Result of FASTA (ccds) for pF1KB4203
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB4203, 318 aa
  1>>>pF1KB4203 318 - 318 aa - 318 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.1352+/-0.0011; mu= 7.4588+/- 0.064
 mean_var=245.9740+/-56.729, 0's: 0 Z-trim(109.3): 660  B-trim: 5 in 2/50
 Lambda= 0.081777
 statistics sampled from 10013 (10826) to 10013 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.694), E-opt: 0.2 (0.333), width:  16
 Scan time:  2.580

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS11218.1 MAP2K3 gene_id:5606|Hs108|chr17        ( 318) 2123 263.8 1.3e-70
CCDS11217.1 MAP2K3 gene_id:5606|Hs108|chr17        ( 347) 2123 263.8 1.4e-70
CCDS11686.1 MAP2K6 gene_id:5608|Hs108|chr17        ( 334) 1759 220.9 1.1e-57
CCDS82194.1 MAP2K6 gene_id:5608|Hs108|chr17        ( 278) 1623 204.7 6.8e-53
CCDS11162.1 MAP2K4 gene_id:6416|Hs108|chr17        ( 399) 1147 148.8 6.8e-36
CCDS62095.1 MAP2K4 gene_id:6416|Hs108|chr17        ( 410) 1147 148.8 6.9e-36
CCDS42491.1 MAP2K7 gene_id:5609|Hs108|chr19        ( 419)  874 116.6 3.5e-26
CCDS74277.1 MAP2K7 gene_id:5609|Hs108|chr19        ( 435)  874 116.6 3.5e-26
CCDS74278.1 MAP2K7 gene_id:5609|Hs108|chr19        ( 426)  742 101.0 1.7e-21
CCDS55970.1 MAP2K5 gene_id:5607|Hs108|chr15        ( 412)  638 88.7 8.2e-18
CCDS10224.1 MAP2K5 gene_id:5607|Hs108|chr15        ( 448)  638 88.8 8.6e-18
CCDS12120.1 MAP2K2 gene_id:5605|Hs108|chr19        ( 400)  620 86.6 3.5e-17
CCDS10216.1 MAP2K1 gene_id:5604|Hs108|chr15        ( 393)  608 85.2 9.3e-17
CCDS47900.1 STK3 gene_id:6788|Hs108|chr8           ( 491)  496 72.1   1e-12
CCDS59108.1 STK3 gene_id:6788|Hs108|chr8           ( 519)  496 72.1   1e-12
CCDS34290.1 STK10 gene_id:6793|Hs108|chr5          ( 968)  495 72.4 1.6e-12
CCDS13341.1 STK4 gene_id:6789|Hs108|chr20          ( 487)  490 71.4 1.6e-12
CCDS54673.1 TNIK gene_id:23043|Hs108|chr3          (1268)  466 69.1   2e-11
CCDS54674.1 TNIK gene_id:23043|Hs108|chr3          (1276)  466 69.1   2e-11
CCDS54677.1 TNIK gene_id:23043|Hs108|chr3          (1297)  466 69.1 2.1e-11
CCDS54678.1 TNIK gene_id:23043|Hs108|chr3          (1305)  466 69.1 2.1e-11
CCDS54675.1 TNIK gene_id:23043|Hs108|chr3          (1323)  466 69.2 2.1e-11
CCDS54676.1 TNIK gene_id:23043|Hs108|chr3          (1331)  466 69.2 2.1e-11
CCDS54679.1 TNIK gene_id:23043|Hs108|chr3          (1352)  466 69.2 2.1e-11
CCDS46956.1 TNIK gene_id:23043|Hs108|chr3          (1360)  466 69.2 2.1e-11
CCDS45589.1 MINK1 gene_id:50488|Hs108|chr17        (1303)  461 68.6 3.1e-11
CCDS45590.1 MINK1 gene_id:50488|Hs108|chr17        (1312)  461 68.6 3.1e-11
CCDS45588.1 MINK1 gene_id:50488|Hs108|chr17        (1332)  461 68.6 3.2e-11
CCDS82487.1 MAP4K4 gene_id:9448|Hs108|chr2         (1165)  457 68.0   4e-11
CCDS56130.1 MAP4K4 gene_id:9448|Hs108|chr2         (1239)  457 68.0 4.2e-11
CCDS74546.1 MAP4K4 gene_id:9448|Hs108|chr2         (1273)  457 68.1 4.3e-11
CCDS9488.1 STK24 gene_id:8428|Hs108|chr13          ( 443)  443 65.8 7.2e-11
CCDS32001.1 STK24 gene_id:8428|Hs108|chr13         ( 431)  441 65.5 8.4e-11
CCDS76334.1 SLK gene_id:9748|Hs108|chr10           (1204)  447 66.9 9.4e-11
CCDS7553.1 SLK gene_id:9748|Hs108|chr10            (1235)  447 66.9 9.5e-11


