Result of FASTA (ccds) for pF1KB4886
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB4886, 340 aa
  1>>>pF1KB4886 340 - 340 aa - 340 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.6468+/-0.0012; mu= 9.1105+/- 0.070
 mean_var=124.5517+/-27.899, 0's: 0 Z-trim(105.4): 210  B-trim: 78 in 2/48
 Lambda= 0.114921
 statistics sampled from 8154 (8403) to 8154 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.62), E-opt: 0.2 (0.258), width:  16
 Scan time:  2.490

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS5703.1 GNB2 gene_id:2783|Hs108|chr7            ( 340) 2330 398.0 5.9e-111
CCDS34.1 GNB1 gene_id:2782|Hs108|chr1              ( 340) 2155 369.0 3.2e-102
CCDS3230.1 GNB4 gene_id:59345|Hs108|chr3           ( 340) 2151 368.3 5.1e-102
CCDS8564.1 GNB3 gene_id:2784|Hs108|chr12           ( 340) 1970 338.3 5.5e-93
CCDS73427.1 GNB3 gene_id:2784|Hs108|chr12          ( 339) 1945 334.1 9.7e-92
CCDS72685.1 GNB1 gene_id:2782|Hs108|chr1           ( 240) 1536 266.2 1.9e-71
CCDS45261.1 GNB5 gene_id:10681|Hs108|chr15         ( 353) 1250 218.9 4.9e-57
CCDS10149.1 GNB5 gene_id:10681|Hs108|chr15         ( 395) 1250 219.0 5.3e-57
CCDS59142.1 PRPF4 gene_id:9128|Hs108|chr9          ( 521)  418 81.1 2.2e-15
CCDS6791.1 PRPF4 gene_id:9128|Hs108|chr9           ( 522)  418 81.1 2.2e-15
CCDS6981.1 WDR5 gene_id:11091|Hs108|chr9           ( 334)  397 77.5 1.7e-14
CCDS2470.1 DAW1 gene_id:164781|Hs108|chr2          ( 415)  394 77.1 2.9e-14
CCDS43876.1 WDR38 gene_id:401551|Hs108|chr9        ( 314)  389 76.1 4.2e-14
CCDS75898.1 WDR38 gene_id:401551|Hs108|chr9        ( 315)  389 76.1 4.2e-14
CCDS3012.1 WDR5B gene_id:54554|Hs108|chr3          ( 330)  382 75.0 9.7e-14
CCDS7547.1 TAF5 gene_id:6877|Hs108|chr10           ( 800)  373 73.8 5.4e-13
CCDS76785.1 WDR61 gene_id:80349|Hs108|chr15        ( 212)  337 67.4 1.2e-11
CCDS10300.1 WDR61 gene_id:80349|Hs108|chr15        ( 305)  337 67.5 1.6e-11
CCDS54592.1 POC1A gene_id:25886|Hs108|chr3         ( 359)  336 67.4   2e-11
CCDS2846.1 POC1A gene_id:25886|Hs108|chr3          ( 407)  336 67.4 2.3e-11
CCDS54591.1 POC1A gene_id:25886|Hs108|chr3         ( 369)  334 67.1 2.6e-11
CCDS340.1 SNRNP40 gene_id:9410|Hs108|chr1          ( 357)  329 66.2 4.6e-11


