Result of FASTA (ccds) for pF1KB5920
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB5920, 532 aa
  1>>>pF1KB5920 532 - 532 aa - 532 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.4621+/-0.000929; mu= 0.2056+/- 0.056
 mean_var=223.7605+/-45.737, 0's: 0 Z-trim(113.8): 42  B-trim: 0 in 0/54
 Lambda= 0.085740
 statistics sampled from 14326 (14363) to 14326 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.772), E-opt: 0.2 (0.441), width:  16
 Scan time:  3.310

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS11345.1 GRB7 gene_id:2886|Hs108|chr17          ( 532) 3668 466.5 3.5e-131
CCDS56028.1 GRB7 gene_id:2886|Hs108|chr17          ( 555) 3668 466.5 3.6e-131
CCDS82116.1 GRB7 gene_id:2886|Hs108|chr17          ( 447) 2929 375.0  1e-103
CCDS43583.1 GRB10 gene_id:2887|Hs108|chr7          ( 536) 1755 229.8   6e-60
CCDS43582.1 GRB10 gene_id:2887|Hs108|chr7          ( 594) 1755 229.9 6.5e-60
CCDS2222.1 GRB14 gene_id:2888|Hs108|chr2           ( 540) 1708 224.0 3.4e-58
CCDS47586.1 GRB10 gene_id:2887|Hs108|chr7          ( 548) 1134 153.0 8.1e-37
CCDS31167.1 APBB1IP gene_id:54518|Hs108|chr10      ( 666)  490 73.4 9.1e-13
CCDS2360.1 RAPH1 gene_id:65059|Hs108|chr2          ( 644)  484 72.7 1.5e-12
CCDS2359.1 RAPH1 gene_id:65059|Hs108|chr2          (1250)  484 72.9 2.5e-12


>>CCDS11345.1 GRB7 gene_id:2886|Hs108|chr17               (532 aa)
 initn: 3668 init1: 3668 opt: 3668  Z-score: 2468.6  bits: 466.5 E(32554): 3.5e-131
Smith-Waterman score: 3668; 100.0% identity (100.0% similar) in 532 aa overlap (1-532:1-532)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MELDLSPPHLSSSPEDLCPAPGTPPGTPRPPDTPLPEEVKRSQPLLIPTTGRKLREEERR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MELDLSPPHLSSSPEDLCPAPGTPPGTPRPPDTPLPEEVKRSQPLLIPTTGRKLREEERR
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 ATSLPSIPNPFPELCSPPSQSPILGGPSSARGLLPRDASRPHVVKVYSEDGACRSVEVAA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 ATSLPSIPNPFPELCSPPSQSPILGGPSSARGLLPRDASRPHVVKVYSEDGACRSVEVAA
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB5 GATARHVCEMLVQRAHALSDETWGLVECHPHLALERGLEDHESVVEVQAAWPVGGDSRFV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 GATARHVCEMLVQRAHALSDETWGLVECHPHLALERGLEDHESVVEVQAAWPVGGDSRFV
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB5 FRKNFAKYELFKSSPHSLFPEKMVSSCLDAHTGISHEDLIQNFLNAGSFPEIQGFLQLRG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 FRKNFAKYELFKSSPHSLFPEKMVSSCLDAHTGISHEDLIQNFLNAGSFPEIQGFLQLRG
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB5 SGRKLWKRFFCFLRRSGLYYSTKGTSKDPRHLQYVADVNESNVYVVTQGRKLYGMPTDFG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SGRKLWKRFFCFLRRSGLYYSTKGTSKDPRHLQYVADVNESNVYVVTQGRKLYGMPTDFG
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB5 FCVKPNKLRNGHKGLRIFCSEDEQSRTCWLAAFRLFKYGVQLYKNYQQAQSRHLHPSCLG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 FCVKPNKLRNGHKGLRIFCSEDEQSRTCWLAAFRLFKYGVQLYKNYQQAQSRHLHPSCLG
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB5 SPPLRSASDNTLVAMDFSGHAGRVIENPREALSVALEEAQAWRKKTNHRLSLPMPASGTS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SPPLRSASDNTLVAMDFSGHAGRVIENPREALSVALEEAQAWRKKTNHRLSLPMPASGTS
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB5 LSAAIHRTQLWFHGRISREESQRLIGQQGLVDGLFLVRESQRNPQGFVLSLCHLQKVKHY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LSAAIHRTQLWFHGRISREESQRLIGQQGLVDGLFLVRESQRNPQGFVLSLCHLQKVKHY
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530  
pF1KB5 LILPSEEEGRLYFSMDDGQTRFTDLLQLVEFHQLNRGILPCLLRHCCTRVAL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LILPSEEEGRLYFSMDDGQTRFTDLLQLVEFHQLNRGILPCLLRHCCTRVAL
              490       500       510       520       530  

>>CCDS56028.1 GRB7 gene_id:2886|Hs108|chr17               (555 aa)
 initn: 3668 init1: 3668 opt: 3668  Z-score: 2468.4  bits: 466.5 E(32554): 3.6e-131
Smith-Waterman score: 3668; 100.0% identity (100.0% similar) in 532 aa overlap (1-532:24-555)

