Result of FASTA (ccds) for pF1KB8018
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB8018, 555 aa
  1>>>pF1KB8018 555 - 555 aa - 555 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.4925+/-0.0009; mu= 4.4594+/- 0.054
 mean_var=169.1037+/-33.225, 0's: 0 Z-trim(112.0): 22  B-trim: 0 in 0/53
 Lambda= 0.098627
 statistics sampled from 12841 (12858) to 12841 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.737), E-opt: 0.2 (0.395), width:  16
 Scan time:  3.950

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS5246.1 CNKSR3 gene_id:154043|Hs108|chr6        ( 555) 3722 541.7 8.4e-154
CCDS55387.1 CNKSR2 gene_id:22866|Hs108|chrX        ( 898) 1944 288.9 1.8e-77
CCDS14198.1 CNKSR2 gene_id:22866|Hs108|chrX        (1034) 1944 288.9   2e-77
CCDS55388.1 CNKSR2 gene_id:22866|Hs108|chrX        (1004) 1821 271.4 3.7e-72
CCDS55389.1 CNKSR2 gene_id:22866|Hs108|chrX        ( 849) 1329 201.3 3.8e-51
CCDS276.1 CNKSR1 gene_id:10256|Hs108|chr1          ( 713)  396 68.5   3e-11


>>CCDS5246.1 CNKSR3 gene_id:154043|Hs108|chr6             (555 aa)
 initn: 3722 init1: 3722 opt: 3722  Z-score: 2874.7  bits: 541.7 E(32554): 8.4e-154
Smith-Waterman score: 3722; 100.0% identity (100.0% similar) in 555 aa overlap (1-555:1-555)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MEPVTKWSPKQVVDWTRGLDDCLQQYVHKFEREKINGEQLLQISHQDLEELGVTRIGHQE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS52 MEPVTKWSPKQVVDWTRGLDDCLQQYVHKFEREKINGEQLLQISHQDLEELGVTRIGHQE
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB8 LVLEAVDLLCALNYGLETDNMKNLVLKLRASSHNLQNYISSRRKSPAYDGNTSRKAPNEF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS52 LVLEAVDLLCALNYGLETDNMKNLVLKLRASSHNLQNYISSRRKSPAYDGNTSRKAPNEF
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB8 LTSVVELIGAAKALLAWLDRAPFTGITDFSVTKNKIIQLCLDLTTTVQKDCFVAEMEDKV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS52 LTSVVELIGAAKALLAWLDRAPFTGITDFSVTKNKIIQLCLDLTTTVQKDCFVAEMEDKV
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB8 LTVVKVLNGICDKTIRSTTDPVMSQCACLEEVHLPNIKPGEGLGMYIKSTYDGLHVITGT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS52 LTVVKVLNGICDKTIRSTTDPVMSQCACLEEVHLPNIKPGEGLGMYIKSTYDGLHVITGT
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB8 TENSPADRSQKIHAGDEVIQVNQQTVVGWQLKNLVKKLRENPTGVVLLLKKRPTGSFNFT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS52 TENSPADRSQKIHAGDEVIQVNQQTVVGWQLKNLVKKLRENPTGVVLLLKKRPTGSFNFT
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB8 PAPLKNLRWKPPLVQTSPPPATTQSPESTMDTSLKKEKSAILDLYIPPPPAVPYSPRDEN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS52 PAPLKNLRWKPPLVQTSPPPATTQSPESTMDTSLKKEKSAILDLYIPPPPAVPYSPRDEN
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB8 GSFVYGGSSKCKQPLPGPKGSESPNSFLDQESRRRRFTIADSDQLPGYSVETNILPTKMR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS52 GSFVYGGSSKCKQPLPGPKGSESPNSFLDQESRRRRFTIADSDQLPGYSVETNILPTKMR
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB8 EKTPSYGKPRPLSMPADGNWMGIVDPFARPRGHGRKGEDALCRYFSNERIPPIIEESSSP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS52 EKTPSYGKPRPLSMPADGNWMGIVDPFARPRGHGRKGEDALCRYFSNERIPPIIEESSSP
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB8 PYRFSRPTTERHLVRGADYIRGSRCYINSDLHSSATIPFQEEGTKKKSGSSATKSSSTEP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS52 PYRFSRPTTERHLVRGADYIRGSRCYINSDLHSSATIPFQEEGTKKKSGSSATKSSSTEP
              490       500       510       520       530       540

