRIPFEDRTGECLKRTGASVALTSISNVTAFF
       :::::::::.::::::::::::.:.  .   :...: ::::.:::.::.::::.:..::.
CCDS53 QVLPFLALGIGVDDVFLLAHAFTEALPG--TPLQERMGECLQRTGTSVVLTSINNMAAFL
        460       470       480         490       500       510    

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pF1KE0 MAALIPIPALRAFSLQAAVVVVFNFAMVLLIFPAILSMDLYRREDRRLDIFCCFTSPCVS
       ::::.:::::::::::::.::  .:. :.:.::::::.:: ::. .:::..:::.::: .
CCDS53 MAALVPIPALRAFSLQAAIVVGCTFVAVMLVFPAILSLDLRRRHCQRLDVLCCFSSPCSA
          520       530       540       550       560       570    

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pF1KE0 RVIQVEPQAYTDTHDNTRYSPPPPYSSHSFAHETQITMQSTVQLRTEYDPHTHVYYTTAE
       .:::. ::   .  :.:      : .   .:: :     .:::  :. .  ..   :   
CCDS53 QVIQILPQ---ELGDGTV-----PVG---IAHLT-----ATVQAFTHCEASSQHVVTILP
          580               590               600       610        

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pF1KE0 PRSEISVQPVTVTQDTLSCQSPESTSSTRDLLSQFSDSSLH--CLEPPCTKWTLSSFAEK
       :....   :    .: :. .     .::::::.:  ..  .  :   ::..:.:. ::. 
CCDS53 PQAHLVPPP----SDPLGSELFSPGGSTRDLLGQEEETRQKAACKSLPCARWNLAHFARY
      620           630       640       650       660       670    

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pF1KE0 HYAPFLLKPKAKVVVIFLFLGLLGVSLYGTTRVRDGLDLTDIVPRETREYDFIAAQFKYF
       ..::.::. .::..:. :: .:::.::::.: :.::: :::.::: :.:. :..::..::
CCDS53 QFAPLLLQSHAKAIVLVLFGALLGLSLYGATLVQDGLALTDVVPRGTKEHAFLSAQLRYF
          680       690       700       710       720       730    

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pF1KE0 SFYNMYIVTQKA-DYPNIQHLLYDLHRSFSNVKYVMLEENKQLPKMWLHYFRDWLQGLQD
       :.:.. .::: . :: . :. :.:::. ::..: :.     : :. ::::.:.::::.: 
CCDS53 SLYEVALVTQGGFDYAHSQRALFDLHQRFSSLKAVLPPPATQAPRTWLHYYRNWLQGIQA
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pF1KE0 AFDSDWETGKIMPNNYKNGSDDGVLAYKLLVQTGSRDKPIDISQLTKQRLVDADGIINPS
       :::.:: .:.:  ..:.:::.::.::::::.:::. ..:.:.:::: ..::: .:.: : 
CCDS53 AFDQDWASGRITRHSYRNGSEDGALAYKLLIQTGDAQEPLDFSQLTTRKLVDREGLIPPE
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pF1KE0 AFYIYLTAWVSNDPVAYAASQANIRPHRPEWVHDKADYMPETRLRIPAAEPIEYAQFPFY
        ::. ::.:::.::.. ::::::. :  :::.::: :   :. :::: :.:.:.::::: 
CCDS53 LFYMGLTVWVSSDPLGLAASQANFYPPPPEWLHDKYDTTGEN-LRIPPAQPLEFAQFPFL
          860       870       880       890        900       910   

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pF1KE0 LNGLRDTSDFVEAIEKVRTICSNYTSLGLSSYPNGYPFLFWEQYIGLRHWLLLFISVVLA
       : ::. :.::::::: .:. :..  . :. .::.: ::::::::.:::. .:: . ..:.
CCDS53 LRGLQKTADFVEAIEGARAACAEAGQAGVHAYPSGSPFLFWEQYLGLRRCFLLAVCILLV
           920       930       940       950       960       970   

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pF1KE0 CTFLVCAVFLLNPWTAGIIVMVLALMTVELFGMMGLIGIKLSAVPVVILIASVGIGVEFT
       :::::::..::::::::.::.:::.:::::::.::..::::::.:::::.::::::::::
CCDS53 CTFLVCALLLLNPWTAGLIVLVLAMMTVELFGIMGFLGIKLSAIPVVILVASVGIGVEFT
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pF1KE0 VHVALAFLTAIGDKNRRAVLALEHMFAPVLDGAVSTLLGVLMLAGSEFDFIVRYFFAVLA
       :::::.:::. :..: ::. :::: :::: :::.:::::.::::::.::::::::::.:.
CCDS53 VHVALGFLTTQGSRNLRAAHALEHTFAPVTDGAISTLLGLLMLAGSHFDFIVRYFFAALT
          1040      1050      1060      1070      1080      1090   

