Result of FASTA (ccds) for pF1KB4899
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB4899, 469 aa
  1>>>pF1KB4899 469 - 469 aa - 469 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.2844+/-0.000925; mu= 13.1525+/- 0.055
 mean_var=86.5893+/-17.523, 0's: 0 Z-trim(107.4): 76  B-trim: 364 in 1/48
 Lambda= 0.137829
 statistics sampled from 9489 (9571) to 9489 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.671), E-opt: 0.2 (0.294), width:  16
 Scan time:  2.200

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS13659.1 ETS2 gene_id:2114|Hs108|chr21          ( 469) 3220 650.3 1.2e-186
CCDS44767.1 ETS1 gene_id:2113|Hs108|chr11          ( 485) 1513 310.9 1.9e-84
CCDS8475.1 ETS1 gene_id:2113|Hs108|chr11           ( 441) 1467 301.7 9.9e-82
CCDS53724.1 ETS1 gene_id:2113|Hs108|chr11          ( 225)  986 206.0 3.4e-53
CCDS81648.1 ETS1 gene_id:2113|Hs108|chr11          ( 354)  745 158.1 1.4e-38
CCDS59230.1 FLI1 gene_id:2313|Hs108|chr11          ( 259)  461 101.6   1e-21
CCDS59231.1 FLI1 gene_id:2313|Hs108|chr11          ( 386)  461 101.7 1.5e-21
CCDS53725.1 FLI1 gene_id:2313|Hs108|chr11          ( 419)  461 101.7 1.6e-21
CCDS44768.1 FLI1 gene_id:2313|Hs108|chr11          ( 452)  461 101.7 1.7e-21
CCDS13575.1 GABPA gene_id:2551|Hs108|chr21         ( 454)  457 100.9 2.9e-21
CCDS13658.1 ERG gene_id:2078|Hs108|chr21           ( 479)  453 100.1 5.3e-21
CCDS46648.1 ERG gene_id:2078|Hs108|chr21           ( 486)  453 100.1 5.4e-21
CCDS58789.1 ERG gene_id:2078|Hs108|chr21           ( 363)  451 99.7 5.5e-21
CCDS82674.1 ERG gene_id:2078|Hs108|chr21           ( 455)  451 99.7 6.7e-21
CCDS13657.1 ERG gene_id:2078|Hs108|chr21           ( 462)  451 99.7 6.8e-21
CCDS2428.1 FEV gene_id:54738|Hs108|chr2            ( 238)  437 96.8 2.6e-20
CCDS46649.1 ERG gene_id:2078|Hs108|chr21           ( 387)  435 96.5 5.3e-20
CCDS55087.1 ETV1 gene_id:2115|Hs108|chr7           ( 454)  429 95.3 1.4e-19
CCDS55084.1 ETV1 gene_id:2115|Hs108|chr7           ( 374)  423 94.1 2.7e-19
CCDS55083.1 ETV1 gene_id:2115|Hs108|chr7           ( 419)  423 94.1 2.9e-19
CCDS55085.1 ETV1 gene_id:2115|Hs108|chr7           ( 437)  423 94.1 3.1e-19
CCDS55086.1 ETV1 gene_id:2115|Hs108|chr7           ( 459)  423 94.2 3.2e-19
CCDS55088.1 ETV1 gene_id:2115|Hs108|chr7           ( 477)  423 94.2 3.3e-19
CCDS33906.1 ETV5 gene_id:2119|Hs108|chr3           ( 510)  422 94.0   4e-19
CCDS59292.1 ETV4 gene_id:2118|Hs108|chr17          ( 207)  405 90.4 1.9e-18
CCDS58553.1 ETV4 gene_id:2118|Hs108|chr17          ( 445)  405 90.6 3.7e-18
CCDS11465.1 ETV4 gene_id:2118|Hs108|chr17          ( 484)  405 90.6   4e-18
CCDS77281.1 ETV2 gene_id:2116|Hs108|chr19          ( 155)  394 88.2 6.8e-18
CCDS74341.1 ETV2 gene_id:2116|Hs108|chr19          ( 249)  394 88.3   1e-17
CCDS32995.2 ETV2 gene_id:2116|Hs108|chr19          ( 342)  394 88.3 1.3e-17
CCDS12600.1 ERF gene_id:2077|Hs108|chr19           ( 548)  374 84.4 3.2e-16
CCDS59165.1 ELK1 gene_id:2002|Hs108|chrX           (  95)  359 81.1 5.5e-16
CCDS1164.1 ETV3 gene_id:2117|Hs108|chr1            ( 143)  356 80.6 1.2e-15
CCDS14283.1 ELK1 gene_id:2002|Hs108|chrX           ( 428)  359 81.4   2e-15
CCDS30893.1 ETV3L gene_id:440695|Hs108|chr1        ( 361)  356 80.8 2.6e-15
CCDS44250.1 ETV3 gene_id:2117|Hs108|chr1           ( 512)  356 80.9 3.6e-15
CCDS9060.1 ELK3 gene_id:2004|Hs108|chr12           ( 407)  341 77.8 2.3e-14
CCDS1457.1 ELK4 gene_id:2005|Hs108|chr1            ( 405)  337 77.0   4e-14
CCDS1456.1 ELK4 gene_id:2005|Hs108|chr1            ( 431)  337 77.0 4.2e-14
CCDS64062.1 ELF2 gene_id:1998|Hs108|chr4           ( 521)  299 69.5 9.4e-12
CCDS9374.1 ELF1 gene_id:1997|Hs108|chr13           ( 619)  300 69.8 9.5e-12
CCDS3744.1 ELF2 gene_id:1998|Hs108|chr4            ( 581)  299 69.5   1e-11
CCDS3745.1 ELF2 gene_id:1998|Hs108|chr4            ( 533)  298 69.3 1.1e-11
CCDS82954.1 ELF2 gene_id:1998|Hs108|chr4           ( 593)  298 69.3 1.2e-11
CCDS45043.1 ELF1 gene_id:1997|Hs108|chr13          ( 595)  296 68.9 1.6e-11
CCDS14617.1 ELF4 gene_id:2000|Hs108|chrX           ( 663)  292 68.2   3e-11
CCDS64063.1 ELF2 gene_id:1998|Hs108|chr4           ( 504)  289 67.5 3.6e-11


