Result of FASTA (ccds) for pF1KB4614
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB4614, 596 aa
  1>>>pF1KB4614 596 - 596 aa - 596 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.2956+/-0.00109; mu= -9.2260+/- 0.065
 mean_var=281.3271+/-57.137, 0's: 0 Z-trim(111.8): 133  B-trim: 0 in 0/52
 Lambda= 0.076466
 statistics sampled from 12555 (12688) to 12555 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.717), E-opt: 0.2 (0.39), width:  16
 Scan time:  3.800

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS3641.1 PDLIM5 gene_id:10611|Hs108|chr4         ( 596) 4047 460.1 3.5e-129
CCDS47102.1 PDLIM5 gene_id:10611|Hs108|chr4        ( 487) 2715 313.2 5.1e-85
CCDS58917.1 PDLIM5 gene_id:10611|Hs108|chr4        ( 483) 2618 302.5 8.4e-82
CCDS58916.1 PDLIM5 gene_id:10611|Hs108|chr4        ( 625) 2053 240.2 6.1e-63
CCDS75166.1 PDLIM5 gene_id:10611|Hs108|chr4        ( 271) 1929 226.3 3.9e-59
CCDS7377.1 LDB3 gene_id:11155|Hs108|chr10          ( 727) 1126 137.9 4.2e-32
CCDS41544.1 LDB3 gene_id:11155|Hs108|chr10         ( 617) 1109 136.0 1.3e-31
CCDS53550.1 LDB3 gene_id:11155|Hs108|chr10         ( 732) 1109 136.1 1.6e-31
CCDS4423.1 PDLIM7 gene_id:9260|Hs108|chr5          ( 423)  890 111.8 1.8e-24
CCDS4422.1 PDLIM7 gene_id:9260|Hs108|chr5          ( 457)  890 111.8 1.9e-24
CCDS47104.1 PDLIM5 gene_id:10611|Hs108|chr4        ( 214)  644 84.5 1.5e-16
CCDS47103.1 PDLIM5 gene_id:10611|Hs108|chr4        ( 234)  644 84.5 1.6e-16
CCDS10713.1 TGFB1I1 gene_id:7041|Hs108|chr16       ( 444)  609 80.8 4.1e-15
CCDS42156.1 TGFB1I1 gene_id:7041|Hs108|chr16       ( 461)  609 80.8 4.2e-15
CCDS44450.1 LDB3 gene_id:11155|Hs108|chr10         ( 330)  560 75.3 1.3e-13
CCDS76407.1 LPXN gene_id:9404|Hs108|chr11          ( 366)  557 75.0 1.8e-13
CCDS7969.1 LPXN gene_id:9404|Hs108|chr11           ( 386)  557 75.0 1.9e-13
CCDS53635.1 LPXN gene_id:9404|Hs108|chr11          ( 391)  557 75.0 1.9e-13
CCDS44996.1 PXN gene_id:5829|Hs108|chr12           ( 557)  520 71.0 4.5e-12
CCDS44998.1 PXN gene_id:5829|Hs108|chr12           ( 424)  513 70.2   6e-12
CCDS44997.1 PXN gene_id:5829|Hs108|chr12           ( 591)  513 70.3   8e-12
CCDS58281.1 PXN gene_id:5829|Hs108|chr12           ( 605)  513 70.3 8.2e-12
CCDS54394.1 LIMS2 gene_id:55679|Hs108|chr2         ( 336)  476 66.1 8.3e-11
CCDS54395.1 LIMS2 gene_id:55679|Hs108|chr2         ( 341)  476 66.1 8.4e-11
CCDS54396.1 LIMS2 gene_id:55679|Hs108|chr2         ( 363)  476 66.1 8.9e-11
CCDS2147.1 LIMS2 gene_id:55679|Hs108|chr2          ( 365)  476 66.1   9e-11


