Result of FASTA (ccds) for pF1KB3264
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB3264, 847 aa
  1>>>pF1KB3264 847 - 847 aa - 847 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.3249+/-0.0013; mu= 6.5372+/- 0.077
 mean_var=245.0575+/-52.766, 0's: 0 Z-trim(107.1): 176  B-trim: 2 in 1/49
 Lambda= 0.081929
 statistics sampled from 9197 (9377) to 9197 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.645), E-opt: 0.2 (0.288), width:  16
 Scan time:  3.190

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS785.1 VAV3 gene_id:10451|Hs108|chr1            ( 847) 5737 692.8 6.6e-199
CCDS12174.1 VAV1 gene_id:7409|Hs108|chr19          ( 845) 3429 420.0 8.7e-117
CCDS48053.1 VAV2 gene_id:7410|Hs108|chr9           ( 878) 2675 330.9   6e-90
CCDS59341.1 VAV1 gene_id:7409|Hs108|chr19          ( 823) 2674 330.7 6.3e-90
CCDS59342.1 VAV1 gene_id:7409|Hs108|chr19          ( 813) 2416 300.2 9.4e-81
CCDS6979.1 VAV2 gene_id:7410|Hs108|chr9            ( 839) 2290 285.3 2.9e-76
CCDS44181.1 VAV3 gene_id:10451|Hs108|chr1          ( 287) 1914 240.4 3.4e-63


>>CCDS785.1 VAV3 gene_id:10451|Hs108|chr1                 (847 aa)
 initn: 5737 init1: 5737 opt: 5737  Z-score: 3684.5  bits: 692.8 E(32554): 6.6e-199
Smith-Waterman score: 5737; 99.9% identity (100.0% similar) in 847 aa overlap (1-847:1-847)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB3 MEPWKQCAQWLIHCKVLPTNHRVTWDSAQVFDLAQTLRDGVLLCQLLNNLRAHSINLKEI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 MEPWKQCAQWLIHCKVLPTNHRVTWDSAQVFDLAQTLRDGVLLCQLLNNLRAHSINLKEI
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB3 NLRPQMSQFLCLKNIRTFLTACCETFGMRKSELFEAFDLFDVRDFGKVIETLSRLSRTPI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 NLRPQMSQFLCLKNIRTFLTACCETFGMRKSELFEAFDLFDVRDFGKVIETLSRLSRTPI
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB3 ALATGIRPFPTEESINDEDIYKGLPDLIDETLVEDEEDLYDCVYGEDEGGEVYEDLMKAE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 ALATGIRPFPTEESINDEDIYKGLPDLIDETLVEDEEDLYDCVYGEDEGGEVYEDLMKAE
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB3 EAHQPKCPENDIRSCCLAEIKQTEEKYTETLESIEKYFMAPLKRFLTAAEFDSVFINIPE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 EAHQPKCPENDIRSCCLAEIKQTEEKYTETLESIEKYFMAPLKRFLTAAEFDSVFINIPE
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB3 LVKLHRNLMQEIHDSIVNKNDQNLYQVFINYKERLVIYGQYCSGVESAISSLDYISKSKE
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::
CCDS78 LVKLHRNLMQEIHDSIVNKNDQNLYQVFINYKERLVIYGQYCSGVESAISSLDYISKTKE
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB3 DVKLKLEECSKRANNGKFTLRDLLVVPMQRVLKYHLLLQELVKHTTDPTEKANLKLALDA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 DVKLKLEECSKRANNGKFTLRDLLVVPMQRVLKYHLLLQELVKHTTDPTEKANLKLALDA
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB3 MKDLAQYVNEVKRDNETLREIKQFQLSIENLNQPVLLFGRPQGDGEIRITTLDKHTKQER
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 MKDLAQYVNEVKRDNETLREIKQFQLSIENLNQPVLLFGRPQGDGEIRITTLDKHTKQER
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB3 HIFLFDLAVIVCKRKGDNYEMKEIIDLQQYKIANNPTTDKENKKWSYGFYLIHTQGQNGL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 HIFLFDLAVIVCKRKGDNYEMKEIIDLQQYKIANNPTTDKENKKWSYGFYLIHTQGQNGL
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB3 EFYCKTKDLKKKWLEQFEMALSNIRPDYADSNFHDFKMHTFTRVTSCKVCQMLLRGTFYQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 EFYCKTKDLKKKWLEQFEMALSNIRPDYADSNFHDFKMHTFTRVTSCKVCQMLLRGTFYQ
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB3 GYLCFKCGARAHKECLGRVDNCGRVNSGEQGTLKLPEKRTNGLRRTPKQVDPGLPKMQVI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 GYLCFKCGARAHKECLGRVDNCGRVNSGEQGTLKLPEKRTNGLRRTPKQVDPGLPKMQVI
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB3 RNYSGTPPPALHEGPPLQLQAGDTVELLKGDAHSLFWQGRNLASGEVGFFPSDAVKPCPC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 RNYSGTPPPALHEGPPLQLQAGDTVELLKGDAHSLFWQGRNLASGEVGFFPSDAVKPCPC
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB3 VPKPVDYSCQPWYAGAMERLQAETELINRVNSTYLVRHRTKESGEYAISIKYNNEAKHIK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 VPKPVDYSCQPWYAGAMERLQAETELINRVNSTYLVRHRTKESGEYAISIKYNNEAKHIK
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KB3 ILTRDGFFHIAENRKFKSLMELVEYYKHHSLKEGFRTLDTTLQFPYKEPEHSAGQRGNRA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 ILTRDGFFHIAENRKFKSLMELVEYYKHHSLKEGFRTLDTTLQFPYKEPEHSAGQRGNRA
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KB3 GNSLLSPKVLGIAIARYDFCARDMRELSLLKGDVVKIYTKMSANGWWRGEVNGRVGWFPS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 GNSLLSPKVLGIAIARYDFCARDMRELSLLKGDVVKIYTKMSANGWWRGEVNGRVGWFPS
              790       800       810       820       830       840

