Result of FASTA (ccds) for pF1KB7034
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB7034, 425 aa
  1>>>pF1KB7034     425 - 425 aa - 425 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3031+/-0.00111; mu= 17.2755+/- 0.066
 mean_var=102.3699+/-26.931, 0's: 0 Z-trim(103.9): 313  B-trim: 902 in 2/46
 Lambda= 0.126762
 statistics sampled from 7229 (7638) to 7229 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.592), E-opt: 0.2 (0.235), width:  16
 Scan time:  2.950

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS4032.1 F2R gene_id:2149|Hs108|chr5             ( 425) 2784 520.5 1.2e-147
CCDS4033.1 F2RL1 gene_id:2150|Hs108|chr5           ( 397)  791 156.0 6.1e-38
CCDS14115.1 P2RY8 gene_id:286530|Hs108|chrX        ( 359)  706 140.4 2.7e-33
CCDS14115.1 P2RY8 gene_id:286530|Hs108|chrY        ( 359)  706 140.4 2.7e-33
CCDS4031.1 F2RL2 gene_id:2151|Hs108|chr5           ( 374)  676 134.9 1.3e-31
CCDS58959.1 F2RL2 gene_id:2151|Hs108|chr5          ( 352)  672 134.2   2e-31
CCDS12350.1 F2RL3 gene_id:9002|Hs108|chr19         ( 385)  613 123.4 3.8e-28
CCDS9410.1 LPAR6 gene_id:10161|Hs108|chr13         ( 344)  611 123.0 4.5e-28
CCDS2148.1 GPR17 gene_id:2840|Hs108|chr2           ( 367)  584 118.1 1.4e-26
CCDS14441.1 LPAR4 gene_id:2846|Hs108|chrX          ( 370)  560 113.7   3e-25
CCDS14398.1 P2RY4 gene_id:5030|Hs108|chrX          ( 365)  541 110.2 3.3e-24
CCDS9492.1 GPR183 gene_id:1880|Hs108|chr13         ( 361)  529 108.0 1.5e-23
CCDS9482.1 OXGR1 gene_id:27199|Hs108|chr13         ( 337)  527 107.6 1.9e-23
CCDS8219.1 P2RY2 gene_id:5029|Hs108|chr11          ( 377)  526 107.5 2.3e-23
CCDS3169.1 P2RY1 gene_id:5028|Hs108|chr3           ( 373)  511 104.7 1.5e-22
CCDS9412.1 CYSLTR2 gene_id:57105|Hs108|chr13       ( 346)  501 102.9 5.1e-22
CCDS14439.1 CYSLTR1 gene_id:10800|Hs108|chrX       ( 337)  477 98.5 1.1e-20
CCDS2684.1 CCR8 gene_id:1237|Hs108|chr3            ( 355)  476 98.3 1.2e-20
CCDS3137.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3            ( 359)  475 98.1 1.4e-20
CCDS82855.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3           ( 388)  475 98.2 1.5e-20
CCDS82854.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3           ( 394)  475 98.2 1.5e-20
CCDS12459.1 FFAR3 gene_id:2865|Hs108|chr19         ( 346)  470 97.2 2.6e-20
CCDS14258.1 GPR34 gene_id:2857|Hs108|chrX          ( 381)  462 95.8 7.7e-20
CCDS9879.1 GPR65 gene_id:8477|Hs108|chr14          ( 337)  459 95.2   1e-19
CCDS2738.1 CCR3 gene_id:1232|Hs108|chr3            ( 355)  459 95.2 1.1e-19
CCDS54574.1 CCR3 gene_id:1232|Hs108|chr3           ( 376)  459 95.2 1.1e-19
CCDS2737.1 CCR1 gene_id:1230|Hs108|chr3            ( 355)  458 95.0 1.2e-19
CCDS5298.1 CCR6 gene_id:1235|Hs108|chr6            ( 374)  454 94.3 2.1e-19
CCDS6152.1 OPRK1 gene_id:4986|Hs108|chr8           ( 380)  453 94.1 2.4e-19
CCDS53842.1 HCAR3 gene_id:8843|Hs108|chr12         ( 387)  451 93.8 3.1e-19
CCDS329.1 OPRD1 gene_id:4985|Hs108|chr1            ( 372)  447 93.0   5e-19
CCDS2733.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3           ( 357)  442 92.1 9.3e-19
CCDS2732.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3           ( 369)  442 92.1 9.5e-19
CCDS13556.1 OPRL1 gene_id:4987|Hs108|chr20         ( 370)  440 91.8 1.2e-18
CCDS11691.1 SSTR2 gene_id:6752|Hs108|chr17         ( 369)  438 91.4 1.6e-18
CCDS12461.1 FFAR2 gene_id:2867|Hs108|chr19         ( 330)  437 91.2 1.7e-18
CCDS13944.1 SSTR3 gene_id:6753|Hs108|chr22         ( 418)  435 90.9 2.5e-18
CCDS10429.1 SSTR5 gene_id:6755|Hs108|chr16         ( 364)  434 90.7 2.6e-18
CCDS8402.1 CXCR5 gene_id:643|Hs108|chr11           ( 372)  432 90.3 3.4e-18
CCDS8553.1 LPAR5 gene_id:57121|Hs108|chr12         ( 372)  432 90.3 3.4e-18
CCDS9894.2 GPR68 gene_id:8111|Hs108|chr14          ( 365)  431 90.1 3.8e-18
CCDS9235.1 HCAR2 gene_id:338442|Hs108|chr12        ( 363)  428 89.6 5.5e-18
CCDS43069.1 CX3CR1 gene_id:1524|Hs108|chr3         ( 355)  426 89.2   7e-18
CCDS54571.1 CX3CR1 gene_id:1524|Hs108|chr3         ( 387)  426 89.2 7.4e-18
CCDS55069.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6          ( 389)  425 89.0 8.5e-18
CCDS47508.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6          ( 392)  425 89.0 8.5e-18
CCDS47505.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6          ( 397)  425 89.0 8.6e-18
CCDS55070.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6          ( 400)  425 89.1 8.6e-18
CCDS47506.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6          ( 403)  425 89.1 8.7e-18
CCDS47504.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6          ( 406)  425 89.1 8.7e-18