>>CCDS5703.1 GNB2 gene_id:2783|Hs108|chr7                 (340 aa)
 initn: 2330 init1: 2330 opt: 2330  Z-score: 2105.4  bits: 398.0 E(32554): 5.9e-111
Smith-Waterman score: 2330; 100.0% identity (100.0% similar) in 340 aa overlap (1-340:1-340)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB4 MSELEQLRQEAEQLRNQIRDARKACGDSTLTQITAGLDPVGRIQMRTRRTLRGHLAKIYA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 MSELEQLRQEAEQLRNQIRDARKACGDSTLTQITAGLDPVGRIQMRTRRTLRGHLAKIYA
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB4 MHWGTDSRLLVSASQDGKLIIWDSYTTNKVHAIPLRSSWVMTCAYAPSGNFVACGGLDNI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 MHWGTDSRLLVSASQDGKLIIWDSYTTNKVHAIPLRSSWVMTCAYAPSGNFVACGGLDNI
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB4 CSIYSLKTREGNVRVSRELPGHTGYLSCCRFLDDNQIITSSGDTTCALWDIETGQQTVGF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 CSIYSLKTREGNVRVSRELPGHTGYLSCCRFLDDNQIITSSGDTTCALWDIETGQQTVGF
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB4 AGHSGDVMSLSLAPDGRTFVSGACDASIKLWDVRDSMCRQTFIGHESDINAVAFFPNGYA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 AGHSGDVMSLSLAPDGRTFVSGACDASIKLWDVRDSMCRQTFIGHESDINAVAFFPNGYA
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB4 FTTGSDDATCRLFDLRADQELLMYSHDNIICGITSVAFSRSGRLLLAGYDDFNCNIWDAM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 FTTGSDDATCRLFDLRADQELLMYSHDNIICGITSVAFSRSGRLLLAGYDDFNCNIWDAM
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340
pF1KB4 KGDRAGVLAGHDNRVSCLGVTDDGMAVATGSWDSFLKIWN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 KGDRAGVLAGHDNRVSCLGVTDDGMAVATGSWDSFLKIWN
              310       320       330       340

>>CCDS34.1 GNB1 gene_id:2782|Hs108|chr1                   (340 aa)
 initn: 2155 init1: 2155 opt: 2155  Z-score: 1948.6  bits: 369.0 E(32554): 3.2e-102
Smith-Waterman score: 2155; 90.3% identity (97.1% similar) in 340 aa overlap (1-340:1-340)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB4 MSELEQLRQEAEQLRNQIRDARKACGDSTLTQITAGLDPVGRIQMRTRRTLRGHLAKIYA
       ::::.:::::::::.::::::::::.:.::.::: ..:::::::::::::::::::::::
CCDS34 MSELDQLRQEAEQLKNQIRDARKACADATLSQITNNIDPVGRIQMRTRRTLRGHLAKIYA
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB4 MHWGTDSRLLVSASQDGKLIIWDSYTTNKVHAIPLRSSWVMTCAYAPSGNFVACGGLDNI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::
CCDS34 MHWGTDSRLLVSASQDGKLIIWDSYTTNKVHAIPLRSSWVMTCAYAPSGNYVACGGLDNI
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB4 CSIYSLKTREGNVRVSRELPGHTGYLSCCRFLDDNQIITSSGDTTCALWDIETGQQTVGF
       ::::.:::::::::::::: :::::::::::::::::.:::::::::::::::::::. :
CCDS34 CSIYNLKTREGNVRVSRELAGHTGYLSCCRFLDDNQIVTSSGDTTCALWDIETGQQTTTF
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB4 AGHSGDVMSLSLAPDGRTFVSGACDASIKLWDVRDSMCRQTFIGHESDINAVAFFPNGYA
       .::.::::::::::: : ::::::::: ::::::..:::::: ::::::::. ::::: :
CCDS34 TGHTGDVMSLSLAPDTRLFVSGACDASAKLWDVREGMCRQTFTGHESDINAICFFPNGNA
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB4 FTTGSDDATCRLFDLRADQELLMYSHDNIICGITSVAFSRSGRLLLAGYDDFNCNIWDAM
       :.:::::::::::::::::::. :::::::::::::.::.:::::::::::::::.:::.
CCDS34 FATGSDDATCRLFDLRADQELMTYSHDNIICGITSVSFSKSGRLLLAGYDDFNCNVWDAL
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340
pF1KB4 KGDRAGVLAGHDNRVSCLGVTDDGMAVATGSWDSFLKIWN
       :.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 KADRAGVLAGHDNRVSCLGVTDDGMAVATGSWDSFLKIWN
              310       320       330       340