              550     
pF1KB8 SLLVSWFTRLKLLTH
       :::::::::::::::
CCDS52 SLLVSWFTRLKLLTH
              550     

>>CCDS55387.1 CNKSR2 gene_id:22866|Hs108|chrX             (898 aa)
 initn: 1926 init1: 1543 opt: 1944  Z-score: 1504.3  bits: 288.9 E(32554): 1.8e-77
Smith-Waterman score: 1944; 62.7% identity (81.8% similar) in 477 aa overlap (1-470:5-477)

                   10        20        30        40        50      
pF1KB8     MEPVTKWSPKQVVDWTRGLDDCLQQYVHKFEREKINGEQLLQISHQDLEELGVTRI
           ::::.::::.::::: .:::::::::...::::::.:.:::.:.::.::.:::.::
CCDS55 MALIMEPVSKWSPSQVVDWMKGLDDCLQQYIKNFEREKISGDQLLRITHQELEDLGVSRI
               10        20        30        40        50        60

         60        70        80        90       100       110      
pF1KB8 GHQELVLEAVDLLCALNYGLETDNMKNLVLKLRASSHNLQNYISSRRKSPAYDGNTSRKA
       :::::.::::::::::::::::.:.:.:  :: ::..::::.:..::.:  ::: :::: 
CCDS55 GHQELILEAVDLLCALNYGLETENLKTLSHKLNASAKNLQNFITGRRRSGHYDGRTSRKL
               70        80        90       100       110       120

        120       130       140       150       160       170      
pF1KB8 PNEFLTSVVELIGAAKALLAWLDRAPFTGITDFSVTKNKIIQLCLDLTTTVQKDCFVAEM
       ::.::::::.::::::.:::::::.::...::.:::.:..:::::.::: ::.:: : : 
CCDS55 PNDFLTSVVDLIGAAKSLLAWLDRSPFAAVTDYSVTRNNVIQLCLELTTIVQQDCTVYET
              130       140       150       160       170       180

        180       190       200       210       220       230      
pF1KB8 EDKVLTVVKVLNGICDKTIRSTTDPVMSQCACLEEVHLPNIKPGEGLGMYIKSTYDGLHV
       :.:.: : :.:.:.::. :  ..::..:: : :: ..: ::::.::::::::::::::::
CCDS55 ENKILHVCKTLSGVCDHIISLSSDPLVSQSAHLEVIQLANIKPSEGLGMYIKSTYDGLHV
              190       200       210       220       230       240

        240       250       260       270       280       290      
pF1KB8 ITGTTENSPADRSQKIHAGDEVIQVNQQTVVGWQLKNLVKKLRENPTGVVLLLKKRPTGS
       :::::::::::: .::::::::::::.::::::::::::. :::.:.::.: ::::: . 
CCDS55 ITGTTENSPADRCKKIHAGDEVIQVNHQTVVGWQLKNLVNALREDPSGVILTLKKRPQSM
              250       260       270       280       290       300

        300       310           320       330       340       350  
pF1KB8 FNFTPAPLKNLRWKP----PLVQTSPPPATTQSPESTMDTSLKKEKSAILDLYIPPPPAV
       .. .:: :::.::::    ::.  ::  ... .: ::..:  :...::. ::::::::: 
CCDS55 LTSAPALLKNMRWKPLALQPLIPRSPT-SSVATPSSTISTPTKRDSSALQDLYIPPPPAE
              310       320        330       340       350         

            360       370       380       390       400        410 
pF1KB8 PYSPRDENGSFVYGGSSKCKQPLPGPKGSESPNSFLDQESRRRRFTIADSDQ-LPGYSVE
       :: ::::.:..            :  :::::::::::::  :.::.:.. :  :  :  :
CCDS55 PYIPRDEKGNLPCEDLRGHMVGKPVHKGSESPNSFLDQE-YRKRFNIVEEDTVLYCYEYE
     360       370       380       390        400       410        

              420       430       440        450       460         
pF1KB8 TNILPTK-MREKTPSYGKPRPLSMPADGNWMG-IVDPFARPRGHGRKGEDALCRYFSNER
        .   ..  ::.::.::: ::.:::.. ::.:   ::    :   :  :..: ::.:::.
CCDS55 KGRSSSQGRRESTPTYGKLRPISMPVEYNWVGDYEDPNKMKRDSRR--ENSLLRYMSNEK
      420       430       440       450       460         470      

