Result of FASTA (omim) for pF1KE0053
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE0053, 1568 aa
  1>>>pF1KE0053 1568 - 1568 aa - 1568 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.2315+/-0.000394; mu= 19.5789+/- 0.025
 mean_var=90.0119+/-18.342, 0's: 0 Z-trim(113.9): 133  B-trim: 36 in 1/51
 Lambda= 0.135184
 statistics sampled from 23257 (23397) to 23257 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.602), E-opt: 0.2 (0.274), width:  16
 Scan time: 17.040

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_005752 (OMIM: 604259) plexin-C1 precursor [Homo (1568) 10446 2048.4       0
XP_016874161 (OMIM: 604259) PREDICTED: plexin-C1 i (1315) 8738 1715.3       0
XP_016874160 (OMIM: 604259) PREDICTED: plexin-C1 i (1323) 8639 1696.0       0
XP_011536032 (OMIM: 604259) PREDICTED: plexin-C1 i (1322) 8632 1694.6       0
XP_006719249 (OMIM: 604259) PREDICTED: plexin-C1 i (1555) 6930 1362.7       0
XP_011536033 (OMIM: 604259) PREDICTED: plexin-C1 i (1036) 6926 1361.8       0
NP_055918 (OMIM: 604282) plexin-D1 precursor [Homo (1925) 1567 316.8 1.1e-84
XP_011510894 (OMIM: 604282) PREDICTED: plexin-D1 i ( 981) 1561 315.5 1.4e-84
XP_011510891 (OMIM: 604282) PREDICTED: plexin-D1 i (1795) 1561 315.6 2.3e-84
XP_011510890 (OMIM: 604282) PREDICTED: plexin-D1 i (1894) 1543 312.1 2.8e-83
XP_016884192 (OMIM: 604293) PREDICTED: plexin-B2 i (1838) 1126 230.8 8.1e-59
NP_036533 (OMIM: 604293) plexin-B2 precursor [Homo (1838) 1126 230.8 8.1e-59
XP_005261968 (OMIM: 604293) PREDICTED: plexin-B2 i (1838) 1126 230.8 8.1e-59
XP_006724476 (OMIM: 604293) PREDICTED: plexin-B2 i (1838) 1126 230.8 8.1e-59
XP_016884193 (OMIM: 604293) PREDICTED: plexin-B2 i (1838) 1126 230.8 8.1e-59
XP_005261967 (OMIM: 604293) PREDICTED: plexin-B2 i (1838) 1126 230.8 8.1e-59
XP_005261966 (OMIM: 604293) PREDICTED: plexin-B2 i (1838) 1126 230.8 8.1e-59
XP_011528984 (OMIM: 604293) PREDICTED: plexin-B2 i (1901) 1126 230.8 8.4e-59
NP_115618 (OMIM: 601055) plexin-A1 precursor [Homo (1896)  739 155.3 4.4e-36
XP_011511210 (OMIM: 601055) PREDICTED: plexin-A1 i (1914)  739 155.3 4.4e-36
XP_011511211 (OMIM: 601055) PREDICTED: plexin-A1 i (1914)  739 155.3 4.4e-36
NP_079455 (OMIM: 601054) plexin-A2 precursor [Homo (1894)  733 154.2 9.9e-36
XP_016868268 (OMIM: 604280) PREDICTED: plexin-A4 i (1827)  729 153.4 1.6e-35
XP_005250743 (OMIM: 604280) PREDICTED: plexin-A4 i (1894)  729 153.4 1.7e-35
XP_006716234 (OMIM: 604280) PREDICTED: plexin-A4 i (1894)  729 153.4 1.7e-35
NP_065962 (OMIM: 604280) plexin-A4 isoform 1 precu (1894)  729 153.4 1.7e-35
XP_005273222 (OMIM: 601054) PREDICTED: plexin-A2 i (1823)  711 149.9 1.9e-34
XP_011529485 (OMIM: 300022) PREDICTED: plexin-A3 i (1684)  709 149.5 2.3e-34
XP_005274763 (OMIM: 300022) PREDICTED: plexin-A3 i (1789)  709 149.5 2.4e-34
XP_006724892 (OMIM: 300022) PREDICTED: plexin-A3 i (1841)  709 149.5 2.5e-34
XP_005274762 (OMIM: 300022) PREDICTED: plexin-A3 i (1853)  709 149.5 2.5e-34
NP_059984 (OMIM: 300022) plexin-A3 precursor [Homo (1871)  709 149.5 2.5e-34
NP_001123554 (OMIM: 601053) plexin-B1 precursor [H (2135)  696 147.0 1.6e-33
XP_016862120 (OMIM: 601053) PREDICTED: plexin-B1 i (2135)  696 147.0 1.6e-33
NP_002664 (OMIM: 601053) plexin-B1 precursor [Homo (2135)  696 147.0 1.6e-33
XP_011532137 (OMIM: 601053) PREDICTED: plexin-B1 i (2136)  696 147.0 1.6e-33
XP_016862119 (OMIM: 601053) PREDICTED: plexin-B1 i (2136)  696 147.0 1.6e-33
XP_011532136 (OMIM: 601053) PREDICTED: plexin-B1 i (2136)  696 147.0 1.6e-33
XP_011532135 (OMIM: 601053) PREDICTED: plexin-B1 i (2136)  696 147.0 1.6e-33
XP_011532138 (OMIM: 601053) PREDICTED: plexin-B1 i (2136)  696 147.0 1.6e-33
XP_011532139 (OMIM: 601053) PREDICTED: plexin-B1 i (2136)  696 147.0 1.6e-33
XP_005273221 (OMIM: 601054) PREDICTED: plexin-A2 i (1974)  672 142.3 3.9e-32
NP_005384 (OMIM: 300214) plexin-B3 isoform 1 precu (1909)  593 126.9 1.6e-27
NP_001156729 (OMIM: 300214) plexin-B3 isoform 2 [H (1932)  593 126.9 1.7e-27
XP_011510892 (OMIM: 604282) PREDICTED: plexin-D1 i (1467)  404 89.9 1.6e-16
XP_011514978 (OMIM: 604280) PREDICTED: plexin-A4 i (1437)  230 56.0 2.7e-06
NP_001310962 (OMIM: 617029) semaphorin-4B isoform  ( 681)  222 54.3 4.2e-06
NP_001310959 (OMIM: 617029) semaphorin-4B isoform  ( 681)  222 54.3 4.2e-06
NP_001310958 (OMIM: 617029) semaphorin-4B isoform  ( 699)  222 54.3 4.3e-06
NP_064595 (OMIM: 617029) semaphorin-4B isoform 1 p ( 837)  222 54.3   5e-06


>>NP_005752 (OMIM: 604259) plexin-C1 precursor [Homo sap  (1568 aa)
 initn: 10446 init1: 10446 opt: 10446  Z-score: 11001.4  bits: 2048.4 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 10446; 100.0% identity (100.0% similar) in 1568 aa overlap (1-1568:1-1568)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MEVSRRKAPPRPPRPAAPLPLLAYLLALAAPGRGADEPVWRSEQAIGAIAASQEDGVFVA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 MEVSRRKAPPRPPRPAAPLPLLAYLLALAAPGRGADEPVWRSEQAIGAIAASQEDGVFVA
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE0 SGSCLDQLDYSLEHSLSRLYRDQAGNCTEPVSLAPPARPRPGSSFSKLLLPYREGAAGLG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 SGSCLDQLDYSLEHSLSRLYRDQAGNCTEPVSLAPPARPRPGSSFSKLLLPYREGAAGLG
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE0 GLLLTGWTFDRGACEVRPLGNLSRNSLRNGTEVVSCHPQGSTAGVVYRAGRNNRWYLAVA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 GLLLTGWTFDRGACEVRPLGNLSRNSLRNGTEVVSCHPQGSTAGVVYRAGRNNRWYLAVA
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE0 ATYVLPEPETASRCNPAASDHDTAIALKDTEGRSLATQELGRLKLCEGAGSLHFVDAFLW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 ATYVLPEPETASRCNPAASDHDTAIALKDTEGRSLATQELGRLKLCEGAGSLHFVDAFLW
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE0 NGSIYFPYYPYNYTSGAATGWPSMARIAQSTEVLFQGQASLDCGHGHPDGRRLLLSSSLV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 NGSIYFPYYPYNYTSGAATGWPSMARIAQSTEVLFQGQASLDCGHGHPDGRRLLLSSSLV
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE0 EALDVWAGVFSAAAGEGQERRSPTTTALCLFRMSEIQARAKRVSWDFKTAESHCKEGDQP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 EALDVWAGVFSAAAGEGQERRSPTTTALCLFRMSEIQARAKRVSWDFKTAESHCKEGDQP
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE0 ERVQPIASSTLIHSDLTSVYGTVVMNRTVLFLGTGDGQLLKVILGENLTSNCPEVIYEIK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 ERVQPIASSTLIHSDLTSVYGTVVMNRTVLFLGTGDGQLLKVILGENLTSNCPEVIYEIK
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE0 EETPVFYKLVPDPVKNIYIYLTAGKEVRRIRVANCNKHKSCSECLTATDPHCGWCHSLQR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 EETPVFYKLVPDPVKNIYIYLTAGKEVRRIRVANCNKHKSCSECLTATDPHCGWCHSLQR
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE0 CTFQGDCVHSENLENWLDISSGAKKCPKIQIIRSSKEKTTVTMVGSFSPRHSKCMVKNVD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 CTFQGDCVHSENLENWLDISSGAKKCPKIQIIRSSKEKTTVTMVGSFSPRHSKCMVKNVD
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE0 SSRELCQNKSQPNRTCTCSIPTRATYKDVSVVNVMFSFGSWNLSDRFNFTNCSSLKECPA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 SSRELCQNKSQPNRTCTCSIPTRATYKDVSVVNVMFSFGSWNLSDRFNFTNCSSLKECPA
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KE0 CVETGCAWCKSARRCIHPFTACDPSDYERNQEQCPVAVEKTSGGGRPKENKGNRTNQALQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 CVETGCAWCKSARRCIHPFTACDPSDYERNQEQCPVAVEKTSGGGRPKENKGNRTNQALQ
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KE0 VFYIKSIEPQKVSTLGKSNVIVTGANFTRASNITMILKGTSTCDKDVIQVSHVLNDTHMK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 VFYIKSIEPQKVSTLGKSNVIVTGANFTRASNITMILKGTSTCDKDVIQVSHVLNDTHMK
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KE0 FSLPSSRKEMKDVCIQFDGGNCSSVGSLSYIALPHCSLIFPATTWISGGQNITMMGRNFD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 FSLPSSRKEMKDVCIQFDGGNCSSVGSLSYIALPHCSLIFPATTWISGGQNITMMGRNFD
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KE0 VIDNLIISHELKGNINVSEYCVATYCGFLAPSLKSSKVRTNVTVKLRVQDTYLDCGTLQY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 VIDNLIISHELKGNINVSEYCVATYCGFLAPSLKSSKVRTNVTVKLRVQDTYLDCGTLQY
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KE0 REDPRFTGYRVESEVDTELEVKIQKENDNFNISKKDIEITLFHGENGQLNCSFENITRNQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 REDPRFTGYRVESEVDTELEVKIQKENDNFNISKKDIEITLFHGENGQLNCSFENITRNQ
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KE0 DLTTILCKIKGIKTASTIANSSKKVRVKLGNLELYVEQESVPSTWYFLIVLPVLLVIVIF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 DLTTILCKIKGIKTASTIANSSKKVRVKLGNLELYVEQESVPSTWYFLIVLPVLLVIVIF
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KE0 AAVGVTRHKSKELSRKQSQQLELLESELRKEIRDGFAELQMDKLDVVDSFGTVPFLDYKH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 AAVGVTRHKSKELSRKQSQQLELLESELRKEIRDGFAELQMDKLDVVDSFGTVPFLDYKH
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KE0 FALRTFFPESGGFTHIFTEDMHNRDANDKNESLTALDALICNKSFLVTVIHTLEKQKNFS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 FALRTFFPESGGFTHIFTEDMHNRDANDKNESLTALDALICNKSFLVTVIHTLEKQKNFS
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KE0 VKDRCLFASFLTIALQTKLVYLTSILEVLTRDLMEQCSNMQPKLMLRRTESVVEKLLTNW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 VKDRCLFASFLTIALQTKLVYLTSILEVLTRDLMEQCSNMQPKLMLRRTESVVEKLLTNW
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KE0 MSVCLSGFLRETVGEPFYLLVTTLNQKINKGPVDVITCKALYTLNEDWLLWQVPEFSTVA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 MSVCLSGFLRETVGEPFYLLVTTLNQKINKGPVDVITCKALYTLNEDWLLWQVPEFSTVA
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KE0 LNVVFEKIPENESADVCRNISVNVLDCDTIGQAKEKIFQAFLSKNGSPYGLQLNEIGLEL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 LNVVFEKIPENESADVCRNISVNVLDCDTIGQAKEKIFQAFLSKNGSPYGLQLNEIGLEL
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

