Result of FASTA (omim) for pF1KB3289
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB3289, 803 aa
  1>>>pF1KB3289 803 - 803 aa - 803 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.9838+/-0.00109; mu= 8.9427+/- 0.067
 mean_var=375.4577+/-69.654, 0's: 0 Z-trim(109.9): 2073  B-trim: 104 in 2/49
 Lambda= 0.066190
 statistics sampled from 15773 (18107) to 15773 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.526), E-opt: 0.2 (0.212), width:  16
 Scan time:  9.660

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
XP_016881640 (OMIM: 604750) PREDICTED: zinc finger ( 669) 3316 332.9 2.7e-90
XP_016881639 (OMIM: 604750) PREDICTED: zinc finger ( 688) 3316 333.0 2.8e-90
XP_006723037 (OMIM: 604750) PREDICTED: zinc finger ( 700) 3316 333.0 2.8e-90
NP_001138296 (OMIM: 604750) zinc finger protein 23 ( 700) 3316 333.0 2.8e-90
XP_016881638 (OMIM: 604750) PREDICTED: zinc finger ( 700) 3316 333.0 2.8e-90
NP_006621 (OMIM: 604750) zinc finger protein 234 [ ( 700) 3316 333.0 2.8e-90
XP_016881641 (OMIM: 604750) PREDICTED: zinc finger ( 502) 3047 307.1 1.3e-82
XP_016881642 (OMIM: 604750) PREDICTED: zinc finger ( 502) 3047 307.1 1.3e-82
XP_006722943 (OMIM: 603971) PREDICTED: zinc finger (1092) 2347 240.7 2.5e-62
XP_011526568 (OMIM: 603971) PREDICTED: zinc finger (1092) 2347 240.7 2.5e-62
XP_016882725 (OMIM: 603971) PREDICTED: zinc finger (1118) 2347 240.8 2.6e-62
XP_016882724 (OMIM: 603971) PREDICTED: zinc finger (1150) 2347 240.8 2.6e-62
XP_011526567 (OMIM: 603971) PREDICTED: zinc finger (1150) 2347 240.8 2.6e-62
NP_001287880 (OMIM: 603971) zinc finger protein 91 (1159) 2347 240.8 2.6e-62
NP_003421 (OMIM: 603971) zinc finger protein 91 is (1191) 2347 240.8 2.6e-62
NP_001243580 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 ( 744) 2327 238.6 7.8e-62
NP_001243583 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 ( 744) 2327 238.6 7.8e-62
XP_016882696 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2327 238.6 8.1e-62
XP_011526559 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2327 238.6 8.1e-62
XP_016882699 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2327 238.6 8.1e-62
NP_001243578 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 ( 803) 2327 238.6 8.1e-62
XP_011526561 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2327 238.6 8.1e-62
NP_001243579 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 ( 803) 2327 238.6 8.1e-62
XP_016882697 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2327 238.6 8.1e-62
XP_016882701 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2327 238.6 8.1e-62
XP_016882703 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2327 238.6 8.1e-62
XP_016882700 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2327 238.6 8.1e-62
XP_016882698 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2327 238.6 8.1e-62
NP_001243577 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 ( 803) 2327 238.6 8.1e-62
XP_016882702 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2327 238.6 8.1e-62
XP_016882705 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2327 238.6 8.1e-62
XP_016882704 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2327 238.6 8.1e-62
NP_003414 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 is ( 809) 2327 238.6 8.1e-62
NP_001243582 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 ( 818) 2327 238.6 8.2e-62
NP_001073878 (OMIM: 603981) zinc finger protein 99 ( 864) 2297 235.8 6.1e-61
NP_001309068 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 782) 2252 231.4 1.1e-59
NP_001309066 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 782) 2252 231.4 1.1e-59
NP_001309067 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 782) 2252 231.4 1.1e-59
NP_001096073 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 2252 231.5 1.2e-59
NP_001309058 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 2252 231.5 1.2e-59
NP_001309060 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 2252 231.5 1.2e-59
NP_001309062 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 2252 231.5 1.2e-59
NP_942596 (OMIM: 600398) zinc finger protein 160 i ( 818) 2252 231.5 1.2e-59
NP_001309059 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 2252 231.5 1.2e-59
XP_016882935 (OMIM: 600398) PREDICTED: zinc finger ( 818) 2252 231.5 1.2e-59
NP_001309061 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 2252 231.5 1.2e-59
NP_001309063 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 2252 231.5 1.2e-59
NP_001309057 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 2252 231.5 1.2e-59
NP_001309064 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 2252 231.5 1.2e-59
NP_150630 (OMIM: 600398) zinc finger protein 160 i ( 818) 2252 231.5 1.2e-59