     470       480       490       500       510       520         
pF1KB8 IPPIIEESSSPPYRFSRPTTERHLVRGADYIRGSRCYINSDLHSSATIPFQEEGTKKKSG
       :                                                           
CCDS55 IAQEEYMFQRNSKKDTGKKSKKKGDKSNSPTHYSLLPSLQMDALRQDIMGTPVPETTLYH
        480       490       500       510       520       530      

>>CCDS14198.1 CNKSR2 gene_id:22866|Hs108|chrX             (1034 aa)
 initn: 1926 init1: 1543 opt: 1944  Z-score: 1503.4  bits: 288.9 E(32554): 2e-77
Smith-Waterman score: 1944; 62.7% identity (81.8% similar) in 477 aa overlap (1-470:5-477)

                   10        20        30        40        50      
pF1KB8     MEPVTKWSPKQVVDWTRGLDDCLQQYVHKFEREKINGEQLLQISHQDLEELGVTRI
           ::::.::::.::::: .:::::::::...::::::.:.:::.:.::.::.:::.::
CCDS14 MALIMEPVSKWSPSQVVDWMKGLDDCLQQYIKNFEREKISGDQLLRITHQELEDLGVSRI
               10        20        30        40        50        60

         60        70        80        90       100       110      
pF1KB8 GHQELVLEAVDLLCALNYGLETDNMKNLVLKLRASSHNLQNYISSRRKSPAYDGNTSRKA
       :::::.::::::::::::::::.:.:.:  :: ::..::::.:..::.:  ::: :::: 
CCDS14 GHQELILEAVDLLCALNYGLETENLKTLSHKLNASAKNLQNFITGRRRSGHYDGRTSRKL
               70        80        90       100       110       120

        120       130       140       150       160       170      
pF1KB8 PNEFLTSVVELIGAAKALLAWLDRAPFTGITDFSVTKNKIIQLCLDLTTTVQKDCFVAEM
       ::.::::::.::::::.:::::::.::...::.:::.:..:::::.::: ::.:: : : 
CCDS14 PNDFLTSVVDLIGAAKSLLAWLDRSPFAAVTDYSVTRNNVIQLCLELTTIVQQDCTVYET
              130       140       150       160       170       180

        180       190       200       210       220       230      
pF1KB8 EDKVLTVVKVLNGICDKTIRSTTDPVMSQCACLEEVHLPNIKPGEGLGMYIKSTYDGLHV
       :.:.: : :.:.:.::. :  ..::..:: : :: ..: ::::.::::::::::::::::
CCDS14 ENKILHVCKTLSGVCDHIISLSSDPLVSQSAHLEVIQLANIKPSEGLGMYIKSTYDGLHV
              190       200       210       220       230       240

        240       250       260       270       280       290      
pF1KB8 ITGTTENSPADRSQKIHAGDEVIQVNQQTVVGWQLKNLVKKLRENPTGVVLLLKKRPTGS
       :::::::::::: .::::::::::::.::::::::::::. :::.:.::.: ::::: . 
CCDS14 ITGTTENSPADRCKKIHAGDEVIQVNHQTVVGWQLKNLVNALREDPSGVILTLKKRPQSM
              250       260       270       280       290       300

        300       310           320       330       340       350  
pF1KB8 FNFTPAPLKNLRWKP----PLVQTSPPPATTQSPESTMDTSLKKEKSAILDLYIPPPPAV
       .. .:: :::.::::    ::.  ::  ... .: ::..:  :...::. ::::::::: 
CCDS14 LTSAPALLKNMRWKPLALQPLIPRSPT-SSVATPSSTISTPTKRDSSALQDLYIPPPPAE
              310       320        330       340       350         

            360       370       380       390       400        410 
pF1KB8 PYSPRDENGSFVYGGSSKCKQPLPGPKGSESPNSFLDQESRRRRFTIADSDQ-LPGYSVE
       :: ::::.:..            :  :::::::::::::  :.::.:.. :  :  :  :
CCDS14 PYIPRDEKGNLPCEDLRGHMVGKPVHKGSESPNSFLDQE-YRKRFNIVEEDTVLYCYEYE
     360       370       380       390        400       410        

              420       430       440        450       460         
pF1KB8 TNILPTK-MREKTPSYGKPRPLSMPADGNWMG-IVDPFARPRGHGRKGEDALCRYFSNER
        .   ..  ::.::.::: ::.:::.. ::.:   ::    :   :  :..: ::.:::.
CCDS14 KGRSSSQGRRESTPTYGKLRPISMPVEYNWVGDYEDPNKMKRDSRR--ENSLLRYMSNEK
      420       430       440       450       460         470      