             1270      1280      1290      1300      1310      1320
pF1KE0 QMGTRQKELLDIDSSSVILEDGITKLNTIGHYEISNGSTIKVFKKIANFTSDVEYSDDHC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 QMGTRQKELLDIDSSSVILEDGITKLNTIGHYEISNGSTIKVFKKIANFTSDVEYSDDHC
             1270      1280      1290      1300      1310      1320

             1330      1340      1350      1360      1370      1380
pF1KE0 HLILPDSEAFQDVQGKRHRGKHKFKVKEMYLTKLLSTKVAIHSVLEKLFRSIWSLPNSRA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 HLILPDSEAFQDVQGKRHRGKHKFKVKEMYLTKLLSTKVAIHSVLEKLFRSIWSLPNSRA
             1330      1340      1350      1360      1370      1380

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pF1KE0 PFAIKYFFDFLDAQAENKKITDPDVVHIWKTNSLPLRFWVNILKNPQFVFDIKKTPHIDG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 PFAIKYFFDFLDAQAENKKITDPDVVHIWKTNSLPLRFWVNILKNPQFVFDIKKTPHIDG
             1390      1400      1410      1420      1430      1440

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pF1KE0 CLSVIAQAFMDAFSLTEQQLGKEAPTNKLLYAKDIPTYKEEVKSYYKAIRDLPPLSSSEM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 CLSVIAQAFMDAFSLTEQQLGKEAPTNKLLYAKDIPTYKEEVKSYYKAIRDLPPLSSSEM
             1450      1460      1470      1480      1490      1500

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pF1KE0 EEFLTQESKKHENEFNEEVALTEIYKYIVKYFDEILNKLERERGLEEAQKQLLHVKVLFD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 EEFLTQESKKHENEFNEEVALTEIYKYIVKYFDEILNKLERERGLEEAQKQLLHVKVLFD
             1510      1520      1530      1540      1550      1560

               
pF1KE0 EKKKCKWM
       ::::::::
NP_005 EKKKCKWM
               

>>XP_016874161 (OMIM: 604259) PREDICTED: plexin-C1 isofo  (1315 aa)
 initn: 8738 init1: 8738 opt: 8738  Z-score: 9202.3  bits: 1715.3 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 8738; 100.0% identity (100.0% similar) in 1311 aa overlap (1-1311:1-1311)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MEVSRRKAPPRPPRPAAPLPLLAYLLALAAPGRGADEPVWRSEQAIGAIAASQEDGVFVA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MEVSRRKAPPRPPRPAAPLPLLAYLLALAAPGRGADEPVWRSEQAIGAIAASQEDGVFVA
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE0 SGSCLDQLDYSLEHSLSRLYRDQAGNCTEPVSLAPPARPRPGSSFSKLLLPYREGAAGLG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SGSCLDQLDYSLEHSLSRLYRDQAGNCTEPVSLAPPARPRPGSSFSKLLLPYREGAAGLG
               70        80        90       100       110       120

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pF1KE0 GLLLTGWTFDRGACEVRPLGNLSRNSLRNGTEVVSCHPQGSTAGVVYRAGRNNRWYLAVA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GLLLTGWTFDRGACEVRPLGNLSRNSLRNGTEVVSCHPQGSTAGVVYRAGRNNRWYLAVA
              130       140       150       160       170       180

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pF1KE0 ATYVLPEPETASRCNPAASDHDTAIALKDTEGRSLATQELGRLKLCEGAGSLHFVDAFLW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ATYVLPEPETASRCNPAASDHDTAIALKDTEGRSLATQELGRLKLCEGAGSLHFVDAFLW
              190       200       210       220       230       240

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pF1KE0 NGSIYFPYYPYNYTSGAATGWPSMARIAQSTEVLFQGQASLDCGHGHPDGRRLLLSSSLV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 NGSIYFPYYPYNYTSGAATGWPSMARIAQSTEVLFQGQASLDCGHGHPDGRRLLLSSSLV
              250       260       270       280       290       300

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pF1KE0 EALDVWAGVFSAAAGEGQERRSPTTTALCLFRMSEIQARAKRVSWDFKTAESHCKEGDQP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EALDVWAGVFSAAAGEGQERRSPTTTALCLFRMSEIQARAKRVSWDFKTAESHCKEGDQP
              310       320       330       340       350       360

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pF1KE0 ERVQPIASSTLIHSDLTSVYGTVVMNRTVLFLGTGDGQLLKVILGENLTSNCPEVIYEIK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ERVQPIASSTLIHSDLTSVYGTVVMNRTVLFLGTGDGQLLKVILGENLTSNCPEVIYEIK
              370       380       390       400       410       420

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pF1KE0 EETPVFYKLVPDPVKNIYIYLTAGKEVRRIRVANCNKHKSCSECLTATDPHCGWCHSLQR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EETPVFYKLVPDPVKNIYIYLTAGKEVRRIRVANCNKHKSCSECLTATDPHCGWCHSLQR
              430       440       450       460       470       480

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pF1KE0 CTFQGDCVHSENLENWLDISSGAKKCPKIQIIRSSKEKTTVTMVGSFSPRHSKCMVKNVD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 CTFQGDCVHSENLENWLDISSGAKKCPKIQIIRSSKEKTTVTMVGSFSPRHSKCMVKNVD
              490       500       510       520       530       540

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pF1KE0 SSRELCQNKSQPNRTCTCSIPTRATYKDVSVVNVMFSFGSWNLSDRFNFTNCSSLKECPA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SSRELCQNKSQPNRTCTCSIPTRATYKDVSVVNVMFSFGSWNLSDRFNFTNCSSLKECPA
              550       560       570       580       590       600

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pF1KE0 CVETGCAWCKSARRCIHPFTACDPSDYERNQEQCPVAVEKTSGGGRPKENKGNRTNQALQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 CVETGCAWCKSARRCIHPFTACDPSDYERNQEQCPVAVEKTSGGGRPKENKGNRTNQALQ
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pF1KE0 VFYIKSIEPQKVSTLGKSNVIVTGANFTRASNITMILKGTSTCDKDVIQVSHVLNDTHMK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VFYIKSIEPQKVSTLGKSNVIVTGANFTRASNITMILKGTSTCDKDVIQVSHVLNDTHMK
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pF1KE0 FSLPSSRKEMKDVCIQFDGGNCSSVGSLSYIALPHCSLIFPATTWISGGQNITMMGRNFD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 FSLPSSRKEMKDVCIQFDGGNCSSVGSLSYIALPHCSLIFPATTWISGGQNITMMGRNFD
              730       740       750       760       770       780

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pF1KE0 VIDNLIISHELKGNINVSEYCVATYCGFLAPSLKSSKVRTNVTVKLRVQDTYLDCGTLQY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VIDNLIISHELKGNINVSEYCVATYCGFLAPSLKSSKVRTNVTVKLRVQDTYLDCGTLQY
              790       800       810       820       830       840

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pF1KE0 REDPRFTGYRVESEVDTELEVKIQKENDNFNISKKDIEITLFHGENGQLNCSFENITRNQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 REDPRFTGYRVESEVDTELEVKIQKENDNFNISKKDIEITLFHGENGQLNCSFENITRNQ
              850       860       870       880       890       900

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pF1KE0 DLTTILCKIKGIKTASTIANSSKKVRVKLGNLELYVEQESVPSTWYFLIVLPVLLVIVIF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DLTTILCKIKGIKTASTIANSSKKVRVKLGNLELYVEQESVPSTWYFLIVLPVLLVIVIF
              910       920       930       940       950       960