>>XP_016881640 (OMIM: 604750) PREDICTED: zinc finger pro  (669 aa)
 initn: 5166 init1: 3037 opt: 3316  Z-score: 1742.0  bits: 332.9 E(85289): 2.7e-90
Smith-Waterman score: 3417; 63.7% identity (74.6% similar) in 804 aa overlap (1-803:1-669)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB3 MNMFKEAVTFKDVAVAFTEEELGLLGPAQRKLYRDVMVENFRNLLSVGHPPFKQDVSPIE
       :. :::..:::::::.::::::::: :.::.::.:::.:::::::::.            
XP_016 MTTFKEGLTFKDVAVVFTEEELGLLDPVQRNLYQDVMLENFRNLLSVA------------
               10        20        30        40                    

               70        80        90       100       110       120
pF1KB3 RNEQLWIMTTATRRQGNLGEKNQSKLITVQDRESEEELSCWQIWQQIANDLTRCQDSMIN
                          .: ::.. :: .   .:::   :::.:::.:: . .::::.
XP_016 -------------------DKIQSEVETVPEAGRHEELYWGQIWKQIASDLIKYEDSMIS
                          50        60        70        80         

              130       140       150       160       170       180
pF1KB3 NSQCHKQGDFPYQVGTELSIQISEDENYIVNKADGPNNTGNPEFPILRTQDSWRKTFLTE
        :.  .:::.                                                  
XP_016 ISRFPRQGDLS-------------------------------------------------
      90       100                                                 

              190       200       210       220       230       240
pF1KB3 SQRLNRDQQISIKNKLCQCKKGVDPIGWISHHDGHRVHKSEKSYRPNDYEKDNMKILTFD
                       :: . :.                    :                
XP_016 ----------------CQVRAGL--------------------YTT--------------
                                                  110              

              250       260       270       280       290       300
pF1KB3 HNSMIHTGQKSYQCNECKKPFSDLSSFDLHQQLQSGEKSLTCVERGKGFCYSPVLPVHQK
            ::::: :::.: :: :.:. .:::::::.::::: :: : ::.:::  .: .::.
XP_016 -----HTGQKFYQCDEYKKSFTDVFNFDLHQQLHSGEKSHTCDECGKSFCYISALHIHQR
                   120       130       140       150       160     

               310       320       330       340       350         
pF1KB3 VHVGEK-LKCDECGKEFSQGAHLQTHQKVHVIEKPYKCKQCGKGFSRRSALNVHCKVHTA
       ::.:::  ::: :::::::..::::::.::..:::.:: .:::::::::.:.::::.:..
XP_016 VHMGEKCYKCDVCGKEFSQSSHLQTHQRVHTVEKPFKCVECGKGFSRRSTLTVHCKLHSG
         170       180       190       200       210       220     

     360       370       380       390       400       410         
pF1KB3 EKPYNCEECGRAFSQASHLQDHQRLHTGEKPFKCDACGKSFSRNSHLQSHQRVHTGEKPY
       ::::::::::::: .:::::.:::.::::::::::.:::.: : : :..:  ::::::::
XP_016 EKPYNCEECGRAFIHASHLQEHQRIHTGEKPFKCDTCGKNFRRRSALNNHCMVHTGEKPY
         230       240       250       260       270       280     

     420       430       440       450       460       470         
pF1KB3 KCEECGKGFICSSNLYIHQRVHTGEKPYKCEECGKGFSRPSSLQAHQGVHTGEKSYICTV
       :::.::: : ::::: ::::::::::::::::::: : .::..:::. .::::: :.: :
XP_016 KCEDCGKCFTCSSNLRIHQRVHTGEKPYKCEECGKCFIQPSQFQAHRRIHTGEKPYVCKV
         290       300       310       320       330       340     

     480       490       500       510       520       530         
pF1KB3 CGKGFTLSSNLQAHQRVHTGEKPYKCNECGKSFRRNSHYQVHLVVHTGEKPYKCEICGKG
       :::::  ::..:::: :::::::::::::::::: . ::::::::::::::::::.:::.
XP_016 CGKGFIYSSSFQAHQGVHTGEKPYKCNECGKSFRMKIHYQVHLVVHTGEKPYKCEVCGKA
         350       360       370       380       390       400     