>>CCDS11218.1 MAP2K3 gene_id:5606|Hs108|chr17             (318 aa)
 initn: 2123 init1: 2123 opt: 2123  Z-score: 1381.3  bits: 263.8 E(32554): 1.3e-70
Smith-Waterman score: 2123; 100.0% identity (100.0% similar) in 318 aa overlap (1-318:1-318)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB4 MSKPPAPNPTPPRNLDSRTFITIGDRNFEVEADDLVTISELGRGAYGVVEKVRHAQSGTI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MSKPPAPNPTPPRNLDSRTFITIGDRNFEVEADDLVTISELGRGAYGVVEKVRHAQSGTI
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB4 MAVKRIRATVNSQEQKRLLMDLDINMRTVDCFYTVTFYGALFREGDVWICMELMDTSLDK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MAVKRIRATVNSQEQKRLLMDLDINMRTVDCFYTVTFYGALFREGDVWICMELMDTSLDK
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB4 FYRKVLDKNMTIPEDILGEIAVSIVRALEHLHSKLSVIHRDVKPSNVLINKEGHVKMCDF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 FYRKVLDKNMTIPEDILGEIAVSIVRALEHLHSKLSVIHRDVKPSNVLINKEGHVKMCDF
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB4 GISGYLVDSVAKTMDAGCKPYMAPERINPELNQKGYNVKSDVWSLGITMIEMAILRFPYE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 GISGYLVDSVAKTMDAGCKPYMAPERINPELNQKGYNVKSDVWSLGITMIEMAILRFPYE
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB4 SWGTPFQQLKQVVEEPSPQLPADRFSPEFVDFTAQCLRKNPAERMSYLELMEHPFFTLHK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SWGTPFQQLKQVVEEPSPQLPADRFSPEFVDFTAQCLRKNPAERMSYLELMEHPFFTLHK
              250       260       270       280       290       300

              310        
pF1KB4 TKKTDIAAFVKEILGEDS
       ::::::::::::::::::
CCDS11 TKKTDIAAFVKEILGEDS
              310        

>>CCDS11217.1 MAP2K3 gene_id:5606|Hs108|chr17             (347 aa)
 initn: 2123 init1: 2123 opt: 2123  Z-score: 1380.9  bits: 263.8 E(32554): 1.4e-70
Smith-Waterman score: 2123; 100.0% identity (100.0% similar) in 318 aa overlap (1-318:30-347)

                                            10        20        30 
pF1KB4                              MSKPPAPNPTPPRNLDSRTFITIGDRNFEVE
                                    :::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MESPASSQPASMPQSKGKSKRKKDLRISCMSKPPAPNPTPPRNLDSRTFITIGDRNFEVE
               10        20        30        40        50        60

              40        50        60        70        80        90 
pF1KB4 ADDLVTISELGRGAYGVVEKVRHAQSGTIMAVKRIRATVNSQEQKRLLMDLDINMRTVDC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 ADDLVTISELGRGAYGVVEKVRHAQSGTIMAVKRIRATVNSQEQKRLLMDLDINMRTVDC
               70        80        90       100       110       120

             100       110       120       130       140       150 
pF1KB4 FYTVTFYGALFREGDVWICMELMDTSLDKFYRKVLDKNMTIPEDILGEIAVSIVRALEHL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 FYTVTFYGALFREGDVWICMELMDTSLDKFYRKVLDKNMTIPEDILGEIAVSIVRALEHL
              130       140       150       160       170       180