>>CCDS3641.1 PDLIM5 gene_id:10611|Hs108|chr4              (596 aa)
 initn: 4047 init1: 4047 opt: 4047  Z-score: 2432.6  bits: 460.1 E(32554): 3.5e-129
Smith-Waterman score: 4047; 99.5% identity (100.0% similar) in 596 aa overlap (1-596:1-596)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB4 MSNYSVSLVGPAPWGFRLQGGKDFNMPLTISSLKDGGKAAQANVRIGDVVLSIDGINAQG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 MSNYSVSLVGPAPWGFRLQGGKDFNMPLTISSLKDGGKAAQANVRIGDVVLSIDGINAQG
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB4 MTHLEAQNKIKGCTGSLNMTLQRASAAPKPEPVPVQKGEPKEVVKPVPITSPAVSKVTST
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 MTHLEAQNKIKGCTGSLNMTLQRASAAPKPEPVPVQKGEPKEVVKPVPITSPAVSKVTST
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB4 NNMAYNKAPRPFGSVSSPKVTSIPSPSSAFTPAHATTSSHASPSPVAAVTPPLFAASGLH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 NNMAYNKAPRPFGSVSSPKVTSIPSPSSAFTPAHATTSSHASPSPVAAVTPPLFAASGLH
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB4 ANANLSADQSPSALSAGKTAVNVPRQPTVTSVCSETSQELAEGQRRGSQGDSKQQNGPPR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 ANANLSADQSPSALSAGKTAVNVPRQPTVTSVCSETSQELAEGQRRGSQGDSKQQNGPPR
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB4 KHIVERYTEFYHVPTHSDASKKRLIEDTEDWRPRTGTTQSRSFRILAQITGTEHLKESEA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 KHIVERYTEFYHVPTHSDASKKRLIEDTEDWRPRTGTTQSRSFRILAQITGTEHLKESEA
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB4 DNTKKANNSQEPSPQLASSVASTRSMPESLDSPTSGRPGVTSLTTAAAFKPVGSTGVIKS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::
CCDS36 DNTKKANNSQEPSPQLASSVASTRSMPESLDSPTSGRPGVTSLTAAAAFKPVGSTGVIKS
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB4 PSWQRPNQGVPSTGRISNSAAYSGSVAPANSALGQTQPSDQDTLVQRAEHIPAGKRTPMC
       ::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 PSWQRPNQGVPSTGRISNSATYSGSVAPANSALGQTQPSDQDTLVQRAEHIPAGKRTPMC
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB4 AHCNQVIRGPFLVALGKSWHPEEFNCAHCKNTMAYIGFVEEKGALYCELCYEKFFAPECG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 AHCNQVIRGPFLVALGKSWHPEEFNCAHCKNTMAYIGFVEEKGALYCELCYEKFFAPECG
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB4 RCQRKILGEVINALKQTWHVSCFVCVACGKPIRNNVFHLEDGEPYCETDYYALFGTICHG
       :::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 RCQRKILGEVISALKQTWHVSCFVCVACGKPIRNNVFHLEDGEPYCETDYYALFGTICHG
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590      
pF1KB4 CEFPIEAGDMFLEALGYTWHDTCFVCSVCCESLEGQTFFSKKDKPLCKKHAHSVNF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 CEFPIEAGDMFLEALGYTWHDTCFVCSVCCESLEGQTFFSKKDKPLCKKHAHSVNF
              550       560       570       580       590      

>>CCDS47102.1 PDLIM5 gene_id:10611|Hs108|chr4             (487 aa)
 initn: 2709 init1: 2709 opt: 2715  Z-score: 1639.9  bits: 313.2 E(32554): 5.1e-85
Smith-Waterman score: 3122; 81.2% identity (81.7% similar) in 596 aa overlap (1-596:1-487)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB4 MSNYSVSLVGPAPWGFRLQGGKDFNMPLTISSLKDGGKAAQANVRIGDVVLSIDGINAQG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MSNYSVSLVGPAPWGFRLQGGKDFNMPLTISSLKDGGKAAQANVRIGDVVLSIDGINAQG
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB4 MTHLEAQNKIKGCTGSLNMTLQRASAAPKPEPVPVQKGEPKEVVKPVPITSPAVSKVTST
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::                       
CCDS47 MTHLEAQNKIKGCTGSLNMTLQRASAAPKPEPVPVQK-----------------------
               70        80        90                              

              130       140       150       160       170       180
pF1KB4 NNMAYNKAPRPFGSVSSPKVTSIPSPSSAFTPAHATTSSHASPSPVAAVTPPLFAASGLH
                                                                   
CCDS47 ------------------------------------------------------------
                                                                   

              190       200       210       220       230       240
pF1KB4 ANANLSADQSPSALSAGKTAVNVPRQPTVTSVCSETSQELAEGQRRGSQGDSKQQNGPPR
                                 ::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 --------------------------PTVTSVCSETSQELAEGQRRGSQGDSKQQNGPPR
                                 100       110       120       130 

              250       260       270       280       290       300
pF1KB4 KHIVERYTEFYHVPTHSDASKKRLIEDTEDWRPRTGTTQSRSFRILAQITGTEHLKESEA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 KHIVERYTEFYHVPTHSDASKKRLIEDTEDWRPRTGTTQSRSFRILAQITGTEHLKESEA
             140       150       160       170       180       190 

              310       320       330       340       350       360
pF1KB4 DNTKKANNSQEPSPQLASSVASTRSMPESLDSPTSGRPGVTSLTTAAAFKPVGSTGVIKS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::
CCDS47 DNTKKANNSQEPSPQLASSVASTRSMPESLDSPTSGRPGVTSLTAAAAFKPVGSTGVIKS
             200       210       220       230       240       250 