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pF1KE0 ILTILGVLNGLVLLPVLLSFFGPYPEVSPANGLNRLPTPSPE--PPPSVVRFAMPPGHTH
       .::.::.:.::::::::::..:: :::       ..   :::   ::.            
CCDS53 VLTLLGLLHGLVLLPVLLSILGPPPEVI------QMYKESPEILSPPAPQGGGLRPEEI 
          1100      1110      1120            1130      1140       

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pF1KE0 SGSDSSDSEYSSQTTVSGLSEELRHYEAQQGAGGPAHQVIVEATENPVFAHSTVVHPESR

>>CCDS516.1 PTCH2 gene_id:8643|Hs108|chr1                 (1203 aa)
 initn: 3662 init1: 1216 opt: 2010  Z-score: 1325.3  bits: 257.5 E(32554): 1.7e-67
Smith-Waterman score: 4357; 55.5% identity (81.0% similar) in 1187 aa overlap (53-1232:12-1159)

             30        40        50         60        70        80 
pF1KE0 APGRPAGGGRRRRTGGLRRAAAPDRDYLHRPSYCDAA-FALEQISKGKATGRKAPLWLRA
                                     :::   :  :  ::  :.    ::::::::
CCDS51                    MTRSPPLRELPPSYTPPARTAAPQILAGSL---KAPLWLRA
                                  10        20        30           

              90       100       110       120       130       140 
pF1KE0 KFQRLLFKLGCYIQKNCGKFLVVGLLIFGAFAVGLKAANLETNVEELWVEVGGRVSRELN
        :: :::.::: ::..::: : .::: :::.:.::. : .:::.:.::::::.:::.::.
CCDS51 YFQGLLFSLGCGIQRHCGKVLFLGLLAFGALALGLRMAIIETNLEQLWVEVGSRVSQELH
       40        50        60        70        80        90        

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pF1KE0 YTRQKIGEEAMFNPQLMIQTPKEEGANVLTTEALLQHLDSALQASRVHVYMYNRQWKLEH
       ::..:.:::: .. :..::: ..:: :.:: :::  ::..:: ::.:.: .:...: :..
CCDS51 YTKEKLGEEAAYTSQMLIQTARQEGENILTPEALGLHLQAALTASKVQVSLYGKSWDLNK
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pF1KE0 LCYKSGELITETGYMDQIIEYLYPCLIITPLDCFWEGAKLQSGTAYLLGKPPLRWTNFDP
       .:::::  . :.:.....:: :.::.:.:::::::::::::.:.::: :.: ..:::.::
CCDS51 ICYKSGVPLIENGMIERMIEKLFPCVILTPLDCFWEGAKLQGGSAYLPGRPDIQWTNLDP
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             270       280       290       300       310       320 
pF1KE0 LEFLEELKKINYQVDSWEEMLNKAEVGHGYMDRPCLNPADPDCPATAPNKNSTKPLDMAL
        ..::::  .  ......:.:.::.::..:. ::::.: :  :: .:::..: .  ..: 
CCDS51 EQLLEELGPFA-SLEGFRELLDKAQVGQAYVGRPCLHPDDLHCPPSAPNHHSRQAPNVAH
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             330       340       350       360       370       380 
pF1KE0 VLNGGCHGLSRKYMHWQEELIVGGTVKNSTGKLVSAHALQTMFQLMTPKQMYEHFKGYEY
        :.:::::.:.:.:::::::..:: ...  :.:. :.:::. : ::.:.:.::::.: .:
CCDS51 ELSGGCHGFSHKFMHWQEELLLGGMARDPQGELLRAEALQSTFLLMSPRQLYEHFRG-DY
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              390       400       410       420       430       440
pF1KE0 VSH-INWNEDKAAAILEAWQRTYVEVVHQSVAQNSTQKVLSFTTTTLDDILKSFSDVSVI
        .: :.:.:..:...:.:::: .:....... .:..:.. .:..:::::::..::.::. 
CCDS51 QTHDIGWSEEQASTVLQAWQRRFVQLAQEALPENASQQIHAFSSTTLDDILHAFSEVSAA
        340       350       360       370       380       390      