             160       170       180       190       200       210 
pF1KB4 HSKLSVIHRDVKPSNVLINKEGHVKMCDFGISGYLVDSVAKTMDAGCKPYMAPERINPEL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 HSKLSVIHRDVKPSNVLINKEGHVKMCDFGISGYLVDSVAKTMDAGCKPYMAPERINPEL
              190       200       210       220       230       240

             220       230       240       250       260       270 
pF1KB4 NQKGYNVKSDVWSLGITMIEMAILRFPYESWGTPFQQLKQVVEEPSPQLPADRFSPEFVD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 NQKGYNVKSDVWSLGITMIEMAILRFPYESWGTPFQQLKQVVEEPSPQLPADRFSPEFVD
              250       260       270       280       290       300

             280       290       300       310        
pF1KB4 FTAQCLRKNPAERMSYLELMEHPFFTLHKTKKTDIAAFVKEILGEDS
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 FTAQCLRKNPAERMSYLELMEHPFFTLHKTKKTDIAAFVKEILGEDS
              310       320       330       340       

>>CCDS11686.1 MAP2K6 gene_id:5608|Hs108|chr17             (334 aa)
 initn: 1751 init1: 1751 opt: 1759  Z-score: 1148.9  bits: 220.9 E(32554): 1.1e-57
Smith-Waterman score: 1759; 82.7% identity (93.9% similar) in 312 aa overlap (5-316:23-334)

                                 10        20        30        40  
pF1KB4                   MSKPPAPNPTPPRNLDSRTFITIGDRNFEVEADDLVTISELG
                             :  . ::::.:::.. :.::..::::.::::  : :::
CCDS11 MSQSKGKKRNPGLKIPKEAFEQPQTSSTPPRDLDSKACISIGNQNFEVKADDLEPIMELG
               10        20        30        40        50        60

             50        60        70        80        90       100  
pF1KB4 RGAYGVVEKVRHAQSGTIMAVKRIRATVNSQEQKRLLMDLDINMRTVDCFYTVTFYGALF
       :::::::::.::. :: :::::::::::::::::::::::::.:::::: .:::::::::
CCDS11 RGAYGVVEKMRHVPSGQIMAVKRIRATVNSQEQKRLLMDLDISMRTVDCPFTVTFYGALF
               70        80        90       100       110       120

            110       120       130       140       150       160  
pF1KB4 REGDVWICMELMDTSLDKFYRKVLDKNMTIPEDILGEIAVSIVRALEHLHSKLSVIHRDV
       ::::::::::::::::::::..:.::..::::::::.::::::.::::::::::::::::
CCDS11 REGDVWICMELMDTSLDKFYKQVIDKGQTIPEDILGKIAVSIVKALEHLHSKLSVIHRDV
              130       140       150       160       170       180

            170       180       190       200       210       220  
pF1KB4 KPSNVLINKEGHVKMCDFGISGYLVDSVAKTMDAGCKPYMAPERINPELNQKGYNVKSDV
       ::::::::  :.:::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::.::::.
CCDS11 KPSNVLINALGQVKMCDFGISGYLVDSVAKTIDAGCKPYMAPERINPELNQKGYSVKSDI
              190       200       210       220       230       240

            230       240       250       260       270       280  
pF1KB4 WSLGITMIEMAILRFPYESWGTPFQQLKQVVEEPSPQLPADRFSPEFVDFTAQCLRKNPA
       :::::::::.:::::::.:::::::::::::::::::::::.:: ::::::.:::.::  
CCDS11 WSLGITMIELAILRFPYDSWGTPFQQLKQVVEEPSPQLPADKFSAEFVDFTSQCLKKNSK
              250       260       270       280       290       300

            290       300       310        
pF1KB4 ERMSYLELMEHPFFTLHKTKKTDIAAFVKEILGEDS
       :: .: :::.:::::::..: ::.:.::: :::.  
CCDS11 ERPTYPELMQHPFFTLHESKGTDVASFVKLILGD  
              310       320       330      

>>CCDS82194.1 MAP2K6 gene_id:5608|Hs108|chr17             (278 aa)
 initn: 1623 init1: 1623 opt: 1623  Z-score: 1063.1  bits: 204.7 E(32554): 6.8e-53
Smith-Waterman score: 1623; 85.9% identity (95.7% similar) in 277 aa overlap (40-316:2-278)