     540       550       560       570       580       590         
pF1KB3 FSQSSYLQIHQKAHSIEKPFKCEECGQGFNQSSRLQIHQLIHTGEKPYKCEECGKGFSRR
       : :::::.:: ::::..:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 FRQSSYLKIHLKAHSVQKPFKCEECGQGFNQSSRLQIHQLIHTGEKPYKCEECGKGFSRR
         410       420       430       440       450       460     

     600       610       620       630       640       650         
pF1KB3 ADLKIHCRIHTGEKPYNCEECGKVFRQASNLLAHQRVHSGEKPFKCEECGKSFGRSAHLQ
       ::::::::::::::::::::::::: :::.::.::::::::::::::::::::.::::::
XP_016 ADLKIHCRIHTGEKPYNCEECGKVFSQASHLLTHQRVHSGEKPFKCEECGKSFSRSAHLQ
         470       480       490       500       510       520     

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pF1KB3 AHQKVHTGDKPYKCDECGKGFKWSLNLDMHQRVHTGEKPYKCGECGKYFSQASSLQLHQS
       ::::::::.::::: ::::::::::::::::::::::::: ::::::.::::::::::::
XP_016 AHQKVHTGEKPYKCGECGKGFKWSLNLDMHQRVHTGEKPYTCGECGKHFSQASSLQLHQS
         530       540       550       560       570       580     

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pF1KB3 VHTGEKPYKCDVCGKVFSRSSQLQSHQRVHTGEKPYKCEICGKSFSWRSNLTVHHRIHVG
       :::::::::::::::::::::::: :.:::::::::::::::: :::::::. ::.::..
XP_016 VHTGEKPYKCDVCGKVFSRSSQLQYHRRVHTGEKPYKCEICGKRFSWRSNLVSHHKIHAA
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     780       790       800   
pF1KB3 DKSYKSNRGGKNIRESTQEKKSIK
          :......::::: ..  .: .
XP_016 GTFYENDENSKNIRELSEGGSSTR
         650       660         

>>XP_016881639 (OMIM: 604750) PREDICTED: zinc finger pro  (688 aa)
 initn: 5166 init1: 3037 opt: 3316  Z-score: 1741.9  bits: 333.0 E(85289): 2.8e-90
Smith-Waterman score: 3508; 64.8% identity (76.6% similar) in 804 aa overlap (1-803:1-688)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB3 MNMFKEAVTFKDVAVAFTEEELGLLGPAQRKLYRDVMVENFRNLLSVGHPPFKQDVSPIE
       :. :::..:::::::.::::::::: :.::.::.:::.:::::::::            :
XP_016 MTTFKEGLTFKDVAVVFTEEELGLLDPVQRNLYQDVMLENFRNLLSV------------E
               10        20        30        40                    

               70        80        90       100       110       120
pF1KB3 RNEQLWIMTTATRRQGNLGEKNQSKLITVQDRESEEELSCWQIWQQIANDLTRCQDSMIN
       ....: :: :::.:.:. ..: ::.. :: .   .:::   :::.:::.:: . .::::.
XP_016 KEKKLDIMKTATQRKGKSADKIQSEVETVPEAGRHEELYWGQIWKQIASDLIKYEDSMIS
       50        60        70        80        90       100        

              130       140       150       160       170       180
pF1KB3 NSQCHKQGDFPYQVGTELSIQISEDENYIVNKADGPNNTGNPEFPILRTQDSWRKTFLTE
        :.  .:::.                                                  
XP_016 ISRFPRQGDLS-------------------------------------------------
      110                                                          

              190       200       210       220       230       240
pF1KB3 SQRLNRDQQISIKNKLCQCKKGVDPIGWISHHDGHRVHKSEKSYRPNDYEKDNMKILTFD
                       :: . :.                    :                
XP_016 ----------------CQVRAGL--------------------YTT--------------
                     120                                           