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pF1KE0 RVASGYLLMLAYACLTMLRWDCSKSQGAVGLAGVLLVALSVAAGLGLCSLIGISFNAATT
       ::..::::::::::.:::::::..:::.:::::::::::.::.:::::.:.::.::::::
CCDS51 RVVGGYLLMLAYACVTMLRWDCAQSQGSVGLAGVLLVALAVASGLGLCALLGITFNAATT
        400       410       420       430       440       450      

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pF1KE0 QVLPFLALGVGVDDVFLLAHAFSETGQNKRIPFEDRTGECLKRTGASVALTSISNVTAFF
       :::::::::.::::::::::::.:.  .   :...: ::::.:::.::.::::.:..::.
CCDS51 QVLPFLALGIGVDDVFLLAHAFTEALPGT--PLQERMGECLQRTGTSVVLTSINNMAAFL
        460       470       480         490       500       510    

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pF1KE0 MAALIPIPALRAFSLQAAVVVVFNFAMVLLIFPAILSMDLYRREDRRLDIFCCFTSPCVS
       ::::.:::::::::::::.::  .:. :.:.::::::.:: ::. .:::..:::.::: .
CCDS51 MAALVPIPALRAFSLQAAIVVGCTFVAVMLVFPAILSLDLRRRHCQRLDVLCCFSSPCSA
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       .:::. ::   .  :.:      : .   .:: :     .:::  :. .  ..   :   
CCDS51 QVIQILPQ---ELGDGT-----VPVG---IAHLT-----ATVQAFTHCEASSQHVVTILP
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pF1KE0 PRSEISVQPVTVTQDTLSCQSPESTSSTRDLLSQFSDSSLH--CLEPPCTKWTLSSFAEK
       :....   :    .: :. .     .::::::.:  ..  .  :   ::..:.:. ::. 
CCDS51 PQAHLVPPP----SDPLGSELFSPGGSTRDLLGQEEETRQKAACKSLPCARWNLAHFARY
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      740       750       760       770       780       790        
pF1KE0 HYAPFLLKPKAKVVVIFLFLGLLGVSLYGTTRVRDGLDLTDIVPRETREYDFIAAQFKYF
       ..::.::. .::..:. :: .:::.::::.: :.::: :::.::: :.:. :..::..::
CCDS51 QFAPLLLQSHAKAIVLVLFGALLGLSLYGATLVQDGLALTDVVPRGTKEHAFLSAQLRYF
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pF1KE0 SFYNMYIVTQKA-DYPNIQHLLYDLHRSFSNVKYVMLEENKQLPKMWLHYFRDWLQGLQD
       :.:.. .::: . :: . :. :.:::. ::..: :.     : :. ::::.:.::::.: 
CCDS51 SLYEVALVTQGGFDYAHSQRALFDLHQRFSSLKAVLPPPATQAPRTWLHYYRNWLQGIQA
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pF1KE0 AFDSDWETGKIMPNNYKNGSDDGVLAYKLLVQTGSRDKPIDISQLTKQRLVDADGIINPS
       :::.:: .:.:  ..:.:::.::.::::::.:::. ..:.:.:::: ..::: .:.: : 
CCDS51 AFDQDWASGRITRHSYRNGSEDGALAYKLLIQTGDAQEPLDFSQLTTRKLVDREGLIPPE
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pF1KE0 AFYIYLTAWVSNDPVAYAASQANIRPHRPEWVHDKADYMPETRLRIPAAEPIEYAQFPFY
        ::. ::.:::.::.. ::::::. :  :::.::: :   :. :::: :.:.:.::::: 
CCDS51 LFYMGLTVWVSSDPLGLAASQANFYPPPPEWLHDKYDTTGEN-LRIPPAQPLEFAQFPFL
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pF1KE0 LNGLRDTSDFVEAIEKVRTICSNYTSLGLSSYPNGYPFLFWEQYIGLRHWLLLFISVVLA
       : ::. :.::::::: .:. :..  . :. .::.: ::::::::.:::. .:: . ..:.
CCDS51 LRGLQKTADFVEAIEGARAACAEAGQAGVHAYPSGSPFLFWEQYLGLRRCFLLAVCILLV
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       :::::::..::::::::.::.:::.:::::::.::..::::::.:::::.::::::::::
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       :::::.:::. :..: ::. :::: :::: :::.:::::.::::::.::::::::::.:.
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       .::.::.:.::::::::::..:: :::       ..   :::   ::     :   :  .
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