      10        20        30        40        50        60         
pF1KB4 TPPRNLDSRTFITIGDRNFEVEADDLVTISELGRGAYGVVEKVRHAQSGTIMAVKRIRAT
                                     ::::::::::::.::. :: ::::::::::
CCDS82                              MELGRGAYGVVEKMRHVPSGQIMAVKRIRAT
                                            10        20        30 

      70        80        90       100       110       120         
pF1KB4 VNSQEQKRLLMDLDINMRTVDCFYTVTFYGALFREGDVWICMELMDTSLDKFYRKVLDKN
       :::::::::::::::.:::::: .:::::::::::::::::::::::::::::..:.::.
CCDS82 VNSQEQKRLLMDLDISMRTVDCPFTVTFYGALFREGDVWICMELMDTSLDKFYKQVIDKG
              40        50        60        70        80        90 

     130       140       150       160       170       180         
pF1KB4 MTIPEDILGEIAVSIVRALEHLHSKLSVIHRDVKPSNVLINKEGHVKMCDFGISGYLVDS
       .::::::::.::::::.::::::::::::::::::::::::  :.:::::::::::::::
CCDS82 QTIPEDILGKIAVSIVKALEHLHSKLSVIHRDVKPSNVLINALGQVKMCDFGISGYLVDS
             100       110       120       130       140       150 

     190       200       210       220       230       240         
pF1KB4 VAKTMDAGCKPYMAPERINPELNQKGYNVKSDVWSLGITMIEMAILRFPYESWGTPFQQL
       ::::.::::::::::::::::::::::.::::.:::::::::.:::::::.:::::::::
CCDS82 VAKTIDAGCKPYMAPERINPELNQKGYSVKSDIWSLGITMIELAILRFPYDSWGTPFQQL
             160       170       180       190       200       210 

     250       260       270       280       290       300         
pF1KB4 KQVVEEPSPQLPADRFSPEFVDFTAQCLRKNPAERMSYLELMEHPFFTLHKTKKTDIAAF
       ::::::::::::::.:: ::::::.:::.::  :: .: :::.:::::::..: ::.:.:
CCDS82 KQVVEEPSPQLPADKFSAEFVDFTSQCLKKNSKERPTYPELMQHPFFTLHESKGTDVASF
             220       230       240       250       260       270 

     310        
pF1KB4 VKEILGEDS
       :: :::.  
CCDS82 VKLILGD  
                

>>CCDS11162.1 MAP2K4 gene_id:6416|Hs108|chr17             (399 aa)
 initn: 1153 init1: 589 opt: 1147  Z-score: 757.9  bits: 148.8 E(32554): 6.8e-36
Smith-Waterman score: 1150; 52.3% identity (78.0% similar) in 327 aa overlap (7-316:63-387)

                                       10             20           
pF1KB4                         MSKPPAPNPTPPRN-----LDSRTFITIG------D
                                     ::::  .:     : .... . :      .
CCDS11 AVSSMQGKRKALKLNFANPPFKSTARFTLNPNPTGVQNPHIERLRTHSIESSGKLKISPE
             40        50        60        70        80        90  

          30        40        50        60        70        80     
pF1KB4 RNFEVEADDLVTISELGRGAYGVVEKVRHAQSGTIMAVKRIRATVNSQEQKRLLMDLDIN
       ....  :.::  ..:.:::::: :.:. :  :: ::::::::.::. .:::.::::::. 
CCDS11 QHWDFTAEDLKDLGEIGRGAYGSVNKMVHKPSGQIMAVKRIRSTVDEKEQKQLLMDLDVV
            100       110       120       130       140       150  

          90       100       110       120          130       140  
pF1KB4 MRTVDCFYTVTFYGALFREGDVWICMELMDTSLDKFYR---KVLDKNMTIPEDILGEIAV
       ::. :: : : :::::::::: :::::::.::.::::.   .:::   .:::.:::.:..
CCDS11 MRSSDCPYIVQFYGALFREGDCWICMELMSTSFDKFYKYVYSVLDD--VIPEEILGKITL
            160       170       180       190         200       210

            150       160       170       180       190       200  
pF1KB4 SIVRALEHLHSKLSVIHRDVKPSNVLINKEGHVKMCDFGISGYLVDSVAKTMDAGCKPYM
       . :.::.::. .:..::::.::::.:... :..:.::::::: ::::.::: ::::.:::
CCDS11 ATVKALNHLKENLKIIHRDIKPSNILLDRSGNIKLCDFGISGQLVDSIAKTRDAGCRPYM
              220       230       240       250       260       270