>>CCDS13659.1 ETS2 gene_id:2114|Hs108|chr21               (469 aa)
 initn: 3220 init1: 3220 opt: 3220  Z-score: 3464.3  bits: 650.3 E(32554): 1.2e-186
Smith-Waterman score: 3220; 100.0% identity (100.0% similar) in 469 aa overlap (1-469:1-469)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB4 MNDFGIKNMDQVAPVANSYRGTLKRQPAFDTFDGSLFAVFPSLNEEQTLQEVPTGLDSIS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 MNDFGIKNMDQVAPVANSYRGTLKRQPAFDTFDGSLFAVFPSLNEEQTLQEVPTGLDSIS
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB4 HDSANCELPLLTPCSKAVMSQALKATFSGFKKEQRRLGIPKNPWLWSEQQVCQWLLWATN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 HDSANCELPLLTPCSKAVMSQALKATFSGFKKEQRRLGIPKNPWLWSEQQVCQWLLWATN
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB4 EFSLVNVNLQRFGMNGQMLCNLGKERFLELAPDFVGDILWEHLEQMIKENQEKTEDQYEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 EFSLVNVNLQRFGMNGQMLCNLGKERFLELAPDFVGDILWEHLEQMIKENQEKTEDQYEE
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB4 NSHLTSVPHWINSNTLGFGTEQAPYGMQTQNYPKGGLLDSMCPASTPSVLSSEQEFQMFP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 NSHLTSVPHWINSNTLGFGTEQAPYGMQTQNYPKGGLLDSMCPASTPSVLSSEQEFQMFP
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB4 KSRLSSVSVTYCSVSQDFPGSNLNLLTNNSGTPKDHDSPENGADSFESSDSLLQSWNSQS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 KSRLSSVSVTYCSVSQDFPGSNLNLLTNNSGTPKDHDSPENGADSFESSDSLLQSWNSQS
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB4 SLLDVQRVPSFESFEDDCSQSLCLNKPTMSFKDYIQERSDPVEQGKPVIPAAVLAGFTGS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 SLLDVQRVPSFESFEDDCSQSLCLNKPTMSFKDYIQERSDPVEQGKPVIPAAVLAGFTGS
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB4 GPIQLWQFLLELLSDKSCQSFISWTGDGWEFKLADPDEVARRWGKRKNKPKMNYEKLSRG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 GPIQLWQFLLELLSDKSCQSFISWTGDGWEFKLADPDEVARRWGKRKNKPKMNYEKLSRG
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460         
pF1KB4 LRYYYDKNIIHKTSGKRYVYRFVCDLQNLLGFTPEELHAILGVQPDTED
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 LRYYYDKNIIHKTSGKRYVYRFVCDLQNLLGFTPEELHAILGVQPDTED
              430       440       450       460         