              
pF1KB3 TYVEEDE
       :::::::
CCDS78 TYVEEDE
              

>>CCDS12174.1 VAV1 gene_id:7409|Hs108|chr19               (845 aa)
 initn: 3081 init1: 1631 opt: 3429  Z-score: 2210.1  bits: 420.0 E(32554): 8.7e-117
Smith-Waterman score: 3429; 58.7% identity (82.6% similar) in 849 aa overlap (1-846:1-840)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB3 MEPWKQCAQWLIHCKVLPTNHRVTWDSAQVFDLAQTLRDGVLLCQLLNNLRAHSINLKEI
       :: :.::..:::.:.::: .::::::.::: .:::.::::::::::::::  :.:::.:.
CCDS12 MELWRQCTHWLIQCRVLPPSHRVTWDGAQVCELAQALRDGVLLCQLLNNLLPHAINLREV
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB3 NLRPQMSQFLCLKNIRTFLTACCETFGMRKSELFEAFDLFDVRDFGKVIETLSRLSRTPI
       :::::::::::::::::::..::: ::...::::::::::::.:::::: ::: :: :::
CCDS12 NLRPQMSQFLCLKNIRTFLSTCCEKFGLKRSELFEAFDLFDVQDFGKVIYTLSALSWTPI
               70        80        90       100       110       120

              130        140       150       160        170        
pF1KB3 ALATGIRPFPTEE-SINDEDIYKGLPDLIDETLVEDEEDLYDCVYGED-EGGEVYEDLMK
       :   :: :::::: :..:::::.:: : ::.: ::..::::::: .:. :: :.:::::.
CCDS12 AQNRGIMPFPTEEESVGDEDIYSGLSDQIDDT-VEEDEDLYDCVENEEAEGDEIYEDLMR
              130       140       150        160       170         

      180        190       200       210       220       230       
pF1KB3 AEEAHQP-KCPENDIRSCCLAEIKQTEEKYTETLESIEKYFMAPLKRFLTAAEFDSVFIN
       .: . .: :  : : : ::: ::.:::::::.:: ::...:. ::.:::   ... .:::
CCDS12 SEPVSMPPKMTEYDKRCCCLREIQQTEEKYTDTLGSIQQHFLKPLQRFLKPQDIEIIFIN
     180       190       200       210       220       230         

       240       250       260       270       280       290       
pF1KB3 IPELVKLHRNLMQEIHDSIVNKNDQNLYQVFINYKERLVIYGQYCSGVESAISSLDYISK
       : .:...: ....:..... . .  :::::::.::::...::.::: :::: . :: .. 
CCDS12 IEDLLRVHTHFLKEMKEALGTPGAANLYQVFIKYKERFLVYGRYCSQVESASKHLDRVAA
     240       250       260       270       280       290         

       300       310       320       330       340       350       
pF1KB3 SKEDVKLKLEECSKRANNGKFTLRDLLVVPMQRVLKYHLLLQELVKHTTDPTEKANLKLA
       ..:::..::::::.:::::.:::::::.:::::::::::::::::::: .  :: ::.::
CCDS12 AREDVQMKLEECSQRANNGRFTLRDLLMVPMQRVLKYHLLLQELVKHTQEAMEKENLRLA
     300       310       320       330       340       350         

       360       370       380       390       400       410       
pF1KB3 LDAMKDLAQYVNEVKRDNETLREIKQFQLSIENLNQPVLLFGRPQGDGEIRITTLDKHTK
       ::::.:::: ::::::::::::.: .::::::::.: .  .:::. :::..::......:
CCDS12 LDAMRDLAQCVNEVKRDNETLRQITNFQLSIENLDQSLAHYGRPKIDGELKITSVERRSK
     360       370       380       390       400       410         

       420       430       440       450       460       470       
pF1KB3 QERHIFLFDLAVIVCKRKGDNYEMKEIIDLQQYKIANNPTTDKENKKWSYGFYLIHTQGQ
       ..:. ::.: :...:::.::.:..:....:..... .. . :..:::::. : ::. :: 
CCDS12 MDRYAFLLDKALLICKRRGDSYDLKDFVNLHSFQVRDDSSGDRDNKKWSHMFLLIEDQGA
     420       430       440       450       460       470         