              250       260       270       280       290       300
pF1KB3 HNSMIHTGQKSYQCNECKKPFSDLSSFDLHQQLQSGEKSLTCVERGKGFCYSPVLPVHQK
            ::::: :::.: :: :.:. .:::::::.::::: :: : ::.:::  .: .::.
XP_016 -----HTGQKFYQCDEYKKSFTDVFNFDLHQQLHSGEKSHTCDECGKSFCYISALHIHQR
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pF1KB3 DKSYKSNRGGKNIRESTQEKKSIK
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XP_006 GTFYENDENSKNIRELSEGGSSTR
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>>NP_001138296 (OMIM: 604750) zinc finger protein 234 [H  (700 aa)
 initn: 5166 init1: 3037 opt: 3316  Z-score: 1741.8  bits: 333.0 E(85289): 2.8e-90
Smith-Waterman score: 3591; 65.7% identity (77.7% similar) in 804 aa overlap (1-803:1-700)

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pF1KB3 MNMFKEAVTFKDVAVAFTEEELGLLGPAQRKLYRDVMVENFRNLLSVGHPPFKQDVSPIE
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NP_001 MTTFKEGLTFKDVAVVFTEEELGLLDPVQRNLYQDVMLENFRNLLSVGHHPFKHDVFLLE
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NP_001 ----------------CQVRAGL--------------------YTT--------------
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pF1KB3 EKPYNCEECGRAFSQASHLQDHQRLHTGEKPFKCDACGKSFSRNSHLQSHQRVHTGEKPY
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pF1KB3 CGKGFTLSSNLQAHQRVHTGEKPYKCNECGKSFRRNSHYQVHLVVHTGEKPYKCEICGKG
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NP_001 CGKGFIYSSSFQAHQGVHTGEKPYKCNECGKSFRMKIHYQVHLVVHTGEKPYKCEVCGKA
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       : :::::.:: ::::..:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::: :::.::.::::::::::::::::::::.::::::
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       ::::::::.::::: ::::::::::::::::::::::::: ::::::.::::::::::::
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       :::::::::::::::::::::::: :.:::::::::::::::: :::::::. ::.::..
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          :......::::: ..  .: .
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        :.  .:::.                                                  
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       ::.:::  ::: :::::::..::::::.::..:::.:: .:::::::::.:.::::.:..
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       ::::::::::::: .:::::.:::.::::::::::.:::.: : : :..:  ::::::::
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pF1KB3 CGKGFTLSSNLQAHQRVHTGEKPYKCNECGKSFRRNSHYQVHLVVHTGEKPYKCEICGKG
       :::::  ::..:::: :::::::::::::::::: . ::::::::::::::::::.:::.
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pF1KB3 FSQSSYLQIHQKAHSIEKPFKCEECGQGFNQSSRLQIHQLIHTGEKPYKCEECGKGFSRR
       : :::::.:: ::::..:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::: :::.::.::::::::::::::::::::.::::::
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       ::::::::.::::: ::::::::::::::::::::::::: ::::::.::::::::::::
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pF1KB3 DKSYKSNRGGKNIRESTQEKKSIK
          :......::::: ..  .: .
XP_016 GTFYENDENSKNIRELSEGGSSTR
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>>NP_006621 (OMIM: 604750) zinc finger protein 234 [Homo  (700 aa)
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Smith-Waterman score: 3591; 65.7% identity (77.7% similar) in 804 aa overlap (1-803:1-700)