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pF1KE0 AAVGVTRHKSKELSRKQSQQLELLESELRKEIRDGFAELQMDKLDVVDSFGTVPFLDYKH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 AAVGVTRHKSKELSRKQSQQLELLESELRKEIRDGFAELQMDKLDVVDSFGTVPFLDYKH
              970       980       990      1000      1010      1020

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pF1KE0 FALRTFFPESGGFTHIFTEDMHNRDANDKNESLTALDALICNKSFLVTVIHTLEKQKNFS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 FALRTFFPESGGFTHIFTEDMHNRDANDKNESLTALDALICNKSFLVTVIHTLEKQKNFS
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

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pF1KE0 VKDRCLFASFLTIALQTKLVYLTSILEVLTRDLMEQCSNMQPKLMLRRTESVVEKLLTNW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VKDRCLFASFLTIALQTKLVYLTSILEVLTRDLMEQCSNMQPKLMLRRTESVVEKLLTNW
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

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pF1KE0 MSVCLSGFLRETVGEPFYLLVTTLNQKINKGPVDVITCKALYTLNEDWLLWQVPEFSTVA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MSVCLSGFLRETVGEPFYLLVTTLNQKINKGPVDVITCKALYTLNEDWLLWQVPEFSTVA
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

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pF1KE0 LNVVFEKIPENESADVCRNISVNVLDCDTIGQAKEKIFQAFLSKNGSPYGLQLNEIGLEL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LNVVFEKIPENESADVCRNISVNVLDCDTIGQAKEKIFQAFLSKNGSPYGLQLNEIGLEL
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

             1270      1280      1290      1300      1310      1320
pF1KE0 QMGTRQKELLDIDSSSVILEDGITKLNTIGHYEISNGSTIKVFKKIANFTSDVEYSDDHC
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::         
XP_016 QMGTRQKELLDIDSSSVILEDGITKLNTIGHYEISNGSTIKVFKKIANFTSVLRM     
             1270      1280      1290      1300      1310          

             1330      1340      1350      1360      1370      1380
pF1KE0 HLILPDSEAFQDVQGKRHRGKHKFKVKEMYLTKLLSTKVAIHSVLEKLFRSIWSLPNSRA

>>XP_016874160 (OMIM: 604259) PREDICTED: plexin-C1 isofo  (1323 aa)
 initn: 8736 init1: 8634 opt: 8639  Z-score: 9097.9  bits: 1696.0 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 8639; 99.2% identity (99.5% similar) in 1305 aa overlap (1-1305:1-1305)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MEVSRRKAPPRPPRPAAPLPLLAYLLALAAPGRGADEPVWRSEQAIGAIAASQEDGVFVA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MEVSRRKAPPRPPRPAAPLPLLAYLLALAAPGRGADEPVWRSEQAIGAIAASQEDGVFVA
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE0 SGSCLDQLDYSLEHSLSRLYRDQAGNCTEPVSLAPPARPRPGSSFSKLLLPYREGAAGLG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SGSCLDQLDYSLEHSLSRLYRDQAGNCTEPVSLAPPARPRPGSSFSKLLLPYREGAAGLG
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE0 GLLLTGWTFDRGACEVRPLGNLSRNSLRNGTEVVSCHPQGSTAGVVYRAGRNNRWYLAVA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GLLLTGWTFDRGACEVRPLGNLSRNSLRNGTEVVSCHPQGSTAGVVYRAGRNNRWYLAVA
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE0 ATYVLPEPETASRCNPAASDHDTAIALKDTEGRSLATQELGRLKLCEGAGSLHFVDAFLW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ATYVLPEPETASRCNPAASDHDTAIALKDTEGRSLATQELGRLKLCEGAGSLHFVDAFLW
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE0 NGSIYFPYYPYNYTSGAATGWPSMARIAQSTEVLFQGQASLDCGHGHPDGRRLLLSSSLV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 NGSIYFPYYPYNYTSGAATGWPSMARIAQSTEVLFQGQASLDCGHGHPDGRRLLLSSSLV
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE0 EALDVWAGVFSAAAGEGQERRSPTTTALCLFRMSEIQARAKRVSWDFKTAESHCKEGDQP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EALDVWAGVFSAAAGEGQERRSPTTTALCLFRMSEIQARAKRVSWDFKTAESHCKEGDQP
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE0 ERVQPIASSTLIHSDLTSVYGTVVMNRTVLFLGTGDGQLLKVILGENLTSNCPEVIYEIK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ERVQPIASSTLIHSDLTSVYGTVVMNRTVLFLGTGDGQLLKVILGENLTSNCPEVIYEIK
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE0 EETPVFYKLVPDPVKNIYIYLTAGKEVRRIRVANCNKHKSCSECLTATDPHCGWCHSLQR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EETPVFYKLVPDPVKNIYIYLTAGKEVRRIRVANCNKHKSCSECLTATDPHCGWCHSLQR
              430       440       450       460       470       480

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pF1KE0 CTFQGDCVHSENLENWLDISSGAKKCPKIQIIRSSKEKTTVTMVGSFSPRHSKCMVKNVD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 CTFQGDCVHSENLENWLDISSGAKKCPKIQIIRSSKEKTTVTMVGSFSPRHSKCMVKNVD
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pF1KE0 SSRELCQNKSQPNRTCTCSIPTRATYKDVSVVNVMFSFGSWNLSDRFNFTNCSSLKECPA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SSRELCQNKSQPNRTCTCSIPTRATYKDVSVVNVMFSFGSWNLSDRFNFTNCSSLKECPA
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pF1KE0 CVETGCAWCKSARRCIHPFTACDPSDYERNQEQCPVAVEKTSGGGRPKENKGNRTNQALQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 CVETGCAWCKSARRCIHPFTACDPSDYERNQEQCPVAVEKTSGGGRPKENKGNRTNQALQ
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pF1KE0 VFYIKSIEPQKVSTLGKSNVIVTGANFTRASNITMILKGTSTCDKDVIQVSHVLNDTHMK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VFYIKSIEPQKVSTLGKSNVIVTGANFTRASNITMILKGTSTCDKDVIQVSHVLNDTHMK
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pF1KE0 FSLPSSRKEMKDVCIQFDGGNCSSVGSLSYIALPHCSLIFPATTWISGGQNITMMGRNFD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 FSLPSSRKEMKDVCIQFDGGNCSSVGSLSYIALPHCSLIFPATTWISGGQNITMMGRNFD
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pF1KE0 VIDNLIISHELKGNINVSEYCVATYCGFLAPSLKSSKVRTNVTVKLRVQDTYLDCGTLQY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VIDNLIISHELKGNINVSEYCVATYCGFLAPSLKSSKVRTNVTVKLRVQDTYLDCGTLQY
              790       800       810       820       830       840

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pF1KE0 REDPRFTGYRVESEVDTELEVKIQKENDNFNISKKDIEITLFHGENGQLNCSFENITRNQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 REDPRFTGYRVESEVDTELEVKIQKENDNFNISKKDIEITLFHGENGQLNCSFENITRNQ
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pF1KE0 DLTTILCKIKGIKTASTIANSSKKVRVKLGNLELYVEQESVPSTWYFLIVLPVLLVIVIF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DLTTILCKIKGIKTASTIANSSKKVRVKLGNLELYVEQESVPSTWYFLIVLPVLLVIVIF
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pF1KE0 AAVGVTRHKSKELSRKQSQQLELLESELRKEIRDGFAELQMDKLDVVDSFGTVPFLDYKH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 AAVGVTRHKSKELSRKQSQQLELLESELRKEIRDGFAELQMDKLDVVDSFGTVPFLDYKH
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pF1KE0 FALRTFFPESGGFTHIFTEDMHNRDANDKNESLTALDALICNKSFLVTVIHTLEKQKNFS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 FALRTFFPESGGFTHIFTEDMHNRDANDKNESLTALDALICNKSFLVTVIHTLEKQKNFS
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

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pF1KE0 VKDRCLFASFLTIALQTKLVYLTSILEVLTRDLMEQCSNMQPKLMLRRTESVVEKLLTNW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VKDRCLFASFLTIALQTKLVYLTSILEVLTRDLMEQCSNMQPKLMLRRTESVVEKLLTNW
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             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KE0 MSVCLSGFLRETVGEPFYLLVTTLNQKINKGPVDVITCKALYTLNEDWLLWQVPEFSTVA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MSVCLSGFLRETVGEPFYLLVTTLNQKINKGPVDVITCKALYTLNEDWLLWQVPEFSTVA
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KE0 LNVVFEKIPENESADVCRNISVNVLDCDTIGQAKEKIFQAFLSKNGSPYGLQLNEIGLEL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LNVVFEKIPENESADVCRNISVNVLDCDTIGQAKEKIFQAFLSKNGSPYGLQLNEIGLEL
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

             1270      1280      1290      1300      1310      1320
pF1KE0 QMGTRQKELLDIDSSSVILEDGITKLNTIGHYEISNGSTIKVFKKIANFTSDVEYSDDHC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::: :   :.  ...               
XP_016 QMGTRQKELLDIDSSSVILEDGITKLNTIGHYEQSVKMTVTFIQRGPLSGIWALTTPTQQ
             1270      1280      1290      1300      1310      1320