>>CCDS3230.1 GNB4 gene_id:59345|Hs108|chr3                (340 aa)
 initn: 2151 init1: 2151 opt: 2151  Z-score: 1945.1  bits: 368.3 E(32554): 5.1e-102
Smith-Waterman score: 2151; 90.0% identity (97.9% similar) in 340 aa overlap (1-340:1-340)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB4 MSELEQLRQEAEQLRNQIRDARKACGDSTLTQITAGLDPVGRIQMRTRRTLRGHLAKIYA
       ::::::::::::::::::.::::::.:.::.:::...: :::::::::::::::::::::
CCDS32 MSELEQLRQEAEQLRNQIQDARKACNDATLVQITSNMDSVGRIQMRTRRTLRGHLAKIYA
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB4 MHWGTDSRLLVSASQDGKLIIWDSYTTNKVHAIPLRSSWVMTCAYAPSGNFVACGGLDNI
       :::: ::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::.:::::::::
CCDS32 MHWGYDSRLLVSASQDGKLIIWDSYTTNKMHAIPLRSSWVMTCAYAPSGNYVACGGLDNI
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB4 CSIYSLKTREGNVRVSRELPGHTGYLSCCRFLDDNQIITSSGDTTCALWDIETGQQTVGF
       ::::.:::::::::::::::::::::::::::::.::.:::::::::::::::.:::. :
CCDS32 CSIYNLKTREGNVRVSRELPGHTGYLSCCRFLDDSQIVTSSGDTTCALWDIETAQQTTTF
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB4 AGHSGDVMSLSLAPDGRTFVSGACDASIKLWDVRDSMCRQTFIGHESDINAVAFFPNGYA
       .:::::::::::.:: ::::::::::: ::::.::.::::.: :: ::::::.:::::::
CCDS32 TGHSGDVMSLSLSPDMRTFVSGACDASSKLWDIRDGMCRQSFTGHVSDINAVSFFPNGYA
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB4 FTTGSDDATCRLFDLRADQELLMYSHDNIICGITSVAFSRSGRLLLAGYDDFNCNIWDAM
       :.::::::::::::::::::::.::::::::::::::::.:::::::::::::::.::..
CCDS32 FATGSDDATCRLFDLRADQELLLYSHDNIICGITSVAFSKSGRLLLAGYDDFNCNVWDTL
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340
pF1KB4 KGDRAGVLAGHDNRVSCLGVTDDGMAVATGSWDSFLKIWN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::
CCDS32 KGDRAGVLAGHDNRVSCLGVTDDGMAVATGSWDSFLRIWN
              310       320       330       340

>>CCDS8564.1 GNB3 gene_id:2784|Hs108|chr12                (340 aa)
 initn: 1970 init1: 1970 opt: 1970  Z-score: 1782.9  bits: 338.3 E(32554): 5.5e-93
Smith-Waterman score: 1970; 80.9% identity (94.4% similar) in 340 aa overlap (1-340:1-340)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB4 MSELEQLRQEAEQLRNQIRDARKACGDSTLTQITAGLDPVGRIQMRTRRTLRGHLAKIYA
       :.:.::::::::::..:: ::::::.: ::.....::. :::.:::::::::::::::::
CCDS85 MGEMEQLRQEAEQLKKQIADARKACADVTLAELVSGLEVVGRVQMRTRRTLRGHLAKIYA
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB4 MHWGTDSRLLVSASQDGKLIIWDSYTTNKVHAIPLRSSWVMTCAYAPSGNFVACGGLDNI
       :::.:::.::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.
CCDS85 MHWATDSKLLVSASQDGKLIVWDSYTTNKVHAIPLRSSWVMTCAYAPSGNFVACGGLDNM
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB4 CSIYSLKTREGNVRVSRELPGHTGYLSCCRFLDDNQIITSSGDTTCALWDIETGQQTVGF
       ::::.::.:::::.::::: .::::::::::::::.:.:::::::::::::::::: . :
CCDS85 CSIYNLKSREGNVKVSRELSAHTGYLSCCRFLDDNNIVTSSGDTTCALWDIETGQQKTVF
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB4 AGHSGDVMSLSLAPDGRTFVSGACDASIKLWDVRDSMCRQTFIGHESDINAVAFFPNGYA
       .::.:: :::...::   :.::::::: ::::::.. ::::: ::::::::. ::::: :
CCDS85 VGHTGDCMSLAVSPDFNLFISGACDASAKLWDVREGTCRQTFTGHESDINAICFFPNGEA
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB4 FTTGSDDATCRLFDLRADQELLMYSHDNIICGITSVAFSRSGRLLLAGYDDFNCNIWDAM
       . ::::::.::::::::::::. .::..::::::::::: :::::.:::::::::.::.:
CCDS85 ICTGSDDASCRLFDLRADQELICFSHESIICGITSVAFSLSGRLLFAGYDDFNCNVWDSM
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340
pF1KB4 KGDRAGVLAGHDNRVSCLGVTDDGMAVATGSWDSFLKIWN
       :..:.:.:.:::::::::::: ::::::::::::::::::
CCDS85 KSERVGILSGHDNRVSCLGVTADGMAVATGSWDSFLKIWN
              310       320       330       340