       480       490       500       510       520       530       
pF1KB3 NGLEFYCKTKDLKKKWLEQFEMALSNIRPDYADSNFHDFKMHTFTRVTSCKVCQMLLRGT
       .: :.. ::..:::::.::::::.::: :. : .: :::.: .: ..::::.::::::::
CCDS12 QGYELFFKTRELKKKWMEQFEMAISNIYPENATANGHDFQMFSFEETTSCKACQMLLRGT
     480       490       500       510       520       530         

       540       550       560       570       580       590       
pF1KB3 FYQGYLCFKCGARAHKECLGRVDNCGRVNSGEQGTLKLPEKRTNGLRRTPKQVDPGLPKM
       ::::: : .: : :::::::::  ::: ..   ::.:  . . .   .  :. . :::::
CCDS12 FYQGYRCHRCRASAHKECLGRVPPCGRHGQDFPGTMK--KDKLHRRAQDKKRNELGLPKM
     540       550       560       570         580       590       

       600       610       620       630       640       650       
pF1KB3 QVIRNYSGTPPPALHEGPPLQLQAGDTVELLKGDAHSLFWQGRNLASGEVGFFPSDAVKP
       .:...: : :::    :: :.:. :: ::: :..:.. .:.::: ...:.:.:: . :::
CCDS12 EVFQEYYGLPPPPGAIGPFLRLNPGDIVELTKAEAEQNWWEGRNTSTNEIGWFPCNRVKP
       600       610       620       630       640       650       

       660       670       680       690       700       710       
pF1KB3 CPCVPKPVDYSCQPWYAGAMERLQAETELINRVNSTYLVRHRTKESGEYAISIKYNNEAK
           : : : : . :::: :::  ::. : :: ..:.:::.:.:...:.::::::: :.:
CCDS12 YVHGP-PQDLSVHLWYAGPMERAGAESILANRSDGTFLVRQRVKDAAEFAISIKYNVEVK
       660        670       680       690       700       710      

       720       730       740       750       760       770       
pF1KB3 HIKILTRDGFFHIAENRKFKSLMELVEYYKHHSLKEGFRTLDTTLQFPYKEPEHSAGQRG
       ::::.: .:...:.:.. :..: ::::.:...:::. :..::::::::.::::. . .: 
CCDS12 HIKIMTAEGLYRITEKKAFRGLTELVEFYQQNSLKDCFKSLDTTLQFPFKEPEKRTISRP
        720       730       740       750       760       770      

       780       790       800       810       820       830       
pF1KB3 NRAGNSLLSPKVLGIAIARYDFCARDMRELSLLKGDVVKIYTKMSANGWWRGEVNGRVGW
            .. : : .: : :::::::::  :::: .::..:: .: . .::::::. :::::
CCDS12 -----AVGSTKYFGTAKARYDFCARDRSELSLKEGDIIKILNKKGQQGWWRGEIYGRVGW
             780       790       800       810       820       830 

       840           
pF1KB3 FPSTYVEEDE    
       ::..:::::     
CCDS12 FPANYVEEDYSEYC
             840     

>>CCDS48053.1 VAV2 gene_id:7410|Hs108|chr9                (878 aa)
 initn: 2588 init1: 766 opt: 2675  Z-score: 1728.3  bits: 330.9 E(32554): 6e-90
Smith-Waterman score: 3105; 52.1% identity (76.8% similar) in 898 aa overlap (1-846:1-875)