                                      10        20        30       
pF1KB5                        MELDLSPPHLSSSPEDLCPAPGTPPGTPRPPDTPLPE
                              :::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 MGKWRPGQGHTTGSVKPLSCSDAMELDLSPPHLSSSPEDLCPAPGTPPGTPRPPDTPLPE
               10        20        30        40        50        60

        40        50        60        70        80        90       
pF1KB5 EVKRSQPLLIPTTGRKLREEERRATSLPSIPNPFPELCSPPSQSPILGGPSSARGLLPRD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 EVKRSQPLLIPTTGRKLREEERRATSLPSIPNPFPELCSPPSQSPILGGPSSARGLLPRD
               70        80        90       100       110       120

       100       110       120       130       140       150       
pF1KB5 ASRPHVVKVYSEDGACRSVEVAAGATARHVCEMLVQRAHALSDETWGLVECHPHLALERG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 ASRPHVVKVYSEDGACRSVEVAAGATARHVCEMLVQRAHALSDETWGLVECHPHLALERG
              130       140       150       160       170       180

       160       170       180       190       200       210       
pF1KB5 LEDHESVVEVQAAWPVGGDSRFVFRKNFAKYELFKSSPHSLFPEKMVSSCLDAHTGISHE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 LEDHESVVEVQAAWPVGGDSRFVFRKNFAKYELFKSSPHSLFPEKMVSSCLDAHTGISHE
              190       200       210       220       230       240

       220       230       240       250       260       270       
pF1KB5 DLIQNFLNAGSFPEIQGFLQLRGSGRKLWKRFFCFLRRSGLYYSTKGTSKDPRHLQYVAD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 DLIQNFLNAGSFPEIQGFLQLRGSGRKLWKRFFCFLRRSGLYYSTKGTSKDPRHLQYVAD
              250       260       270       280       290       300

       280       290       300       310       320       330       
pF1KB5 VNESNVYVVTQGRKLYGMPTDFGFCVKPNKLRNGHKGLRIFCSEDEQSRTCWLAAFRLFK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 VNESNVYVVTQGRKLYGMPTDFGFCVKPNKLRNGHKGLRIFCSEDEQSRTCWLAAFRLFK
              310       320       330       340       350       360

       340       350       360       370       380       390       
pF1KB5 YGVQLYKNYQQAQSRHLHPSCLGSPPLRSASDNTLVAMDFSGHAGRVIENPREALSVALE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 YGVQLYKNYQQAQSRHLHPSCLGSPPLRSASDNTLVAMDFSGHAGRVIENPREALSVALE
              370       380       390       400       410       420

       400       410       420       430       440       450       
pF1KB5 EAQAWRKKTNHRLSLPMPASGTSLSAAIHRTQLWFHGRISREESQRLIGQQGLVDGLFLV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 EAQAWRKKTNHRLSLPMPASGTSLSAAIHRTQLWFHGRISREESQRLIGQQGLVDGLFLV
              430       440       450       460       470       480

       460       470       480       490       500       510       
pF1KB5 RESQRNPQGFVLSLCHLQKVKHYLILPSEEEGRLYFSMDDGQTRFTDLLQLVEFHQLNRG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 RESQRNPQGFVLSLCHLQKVKHYLILPSEEEGRLYFSMDDGQTRFTDLLQLVEFHQLNRG
              490       500       510       520       530       540

       520       530  
pF1KB5 ILPCLLRHCCTRVAL
       :::::::::::::::
CCDS56 ILPCLLRHCCTRVAL
              550     

>>CCDS82116.1 GRB7 gene_id:2886|Hs108|chr17               (447 aa)
 initn: 2924 init1: 2924 opt: 2929  Z-score: 1975.7  bits: 375.0 E(32554): 1e-103
Smith-Waterman score: 2929; 97.9% identity (98.2% similar) in 437 aa overlap (1-437:1-432)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MELDLSPPHLSSSPEDLCPAPGTPPGTPRPPDTPLPEEVKRSQPLLIPTTGRKLREEERR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 MELDLSPPHLSSSPEDLCPAPGTPPGTPRPPDTPLPEEVKRSQPLLIPTTGRKLREEERR
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 ATSLPSIPNPFPELCSPPSQSPILGGPSSARGLLPRDASRPHVVKVYSEDGACRSVEVAA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 ATSLPSIPNPFPELCSPPSQSPILGGPSSARGLLPRDASRPHVVKVYSEDGACRSVEVAA
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB5 GATARHVCEMLVQRAHALSDETWGLVECHPHLALERGLEDHESVVEVQAAWPVGGDSRFV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 GATARHVCEMLVQRAHALSDETWGLVECHPHLALERGLEDHESVVEVQAAWPVGGDSRFV
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB5 FRKNFAKYELFKSSPHSLFPEKMVSSCLDAHTGISHEDLIQNFLNAGSFPEIQGFLQLRG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 FRKNFAKYELFKSSPHSLFPEKMVSSCLDAHTGISHEDLIQNFLNAGSFPEIQGFLQLRG
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB5 SGRKLWKRFFCFLRRSGLYYSTKGTSKDPRHLQYVADVNESNVYVVTQGRKLYGMPTDFG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 SGRKLWKRFFCFLRRSGLYYSTKGTSKDPRHLQYVADVNESNVYVVTQGRKLYGMPTDFG
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB5 FCVKPNKLRNGHKGLRIFCSEDEQSRTCWLAAFRLFKYGVQLYKNYQQAQSRHLHPSCLG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 FCVKPNKLRNGHKGLRIFCSEDEQSRTCWLAAFRLFKYGVQLYKNYQQAQSRHLHPSCLG
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB5 SPPLRSASDNTLVAMDFSGHAGRVIENPREALSVALEEAQAWRKKTNHRLSLPMPASGTS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 SPPLRSASDNTLVAMDFSGHAGRVIENPREALSVALEEAQAWRKKTNHRLSLPMPASGTS
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB5 LSAAIHRTQLWFHGRISREESQRLIGQQGLVDGLFLVRESQRNPQGFVLSLCHLQKVKHY
       ::::      :  ::.:                                           
CCDS82 LSAACS----W-SGRVSGTPRALSSLCATCRK                            
                   430       440                                   