>>CCDS73427.1 GNB3 gene_id:2784|Hs108|chr12               (339 aa)
 initn: 1089 init1: 1006 opt: 1945  Z-score: 1760.5  bits: 334.1 E(32554): 9.7e-92
Smith-Waterman score: 1945; 80.6% identity (94.1% similar) in 340 aa overlap (1-340:1-339)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB4 MSELEQLRQEAEQLRNQIRDARKACGDSTLTQITAGLDPVGRIQMRTRRTLRGHLAKIYA
       :.:.::::::::::..:: ::::::.: ::.....::. :::.:::::::::::::::::
CCDS73 MGEMEQLRQEAEQLKKQIADARKACADVTLAELVSGLEVVGRVQMRTRRTLRGHLAKIYA
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB4 MHWGTDSRLLVSASQDGKLIIWDSYTTNKVHAIPLRSSWVMTCAYAPSGNFVACGGLDNI
       :::.:::.::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.
CCDS73 MHWATDSKLLVSASQDGKLIVWDSYTTNKVHAIPLRSSWVMTCAYAPSGNFVACGGLDNM
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB4 CSIYSLKTREGNVRVSRELPGHTGYLSCCRFLDDNQIITSSGDTTCALWDIETGQQTVGF
       ::::.::.:::::.::::: .::::::::::::::.:.::::::: :::::::::: . :
CCDS73 CSIYNLKSREGNVKVSRELSAHTGYLSCCRFLDDNNIVTSSGDTT-ALWDIETGQQKTVF
              130       140       150       160        170         

              190       200       210       220       230       240
pF1KB4 AGHSGDVMSLSLAPDGRTFVSGACDASIKLWDVRDSMCRQTFIGHESDINAVAFFPNGYA
       .::.:: :::...::   :.::::::: ::::::.. ::::: ::::::::. ::::: :
CCDS73 VGHTGDCMSLAVSPDFNLFISGACDASAKLWDVREGTCRQTFTGHESDINAICFFPNGEA
     180       190       200       210       220       230         

              250       260       270       280       290       300
pF1KB4 FTTGSDDATCRLFDLRADQELLMYSHDNIICGITSVAFSRSGRLLLAGYDDFNCNIWDAM
       . ::::::.::::::::::::. .::..::::::::::: :::::.:::::::::.::.:
CCDS73 ICTGSDDASCRLFDLRADQELICFSHESIICGITSVAFSLSGRLLFAGYDDFNCNVWDSM
     240       250       260       270       280       290         

              310       320       330       340
pF1KB4 KGDRAGVLAGHDNRVSCLGVTDDGMAVATGSWDSFLKIWN
       :..:.:.:.:::::::::::: ::::::::::::::::::
CCDS73 KSERVGILSGHDNRVSCLGVTADGMAVATGSWDSFLKIWN
     300       310       320       330         

>>CCDS72685.1 GNB1 gene_id:2782|Hs108|chr1                (240 aa)
 initn: 1536 init1: 1536 opt: 1536  Z-score: 1396.1  bits: 266.2 E(32554): 1.9e-71
Smith-Waterman score: 1536; 89.6% identity (96.2% similar) in 240 aa overlap (101-340:1-240)

               80        90       100       110       120       130
pF1KB4 VSASQDGKLIIWDSYTTNKVHAIPLRSSWVMTCAYAPSGNFVACGGLDNICSIYSLKTRE
                                     ::::::::::.:::::::::::::.:::::
CCDS72                               MTCAYAPSGNYVACGGLDNICSIYNLKTRE
                                             10        20        30