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pF1KB3 MNMFKEAVTFKDVAVAFTEEELGLLGPAQRKLYRDVMVENFRNLLSVGHPPFKQDVSPIE
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pF1KB3 RNEQLWIMTTATRRQGNLGEKNQSKLITVQDRESEEELSCWQIWQQIANDLTRCQDSMIN
       ....: :: :::.:.:. ..: ::.. :: .   .:::   :::.:::.:: . .::::.
NP_006 KEKKLDIMKTATQRKGKSADKIQSEVETVPEAGRHEELYWGQIWKQIASDLIKYEDSMIS
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        :.  .:::.                                                  
NP_006 ISRFPRQGDLS-------------------------------------------------
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NP_006 ----------------CQVRAGL--------------------YTT--------------
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pF1KB3 VHVGEK-LKCDECGKEFSQGAHLQTHQKVHVIEKPYKCKQCGKGFSRRSALNVHCKVHTA
       ::.:::  ::: :::::::..::::::.::..:::.:: .:::::::::.:.::::.:..
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pF1KB3 CGKGFTLSSNLQAHQRVHTGEKPYKCNECGKSFRRNSHYQVHLVVHTGEKPYKCEICGKG
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NP_006 VHTGEKPYKCDVCGKVFSRSSQLQYHRRVHTGEKPYKCEICGKRFSWRSNLVSHHKIHAA
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pF1KB3 DKSYKSNRGGKNIRESTQEKKSIK
          :......::::: ..  .: .
NP_006 GTFYENDENSKNIRELSEGGSSTR
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>>XP_016881641 (OMIM: 604750) PREDICTED: zinc finger pro  (502 aa)
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                                     .:::  ::: :::::::..::::::.::..
XP_016                               MGEKCYKCDVCGKEFSQSSHLQTHQRVHTV
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       :::.:: .:::::::::.:.::::.:..::::::::::::: .:::::.:::.:::::::
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       :::.:::.: : : :..:  :::::::::::.::: : ::::: ::::::::::::::::
XP_016 KCDTCGKNFRRRSALNNHCMVHTGEKPYKCEDCGKCFTCSSNLRIHQRVHTGEKPYKCEE
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       ::: : .::..:::. .::::: :.: ::::::  ::..:::: ::::::::::::::::
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       :: . ::::::::::::::::::.:::.: :::::.:: ::::..:::::::::::::::
XP_016 FRMKIHYQVHLVVHTGEKPYKCEVCGKAFRQSSYLKIHLKAHSVQKPFKCEECGQGFNQS
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::.::
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       .::::::::::::::::::::.::::::::::::::.::::: :::::::::::::::::
XP_016 THQRVHSGEKPFKCEECGKSFSRSAHLQAHQKVHTGEKPYKCGECGKGFKWSLNLDMHQR
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       :::::::: ::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::: :.:::::
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pF1KB3 EKPYKCEICGKSFSWRSNLTVHHRIHVGDKSYKSNRGGKNIRESTQEKKSIK
       ::::::::::: :::::::. ::.::..   :......::::: ..  .: .
XP_016 EKPYKCEICGKRFSWRSNLVSHHKIHAAGTFYENDENSKNIRELSEGGSSTR
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>>XP_016881642 (OMIM: 604750) PREDICTED: zinc finger pro  (502 aa)
 initn: 5075 init1: 3037 opt: 3047  Z-score: 1604.4  bits: 307.1 E(85289): 1.3e-82
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XP_016                               MGEKCYKCDVCGKEFSQSSHLQTHQRVHTV
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pF1KB3 EKPYKCKQCGKGFSRRSALNVHCKVHTAEKPYNCEECGRAFSQASHLQDHQRLHTGEKPF
       :::.:: .:::::::::.:.::::.:..::::::::::::: .:::::.:::.:::::::
XP_016 EKPFKCVECGKGFSRRSTLTVHCKLHSGEKPYNCEECGRAFIHASHLQEHQRIHTGEKPF
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pF1KB3 KCDACGKSFSRNSHLQSHQRVHTGEKPYKCEECGKGFICSSNLYIHQRVHTGEKPYKCEE
       :::.:::.: : : :..:  :::::::::::.::: : ::::: ::::::::::::::::
XP_016 KCDTCGKNFRRRSALNNHCMVHTGEKPYKCEDCGKCFTCSSNLRIHQRVHTGEKPYKCEE
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       ::: : .::..:::. .::::: :.: ::::::  ::..:::: ::::::::::::::::
XP_016 CGKCFIQPSQFQAHRRIHTGEKPYVCKVCGKGFIYSSSFQAHQGVHTGEKPYKCNECGKS
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pF1KB3 FRRNSHYQVHLVVHTGEKPYKCEICGKGFSQSSYLQIHQKAHSIEKPFKCEECGQGFNQS
       :: . ::::::::::::::::::.:::.: :::::.:: ::::..:::::::::::::::
