Result of FASTA (omim) for pF1KB6110
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB6110, 628 aa
  1>>>pF1KB6110 628 - 628 aa - 628 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.3506+/-0.000329; mu= 6.7325+/- 0.021
 mean_var=178.9132+/-36.627, 0's: 0 Z-trim(122.1): 65  B-trim: 1315 in 1/57
 Lambda= 0.095886
 statistics sampled from 39696 (39763) to 39696 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.78), E-opt: 0.2 (0.466), width:  16
 Scan time: 13.680

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_006090 (OMIM: 605987) E3 SUMO-protein ligase PI ( 628) 4294 606.2 1.1e-172
NP_057250 (OMIM: 603566) E3 SUMO-protein ligase PI ( 651) 2303 330.7 9.5e-90
XP_016878177 (OMIM: 603566) PREDICTED: E3 SUMO-pro ( 653) 2282 327.8 7.2e-89
NP_001307616 (OMIM: 603566) E3 SUMO-protein ligase ( 653) 2282 327.8 7.2e-89
XP_011520429 (OMIM: 603566) PREDICTED: E3 SUMO-pro ( 645) 2279 327.4 9.4e-89
XP_016878178 (OMIM: 603566) PREDICTED: E3 SUMO-pro ( 644) 2275 326.9 1.4e-88
XP_011520428 (OMIM: 603566) PREDICTED: E3 SUMO-pro ( 660) 2275 326.9 1.4e-88
XP_016878179 (OMIM: 603566) PREDICTED: E3 SUMO-pro ( 642) 2274 326.7 1.5e-88
XP_016878180 (OMIM: 603566) PREDICTED: E3 SUMO-pro ( 642) 2274 326.7 1.5e-88
XP_011524561 (OMIM: 603567) PREDICTED: E3 SUMO-pro ( 613) 1814 263.1 2.1e-69
XP_016881557 (OMIM: 603567) PREDICTED: E3 SUMO-pro ( 613) 1814 263.1 2.1e-69
NP_001310976 (OMIM: 603567) E3 SUMO-protein ligase ( 613) 1814 263.1 2.1e-69
XP_011524560 (OMIM: 603567) PREDICTED: E3 SUMO-pro ( 620) 1814 263.1 2.1e-69
XP_005258436 (OMIM: 603567) PREDICTED: E3 SUMO-pro ( 622) 1814 263.1 2.1e-69
XP_005258434 (OMIM: 603567) PREDICTED: E3 SUMO-pro ( 626) 1814 263.1 2.1e-69
XP_006722634 (OMIM: 603567) PREDICTED: E3 SUMO-pro ( 661) 1814 263.1 2.2e-69
XP_016881559 (OMIM: 603567) PREDICTED: E3 SUMO-pro ( 612) 1813 262.9 2.3e-69
NP_001310977 (OMIM: 603567) E3 SUMO-protein ligase ( 612) 1813 262.9 2.3e-69
NP_001310978 (OMIM: 603567) E3 SUMO-protein ligase ( 612) 1813 262.9 2.3e-69
XP_016881558 (OMIM: 603567) PREDICTED: E3 SUMO-pro ( 612) 1813 262.9 2.3e-69
NP_004662 (OMIM: 603567) E3 SUMO-protein ligase PI ( 621) 1813 262.9 2.3e-69
XP_006722635 (OMIM: 603567) PREDICTED: E3 SUMO-pro ( 660) 1813 263.0 2.4e-69
NP_001310975 (OMIM: 603567) E3 SUMO-protein ligase ( 571) 1799 261.0 8.3e-69
XP_016881560 (OMIM: 603567) PREDICTED: E3 SUMO-pro ( 563) 1768 256.7 1.6e-67
XP_016881561 (OMIM: 603567) PREDICTED: E3 SUMO-pro ( 563) 1768 256.7 1.6e-67
NP_001310982 (OMIM: 603567) E3 SUMO-protein ligase ( 563) 1768 256.7 1.6e-67
NP_001310980 (OMIM: 603567) E3 SUMO-protein ligase ( 563) 1768 256.7 1.6e-67
NP_001310983 (OMIM: 603567) E3 SUMO-protein ligase ( 563) 1768 256.7 1.6e-67
NP_001310981 (OMIM: 603567) E3 SUMO-protein ligase ( 563) 1768 256.7 1.6e-67
NP_775298 (OMIM: 603567) E3 SUMO-protein ligase PI ( 572) 1768 256.7 1.6e-67
XP_006722636 (OMIM: 603567) PREDICTED: E3 SUMO-pro ( 611) 1768 256.7 1.7e-67
NP_001310988 (OMIM: 603567) E3 SUMO-protein ligase ( 498) 1722 250.3 1.2e-65
NP_001310986 (OMIM: 603567) E3 SUMO-protein ligase ( 498) 1722 250.3 1.2e-65
NP_001310984 (OMIM: 603567) E3 SUMO-protein ligase ( 498) 1722 250.3 1.2e-65
NP_001310987 (OMIM: 603567) E3 SUMO-protein ligase ( 507) 1722 250.3 1.2e-65
NP_056981 (OMIM: 605989) E3 SUMO-protein ligase PI ( 510) 1455 213.4 1.6e-54
XP_011526362 (OMIM: 605989) PREDICTED: E3 SUMO-pro ( 529) 1439 211.2 7.7e-54
NP_001310989 (OMIM: 603567) E3 SUMO-protein ligase ( 405) 1395 205.0 4.2e-52
XP_016882357 (OMIM: 605989) PREDICTED: E3 SUMO-pro ( 319) 1019 152.9 1.6e-36
XP_016871931 (OMIM: 607159) PREDICTED: zinc finger ( 943)  387 65.8 7.9e-10
XP_011538282 (OMIM: 607159) PREDICTED: zinc finger ( 943)  387 65.8 7.9e-10
XP_011538280 (OMIM: 607159) PREDICTED: zinc finger ( 949)  387 65.8 7.9e-10
XP_016871932 (OMIM: 607159) PREDICTED: zinc finger ( 949)  387 65.8 7.9e-10
XP_016871930 (OMIM: 607159) PREDICTED: zinc finger ( 949)  387 65.8 7.9e-10
XP_011538281 (OMIM: 607159) PREDICTED: zinc finger ( 949)  387 65.8 7.9e-10
XP_016871929 (OMIM: 607159) PREDICTED: zinc finger (1022)  387 65.8 8.4e-10
NP_065071 (OMIM: 607159) zinc finger MIZ domain-co (1067)  387 65.8 8.7e-10
XP_006717987 (OMIM: 607159) PREDICTED: zinc finger (1073)  387 65.8 8.7e-10
XP_006717986 (OMIM: 607159) PREDICTED: zinc finger (1073)  387 65.8 8.7e-10
XP_005270045 (OMIM: 607159) PREDICTED: zinc finger (1073)  387 65.8 8.7e-10


