Result of FASTA (omim) for pF1KB5427
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB5427, 378 aa
  1>>>pF1KB5427 378 - 378 aa - 378 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6867+/-0.000405; mu= 14.0425+/- 0.025
 mean_var=63.6994+/-13.042, 0's: 0 Z-trim(112.2): 44  B-trim: 1103 in 2/53
 Lambda= 0.160697
 statistics sampled from 21016 (21061) to 21016 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.613), E-opt: 0.2 (0.247), width:  16
 Scan time:  7.600

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_064518 (OMIM: 614795) 1-acyl-sn-glycerol-3-phos ( 378) 2591 609.6 3.8e-174
XP_016866548 (OMIM: 614795) PREDICTED: 1-acyl-sn-g ( 244) 1675 397.2 2.2e-110
XP_005267110 (OMIM: 614795) PREDICTED: 1-acyl-sn-g ( 244) 1675 397.2 2.2e-110
XP_005261217 (OMIM: 614794) PREDICTED: 1-acyl-sn-g ( 376) 1661 394.0 3.1e-109
XP_006724092 (OMIM: 614794) PREDICTED: 1-acyl-sn-g ( 376) 1661 394.0 3.1e-109
XP_016883898 (OMIM: 614794) PREDICTED: 1-acyl-sn-g ( 376) 1661 394.0 3.1e-109
NP_064517 (OMIM: 614794) 1-acyl-sn-glycerol-3-phos ( 376) 1661 394.0 3.1e-109
XP_016883899 (OMIM: 614794) PREDICTED: 1-acyl-sn-g ( 376) 1661 394.0 3.1e-109
XP_006724093 (OMIM: 614794) PREDICTED: 1-acyl-sn-g ( 376) 1661 394.0 3.1e-109
XP_011527967 (OMIM: 614794) PREDICTED: 1-acyl-sn-g ( 376) 1661 394.0 3.1e-109
NP_001032642 (OMIM: 614794) 1-acyl-sn-glycerol-3-p ( 376) 1661 394.0 3.1e-109
XP_011527964 (OMIM: 614794) PREDICTED: 1-acyl-sn-g ( 463) 1661 394.0 3.7e-109
XP_011527962 (OMIM: 614794) PREDICTED: 1-acyl-sn-g ( 358) 1422 338.6 1.4e-92
XP_011527966 (OMIM: 614794) PREDICTED: 1-acyl-sn-g ( 380) 1422 338.6 1.5e-92
XP_016883897 (OMIM: 614794) PREDICTED: 1-acyl-sn-g ( 406) 1422 338.6 1.6e-92
XP_011527965 (OMIM: 614794) PREDICTED: 1-acyl-sn-g ( 416) 1422 338.6 1.6e-92
XP_011527963 (OMIM: 614794) PREDICTED: 1-acyl-sn-g ( 450) 1422 338.6 1.7e-92
XP_006715577 (OMIM: 614795) PREDICTED: 1-acyl-sn-g ( 324) 1413 336.5 5.4e-92
XP_016883900 (OMIM: 614794) PREDICTED: 1-acyl-sn-g ( 314) 1408 335.3 1.2e-91
XP_006724094 (OMIM: 614794) PREDICTED: 1-acyl-sn-g ( 314) 1408 335.3 1.2e-91
XP_016883902 (OMIM: 614794) PREDICTED: 1-acyl-sn-g ( 314) 1408 335.3 1.2e-91
XP_016883901 (OMIM: 614794) PREDICTED: 1-acyl-sn-g ( 314) 1408 335.3 1.2e-91
XP_016859235 (OMIM: 614241) PREDICTED: lysocardiol ( 376)  387 98.6 2.5e-20
XP_005264302 (OMIM: 614241) PREDICTED: lysocardiol ( 376)  387 98.6 2.5e-20
XP_011531045 (OMIM: 614241) PREDICTED: lysocardiol ( 376)  387 98.6 2.5e-20
NP_001002257 (OMIM: 614241) lysocardiolipin acyltr ( 376)  387 98.6 2.5e-20
XP_011531044 (OMIM: 614241) PREDICTED: lysocardiol ( 376)  387 98.6 2.5e-20
NP_001291374 (OMIM: 614241) lysocardiolipin acyltr ( 376)  387 98.6 2.5e-20
NP_872357 (OMIM: 614241) lysocardiolipin acyltrans ( 414)  387 98.6 2.7e-20
XP_005264301 (OMIM: 614241) PREDICTED: lysocardiol ( 414)  387 98.6 2.7e-20
XP_011531043 (OMIM: 614241) PREDICTED: lysocardiol ( 414)  387 98.6 2.7e-20
XP_016859236 (OMIM: 614241) PREDICTED: lysocardiol ( 252)  282 74.2 3.7e-13
NP_060831 (OMIM: 614796) 1-acyl-sn-glycerol-3-phos ( 364)  261 69.4 1.5e-11
NP_001291375 (OMIM: 614241) lysocardiolipin acyltr ( 252)  254 67.7 3.3e-11
XP_011531046 (OMIM: 614241) PREDICTED: lysocardiol ( 252)  254 67.7 3.3e-11
XP_016883903 (OMIM: 614794) PREDICTED: 1-acyl-sn-g ( 233)  236 63.5 5.6e-10
XP_011533053 (OMIM: 614796) PREDICTED: 1-acyl-sn-g ( 193)  138 40.8  0.0032