>>CCDS43583.1 GRB10 gene_id:2887|Hs108|chr7               (536 aa)
 initn: 1804 init1: 587 opt: 1755  Z-score: 1189.7  bits: 229.8 E(32554): 6e-60
Smith-Waterman score: 1908; 54.1% identity (80.2% similar) in 536 aa overlap (1-532:14-536)

                            10        20        30        40       
pF1KB5              MELDLSPPHLSSSPEDLCPAPGTPPGTPRPPDTPLPEEVKRSQPLLI
                    :. :  :   ...     :  . :: . .:  .:  ..:.::::. :
CCDS43 MNASLESLYSACSMQSDTVPLLQNGQHARSQPRASGPPRSIQPQVSPR-QRVQRSQPVHI
               10        20        30        40         50         

        50          60        70        80        90       100     
pF1KB5 PTTGRKLREEER--RATSLPSIPNPFPELCSPPSQSPILGGPSSARGLLPRDASRPHVVK
        .. :.:.::..  :..:::.:::::::::.: :  :.:  :.:   : : .:.  . ::
CCDS43 LAV-RRLQEEDQQFRTSSLPAIPNPFPELCGPGSP-PVLT-PGS---LPPSQAAAKQDVK
      60         70        80        90         100          110   

         110       120       130       140       150       160     
pF1KB5 VYSEDGACRSVEVAAGATARHVCEMLVQRAHALSDETWGLVECHPHLALERGLEDHESVV
       :.::::. . ::. :  ::: .:..:: ..: ..:..: ::: ::::.::: ::::: ::
CCDS43 VFSEDGTSKVVEILADMTARDLCQLLVYKSHCVDDNSWTLVEHHPHLGLERCLEDHELVV
           120       130       140       150       160       170   

         170       180       190       200       210       220     
pF1KB5 EVQAAWPVGGDSRFVFRKNFAKYELFKSSPHSLFPEKMVSSCLDAHTGISHEDLIQNFLN
       .:...  ....:.:.::::.::::.::. : ..:::.::. : ... : :. .:.:::::
CCDS43 QVEST--MASESKFLFRKNYAKYEFFKN-PMNFFPEQMVTWCQQSN-G-SQTQLLQNFLN
             180       190        200       210         220        

         230       240       250       260       270       280     
pF1KB5 AGSFPEIQGFLQLRGSGRKLWKRFFCFLRRSGLYYSTKGTSKDPRHLQYVADVNESNVYV
       ..: :::::::...  :.: ::...  ::::::: :::::::.::::: .::...::.. 
CCDS43 SSSCPEIQGFLHVKELGKKSWKKLYVCLRRSGLYCSTKGTSKEPRHLQLLADLEDSNIFS
      230       240       250       260       270       280        

         290       300       310       320       330       340     
pF1KB5 VTQGRKLYGMPTDFGFCVKPNKLRNGHKGLRIFCSEDEQSRTCWLAAFRLFKYGVQLYKN
       .  ::: :. ::: :.:.::::.::  : ::..:.::::.::::..::::.:::. ::.:
CCDS43 LIAGRKQYNAPTDHGLCIKPNKVRNETKELRLLCAEDEQTRTCWMTAFRLLKYGMLLYQN
      290       300       310       320       330       340        

         350       360       370       380       390       400     
pF1KB5 YQQAQSRHLHPSCLGSPPLRSASDNTLVAMDFSGHAGRVIENPREALSVALEEAQAWRKK
       :.  :.:.   : . : :.::.:.:.::::::::..::::::: :: :.::::..::::.
CCDS43 YRIPQQRKALLSPF-STPVRSVSENSLVAMDFSGQTGRVIENPAEAQSAALEEGHAWRKR
      350       360        370       380       390       400       

           410       420       430       440       450       460   
pF1KB5 TNHR--LSLPMPASGTSLSAAIHRTQLWFHGRISREESQRLIGQQGLVDGLFLVRESQRN
       ...   :.   :   ..::..::::: :::::::::::.:.: ::::::::::.:.:: :
CCDS43 STRMNILGSQSPLHPSTLSTVIHRTQHWFHGRISREESHRIIKQQGLVDGLFLLRDSQSN
       410       420       430       440       450       460       