              140       150       160       170       180       190
pF1KB4 GNVRVSRELPGHTGYLSCCRFLDDNQIITSSGDTTCALWDIETGQQTVGFAGHSGDVMSL
       ::::::::: :::::::::::::::::.:::::::::::::::::::. :.::.::::::
CCDS72 GNVRVSRELAGHTGYLSCCRFLDDNQIVTSSGDTTCALWDIETGQQTTTFTGHTGDVMSL
               40        50        60        70        80        90

              200       210       220       230       240       250
pF1KB4 SLAPDGRTFVSGACDASIKLWDVRDSMCRQTFIGHESDINAVAFFPNGYAFTTGSDDATC
       ::::: : ::::::::: ::::::..:::::: ::::::::. ::::: ::.::::::::
CCDS72 SLAPDTRLFVSGACDASAKLWDVREGMCRQTFTGHESDINAICFFPNGNAFATGSDDATC
              100       110       120       130       140       150

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pF1KB4 RLFDLRADQELLMYSHDNIICGITSVAFSRSGRLLLAGYDDFNCNIWDAMKGDRAGVLAG
       :::::::::::. :::::::::::::.::.:::::::::::::::.:::.:.::::::::
CCDS72 RLFDLRADQELMTYSHDNIICGITSVSFSKSGRLLLAGYDDFNCNVWDALKADRAGVLAG
              160       170       180       190       200       210

              320       330       340
pF1KB4 HDNRVSCLGVTDDGMAVATGSWDSFLKIWN
       ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 HDNRVSCLGVTDDGMAVATGSWDSFLKIWN
              220       230       240

>>CCDS45261.1 GNB5 gene_id:10681|Hs108|chr15              (353 aa)
 initn: 1316 init1: 602 opt: 1250  Z-score: 1137.5  bits: 218.9 E(32554): 4.9e-57
Smith-Waterman score: 1250; 51.9% identity (78.3% similar) in 341 aa overlap (4-339:12-352)

                       10        20        30        40        50  
pF1KB4         MSELEQLRQEAEQLRNQIRDARKACGDSTLTQITAGLDPVGRIQMRTRRTLR
                  : .:..:::.:...... :    :  : :..  .. .:.. :.:::::.
CCDS45 MATEGLHENETLASLKSEAESLKGKLEEERAKLHDVELHQVAERVEALGQFVMKTRRTLK
               10        20        30        40        50        60

             60        70        80        90       100       110  
pF1KB4 GHLAKIYAMHWGTDSRLLVSASQDGKLIIWDSYTTNKVHAIPLRSSWVMTCAYAPSGNFV
       ::  :.  : :  :.: .::.:::::.:.:::.:::: ::. .  .:::.:::::::  .
CCDS45 GHGNKVLCMDWCKDKRRIVSSSQDGKVIVWDSFTTNKEHAVTMPCTWVMACAYAPSGCAI
               70        80        90       100       110       120

            120        130        140       150        160         
pF1KB4 ACGGLDNICSIYSLK-TREGNVRVSRE-LPGHTGYLSCCRFLD-DNQIITSSGDTTCALW
       ::::::: ::.: :   .. :. .... .  ::.::: : : . : ::.:.::: :::::
CCDS45 ACGGLDNKCSVYPLTFDKNENMAAKKKSVAMHTNYLSACSFTNSDMQILTASGDGTCALW
              130       140       150       160       170       180

     170       180       190         200       210       220       
pF1KB4 DIETGQQTVGFAGHSGDVMSLSLAPD--GRTFVSGACDASIKLWDVRDSMCRQTFIGHES
       :.:.::   .: ::..::. :.:::.  : :::::.:: .  .::.:...: :.:  :::
CCDS45 DVESGQLLQSFHGHGADVLCLDLAPSETGNTFVSGGCDKKAMVWDMRSGQCVQAFETHES
              190       200       210       220       230       240