              370       380       390       400       410       420
pF1KB4 PSWQRPNQGVPSTGRISNSAAYSGSVAPANSALGQTQPSDQDTLVQRAEHIPAGKRTPMC
       ::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 PSWQRPNQGVPSTGRISNSATYSGSVAPANSALGQTQPSDQDTLVQRAEHIPAGKRTPMC
             260       270       280       290       300       310 

              430       440       450       460       470       480
pF1KB4 AHCNQVIRGPFLVALGKSWHPEEFNCAHCKNTMAYIGFVEEKGALYCELCYEKFFAPECG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 AHCNQVIRGPFLVALGKSWHPEEFNCAHCKNTMAYIGFVEEKGALYCELCYEKFFAPECG
             320       330       340       350       360       370 

              490       500       510       520       530       540
pF1KB4 RCQRKILGEVINALKQTWHVSCFVCVACGKPIRNNVFHLEDGEPYCETDYYALFGTICHG
       :::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 RCQRKILGEVISALKQTWHVSCFVCVACGKPIRNNVFHLEDGEPYCETDYYALFGTICHG
             380       390       400       410       420       430 

              550       560       570       580       590      
pF1KB4 CEFPIEAGDMFLEALGYTWHDTCFVCSVCCESLEGQTFFSKKDKPLCKKHAHSVNF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 CEFPIEAGDMFLEALGYTWHDTCFVCSVCCESLEGQTFFSKKDKPLCKKHAHSVNF
             440       450       460       470       480       

>>CCDS58917.1 PDLIM5 gene_id:10611|Hs108|chr4             (483 aa)
 initn: 3058 init1: 2428 opt: 2618  Z-score: 1582.1  bits: 302.5 E(32554): 8.4e-82
Smith-Waterman score: 3025; 80.1% identity (80.6% similar) in 592 aa overlap (1-586:1-483)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB4 MSNYSVSLVGPAPWGFRLQGGKDFNMPLTISSLKDGGKAAQANVRIGDVVLSIDGINAQG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MSNYSVSLVGPAPWGFRLQGGKDFNMPLTISSLKDGGKAAQANVRIGDVVLSIDGINAQG
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB4 MTHLEAQNKIKGCTGSLNMTLQRASAAPKPEPVPVQKGEPKEVVKPVPITSPAVSKVTST
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::                       
CCDS58 MTHLEAQNKIKGCTGSLNMTLQRASAAPKPEPVPVQK-----------------------
               70        80        90                              

              130       140       150       160       170       180
pF1KB4 NNMAYNKAPRPFGSVSSPKVTSIPSPSSAFTPAHATTSSHASPSPVAAVTPPLFAASGLH
                                                                   
CCDS58 ------------------------------------------------------------
                                                                   

              190       200       210       220       230          
pF1KB4 ANANLSADQSPSALSAGKTAVNVPRQPTVTSVCSETSQELAEGQRRGSQGDSKQQNG---
                                 :::::::::::::::::::::::::::::::   
CCDS58 --------------------------PTVTSVCSETSQELAEGQRRGSQGDSKQQNGKIP
                                 100       110       120       130 

          240       250       260       270       280       290    
pF1KB4 ---PPRKHIVERYTEFYHVPTHSDASKKRLIEDTEDWRPRTGTTQSRSFRILAQITGTEH
          :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 PKRPPRKHIVERYTEFYHVPTHSDASKKRLIEDTEDWRPRTGTTQSRSFRILAQITGTEH
             140       150       160       170       180       190 

          300       310       320       330       340       350    
pF1KB4 LKESEADNTKKANNSQEPSPQLASSVASTRSMPESLDSPTSGRPGVTSLTTAAAFKPVGS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::
CCDS58 LKESEADNTKKANNSQEPSPQLASSVASTRSMPESLDSPTSGRPGVTSLTAAAAFKPVGS
             200       210       220       230       240       250 

          360       370       380       390       400       410    
pF1KB4 TGVIKSPSWQRPNQGVPSTGRISNSAAYSGSVAPANSALGQTQPSDQDTLVQRAEHIPAG
       ::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 TGVIKSPSWQRPNQGVPSTGRISNSATYSGSVAPANSALGQTQPSDQDTLVQRAEHIPAG
             260       270       280       290       300       310 

          420       430       440       450       460       470    
pF1KB4 KRTPMCAHCNQVIRGPFLVALGKSWHPEEFNCAHCKNTMAYIGFVEEKGALYCELCYEKF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 KRTPMCAHCNQVIRGPFLVALGKSWHPEEFNCAHCKNTMAYIGFVEEKGALYCELCYEKF
             320       330       340       350       360       370 