>>NP_006090 (OMIM: 605987) E3 SUMO-protein ligase PIAS3   (628 aa)
 initn: 4294 init1: 4294 opt: 4294  Z-score: 3221.0  bits: 606.2 E(85289): 1.1e-172
Smith-Waterman score: 4294; 100.0% identity (100.0% similar) in 628 aa overlap (1-628:1-628)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB6 MAELGELKHMVMSFRVSELQVLLGFAGRNKSGRKHELLAKALHLLKSSCAPSVQMKIKEL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 MAELGELKHMVMSFRVSELQVLLGFAGRNKSGRKHELLAKALHLLKSSCAPSVQMKIKEL
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB6 YRRRFPRKTLGPSDLSLLSLPPGTSPVGSPGPLAPIPPTLLAPGTLLGPKREVDMHPPLP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 YRRRFPRKTLGPSDLSLLSLPPGTSPVGSPGPLAPIPPTLLAPGTLLGPKREVDMHPPLP
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB6 QPVHPDVTMKPLPFYEVYGELIRPTTLASTSSQRFEEAHFTFALTPQQVQQILTSREVLP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 QPVHPDVTMKPLPFYEVYGELIRPTTLASTSSQRFEEAHFTFALTPQQVQQILTSREVLP
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB6 GAKCDYTIQVQLRFCLCETSCPQEDYFPPNLFVKVNGKLCPLPGYLPPTKNGAEPKRPSR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 GAKCDYTIQVQLRFCLCETSCPQEDYFPPNLFVKVNGKLCPLPGYLPPTKNGAEPKRPSR
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB6 PINITPLARLSATVPNTIVVNWSSEFGRNYSLSVYLVRQLTAGTLLQKLRAKGIRNPDHS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 PINITPLARLSATVPNTIVVNWSSEFGRNYSLSVYLVRQLTAGTLLQKLRAKGIRNPDHS
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB6 RALIKEKLTADPDSEVATTSLRVSLMCPLGKMRLTVPCRALTCAHLQSFDAALYLQMNEK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 RALIKEKLTADPDSEVATTSLRVSLMCPLGKMRLTVPCRALTCAHLQSFDAALYLQMNEK
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB6 KPTWTCPVCDKKAPYESLIIDGLFMEILSSCSDCDEIQFMEDGSWCPMKPKKEASEVCPP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 KPTWTCPVCDKKAPYESLIIDGLFMEILSSCSDCDEIQFMEDGSWCPMKPKKEASEVCPP
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB6 PGYGLDGLQYSPVQGGDPSENKKKVEVIDLTIESSSDEEDLPPTKKHCSVTSAAIPALPG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 PGYGLDGLQYSPVQGGDPSENKKKVEVIDLTIESSSDEEDLPPTKKHCSVTSAAIPALPG
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB6 SKGVLTSGHQPSSVLRSPAMGTLGGDFLSSLPLHEYPPAFPLGADIQGLDLFSFLQTESQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 SKGVLTSGHQPSSVLRSPAMGTLGGDFLSSLPLHEYPPAFPLGADIQGLDLFSFLQTESQ
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB6 HYGPSVITSLDEQDALGHFFQYRGTPSHFLGPLAPTLGSSHCSATPAPPPGRVSSIVAPG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 HYGPSVITSLDEQDALGHFFQYRGTPSHFLGPLAPTLGSSHCSATPAPPPGRVSSIVAPG
              550       560       570       580       590       600