     470       480       490       500       510       520         
pF1KB8 IPPIIEESSSPPYRFSRPTTERHLVRGADYIRGSRCYINSDLHSSATIPFQEEGTKKKSG
       :                                                           
CCDS14 IAQEEYMFQRNSKKDTGKKSKKKGDKSNSPTHYSLLPSLQMDALRQDIMGTPVPETTLYH
        480       490       500       510       520       530      

>>CCDS55388.1 CNKSR2 gene_id:22866|Hs108|chrX             (1004 aa)
 initn: 1821 init1: 1543 opt: 1821  Z-score: 1409.0  bits: 271.4 E(32554): 3.7e-72
Smith-Waterman score: 1821; 64.1% identity (83.3% similar) in 432 aa overlap (1-426:5-434)

                   10        20        30        40        50      
pF1KB8     MEPVTKWSPKQVVDWTRGLDDCLQQYVHKFEREKINGEQLLQISHQDLEELGVTRI
           ::::.::::.::::: .:::::::::...::::::.:.:::.:.::.::.:::.::
CCDS55 MALIMEPVSKWSPSQVVDWMKGLDDCLQQYIKNFEREKISGDQLLRITHQELEDLGVSRI
               10        20        30        40        50        60

         60        70        80        90       100       110      
pF1KB8 GHQELVLEAVDLLCALNYGLETDNMKNLVLKLRASSHNLQNYISSRRKSPAYDGNTSRKA
       :::::.::::::::::::::::.:.:.:  :: ::..::::.:..::.:  ::: :::: 
CCDS55 GHQELILEAVDLLCALNYGLETENLKTLSHKLNASAKNLQNFITGRRRSGHYDGRTSRKL
               70        80        90       100       110       120

        120       130       140       150       160       170      
pF1KB8 PNEFLTSVVELIGAAKALLAWLDRAPFTGITDFSVTKNKIIQLCLDLTTTVQKDCFVAEM
       ::.::::::.::::::.:::::::.::...::.:::.:..:::::.::: ::.:: : : 
CCDS55 PNDFLTSVVDLIGAAKSLLAWLDRSPFAAVTDYSVTRNNVIQLCLELTTIVQQDCTVYET
              130       140       150       160       170       180

        180       190       200       210       220       230      
pF1KB8 EDKVLTVVKVLNGICDKTIRSTTDPVMSQCACLEEVHLPNIKPGEGLGMYIKSTYDGLHV
       :.:.: : :.:.:.::. :  ..::..:: : :: ..: ::::.::::::::::::::::
CCDS55 ENKILHVCKTLSGVCDHIISLSSDPLVSQSAHLEVIQLANIKPSEGLGMYIKSTYDGLHV
              190       200       210       220       230       240

        240       250       260       270       280       290      
pF1KB8 ITGTTENSPADRSQKIHAGDEVIQVNQQTVVGWQLKNLVKKLRENPTGVVLLLKKRPTGS
       :::::::::::: .::::::::::::.::::::::::::. :::.:.::.: ::::: . 
CCDS55 ITGTTENSPADRCKKIHAGDEVIQVNHQTVVGWQLKNLVNALREDPSGVILTLKKRPQSM
              250       260       270       280       290       300

        300       310           320       330       340       350  
pF1KB8 FNFTPAPLKNLRWKP----PLVQTSPPPATTQSPESTMDTSLKKEKSAILDLYIPPPPAV
       .. .:: :::.::::    ::.  ::  ... .: ::..:  :...::. ::::::::: 
CCDS55 LTSAPALLKNMRWKPLALQPLIPRSPT-SSVATPSSTISTPTKRDSSALQDLYIPPPPAE
              310       320        330       340       350         

            360       370       380       390       400        410 
pF1KB8 PYSPRDENGSFVYGGSSKCKQPLPGPKGSESPNSFLDQESRRRRFTIADSDQ-LPGYSVE
       :: ::::.:..            :  :::::::::::::  :.::.:.. :  :  :  :
CCDS55 PYIPRDEKGNLPCEDLRGHMVGKPVHKGSESPNSFLDQE-YRKRFNIVEEDTVLYCYEYE
     360       370       380       390        400       410        

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pF1KB8 TNILPTK-MREKTPSYGKPRPLSMPADGNWMGIVDPFARPRGHGRKGEDALCRYFSNERI
        .   ..  ::.::.:                                            
CCDS55 KGRSSSQGRRESTPTYENSLLRYMSNEKIAQEEYMFQRNSKKDTGKKSKKKGDKSNSPTH
      420       430       440       450       460       470        