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pF1KE0 HLILPDSEAFQDVQGKRHRGKHKFKVKEMYLTKLLSTKVAIHSVLEKLFRSIWSLPNSRA
                                                                   
XP_016 DHS                                                         
                                                                   

>>XP_011536032 (OMIM: 604259) PREDICTED: plexin-C1 isofo  (1322 aa)
 initn: 8632 init1: 8632 opt: 8632  Z-score: 9090.6  bits: 1694.6 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 8632; 100.0% identity (100.0% similar) in 1293 aa overlap (1-1293:1-1293)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MEVSRRKAPPRPPRPAAPLPLLAYLLALAAPGRGADEPVWRSEQAIGAIAASQEDGVFVA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MEVSRRKAPPRPPRPAAPLPLLAYLLALAAPGRGADEPVWRSEQAIGAIAASQEDGVFVA
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE0 SGSCLDQLDYSLEHSLSRLYRDQAGNCTEPVSLAPPARPRPGSSFSKLLLPYREGAAGLG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SGSCLDQLDYSLEHSLSRLYRDQAGNCTEPVSLAPPARPRPGSSFSKLLLPYREGAAGLG
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pF1KE0 GLLLTGWTFDRGACEVRPLGNLSRNSLRNGTEVVSCHPQGSTAGVVYRAGRNNRWYLAVA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GLLLTGWTFDRGACEVRPLGNLSRNSLRNGTEVVSCHPQGSTAGVVYRAGRNNRWYLAVA
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pF1KE0 ATYVLPEPETASRCNPAASDHDTAIALKDTEGRSLATQELGRLKLCEGAGSLHFVDAFLW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ATYVLPEPETASRCNPAASDHDTAIALKDTEGRSLATQELGRLKLCEGAGSLHFVDAFLW
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pF1KE0 NGSIYFPYYPYNYTSGAATGWPSMARIAQSTEVLFQGQASLDCGHGHPDGRRLLLSSSLV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 NGSIYFPYYPYNYTSGAATGWPSMARIAQSTEVLFQGQASLDCGHGHPDGRRLLLSSSLV
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pF1KE0 EALDVWAGVFSAAAGEGQERRSPTTTALCLFRMSEIQARAKRVSWDFKTAESHCKEGDQP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 EALDVWAGVFSAAAGEGQERRSPTTTALCLFRMSEIQARAKRVSWDFKTAESHCKEGDQP
              310       320       330       340       350       360

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pF1KE0 ERVQPIASSTLIHSDLTSVYGTVVMNRTVLFLGTGDGQLLKVILGENLTSNCPEVIYEIK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ERVQPIASSTLIHSDLTSVYGTVVMNRTVLFLGTGDGQLLKVILGENLTSNCPEVIYEIK
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pF1KE0 EETPVFYKLVPDPVKNIYIYLTAGKEVRRIRVANCNKHKSCSECLTATDPHCGWCHSLQR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 EETPVFYKLVPDPVKNIYIYLTAGKEVRRIRVANCNKHKSCSECLTATDPHCGWCHSLQR
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pF1KE0 CTFQGDCVHSENLENWLDISSGAKKCPKIQIIRSSKEKTTVTMVGSFSPRHSKCMVKNVD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 CTFQGDCVHSENLENWLDISSGAKKCPKIQIIRSSKEKTTVTMVGSFSPRHSKCMVKNVD
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pF1KE0 SSRELCQNKSQPNRTCTCSIPTRATYKDVSVVNVMFSFGSWNLSDRFNFTNCSSLKECPA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SSRELCQNKSQPNRTCTCSIPTRATYKDVSVVNVMFSFGSWNLSDRFNFTNCSSLKECPA
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pF1KE0 CVETGCAWCKSARRCIHPFTACDPSDYERNQEQCPVAVEKTSGGGRPKENKGNRTNQALQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 CVETGCAWCKSARRCIHPFTACDPSDYERNQEQCPVAVEKTSGGGRPKENKGNRTNQALQ
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pF1KE0 VFYIKSIEPQKVSTLGKSNVIVTGANFTRASNITMILKGTSTCDKDVIQVSHVLNDTHMK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VFYIKSIEPQKVSTLGKSNVIVTGANFTRASNITMILKGTSTCDKDVIQVSHVLNDTHMK
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pF1KE0 FSLPSSRKEMKDVCIQFDGGNCSSVGSLSYIALPHCSLIFPATTWISGGQNITMMGRNFD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 FSLPSSRKEMKDVCIQFDGGNCSSVGSLSYIALPHCSLIFPATTWISGGQNITMMGRNFD
              730       740       750       760       770       780

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pF1KE0 VIDNLIISHELKGNINVSEYCVATYCGFLAPSLKSSKVRTNVTVKLRVQDTYLDCGTLQY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VIDNLIISHELKGNINVSEYCVATYCGFLAPSLKSSKVRTNVTVKLRVQDTYLDCGTLQY
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KE0 REDPRFTGYRVESEVDTELEVKIQKENDNFNISKKDIEITLFHGENGQLNCSFENITRNQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 REDPRFTGYRVESEVDTELEVKIQKENDNFNISKKDIEITLFHGENGQLNCSFENITRNQ
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pF1KE0 DLTTILCKIKGIKTASTIANSSKKVRVKLGNLELYVEQESVPSTWYFLIVLPVLLVIVIF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DLTTILCKIKGIKTASTIANSSKKVRVKLGNLELYVEQESVPSTWYFLIVLPVLLVIVIF
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pF1KE0 AAVGVTRHKSKELSRKQSQQLELLESELRKEIRDGFAELQMDKLDVVDSFGTVPFLDYKH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 AAVGVTRHKSKELSRKQSQQLELLESELRKEIRDGFAELQMDKLDVVDSFGTVPFLDYKH
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pF1KE0 FALRTFFPESGGFTHIFTEDMHNRDANDKNESLTALDALICNKSFLVTVIHTLEKQKNFS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 FALRTFFPESGGFTHIFTEDMHNRDANDKNESLTALDALICNKSFLVTVIHTLEKQKNFS
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

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pF1KE0 VKDRCLFASFLTIALQTKLVYLTSILEVLTRDLMEQCSNMQPKLMLRRTESVVEKLLTNW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VKDRCLFASFLTIALQTKLVYLTSILEVLTRDLMEQCSNMQPKLMLRRTESVVEKLLTNW
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pF1KE0 MSVCLSGFLRETVGEPFYLLVTTLNQKINKGPVDVITCKALYTLNEDWLLWQVPEFSTVA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MSVCLSGFLRETVGEPFYLLVTTLNQKINKGPVDVITCKALYTLNEDWLLWQVPEFSTVA
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pF1KE0 LNVVFEKIPENESADVCRNISVNVLDCDTIGQAKEKIFQAFLSKNGSPYGLQLNEIGLEL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LNVVFEKIPENESADVCRNISVNVLDCDTIGQAKEKIFQAFLSKNGSPYGLQLNEIGLEL
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pF1KE0 QMGTRQKELLDIDSSSVILEDGITKLNTIGHYEISNGSTIKVFKKIANFTSDVEYSDDHC
       :::::::::::::::::::::::::::::::::                           
XP_011 QMGTRQKELLDIDSSSVILEDGITKLNTIGHYESVKMTVTFIQRGPLSGIWALTTPTQQD
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pF1KE0 HLILPDSEAFQDVQGKRHRGKHKFKVKEMYLTKLLSTKVAIHSVLEKLFRSIWSLPNSRA
                                                                   
XP_011 HS                                                          
                                                                   

>>XP_006719249 (OMIM: 604259) PREDICTED: plexin-C1 isofo  (1555 aa)
 initn: 6927 init1: 6927 opt: 6930  Z-score: 7295.6  bits: 1362.7 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 10317; 99.2% identity (99.2% similar) in 1568 aa overlap (1-1568:1-1555)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MEVSRRKAPPRPPRPAAPLPLLAYLLALAAPGRGADEPVWRSEQAIGAIAASQEDGVFVA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 MEVSRRKAPPRPPRPAAPLPLLAYLLALAAPGRGADEPVWRSEQAIGAIAASQEDGVFVA
               10        20        30        40        50        60