           470       480       490       500       510       520   
pF1KB5 PQGFVLSLCHLQKVKHYLILPSEEEGRLYFSMDDGQTRFTDLLQLVEFHQLNRGILPCLL
       :..:::.::: ::.:.. ::: :..:. .::.:::.:.:.::.:::.:.:::.:.::: :
CCDS43 PKAFVLTLCHHQKIKNFQILPCEDDGQTFFSLDDGNTKFSDLIQLVDFYQLNKGVLPCKL
       470       480       490       500       510       520       

           530  
pF1KB5 RHCCTRVAL
       .: : ::::
CCDS43 KHHCIRVAL
       530      

>>CCDS43582.1 GRB10 gene_id:2887|Hs108|chr7               (594 aa)
 initn: 1804 init1: 587 opt: 1755  Z-score: 1189.1  bits: 229.9 E(32554): 6.5e-60
Smith-Waterman score: 1908; 54.1% identity (80.2% similar) in 536 aa overlap (1-532:72-594)

                                             10        20        30
pF1KB5                               MELDLSPPHLSSSPEDLCPAPGTPPGTPRP
                                     :. :  :   ...     :  . :: . .:
CCDS43 LANHQEDDVDLEALVNDMNASLESLYSACSMQSDTVPLLQNGQHARSQPRASGPPRSIQP
              50        60        70        80        90       100 

               40        50          60        70        80        
pF1KB5 PDTPLPEEVKRSQPLLIPTTGRKLREEER--RATSLPSIPNPFPELCSPPSQSPILGGPS
         .:  ..:.::::. : .. :.:.::..  :..:::.:::::::::.: :  :.:  :.
CCDS43 QVSPR-QRVQRSQPVHILAV-RRLQEEDQQFRTSSLPAIPNPFPELCGPGSP-PVLT-PG
              110       120        130       140       150         

       90       100       110       120       130       140        
pF1KB5 SARGLLPRDASRPHVVKVYSEDGACRSVEVAAGATARHVCEMLVQRAHALSDETWGLVEC
       :   : : .:.  . :::.::::. . ::. :  ::: .:..:: ..: ..:..: ::: 
CCDS43 S---LPPSQAAAKQDVKVFSEDGTSKVVEILADMTARDLCQLLVYKSHCVDDNSWTLVEH
          160       170       180       190       200       210    

      150       160       170       180       190       200        
pF1KB5 HPHLALERGLEDHESVVEVQAAWPVGGDSRFVFRKNFAKYELFKSSPHSLFPEKMVSSCL
       ::::.::: ::::: ::.:...  ....:.:.::::.::::.::. : ..:::.::. : 
CCDS43 HPHLGLERCLEDHELVVQVEST--MASESKFLFRKNYAKYEFFKN-PMNFFPEQMVTWCQ
          220       230         240       250        260       270 

      210       220       230       240       250       260        
pF1KB5 DAHTGISHEDLIQNFLNAGSFPEIQGFLQLRGSGRKLWKRFFCFLRRSGLYYSTKGTSKD
       ... : :. .:.:::::..: :::::::...  :.: ::...  ::::::: :::::::.
CCDS43 QSN-G-SQTQLLQNFLNSSSCPEIQGFLHVKELGKKSWKKLYVCLRRSGLYCSTKGTSKE
               280       290       300       310       320         

      270       280       290       300       310       320        
pF1KB5 PRHLQYVADVNESNVYVVTQGRKLYGMPTDFGFCVKPNKLRNGHKGLRIFCSEDEQSRTC
       ::::: .::...::.. .  ::: :. ::: :.:.::::.::  : ::..:.::::.:::
CCDS43 PRHLQLLADLEDSNIFSLIAGRKQYNAPTDHGLCIKPNKVRNETKELRLLCAEDEQTRTC
     330       340       350       360       370       380         

      330       340       350       360       370       380        
pF1KB5 WLAAFRLFKYGVQLYKNYQQAQSRHLHPSCLGSPPLRSASDNTLVAMDFSGHAGRVIENP
       :..::::.:::. ::.::.  :.:.   : . : :.::.:.:.::::::::..:::::::
CCDS43 WMTAFRLLKYGMLLYQNYRIPQQRKALLSPF-STPVRSVSENSLVAMDFSGQTGRVIENP
     390       400       410       420        430       440        

      390       400         410       420       430       440      
pF1KB5 REALSVALEEAQAWRKKTNHR--LSLPMPASGTSLSAAIHRTQLWFHGRISREESQRLIG
        :: :.::::..::::....   :.   :   ..::..::::: :::::::::::.:.: 
CCDS43 AEAQSAALEEGHAWRKRSTRMNILGSQSPLHPSTLSTVIHRTQHWFHGRISREESHRIIK
      450       460       470       480       490       500        

        450       460       470       480       490       500      
pF1KB5 QQGLVDGLFLVRESQRNPQGFVLSLCHLQKVKHYLILPSEEEGRLYFSMDDGQTRFTDLL
       ::::::::::.:.:: ::..:::.::: ::.:.. ::: :..:. .::.:::.:.:.::.
CCDS43 QQGLVDGLFLLRDSQSNPKAFVLTLCHHQKIKNFQILPCEDDGQTFFSLDDGNTKFSDLI
      510       520       530       540       550       560        