       230       240       250       260       270       280       
pF1KB4 DINAVAFFPNGYAFTTGSDDATCRLFDLRADQELLMYSHDNIICGITSVAFSRSGRLLLA
       :::.: ..:.: ::..:::::::::.:::::.:. .::...:: : .:: :: :::::.:
CCDS45 DINSVRYYPSGDAFASGSDDATCRLYDLRADREVAIYSKESIIFGASSVDFSLSGRLLFA
              250       260       270       280       290       300

       290       300       310       320       330       340
pF1KB4 GYDDFNCNIWDAMKGDRAGVLAGHDNRVSCLGVTDDGMAVATGSWDSFLKIWN
       ::.:.. :.::..::.:...: ::.:::: : :. :: :  .::::  :..: 
CCDS45 GYNDYTINVWDVLKGSRVSILFGHENRVSTLRVSPDGTAFCSGSWDHTLRVWA
              310       320       330       340       350   

>>CCDS10149.1 GNB5 gene_id:10681|Hs108|chr15              (395 aa)
 initn: 1316 init1: 602 opt: 1250  Z-score: 1136.8  bits: 219.0 E(32554): 5.3e-57
Smith-Waterman score: 1250; 51.9% identity (78.3% similar) in 341 aa overlap (4-339:54-394)

                                          10        20        30   
pF1KB4                            MSELEQLRQEAEQLRNQIRDARKACGDSTLTQI
                                     : .:..:::.:...... :    :  : :.
CCDS10 RPVFKKSQQLSYCSTCAEIMATEGLHENETLASLKSEAESLKGKLEEERAKLHDVELHQV
            30        40        50        60        70        80   

            40        50        60        70        80        90   
pF1KB4 TAGLDPVGRIQMRTRRTLRGHLAKIYAMHWGTDSRLLVSASQDGKLIIWDSYTTNKVHAI
       .  .. .:.. :.:::::.::  :.  : :  :.: .::.:::::.:.:::.:::: ::.
CCDS10 AERVEALGQFVMKTRRTLKGHGNKVLCMDWCKDKRRIVSSSQDGKVIVWDSFTTNKEHAV
            90       100       110       120       130       140   

           100       110       120        130        140       150 
pF1KB4 PLRSSWVMTCAYAPSGNFVACGGLDNICSIYSLK-TREGNVRVSRE-LPGHTGYLSCCRF
        .  .:::.:::::::  .::::::: ::.: :   .. :. .... .  ::.::: : :
CCDS10 TMPCTWVMACAYAPSGCAIACGGLDNKCSVYPLTFDKNENMAAKKKSVAMHTNYLSACSF
           150       160       170       180       190       200   

              160       170       180       190         200        
pF1KB4 LD-DNQIITSSGDTTCALWDIETGQQTVGFAGHSGDVMSLSLAPD--GRTFVSGACDASI
        . : ::.:.::: ::::::.:.::   .: ::..::. :.:::.  : :::::.:: . 
CCDS10 TNSDMQILTASGDGTCALWDVESGQLLQSFHGHGADVLCLDLAPSETGNTFVSGGCDKKA
           210       220       230       240       250       260   

      210       220       230       240       250       260        
pF1KB4 KLWDVRDSMCRQTFIGHESDINAVAFFPNGYAFTTGSDDATCRLFDLRADQELLMYSHDN
        .::.:...: :.:  ::::::.: ..:.: ::..:::::::::.:::::.:. .::...
CCDS10 MVWDMRSGQCVQAFETHESDINSVRYYPSGDAFASGSDDATCRLYDLRADREVAIYSKES
           270       280       290       300       310       320   

      270       280       290       300       310       320        
pF1KB4 IICGITSVAFSRSGRLLLAGYDDFNCNIWDAMKGDRAGVLAGHDNRVSCLGVTDDGMAVA
       :: : .:: :: :::::.:::.:.. :.::..::.:...: ::.:::: : :. :: :  
CCDS10 IIFGASSVDFSLSGRLLFAGYNDYTINVWDVLKGSRVSILFGHENRVSTLRVSPDGTAFC
           330       340       350       360       370       380   