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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 SGSCLDQLDYSLEHSLSRLYRDQAGNCTEPVSLAPPARPRPGSSFSKLLLPYREGAAGLG
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 GLLLTGWTFDRGACEVRPLGNLSRNSLRNGTEVVSCHPQGSTAGVVYRAGRNNRWYLAVA
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 ATYVLPEPETASRCNPAASDHDTAIALKDTEGRSLATQELGRLKLCEGAGSLHFVDAFLW
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 NGSIYFPYYPYNYTSGAATGWPSMARIAQSTEVLFQGQASLDCGHGHPDGRRLLLSSSLV
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 EALDVWAGVFSAAAGEGQERRSPTTTALCLFRMSEIQARAKRVSWDFKTAESHCKEGDQP
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pF1KE0 ERVQPIASSTLIHSDLTSVYGTVVMNRTVLFLGTGDGQLLKVILGENLTSNCPEVIYEIK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 ERVQPIASSTLIHSDLTSVYGTVVMNRTVLFLGTGDGQLLKVILGENLTSNCPEVIYEIK
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pF1KE0 EETPVFYKLVPDPVKNIYIYLTAGKEVRRIRVANCNKHKSCSECLTATDPHCGWCHSLQR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 EETPVFYKLVPDPVKNIYIYLTAGKEVRRIRVANCNKHKSCSECLTATDPHCGWCHSLQR
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pF1KE0 CTFQGDCVHSENLENWLDISSGAKKCPKIQIIRSSKEKTTVTMVGSFSPRHSKCMVKNVD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 CTFQGDCVHSENLENWLDISSGAKKCPKIQIIRSSKEKTTVTMVGSFSPRHSKCMVKNVD
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 SSRELCQNKSQPNRTCTCSIPTRATYKDVSVVNVMFSFGSWNLSDRFNFTNCSSLKECPA
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 CVETGCAWCKSARRCIHPFTACDPSDYERNQEQCPVAVEKTSGGGRPKENKGNRTNQALQ
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pF1KE0 VFYIKSIEPQKVSTLGKSNVIVTGANFTRASNITMILKGTSTCDKDVIQVSHVLNDTHMK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 VFYIKSIEPQKVSTLGKSNVIVTGANFTRASNITMILKGTSTCDKDVIQVSHVLNDTHMK
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pF1KE0 FSLPSSRKEMKDVCIQFDGGNCSSVGSLSYIALPHCSLIFPATTWISGGQNITMMGRNFD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 FSLPSSRKEMKDVCIQFDGGNCSSVGSLSYIALPHCSLIFPATTWISGGQNITMMGRNFD
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pF1KE0 VIDNLIISHELKGNINVSEYCVATYCGFLAPSLKSSKVRTNVTVKLRVQDTYLDCGTLQY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 VIDNLIISHELKGNINVSEYCVATYCGFLAPSLKSSKVRTNVTVKLRVQDTYLDCGTLQY
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pF1KE0 REDPRFTGYRVESEVDTELEVKIQKENDNFNISKKDIEITLFHGENGQLNCSFENITRNQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 REDPRFTGYRVESEVDTELEVKIQKENDNFNISKKDIEITLFHGENGQLNCSFENITRNQ
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pF1KE0 DLTTILCKIKGIKTASTIANSSKKVRVKLGNLELYVEQESVPSTWYFLIVLPVLLVIVIF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 DLTTILCKIKGIKTASTIANSSKKVRVKLGNLELYVEQESVPSTWYFLIVLPVLLVIVIF
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pF1KE0 AAVGVTRHKSKELSRKQSQQLELLESELRKEIRDGFAELQMDKLDVVDSFGTVPFLDYKH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 AAVGVTRHKSKELSRKQSQQLELLESELRKEIRDGFAELQMDKLDVVDSFGTVPFLDYKH
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pF1KE0 FALRTFFPESGGFTHIFTEDMHNRDANDKNESLTALDALICNKSFLVTVIHTLEKQKNFS
       :::::::::             ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 FALRTFFPE-------------NRDANDKNESLTALDALICNKSFLVTVIHTLEKQKNFS
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pF1KE0 VKDRCLFASFLTIALQTKLVYLTSILEVLTRDLMEQCSNMQPKLMLRRTESVVEKLLTNW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 VKDRCLFASFLTIALQTKLVYLTSILEVLTRDLMEQCSNMQPKLMLRRTESVVEKLLTNW
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pF1KE0 MSVCLSGFLRETVGEPFYLLVTTLNQKINKGPVDVITCKALYTLNEDWLLWQVPEFSTVA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 MSVCLSGFLRETVGEPFYLLVTTLNQKINKGPVDVITCKALYTLNEDWLLWQVPEFSTVA
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pF1KE0 LNVVFEKIPENESADVCRNISVNVLDCDTIGQAKEKIFQAFLSKNGSPYGLQLNEIGLEL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 LNVVFEKIPENESADVCRNISVNVLDCDTIGQAKEKIFQAFLSKNGSPYGLQLNEIGLEL
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pF1KE0 QMGTRQKELLDIDSSSVILEDGITKLNTIGHYEISNGSTIKVFKKIANFTSDVEYSDDHC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 QMGTRQKELLDIDSSSVILEDGITKLNTIGHYEISNGSTIKVFKKIANFTSDVEYSDDHC
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pF1KE0 HLILPDSEAFQDVQGKRHRGKHKFKVKEMYLTKLLSTKVAIHSVLEKLFRSIWSLPNSRA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 HLILPDSEAFQDVQGKRHRGKHKFKVKEMYLTKLLSTKVAIHSVLEKLFRSIWSLPNSRA
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pF1KE0 PFAIKYFFDFLDAQAENKKITDPDVVHIWKTNSLPLRFWVNILKNPQFVFDIKKTPHIDG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 PFAIKYFFDFLDAQAENKKITDPDVVHIWKTNSLPLRFWVNILKNPQFVFDIKKTPHIDG
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pF1KE0 CLSVIAQAFMDAFSLTEQQLGKEAPTNKLLYAKDIPTYKEEVKSYYKAIRDLPPLSSSEM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 CLSVIAQAFMDAFSLTEQQLGKEAPTNKLLYAKDIPTYKEEVKSYYKAIRDLPPLSSSEM
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pF1KE0 EEFLTQESKKHENEFNEEVALTEIYKYIVKYFDEILNKLERERGLEEAQKQLLHVKVLFD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 EEFLTQESKKHENEFNEEVALTEIYKYIVKYFDEILNKLERERGLEEAQKQLLHVKVLFD
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pF1KE0 EKKKCKWM
       ::::::::
XP_006 EKKKCKWM
      1550     

>>XP_011536033 (OMIM: 604259) PREDICTED: plexin-C1 isofo  (1036 aa)
 initn: 6926 init1: 6926 opt: 6926  Z-score: 7294.0  bits: 1361.8 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 6926; 100.0% identity (100.0% similar) in 1029 aa overlap (1-1029:1-1029)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MEVSRRKAPPRPPRPAAPLPLLAYLLALAAPGRGADEPVWRSEQAIGAIAASQEDGVFVA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MEVSRRKAPPRPPRPAAPLPLLAYLLALAAPGRGADEPVWRSEQAIGAIAASQEDGVFVA
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE0 SGSCLDQLDYSLEHSLSRLYRDQAGNCTEPVSLAPPARPRPGSSFSKLLLPYREGAAGLG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SGSCLDQLDYSLEHSLSRLYRDQAGNCTEPVSLAPPARPRPGSSFSKLLLPYREGAAGLG
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE0 GLLLTGWTFDRGACEVRPLGNLSRNSLRNGTEVVSCHPQGSTAGVVYRAGRNNRWYLAVA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GLLLTGWTFDRGACEVRPLGNLSRNSLRNGTEVVSCHPQGSTAGVVYRAGRNNRWYLAVA
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE0 ATYVLPEPETASRCNPAASDHDTAIALKDTEGRSLATQELGRLKLCEGAGSLHFVDAFLW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ATYVLPEPETASRCNPAASDHDTAIALKDTEGRSLATQELGRLKLCEGAGSLHFVDAFLW
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE0 NGSIYFPYYPYNYTSGAATGWPSMARIAQSTEVLFQGQASLDCGHGHPDGRRLLLSSSLV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 NGSIYFPYYPYNYTSGAATGWPSMARIAQSTEVLFQGQASLDCGHGHPDGRRLLLSSSLV
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE0 EALDVWAGVFSAAAGEGQERRSPTTTALCLFRMSEIQARAKRVSWDFKTAESHCKEGDQP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 EALDVWAGVFSAAAGEGQERRSPTTTALCLFRMSEIQARAKRVSWDFKTAESHCKEGDQP
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE0 ERVQPIASSTLIHSDLTSVYGTVVMNRTVLFLGTGDGQLLKVILGENLTSNCPEVIYEIK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ERVQPIASSTLIHSDLTSVYGTVVMNRTVLFLGTGDGQLLKVILGENLTSNCPEVIYEIK
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE0 EETPVFYKLVPDPVKNIYIYLTAGKEVRRIRVANCNKHKSCSECLTATDPHCGWCHSLQR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 EETPVFYKLVPDPVKNIYIYLTAGKEVRRIRVANCNKHKSCSECLTATDPHCGWCHSLQR
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE0 CTFQGDCVHSENLENWLDISSGAKKCPKIQIIRSSKEKTTVTMVGSFSPRHSKCMVKNVD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 CTFQGDCVHSENLENWLDISSGAKKCPKIQIIRSSKEKTTVTMVGSFSPRHSKCMVKNVD
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE0 SSRELCQNKSQPNRTCTCSIPTRATYKDVSVVNVMFSFGSWNLSDRFNFTNCSSLKECPA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SSRELCQNKSQPNRTCTCSIPTRATYKDVSVVNVMFSFGSWNLSDRFNFTNCSSLKECPA
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KE0 CVETGCAWCKSARRCIHPFTACDPSDYERNQEQCPVAVEKTSGGGRPKENKGNRTNQALQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 CVETGCAWCKSARRCIHPFTACDPSDYERNQEQCPVAVEKTSGGGRPKENKGNRTNQALQ
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KE0 VFYIKSIEPQKVSTLGKSNVIVTGANFTRASNITMILKGTSTCDKDVIQVSHVLNDTHMK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VFYIKSIEPQKVSTLGKSNVIVTGANFTRASNITMILKGTSTCDKDVIQVSHVLNDTHMK
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KE0 FSLPSSRKEMKDVCIQFDGGNCSSVGSLSYIALPHCSLIFPATTWISGGQNITMMGRNFD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 FSLPSSRKEMKDVCIQFDGGNCSSVGSLSYIALPHCSLIFPATTWISGGQNITMMGRNFD
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KE0 VIDNLIISHELKGNINVSEYCVATYCGFLAPSLKSSKVRTNVTVKLRVQDTYLDCGTLQY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VIDNLIISHELKGNINVSEYCVATYCGFLAPSLKSSKVRTNVTVKLRVQDTYLDCGTLQY
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KE0 REDPRFTGYRVESEVDTELEVKIQKENDNFNISKKDIEITLFHGENGQLNCSFENITRNQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 REDPRFTGYRVESEVDTELEVKIQKENDNFNISKKDIEITLFHGENGQLNCSFENITRNQ
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KE0 DLTTILCKIKGIKTASTIANSSKKVRVKLGNLELYVEQESVPSTWYFLIVLPVLLVIVIF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DLTTILCKIKGIKTASTIANSSKKVRVKLGNLELYVEQESVPSTWYFLIVLPVLLVIVIF
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KE0 AAVGVTRHKSKELSRKQSQQLELLESELRKEIRDGFAELQMDKLDVVDSFGTVPFLDYKH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 AAVGVTRHKSKELSRKQSQQLELLESELRKEIRDGFAELQMDKLDVVDSFGTVPFLDYKH
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KE0 FALRTFFPESGGFTHIFTEDMHNRDANDKNESLTALDALICNKSFLVTVIHTLEKQKNFS
       :::::::::                                                   
XP_011 FALRTFFPEGSEESST                                            
             1030                                                  

>>NP_055918 (OMIM: 604282) plexin-D1 precursor [Homo sap  (1925 aa)
 initn: 2056 init1: 820 opt: 1567  Z-score: 1641.4  bits: 316.8 E(85289): 1.1e-84
Smith-Waterman score: 1945; 30.2% identity (54.5% similar) in 1615 aa overlap (278-1565:340-1921)

       250       260       270       280       290         300     
pF1KE0 YYPYNYTSGAATGWPSMARIAQSTEVLFQGQASLDCGHGHPDGRRLLLSS--SLVEALDV
                                     : .:.:. :   ::  : :   :.  : . 
NP_055 KESQARSLLARICLPHGAGGDAKKLTESYIQLGLQCAGGA--GRGDLYSRLVSVFPARER
     310       320       330       340         350       360       

         310       320       330         340             350       
pF1KE0 WAGVFSAAAGEGQERRSPTTTALCLFRMSEIQA--RAKRVS------WDFKTAESHCKEG
         .::    :    : .:.  ::: ::.....:  :: :..       :  .. .   .:
NP_055 LFAVFERPQGSPAARAAPA--ALCAFRFADVRAAIRAARTACFVEPAPDVVAVLDSVVQG
       370       380         390       400       410       420     