>>CCDS44767.1 ETS1 gene_id:2113|Hs108|chr11               (485 aa)
 initn: 1464 init1: 877 opt: 1513  Z-score: 1629.6  bits: 310.9 E(32554): 1.9e-84
Smith-Waterman score: 1519; 54.7% identity (76.5% similar) in 439 aa overlap (45-469:55-485)

           20        30        40        50        60        70    
pF1KB4 VANSYRGTLKRQPAFDTFDGSLFAVFPSLNEEQTLQEVPTGLDSISHDSANCELPLLTPC
                                     .:.. :::::::.    :    ..::::: 
CCDS44 QGPSNTYEDPRMNCGFQSNYHQQRPCYPFWDEMATQEVPTGLEHCVSDMECADVPLLTPS
           30        40        50        60        70        80    

           80        90       100       110       120       130    
pF1KB4 SKAVMSQALKATFSGFKKEQRRLGIPKNPWLWSEQQVCQWLLWATNEFSLVNVNLQRFGM
       :: .:::::::::::: :::.::::::.:  :.: .: .:..::.::::: .:..:.: :
CCDS44 SKEMMSQALKATFSGFTKEQQRLGIPKDPRQWTETHVRDWVMWAVNEFSLKGVDFQKFCM
           90       100       110       120       130       140    

          140       150       160       170       180         190  
pF1KB4 NGQMLCNLGKERFLELAPDFVGDILWEHLEQMIKENQEKTEDQYEENSHLTSVPH--WIN
       ::  :: :::. :::::::::::::::::: . ::. .     :. :.   . :.  . .
CCDS44 NGAALCALGKDCFLELAPDFVGDILWEHLEILQKEDVK----PYQVNGVNPAYPESRYTS
          150       160       170       180           190       200

            200           210       220       230       240        
pF1KB4 SNTLGFGTEQA----PYGMQTQNYPKGGLLDSMCPASTPSVLSSEQEFQMFPKSRL----
       .  ...: :.:    :  ..  ..   .  ... : :.  .:: . : . .:.  :    
CCDS44 DYFISYGIEHAQCVPPSEFSEPSFITESY-QTLHPISSEELLSLKYE-NDYPSVILRDPL
              210       220        230       240        250        

            250        260       270       280       290       300 
pF1KB4 --SSVSVTYCSVSQDF-PGSNLNLLTNNSGTPKDHDSPENGADSFESSDSLLQSWNSQSS
         ....  : ...:.    .:. .  .. :    .:: :.  .:..: : : :::.::::
CCDS44 QTDTLQNDYFAIKQEVVTPDNMCMGRTSRGKLGGQDSFES-IESYDSCDRLTQSWSSQSS
      260       270       280       290        300       310       

             310        320       330       340       350       360
pF1KB4 LLDVQRVPSFESFE-DDCSQSLCLNKPTMSFKDYIQERSDPVEQGKPVIPAAVLAGFTGS
       . ..:::::..::. .:   .:  .::  .::::...:.: ... :::::::.:::.:::
CCDS44 FNSLQRVPSYDSFDSEDYPAALPNHKPKGTFKDYVRDRAD-LNKDKPVIPAAALAGYTGS
       320       330       340       350        360       370      

              370       380       390       400       410       420
pF1KB4 GPIQLWQFLLELLSDKSCQSFISWTGDGWEFKLADPDEVARRWGKRKNKPKMNYEKLSRG
       :::::::::::::.:::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 GPIQLWQFLLELLTDKSCQSFISWTGDGWEFKLSDPDEVARRWGKRKNKPKMNYEKLSRG
        380       390       400       410       420       430      

              430       440       450       460         
pF1KB4 LRYYYDKNIIHKTSGKRYVYRFVCDLQNLLGFTPEELHAILGVQPDTED
       :::::::::::::.:::::::::::::.:::.:::::::.: :.::...
CCDS44 LRYYYDKNIIHKTAGKRYVYRFVCDLQSLLGYTPEELHAMLDVKPDADE
        440       450       460       470       480     

>>CCDS8475.1 ETS1 gene_id:2113|Hs108|chr11                (441 aa)
 initn: 1413 init1: 877 opt: 1467  Z-score: 1580.8  bits: 301.7 E(32554): 9.9e-82
Smith-Waterman score: 1473; 54.7% identity (77.1% similar) in 424 aa overlap (60-469:26-441)