        510       520       530  
pF1KB5 QLVEFHQLNRGILPCLLRHCCTRVAL
       :::.:.:::.:.::: :.: : ::::
CCDS43 QLVDFYQLNKGVLPCKLKHHCIRVAL
      570       580       590    

>>CCDS2222.1 GRB14 gene_id:2888|Hs108|chr2                (540 aa)
 initn: 1035 init1: 535 opt: 1708  Z-score: 1158.3  bits: 224.0 E(32554): 3.4e-58
Smith-Waterman score: 1708; 50.0% identity (74.7% similar) in 522 aa overlap (22-532:28-540)

                     10        20        30         40        50   
pF1KB5       MELDLSPPHLSSSPEDLCPAPGTPPGTPRPPD-TPLPEEVKRSQPLLIPTTGRK
                                  :.  :     : .: :    :.  : .:   : 
CCDS22 MTTSLQDGQSAASRAAARDSPLAAQVCGAAQGRGDAHDLAPAPWLHARAL-LPLPDGTRG
               10        20        30        40        50          

            60             70        80        90       100        
pF1KB5 LREEERRATSL-----PSIPNPFPELCSPPSQSPILGGPSSARGLLPRDASRP-HVVKVY
          ..:.  .:     :::::::::::  :  : .:    ::  :.:.  ::  .:.:::
CCDS22 CAADRRKKKDLDVPEMPSIPNPFPELCCSPFTS-VL----SA-DLFPKANSRKKQVIKVY
      60        70        80        90             100       110   

       110       120       130       140       150       160       
pF1KB5 SEDGACRSVEVAAGATARHVCEMLVQRAHALSDETWGLVECHPHLALERGLEDHESVVEV
       ::: . :...: .  ::: ::..:. . : ..:..: : :  ::...:: .:::: :.::
CCDS22 SEDETSRALDVPSDITARDVCQLLILKNHYIDDHSWTLFEHLPHIGVERTIEDHELVIEV
           120       130       140       150       160       170   

       170       180       190       200       210       220       
pF1KB5 QAAWPVGGDSRFVFRKNFAKYELFKSSPHSLFPEKMVSSCLDAHTGISHEDLIQNFLNAG
        . : .  .... ::::.::::.::. :  .:::.:::   ...  ::  ...: ::...
CCDS22 LSNWGIEEENKLYFRKNYAKYEFFKN-PMYFFPEHMVSFATETNGEISPTQILQMFLSSS
           180       190        200       210       220       230  

       230       240       250       260       270       280       
pF1KB5 SFPEIQGFLQLRGSGRKLWKRFFCFLRRSGLYYSTKGTSKDPRHLQYVADVNESNVYVVT
       ..:::.:::. . .:.: ::... ::::::::.:::::::.:::::. .. ..:..::  
CCDS22 TYPEIHGFLHAKEQGKKSWKKIYFFLRRSGLYFSTKGTSKEPRHLQFFSEFGNSDIYVSL
            240       250       260       270       280       290  

       290       300       310       320       330       340       
pF1KB5 QGRKLYGMPTDFGFCVKPNKLRNGHKGLRIFCSEDEQSRTCWLAAFRLFKYGVQLYKNYQ
        :.: .: ::..::: ::::  .: . :...:.:.:::::::..:.::.:::.:::.::.
CCDS22 AGKKKHGAPTNYGFCFKPNKA-GGPRDLKMLCAEEEQSRTCWVTAIRLLKYGMQLYQNYM
            300       310        320       330       340       350 

       350       360       370       380       390       400       
pF1KB5 QAQSRHLHPSCLGSPPLRSASDNTLVAMDFSGHAGRVIENPREALSVALEEAQAWRKKTN
       .  . .   :  .  :.:: :.:.::::::::. .:::::: ::::::.::. :::::  
CCDS22 HPYQGRSGCSSQSISPMRSISENSLVAMDFSGQKSRVIENPTEALSVAVEEGLAWRKKGC
             360       370       380       390       400       410 

       410          420        430       440       450       460   
pF1KB5 HRLSL---PMPASGTSLSA-AIHRTQLWFHGRISREESQRLIGQQGLVDGLFLVRESQRN
        ::.    :  .: .: .  ::::.: ::: .:::.:.:::: :::::::.::::.:: :
CCDS22 LRLGTHGSPTASSQSSATNMAIHRSQPWFHHKISRDEAQRLIIQQGLVDGVFLVRDSQSN
             420       430       440       450       460       470 

           470       480       490       500       510       520   
pF1KB5 PQGFVLSLCHLQKVKHYLILPSEEEGRLYFSMDDGQTRFTDLLQLVEFHQLNRGILPCLL
       :. ::::. : ::.::. :.: :..:... ..:::.::::::.:::::.:::.:.::: :
CCDS22 PKTFVLSMSHGQKIKHFQIIPVEDDGEMFHTLDDGHTRFTDLIQLVEFYQLNKGVLPCKL
             480       490       500       510       520       530 