                   360                     370        380       390
pF1KE0 D------------QPERV--------------QPIASSTLIHSD-LTSVYGTVVMNRTVL
                    :::..              ::. .. ....  ::::  . : : :..
NP_055 TGPACERKLNIQLQPEQLDCGAAHLQHPLSILQPLKATPVFRAPGLTSVAVASVNNYTAV
         430       440       450       460       470       480     

              400       410       420       430       440       450
pF1KE0 FLGTGDGQLLKVILGENLTSNCPEVIYEIKEETPVFYKLVPDPVKNIYIYLTAGKEVRRI
       :::: .:.:::. :.:..     .:.  .    :: . .  ::. . :.:: ..... :.
NP_055 FLGTVNGRLLKINLNESMQVVSRRVV-TVAYGEPVHHVMQFDPADSGYLYLMTSHQMARV
         490       500       510        520       530       540    

              460       470       480       490       500       510
pF1KE0 RVANCNKHKSCSECLTATDPHCGWCHSLQRCTFQGDCVHSENLENWLDISSGAKKCPKIQ
       .:: :: :..:..:. :.: .::::    :::.: ::..: . . : . : : ..:: . 
NP_055 KVAACNVHSTCGDCVGAADAYCGWCALETRCTLQQDCTNSSQQHFWTSASEGPSRCPAMT
          550       560       570       580       590       600    

                    520       530       540       550          560 
pF1KE0 I------IRSSKEKTTVTMVGSFSPRHSKCMVKNVDSSRELCQNKSQP---NRTCTCSIP
       .      .:.      . . ::.    .  :. .  .. .       :   ..   :.. 
NP_055 VLPSEIDVRQEYPGMILQISGSLPSLSGMEMACDYGNNIRTVARVPGPAFGHQIAYCNLL
          610       620       630       640       650       660    

                   570       580       590               600       
pF1KE0 TRATY------KDVSVVNVMFSFGSWNLSDRFNFT--NCSSLKE------CPACVETG--
        :  .      .:  .:..    .. :.  . :::  .::   .      : .:. .   
NP_055 PRDQFPPFPPNQDHVTVEMSVRVNGRNIV-KANFTIYDCSRTAQVYPHTACTSCLSAQWP
          670       680       690        700       710       720   

         610       620       630                                   
pF1KE0 CAWCKSARRCIHPFTACDPSDYERNQEQCP------------------------------
       : ::.. . :.   . :. :    . ..::                              
NP_055 CFWCSQQHSCVSNQSRCEASPNPTSPQDCPRTLLSPLAPVPTGGSQNILVPLANTAFFQG
           730       740       750       760       770       780   

         640                                                       
pF1KE0 VAVEKTSG-------------------------------------GGRP-----------
       .:.: . :                                      :::           
NP_055 AALECSFGLEEIFEAVWVNESVVRCDQVVLHTTRKSQVFPLSLQLKGRPARFLDSPEPMT
           790       800       810       820       830       840   

                         650               660              670    
pF1KE0 ------------------KENKGN--------RTNQALQVFY-------IKSIEPQKVST
                         .:. :.        :    :: .        :..::: .   
NP_055 VMVYNCAMGSPDCSQCLGREDLGHLCMWSDGCRLRGPLQPMAGTCPAPEIRAIEPLSGPL
           850       860       870       880       890       900   

          680        690        700                710             
pF1KE0 LGKSNVIVTGANF-TRASNITM-ILKGTSTCD---------KDVIQV-------------
        : . . . : :.  : :...  .  :  .:.         .... :             
NP_055 DGGTLLTIRGRNLGRRLSDVAHGVWIGGVACEPLPDRYTVSEEIVCVTGPAPGPLSGVVT
           910       920       930       940       950       960   

                                                  720              
pF1KE0 -------------SHVL-----------------------NDTHMKFSL--------PSS
                    :.::                       :: :.   :        : .
NP_055 VNASKEGKSRDRFSYVLPLVHSLEPTMGPKAGGTRITIHGNDLHVGSELQVLVNDTDPCT
           970       980       990      1000      1010      1020   

        730                        740         750       760       
pF1KE0 RKEMKD-----------------VCIQFDGGNCSSVGSLS--YIALPHCSLIFPATTWIS
       .    :                 ::..:.  .:   :.:.  :.  :  . : :  . .:
NP_055 ELMRTDTSIACTMPEGALPAPVPVCVRFERRGCVH-GNLTFWYMQNPVITAISPRRSPVS
          1030      1040      1050       1060      1070      1080  

       770       780        790       800       810        820     
pF1KE0 GGQNITMMGRNFDVIDNLIIS-HELKGNINVSEYCVATYCGFLAP-SLKSSKVRTNVTVK
       ::..::. :. : ...:. .. :..  . .. .   .:     .: .:..... ..  ..
NP_055 GGRTITVAGERFHMVQNVSMAVHHIGREPTLCKVLNSTLITCPSPGALSNASAPVDFFIN
           1090      1100      1110      1120      1130      1140  

                830               840       850           860      
pF1KE0 LR-------VQDTYLDC-----GT---LQYREDPRFTGYRVESEVDTE----LEVKIQKE
        :       : .  ::      :.   :.:  .:.:.  . :. .  .    : . :.::
NP_055 GRAYADEVAVAEELLDPEEAQRGSRFRLDYLPNPQFSTAKREKWIKHHPGEPLTLVIHKE
           1150      1160      1170      1180      1190      1200  

        870       880       890       900       910       920      
pF1KE0 NDNFNISKKDIEITLFHGENGQLNCSFENITRNQDLTTILCKIKGIKTASTIANSSKKVR
       .:........ .. .     ::..:... ..   :   : :...    :   : ..  . 
NP_055 QDSLGLQSHEYRVKI-----GQVSCDIQIVS---D-RIIHCSVNESLGA---AVGQLPIT
           1210           1220          1230      1240         1250

        930       940       950          960       970          980
pF1KE0 VKLGNLELYVEQESVPSTWYFLIVLPVL---LVIVIFAAVGVTRHKSKELSR---KQSQQ
       ...::..  .   .. ..   .::  :.   :...  .:. :   ::..  :   :   :
NP_055 IQVGNFNQTIATLQLGGSETAIIVSIVICSVLLLLSVVALFVFCTKSRRAERYWQKTLLQ
             1260      1270      1280      1290      1300      1310

              990      1000      1010         1020      1030       
pF1KE0 LELLESELRKEIRDGFAELQMDKLDVVDSFGT---VPFLDYKHFALRTFFPESGGF---T
       .: .::..:.::: :::::: :  :..  ..    .:::.::::. :::::. ...    
NP_055 MEEMESQIREEIRKGFAELQTDMTDLTKELNRSQGIPFLEYKHFVTRTFFPKCSSLYEER
             1320      1330      1340      1350      1360      1370

         1040                           1050      1060      1070   
pF1KE0 HIFTEDMHNRDANDK---------------------NESLTALDALICNKSFLVTVIHTL
       ...  .  : .....                     .:... ...:. :: ::.. .:.:
NP_055 YVLPSQTLNSQGSSQAQETHPLLGEWKIPESCRPNMEEGISLFSSLLNNKHFLIVFVHAL
             1380      1390      1400      1410      1420      1430

          1080      1090      1100      1110      1120      1130   
pF1KE0 EKQKNFSVKDRCLFASFLTIALQTKLVYLTSILEVLTRDLMEQCSNMQPKLMLRRTESVV
       :.::.:.:.::: .::.:::::. :: : :::.. :  ::..  .  .::::::::::::
NP_055 EQQKDFAVRDRCSLASLLTIALHGKLEYYTSIMKELLVDLIDASAAKNPKLMLRRTESVV
             1440      1450      1460      1470      1480      1490

          1140      1150      1160      1170      1180      1190   
pF1KE0 EKLLTNWMSVCLSGFLRETVGEPFYLLVTTLNQKINKGPVDVITCKALYTLNEDWLLWQV
       ::.::::::.:. . :::::::::.::. ...:.:::: .:.:: :: :::::.::: . 
NP_055 EKMLTNWMSICMYSCLRETVGEPFFLLLCAIKQQINKGSIDAITGKARYTLNEEWLLREN
             1500      1510      1520      1530      1540      1550

          1200      1210      1220      1230      1240      1250   
pF1KE0 PEFSTVALNVVFEKIPENESADVCRNISVNVLDCDTIGQAKEKIFQAFLSKNGSPYGL--
        : .   ::: :.    . . :   ..:: ..: ::. :.::::..::  ::  ::.   
NP_055 IEAKPRNLNVSFQ----GCGMD---SLSVRAMDTDTLTQVKEKILEAF-CKN-VPYSQWP
             1560             1570      1580      1590        1600 

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pF1KE0 QLNEIGLELQMGTRQKELL-DIDSSSVILEDGITKLNTIGHYEISNGSTI--KVFKKIAN
       . ... ::   .. :. .: :.:..::. :::  ::::..::.: .:...  ... :  :
NP_055 RAEDVDLEWFASSTQSYILRDLDDTSVV-EDGRKKLNTLAHYKIPEGASLAMSLIDKKDN
            1610      1620       1630      1640      1650      1660

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pF1KE0 FTSDVEYSDD--HCHLILPDSEAFQDVQGKRHRGKHKFKV-KEMYLTKLLSTKVAIHSVL
         . :.  :   . ::.:: .:  .    : :: .:. ::  :.:::.::::: .... :
NP_055 TLGRVKDLDTEKYFHLVLPTDELAE--PKKSHRQSHRKKVLPEIYLTRLLSTKGTLQKFL
             1670      1680        1690      1700      1710        

        1370      1380      1390      1400      1410      1420     
pF1KE0 EKLFRSIWSLPNSRAPFAIKYFFDFLDAQAENKKITDPDVVHIWKTNSLPLRFWVNILKN
       . ::..: :. ... :.:.:::::::. :::.. :.:::..:::::::::::::::::::
NP_055 DDLFKAILSIREDKPPLAVKYFFDFLEEQAEKRGISDPDTLHIWKTNSLPLRFWVNILKN
     1720      1730      1740      1750      1760      1770        