          480       490       500       510       520       530    
pF1KB4 FAPECGRCQRKILGEVINALKQTWHVSCFVCVACGKPIRNNVFHLEDGEPYCETDYYALF
       :::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 FAPECGRCQRKILGEVISALKQTWHVSCFVCVACGKPIRNNVFHLEDGEPYCETDYYALF
             380       390       400       410       420       430 

          540       550       560       570       580       590    
pF1KB4 GTICHGCEFPIEAGDMFLEALGYTWHDTCFVCSVCCESLEGQTFFSKKDKPLCKKHAHSV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::        
CCDS58 GTICHGCEFPIEAGDMFLEALGYTWHDTCFVCSVCCESLEGQTFFSKKDKPL        
             440       450       460       470       480           

         
pF1KB4 NF

>>CCDS58916.1 PDLIM5 gene_id:10611|Hs108|chr4             (625 aa)
 initn: 2683 init1: 2053 opt: 2053  Z-score: 1243.5  bits: 240.2 E(32554): 6.1e-63
Smith-Waterman score: 2820; 65.8% identity (66.3% similar) in 734 aa overlap (1-596:1-625)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB4 MSNYSVSLVGPAPWGFRLQGGKDFNMPLTISSLKDGGKAAQANVRIGDVVLSIDGINAQG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MSNYSVSLVGPAPWGFRLQGGKDFNMPLTISSLKDGGKAAQANVRIGDVVLSIDGINAQG
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB4 MTHLEAQNKIKGCTGSLNMTLQRASAAPKPEPVPVQKGEPKEVVKPVPITSPAVSKVTST
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::                       
CCDS58 MTHLEAQNKIKGCTGSLNMTLQRASAAPKPEPVPVQK-----------------------
               70        80        90                              

              130       140       150       160       170       180
pF1KB4 NNMAYNKAPRPFGSVSSPKVTSIPSPSSAFTPAHATTSSHASPSPVAAVTPPLFAASGLH
                                                                   
CCDS58 ------------------------------------------------------------
                                                                   

              190       200       210       220       230          
pF1KB4 ANANLSADQSPSALSAGKTAVNVPRQPTVTSVCSETSQELAEGQRRGSQGDSKQQNG---
                                 :::::::::::::::::::::::::::::::   
CCDS58 --------------------------PTVTSVCSETSQELAEGQRRGSQGDSKQQNGKIP
                                 100       110       120       130 

          240       250       260       270       280       290    
pF1KB4 ---PPRKHIVERYTEFYHVPTHSDASKKRLIEDTEDWRPRTGTTQSRSFRILAQITGTEH
          :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 PKRPPRKHIVERYTEFYHVPTHSDASKKRLIEDTEDWRPRTGTTQSRSFRILAQITGTEH
             140       150       160       170       180       190 

          300                                                      
pF1KB4 LKESEADNTKKA------------------------------------------------
       ::::::::::::                                                
CCDS58 LKESEADNTKKAKFDSALEDLPKSGPHPPATPQVLTIGSQVATLSKVATTYSSLSSSTGN
             200       210       220       230       240       250 

                                                                   
pF1KB4 ------------------------------------------------------------
                                                                   
CCDS58 VEDSFEGFRNFSTFSSPARYSAAVLSSAAATVSAVIATKTRLYTPERYHSLLDALCISPV
             260       270       280       290       300       310 

                                310       320       330       340  
pF1KB4 ------------------------NNSQEPSPQLASSVASTRSMPESLDSPTSGRPGVTS
                               .:::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 SKPLAFSYLQSSRKSTGSIHVKKTSNSQEPSPQLASSVASTRSMPESLDSPTSGRPGVTS
             320       330       340       350       360       370 

            350       360       370       380       390       400  
pF1KB4 LTTAAAFKPVGSTGVIKSPSWQRPNQGVPSTGRISNSAAYSGSVAPANSALGQTQPSDQD
       ::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::
CCDS58 LTAAAAFKPVGSTGVIKSPSWQRPNQGVPSTGRISNSATYSGSVAPANSALGQTQPSDQD
             380       390       400       410       420       430 

            410       420       430       440       450       460  
pF1KB4 TLVQRAEHIPAGKRTPMCAHCNQVIRGPFLVALGKSWHPEEFNCAHCKNTMAYIGFVEEK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 TLVQRAEHIPAGKRTPMCAHCNQVIRGPFLVALGKSWHPEEFNCAHCKNTMAYIGFVEEK
             440       450       460       470       480       490 

            470       480       490       500       510       520  
pF1KB4 GALYCELCYEKFFAPECGRCQRKILGEVINALKQTWHVSCFVCVACGKPIRNNVFHLEDG
       :::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 GALYCELCYEKFFAPECGRCQRKILGEVISALKQTWHVSCFVCVACGKPIRNNVFHLEDG
             500       510       520       530       540       550 