            210       220       230       240       250       260  
pF1KB4 APERINPELNQKGYNVKSDVWSLGITMIEMAILRFPYESWGTPFQQLKQVVEEPSPQLPA
       :::::.:  ...::.:.:::::::::. :.:  :::: .:.. :.:: :::.   :::  
CCDS11 APERIDPSASRQGYDVRSDVWSLGITLYELATGRFPYPKWNSVFDQLTQVVKGDPPQLSN
              280       290       300       310       320       330

               270       280       290       300       310         
pF1KB4 DR---FSPEFVDFTAQCLRKNPAERMSYLELMEHPFFTLHKTKKTDIAAFVKEILGEDS 
       ..   ::: :..:.  :: :. ..: .: ::..:::. ... . ...: .: .:: .   
CCDS11 SEEREFSPSFINFVNLCLTKDESKRPKYKELLKHPFILMYEERAVEVACYVCKILDQMPA
              340       350       360       370       380       390

CCDS11 TPSSPMYVD
                

>>CCDS62095.1 MAP2K4 gene_id:6416|Hs108|chr17             (410 aa)
 initn: 1153 init1: 589 opt: 1147  Z-score: 757.8  bits: 148.8 E(32554): 6.9e-36
Smith-Waterman score: 1150; 52.3% identity (78.0% similar) in 327 aa overlap (7-316:74-398)

                                       10             20           
pF1KB4                         MSKPPAPNPTPPRN-----LDSRTFITIG------D
                                     ::::  .:     : .... . :      .
CCDS62 FCEKAQSKRKALKLNFANPPFKSTARFTLNPNPTGVQNPHIERLRTHSIESSGKLKISPE
            50        60        70        80        90       100   

          30        40        50        60        70        80     
pF1KB4 RNFEVEADDLVTISELGRGAYGVVEKVRHAQSGTIMAVKRIRATVNSQEQKRLLMDLDIN
       ....  :.::  ..:.:::::: :.:. :  :: ::::::::.::. .:::.::::::. 
CCDS62 QHWDFTAEDLKDLGEIGRGAYGSVNKMVHKPSGQIMAVKRIRSTVDEKEQKQLLMDLDVV
           110       120       130       140       150       160   

          90       100       110       120          130       140  
pF1KB4 MRTVDCFYTVTFYGALFREGDVWICMELMDTSLDKFYR---KVLDKNMTIPEDILGEIAV
       ::. :: : : :::::::::: :::::::.::.::::.   .:::   .:::.:::.:..
CCDS62 MRSSDCPYIVQFYGALFREGDCWICMELMSTSFDKFYKYVYSVLDD--VIPEEILGKITL
           170       180       190       200         210       220 

            150       160       170       180       190       200  
pF1KB4 SIVRALEHLHSKLSVIHRDVKPSNVLINKEGHVKMCDFGISGYLVDSVAKTMDAGCKPYM
       . :.::.::. .:..::::.::::.:... :..:.::::::: ::::.::: ::::.:::
CCDS62 ATVKALNHLKENLKIIHRDIKPSNILLDRSGNIKLCDFGISGQLVDSIAKTRDAGCRPYM
             230       240       250       260       270       280 

            210       220       230       240       250       260  
pF1KB4 APERINPELNQKGYNVKSDVWSLGITMIEMAILRFPYESWGTPFQQLKQVVEEPSPQLPA
       :::::.:  ...::.:.:::::::::. :.:  :::: .:.. :.:: :::.   :::  
CCDS62 APERIDPSASRQGYDVRSDVWSLGITLYELATGRFPYPKWNSVFDQLTQVVKGDPPQLSN
             290       300       310       320       330       340 

               270       280       290       300       310         
pF1KB4 DR---FSPEFVDFTAQCLRKNPAERMSYLELMEHPFFTLHKTKKTDIAAFVKEILGEDS 
       ..   ::: :..:.  :: :. ..: .: ::..:::. ... . ...: .: .:: .   
CCDS62 SEEREFSPSFINFVNLCLTKDESKRPKYKELLKHPFILMYEERAVEVACYVCKILDQMPA
             350       360       370       380       390       400 