           530  
pF1KB5 RHCCTRVAL
       .: :.:.::
CCDS22 KHYCARIAL
             540

>>CCDS47586.1 GRB10 gene_id:2887|Hs108|chr7               (548 aa)
 initn: 1594 init1: 568 opt: 1134  Z-score: 774.4  bits: 153.0 E(32554): 8.1e-37
Smith-Waterman score: 1606; 48.5% identity (72.2% similar) in 536 aa overlap (1-532:72-548)

                                             10        20        30
pF1KB5                               MELDLSPPHLSSSPEDLCPAPGTPPGTPRP
                                     :. :  :   ...     :  . :: . .:
CCDS47 LANHQEDDVDLEALVNDMNASLESLYSACSMQSDTVPLLQNGQHARSQPRASGPPRSIQP
              50        60        70        80        90       100 

               40        50          60        70        80        
pF1KB5 PDTPLPEEVKRSQPLLIPTTGRKLREEER--RATSLPSIPNPFPELCSPPSQSPILGGPS
         .:  ..:.::::. : .. :.:.::..  :..:::.:::::::::.: :  :.:  :.
CCDS47 QVSPR-QRVQRSQPVHILAV-RRLQEEDQQFRTSSLPAIPNPFPELCGPGSP-PVLT-PG
              110       120        130       140       150         

       90       100       110       120       130       140        
pF1KB5 SARGLLPRDASRPHVVKVYSEDGACRSVEVAAGATARHVCEMLVQRAHALSDETWGLVEC
       :   : : .:.  . :::.::::. . ::. :  ::: .:..:: ..: ..:..: ::: 
CCDS47 S---LPPSQAAAKQDVKVFSEDGTSKVVEILADMTARDLCQLLVYKSHCVDDNSWTLVEH
          160       170       180       190       200       210    

      150       160       170       180       190       200        
pF1KB5 HPHLALERGLEDHESVVEVQAAWPVGGDSRFVFRKNFAKYELFKSSPHSLFPEKMVSSCL
       ::::.::: ::::: ::.:...  ....:.:.::::.::::.::. : ..:::.::. : 
CCDS47 HPHLGLERCLEDHELVVQVEST--MASESKFLFRKNYAKYEFFKN-PMNFFPEQMVTWCQ
          220       230         240       250        260       270 

      210       220       230       240       250       260        
pF1KB5 DAHTGISHEDLIQNFLNAGSFPEIQGFLQLRGSGRKLWKRFFCFLRRSGLYYSTKGTSKD
                                   :  ::  .:                     ..
CCDS47 ----------------------------QSNGSQTQLL--------------------QE
                                         280                       

      270       280       290       300       310       320        
pF1KB5 PRHLQYVADVNESNVYVVTQGRKLYGMPTDFGFCVKPNKLRNGHKGLRIFCSEDEQSRTC
       ::::: .::...::.. .  ::: :. ::: :.:.::::.::  : ::..:.::::.:::
CCDS47 PRHLQLLADLEDSNIFSLIAGRKQYNAPTDHGLCIKPNKVRNETKELRLLCAEDEQTRTC
           290       300       310       320       330       340   

      330       340       350       360       370       380        
pF1KB5 WLAAFRLFKYGVQLYKNYQQAQSRHLHPSCLGSPPLRSASDNTLVAMDFSGHAGRVIENP
       :..::::.:::. ::.::.  :.:.   : . : :.::.:.:.::::::::..:::::::
CCDS47 WMTAFRLLKYGMLLYQNYRIPQQRKALLSPF-STPVRSVSENSLVAMDFSGQTGRVIENP
           350       360       370        380       390       400  

      390       400         410       420       430       440      
pF1KB5 REALSVALEEAQAWRKKTNHR--LSLPMPASGTSLSAAIHRTQLWFHGRISREESQRLIG
        :: :.::::..::::....   :.   :   ..::..::::: :::::::::::.:.: 
CCDS47 AEAQSAALEEGHAWRKRSTRMNILGSQSPLHPSTLSTVIHRTQHWFHGRISREESHRIIK
            410       420       430       440       450       460  

        450       460       470       480       490       500      
pF1KB5 QQGLVDGLFLVRESQRNPQGFVLSLCHLQKVKHYLILPSEEEGRLYFSMDDGQTRFTDLL
       ::::::::::.:.:: ::..:::.::: ::.:.. ::: :..:. .::.:::.:.:.::.
CCDS47 QQGLVDGLFLLRDSQSNPKAFVLTLCHHQKIKNFQILPCEDDGQTFFSLDDGNTKFSDLI
            470       480       490       500       510       520  

        510       520       530  
pF1KB5 QLVEFHQLNRGILPCLLRHCCTRVAL
       :::.:.:::.:.::: :.: : ::::
CCDS47 QLVDFYQLNKGVLPCKLKHHCIRVAL
            530       540        

>>CCDS31167.1 APBB1IP gene_id:54518|Hs108|chr10           (666 aa)
 initn: 486 init1: 299 opt: 490  Z-score: 342.7  bits: 73.4 E(32554): 9.1e-13
Smith-Waterman score: 490; 28.0% identity (56.8% similar) in 375 aa overlap (64-427:139-507)