>>CCDS4032.1 F2R gene_id:2149|Hs108|chr5                  (425 aa)
 initn: 2784 init1: 2784 opt: 2784  Z-score: 2764.1  bits: 520.5 E(32554): 1.2e-147
Smith-Waterman score: 2784; 99.8% identity (100.0% similar) in 425 aa overlap (1-425:1-425)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MGPRRLLLVAACFSLCGPLLSARTRARRPESKATNATLDPRSFLLRNPNDKYEPFWEDEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 MGPRRLLLVAACFSLCGPLLSARTRARRPESKATNATLDPRSFLLRNPNDKYEPFWEDEE
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB7 KNESGLTEYRLVSINKSSPLQKQLPAFISEDASGYLTSSWLTLFVPSVYTGVFVVSLPLN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 KNESGLTEYRLVSINKSSPLQKQLPAFISEDASGYLTSSWLTLFVPSVYTGVFVVSLPLN
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB7 IMAIVVFILKMKVKKPAVVYMLHLATADVLFVSVLPFKISYYFSGSDWQFGSELCRFVTA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 IMAIVVFILKMKVKKPAVVYMLHLATADVLFVSVLPFKISYYFSGSDWQFGSELCRFVTA
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB7 AFYCNMYASILLMTVISIDRFLAVVYPMQSLSWRTLGRASFTCLAIWALAIAGVVPLLLK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 AFYCNMYASILLMTVISIDRFLAVVYPMQSLSWRTLGRASFTCLAIWALAIAGVVPLLLK
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB7 EQTIQVPGLNITTCHDVLNETLLEGYYAYYFSAFSAVFFFVPLIISTVCYVSIIRCLSSS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 EQTIQVPGLNITTCHDVLNETLLEGYYAYYFSAFSAVFFFVPLIISTVCYVSIIRCLSSS
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB7 AVANRSKKSRALFLSAAVFCIFIICFGPTNVLLIVHYSFLSHTSTTEAAYFAYLLCVCVS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::
CCDS40 AVANRSKKSRALFLSAAVFCIFIICFGPTNVLLIAHYSFLSHTSTTEAAYFAYLLCVCVS
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB7 SISCCIDPLIYYYASSECQRYVYSILCCKESSDPSSYNSSGQLMASKMDTCSSNLNNSIY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 SISCCIDPLIYYYASSECQRYVYSILCCKESSDPSSYNSSGQLMASKMDTCSSNLNNSIY
              370       380       390       400       410       420

            
pF1KB7 KKLLT
       :::::
CCDS40 KKLLT
            

>>CCDS4033.1 F2RL1 gene_id:2150|Hs108|chr5                (397 aa)
 initn: 724 init1: 480 opt: 791  Z-score: 794.7  bits: 156.0 E(32554): 6.1e-38
Smith-Waterman score: 791; 40.4% identity (70.4% similar) in 334 aa overlap (88-418:61-389)