XP_016 FRMKIHYQVHLVVHTGEKPYKCEVCGKAFRQSSYLKIHLKAHSVQKPFKCEECGQGFNQS
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::.::
XP_016 SRLQIHQLIHTGEKPYKCEECGKGFSRRADLKIHCRIHTGEKPYNCEECGKVFSQASHLL
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       .::::::::::::::::::::.::::::::::::::.::::: :::::::::::::::::
XP_016 THQRVHSGEKPFKCEECGKSFSRSAHLQAHQKVHTGEKPYKCGECGKGFKWSLNLDMHQR
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pF1KB3 VHTGEKPYKCGECGKYFSQASSLQLHQSVHTGEKPYKCDVCGKVFSRSSQLQSHQRVHTG
       :::::::: ::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::: :.:::::
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pF1KB3 EKPYKCEICGKSFSWRSNLTVHHRIHVGDKSYKSNRGGKNIRESTQEKKSIK
       ::::::::::: :::::::. ::.::..   :......::::: ..  .: .
XP_016 EKPYKCEICGKRFSWRSNLVSHHKIHAAGTFYENDENSKNIRELSEGGSSTR
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>>XP_006722943 (OMIM: 603971) PREDICTED: zinc finger pro  (1092 aa)
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XP_006 CGKAFNWSSSLTKHKRFHTREKPFKCKECGKAFIW-SSTLTRHKRIHTGEKPYKCEECGK
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pF1KB3 PIGWISHHDGHRV-HKSEKSYRPNDYEKDNMKILTFDHNSMIHTGQKSYQCNECKKPFSD
        .   :    :.. : .:: :. ..  :   . ::......::. .: :.:.:: : :..
XP_006 AFRQSSTLTKHKIIHTGEKPYKFEECGKAFRQSLTLNKHKIIHSREKPYKCKECGKAFKQ
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pF1KB3 LSSFDLHQQLQSGEKSLTCVERGKGFCYSPVLPVHQKVHVGEK-LKCDECGKEFSQGAHL
       .:..  :. ...:.:   : : ::.: .:  : .:. .:.:::  ::.:::: :  .. :
XP_006 FSTLTTHKIIHAGKKLYKCEECGKAFNHSSSLSTHKIIHTGEKSYKCEECGKAFLWSSTL
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pF1KB3 QTHQKVHVIEKPYKCKQCGKGFSRRSALNVHCKVHTAEKPYNCEECGRAFSQASHLQDHQ
       . :...:. ::::::..:::.::. :::  : ..::.::::.:.:::.:::..: : .:.
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pF1KB3 RLHTGEKPFKCDACGKSFSRNSHLQSHQRVHTGEKPYKCEECGKGFICSSNLYIHQRVHT
         :: :::.::  : :.:.: : : .:. .:.::: ::::::::.:  :::: ::. .::
XP_006 ITHTEEKPYKCKECDKTFKRLSTLTKHKIIHAGEKLYKCEECGKAFNRSSNLTIHKFIHT
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pF1KB3 GEKPYKCEECGKGFSRPSSLQAHQGVHTGEKSYICTVCGKGFTLSSNLQAHQRVHTGEKP
       ::::::::::::.:.  :::  :. .:: :: . :  :::.:  ::.:  :.:.::::::
XP_006 GEKPYKCEECGKAFNWSSSLTKHKRIHTREKPFKCKECGKAFIWSSTLTRHKRIHTGEKP
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pF1KB3 YKCNECGKSFRRNSHYQVHLVVHTGEKPYKCEICGKGFSQSSYLQIHQKAHSIEKPFKCE
       :::.::::.: :.:    : ..:::::::::. :::.:..:: :  :.  :. :: .:::
XP_006 YKCEECGKAFSRSSTLTKHKTIHTGEKPYKCKECGKAFKHSSALAKHKIIHAGEKLYKCE
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pF1KB3 ECGQGFNQSSRLQIHQLIHTGEKP----------------------------YKCEECGK
       :::..::::: :  :..::: :::                            ::::::::
XP_006 ECGKAFNQSSNLTTHKIIHTKEKPSKSEECDKAFIWSSTLTEHKRIHTREKTYKCEECGK
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pF1KB3 GFSRRADLKIHCRIHTGEKPYNCEECGKVFRQASNLLAHQRVHSGEKPFKCEECGKSFGR
       .::. . :  : :.:::::::.::::::.: :.:.: .:. .:.::::.:::::::.: .
XP_006 AFSQPSHLTTHKRMHTGEKPYKCEECGKAFSQSSTLTTHKIIHTGEKPYKCEECGKAFRK
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pF1KB3 SAHLQAHQKVHTGDKPYKCDECGKGFKWSLNLDMHQRVHTGEKPYKCGECGKYFSQASSL
       :. :  :. .:::.:::::.::::.:. : .:  : :.::::::::: :::: :...:.:
XP_006 SSTLTEHKIIHTGEKPYKCEECGKAFSQSSTLTRHTRMHTGEKPYKCEECGKAFNRSSKL
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pF1KB3 QLHQSVHTGEKPYKCDVCGKVFSRSSQLQSHQRVHTGEKPYKCEICGKSFSWRSNLTVHH
         :. .:::::::::. :::.:  :: :..:.:.:: ::::::: :::.::  :.:: :.
XP_006 TTHKIIHTGEKPYKCEECGKAFISSSTLNGHKRIHTREKPYKCEECGKAFSQSSTLTRHK
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pF1KB3 RIHVGDKSYKSNRGGKNIRESTQEKKSIK                               
       :.:.:.: :: .. :: ..::.   :                                  
XP_006 RLHTGEKPYKCGECGKAFKESSALTKHKIIHTGEKPYKCEKCGKAFNQSSILTNHKKIHT
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>--
 initn: 1184 init1: 1184 opt: 1230  Z-score: 663.4  bits: 134.1 E(85289): 3.3e-30
Smith-Waterman score: 1230; 47.8% identity (70.8% similar) in 370 aa overlap (308-677:12-369)