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pF1KB3 MEPWKQCAQWLIHCKVLPTNHRVTWDSAQVFDLAQTLRDGVLLCQLLNNLRAHSINLKEI
       :: :.::..::: ::::: ::::.: :: ::::::.:::::::::::.::   ::.::.:
CCDS48 MEQWRQCGRWLIDCKVLPPNHRVVWPSAVVFDLAQALRDGVLLCQLLHNLSPGSIDLKDI
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pF1KB3 NLRPQMSQFLCLKNIRTFLTACCETFGMRKSELFEAFDLFDVRDFGKVIETLSRLSRTPI
       :.::::::::::::::::: .: . ::.:.::::. ::::::::::::: ..::::   :
CCDS48 NFRPQMSQFLCLKNIRTFLKVCHDKFGLRNSELFDPFDLFDVRDFGKVISAVSRLSLHSI
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pF1KB3 ALATGIRPFPTEESI-NDEDIYKGLPDLIDETLVEDEEDLYDCVYGEDEGGEVYEDLMKA
       :   ::::::.::.  ::.:.:..: .: ::   .  ::.::::  :: : ..:::..:.
CCDS48 AQNKGIRPFPSEETTENDDDVYRSLEELADEH--DLGEDIYDCVPCEDGGDDIYEDIIKV
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pF1KB3 EEAHQPKC--------PENDIRSCCLAEIKQTEEKYTETLESIEKYFMAPLKRFLTAAEF
       : ..::           :.: :.::: ::..:: :: .:::.::: .:.::.  :. :..
CCDS48 E-VQQPMIRYMQKMGMTEDDKRNCCLLEIQETEAKYYRTLEDIEKNYMSPLRLVLSPADM
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pF1KB3 DSVFINIPELVKLHRNLMQEIHDSIVNKNDQNLYQVFINYKERLVIYGQYCSGVESAISS
        .::::. .:.:.:..... : :  :  . ..: .::...::::.:::.::: .: : ..
CCDS48 AAVFINLEDLIKVHHSFLRAI-DVSVMVGGSTLAKVFLDFKERLLIYGEYCSHMEHAQNT
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pF1KB3 LDYISKSKEDVKLKLEECSKRANNGKFTLRDLLVVPMQRVLKYHLLLQELVKHTTDPTEK
       :. .  :.:: . :.:::. ....::: :.:::::::::::::::::.::..:...  :.
CCDS48 LNQLLASREDFRQKVEECTLKVQDGKFKLQDLLVVPMQRVLKYHLLLKELLSHSAERPER
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pF1KB3 ANLKLALDAMKDLAQYVNEVKRDNETLREIKQFQLSIENLNQPVLLFGRPQGDGEIRITT
        .:: ::.::.:::.:.::::::.::::.:..:: :::::.  .  ::::. :::... .
CCDS48 QQLKEALEAMQDLAMYINEVKRDKETLRKISEFQSSIENLQVKLEEFGRPKIDGELKVRS
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pF1KB3 LDKHTKQERHIFLFDLAVIVCKRKGDNYEMKEIIDLQQYKIANNPTTDKENKK-----WS
       . .::::.:..:::: .:::::::: .::.::::.:  .:....: ..:. ::     ::
CCDS48 IVNHTKQDRYLFLFDKVVIVCKRKGYSYELKEIIELLFHKMTDDPMNNKDVKKSHGKMWS
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pF1KB3 YGFYLIHTQGQNGLEFYCKTKDLKKKWLEQFEMALSNIRPDYADSNFHDFKMHTFTRVTS
       ::::::: ::..:..:.:::.:.:.::.::::::.:::.:: :..: :.:.:.:: ..:.
CCDS48 YGFYLIHLQGKQGFQFFCKTEDMKRKWMEQFEMAMSNIKPDKANANHHSFQMYTFDKTTN
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pF1KB3 CKVCQMLLRGTFYQGYLCFKCGARAHKECLGRVDNCGRVNSGEQGTLKLPEKRTNGLRRT
       ::.:.:.:::::::::.: :::. ::::::  .  :               : :.     
CCDS48 CKACKMFLRGTFYQGYMCTKCGVGAHKECLEVIPPC---------------KFTSPADLD
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pF1KB3 PKQVDPGLPKMQVIRNYSGTPPPALHEGPP-LQLQAGDTVELLKGDAHSLFWQGRNLASG
        . . :: ::: ...:: :.: :    : : : .:.::..:::.:: .: .:.:: . . 
CCDS48 ASGAGPG-PKMVAMQNYHGNPAPP---GKPVLTFQTGDVLELLRGDPESPWWEGRLVQTR
              590       600          610       620       630       

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pF1KB3 EVGFFPSDAVKPCPCVPKP---------VDYSCQPWYAGAMERLQAETELINRVNSTYLV
       . :.:::..:::::   .:         .::.  ::.:: ::: :... : .....:::.
CCDS48 KSGYFPSSSVKPCPVDGRPPISRPPSREIDYTAYPWFAGNMERQQTDNLLKSHASGTYLI
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pF1KB3 RHRTKESGEYAISIKYNNEAKHIKILTRDGFFHIAENRKFKSLMELVEYYKHHSLKEGFR
       :.:  :. ..:::::.:.:.::::.. .:...::.: .:: ::.::::::. :::::.:.
CCDS48 RERPAEAERFAISIKFNDEVKHIKVVEKDNWIHITEAKKFDSLLELVEYYQCHSLKESFK
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pF1KB3 TLDTTLQFPYKEPEHSAGQRGNRAGNS---------------------------LLSPKV
        :::::..:::  :.::.. ..:.  :                           ...:.:
CCDS48 QLDTTLKYPYKSRERSASRASSRSPASCASYNFSFLSPQGLSFASQGPSAPFWSVFTPRV
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pF1KB3 LGIAIARYDFCARDMRELSLLKGDVVKIYTKMSAN-GWWRGEVNGRVGWFPSTYVEEDE 
       .: :.:::.: ::::::::: .::::.::...... :::.::.:::.::::::::::.  
CCDS48 IGTAVARYNFAARDMRELSLREGDVVRIYSRIGGDQGWWKGETNGRIGWFPSTYVEEEGI
       820       830       840       850       860       870       

