Result of SIM4 for pF1KB5307

seq1 = pF1KB5307.tfa, 1236 bp
seq2 = pF1KB5307/gi568815582f_31009224.tfa (gi568815582f:31009224_31212262), 203039 bp

>pF1KB5307 1236
>gi568815582f:31009224_31212262 (Chr16)

1-195  (100001-100195)   100% ->
196-264  (100288-100356)   100% ->
265-375  (100450-100560)   100% ->
376-423  (100854-100901)   100% ->
424-543  (100982-101101)   100% ->
544-642  (101178-101276)   100% ->
643-716  (101465-101538)   100% ->
717-845  (101868-101996)   100% ->
846-935  (102077-102166)   100% ->
936-1094  (102646-102804)   100% ->
1095-1236  (102898-103039)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGATCCTGGCGTCGGTGCTGAGGAGCGGTCCCGGGGGCGGGCTTCCGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGATCCTGGCGTCGGTGCTGAGGAGCGGTCCCGGGGGCGGGCTTCCGCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCGGCCCCTCCTGGGACCCGCACTCGCGCTCCGGGCCCGCTCGACGTCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCGGCCCCTCCTGGGACCCGCACTCGCGCTCCGGGCCCGCTCGACGTCGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCACCGACACACACCACGTGGAGATGGCTCGGGAGCGCTCCAAGACCGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCACCGACACACACCACGTGGAGATGGCTCGGGAGCGCTCCAAGACCGTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ACCTCCTTTTACAACCAGTCGGCCATCGACGCGGCAGCGGAGAAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 100151 ACCTCCTTTTACAACCAGTCGGCCATCGACGCGGCAGCGGAGAAGGTG..

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    196     CCCTCAGTCCGCCTAACGCCCACCATGATGCTCTACGCTGGCCGCT
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 .TAGCCCTCAGTCCGCCTAACGCCCACCATGATGCTCTACGCTGGCCGCT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CTCAGGACGGCAGCCACCTTCTG         AAAAGTGCTCGGTACCTG
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 100334 CTCAGGACGGCAGCCACCTTCTGGTA...CAGAAAAGTGCTCGGTACCTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CAGCAAGAACTTCCAGTGAGGATTGCTCACCGCATCAAGGGCTTCCGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100468 CAGCAAGAACTTCCAGTGAGGATTGCTCACCGCATCAAGGGCTTCCGCTG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CCTTCCTTTCATCATTGGCTGCAACCCCACCATACTGCACGTG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 100518 CCTTCCTTTCATCATTGGCTGCAACCCCACCATACTGCACGTGGTA...C

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    376   CATGAGCTATATATCCGTGCCTTCCAGAAGCTGACAGACTTCCCTCCG
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100852 AGCATGAGCTATATATCCGTGCCTTCCAGAAGCTGACAGACTTCCCTCCG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424          ATCAAGGACCAGGCGGACGAGGCCCAGTACTGCCAGCTGGT
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100902 GTG...CAGATCAAGGACCAGGCGGACGAGGCCCAGTACTGCCAGCTGGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 GCGACAGCTGCTGGATGACCACAAGGATGTGGTGACCCTCTTGGCAGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101023 GCGACAGCTGCTGGATGACCACAAGGATGTGGTGACCCTCTTGGCAGAGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 GCCTACGTGAGAGCCGGAAGCACATAGAG         GATGAAAAGCTC
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 101073 GCCTACGTGAGAGCCGGAAGCACATAGAGGTT...CAGGATGAAAAGCTC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 GTCCGCTACTTCTTGGACAAGACGCTGACTTCGAGGCTTGGAATCCGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101190 GTCCGCTACTTCTTGGACAAGACGCTGACTTCGAGGCTTGGAATCCGCAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 GTTGGCCACGCATCACCTGGCGCTGCATGAGGACAAG         CCTG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 101240 GTTGGCCACGCATCACCTGGCGCTGCATGAGGACAAGGTG...CAGCCTG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 ACTTTGTCGGCATCATCTGTACTCGTCTCTCACCAAAGAAGATTATTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101469 ACTTTGTCGGCATCATCTGTACTCGTCTCTCACCAAAGAAGATTATTGAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 AAGTGGGTGGACTTTGCCAG         ACGCCTGTGTGAGCACAAGTA
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 101519 AAGTGGGTGGACTTTGCCAGGTG...CAGACGCCTGTGTGAGCACAAGTA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    738 TGGCAATGCGCCCCGTGTCCGCATCAATGGCCATGTGGCTGCCCGGTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101889 TGGCAATGCGCCCCGTGTCCGCATCAATGGCCATGTGGCTGCCCGGTTCC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 CCTTCATCCCTATGCCACTGGACTACATCCTGCCGGAGCTGCTCAAGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101939 CCTTCATCCCTATGCCACTGGACTACATCCTGCCGGAGCTGCTCAAGAAT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 GCCATGAG         AGCCACAATGGAGAGTCACCTAGACACTCCCTA
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 101989 GCCATGAGGTG...TAGAGCCACAATGGAGAGTCACCTAGACACTCCCTA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    879 CAATGTCCCAGATGTGGTCATCACCATCGCCAACAATGATGTCGATCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102110 CAATGTCCCAGATGTGGTCATCACCATCGCCAACAATGATGTCGATCTGA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    929 TCATCAG         GATCTCAGACCGTGGTGGAGGAATCGCTCACAAA
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102160 TCATCAGGTT...TAGGATCTCAGACCGTGGTGGAGGAATCGCTCACAAA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    970 GATCTGGACCGGGTCATGGACTACCACTTCACTACTGCTGAGGCCAGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102680 GATCTGGACCGGGTCATGGACTACCACTTCACTACTGCTGAGGCCAGCAC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1020 ACAGGACCCCCGGATCAGCCCCCTCTTTGGCCATCTGGACATGCATAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102730 ACAGGACCCCCGGATCAGCCCCCTCTTTGGCCATCTGGACATGCATAGTG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1070 GCGCCCAGTCAGGACCCATGCACGG         CTTTGGCTTCGGGTTG
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 102780 GCGCCCAGTCAGGACCCATGCACGGGTG...CAGCTTTGGCTTCGGGTTG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1111 CCCACGTCACGGGCCTACGCGGAGTACCTCGGTGGGTCTCTGCAGCTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102914 CCCACGTCACGGGCCTACGCGGAGTACCTCGGTGGGTCTCTGCAGCTGCA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1161 GTCCCTGCAGGGCATTGGCACGGACGTCTACCTGCGGCTCCGCCACATCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102964 GTCCCTGCAGGGCATTGGCACGGACGTCTACCTGCGGCTCCGCCACATCG

   1300     .    :    .    :    .
   1211 ATGGCCGGGAGGAAAGCTTCCGGATC
        ||||||||||||||||||||||||||
 103014 ATGGCCGGGAGGAAAGCTTCCGGATC

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