CCDS62 TPSSPMYVD
             410

>>CCDS42491.1 MAP2K7 gene_id:5609|Hs108|chr19             (419 aa)
 initn: 907 init1: 352 opt: 874  Z-score: 583.6  bits: 116.6 E(32554): 3.5e-26
Smith-Waterman score: 874; 43.5% identity (76.3% similar) in 299 aa overlap (20-316:105-400)

                          10        20        30        40         
pF1KB4            MSKPPAPNPTPPRNLDSRTFITIGDRNFEVEADDLVTISELGRGAYGVV
                                     ..::: . ...: .:: ...:.: :. : :
CCDS42 LGLPSTLFTPRSMESIEIDQKLQEIMKQTGYLTIGGQRYQAEINDLENLGEMGSGTCGQV
           80        90       100       110       120       130    

      50        60        70        80        90       100         
pF1KB4 EKVRHAQSGTIMAVKRIRATVNSQEQKRLLMDLDINMRTVDCFYTVTFYGALFREGDVWI
        :.:  ..: ..:::..: . :..:.::.:::::. ... :: : :  .:... . ::.:
CCDS42 WKMRFRKTGHVIAVKQMRRSGNKEENKRILMDLDVVLKSHDCPYIVQCFGTFITNTDVFI
          140       150       160       170       180       190    

     110       120       130       140       150       160         
pF1KB4 CMELMDTSLDKFYRKVLDKNMTIPEDILGEIAVSIVRALEHLHSKLSVIHRDVKPSNVLI
        :::: :  .:. ...      ::: :::...:.::.:: .:. : .::::::::::.:.
CCDS42 AMELMGTCAEKLKKRMQG---PIPERILGKMTVAIVKALYYLKEKHGVIHRDVKPSNILL
          200       210          220       230       240       250 

     170       180       190       200        210       220        
pF1KB4 NKEGHVKMCDFGISGYLVDSVAKTMDAGCKPYMAPERINP-ELNQKGYNVKSDVWSLGIT
       ...:..:.::::::: :::: ::: .:::  :::::::.: . ..  :....:::::::.
CCDS42 DERGQIKLCDFGISGRLVDSKAKTRSAGCAAYMAPERIDPPDPTKPDYDIRADVWSLGIS
             260       270       280       290       300       310 

      230       240       250       260        270       280       
pF1KB4 MIEMAILRFPYESWGTPFQQLKQVVEEPSPQLPADR-FSPEFVDFTAQCLRKNPAERMSY
       ..:.:  .:::..  : :. : .:..:  : ::.   :: .: .:. .:: :.  .: .:
CCDS42 LVELATGQFPYKNCKTDFEVLTKVLQEEPPLLPGHMGFSGDFQSFVKDCLTKDHRKRPKY
             320       330       340       350       360       370 

       290       300       310                         
pF1KB4 LELMEHPFFTLHKTKKTDIAAFVKEILGEDS                 
        .:.:: :.  ..: ..:.:.. :.....                   
CCDS42 NKLLEHSFIKRYETLEVDVASWFKDVMAKTESPRTSGVLSQPHLPFFR
             380       390       400       410         

>>CCDS74277.1 MAP2K7 gene_id:5609|Hs108|chr19             (435 aa)
 initn: 907 init1: 352 opt: 874  Z-score: 583.5  bits: 116.6 E(32554): 3.5e-26
Smith-Waterman score: 874; 43.5% identity (76.3% similar) in 299 aa overlap (20-316:121-416)

                          10        20        30        40         
pF1KB4            MSKPPAPNPTPPRNLDSRTFITIGDRNFEVEADDLVTISELGRGAYGVV
                                     ..::: . ...: .:: ...:.: :. : :
CCDS74 LGLPSTLFTPRSMESIEIDQKLQEIMKQTGYLTIGGQRYQAEINDLENLGEMGSGTCGQV
              100       110       120       130       140       150

      50        60        70        80        90       100         
pF1KB4 EKVRHAQSGTIMAVKRIRATVNSQEQKRLLMDLDINMRTVDCFYTVTFYGALFREGDVWI
        :.:  ..: ..:::..: . :..:.::.:::::. ... :: : :  .:... . ::.:
CCDS74 WKMRFRKTGHVIAVKQMRRSGNKEENKRILMDLDVVLKSHDCPYIVQCFGTFITNTDVFI
              160       170       180       190       200       210