>>CCDS55389.1 CNKSR2 gene_id:22866|Hs108|chrX             (849 aa)
 initn: 1712 init1: 1329 opt: 1329  Z-score: 1031.8  bits: 201.3 E(32554): 3.8e-51
Smith-Waterman score: 1648; 56.9% identity (74.2% similar) in 473 aa overlap (1-470:5-428)

                   10        20        30        40        50      
pF1KB8     MEPVTKWSPKQVVDWTRGLDDCLQQYVHKFEREKINGEQLLQISHQDLEELGVTRI
           ::::.::::.::::: .:::::::::...::::::.:.:::.:.::.::.:::.::
CCDS55 MALIMEPVSKWSPSQVVDWMKGLDDCLQQYIKNFEREKISGDQLLRITHQELEDLGVSRI
               10        20        30        40        50        60

         60        70        80        90       100       110      
pF1KB8 GHQELVLEAVDLLCALNYGLETDNMKNLVLKLRASSHNLQNYISSRRKSPAYDGNTSRKA
       :::::.::::::::::::::::.:.:.:  :: ::..::::.:..::.:  ::: :::: 
CCDS55 GHQELILEAVDLLCALNYGLETENLKTLSHKLNASAKNLQNFITGRRRSGHYDGRTSRKL
               70        80        90       100       110       120

        120       130       140       150       160       170      
pF1KB8 PNEFLTSVVELIGAAKALLAWLDRAPFTGITDFSVTKNKIIQLCLDLTTTVQKDCFVAEM
       ::.::::::.::::::.:::::::.::...::.:::.:..:::::.::: ::.:: : : 
CCDS55 PNDFLTSVVDLIGAAKSLLAWLDRSPFAAVTDYSVTRNNVIQLCLELTTIVQQDCTVYET
              130       140       150       160       170       180

        180       190       200       210       220       230      
pF1KB8 EDKVLTVVKVLNGICDKTIRSTTDPVMSQCACLEEVHLPNIKPGEGLGMYIKSTYDGLHV
       :.:.: : :.:.:.::. :  ..::..:: : :: ..: ::::.::::::::::::::::
CCDS55 ENKILHVCKTLSGVCDHIISLSSDPLVSQSAHLEVIQLANIKPSEGLGMYIKSTYDGLHV
              190       200       210       220       230       240

        240       250       260       270       280       290      
pF1KB8 ITGTTENSPADRSQKIHAGDEVIQVNQQTVVGWQLKNLVKKLRENPTGVVLLLKKRPTGS
       :::::::::::: .::::::::::::.:::                              
CCDS55 ITGTTENSPADRCKKIHAGDEVIQVNHQTV------------------------------
              250       260       270                              

        300       310       320       330       340       350      
pF1KB8 FNFTPAPLKNLRWKPPLVQTSPPPATTQSPESTMDTSLKKEKSAILDLYIPPPPAVPYSP
                      ::.  ::  ... .: ::..:  :...::. ::::::::: :: :
CCDS55 ---------------PLIPRSPT-SSVATPSSTISTPTKRDSSALQDLYIPPPPAEPYIP
                              280       290       300       310    

        360       370       380       390       400        410     
pF1KB8 RDENGSFVYGGSSKCKQPLPGPKGSESPNSFLDQESRRRRFTIADSDQ-LPGYSVETNIL
       :::.:..            :  :::::::::::::  :.::.:.. :  :  :  : .  
CCDS55 RDEKGNLPCEDLRGHMVGKPVHKGSESPNSFLDQE-YRKRFNIVEEDTVLYCYEYEKGRS
          320       330       340        350       360       370   

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pF1KB8 PTK-MREKTPSYGKPRPLSMPADGNWMG-IVDPFARPRGHGRKGEDALCRYFSNERIPPI
        ..  ::.::.::: ::.:::.. ::.:   ::    :   :  :..: ::.:::.:   
CCDS55 SSQGRRESTPTYGKLRPISMPVEYNWVGDYEDPNKMKRDSRR--ENSLLRYMSNEKIAQE
           380       390       400       410         420       430 

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pF1KB8 IEESSSPPYRFSRPTTERHLVRGADYIRGSRCYINSDLHSSATIPFQEEGTKKKSGSSAT
                                                                   
CCDS55 EYMFQRNSKKDTGKKSKKKGDKSNSPTHYSLLPSLQMDALRQDIMGTPVPETTLYHTFQQ
             440       450       460       470       480       490 