              610       620        
pF1KB6 GALREGHGGPLPSGPSLTGCRSDIISLD
       ::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 GALREGHGGPLPSGPSLTGCRSDIISLD
              610       620        

>>NP_057250 (OMIM: 603566) E3 SUMO-protein ligase PIAS1   (651 aa)
 initn: 1958 init1: 1388 opt: 2303  Z-score: 1732.2  bits: 330.7 E(85289): 9.5e-90
Smith-Waterman score: 2375; 57.9% identity (78.4% similar) in 663 aa overlap (1-628:1-651)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB6 MAELGELKHMVMSFRVSELQVLLGFAGRNKSGRKHELLAKALHLLKSSCAPSVQMKIKEL
       ::. .:::.::::.::::::::::.::::: :::::::.:::::::..:.:.::::::::
NP_057 MADSAELKQMVMSLRVSELQVLLGYAGRNKHGRKHELLTKALHLLKAGCSPAVQMKIKEL
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90                  100         
pF1KB6 YRRRFPRKTLGPSDLSLLSLPPGTSPVGSPGPLAP--IP-------P--TLLAPGTLLGP
       ::::::.: . :.:::. ..   .::.  :. :.:  ::       :  . : : .::::
NP_057 YRRRFPQKIMTPADLSIPNV--HSSPM--PATLSPSTIPQLTYDGHPASSPLLPVSLLGP
               70        80            90       100       110      

     110       120          130       140       150       160      
pF1KB6 KREVDMHPPLP---QPVHPDVTMKPLPFYEVYGELIRPTTLASTSSQRFEEAHFTFALTP
       :.:... : :    .:::::. .. ::::..  :::.::.::: .::::.:. :.:::::
NP_057 KHELEL-PHLTSALHPVHPDIKLQKLPFYDLLDELIKPTSLASDNSQRFRETCFAFALTP
        120        130       140       150       160       170     

        170       180       190       200       210       220      
pF1KB6 QQVQQILTSREVLPGAKCDYTIQVQLRFCLCETSCPQEDYFPPNLFVKVNGKLCPLPGYL
       :::::: .: ..  :.:::.:.:::::::: ::::::::.::::: :::: : : :::::
NP_057 QQVQQISSSMDI-SGTKCDFTVQVQLRFCLSETSCPQEDHFPPNLCVKVNTKPCSLPGYL
         180        190       200       210       220       230    

        230       240       250       260       270       280      
pF1KB6 PPTKNGAEPKRPSRPINITPLARLSATVPNTIVVNWSSEFGRNYSLSVYLVRQLTAGTLL
       ::::::.:::::::::::: :.:::.::::::::.:..:.:::::..::::.::.. .::
NP_057 PPTKNGVEPKRPSRPINITSLVRLSTTVPNTIVVSWTAEIGRNYSMAVYLVKQLSSTVLL
          240       250       260       270       280       290    

        290       300       310       320       330       340      
pF1KB6 QKLRAKGIRNPDHSRALIKEKLTADPDSEVATTSLRVSLMCPLGKMRLTVPCRALTCAHL
       :.:::::::::::::::::::::::::::.:::::::::.:::::::::.:::::::.::
NP_057 QRLRAKGIRNPDHSRALIKEKLTADPDSEIATTSLRVSLLCPLGKMRLTIPCRALTCSHL
          300       310       320       330       340       350    

        350       360       370       380       390       400      
pF1KB6 QSFDAALYLQMNEKKPTWTCPVCDKKAPYESLIIDGLFMEILSSCSDCDEIQFMEDGSWC
       : :::.::.:::::::::.::::::::::: :::::::::::. :.::::::: :::.: 
NP_057 QCFDATLYIQMNEKKPTWVCPVCDKKAPYEHLIIDGLFMEILKYCTDCDEIQFKEDGTWA
          360       370       380       390       400       410    

        410       420            430       440       450       460 
pF1KB6 PMKPKKEASEVCPPPGYGLDG-----LQYSPVQGGDPSENKKKVEVIDLTIESSSDEEDL
       ::. :::..::    . :.::     :... ..  . :...::::::::::.::::::. 
NP_057 PMRSKKEVQEVSASYN-GVDGCLSSTLEHQVASHHQSSNKNKKVEVIDLTIDSSSDEEEE
          420       430        440       450       460       470   