CCDS48 Q
        

>>CCDS59341.1 VAV1 gene_id:7409|Hs108|chr19               (823 aa)
 initn: 3081 init1: 1631 opt: 2674  Z-score: 1728.0  bits: 330.7 E(32554): 6.3e-90
Smith-Waterman score: 3315; 57.6% identity (80.8% similar) in 849 aa overlap (1-846:1-818)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB3 MEPWKQCAQWLIHCKVLPTNHRVTWDSAQVFDLAQTLRDGVLLCQLLNNLRAHSINLKEI
       :: :.::..:::.:.::: .::::::.::: .:::.::::::::::::::  :.:::.:.
CCDS59 MELWRQCTHWLIQCRVLPPSHRVTWDGAQVCELAQALRDGVLLCQLLNNLLPHAINLREV
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pF1KB3 NLRPQMSQFLCLKNIRTFLTACCETFGMRKSELFEAFDLFDVRDFGKVIETLSRLSRTPI
       :::::::::::::::::::..::: ::...::::::::::::.:::::: ::: :: :::
CCDS59 NLRPQMSQFLCLKNIRTFLSTCCEKFGLKRSELFEAFDLFDVQDFGKVIYTLSALSWTPI
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pF1KB3 ALATGIRPFPTEE-SINDEDIYKGLPDLIDETLVEDEEDLYDCVYGED-EGGEVYEDLMK
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CCDS59 AQNRGIMPFPTEEESVGDEDIYSGLSDQIDDT-VEEDEDLYDCVENEEAEGDEIYEDLMR
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pF1KB3 AEEAHQP-KCPENDIRSCCLAEIKQTEEKYTETLESIEKYFMAPLKRFLTAAEFDSVFIN
       .: . .: :  : : : ::: ::.:::::::.:: ::...:. ::.:::   ... .:::
CCDS59 SEPVSMPPKMTEYDKRCCCLREIQQTEEKYTDTLGSIQQHFLKPLQRFLKPQDIEIIFIN
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pF1KB3 IPELVKLHRNLMQEIHDSIVNKNDQNLYQVFINYKERLVIYGQYCSGVESAISSLDYISK
       : .:...: ....:..... . .  :::::::.::::...::.::: :::: . :: .. 
CCDS59 IEDLLRVHTHFLKEMKEALGTPGAANLYQVFIKYKERFLVYGRYCSQVESASKHLDRVAA
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pF1KB3 SKEDVKLKLEECSKRANNGKFTLRDLLVVPMQRVLKYHLLLQELVKHTTDPTEKANLKLA
       ..:::..::::::.:::::.:::::::.:::::::::::::::::::: .  :: ::.::
CCDS59 AREDVQMKLEECSQRANNGRFTLRDLLMVPMQRVLKYHLLLQELVKHTQEAMEKENLRLA
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pF1KB3 LDAMKDLAQYVNEVKRDNETLREIKQFQLSIENLNQPVLLFGRPQGDGEIRITTLDKHTK
       ::::.:::: ::::::::::::.: .::::::::.: .  .:::. :::..::......:
CCDS59 LDAMRDLAQCVNEVKRDNETLRQITNFQLSIENLDQSLAHYGRPKIDGELKITSVERRSK
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pF1KB3 QERHIFLFDLAVIVCKRKGDNYEMKEIIDLQQYKIANNPTTDKENKKWSYGFYLIHTQGQ
       ..:. ::.: :...:::.::.:..:....:..... .. . :..:::::. : ::. :: 
CCDS59 MDRYAFLLDKALLICKRRGDSYDLKDFVNLHSFQVRDDSSGDRDNKKWSHMFLLIEDQGA
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pF1KB3 NGLEFYCKTKDLKKKWLEQFEMALSNIRPDYADSNFHDFKMHTFTRVTSCKVCQMLLRGT
       .: :.. ::..:::::.::::::.::: :. : .: :::.: .: ..::::.::::::::
CCDS59 QGYELFFKTRELKKKWMEQFEMAISNIYPENATANGHDFQMFSFEETTSCKACQMLLRGT
     480       490       500       510       520       530         

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pF1KB3 FYQGYLCFKCGARAHKECLGRVDNCGRVNSGEQGTLKLPEKRTNGLRRTPKQVDPGLPKM
       ::::: : .: : :::::::::  ::: ..   ::.:  . . .   .  :. . :::::
CCDS59 FYQGYRCHRCRASAHKECLGRVPPCGRHGQDFPGTMK--KDKLHRRAQDKKRNELGLPKM
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pF1KB3 QVIRNYSGTPPPALHEGPPLQLQAGDTVELLKGDAHSLFWQGRNLASGEVGFFPSDAVKP
       .:...: : :::    :: :.:. :: ::: :..:.. .:.:           :      
CCDS59 EVFQEYYGLPPPPGAIGPFLRLNPGDIVELTKAEAEQNWWEG-----------P------
       600       610       620       630                  640      

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pF1KB3 CPCVPKPVDYSCQPWYAGAMERLQAETELINRVNSTYLVRHRTKESGEYAISIKYNNEAK
             : : : . :::: :::  ::. : :: ..:.:::.:.:...:.::::::: :.:
CCDS59 ------PQDLSVHLWYAGPMERAGAESILANRSDGTFLVRQRVKDAAEFAISIKYNVEVK
                    650       660       670       680       690    