      30        40        50        60        70        80         
pF1KB4 DTFDGSLFAVFPSLNEEQTLQEVPTGLDSISHDSANCELPLLTPCSKAVMSQALKATFSG
                                     : :    ..::::: :: .:::::::::::
CCDS84      MKAAVDLKPTLTIIKTEKVDLELFPSPDMECADVPLLTPSSKEMMSQALKATFSG
                    10        20        30        40        50     

      90       100       110       120       130       140         
pF1KB4 FKKEQRRLGIPKNPWLWSEQQVCQWLLWATNEFSLVNVNLQRFGMNGQMLCNLGKERFLE
       : :::.::::::.:  :.: .: .:..::.::::: .:..:.: :::  :: :::. :::
CCDS84 FTKEQQRLGIPKDPRQWTETHVRDWVMWAVNEFSLKGVDFQKFCMNGAALCALGKDCFLE
          60        70        80        90       100       110     

     150       160       170       180         190       200       
pF1KB4 LAPDFVGDILWEHLEQMIKENQEKTEDQYEENSHLTSVPH--WINSNTLGFGTEQAPYGM
       ::::::::::::::: . ::. .     :. :.   . :.  . ..  ...: :.:   .
CCDS84 LAPDFVGDILWEHLEILQKEDVKP----YQVNGVNPAYPESRYTSDYFISYGIEHAQC-V
         120       130           140       150       160        170

       210           220       230       240             250       
pF1KB4 QTQNYPKGGLL----DSMCPASTPSVLSSEQEFQMFPKSRL------SSVSVTYCSVSQD
         ... . ...    ... : :.  .:: . : . .:.  :      ....  : ...:.
CCDS84 PPSEFSEPSFITESYQTLHPISSEELLSLKYE-NDYPSVILRDPLQTDTLQNDYFAIKQE
              180       190       200        210       220         

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pF1KB4 F-PGSNLNLLTNNSGTPKDHDSPENGADSFESSDSLLQSWNSQSSLLDVQRVPSFESFE-
           .:. .  .. :    .:: :.  .:..: : : :::.::::. ..:::::..::. 
CCDS84 VVTPDNMCMGRTSRGKLGGQDSFES-IESYDSCDRLTQSWSSQSSFNSLQRVPSYDSFDS
     230       240       250        260       270       280        

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pF1KB4 DDCSQSLCLNKPTMSFKDYIQERSDPVEQGKPVIPAAVLAGFTGSGPIQLWQFLLELLSD
       .:   .:  .::  .::::...:.: ... :::::::.:::.::::::::::::::::.:
CCDS84 EDYPAALPNHKPKGTFKDYVRDRAD-LNKDKPVIPAAALAGYTGSGPIQLWQFLLELLTD
      290       300       310        320       330       340       

         380       390       400       410       420       430     
pF1KB4 KSCQSFISWTGDGWEFKLADPDEVARRWGKRKNKPKMNYEKLSRGLRYYYDKNIIHKTSG
       ::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:
CCDS84 KSCQSFISWTGDGWEFKLSDPDEVARRWGKRKNKPKMNYEKLSRGLRYYYDKNIIHKTAG
       350       360       370       380       390       400       

         440       450       460         
pF1KB4 KRYVYRFVCDLQNLLGFTPEELHAILGVQPDTED
       ::::::::::::.:::.:::::::.: :.::...
CCDS84 KRYVYRFVCDLQSLLGYTPEELHAMLDVKPDADE
       410       420       430       440 

>>CCDS53724.1 ETS1 gene_id:2113|Hs108|chr11               (225 aa)
 initn: 976 init1: 877 opt: 986  Z-score: 1068.4  bits: 206.0 E(32554): 3.4e-53
Smith-Waterman score: 986; 70.2% identity (87.8% similar) in 205 aa overlap (266-469:23-225)

         240       250       260       270       280       290     
pF1KB4 FQMFPKSRLSSVSVTYCSVSQDFPGSNLNLLTNNSGTPKDHDSPENGADSFESSDSLLQS
                                     :  . :    .:: :.  .:..: : : ::
CCDS53         MKAAVDLKPTLTIIKTEKVDLELFPSPGKLGGQDSFES-IESYDSCDRLTQS
                       10        20        30         40        50 

         300       310        320       330       340       350    
pF1KB4 WNSQSSLLDVQRVPSFESFE-DDCSQSLCLNKPTMSFKDYIQERSDPVEQGKPVIPAAVL
       :.::::. ..:::::..::. .:   .:  .::  .::::...:.: ... :::::::.:
CCDS53 WSSQSSFNSLQRVPSYDSFDSEDYPAALPNHKPKGTFKDYVRDRAD-LNKDKPVIPAAAL
              60        70        80        90        100       110