              470       480       490       500       510       520
pF1KB6 PPT-KKHCSVTSAAIPALPGSKGVLTSGHQPSSVLRSPAMGTLGGDFLSSLPLHEYPPAF
        :. :. :   : . :   ..::.:.  :: : : :.:.. ..  .....  ...:   :
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NP_057 SLD
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pF1KB6 AF---PLGADIQGLDLFSFLQTESQHYGPSVITSL-----DEQDAL--GHFFQYRGTPSH
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pF1KB6 FLGPLAPTLGSSHCSATPAPPPGRVSSIVAPGGALREGHGGPLPS-----GPSLTGCRSD
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pF1KB6 IISLD
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XP_016 IISLD
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pF1KB6   MAELGELKHMVMSFRVSELQVLLGFAGRNKSGRKHELLAKALHLLKSSCAPSVQMKIK
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NP_001 MFTLQDSYVKQMVMSLRVSELQVLLGYAGRNKHGRKHELLTKALHLLKAGCSPAVQMKIK
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pF1KB6 GPKREVDMHPPLP---QPVHPDVTMKPLPFYEVYGELIRPTTLASTSSQRFEEAHFTFAL
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NP_001 EEEPSAKRTCPSLSPTSPL--NNKGILSLPHQASPVSRTPSLPAVDTSYINTSLIQDYRH
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pF1KB6 AF---PLGADIQGLDLFSFLQTESQHYGPSVITSL-----DEQDAL--GHFFQYRGTPSH
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NP_001 PFHMTPMPYDLQGLDFFPFLSGDNQHYNTSLLAAAAAAVSDDQDLLHSSRFFPYTSS-QM
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pF1KB6 FLGPLAPTLGSSHCSATPAPPPGRVSSIVAPGGALREGHGGPLPS-----GPSLTGCRSD
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NP_001 FLDQLSAG-GSTSLPTTNGSSSGSNSSLVS-SNSLRESHSHTVTNRSSTDTASIFGIIPD
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pF1KB6 IISLD
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NP_001 IISLD
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pF1KB6 MAELGELKHMVMSFRVSELQVLLGFAGRNKSGRKHELLAKALHLLKSSCAPSVQMKIKEL
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XP_011       MEQMVMSLRVSELQVLLGYAGRNKHGRKHELLTKALHLLKAGCSPAVQMKIKEL
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pF1KB6 YRRRFPRKTLGPSDLSLLSLPPGTSPVGSPGPLAP--IP-------P--TLLAPGTLLGP
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pF1KB6 KREVDMHPPLP---QPVHPDVTMKPLPFYEVYGELIRPTTLASTSSQRFEEAHFTFALTP
       :.:... : :    .:::::. .. ::::..  :::.::.::: .::::.:. :.:::::
XP_011 KHELEL-PHLTSALHPVHPDIKLQKLPFYDLLDELIKPTSLASDNSQRFRETCFAFALTP
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pF1KB6 QQVQQILTSREVLPGAKCDYTIQVQLRFCLCETSCPQEDYFPPNLFVKVNGKLCPLPGYL
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XP_011 QQVQQISSSMDI-SGTKCDFTVQVQLRFCLSETSCPQEDHFPPNLCVKVNTKPCSLPGYL
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pF1KB6 PPTKNGAEPKRPSRPINITPLARLSATVPNTIVVNWSSEFGRNYSLSVYLVRQLTAGTLL
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XP_011 PPTKNGVEPKRPSRPINITSLVRLSTTVPNTIVVSWTAEIGRNYSMAVYLVKQLSSTVLL
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pF1KB6 QKLRAKGIRNPDHSRALIKEKLTADPDSEVATTSLRVSLMCPLGKMRLTVPCRALTCAHL
       :.:::::::::::::::::::::::::::.:::::::::.:::::::::.:::::::.::
XP_011 QRLRAKGIRNPDHSRALIKEKLTADPDSEIATTSLRVSLLCPLGKMRLTIPCRALTCSHL
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pF1KB6 QSFDAALYLQMNEKKPTWTCPVCDKKAPYESLIIDGLFMEILSSCSDCDEIQFMEDGSWC
       : :::.::.:::::::::.::::::::::: :::::::::::. :.::::::: :::.: 
XP_011 QCFDATLYIQMNEKKPTWVCPVCDKKAPYEHLIIDGLFMEILKYCTDCDEIQFKEDGTWA
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pF1KB6 PMKPKKEASEVCPPPGYGLDG-----LQYSPVQGGDPSENKKKVEVIDLTIESSSDEEDL
       ::. :::..::    . :.::     :... ..  . :...::::::::::.::::::. 
XP_011 PMRSKKEVQEVSASYN-GVDGCLSSTLEHQVASHHQSSNKNKKVEVIDLTIDSSSDEEEE
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pF1KB6 PPT-KKHCSVTSAAIPALPGSKGVLTSGHQPSSVLRSPAMGTLGGDFLSSLPLHEYPPAF
        :. :. :   : . :   ..::.:.  :: : : :.:.. ..  .....  ...:   :
XP_011 EPSAKRTCPSLSPTSPL--NNKGILSLPHQASPVSRTPSLPAVDTSYINTSLIQDYRHPF
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pF1KB6 ---PLGADIQGLDLFSFLQTESQHYGPSVITSL-----DEQDAL--GHFFQYRGTPSHFL
          :.  :.::::.: ::. ..:::. :....      :.:: :  ..:: : .. . ::
XP_011 HMTPMPYDLQGLDFFPFLSGDNQHYNTSLLAAAAAAVSDDQDLLHSSRFFPYTSS-QMFL
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pF1KB6 GPLAPTLGSSHCSATPAPPPGRVSSIVAPGGALREGHGGPLPS-----GPSLTGCRSDII
         :.   ::.   .: .   :  ::.:. ...:::.:.  . .       :. :   :::
XP_011 DQLSAG-GSTSLPTTNGSSSGSNSSLVS-SNSLRESHSHTVTNRSSTDTASIFGIIPDII
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pF1KB6 SLD
       :::
XP_011 SLD
          