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pF1KB3 HIKILTRDGFFHIAENRKFKSLMELVEYYKHHSLKEGFRTLDTTLQFPYKEPEHSAGQRG
       ::::.: .:...:.:.. :..: ::::.:...:::. :..::::::::.::::. . .: 
CCDS59 HIKIMTAEGLYRITEKKAFRGLTELVEFYQQNSLKDCFKSLDTTLQFPFKEPEKRTISRP
          700       710       720       730       740       750    

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pF1KB3 NRAGNSLLSPKVLGIAIARYDFCARDMRELSLLKGDVVKIYTKMSANGWWRGEVNGRVGW
            .. : : .: : :::::::::  :::: .::..:: .: . .::::::. :::::
CCDS59 -----AVGSTKYFGTAKARYDFCARDRSELSLKEGDIIKILNKKGQQGWWRGEIYGRVGW
               760       770       780       790       800         

       840           
pF1KB3 FPSTYVEEDE    
       ::..:::::     
CCDS59 FPANYVEEDYSEYC
     810       820   

>>CCDS59342.1 VAV1 gene_id:7409|Hs108|chr19               (813 aa)
 initn: 3169 init1: 1495 opt: 2416  Z-score: 1563.2  bits: 300.2 E(32554): 9.4e-81
Smith-Waterman score: 3243; 56.4% identity (79.8% similar) in 848 aa overlap (1-846:1-808)

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pF1KB3 MEPWKQCAQWLIHCKVLPTNHRVTWDSAQVFDLAQTLRDGVLLCQLLNNLRAHSINLKEI
       :: :.::..:::.:.::: .::::::.::: .:::.::::::::::::::  :.:::.:.
CCDS59 MELWRQCTHWLIQCRVLPPSHRVTWDGAQVCELAQALRDGVLLCQLLNNLLPHAINLREV
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB3 NLRPQMSQFLCLKNIRTFLTACCETFGMRKSELFEAFDLFDVRDFGKVIETLSRLSRTPI
       :::::::::::::::::::..::: ::...::::::::::::.:::::: ::: :: :::
CCDS59 NLRPQMSQFLCLKNIRTFLSTCCEKFGLKRSELFEAFDLFDVQDFGKVIYTLSALSWTPI
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pF1KB3 ALATGIRPFPTEE-SINDEDIYKGLPDLIDETLVEDEEDLYDCVYGED-EGGEVYEDLMK
       :   :: :::::: :..:::::.:: : ::.: ::..::::::: .:. :: :.:::::.
CCDS59 AQNRGIMPFPTEEESVGDEDIYSGLSDQIDDT-VEEDEDLYDCVENEEAEGDEIYEDLMR
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pF1KB3 AEEAHQPKCPENDIRSCCLAEIKQTEEKYTETLESIEKYFMAPLKRFLTAAEFDSVFINI
       .: . .:                               .:. ::.:::   ... .::::
CCDS59 SEPVSMP-------------------------------HFLKPLQRFLKPQDIEIIFINI
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pF1KB3 PELVKLHRNLMQEIHDSIVNKNDQNLYQVFINYKERLVIYGQYCSGVESAISSLDYISKS
        .:...: ....:..... . .  :::::::.::::...::.::: :::: . :: .. .
CCDS59 EDLLRVHTHFLKEMKEALGTPGAANLYQVFIKYKERFLVYGRYCSQVESASKHLDRVAAA
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pF1KB3 KEDVKLKLEECSKRANNGKFTLRDLLVVPMQRVLKYHLLLQELVKHTTDPTEKANLKLAL
       .:::..::::::.:::::.:::::::.:::::::::::::::::::: .  :: ::.:::
CCDS59 REDVQMKLEECSQRANNGRFTLRDLLMVPMQRVLKYHLLLQELVKHTQEAMEKENLRLAL
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pF1KB3 DAMKDLAQYVNEVKRDNETLREIKQFQLSIENLNQPVLLFGRPQGDGEIRITTLDKHTKQ
       :::.:::: ::::::::::::.: .::::::::.: .  .:::. :::..::......:.
CCDS59 DAMRDLAQCVNEVKRDNETLRQITNFQLSIENLDQSLAHYGRPKIDGELKITSVERRSKM
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pF1KB3 ERHIFLFDLAVIVCKRKGDNYEMKEIIDLQQYKIANNPTTDKENKKWSYGFYLIHTQGQN
       .:. ::.: :...:::.::.:..:....:..... .. . :..:::::. : ::. :: .
CCDS59 DRYAFLLDKALLICKRRGDSYDLKDFVNLHSFQVRDDSSGDRDNKKWSHMFLLIEDQGAQ
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pF1KB3 GLEFYCKTKDLKKKWLEQFEMALSNIRPDYADSNFHDFKMHTFTRVTSCKVCQMLLRGTF
       : :.. ::..:::::.::::::.::: :. : .: :::.: .: ..::::.:::::::::
CCDS59 GYELFFKTRELKKKWMEQFEMAISNIYPENATANGHDFQMFSFEETTSCKACQMLLRGTF
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pF1KB3 YQGYLCFKCGARAHKECLGRVDNCGRVNSGEQGTLKLPEKRTNGLRRTPKQVDPGLPKMQ
       :::: : .: : :::::::::  ::: ..   ::.:  . . .   .  :. . :::::.
CCDS59 YQGYRCHRCRASAHKECLGRVPPCGRHGQDFPGTMK--KDKLHRRAQDKKRNELGLPKME
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pF1KB3 VIRNYSGTPPPALHEGPPLQLQAGDTVELLKGDAHSLFWQGRNLASGEVGFFPSDAVKPC
       :...: : :::    :: :.:. :: ::: :..:.. .:.::: ...:.:.:: . ::: 
CCDS59 VFQEYYGLPPPPGAIGPFLRLNPGDIVELTKAEAEQNWWEGRNTSTNEIGWFPCNRVKPY
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pF1KB3 PCVPKPVDYSCQPWYAGAMERLQAETELINRVNSTYLVRHRTKESGEYAISIKYNNEAKH
          : : : : . :::: :::  ::. : :: ..:.:::.:.:...:.::::::: :.::
CCDS59 VHGP-PQDLSVHLWYAGPMERAGAESILANRSDGTFLVRQRVKDAAEFAISIKYNVEVKH
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pF1KB3 IKILTRDGFFHIAENRKFKSLMELVEYYKHHSLKEGFRTLDTTLQFPYKEPEHSAGQRGN
       :::.: .:...:.:.. :..: ::::.:...:::. :..::::::::.::::. . .:  
CCDS59 IKIMTAEGLYRITEKKAFRGLTELVEFYQQNSLKDCFKSLDTTLQFPFKEPEKRTISRP-
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pF1KB3 RAGNSLLSPKVLGIAIARYDFCARDMRELSLLKGDVVKIYTKMSANGWWRGEVNGRVGWF
           .. : : .: : :::::::::  :::: .::..:: .: . .::::::. ::::::
CCDS59 ----AVGSTKYFGTAKARYDFCARDRSELSLKEGDIIKILNKKGQQGWWRGEIYGRVGWF
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      840           
pF1KB3 PSTYVEEDE    
       :..:::::     
CCDS59 PANYVEEDYSEYC
              810   