            40        50        60        70        80        90   
pF1KB5 PLPEEVKRSQPLLIPTTGRKLREEERRATSLPSIPNPFPELCSPPSQSPILGGPSSARGL
                                     :: .: : ::  :   .     . .   .:
CCDS31 SLGYGTNVAATGISQYEDDLPPPPADPVLDLP-LPPPPPEPLSQEEEEAQAKADKIKLAL
      110       120       130       140        150       160       

             100       110       120       130       140       150 
pF1KB5 --LPRDASRPHVVKVYSEDGACRSVEVAAGATARHVCEMLVQRAHALSDETWGLVECHPH
         : .   .  ::::. .:.. .:. :     :: : . : ...:   .  : : : .:.
CCDS31 EKLKEAKVKKLVVKVHMNDNSTKSLMVDERQLARDVLDNLFEKTHCDCNVDWCLYEIYPE
       170       180       190       200       210       220       

             160       170       180       190           200       
pF1KB5 LALERGLEDHESVVEVQAAWPVGGDSRFVFRKNFAKYELFKSSPHSLF----PEKMVSSC
       : .:: .::::.:::: . :    .....: ..  :: .::. :....     .:  .  
CCDS31 LQIERFFEDHENVVEVLSDWTRDTENKILFLEKEEKYAVFKN-PQNFYLDNRGKKESKET
       230       240       250       260        270       280      

       210       220         230       240       250       260     
pF1KB5 LDAHTGISHEDLIQNFLNAGSF--PEIQGFLQLRGSGRKLWKRFFCFLRRSGLYYSTKGT
        .  .. ..:.:... . . :.  ::..: : :. .:.: ::: . .:: ::.::  :: 
CCDS31 NEKMNAKNKESLLEESFCGTSIIVPELEGALYLKEDGKKSWKRRYFLLRASGIYYVPKGK
        290       300       310       320       330       340      

         270       280       290       300       310       320     
pF1KB5 SKDPRHLQYVADVNESNVYVVTQGRKLYGMPTDFGFCVKPNKLRNGHKGLRIFCSEDEQS
       .:  : :    . .. :.:  :: .  :  :::. : .:  ....  . .. .: .: ..
CCDS31 TKTSRDLACFIQFENVNIYYGTQHKMKYKAPTDYCFVLKHPQIQKESQYIKYLCCDDTRT
        350       360       370       380       390       400      

         330       340       350          360       370       380  
pF1KB5 RTCWLAAFRLFKYGVQLYKNYQQAQSRHLHPS---CLGSPPLRSASDNTLVAMDFSGHAG
        . :. ..:. :::  :: :::.: ..    :    ::.    . .. .      . . .
CCDS31 LNQWVMGIRIAKYGKTLYDNYQRAVAKAGLASRWTNLGTVNAAAPAQPSTGPKTGTTQPN
        410       420       430       440       450       460      

            390       400       410       420       430       440  
pF1KB5 RVIENPREALSVALEEAQAWRKKTNHRLSLPMPASGTSLSAAIHRTQLWFHGRISREESQ
         : .  ...:..:.:::   . .. .     :: :.  . :. :               
CCDS31 GQIPQATHSVSAVLQEAQRHAETSKDK----KPALGNHHDPAVPRAPHAPKSSLPPPPPV
        470       480       490           500       510       520  

            450       460       470       480       490       500  
pF1KB5 RLIGQQGLVDGLFLVRESQRNPQGFVLSLCHLQKVKHYLILPSEEEGRLYFSMDDGQTRF
                                                                   
CCDS31 RRSSDTSGSPATPLKAKGTGGGGLPAPPDDFLPPPPPPPPLDDPELPPPPPDFMEPPPDF
            530       540       550       560       570       580  

>>CCDS2360.1 RAPH1 gene_id:65059|Hs108|chr2               (644 aa)
 initn: 407 init1: 294 opt: 484  Z-score: 338.9  bits: 72.7 E(32554): 1.5e-12
Smith-Waterman score: 484; 29.6% identity (62.0% similar) in 284 aa overlap (103-383:324-605)

             80        90       100       110       120       130  
pF1KB5 ELCSPPSQSPILGGPSSARGLLPRDASRPHVVKVYSEDGACRSVEVAAGATARHVCEMLV
                                     :..:.  : . ... :    :.:.: . :.
CCDS23 LTKEEQAAKLKAEKIRVALEKIKEAQVKKLVIRVHMSDDSSKTMMVDERQTVRQVLDNLM
           300       310       320       330       340       350   

            140       150       160       170       180       190  
pF1KB5 QRAHALSDETWGLVECHPHLALERGLEDHESVVEVQAAWPVGGDSRFVFRKNFAKYELFK
       ...:   .  :.:::   .: .:: .::::..::    :   ......: . . :: :::
CCDS23 DKSHCGYSLDWSLVETVSELQMERIFEDHENLVENLLNWTRDSQNKLIFMERIEKYALFK
           360       370       380       390       400       410   