      330       340
pF1KB4 TGSWDSFLKIWN
       .::::  :..: 
CCDS10 SGSWDHTLRVWA
           390     

>>CCDS59142.1 PRPF4 gene_id:9128|Hs108|chr9               (521 aa)
 initn: 347 init1: 239 opt: 418  Z-score: 389.7  bits: 81.1 E(32554): 2.2e-15
Smith-Waterman score: 418; 27.8% identity (60.8% similar) in 291 aa overlap (62-339:237-518)

              40        50        60        70        80        90 
pF1KB4 QITAGLDPVGRIQMRTRRTLRGHLAKIYAMHWGTDSRLLVSASQDGKLIIWDSYTTNKVH
                                     :.. .:..:..:  .:   .:.    : .:
CCDS59 TSQMQELHKSLRSLNNFCSQIGDDRPISYCHFSPNSKMLATACWSGLCKLWSVPDCNLLH
        210       220       230       240       250       260      

             100                110       120       130       140  
pF1KB4 AIPLRSSWVMTCAYAPSG---------NFVACGGLDNICSIYSLKTREGNVRVSRELPGH
       ..  ... : . .. :..         :...:.. :.  ...:: . :  .    .. ::
CCDS59 TLRGHNTNVGAIVFHPKSTVSLDPKDVNLASCAA-DGSVKLWSLDSDEPVA----DIEGH
        270       280       290       300        310           320 

            150        160       170       180       190       200 
pF1KB4 TGYLSCCRFLDDNQII-TSSGDTTCALWDIETGQQTVGFAGHSGDVMSLSLAPDGRTFVS
       :  ..   .  ..... :.  : .  :::.:. .. .   :::  :.....  ::    .
CCDS59 TVRVARVMWHPSGRFLGTTCYDRSWRLWDLEAQEEILHQEGHSMGVYDIAFHQDGSLAGT
             330       340       350       360       370       380 

             210       220       230       240       250       260 
pF1KB4 GACDASIKLWDVRDSMCRQTFIGHESDINAVAFFPNGYAFTTGSDDATCRLFDLRADQEL
       :. ::  ..::.: . : . . :: ..: .. : :::: ..::: : ::...:::  :. 
CCDS59 GGLDAFGRVWDLRTGRCIMFLEGHLKEIYGINFSPNGYHIATGSGDNTCKVWDLR--QRR
             390       400       410       420       430           

                270       280       290       300       310        
pF1KB4 LMYS---HDNIICGITSVAFSRSGRLLLAGYDDFNCNIWDAMKGDRAGVLAGHDNRVSCL
        .:.   :.:.. :.    .   : .::.:  : . .::     .   .::::...:  :
CCDS59 CVYTIPAHQNLVTGVKFEPIH--GNFLLTGAYDNTAKIWTHPGWSPLKTLAGHEGKVMGL
     440       450       460         470       480       490       

      320       330       340  
pF1KB4 GVTDDGMAVATGSWDSFLKIWN  
        ...::. .:: :.:  .:.:   
CCDS59 DISSDGQLIATCSYDRTFKLWMAE
       500       510       520 

>>CCDS6791.1 PRPF4 gene_id:9128|Hs108|chr9                (522 aa)
 initn: 347 init1: 239 opt: 418  Z-score: 389.7  bits: 81.1 E(32554): 2.2e-15
Smith-Waterman score: 418; 27.8% identity (60.8% similar) in 291 aa overlap (62-339:238-519)

              40        50        60        70        80        90 
pF1KB4 QITAGLDPVGRIQMRTRRTLRGHLAKIYAMHWGTDSRLLVSASQDGKLIIWDSYTTNKVH
                                     :.. .:..:..:  .:   .:.    : .:
CCDS67 TSQMQELHKSLRSLNNFCSQIGDDRPISYCHFSPNSKMLATACWSGLCKLWSVPDCNLLH
       210       220       230       240       250       260       

             100                110       120       130       140  
pF1KB4 AIPLRSSWVMTCAYAPSG---------NFVACGGLDNICSIYSLKTREGNVRVSRELPGH
       ..  ... : . .. :..         :...:.. :.  ...:: . :  .    .. ::
CCDS67 TLRGHNTNVGAIVFHPKSTVSLDPKDVNLASCAA-DGSVKLWSLDSDEPVA----DIEGH
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