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pF1KB6 MAELGELKHMVMSFRVSELQVLLGFAGRNKSGRKHELLAKALHLLKSSCAPSVQMKIKEL
               .::::.::::::::::.::::: :::::::.:::::::..:.:.::::::::
XP_016        MQMVMSLRVSELQVLLGYAGRNKHGRKHELLTKALHLLKAGCSPAVQMKIKEL
                      10        20        30        40        50   

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       ::::::.: . :.:::. ..   .::.  :. :.:  ::       :  . : : .::::
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pF1KB6 KREVDMHPPLP---QPVHPDVTMKPLPFYEVYGELIRPTTLASTSSQRFEEAHFTFALTP
       :.:... : :    .:::::. .. ::::..  :::.::.::: .::::.:. :.:::::
XP_016 KHELEL-PHLTSALHPVHPDIKLQKLPFYDLLDELIKPTSLASDNSQRFRETCFAFALTP
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       :::::: .: ..  :.:::.:.:::::::: ::::::::.::::: :::: : : :::::
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pF1KB6 PPTKNGAEPKRPSRPINITPLARLSATVPNTIVVNWSSEFGRNYSLSVYLVRQLTAGTLL
       ::::::.:::::::::::: :.:::.::::::::.:..:.:::::..::::.::.. .::
XP_016 PPTKNGVEPKRPSRPINITSLVRLSTTVPNTIVVSWTAEIGRNYSMAVYLVKQLSSTVLL
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pF1KB6 QKLRAKGIRNPDHSRALIKEKLTADPDSEVATTSLRVSLMCPLGKMRLTVPCRALTCAHL
       :.:::::::::::::::::::::::::::.:::::::::.:::::::::.:::::::.::
XP_016 QRLRAKGIRNPDHSRALIKEKLTADPDSEIATTSLRVSLLCPLGKMRLTIPCRALTCSHL
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pF1KB6 QSFDAALYLQMNEKKPTWTCPVCDKKAPYESLIIDGLFMEILSSCSDCDEIQFMEDGSWC
       : :::.::.:::::::::.::::::::::: :::::::::::. :.::::::: :::.: 
XP_016 QCFDATLYIQMNEKKPTWVCPVCDKKAPYEHLIIDGLFMEILKYCTDCDEIQFKEDGTWA
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pF1KB6 PMKPKKEASEVCPPPGYGLDG-----LQYSPVQGGDPSENKKKVEVIDLTIESSSDEEDL
       ::. :::..::    . :.::     :... ..  . :...::::::::::.::::::. 
XP_016 PMRSKKEVQEVSASYN-GVDGCLSSTLEHQVASHHQSSNKNKKVEVIDLTIDSSSDEEEE
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pF1KB6 PPT-KKHCSVTSAAIPALPGSKGVLTSGHQPSSVLRSPAMGTLGGDFLSSLPLHEYPPAF
        :. :. :   : . :   ..::.:.  :: : : :.:.. ..  .....  ...:   :
XP_016 EPSAKRTCPSLSPTSPL--NNKGILSLPHQASPVSRTPSLPAVDTSYINTSLIQDYRHPF
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pF1KB6 ---PLGADIQGLDLFSFLQTESQHYGPSVITSL-----DEQDAL--GHFFQYRGTPSHFL
          :.  :.::::.: ::. ..:::. :....      :.:: :  ..:: : .. . ::
XP_016 HMTPMPYDLQGLDFFPFLSGDNQHYNTSLLAAAAAAVSDDQDLLHSSRFFPYTSS-QMFL
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pF1KB6 GPLAPTLGSSHCSATPAPPPGRVSSIVAPGGALREGHGGPLPS-----GPSLTGCRSDII
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XP_016 DQLSAG-GSTSLPTTNGSSSGSNSSLVS-SNSLRESHSHTVTNRSSTDTASIFGIIPDII
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pF1KB6 SLD
       :::
XP_016 SLD
          