            530       540       550       560       570       580  
pF1KB4 EPYCETDYYALFGTICHGCEFPIEAGDMFLEALGYTWHDTCFVCSVCCESLEGQTFFSKK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 EPYCETDYYALFGTICHGCEFPIEAGDMFLEALGYTWHDTCFVCSVCCESLEGQTFFSKK
             560       570       580       590       600       610 

            590      
pF1KB4 DKPLCKKHAHSVNF
       ::::::::::::::
CCDS58 DKPLCKKHAHSVNF
             620     

>>CCDS75166.1 PDLIM5 gene_id:10611|Hs108|chr4             (271 aa)
 initn: 1929 init1: 1929 opt: 1929  Z-score: 1175.2  bits: 226.3 E(32554): 3.9e-59
Smith-Waterman score: 1929; 98.9% identity (100.0% similar) in 271 aa overlap (326-596:1-271)

         300       310       320       330       340       350     
pF1KB4 KESEADNTKKANNSQEPSPQLASSVASTRSMPESLDSPTSGRPGVTSLTTAAAFKPVGST
                                     :::::::::::::::::::.::::::::::
CCDS75                               MPESLDSPTSGRPGVTSLTAAAAFKPVGST
                                             10        20        30

         360       370       380       390       400       410     
pF1KB4 GVIKSPSWQRPNQGVPSTGRISNSAAYSGSVAPANSALGQTQPSDQDTLVQRAEHIPAGK
       :::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 GVIKSPSWQRPNQGVPSTGRISNSATYSGSVAPANSALGQTQPSDQDTLVQRAEHIPAGK
               40        50        60        70        80        90

         420       430       440       450       460       470     
pF1KB4 RTPMCAHCNQVIRGPFLVALGKSWHPEEFNCAHCKNTMAYIGFVEEKGALYCELCYEKFF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 RTPMCAHCNQVIRGPFLVALGKSWHPEEFNCAHCKNTMAYIGFVEEKGALYCELCYEKFF
              100       110       120       130       140       150

         480       490       500       510       520       530     
pF1KB4 APECGRCQRKILGEVINALKQTWHVSCFVCVACGKPIRNNVFHLEDGEPYCETDYYALFG
       ::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 APECGRCQRKILGEVISALKQTWHVSCFVCVACGKPIRNNVFHLEDGEPYCETDYYALFG
              160       170       180       190       200       210

         540       550       560       570       580       590     
pF1KB4 TICHGCEFPIEAGDMFLEALGYTWHDTCFVCSVCCESLEGQTFFSKKDKPLCKKHAHSVN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 TICHGCEFPIEAGDMFLEALGYTWHDTCFVCSVCCESLEGQTFFSKKDKPLCKKHAHSVN
              220       230       240       250       260       270

        
pF1KB4 F
       :
CCDS75 F
        

>>CCDS7377.1 LDB3 gene_id:11155|Hs108|chr10               (727 aa)
 initn: 1762 init1: 1089 opt: 1126  Z-score: 689.8  bits: 137.9 E(32554): 4.2e-32
Smith-Waterman score: 1151; 35.5% identity (61.0% similar) in 589 aa overlap (19-596:175-727)

                           10        20        30        40        
pF1KB4             MSNYSVSLVGPAPWGFRLQGGKDFNMPLTISSLKDGGKAAQANVRIGD
                                     .:..:.  :   ..:  ...  : :  :: 
CCDS73 AFSRPSAFSSLAEASDPGPPRASLRAKTSPEGARDLLGP---KALPGSSQPRQYNNPIG-
          150       160       170       180          190       200 

       50        60         70           80         90       100   
pF1KB4 VVLSIDGINAQG-MTHLEAQNKIKGCT---GSLNMT-LQRASAAPKPEPVPVQKGEPKEV
        . : . .  .. : ..  ..: .:     ::: .  :   ::.:  . :  ....:.. 
CCDS73 -LYSAETLREMAQMYQMSLRGKASGVGLPGGSLPIKDLAVDSASPVYQAVIKSQNKPED-
               210       220       230       240       250         

           110       120       130       140       150       160   
pF1KB4 VKPVPITSPAVSKVTSTNNMAYNKAPRPFGSVSSPKVTSIPSPSSAFTPAHATTSSHASP
                :   .  ..:.  ... : ...... .   . .:.       .:   ::  
CCDS73 --------EADEWARRSSNLQ-SRSFRILAQMTGTEF--MQDPDEEALRRSSTPIEHAPV
              260       270        280         290       300       

           170       180       190       200       210       220   
pF1KB4 SPVAAVTPPLFAASGLHANANLSADQSPSALSAGKTAVNVPRQPTVTSVCSETSQELAEG
           :.:: : :..   : :. :: . : : .:..::.      .....   .:   .  
CCDS73 CTSQATTPLLPASAQPPAAASPSAASPPLATAAAHTAIA-----SASTTAPASSPADSPR
       310       320       330       340            350       360  