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pF1KB4 AGFTGSGPIQLWQFLLELLSDKSCQSFISWTGDGWEFKLADPDEVARRWGKRKNKPKMNY
       ::.::::::::::::::::.:::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::
CCDS53 AGYTGSGPIQLWQFLLELLTDKSCQSFISWTGDGWEFKLSDPDEVARRWGKRKNKPKMNY
              120       130       140       150       160       170

          420       430       440       450       460         
pF1KB4 EKLSRGLRYYYDKNIIHKTSGKRYVYRFVCDLQNLLGFTPEELHAILGVQPDTED
       :::::::::::::::::::.:::::::::::::.:::.:::::::.: :.::...
CCDS53 EKLSRGLRYYYDKNIIHKTAGKRYVYRFVCDLQSLLGYTPEELHAMLDVKPDADE
              180       190       200       210       220     

>>CCDS81648.1 ETS1 gene_id:2113|Hs108|chr11               (354 aa)
 initn: 1207 init1: 728 opt: 745  Z-score: 806.4  bits: 158.1 E(32554): 1.4e-38
Smith-Waterman score: 1122; 49.0% identity (64.6% similar) in 412 aa overlap (60-469:26-354)

      30        40        50        60        70        80         
pF1KB4 DTFDGSLFAVFPSLNEEQTLQEVPTGLDSISHDSANCELPLLTPCSKAVMSQALKATFSG
                                     : :    ..::::: :: .:::::::::::
CCDS81      MKAAVDLKPTLTIIKTEKVDLELFPSPDMECADVPLLTPSSKEMMSQALKATFSG
                    10        20        30        40        50     

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pF1KB4 FKKEQRRLGIPKNPWLWSEQQVCQWLLWATNEFSLVNVNLQRFGMNGQMLCNLGKERFLE
       : :::.::::::.:  :.: .: .:..::.::::: .:..:.: :::  :: :::. :::
CCDS81 FTKEQQRLGIPKDPRQWTETHVRDWVMWAVNEFSLKGVDFQKFCMNGAALCALGKDCFLE
          60        70        80        90       100       110     

     150       160       170       180       190       200         
pF1KB4 LAPDFVGDILWEHLEQMIKENQEKTEDQYEENSHLTSVPHWINSNTLGFGTEQAPYGMQT
       ::::::::::::::: . ::. .               :. .:             :.. 
CCDS81 LAPDFVGDILWEHLEILQKEDVK---------------PYQVN-------------GVN-
         120       130                      140                    

     210       220       230       240       250       260         
pF1KB4 QNYPKGGLLDSMCPASTPSVLSSEQEFQMFPKSRLSSVSVTYCSVSQDFPGSNLNLLTNN
                    ::              .:.:: .:          :.  :  ..   .
CCDS81 -------------PA--------------YPESRYTS----------DYFIS-YGIEHAQ
                                   150                 160         

     270       280       290       300       310       320         
pF1KB4 SGTPKDHDSPENGADSFESSDSLLQSWNSQSSLLDVQRVPSFESFEDDCSQSLCLNKPTM
          :.. . :   ..:...   .     :.  ::...       .:.:   :. :  : .
CCDS81 CVPPSEFSEPSFITESYQTLHPI-----SSEELLSLK-------YEND-YPSVILRDPLQ
      170       180       190            200               210     

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pF1KB4 SFKDYIQERSDPVEQGKPVIPAAVLAGFT--GSGPIQLWQFLLELLSDKSCQSFISWTGD
       .  : .:.    ..: . : :  .  : :  :::::::::::::::.:::::::::::::
CCDS81 T--DTLQNDYFAIKQ-EVVTPDNMCMGRTSRGSGPIQLWQFLLELLTDKSCQSFISWTGD
           220        230       240       250       260       270  

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pF1KB4 GWEFKLADPDEVARRWGKRKNKPKMNYEKLSRGLRYYYDKNIIHKTSGKRYVYRFVCDLQ
       ::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::
CCDS81 GWEFKLSDPDEVARRWGKRKNKPKMNYEKLSRGLRYYYDKNIIHKTAGKRYVYRFVCDLQ
            280       290       300       310       320       330  

       450       460         
pF1KB4 NLLGFTPEELHAILGVQPDTED
       .:::.:::::::.: :.::...
CCDS81 SLLGYTPEELHAMLDVKPDADE
            340       350    