     110       120       130       140       150       160         
pF1KB4 CMELMDTSLDKFYRKVLDKNMTIPEDILGEIAVSIVRALEHLHSKLSVIHRDVKPSNVLI
        :::: :  .:. ...      ::: :::...:.::.:: .:. : .::::::::::.:.
CCDS74 AMELMGTCAEKLKKRMQG---PIPERILGKMTVAIVKALYYLKEKHGVIHRDVKPSNILL
              220          230       240       250       260       

     170       180       190       200        210       220        
pF1KB4 NKEGHVKMCDFGISGYLVDSVAKTMDAGCKPYMAPERINP-ELNQKGYNVKSDVWSLGIT
       ...:..:.::::::: :::: ::: .:::  :::::::.: . ..  :....:::::::.
CCDS74 DERGQIKLCDFGISGRLVDSKAKTRSAGCAAYMAPERIDPPDPTKPDYDIRADVWSLGIS
       270       280       290       300       310       320       

      230       240       250       260        270       280       
pF1KB4 MIEMAILRFPYESWGTPFQQLKQVVEEPSPQLPADR-FSPEFVDFTAQCLRKNPAERMSY
       ..:.:  .:::..  : :. : .:..:  : ::.   :: .: .:. .:: :.  .: .:
CCDS74 LVELATGQFPYKNCKTDFEVLTKVLQEEPPLLPGHMGFSGDFQSFVKDCLTKDHRKRPKY
       330       340       350       360       370       380       

       290       300       310                         
pF1KB4 LELMEHPFFTLHKTKKTDIAAFVKEILGEDS                 
        .:.:: :.  ..: ..:.:.. :.....                   
CCDS74 NKLLEHSFIKRYETLEVDVASWFKDVMAKTESPRTSGVLSQPHLPFFR
       390       400       410       420       430     

>>CCDS74278.1 MAP2K7 gene_id:5609|Hs108|chr19             (426 aa)
 initn: 854 init1: 352 opt: 742  Z-score: 499.4  bits: 101.0 E(32554): 1.7e-21
Smith-Waterman score: 850; 42.5% identity (74.5% similar) in 306 aa overlap (20-316:105-407)

                          10        20        30        40         
pF1KB4            MSKPPAPNPTPPRNLDSRTFITIGDRNFEVEADDLVTISELGRGAYGVV
                                     ..::: . ...: .:: ...:.: :. : :
CCDS74 LGLPSTLFTPRSMESIEIDQKLQEIMKQTGYLTIGGQRYQAEINDLENLGEMGSGTCGQV
           80        90       100       110       120       130    

      50        60        70        80        90       100         
pF1KB4 EKVRHAQSGTIMAVKRIRATVNSQEQKRLLMDLDINMRTVDCFYTVTFYGALFREGDVWI
        :.:  ..: ..:::..: . :..:.::.:::::. ... :: : :  .:... . ::.:
CCDS74 WKMRFRKTGHVIAVKQMRRSGNKEENKRILMDLDVVLKSHDCPYIVQCFGTFITNTDVFI
          140       150       160       170       180       190    

     110       120       130       140       150       160         
pF1KB4 CMELMDTSLDKFYRKVLDKNMTIPEDILGEIAVSIVRALEHLHSKLSVIHRDVKPSNVLI
        :::: :  .:. ...      ::: :::...:.::.:: .:. : .::::::::::.:.
CCDS74 AMELMGTCAEKLKKRMQG---PIPERILGKMTVAIVKALYYLKEKHGVIHRDVKPSNILL
          200       210          220       230       240       250 

     170       180       190       200        210       220        
pF1KB4 NKEGHVKMCDFGISGYLVDSVAKTMDAGCKPYMAPERINP-ELNQKGYNVKSDVWSLGIT
       ...:..:.::::::: :::: ::: .:::  :::::::.: . ..  :....:::::::.
CCDS74 DERGQIKLCDFGISGRLVDSKAKTRSAGCAAYMAPERIDPPDPTKPDYDIRADVWSLGIS
             260       270       280       290       300       310 