>>CCDS6979.1 VAV2 gene_id:7410|Hs108|chr9                 (839 aa)
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pF1KB3 MEPWKQCAQWLIHCKVLPTNHRVTWDSAQVFDLAQTLRDGVLLCQLLNNLRAHSINLKEI
       :: :.::..::: ::::: ::::.: :: ::::::.:::::::::::.::   ::.::.:
CCDS69 MEQWRQCGRWLIDCKVLPPNHRVVWPSAVVFDLAQALRDGVLLCQLLHNLSPGSIDLKDI
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pF1KB3 NLRPQMSQFLCLKNIRTFLTACCETFGMRKSELFEAFDLFDVRDFGKVIETLSRLSRTPI
       :.::::::::::::::::: .: . ::.:.::::. ::::::::::::: ..::::   :
CCDS69 NFRPQMSQFLCLKNIRTFLKVCHDKFGLRNSELFDPFDLFDVRDFGKVISAVSRLSLHSI
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pF1KB3 ALATGIRPFPTEESI-NDEDIYKGLPDLIDETLVEDEEDLYDCVYGEDEGGEVYEDLMKA
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CCDS69 AQNKGIRPFPSEETTENDDDVYRSLEELADEH--DLGEDIYDCVPCEDGGDDIYEDIIKV
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pF1KB3 EEAHQPK---CPENDIRSCCLAEIKQTEEKYTETLESIEKYFMAPLKRFLTAAEFDSVFI
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CCDS69 E-VQQPMKMGMTEDDKRNCCLLEIQETEAKYYRTLEDIEKNYMSPLRLVLSPADMAAVFI
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pF1KB3 NIPELVKLHRNLMQEIHDSIVNKNDQNLYQVFINYKERLVIYGQYCSGVESAISSLDYIS
       :. .:.:.:..... : :  :  . ..: .::...::::.:::.::: .: : ..:. . 
CCDS69 NLEDLIKVHHSFLRAI-DVSVMVGGSTLAKVFLDFKERLLIYGEYCSHMEHAQNTLNQLL
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pF1KB3 KSKEDVKLKLEECSKRANNGKFTLRDLLVVPMQRVLKYHLLLQELVKHTTDPTEKANLKL
        :.:: . :.:::. ....::: :.:::::::::::::::::.::..:...  :. .:: 
CCDS69 ASREDFRQKVEECTLKVQDGKFKLQDLLVVPMQRVLKYHLLLKELLSHSAERPERQQLKE
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pF1KB3 ALDAMKDLAQYVNEVKRDNETLREIKQFQLSIENLNQPVLLFGRPQGDGEIRITTLDKHT
       ::.::.:::.:.::::::.::::.:..:: :::::.  .  ::::. :::... .. .::
CCDS69 ALEAMQDLAMYINEVKRDKETLRKISEFQSSIENLQVKLEEFGRPKIDGELKVRSIVNHT
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pF1KB3 KQERHIFLFDLAVIVCKRKGDNYEMKEIIDLQQYKIANNPTTDKENKKWSYGFYLIHTQG
       ::.:..:::: .:::::::: .::.::::.:  .:....: ..:. ::::::::::: ::
CCDS69 KQDRYLFLFDKVVIVCKRKGYSYELKEIIELLFHKMTDDPMNNKDVKKWSYGFYLIHLQG
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pF1KB3 QNGLEFYCKTKDLKKKWLEQFEMALSNIRPDYADSNFHDFKMHTFTRVTSCKVCQMLLRG
       ..:..:.:::.:.:.::.::::::.:::.:: :..: :.:.:.:: ..:.::.:.:.:::
CCDS69 KQGFQFFCKTEDMKRKWMEQFEMAMSNIKPDKANANHHSFQMYTFDKTTNCKACKMFLRG
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pF1KB3 TFYQGYLCFKCGARAHKECLGRVDNCGRVNSGEQGTLKLPEKRTNGLRRTPKQVDPGLPK
       ::::::.: :::. ::::::  .  :               : :.      . . :: ::
CCDS69 TFYQGYMCTKCGVGAHKECLEVIPPC---------------KFTSPADLDASGAGPG-PK
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pF1KB3 MQVIRNYSGTPPPALHEGPP-LQLQAGDTVELLKGDAHSLFWQGRNLASGEVGFFPSDAV
       : ...:: :.: :    : : : .:.::..:::.:: .: .:.:: . . . :.:::..:
CCDS69 MVAMQNYHGNPAPP---GKPVLTFQTGDVLELLRGDPESPWWEGRLVQTRKSGYFPSSSV
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pF1KB3 KPCPCVPKP---------VDYSCQPWYAGAMERLQAETELINRVNSTYLVRHRTKESGEY
       ::::   .:         .::.  ::.:: ::: :... : .....:::.:.:  :. ..
CCDS69 KPCPVDGRPPISRPPSREIDYTAYPWFAGNMERQQTDNLLKSHASGTYLIRERPAEAERF
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pF1KB3 AISIKYNNEAKHIKILTRDGFFHIAENRKFKSLMELVEYYKHHSLKEGFRTLDTTLQFPY
       :::::.:.:.::::.. .:...::.: .:: ::.::::::. :::::.:. :::::..::
CCDS69 AISIKFNDEVKHIKVVEKDNWIHITEAKKFDSLLELVEYYQCHSLKESFKQLDTTLKYPY
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pF1KB3 KEPEHSAGQRGNRAGNSLLSPKVLGIAIARYDFCARDMRELSLLKGDVVKIYTKMSAN-G
       :  :.::.. ..:.   ...:.:.: :.:::.: ::::::::: .::::.::...... :
CCDS69 KSRERSASRASSRS--PVFTPRVIGTAVARYNFAARDMRELSLREGDVVRIYSRIGGDQG
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pF1KB3 WWRGEVNGRVGWFPSTYVEEDE  
       ::.::.:::.::::::::::.   
CCDS69 WWKGETNGRIGWFPSTYVEEEGIQ
         820       830         