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pF1KE0 PQFVFDIKKTPHIDGCLSVIAQAFMDAFSLTEQQLGKEAPTNKLLYAKDIPTYKEEVKSY
       ::::::: :: :::.:::::::::.:: :... ::::..:::::::::.:: :.. :. :
NP_055 PQFVFDIDKTDHIDACLSVIAQAFIDACSISDLQLGKDSPTNKLLYAKEIPEYRKIVQRY
     1780      1790      1800      1810      1820      1830        

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pF1KE0 YKAIRDLPPLSSSEMEEFLTQESKKHENEFNEEVALTEIYKYIVKYFDEILNKLE-----
       :: :.:. ::: .::.  :..::.:..:::: .::..:::::  .:  .:.  ::     
NP_055 YKQIQDMTPLSEQEMNAHLAEESRKYQNEFNTNVAMAEIYKYAKRYRPQIMAALEANPTA
     1840      1850      1860      1870      1880      1890        

             1550      1560         
pF1KE0 RERGLEEAQKQLLHVKVLFDEKKKCKWM 
       :.  :..  .:.  : .. :.  .:    
NP_055 RRTQLQHKFEQV--VALMEDNIYECYSEA
     1900      1910        1920     

>>XP_011510894 (OMIM: 604282) PREDICTED: plexin-D1 isofo  (981 aa)
 initn: 1651 init1: 820 opt: 1561  Z-score: 1639.5  bits: 315.5 E(85289): 1.4e-84
Smith-Waterman score: 1849; 36.7% identity (66.2% similar) in 988 aa overlap (648-1565:24-977)

       620       630       640       650        660       670      
pF1KE0 PFTACDPSDYERNQEQCPVAVEKTSGGGRPKENKG-NRTNQALQVFYIKSIEPQKVSTLG
                                     ::.:. .: . .: .  ..:.::      :
XP_011        MGIVCVTGPAPGPLSGVVTVNASKEGKSRDRFSYVLPL--VHSLEPTMGPKAG
                      10        20        30          40        50 

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pF1KE0 KSNVIVTGANFTRASNITMILKGTSTCDKDVIQVSHVLNDTHMKFSLPSSRKEMKDVCIQ
        . . . : ..  .:.. .... :. :  ......  .  :  . .::.       ::..
XP_011 GTRITIHGNDLHVGSELQVLVNDTDPCT-ELMRTDTSIACTMPEGALPAPVP----VCVR
              60        70         80        90       100          

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pF1KE0 FDGGNCSSVGSLS--YIALPHCSLIFPATTWISGGQNITMMGRNFDVIDNLIIS-HELKG
       :.  .:   :.:.  :.  :  . : :  . .:::..::. :. : ...:. .. :..  
XP_011 FERRGCVH-GNLTFWYMQNPVITAISPRRSPVSGGRTITVAGERFHMVQNVSMAVHHIGR
        110        120       130       140       150       160     

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pF1KE0 NINVSEYCVATYCGFLAP-SLKSSKVRTNVTVKLR-------VQDTYLDC-----GT---
       . .. .   .:     .: .:..... ..  .. :       : .  ::      :.   
XP_011 EPTLCKVLNSTLITCPSPGALSNASAPVDFFINGRAYADEVAVAEELLDPEEAQRGSRFR
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pF1KE0 LQYREDPRFTGYRVESEVDTE----LEVKIQKENDNFNISKKDIEITLFHGENGQLNCSF
       :.:  .:.:.  . :. .  .    : . :.::.:........ .. .     ::..:..
XP_011 LDYLPNPQFSTAKREKWIKHHPGEPLTLVIHKEQDSLGLQSHEYRVKI-----GQVSCDI
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pF1KE0 ENITRNQDLTTILCKIKGIKTASTIANSSKKVRVKLGNLELYVEQESVPSTWYFLIVLPV
       . ..   :   : :.   .. .   : ..  . ...::..  .   .. ..   .::  :
XP_011 QIVS---D-RIIHCS---VNESLGAAVGQLPITIQVGNFNQTIATLQLGGSETAIIVSIV
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pF1KE0 L---LVIVIFAAVGVTRHKSKELSR---KQSQQLELLESELRKEIRDGFAELQMDKLDVV
       .   :...  .:. :   ::..  :   :   :.: .::..:.::: :::::: :  :..
XP_011 ICSVLLLLSVVALFVFCTKSRRAERYWQKTLLQMEEMESQIREEIRKGFAELQTDMTDLT
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      1010         1020      1030         1040                     
pF1KE0 DSFGT---VPFLDYKHFALRTFFPESGGF---THIFTEDMHNRDANDK------------
         ..    .:::.::::. :::::. ...    ...  .  : .....            
XP_011 KELNRSQGIPFLEYKHFVTRTFFPKCSSLYEERYVLPSQTLNSQGSSQAQETHPLLGEWK
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pF1KE0 ---------NESLTALDALICNKSFLVTVIHTLEKQKNFSVKDRCLFASFLTIALQTKLV
                .:... ...:. :: ::.. .:.::.::.:.:.::: .::.:::::. :: 
XP_011 IPESCRPNMEEGISLFSSLLNNKHFLIVFVHALEQQKDFAVRDRCSLASLLTIALHGKLE
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pF1KE0 YLTSILEVLTRDLMEQCSNMQPKLMLRRTESVVEKLLTNWMSVCLSGFLRETVGEPFYLL
       : :::.. :  ::..  .  .::::::::::::::.::::::.:. . :::::::::.::
XP_011 YYTSIMKELLVDLIDASAAKNPKLMLRRTESVVEKMLTNWMSICMYSCLRETVGEPFFLL
           520       530       540       550       560       570   

             1170      1180      1190      1200      1210      1220
pF1KE0 VTTLNQKINKGPVDVITCKALYTLNEDWLLWQVPEFSTVALNVVFEKIPENESADVCRNI
       . ...:.:::: .:.:: :: :::.:.::: .  : .   ::: :.    . . :   ..
XP_011 LCAIKQQINKGSIDAITGKARYTLSEEWLLRENIEAKPRNLNVSFQ----GCGMD---SL
           580       590       600       610           620         

             1230      1240      1250        1260      1270        
pF1KE0 SVNVLDCDTIGQAKEKIFQAFLSKNGSPYGL--QLNEIGLELQMGTRQKELL-DIDSSSV
       :: ..: ::. :.::::..::  ::  ::.   . ... ::   .. :. .: :.:..::
XP_011 SVRAMDTDTLTQVKEKILEAF-CKN-VPYSQWPRAEDVDLEWFASSTQSYILRDLDDTSV
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pF1KE0 ILEDGITKLNTIGHYEISNGSTI--KVFKKIANFTSDVEYSDD--HCHLILPDSEAFQDV
       . :::  ::::..::.: .:...  ... :  :  . :.  :   . ::.:: .:  .  
XP_011 V-EDGRKKLNTLAHYKIPEGASLAMSLIDKKDNTLGRVKDLDTEKYFHLVLPTDELAE--
           690       700       710       720       730       740   

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pF1KE0 QGKRHRGKHKFKV-KEMYLTKLLSTKVAIHSVLEKLFRSIWSLPNSRAPFAIKYFFDFLD
         : :: .:. ::  :.:::.::::: .... :. ::..: :. ... :.:.:::::::.
XP_011 PKKSHRQSHRKKVLPEIYLTRLLSTKGTLQKFLDDLFKAILSIREDKPPLAVKYFFDFLE
             750       760       770       780       790       800 

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pF1KE0 AQAENKKITDPDVVHIWKTNSLPLRFWVNILKNPQFVFDIKKTPHIDGCLSVIAQAFMDA
        :::.. :.:::..:::::::::::::::::::::::::: :: :::.:::::::::.::
XP_011 EQAEKRGISDPDTLHIWKTNSLPLRFWVNILKNPQFVFDIDKTDHIDACLSVIAQAFIDA
             810       820       830       840       850       860 

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pF1KE0 FSLTEQQLGKEAPTNKLLYAKDIPTYKEEVKSYYKAIRDLPPLSSSEMEEFLTQESKKHE
        :... ::::..:::::::::.:: :.. :. ::: :.:. ::: .::.  :..::.:..
XP_011 CSISDLQLGKDSPTNKLLYAKEIPEYRKIVQRYYKQIQDMTPLSEQEMNAHLAEESRKYQ
             870       880       890       900       910       920 

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pF1KE0 NEFNEEVALTEIYKYIVKYFDEILNKLE-----RERGLEEAQKQLLHVKVLFDEKKKCKW
       :::: .::..:::::  .:  .:.  ::     :.  :..  .:.  : .. :.  .:  
XP_011 NEFNTNVAMAEIYKYAKRYRPQIMAALEANPTARRTQLQHKFEQV--VALMEDNIYECYS
             930       940       950       960         970         

         
pF1KE0 M 
         
XP_011 EA
     980 

>>XP_011510891 (OMIM: 604282) PREDICTED: plexin-D1 isofo  (1795 aa)
 initn: 2050 init1: 820 opt: 1561  Z-score: 1635.6  bits: 315.6 E(85289): 2.3e-84
Smith-Waterman score: 2098; 30.8% identity (58.0% similar) in 1652 aa overlap (108-1565:194-1791)

        80        90       100       110       120        130      
pF1KE0 RLYRDQAGNCTEPVSLAPPARPRPGSSFSKLLLPYREGAAGLGGL-LLTGWTFDRGACEV
                                     :.::    ::: ::  ::.: :.   .   
XP_011 PPAAPPAEPVTVFPSMLNVAANHPNASTVGLVLP---PAAGAGGSRLLVGATYTGYGSSF
           170       180       190          200       210       220