           230       240       250       260       270       280   
pF1KB4 QRRGSQGDSKQQNGPPRKHIVERYTEFYHVPTHSDASKKRLIEDTEDWRPRTGTTQSRSF
        . .: . .   .. :  :    :.:   .:    : : :..  : . ::  .. :    
CCDS73 PQASSYSPAVAASSAPATHT--SYSEGPAAP----APKPRVVT-TASIRP--SVYQPVPA
            370       380         390            400         410   

           290       300       310          320       330          
pF1KB4 RILAQITGTEHLKESEADNTKKANNSQEPSPQLA---SSVASTRSMPESLDSPTSG---R
          .   :...   : .  : .   .  :::  :   : : .    :    .:. .    
CCDS73 STYSPSPGANY---SPTPYTPSPAPAYTPSPAPAYTPSPVPTYTPSPAPAYTPSPAPNYN
           420          430       440       450       460       470

       340       350       360       370       380       390       
pF1KB4 PGVTSLTTAAAFKPVGSTGVIKSPSWQRPNQGVPSTGRISNSAAYSGSVAPANSALGQTQ
       :. .   ...  .:..    . . :...      ::  ::...   :.  :: .  :   
CCDS73 PAPSVAYSGGPAEPASRPPWVTDDSFSQKFAPGKSTTSISKQTLPRGG--PAYTPAGPQV
              480       490       500       510         520        

       400       410       420       430       440       450       
pF1KB4 PSDQDTLVQRAEHIPAGKRTPMCAHCNQVIRGPFLVALGKSWHPEEFNCAHCKNTMAYIG
       :      :::::..::..:::.:.:::.:::::::::.:.:::::::.::.::...: . 
CCDS73 PPLARGTVQRAERFPASSRTPLCGHCNNVIRGPFLVAMGRSWHPEEFTCAYCKTSLADVC
      530       540       550       560       570       580        

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pF1KB4 FVEEKGALYCELCYEKFFAPECGRCQRKILGEVINALKQTWHVSCFVCVACGKPIRNNVF
       ::::.. .::: :::.:::: :..:. ::.:::..::.::::..::::.:: ::. :..:
CCDS73 FVEEQNNVYCERCYEQFFAPLCAKCNTKIMGEVMHALRQTWHTTCFVCAACKKPFGNSLF
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pF1KB4 HLEDGEPYCETDYYALFGTICHGCEFPIEAGDMFLEALGYTWHDTCFVCSVCCESLEGQT
       :.:::::::: ::  ::.: ::::.::.:::: :.::::.:::::::.:.::  .:::: 
CCDS73 HMEDGEPYCEKDYINLFSTKCHGCDFPVEAGDKFIEALGHTWHDTCFICAVCHVNLEGQP
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pF1KB4 FFSKKDKPLCKKHAHSVNF
       :.::::.::::::::..:.
CCDS73 FYSKKDRPLCKKHAHTINL
      710       720       

>>CCDS41544.1 LDB3 gene_id:11155|Hs108|chr10              (617 aa)
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Smith-Waterman score: 1482; 38.5% identity (61.2% similar) in 670 aa overlap (3-596:2-617)