            200       210       220       230       240       250  
pF1KB5 SSPHSLFPEKMVSSCLDAHTGISHEDLIQNFLNAGSFPEIQGFLQLRGSGRKLWKRFFCF
       .  . :. .: ..   : .  .  :. . .  .. . :::.: : :. .:.: ::. . .
CCDS23 NPQNYLLGKKETAEMADRNKEVLLEECFCG--SSVTVPEIEGVLWLKDDGKKSWKKRYFL
           420       430       440         450       460       470 

            260       270       280       290       300       310  
pF1KB5 LRRSGLYYSTKGTSKDPRHLQYVADVNESNVYVVTQGRKLYGMPTDFGFCVKPNKLRNGH
       :: ::.::  :: .:  : :    .... :::   . :. :  :::. . .:  ....  
CCDS23 LRASGIYYVPKGKAKVSRDLVCFLQLDHVNVYYGQDYRNKYKAPTDYCLVLKHPQIQKKS
             480       490       500       510       520       530 

            320       330       340       350          360         
pF1KB5 KGLRIFCSEDEQSRTCWLAAFRLFKYGVQLYKNYQQAQSRHLHP---SCLGSPPLRSASD
       . .. .: .: ..   :. ..:. ::: ::: :::.: .:       . :.:  ..:.:.
CCDS23 QYIKYLCCDDVRTLHQWVNGIRIAKYGKQLYMNYQEALKRTESAYDWTSLSSSSIKSGSS
             540       550       560       570       580       590 

     370       380       390       400       410       420         
pF1KB5 NTLVAMDFSGHAGRVIENPREALSVALEEAQAWRKKTNHRLSLPMPASGTSLSAAIHRTQ
       .. .  . :.:...                                              
CCDS23 SSSIPESQSNHSNQSDSGVSDTQPAGHVRSQSIVSSVFSEAWKRGTQLEESSK       
             600       610       620       630       640           

>>CCDS2359.1 RAPH1 gene_id:65059|Hs108|chr2               (1250 aa)
 initn: 408 init1: 295 opt: 484  Z-score: 334.7  bits: 72.9 E(32554): 2.5e-12
Smith-Waterman score: 484; 29.6% identity (62.0% similar) in 284 aa overlap (103-383:272-553)

             80        90       100       110       120       130  
pF1KB5 ELCSPPSQSPILGGPSSARGLLPRDASRPHVVKVYSEDGACRSVEVAAGATARHVCEMLV
                                     :..:.  : . ... :    :.:.: . :.
CCDS23 ITEEEQAAKLKAEKIRVALEKIKEAQVKKLVIRVHMSDDSSKTMMVDERQTVRQVLDNLM
             250       260       270       280       290       300 

            140       150       160       170       180       190  
pF1KB5 QRAHALSDETWGLVECHPHLALERGLEDHESVVEVQAAWPVGGDSRFVFRKNFAKYELFK
       ...:   .  :.:::   .: .:: .::::..::    :   ......: . . :: :::
CCDS23 DKSHCGYSLDWSLVETVSELQMERIFEDHENLVENLLNWTRDSQNKLIFMERIEKYALFK
             310       320       330       340       350       360 

            200       210       220       230       240       250  
pF1KB5 SSPHSLFPEKMVSSCLDAHTGISHEDLIQNFLNAGSFPEIQGFLQLRGSGRKLWKRFFCF
       .  . :. .: ..   : .  .  :. . .  .. . :::.: : :. .:.: ::. . .
CCDS23 NPQNYLLGKKETAEMADRNKEVLLEECFCG--SSVTVPEIEGVLWLKDDGKKSWKKRYFL
             370       380       390         400       410         

            260       270       280       290       300       310  
pF1KB5 LRRSGLYYSTKGTSKDPRHLQYVADVNESNVYVVTQGRKLYGMPTDFGFCVKPNKLRNGH
       :: ::.::  :: .:  : :    .... :::   . :. :  :::. . .:  ....  
CCDS23 LRASGIYYVPKGKAKVSRDLVCFLQLDHVNVYYGQDYRNKYKAPTDYCLVLKHPQIQKKS
     420       430       440       450       460       470         

            320       330       340       350          360         
pF1KB5 KGLRIFCSEDEQSRTCWLAAFRLFKYGVQLYKNYQQAQSRHLHP---SCLGSPPLRSASD
       . .. .: .: ..   :. ..:. ::: ::: :::.: .:       . :.:  ..:.:.
CCDS23 QYIKYLCCDDVRTLHQWVNGIRIAKYGKQLYMNYQEALKRTESAYDWTSLSSSSIKSGSS
     480       490       500       510       520       530         

     370       380       390       400       410       420         
pF1KB5 NTLVAMDFSGHAGRVIENPREALSVALEEAQAWRKKTNHRLSLPMPASGTSLSAAIHRTQ
       .. .  . :.:...                                              
CCDS23 SSSIPESQSNHSNQSDSGVSDTQPAGHVRSQSIVSSVFSEAWKRGTQLEESSKARMESMN
     540       550       560       570       580       590         




532 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Sat Nov  5 10:41:32 2016 done: Sat Nov  5 10:41:33 2016
 Total Scan time:  3.310 Total Display time:  0.100

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
Inquiries or Suggestions ?
Send a message to flexiclone AT kazusagt.com