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pF1KE0 RPLG-NLSRNSLRNGTEVV--SCHPQGSTAGVV-------------YRAGRNNRWYLAVA
        : . .:  . ..:  :..  :   .:. : .               . : ...  :. .
XP_011 FPRNRSLEDHRFENTPEIAIRSLDTRGDLAKLFTFDLNPSDDNILKIKQGAKEQHKLGFV
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pF1KE0 ATYVLPE--PETASRCNPAASDHDTAIALKDTEGRSLATQELGRLKLCEGAGSLHFVDAF
       .... :   :  :.     : . ..  . :....:::    :.:. : .:::.    :: 
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pF1KE0 LWNGSIYFPYYPYNYTSGAATG--WPSMARIAQSTEVLFQGQASLDCGHGHPDGRRLLLS
         . :  .     . ..::. :  .  .. .  . : ::   : ..  .: : .:    .
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           .  :: :.. .: ..   :    ....:    ..   :  .... ...  .  :  
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pF1KE0 G--DQPERV-QPIASSTLIHSD-LTSVYGTVVMNRTVLFLGTGDGQLLKVILGENLTSNC
       .  ..:  . ::. .. ....  ::::  . : : :..:::: .:.:::. :.:..    
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        .:.  .    :: . .  ::. . :.:: ..... :..:: :: :..:..:. :.: .:
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       :::    :::.: ::..: . . : . : : ..:: . .. :         : .    :.
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pF1KE0 VGSFSPRHSKCMVKNVDSSRELCQNKSQPNRTCTCSIPTRATYKDV----SVVN----VM
       .. ..:  .    .:.     : ..    . .  ::.  .  .. :    :::     :.
XP_011 LSPLAPVPTGGS-QNILVP--LANTAFFQGAALECSFGLEEIFEAVWVNESVVRCDQVVL
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        .      :  : .:. :                ::. .  .:  :.   . :  : :  
XP_011 HTTRKSQVFPLSLQLKGRPARFLDSPEPMTVMVYNCAMGSPDCSQCLGREDLGHLCMWSD
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       :.:   . .  .  : :   . :        .  ::.:. .: . .: .  ..:.::   
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          : . . . : ..  .:.. .... :. :  ......  .  :  . .::.       
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       ::..:.  .:   :.:.  :.  :  . : :  . .:::..::. :. : ...:. .. :
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       ..  . .. .   .:     .: .:..... ..  .. :       : .  ::      :
XP_011 HIGREPTLCKVLNSTLITCPSPGALSNASAPVDFFINGRAYADEVAVAEELLDPEEAQRG
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       .   :.:  .:.:.  . :. .  .    : . :.::.:........ .. .     ::.
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       .:... ..       : :...    :   : ..  . ...::..  .   .. ..   .:
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       :  :.   :...  .:. :   ::..  :   :   :.: .::..:.::: :::::: : 
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        :..  ..    .:::.::::. :::::. ...    ...  .  : .....        
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                    .:... ...:. :: ::.. .:.::.::.:.:.::: .::.:::::.
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        :: : :::.. :  ::..  .  .::::::::::::::.::::::.:. . ::::::::
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       :.::. ...:.:::: .:.:: :: :::.:.::: .  : .   ::: :.    .     
XP_011 FFLLLCAIKQQINKGSIDAITGKARYTLSEEWLLRENIEAKPRNLNVSFQGCGMD-----
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         ..:: ..: ::. :.::::..::  ::  ::.   . ... ::   .. :. .: :.:
XP_011 --SLSVRAMDTDTLTQVKEKILEAF-CKN-VPYSQWPRAEDVDLEWFASSTQSYILRDLD
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       ..::. :::  ::::..::.: .:...  ... :  :  . :.  :   . ::.:: .: 
XP_011 DTSVV-EDGRKKLNTLAHYKIPEGASLAMSLIDKKDNTLGRVKDLDTEKYFHLVLPTDEL
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        .    : :: .:. ::  :.:::.::::: .... :. ::..: :. ... :.:.::::
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       :::. :::.. :.:::..:::::::::::::::::::::::::: :: :::.::::::::
XP_011 DFLEEQAEKRGISDPDTLHIWKTNSLPLRFWVNILKNPQFVFDIDKTDHIDACLSVIAQA
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pF1KE0 I------IRSSKEKTTVTMVGSFSPRHSKCMVKNVDSSRELCQNKSQP---NRTCTCSIP
       .      .:.      . . ::.    .  :. .  .. .       :   ..   :.. 
XP_011 VLPSEIDVRQEYPGMILQISGSLPSLSGMEMACDYGNNIRTVARVPGPAFGHQIAYCNLL
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pF1KE0 TRATY------KDVSVVNVMFSFGSWNLSDRFNFT--NCSSLKE------CPACVETG--
        :  .      .:  .:..    .. :.  . :::  .::   .      : .:. .   
XP_011 PRDQFPPFPPNQDHVTVEMSVRVNGRNIV-KANFTIYDCSRTAQVYPHTACTSCLSAQWP
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pF1KE0 CAWCKSARRCIHPFTACDPSDYERNQEQCPVAVEKT-----SGGGR----PKEN----KG
       : ::.. . :.   . :. :    . ..:: .. .      .::..    :  :    .:
XP_011 CFWCSQQHSCVSNQSRCEASPNPTSPQDCPRTLLSPLAPVPTGGSQNILVPLANTAFFQG
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pF1KE0 N----------------------RTNQAL-------QVF------------YIKSIEPQK
                              : .:..       :::            .. : ::. 
XP_011 AALECSFGLEEIFEAVWVNESVVRCDQVVLHTTRKSQVFPLSLQLKGRPARFLDSPEPMT
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pF1KE0 V-------------STLGKSNV--------------------------------------
       :             . ::. ..                                      
XP_011 VMVYNCAMGSPDCSQCLGREDLGHLCMWSDGCRLRGPLQPMAGTCPAPEIHAIEPLSGPL
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pF1KE0 ------IVTGANF-TRASNITM-ILKGTSTCD---------KDVIQV-------------
              . : :.  : :...  .  :  .:.         .... :             
XP_011 DGGTLLTIRGRNLGRRLSDVAHGVWIGGVACEPLPDRYTVSEEIVCVTGPAPGPLSGVVT
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pF1KE0 -------------SHVL-----------------------NDTHMKFSL--------PSS
                    :.::                       :: :.   :        : .
XP_011 VNASKEGKSRDRFSYVLPLVHSLEPTMGPKAGGTRITIHGNDLHVGSELQVLVNDTDPCT
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pF1KE0 RKEMKD-----------------VCIQFDGGNCSSVGSLS--YIALPHCSLIFPATTWIS
       .    :                 ::..:.  .:   :.:.  :.  :  . : :  . .:
XP_011 ELMRTDTSIACTMPEGALPAPVPVCVRFERRGCVH-GNLTFWYMQNPVITAISPRRSPVS
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pF1KE0 GGQNITMMGRNFDVIDNLIIS-HELKGNINVSEYCVATYCGFLAP-SLKSSKVRTNVTVK
       ::..::. :. : ...:. .. :..  . .. .   .:     .: .:..... ..  ..
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pF1KE0 LR-------VQDTYLDC-----GT---LQYREDPRFTGYRVESEVDTE----LEVKIQKE
        :       : .  ::      :.   :.:  .:.:.  . :. .  .    : . :.::
XP_011 GRAYADEVAVAEELLDPEEAQRGSRFRLDYLPNPQFSTAKREKWIKHHPGEPLTLVIHKE
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pF1KE0 NDNFNISKKDIEITLFHGENGQLNCSFENITRNQDLTTILCKIKGIKTASTIANSSKKVR
       .:........ .. .     ::..:... ..       : :...    .   : ..  . 
XP_011 QDSLGLQSHEYRVKI-----GQVSCDIQIVSDR----IIHCSVN---ESLGAAVGQLPIT
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pF1KE0 VKLGNLELYVEQESVPSTWYFLIVLPVL---LVIVIFAAVGVTRHKSKELSR---KQSQQ
       ...::..  .   .. ..   .::  :.   :...  .:. :   ::..  :   :   :
XP_011 IQVGNFNQTIATLQLGGSETAIIVSIVICSVLLLLSVVALFVFCTKSRRAERYWQKTLLQ
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pF1KE0 LELLESELRKEIRDGFAELQMDKLDVVDSFGT---VPFLDYKHFALRTFFPESGGF---T
       .: .::..:.::: :::::: :  :..  ..    .:::.::::. :::::. ...    
XP_011 MEEMESQIREEIRKGFAELQTDMTDLTKELNRSQGIPFLEYKHFVTRTFFPKCSSLYEER
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pF1KE0 HIFTEDMHNRDANDK---------------------NESLTALDALICNKSFLVTVIHTL
       ...  .  : .....                     .:... ...:. :: ::.. .:.:
XP_011 YVLPSQTLNSQGSSQAQETHPLLGEWKIPESCRPNMEEGISLFSSLLNNKHFLIVFVHAL
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pF1KE0 EKQKNFSVKDRCLFASFLTIALQTKLVYLTSILEVLTRDLMEQCSNMQPKLMLRRTESVV
       :.::.:.:.::: .::.:::::. :: : :::.. :  ::..  .  .::::::::::::
XP_011 EQQKDFAVRDRCSLASLLTIALHGKLEYYTSIMKELLVDLIDASAAKNPKLMLRRTESVV
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pF1KE0 EKLLTNWMSVCLSGFLRETVGEPFYLLVTTLNQKINKGPVDVITCKALYTLNEDWLLWQV
       ::.::::::.:. . :::::::::.::. ...:.:::: .:.:: :: :::.:.::: . 
XP_011 EKMLTNWMSICMYSCLRETVGEPFFLLLCAIKQQINKGSIDAITGKARYTLSEEWLLREN
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        : .   ::: :.    .       ..:: ..: ::. :.::::..::  ::  ::.   
XP_011 IEAKPRNLNVSFQGCGMD-------SLSVRAMDTDTLTQVKEKILEAF-CKN-VPYSQWP
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       . ... ::   .. :. .: :.:..::. :::  ::::..::.: .:...  ... :  :
XP_011 RAEDVDLEWFASSTQSYILRDLDDTSVV-EDGRKKLNTLAHYKIPEGASLAMSLIDKKDN
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XP_011 TLGRVKDLDTEKYFHLVLPTDELAEP--KKSHRQSHRKKVLPEIYLTRLLSTKGTLQKFL
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       . ::..: :. ... :.:.:::::::. :::.. :.:::..:::::::::::::::::::
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XP_011 PQFVFDIDKTDHIDACLSVIAQAFIDACSISDLQLGKDSPTNKLLYAKEIPEYRKIVQRY
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       :: :.:. ::: .::.  :..::.:..:::: .::..:::::  .:              
XP_011 YKQIQDMTPLSEQEMNAHLAEESRKYQNEFNTNVAMAEIYKYAKRYRPQGYRPWPG    
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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