>>NP_064518 (OMIM: 614795) 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphat  (378 aa)
 initn: 2591 init1: 2591 opt: 2591  Z-score: 3247.4  bits: 609.6 E(85289): 3.8e-174
Smith-Waterman score: 2591; 100.0% identity (100.0% similar) in 378 aa overlap (1-378:1-378)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MDLAGLLKSQFLCHLVFCYVFIASGLIINTIQLFTLLLWPINKQLFRKINCRLSYCISSQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_064 MDLAGLLKSQFLCHLVFCYVFIASGLIINTIQLFTLLLWPINKQLFRKINCRLSYCISSQ
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 LVMLLEWWSGTECTIFTDPRAYLKYGKENAIVVLNHKFEIDFLCGWSLSERFGLLGGSKV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_064 LVMLLEWWSGTECTIFTDPRAYLKYGKENAIVVLNHKFEIDFLCGWSLSERFGLLGGSKV
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB5 LAKKELAYVPIIGWMWYFTEMVFCSRKWEQDRKTVATSLQHLRDYPEKYFFLIHCEGTRF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_064 LAKKELAYVPIIGWMWYFTEMVFCSRKWEQDRKTVATSLQHLRDYPEKYFFLIHCEGTRF
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB5 TEKKHEISMQVARAKGLPRLKHHLLPRTKGFAITVRSLRNVVSAVYDCTLNFRNNENPTL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_064 TEKKHEISMQVARAKGLPRLKHHLLPRTKGFAITVRSLRNVVSAVYDCTLNFRNNENPTL
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB5 LGVLNGKKYHADLYVRRIPLEDIPEDDDECSAWLHKLYQEKDAFQEEYYRTGTFPETPMV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_064 LGVLNGKKYHADLYVRRIPLEDIPEDDDECSAWLHKLYQEKDAFQEEYYRTGTFPETPMV
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB5 PPRRPWTLVNWLFWASLVLYPFFQFLVSMIRSGSSLTLASFILVFFVASVGVRWMIGVTE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_064 PPRRPWTLVNWLFWASLVLYPFFQFLVSMIRSGSSLTLASFILVFFVASVGVRWMIGVTE
              310       320       330       340       350       360

              370        
pF1KB5 IDKGSAYGNSDSKQKLND
       ::::::::::::::::::
NP_064 IDKGSAYGNSDSKQKLND
              370        

>>XP_016866548 (OMIM: 614795) PREDICTED: 1-acyl-sn-glyce  (244 aa)
 initn: 1675 init1: 1675 opt: 1675  Z-score: 2102.8  bits: 397.2 E(85289): 2.2e-110
Smith-Waterman score: 1675; 100.0% identity (100.0% similar) in 244 aa overlap (135-378:1-244)

          110       120       130       140       150       160    
pF1KB5 GWSLSERFGLLGGSKVLAKKELAYVPIIGWMWYFTEMVFCSRKWEQDRKTVATSLQHLRD
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016                               MWYFTEMVFCSRKWEQDRKTVATSLQHLRD
                                             10        20        30

          170       180       190       200       210       220    
pF1KB5 YPEKYFFLIHCEGTRFTEKKHEISMQVARAKGLPRLKHHLLPRTKGFAITVRSLRNVVSA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 YPEKYFFLIHCEGTRFTEKKHEISMQVARAKGLPRLKHHLLPRTKGFAITVRSLRNVVSA
               40        50        60        70        80        90

          230       240       250       260       270       280    
pF1KB5 VYDCTLNFRNNENPTLLGVLNGKKYHADLYVRRIPLEDIPEDDDECSAWLHKLYQEKDAF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VYDCTLNFRNNENPTLLGVLNGKKYHADLYVRRIPLEDIPEDDDECSAWLHKLYQEKDAF
              100       110       120       130       140       150

          290       300       310       320       330       340    
pF1KB5 QEEYYRTGTFPETPMVPPRRPWTLVNWLFWASLVLYPFFQFLVSMIRSGSSLTLASFILV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 QEEYYRTGTFPETPMVPPRRPWTLVNWLFWASLVLYPFFQFLVSMIRSGSSLTLASFILV
              160       170       180       190       200       210

          350       360       370        
pF1KB5 FFVASVGVRWMIGVTEIDKGSAYGNSDSKQKLND
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 FFVASVGVRWMIGVTEIDKGSAYGNSDSKQKLND
              220       230       240    

>>XP_005267110 (OMIM: 614795) PREDICTED: 1-acyl-sn-glyce  (244 aa)
 initn: 1675 init1: 1675 opt: 1675  Z-score: 2102.8  bits: 397.2 E(85289): 2.2e-110
Smith-Waterman score: 1675; 100.0% identity (100.0% similar) in 244 aa overlap (135-378:1-244)