>>CCDS276.1 CNKSR1 gene_id:10256|Hs108|chr1               (713 aa)
 initn: 562 init1: 181 opt: 396  Z-score: 315.4  bits: 68.5 E(32554): 3e-11
Smith-Waterman score: 655; 32.8% identity (56.5% similar) in 467 aa overlap (1-457:1-426)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MEPVTKWSPKQVVDWTRGLDDCLQQYVHKFEREKINGEQLLQISHQDLEELGVTRIGHQE
       ::::  :.: .:. : ::::: ::.:   ::  .. :..:::.  :.:: :.:  .::::
CCDS27 MEPVETWTPGKVATWLRGLDDSLQDY--PFEDWQLPGKNLLQLCPQSLEALAVRSLGHQE
               10        20          30        40        50        

               70        80        90       100       110       120
pF1KB8 LVLEAVDLLCALNYGLETDNMKNLVLKLRASSHNLQNYISSRRKSPAYDGNTSRKAPNEF
       :.: .:. : ::.  :.:.:...:.  : ...:..:. ..      .  :. . :.: . 
CCDS27 LILGGVEQLQALSSRLQTENLQSLTEGLLGATHDFQSIVQ------GCLGDCA-KTPIDV
       60        70        80        90             100        110 

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pF1KB8 LTSVVELIGAAKALLAWLDRAPFTGITDFSVTKNKIIQLCLDLTTTVQKDCFVAEMEDKV
       : ..:::.  : ::: ::.:  :. ..:::. . .: .:  .:. ....:  .:: :  :
CCDS27 LCAAVELLHEADALLFWLSRYLFSHLNDFSACQ-EIRDLLEELSQVLHEDGPAAEKEGTV
             120       130       140        150       160       170

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pF1KB8 LTVVKVLNGICDKTIRSTTDPVMSQCACLEEVHLPNIKPGEGLGMYIKSTYDGLHVITGT
       : . . . ::: . .      .. : : ::.:.: .  :   ::. :..: .  : .. .
CCDS27 LRICSHVAGICHNILVCCPKELLEQKAVLEQVQLDS--P---LGLEIHTTSNCQHFVSQV
              180       190       200            210       220     

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pF1KB8 TENSPADRSQKIHAGDEVIQVNQQTVVGWQLKNLVKKLRENPTGVVLLLKKRPTGSFNFT
         . :.:   .:. ::::.:.:.:.::::  ::.:..: ..:.:. :.::: :      :
CCDS27 DTQVPTDSRLQIQPGDEVVQINEQVVVGWPRKNMVRELLREPAGLSLVLKKIPIPE---T
         230       240       250       260       270       280     

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pF1KB8 PAPLKNLRWKPPLVQTSP---PPATTQSPESTMDTSLKKEKSAILDLYIPPPPAVPYSPR
       : :       :: :  ::    :. . .: :    :   :    .::   : :. : :: 
CCDS27 P-P-----QTPPQVLDSPHQRSPSLSLAPLSPRAPS---EDVFAFDLSSNPSPG-P-SPA
                  290       300       310          320         330 

       360       370       380       390       400       410       
pF1KB8 DENGSFVYGGSSKCKQPLPGPKGSESPNSFLDQESRRRRFTIADSDQLPGYSVETNILPT
         ...      :   .::: :     : ..:            . :. :    ... : :
CCDS27 WTDSA------SLGPEPLPIPP---EPPAILPAGVAGTPGLPESPDKSPVGRKKSKGLAT
                   340          350       360       370       380  

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pF1KB8 KMREKTPSYGKPRPLSMPADGNWM-------GIVDPFARPRGHGRKGEDALCRYFSNERI
       .. ..  :    : :. :   .:.       :.. :  : :    ::             
CCDS27 RLSRRRVSC---RELGRPDCDGWLLLRKAPGGFMGPRWRRRWFVLKGHTLYWYRQPQDEK
            390          400       410       420       430         

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pF1KB8 PPIIEESSSPPYRFSRPTTERHLVRGADYIRGSRCYINSDLHSSATIPFQEEGTKKKSGS
                                                                   
CCDS27 AEGLINVSNYSLESGHDQKKKYVFQLTHDVYKPFIFAADTLTDLSMWVRHLITCISKYQS
     440       450       460       470       480       490         




555 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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