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pF1KB4 MSNYSVSLVGPAPWGFRLQGGKDFNMPLTISSLKDGGKAAQANVRIGDVVLSIDGINAQG
         .:::.:.::.::::::::::::::::::: .  :.::::...  ::.:..:::.:.. 
CCDS41  MSYSVTLTGPGPWGFRLQGGKDFNMPLTISRITPGSKAAQSQLSQGDLVVAIDGVNTDT
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pF1KB4 MTHLEAQNKIKGCTGSLNMTLQRASAAPKPEPVPVQKGEPKEVVKPVPITSPAVSKVTST
       :::::::::::. . .:..:::...     .:.:..   :  :  :.:.       :.: 
CCDS41 MTHLEAQNKIKSASYNLSLTLQKSK-----RPIPISTTAPP-VQTPLPVIPHQKVVVNSP
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pF1KB4 NNMAYNKAPRPFGSVSSPKVTSIPSPSSAFTPAHATTSSHASPSPVAAVTPPLFAASGLH
        :  :..                      :.:.    :. .. .:. .        .:: 
CCDS41 ANADYQER---------------------FNPSALKDSALSTHKPIEV--------KGLG
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pF1KB4 ANANLSADQSPSALSAGKTAVNVPRQPTVTSVCSETSQELAEGQRRGSQGDSKQQNGPPR
       ..:..   :            :.:    ..   ... ..   :: . .::.. . . : .
CCDS41 GKATIIHAQ-----------YNTP----ISMYSQDAIMDAIAGQAQ-AQGSDFSGSLPIK
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pF1KB4 KHIVERYTEFYHVPTHSDASKKRLIEDTEDWRPRTGTTQSRSFRILAQITGTEHLKESEA
          :.  .  :..  .:. . .   .....:  :... ::::::::::.:::: ... . 
CCDS41 DLAVDSASPVYQAVIKSQNKPE---DEADEWARRSSNLQSRSFRILAQMTGTEFMQDPDE
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pF1KB4 DNTKKAN-NSQEPSPQLASS---------------------VASTRSM--------PESL
       .  ...  ...  :: .:.:                     :..: :.        : : 
CCDS41 EALRRSRPQASSYSPAVAASSAPATHTSYSEGPAAPAPKPRVVTTASIRPSVYQPVPAST
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pF1KB4 DSPTSG---RPGVTSLTTAAAFKPVGSTGVIKSP-SWQRPNQG---VPSTGRISN---SA
        ::. :    :   . . : :. :  . .   ::     :. .   .:: .   :   :.
CCDS41 YSPSPGANYSPTPYTPSPAPAYTPSPAPAYTPSPVPTYTPSPAPAYTPSPAPNYNPAPSV
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pF1KB4 AYSGSVA------------------------------------PANSALGQTQPSDQDTL
       ::::. :                                    :: .  :   :      
CCDS41 AYSGGPAEPASRPPWVTDDSFSQKFAPGKSTTSISKQTLPRGGPAYTPAGPQVPPLARGT
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pF1KB4 VQRAEHIPAGKRTPMCAHCNQVIRGPFLVALGKSWHPEEFNCAHCKNTMAYIGFVEEKGA
       :::::..::..:::.:.:::.:::::::::.:.:::::::.::.::...: . ::::.. 
CCDS41 VQRAERFPASSRTPLCGHCNNVIRGPFLVAMGRSWHPEEFTCAYCKTSLADVCFVEEQNN
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pF1KB4 LYCELCYEKFFAPECGRCQRKILGEVINALKQTWHVSCFVCVACGKPIRNNVFHLEDGEP
       .::: :::.:::: :..:. ::.:::..::.::::..::::.:: ::. :..::.:::::
CCDS41 VYCERCYEQFFAPLCAKCNTKIMGEVMHALRQTWHTTCFVCAACKKPFGNSLFHMEDGEP
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pF1KB4 YCETDYYALFGTICHGCEFPIEAGDMFLEALGYTWHDTCFVCSVCCESLEGQTFFSKKDK
       ::: ::  ::.: ::::.::.:::: :.::::.:::::::.:.::  .:::: :.::::.
CCDS41 YCEKDYINLFSTKCHGCDFPVEAGDKFIEALGHTWHDTCFICAVCHVNLEGQPFYSKKDR
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          590      
pF1KB4 PLCKKHAHSVNF
       ::::::::..:.
CCDS41 PLCKKHAHTINL
         610       

>>CCDS53550.1 LDB3 gene_id:11155|Hs108|chr10              (732 aa)
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Smith-Waterman score: 1173; 34.7% identity (58.3% similar) in 619 aa overlap (90-596:120-732)