>>CCDS59230.1 FLI1 gene_id:2313|Hs108|chr11               (259 aa)
 initn: 461 init1: 427 opt: 461  Z-score: 503.3  bits: 101.6 E(32554): 1e-21
Smith-Waterman score: 461; 49.7% identity (73.5% similar) in 155 aa overlap (295-442:13-167)

          270       280       290       300       310          320 
pF1KB4 LLTNNSGTPKDHDSPENGADSFESSDSLLQSWNSQSSLLDVQRVPSFESFEDDC---SQS
                                     : ..::: :.:.. ::..: .      ...
CCDS59                   MDPGSLLAYNTTSHTDQSSRLSVKEDPSYDSVRRGAWGNNMN
                                 10        20        30        40  

              330       340          350       360       370       
pF1KB4 LCLNK-PTMSFKDYIQERSDPVEQGKP---VIPAAVLAGFTGSGPIQLWQFLLELLSDKS
         ::: : ..  . :.. ..   :  :   . :..   .  ::: :::::::::::::..
CCDS59 SGLNKSPPLGGAQTISKNTEQRPQPDPYQILGPTSSRLANPGSGQIQLWQFLLELLSDSA
             50        60        70        80        90       100  

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pF1KB4 CQSFISWTGDGWEFKLADPDEVARRWGKRKNKPKMNYEKLSRGLRYYYDKNIIHKTSGKR
         : :.: : . :::..::::::::::.::.::.:::.::::.:::::::::. :. :::
CCDS59 NASCITWEGTNGEFKMTDPDEVARRWGERKSKPNMNYDKLSRALRYYYDKNIMTKVHGKR
            110       120       130       140       150       160  

       440       450       460                                     
pF1KB4 YVYRFVCDLQNLLGFTPEELHAILGVQPDTED                            
       :.:.:                                                       
CCDS59 YAYKFDFHGIAQALQPHPTESSMYKYPSDISYMPSYHAHQQKVNFVPPHPSSMPVTSSSF
            170       180       190       200       210       220  

>>CCDS59231.1 FLI1 gene_id:2313|Hs108|chr11               (386 aa)
 initn: 628 init1: 427 opt: 461  Z-score: 500.6  bits: 101.7 E(32554): 1.5e-21
Smith-Waterman score: 480; 34.3% identity (54.0% similar) in 350 aa overlap (94-442:55-294)

            70        80        90       100       110       120   
pF1KB4 ANCELPLLTPCSKAVMSQALKATFSGFKKEQRRLGIPKNPWLWSEQQVCQWLLWATNEFS
                                     .::. .: .: ::....: ::: :: .:.:
CCDS59 LVGGGESNPMNYNSYMDEKNGPPPPNMTTNERRVIVPADPTLWTQEHVRQWLEWAIKEYS
           30        40        50        60        70        80    

           130        140       150       160       170       180  
pF1KB4 LVNVNLQRF-GMNGQMLCNLGKERFLELAPDFVGDILWEHLEQMIKENQEKTEDQYEENS
       :.... . : .:.:. ::...:: ::. .  .  ..:  ::  .    .:..   :. .:
CCDS59 LMEIDTSFFQNMDGKELCKMNKEDFLRATTLYNTEVLLSHLSYL----RESSLLAYNTTS
           90       100       110       120           130       140

            190       200       210       220       230       240  
pF1KB4 HLTSVPHWINSNTLGFGTEQAPYGMQTQNYPKGGLLDSMCPASTPSVLSSEQEFQMFPKS
       :                :.:.                        : :: ...    :  
CCDS59 H----------------TDQS------------------------SRLSVKED----P--
                                                      150          

            250       260       270       280       290       300  
pF1KB4 RLSSVSVTYCSVSQDFPGSNLNLLTNNSGTPKDHDSPENGADSFESSDSLLQSWNSQSSL
              .: :: .   :.:.:     ::  :.   : .::...        : :..   
CCDS59 -------SYDSVRRGAWGNNMN-----SGLNKS--PPLGGAQTI--------SKNTE---
                 160            170         180                    

            310       320       330       340       350       360  
pF1KB4 LDVQRVPSFESFEDDCSQSLCLNKPTMSFKDYIQERSDPVEQGKPVIPAAVLAGFTGSGP
          :: :                .:            :: .   :.  .. ::.  ::: 
CCDS59 ---QR-P----------------QP------------DPYQILGPT--SSRLAN-PGSGQ
        190                                    200          210    