          110       120       130       140       150       160    
pF1KB5 GWSLSERFGLLGGSKVLAKKELAYVPIIGWMWYFTEMVFCSRKWEQDRKTVATSLQHLRD
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005                               MWYFTEMVFCSRKWEQDRKTVATSLQHLRD
                                             10        20        30

          170       180       190       200       210       220    
pF1KB5 YPEKYFFLIHCEGTRFTEKKHEISMQVARAKGLPRLKHHLLPRTKGFAITVRSLRNVVSA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 YPEKYFFLIHCEGTRFTEKKHEISMQVARAKGLPRLKHHLLPRTKGFAITVRSLRNVVSA
               40        50        60        70        80        90

          230       240       250       260       270       280    
pF1KB5 VYDCTLNFRNNENPTLLGVLNGKKYHADLYVRRIPLEDIPEDDDECSAWLHKLYQEKDAF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 VYDCTLNFRNNENPTLLGVLNGKKYHADLYVRRIPLEDIPEDDDECSAWLHKLYQEKDAF
              100       110       120       130       140       150

          290       300       310       320       330       340    
pF1KB5 QEEYYRTGTFPETPMVPPRRPWTLVNWLFWASLVLYPFFQFLVSMIRSGSSLTLASFILV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 QEEYYRTGTFPETPMVPPRRPWTLVNWLFWASLVLYPFFQFLVSMIRSGSSLTLASFILV
              160       170       180       190       200       210

          350       360       370        
pF1KB5 FFVASVGVRWMIGVTEIDKGSAYGNSDSKQKLND
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 FFVASVGVRWMIGVTEIDKGSAYGNSDSKQKLND
              220       230       240    

>>XP_005261217 (OMIM: 614794) PREDICTED: 1-acyl-sn-glyce  (376 aa)
 initn: 1700 init1: 1651 opt: 1661  Z-score: 2082.2  bits: 394.0 E(85289): 3.1e-109
Smith-Waterman score: 1661; 61.9% identity (84.8% similar) in 375 aa overlap (1-375:1-375)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MDLAGLLKSQFLCHLVFCYVFIASGLIINTIQLFTLLLWPINKQLFRKINCRLSYCISSQ
       : : ..::.::. ::.  .::..:::.:: .:: :: :::..:::.:..::::.: . ::
XP_005 MGLLAFLKTQFVLHLLVGFVFVVSGLVINFVQLCTLALWPVSKQLYRRLNCRLAYSLWSQ
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 LVMLLEWWSGTECTIFTDPRAYLKYGKENAIVVLNHKFEIDFLCGWSLSERFGLLGGSKV
       ::::::::: ::::.:::  .  ..:::.:...:::.:::::::::.. ::::.::.:::
XP_005 LVMLLEWWSCTECTLFTDQATVERFGKEHAVIILNHNFEIDFLCGWTMCERFGVLGSSKV
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB5 LAKKELAYVPIIGWMWYFTEMVFCSRKWEQDRKTVATSLQHLRDYPEKYFFLIHCEGTRF
       :::::: :::.::: ::: :.:::.::::.:: ::. .:..: :::: ..::..::::::
XP_005 LAKKELLYVPLIGWTWYFLEIVFCKRKWEEDRDTVVEGLRRLSDYPEYMWFLLYCEGTRF
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB5 TEKKHEISMQVARAKGLPRLKHHLLPRTKGFAITVRSLRNVVSAVYDCTLNFRNNENPTL
       :: ::..::.:: ::::: ::.:::::::::. .:. ::..:.:::: :::::.:.::.:
XP_005 TETKHRVSMEVAAAKGLPVLKYHLLPRTKGFTTAVKCLRGTVAAVYDVTLNFRGNKNPSL
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB5 LGVLNGKKYHADLYVRRIPLEDIPEDDDECSAWLHKLYQEKDAFQEEYYRTGTFPETPMV
       ::.: ::::.::. :::.:::::: :. : . :::::::::::.:: : . : ::   . 
XP_005 LGILYGKKYEADMCVRRFPLEDIPLDEKEAAQWLHKLYQEKDALQEIYNQKGMFPGEQFK
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pF1KB5 PPRRPWTLVNWLFWASLVLYPFFQFLVSMIRSGSSLTLASFILVFFVASVGVRWMIGVTE
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XP_016 PARRPWTLLNFLSWATILLSPLFSFVLGVFASGSPLLILTFLGFVGAASFGVRRLIGVTE
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pF1KB5 IDKGSAYGNSDSKQKLND
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XP_016 IEKGSSYGNQEFKKKE  
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>>XP_006724093 (OMIM: 614794) PREDICTED: 1-acyl-sn-glyce  (376 aa)
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pF1KB5 MDLAGLLKSQFLCHLVFCYVFIASGLIINTIQLFTLLLWPINKQLFRKINCRLSYCISSQ
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XP_006 MGLLAFLKTQFVLHLLVGFVFVVSGLVINFVQLCTLALWPVSKQLYRRLNCRLAYSLWSQ
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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