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                                     : ..::.:     .:: ..  . ..   .:
XP_006                    MEDSFQKVLLRKYEKCGHE-----NLQLRKGCKSVD---EC
                                  10             20        30      

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pF1KB3 KQCGKGFSRRSALNVHCKVHTAEKPYNCEECGRAFSQASHLQDHQRLHTGEKPFKCDACG
       :   .:...   :: .: . .  : ..: .  ..: .  . . :   :::.: :::  : 
XP_006 KVHKEGYNK---LN-QCLTTAQSKVFQCGKYLKVFYKFLNSNRHTIRHTGKKCFKCKKCV
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pF1KB3 KSFSRNSHLQSHQRVHTGEKPYKCEECGKGFICSSNLYIHQRVHTGEKPYKCEECGKGFS
       :::    :  .:. :.  ::  ::.:: : :  ::.:  :...:: .::::::::::.:.
XP_006 KSFCIRLHKTQHKCVYITEKSCKCKECEKTFHWSSTLTNHKEIHTEDKPYKCEECGKAFK
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pF1KB3 RPSSLQAHQGVHTGEKSYICTVCGKGFTLSSNLQAHQRVHTGEKPYKCNECGKSFRRNSH
       . :.: .:. . . :: : :  :::.:  ::.:  :.:.:::::::::.::::.: ..: 
XP_006 QLSTLTTHKIICAKEKIYKCEECGKAFLWSSTLTRHKRIHTGEKPYKCEECGKAFSHSST
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pF1KB3 YQVHLVVHTGEKPYKCEICGKGFSQSSYLQIHQKAHSIEKPFKCEECGQGFNQSSRLQIH
          :  .:::::::::: :::.::.:: :  :.. :. :::.::.:::..:..:: :  :
XP_006 LAKHKRIHTGEKPYKCEECGKAFSRSSTLAKHKRIHTGEKPYKCKECGKAFSNSSTLANH
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pF1KB3 QLIHTGEKPYKCEECGKGFSRRADLKIHCRIHTGEKPYNCEECGKVFRQASNLLAHQRVH
       .. :: ::::::.:: :.:.: . :  :  ::.::: :.::::::.: ..:::  :. .:
XP_006 KITHTEEKPYKCKECDKAFKRLSTLTKHKIIHAGEKLYKCEECGKAFNRSSNLTIHKFIH
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pF1KB3 SGEKPFKCEECGKSFGRSAHLQAHQKVHTGDKPYKCDECGKGFKWSLNLDMHQRVHTGEK
       .::::.:::::::.:. :. :  :.. :: .::.:: :::                    
XP_006 TGEKPYKCEECGKAFNWSSSLTKHKRFHTREKPFKCKECGKAFIWSSTLTRHKRIHTGEK
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XP_006 PYKCEECGKAFRQSSTLTKHKIIHTGEKPYKFEECGKAFRQSLTLNKHKIIHSREKPYKC
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>>XP_011526568 (OMIM: 603971) PREDICTED: zinc finger pro  (1092 aa)
 initn: 14499 init1: 2115 opt: 2347  Z-score: 1239.9  bits: 240.7 E(85289): 2.5e-62
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XP_011 CGKAFNWSSSLTKHKRFHTREKPFKCKECGKAFIW-SSTLTRHKRIHTGEKPYKCEECGK
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pF1KB3 PIGWISHHDGHRV-HKSEKSYRPNDYEKDNMKILTFDHNSMIHTGQKSYQCNECKKPFSD
        .   :    :.. : .:: :. ..  :   . ::......::. .: :.:.:: : :..
XP_011 AFRQSSTLTKHKIIHTGEKPYKFEECGKAFRQSLTLNKHKIIHSREKPYKCKECGKAFKQ
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       .:..  :. ...:.:   : : ::.: .:  : .:. .:.:::  ::.:::: :  .. :
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       . :...:. ::::::..:::.::. :::  : ..::.::::.:.:::.:::..: : .:.