            370       380       390       400       410       420  
pF1KB4 IQLWQFLLELLSDKSCQSFISWTGDGWEFKLADPDEVARRWGKRKNKPKMNYEKLSRGLR
       :::::::::::::..  : :.: : . :::..::::::::::.::.::.:::.::::.::
CCDS59 IQLWQFLLELLSDSANASCITWEGTNGEFKMTDPDEVARRWGERKSKPNMNYDKLSRALR
          220       230       240       250       260       270    

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pF1KB4 YYYDKNIIHKTSGKRYVYRFVCDLQNLLGFTPEELHAILGVQPDTED             
       :::::::. :. ::::.:.:                                        
CCDS59 YYYDKNIMTKVHGKRYAYKFDFHGIAQALQPHPTESSMYKYPSDISYMPSYHAHQQKVNF
          280       290       300       310       320       330    

>>CCDS53725.1 FLI1 gene_id:2313|Hs108|chr11               (419 aa)
 initn: 628 init1: 427 opt: 461  Z-score: 500.0  bits: 101.7 E(32554): 1.6e-21
Smith-Waterman score: 480; 34.3% identity (54.0% similar) in 350 aa overlap (94-442:88-327)

            70        80        90       100       110       120   
pF1KB4 ANCELPLLTPCSKAVMSQALKATFSGFKKEQRRLGIPKNPWLWSEQQVCQWLLWATNEFS
                                     .::. .: .: ::....: ::: :: .:.:
CCDS53 LVGGGESNPMNYNSYMDEKNGPPPPNMTTNERRVIVPADPTLWTQEHVRQWLEWAIKEYS
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pF1KB4 LVNVNLQRF-GMNGQMLCNLGKERFLELAPDFVGDILWEHLEQMIKENQEKTEDQYEENS
       :.... . : .:.:. ::...:: ::. .  .  ..:  ::  .    .:..   :. .:
CCDS53 LMEIDTSFFQNMDGKELCKMNKEDFLRATTLYNTEVLLSHLSYL----RESSLLAYNTTS
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       :                :.:.                        : :: ...    :  
CCDS53 H----------------TDQS------------------------SRLSVKED----P--
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              .: :: .   :.:.:     ::  :.   : .::...        : :..   
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          :: :                .:            :: .   :.  .. ::.  ::: 
CCDS53 ---QR-P----------------QP------------DPYQILGPT--SSRLAN-PGSGQ
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       :::::::::::::..  : :.: : . :::..::::::::::.::.::.:::.::::.::
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pF1KB4 YYYDKNIIHKTSGKRYVYRFVCDLQNLLGFTPEELHAILGVQPDTED             
       :::::::. :. ::::.:.:                                        
CCDS53 YYYDKNIMTKVHGKRYAYKFDFHGIAQALQPHPTESSMYKYPSDISYMPSYHAHQQKVNF
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>>CCDS44768.1 FLI1 gene_id:2313|Hs108|chr11               (452 aa)
 initn: 628 init1: 427 opt: 461  Z-score: 499.5  bits: 101.7 E(32554): 1.7e-21
Smith-Waterman score: 480; 34.3% identity (54.0% similar) in 350 aa overlap (94-442:121-360)

            70        80        90       100       110       120   
pF1KB4 ANCELPLLTPCSKAVMSQALKATFSGFKKEQRRLGIPKNPWLWSEQQVCQWLLWATNEFS
                                     .::. .: .: ::....: ::: :: .:.:
CCDS44 LVGGGESNPMNYNSYMDEKNGPPPPNMTTNERRVIVPADPTLWTQEHVRQWLEWAIKEYS
              100       110       120       130       140       150