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 initn: 1930 init1: 1388 opt: 2275  Z-score: 1711.2  bits: 326.9 E(85289): 1.4e-88
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                        10        20        30        40        50 
pF1KB6          MAELGELKHMVMSFRVSELQVLLGFAGRNKSGRKHELLAKALHLLKSSCAP
                        .::::.::::::::::.::::: :::::::.:::::::..:.:
XP_011 MKLNGKRNHNYKSYYECQMVMSLRVSELQVLLGYAGRNKHGRKHELLTKALHLLKAGCSP
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pF1KB6 SVQMKIKELYRRRFPRKTLGPSDLSLLSLPPGTSPVGSPGPLAP--IP-------P--TL
       .::::::::::::::.: . :.:::. ..   .::.  :. :.:  ::       :  . 
XP_011 AVQMKIKELYRRRFPQKIMTPADLSIPNV--HSSPM--PATLSPSTIPQLTYDGHPASSP
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pF1KB6 LAPGTLLGPKREVDMHPPLP---QPVHPDVTMKPLPFYEVYGELIRPTTLASTSSQRFEE
       : : .:::::.:... : :    .:::::. .. ::::..  :::.::.::: .::::.:
XP_011 LLPVSLLGPKHELEL-PHLTSALHPVHPDIKLQKLPFYDLLDELIKPTSLASDNSQRFRE
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pF1KB6 AHFTFALTPQQVQQILTSREVLPGAKCDYTIQVQLRFCLCETSCPQEDYFPPNLFVKVNG
       . :.::::::::::: .: ..  :.:::.:.:::::::: ::::::::.::::: :::: 
XP_011 TCFAFALTPQQVQQISSSMDI-SGTKCDFTVQVQLRFCLSETSCPQEDHFPPNLCVKVNT
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pF1KB6 KLCPLPGYLPPTKNGAEPKRPSRPINITPLARLSATVPNTIVVNWSSEFGRNYSLSVYLV
       : : :::::::::::.:::::::::::: :.:::.::::::::.:..:.:::::..::::
XP_011 KPCSLPGYLPPTKNGVEPKRPSRPINITSLVRLSTTVPNTIVVSWTAEIGRNYSMAVYLV
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pF1KB6 RQLTAGTLLQKLRAKGIRNPDHSRALIKEKLTADPDSEVATTSLRVSLMCPLGKMRLTVP
       .::.. .:::.:::::::::::::::::::::::::::.:::::::::.:::::::::.:
XP_011 KQLSSTVLLQRLRAKGIRNPDHSRALIKEKLTADPDSEIATTSLRVSLLCPLGKMRLTIP
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       340       350       360       370       380       390       
pF1KB6 CRALTCAHLQSFDAALYLQMNEKKPTWTCPVCDKKAPYESLIIDGLFMEILSSCSDCDEI
       ::::::.::: :::.::.:::::::::.::::::::::: :::::::::::. :.:::::
XP_011 CRALTCSHLQCFDATLYIQMNEKKPTWVCPVCDKKAPYEHLIIDGLFMEILKYCTDCDEI
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       400       410       420            430       440       450  
pF1KB6 QFMEDGSWCPMKPKKEASEVCPPPGYGLDG-----LQYSPVQGGDPSENKKKVEVIDLTI
       :: :::.: ::. :::..::    . :.::     :... ..  . :...::::::::::
XP_011 QFKEDGTWAPMRSKKEVQEVSASYN-GVDGCLSSTLEHQVASHHQSSNKNKKVEVIDLTI
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pF1KB6 ESSSDEEDLPPT-KKHCSVTSAAIPALPGSKGVLTSGHQPSSVLRSPAMGTLGGDFLSSL
       .::::::.  :. :. :   : . :   ..::.:.  :: : : :.:.. ..  ..... 
XP_011 DSSSDEEEEEPSAKRTCPSLSPTSPL--NNKGILSLPHQASPVSRTPSLPAVDTSYINTS
           480       490         500       510       520       530 

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pF1KB6 PLHEYPPAF---PLGADIQGLDLFSFLQTESQHYGPSVITSL-----DEQDAL--GHFFQ
        ...:   :   :.  :.::::.: ::. ..:::. :....      :.:: :  ..:: 
XP_011 LIQDYRHPFHMTPMPYDLQGLDFFPFLSGDNQHYNTSLLAAAAAAVSDDQDLLHSSRFFP
             540       550       560       570       580       590 

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pF1KB6 YRGTPSHFLGPLAPTLGSSHCSATPAPPPGRVSSIVAPGGALREGHGGPLPS-----GPS
       : .. . ::  :.   ::.   .: .   :  ::.:. ...:::.:.  . .       :
XP_011 YTSS-QMFLDQLSAG-GSTSLPTTNGSSSGSNSSLVS-SNSLRESHSHTVTNRSSTDTAS
              600        610       620        630       640        

        620        
pF1KB6 LTGCRSDIISLD
       . :   ::::::
XP_011 IFGIIPDIISLD
      650       660

>>XP_016878179 (OMIM: 603566) PREDICTED: E3 SUMO-protein  (642 aa)
 initn: 1929 init1: 1388 opt: 2274  Z-score: 1710.6  bits: 326.7 E(85289): 1.5e-88
Smith-Waterman score: 2346; 58.0% identity (78.3% similar) in 654 aa overlap (10-628:1-642)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB6 MAELGELKHMVMSFRVSELQVLLGFAGRNKSGRKHELLAKALHLLKSSCAPSVQMKIKEL
                ::::.::::::::::.::::: :::::::.:::::::..:.:.::::::::
XP_016          MVMSLRVSELQVLLGYAGRNKHGRKHELLTKALHLLKAGCSPAVQMKIKEL
                        10        20        30        40        50 