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CCDS53 STTAPPVQTPLPVIPHQKDPALDTNGSLVAPSPSPEARASPGTPGTPELRPTFSPAFSRP
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pF1KB4 TSTNNMAYNKAPRP----FGSVSSPK-VTSIPSPSSAFTPAHATTSSHASPSPVAAVTP-
       .. ...:  . : :    . . .::. . .. .:..   :. .   .. .:  . ..   
CCDS53 SAFSSLAEASDPGPPRASLRAKTSPEGARDLLGPKA--LPGSSQPRQYNNPIGLYSAETL
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pF1KB4 ----PLFAAS--------GLHANANLSADQSPSALS---------------AGK-TAVNV
            ..  :        :: ..:. .   .::::.               .:: : ...
CCDS53 REMAQMYQMSLRGKASGVGLPGGADYQERFNPSALKDSALSTHKPIEVKGLGGKATIIHA
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           210       220       230       240       250       260   
pF1KB4 PRQPTVTSVCSETSQELAEGQRRGSQGDSKQQNGPPRKHIVERYTEFYHVPTHSDASKKR
         .  ..   ... ..   :: . .::.. . . : .   :.  .  :..  .:. . . 
CCDS53 QYNTPISMYSQDAIMDAIAGQAQ-AQGSDFSGSLPIKDLAVDSASPVYQAVIKSQNKPE-
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           270       280       290       300        310            
pF1KB4 LIEDTEDWRPRTGTTQSRSFRILAQITGTEHLKESEADNTKKAN-NSQEPSPQLASS---
         .....:  :... ::::::::::.:::: ... . .  ...  ...  :: .:.:   
CCDS53 --DEADEWARRSSNLQSRSFRILAQMTGTEFMQDPDEEALRRSRPQASSYSPAVAASSAP
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pF1KB4 ------------------VASTRSM--------PESLDSPTSG---RPGVTSLTTAAAFK
                         :..: :.        : :  ::. :    :   . . : :. 
CCDS53 ATHTSYSEGPAAPAPKPRVVTTASIRPSVYQPVPASTYSPSPGANYSPTPYTPSPAPAYT
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pF1KB4 PVGSTGVIKSP-SWQRPNQG---VPSTGRISN---SAAYSGSVA----------------
       :  . .   ::     :. .   .:: .   :   :.::::. :                
CCDS53 PSPAPAYTPSPVPTYTPSPAPAYTPSPAPNYNPAPSVAYSGGPAEPASRPPWVTDDSFSQ
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pF1KB4 --------------------PANSALGQTQPSDQDTLVQRAEHIPAGKRTPMCAHCNQVI
                           :: .  :   :      :::::..::..:::.:.:::.::
CCDS53 KFAPGKSTTSISKQTLPRGGPAYTPAGPQVPPLARGTVQRAERFPASSRTPLCGHCNNVI
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pF1KB4 RGPFLVALGKSWHPEEFNCAHCKNTMAYIGFVEEKGALYCELCYEKFFAPECGRCQRKIL
       :::::::.:.:::::::.::.::...: . ::::.. .::: :::.:::: :..:. ::.
CCDS53 RGPFLVAMGRSWHPEEFTCAYCKTSLADVCFVEEQNNVYCERCYEQFFAPLCAKCNTKIM
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pF1KB4 GEVINALKQTWHVSCFVCVACGKPIRNNVFHLEDGEPYCETDYYALFGTICHGCEFPIEA
       :::..::.::::..::::.:: ::. :..::.:::::::: ::  ::.: ::::.::.::
CCDS53 GEVMHALRQTWHTTCFVCAACKKPFGNSLFHMEDGEPYCEKDYINLFSTKCHGCDFPVEA
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pF1KB4 GDMFLEALGYTWHDTCFVCSVCCESLEGQTFFSKKDKPLCKKHAHSVNF
       :: :.::::.:::::::.:.::  .:::: :.::::.::::::::..:.
CCDS53 GDKFIEALGHTWHDTCFICAVCHVNLEGQPFYSKKDRPLCKKHAHTINL
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>>CCDS4423.1 PDLIM7 gene_id:9260|Hs108|chr5               (423 aa)
 initn: 1702 init1: 873 opt: 890  Z-score: 552.7  bits: 111.8 E(32554): 1.8e-24
Smith-Waterman score: 1213; 38.2% identity (54.8% similar) in 597 aa overlap (1-593:1-421)

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pF1KB4 MSNYSVSLVGPAPWGFRLQGGKDFNMPLTISSLKDGGKAAQANVRIGDVVLSIDGINAQG
       :....: : ::::::::::::::::.::.:: :  :::::::.: .:: :::::: :: .
CCDS44 MDSFKVVLEGPAPWGFRLQGGKDFNVPLSISRLTPGGKAAQAGVAVGDWVLSIDGENAGS
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pF1KB4 MTHLEAQNKIKGCTGSLNMTLQRASAAPKPEPVPVQKGEPKEVVKPVPITSPAVSKVTST
       .::.::::::..:   :.. :.::.        :::.       ::  . .:        
CCDS44 LTHIEAQNKIRACGERLSLGLSRAQ--------PVQS-------KPQKVQTP--------
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               130       140       150       160       170         
pF1KB4 NNMAYNKAP-RPFGSVSSPKVTSIPSPSSAFTPAHATTSSHASPSPVAAVTPPLFAASGL
            .: : ::.                                               
CCDS44 -----DKQPLRPL-----------------------------------------------
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     180       190       200       210       220       230         
pF1KB4 HANANLSADQSPSALSAGKTAVNVPRQPTVTSVCSETSQELAEGQRRGSQGDSKQQNGPP
                              ::                                   
CCDS44 -----------------------VP-----------------------------------
                                                                   

     240       250       260       270       280       290         
pF1KB4 RKHIVERYTEFYHVPTHSDASKKRLIEDTEDWRPRTGTTQSRSFRILAQITGTEHLKESE
                         ::::.::.:.::::::: :: :::::::::..:::: ... .
CCDS44 ------------------DASKQRLMENTEDWRPRPGTGQSRSFRILAHLTGTEFMQDPD
                         110       120       130       140         

     300       310       320          330       340       350      
pF1KB4 ADNTKKANNSQEPSPQLASSVASTRSMP---ESLDSPTSGRPGVTSLTTAAAFKPVGSTG
        .. ::  .:: :  .  . ..:: . :    .  ::::  : ... . :  . :  .. 
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