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pF1KB4 LVNVNLQRF-GMNGQMLCNLGKERFLELAPDFVGDILWEHLEQMIKENQEKTEDQYEENS
       :.... . : .:.:. ::...:: ::. .  .  ..:  ::  .    .:..   :. .:
CCDS44 LMEIDTSFFQNMDGKELCKMNKEDFLRATTLYNTEVLLSHLSYL----RESSLLAYNTTS
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pF1KB4 HLTSVPHWINSNTLGFGTEQAPYGMQTQNYPKGGLLDSMCPASTPSVLSSEQEFQMFPKS
       :                :.:.                        : :: ...    :  
CCDS44 H----------------TDQS------------------------SRLSVKED----P--
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pF1KB4 RLSSVSVTYCSVSQDFPGSNLNLLTNNSGTPKDHDSPENGADSFESSDSLLQSWNSQSSL
              .: :: .   :.:.:     ::  :.   : .::...        : :..   
CCDS44 -------SYDSVRRGAWGNNMN-----SGLNKS--PPLGGAQTI--------SKNTE---
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pF1KB4 LDVQRVPSFESFEDDCSQSLCLNKPTMSFKDYIQERSDPVEQGKPVIPAAVLAGFTGSGP
          :: :                .:            :: .   :.  .. ::.  ::: 
CCDS44 ---QR-P----------------QP------------DPYQILGPT--SSRLAN-PGSGQ
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pF1KB4 IQLWQFLLELLSDKSCQSFISWTGDGWEFKLADPDEVARRWGKRKNKPKMNYEKLSRGLR
       :::::::::::::..  : :.: : . :::..::::::::::.::.::.:::.::::.::
CCDS44 IQLWQFLLELLSDSANASCITWEGTNGEFKMTDPDEVARRWGERKSKPNMNYDKLSRALR
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pF1KB4 YYYDKNIIHKTSGKRYVYRFVCDLQNLLGFTPEELHAILGVQPDTED             
       :::::::. :. ::::.:.:                                        
CCDS44 YYYDKNIMTKVHGKRYAYKFDFHGIAQALQPHPTESSMYKYPSDISYMPSYHAHQQKVNF
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>>CCDS13575.1 GABPA gene_id:2551|Hs108|chr21              (454 aa)
 initn: 730 init1: 448 opt: 457  Z-score: 495.2  bits: 100.9 E(32554): 2.9e-21
Smith-Waterman score: 552; 32.8% identity (54.0% similar) in 378 aa overlap (85-461:168-418)

           60        70        80        90       100       110    
pF1KB4 GLDSISHDSANCELPLLTPCSKAVMSQALKATFSGFKKEQRRLGIPKNPWLWSEQQVCQW
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CCDS13 VEEAQVITLDGTKHITTISDETSEQVTRWAAALEGYRKEQERLGIPYDPIQWSTDQVLHW
       140       150       160       170       180       190       

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pF1KB4 LLWATNEFSLVNVNLQRFGMNGQMLCNLGKERFLELAPDFVGDILWEHLEQMIKENQEKT
       ..:. .:::.....:  ....:. ::.:..: :.. .:   :.::: ::: . :    . 
CCDS13 VVWVMKEFSMTDIDLTTLNISGRELCSLNQEDFFQRVPR--GEILWSHLELLRKYVLASQ
       200       210       220       230         240       250     

          180       190       200       210       220       230    
pF1KB4 EDQYEENSHLTSVPHWINSNTLGFGTEQAPYGMQTQNYPKGGLLDSMCPASTPSVLSSEQ
       :.:..:                                                ... .:
CCDS13 EQQMNE------------------------------------------------IVTIDQ
         260                                                       

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pF1KB4 EFQMFPKSRLSSVSVTYCSVSQDFPGSNLNLLTNNSGTPKDHDSPENGADSFESSDSLLQ
         :..:    .::.                     :.::                 . ..
CCDS13 PVQIIP----ASVQ---------------------SATP-----------------TTIK
       270                                280                      

          300       310       320       330       340       350    
pF1KB4 SWNSQSSLLDVQRVPSFESFEDDCSQSLCLNKPTMSFKDYIQERSDPVEQGKPVIPAAVL
         ::...   :::.: . : ::                     ::.: ..          
CCDS13 VINSSAKAAKVQRAPRI-SGED---------------------RSSPGNR----------
         290       300                             310             

          360        370       380       390       400       410   
pF1KB4 AGFTGS-GPIQLWQFLLELLSDKSCQSFISWTGDGWEFKLADPDEVARRWGKRKNKPKMN
          ::. : :::::::::::.::. .. :::.::  :::: .:. ::..::.::::: ::
CCDS13 ---TGNNGQIQLWQFLLELLTDKDARDCISWVGDEGEFKLNQPELVAQKWGQRKNKPTMN
              320       330       340       350       360       370

           420       430       440       450       460             
pF1KB4 YEKLSRGLRYYYDKNIIHKTSGKRYVYRFVCDLQNLLGFTPEELHAILGVQPDTED    
       ::::::.:::::: ..: :..:::.::.:::::..:.:..  ::. ..            
CCDS13 YEKLSRALRYYYDGDMICKVQGKRFVYKFVCDLKTLIGYSAAELNRLVTECEQKKLAKMQ
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CCDS13 LHGIAQPVTAVALATASLQTEKDN
              440       450    




469 residues in 1 query   sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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