               70        80        90                  100         
pF1KB6 YRRRFPRKTLGPSDLSLLSLPPGTSPVGSPGPLAP--IP-------P--TLLAPGTLLGP
       ::::::.: . :.:::. ..   .::.  :. :.:  ::       :  . : : .::::
XP_016 YRRRFPQKIMTPADLSIPNVH--SSPM--PATLSPSTIPQLTYDGHPASSPLLPVSLLGP
              60        70            80        90       100       

     110       120          130       140       150       160      
pF1KB6 KREVDMHPPLP---QPVHPDVTMKPLPFYEVYGELIRPTTLASTSSQRFEEAHFTFALTP
       :.:... : :    .:::::. .. ::::..  :::.::.::: .::::.:. :.:::::
XP_016 KHELEL-PHLTSALHPVHPDIKLQKLPFYDLLDELIKPTSLASDNSQRFRETCFAFALTP
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pF1KB6 QQVQQILTSREVLPGAKCDYTIQVQLRFCLCETSCPQEDYFPPNLFVKVNGKLCPLPGYL
       :::::: .: ..  :.:::.:.:::::::: ::::::::.::::: :::: : : :::::
XP_016 QQVQQISSSMDI-SGTKCDFTVQVQLRFCLSETSCPQEDHFPPNLCVKVNTKPCSLPGYL
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pF1KB6 PPTKNGAEPKRPSRPINITPLARLSATVPNTIVVNWSSEFGRNYSLSVYLVRQLTAGTLL
       ::::::.:::::::::::: :.:::.::::::::.:..:.:::::..::::.::.. .::
XP_016 PPTKNGVEPKRPSRPINITSLVRLSTTVPNTIVVSWTAEIGRNYSMAVYLVKQLSSTVLL
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pF1KB6 QKLRAKGIRNPDHSRALIKEKLTADPDSEVATTSLRVSLMCPLGKMRLTVPCRALTCAHL
       :.:::::::::::::::::::::::::::.:::::::::.:::::::::.:::::::.::
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pF1KB6 QSFDAALYLQMNEKKPTWTCPVCDKKAPYESLIIDGLFMEILSSCSDCDEIQFMEDGSWC
       : :::.::.:::::::::.::::::::::: :::::::::::. :.::::::: :::.: 
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pF1KB6 PMKPKKEASEVCPPPGYGLDG-----LQYSPVQGGDPSENKKKVEVIDLTIESSSDEEDL
       ::. :::..::    . :.::     :... ..  . :...::::::::::.::::::. 
XP_016 PMRSKKEVQEVSASYN-GVDGCLSSTLEHQVASHHQSSNKNKKVEVIDLTIDSSSDEEEE
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        :. :. :   : . :   ..::.:.  :: : : :.:.. ..  .....  ...:   :
XP_016 EPSAKRTCPSLSPTSPL--NNKGILSLPHQASPVSRTPSLPAVDTSYINTSLIQDYRHPF
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pF1KB6 ---PLGADIQGLDLFSFLQTESQHYGPSVITSL-----DEQDAL--GHFFQYRGTPSHFL
          :.  :.::::.: ::. ..:::. :....      :.:: :  ..:: : .. . ::
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         :.   ::.   .: .   :  ::.:. ...:::.:.  . .       :. :   :::
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pF1KB6 SLD
       :::
XP_016 SLD
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XP_016          MVMSLRVSELQVLLGYAGRNKHGRKHELLTKALHLLKAGCSPAVQMKIKEL
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       ::::::.: . :.:::. ..   .::.  :. :.:  ::       :  . : : .::::
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       :.:... : :    .:::::. .. ::::..  :::.::.::: .::::.:. :.:::::
XP_016 KHELEL-PHLTSALHPVHPDIKLQKLPFYDLLDELIKPTSLASDNSQRFRETCFAFALTP
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       :::::: .: ..  :.:::.:.:::::::: ::::::::.::::: :::: : : :::::
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       ::::::.:::::::::::: :.:::.::::::::.:..:.:::::..::::.::.. .::
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       :.:::::::::::::::::::::::::::.:::::::::.:::::::::.:::::::.::
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pF1KB6 QSFDAALYLQMNEKKPTWTCPVCDKKAPYESLIIDGLFMEILSSCSDCDEIQFMEDGSWC
       : :::.::.:::::::::.::::::::::: :::::::::::. :.::::::: :::.: 
XP_016 QCFDATLYIQMNEKKPTWVCPVCDKKAPYEHLIIDGLFMEILKYCTDCDEIQFKEDGTWA
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       ::. :::..::    . :.::     :... ..  . :...::::::::::.::::::. 
XP_016 PMRSKKEVQEVSASYN-GVDGCLSSTLEHQVASHHQSSNKNKKVEVIDLTIDSSSDEEEE
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        :. :. :   : . :   ..::.:.  :: : : :.:.. ..  .....  ...:   :
XP_016 EPSAKRTCPSLSPTSPL--NNKGILSLPHQASPVSRTPSLPAVDTSYINTSLIQDYRHPF
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pF1KB6 ---PLGADIQGLDLFSFLQTESQHYGPSVITSL-----DEQDAL--GHFFQYRGTPSHFL
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XP_016 HMTPMPYDLQGLDFFPFLSGDNQHYNTSLLAAAAAAVSDDQDLLHSSRFFPYTSS-QMFL
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pF1KB6 GPLAPTLGSSHCSATPAPPPGRVSSIVAPGGALREGHGGPLPS-----GPSLTGCRSDII
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XP_016 DQLSAG-GSTSLPTTNGSSSGSNSSLVS-SNSLRESHSHTVTNRSSTDTASIFGIIPDII
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pF1KB6 SLD
       :::
XP_016 SLD
     640  