             230       240       250       260        270       280
pF1KB4 M-------IEMAILRFPYESWGTPFQQLKQVVEEPSPQLPADR-FSPEFVDFTAQCLRKN
       .       .:.:  .:::..  : :. : .:..:  : ::.   :: .: .:. .:: :.
CCDS74 LPCPSPSQVELATGQFPYKNCKTDFEVLTKVLQEEPPLLPGHMGFSGDFQSFVKDCLTKD
             320       330       340       350       360       370 

              290       300       310                         
pF1KB4 PAERMSYLELMEHPFFTLHKTKKTDIAAFVKEILGEDS                 
         .: .: .:.:: :.  ..: ..:.:.. :.....                   
CCDS74 HRKRPKYNKLLEHSFIKRYETLEVDVASWFKDVMAKTESPRTSGVLSQPHLPFFR
             380       390       400       410       420      

>>CCDS55970.1 MAP2K5 gene_id:5607|Hs108|chr15             (412 aa)
 initn: 733 init1: 188 opt: 638  Z-score: 433.2  bits: 88.7 E(32554): 8.2e-18
Smith-Waterman score: 739; 43.7% identity (68.5% similar) in 302 aa overlap (2-295:96-382)

                                            10         20        30
pF1KB4                              MSKPPAPNPTPPRNLD-SRTFITIGDRNFEV
                                     :.: . .  :  .:  : . .     : ..
CCDS55 LQIFPRACKPPGERNIHGLKVNTRAGPSQHSSPAVSDSLPSNSLKKSSAELKKILANGQM
          70        80        90       100       110       120     

               40        50        60        70        80        90
pF1KB4 EADDLVTISELGRGAYGVVEKVRHAQSGTIMAVKRIRATVNSQEQKRLLMDLDINMRTVD
       . .:.   . ::.:  :.: :. :. :: :.::: :   .. . ::... .:.: .   :
CCDS55 NEQDIRYRDTLGHGNGGTVYKAYHVPSGKILAVKVILLDITLELQKQIMSELEI-LYKCD
         130       140       150       160       170        180    

              100       110        120       130       140         
pF1KB4 CFYTVTFYGALFREGDVWICMELMDT-SLDKFYRKVLDKNMTIPEDILGEIAVSIVRALE
         : . ::::.: :. . :: :.::  :::  :::       .:: .::.:::..:..: 
CCDS55 SSYIIGFYGAFFVENRISICTEFMDGGSLD-VYRK-------MPEHVLGRIAVAVVKGLT
          190       200       210               220       230      

     150       160       170       180       190       200         
pF1KB4 HLHSKLSVIHRDVKPSNVLINKEGHVKMCDFGISGYLVDSVAKTMDAGCKPYMAPERINP
       .: : :...::::::::.:.: .:.::.::::.:  ::.:.:::. .: . :::::::. 
CCDS55 YLWS-LKILHRDVKPSNMLVNTRGQVKLCDFGVSTQLVNSIAKTY-VGTNAYMAPERISG
        240        250       260       270       280        290    

     210       220       230           240         250       260   
pF1KB4 ELNQKGYNVKSDVWSLGITMIEMAILRFPY----ESWGT--PFQQLKQVVEEPSPQLPAD
       :     :...::::::::...:.:. ::::    .. :.  :.: :. .:.: :: ::. 
CCDS55 EQ----YGIHSDVWSLGISFMELALGRFPYPQIQKNQGSLMPLQLLQCIVDEDSPVLPVG
              300       310       320       330       340       350

           270       280       290       300       310             
pF1KB4 RFSPEFVDFTAQCLRKNPAERMSYLELMEHPFFTLHKTKKTDIAAFVKEILGEDS     
       .::  :: : .::.::.: :: .  ::: :::                            
CCDS55 EFSEPFVHFITQCMRKQPKERPAPEELMGHPFIVQFNDGNAAVVSMWVCRALEERRSQQG
              360       370       380       390       400       410

CCDS55 PP
         




318 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Fri Nov  4 20:43:24 2016 done: Fri Nov  4 20:43:24 2016
 Total Scan time:  2.580 Total Display time:  0.040

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
Inquiries or Suggestions ?
Send a message to flexiclone AT kazusagt.com