>>CCDS44181.1 VAV3 gene_id:10451|Hs108|chr1               (287 aa)
 initn: 1914 init1: 1914 opt: 1914  Z-score: 1248.1  bits: 240.4 E(32554): 3.4e-63
Smith-Waterman score: 1914; 100.0% identity (100.0% similar) in 279 aa overlap (569-847:9-287)

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CCDS44                       MPIFTFLSEQGTLKLPEKRTNGLRRTPKQVDPGLPKMQ
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pF1KB3 VIRNYSGTPPPALHEGPPLQLQAGDTVELLKGDAHSLFWQGRNLASGEVGFFPSDAVKPC
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CCDS44 VIRNYSGTPPPALHEGPPLQLQAGDTVELLKGDAHSLFWQGRNLASGEVGFFPSDAVKPC
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pF1KB3 PCVPKPVDYSCQPWYAGAMERLQAETELINRVNSTYLVRHRTKESGEYAISIKYNNEAKH
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CCDS44 PCVPKPVDYSCQPWYAGAMERLQAETELINRVNSTYLVRHRTKESGEYAISIKYNNEAKH
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pF1KB3 IKILTRDGFFHIAENRKFKSLMELVEYYKHHSLKEGFRTLDTTLQFPYKEPEHSAGQRGN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 IKILTRDGFFHIAENRKFKSLMELVEYYKHHSLKEGFRTLDTTLQFPYKEPEHSAGQRGN
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 RAGNSLLSPKVLGIAIARYDFCARDMRELSLLKGDVVKIYTKMSANGWWRGEVNGRVGWF
      220       230       240       250       260       270        

      840       
pF1KB3 PSTYVEEDE
       :::::::::
CCDS44 PSTYVEEDE
      280       




847 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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