>>XP_011524561 (OMIM: 603567) PREDICTED: E3 SUMO-protein  (613 aa)
 initn: 2053 init1: 1568 opt: 1814  Z-score: 1367.0  bits: 263.1 E(85289): 2.1e-69
Smith-Waterman score: 2142; 60.5% identity (78.0% similar) in 564 aa overlap (10-544:1-557)

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pF1KB6 MAELGELKHMVMSFRVSELQVLLGFAGRNKSGRKHELLAKALHLLKSSCAPSVQMKIKEL
                :: :::::::::::::::::::::::.:: .:::::::.:.:.::.::.::
XP_011          MVSSFRVSELQVLLGFAGRNKSGRKHDLLMRALHLLKSGCSPAVQIKIREL
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pF1KB6 YRRRFPRKTLGPSDLS-----LLSLPPGTSPVGSPGPLAPI---PPTLLAP-------GT
       ::::.::   : ::::     ..::  :.:::     .: :   : : ..:       :.
XP_011 YRRRYPRTLEGLSDLSTIKSSVFSLDGGSSPVEPDLAVAGIHSLPSTSVTPHSPSSPVGS
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pF1KB6 LL----GPKREVDM-HPPLPQPVHPDVTMKPLPFYEVYGELIRPTTLASTSSQRFEEAHF
       .:     :  :...  ::.: :::::: .: ::::.:   ::.::.:...: :::.:  :
XP_011 VLLQDTKPTFEMQQPSPPIP-PVHPDVQLKNLPFYDVLDVLIKPTSLVQSSIQRFQEKFF
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pF1KB6 TFALTPQQVQQILTSREVLPGAKCDYTIQVQLRFCLCETSCPQEDYFPPNLFVKVNGKLC
        ::::::::..:  ::. :::.. :::.:::::.:: :::::::: .: .: .:::::: 
XP_011 IFALTPQQVREICISRDFLPGGRRDYTVQVQLRLCLAETSCPQEDNYPNSLCIKVNGKLF
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       ::::: :: ::: : :::.::.::: :.:::..::: : ..:.::.:.:::.::::::::
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       :.. :::.:. ::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::.::::
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pF1KB6 LTCAHLQSFDAALYLQMNEKKPTWTCPVCDKKAPYESLIIDGLFMEILSSCSDCDEIQFM
       .::.::: :::::::::::::::: :::::::: :::::.::::::::..::: :::.:.
XP_011 VTCTHLQCFDAALYLQMNEKKPTWICPVCDKKAAYESLILDGLFMEILNDCSDVDEIKFQ
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pF1KB6 EDGSWCPMKPKKEASEVCPPPGYGLDG--LQYSPVQGGDPSE-NKKKVEVIDLTIESSSD
       ::::::::.::::: .:   :   ...  .  .: .    :: .::::.:::::::::::
XP_011 EDGSWCPMRPKKEAMKVSSQPCTKIESSSVLSKPCSVTVASEASKKKVDVIDLTIESSSD
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       460       470       480       490       500             510 
pF1KB6 EEDLPPTKKHCSVTSAAIPALPGSKGVLTSGHQPSSVLRSPAMGTLGGDFLS------SL
       ::. ::.:..:   : .  . : .::::   .::::: : :.. ..    .       :.
XP_011 EEEDPPAKRKCIFMSETQSS-P-TKGVLM--YQPSSV-RVPSVTSVDPAAIPPSLTDYSV
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pF1KB6 PLHEYPPAFPLGADIQGLDLFSFLQTESQHYGPSVITSLDEQDALGHFFQYRGTPSHFLG
       :.: . :   ...:. :::..:.. .. :.: :                           
XP_011 PFH-HTPISSMSSDLPGLDFLSLIPVDPQQYCPPMFLDSLTSPLTASSTSVTTTSSHESS
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pF1KB6 PLAPTLGSSHCSATPAPPPGRVSSIVAPGGALREGHGGPLPSGPSLTGCRSDIISLD
                                                                
XP_011 THVSSSSSRSETGVITSSGSNIPDIISLD                            
          590       600       610                               




628 residues in 1 query   sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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