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         :: :::.::  : :.:.: : : .:. .:.::: ::::::::.:  :::: ::. .::
XP_011 ITHTEEKPYKCKECDKTFKRLSTLTKHKIIHAGEKLYKCEECGKAFNRSSNLTIHKFIHT
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       ::::::::::::.:.  :::  :. .:: :: . :  :::.:  ::.:  :.:.::::::
XP_011 GEKPYKCEECGKAFNWSSSLTKHKRIHTREKPFKCKECGKAFIWSSTLTRHKRIHTGEKP
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pF1KB3 YKCNECGKSFRRNSHYQVHLVVHTGEKPYKCEICGKGFSQSSYLQIHQKAHSIEKPFKCE
       :::.::::.: :.:    : ..:::::::::. :::.:..:: :  :.  :. :: .:::
XP_011 YKCEECGKAFSRSSTLTKHKTIHTGEKPYKCKECGKAFKHSSALAKHKIIHAGEKLYKCE
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pF1KB3 ECGQGFNQSSRLQIHQLIHTGEKP----------------------------YKCEECGK
       :::..::::: :  :..::: :::                            ::::::::
XP_011 ECGKAFNQSSNLTTHKIIHTKEKPSKSEECDKAFIWSSTLTEHKRIHTREKTYKCEECGK
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       .::. . :  : :.:::::::.::::::.: :.:.: .:. .:.::::.:::::::.: .
XP_011 AFSQPSHLTTHKRMHTGEKPYKCEECGKAFSQSSTLTTHKIIHTGEKPYKCEECGKAFRK
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pF1KB3 SAHLQAHQKVHTGDKPYKCDECGKGFKWSLNLDMHQRVHTGEKPYKCGECGKYFSQASSL
       :. :  :. .:::.:::::.::::.:. : .:  : :.::::::::: :::: :...:.:
XP_011 SSTLTEHKIIHTGEKPYKCEECGKAFSQSSTLTRHTRMHTGEKPYKCEECGKAFNRSSKL
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pF1KB3 QLHQSVHTGEKPYKCDVCGKVFSRSSQLQSHQRVHTGEKPYKCEICGKSFSWRSNLTVHH
         :. .:::::::::. :::.:  :: :..:.:.:: ::::::: :::.::  :.:: :.
XP_011 TTHKIIHTGEKPYKCEECGKAFISSSTLNGHKRIHTREKPYKCEECGKAFSQSSTLTRHK
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pF1KB3 RIHVGDKSYKSNRGGKNIRESTQEKKSIK                               
       :.:.:.: :: .. :: ..::.   :                                  
XP_011 RLHTGEKPYKCGECGKAFKESSALTKHKIIHTGEKPYKCEKCGKAFNQSSILTNHKKIHT
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pF1KB3 KSLTCVERGKGFCYSPVLPVHQKVHVGEKLKCDECGKEFSQGAHLQTHQKVHVIEKPYKC
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XP_011                    MEDSFQKVLLRKYEKCGHE-----NLQLRKGCKSVD---EC
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XP_011 LAKHKRIHTGEKPYKCEECGKAFSRSSTLAKHKRIHTGEKPYKCKECGKAFSNSSTLANH
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pF1KB3 QLIHTGEKPYKCEECGKGFSRRADLKIHCRIHTGEKPYNCEECGKVFRQASNLLAHQRVH
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XP_011 KITHTEEKPYKCKECDKAFKRLSTLTKHKIIHAGEKLYKCEECGKAFNRSSNLTIHKFIH
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pF1KB3 SGEKPFKCEECGKSFGRSAHLQAHQKVHTGDKPYKCDECGKGFKWSLNLDMHQRVHTGEK
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803 residues in 1 query   sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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