        60        70        80        90       100       110       
pF1KB7 DEEKNESGLTEYRLVSINKSSPLQKQLPAFISEDASGYLTSSWLTLFVPSVYTGVFVVSL
                                     ..: ... ::..  :.:.: ::: ::::.:
CCDS40 RSSKGRSLIGKVDGTSHVTGKGVTVETVFSVDEFSASVLTGKLTTVFLPIVYTIVFVVGL
               40        50        60        70        80        90

       120       130       140       150       160       170       
pF1KB7 PLNIMAIVVFILKMKVKKPAVVYMLHLATADVLFVSVLPFKISYYFSGSDWQFGSELCRF
       : : ::. ::... : :.:::.:: .:: ::.: :  .:.::.:.. :..: .:  ::  
CCDS40 PSNGMALWVFLFRTKKKHPAVIYMANLALADLLSVIWFPLKIAYHIHGNNWIYGEALCNV
              100       110       120       130       140       150

       180       190       200       210       220       230       
pF1KB7 VTAAFYCNMYASILLMTVISIDRFLAVVYPMQSLSWRTLGRASFTCLAIWALAIAGVVPL
       . . :: ::: :::.:: .:..:. ..: ::   : .  . :    :::: : .  ..::
CCDS40 LIGFFYGNMYCSILFMTCLSVQRYWVIVNPMGH-SRKKANIAIGISLAIWLLILLVTIPL
              160       170       180        190       200         

       240       250       260        270       280       290      
pF1KB7 LLKEQTIQVPGLNITTCHDVLNETLLEG-YYAYYFSAFSAVFFFVPLIISTVCYVSIIRC
        . .::: .:.:::::::::: : :: : .. :..:   .::.: : ....  :: .:: 
CCDS40 YVVKQTIFIPALNITTCHDVLPEQLLVGDMFNYFLSLAIGVFLF-PAFLTASAYVLMIRM
     210       220       230       240       250        260        

        300         310       320       330       340       350    
pF1KB7 LSSSAVANRS--KKSRALFLSAAVFCIFIICFGPTNVLLIVHYSFLSHTSTTEAAYFAYL
       : :::. . :  :..::. : ..:. ...::: :.:.::.::: :: ...    .:  :.
CCDS40 LRSSAMDENSEKKRKRAIKLIVTVLAMYLICFTPSNLLLVVHY-FLIKSQGQSHVYALYI
      270       280       290       300       310        320       

          360       370       380       390       400       410    
pF1KB7 LCVCVSSISCCIDPLIYYYASSECQRYVYSILCCKESSDPSSYNSSGQLMASKMDTCSSN
       . .:.:... ::::..::..: . . .. . : :.     .... :  : ..: .  ::.
CCDS40 VALCLSTLNSCIDPFVYYFVSHDFRDHAKNALLCRSVRTVKQMQVS--LTSKKHSRKSSS
       330       340       350       360       370         380     

          420      
pF1KB7 LNNSIYKKLLT 
        ..:        
CCDS40 YSSSSTTVKTSY
         390       

>>CCDS14115.1 P2RY8 gene_id:286530|Hs108|chrX             (359 aa)
 initn: 591 init1: 445 opt: 706  Z-score: 711.2  bits: 140.4 E(32554): 2.7e-33
Smith-Waterman score: 706; 35.5% identity (68.4% similar) in 313 aa overlap (83-389:2-311)

             60        70        80        90         100       110
pF1KB7 EPFWEDEEKNESGLTEYRLVSINKSSPLQKQLPAFISEDASG--YLTSSWLTLFVPSVYT
                                     :.:   . : .   .: .  ... .: ::.
CCDS14                              MQVPNSTGPDNATLQMLRNPAIAVALPVVYS
                                            10        20        30 

              120       130       140       150       160       170
pF1KB7 GVFVVSLPLNIMAIVVFILKMKVKKPAVVYMLHLATADVLFVSVLPFKISYYFSGSDWQF
        : .::.: :.... :.  .:  ..:.:..:..:...:....:::::.: :. .   : :
CCDS14 LVAAVSIPGNLFSLWVLCRRMGPRSPSVIFMINLSVTDLMLASVLPFQIYYHCNRHHWVF
              40        50        60        70        80        90 

              180       190       200       210       220       230
pF1KB7 GSELCRFVTAAFYCNMYASILLMTVISIDRFLAVVYPMQSLSWRTLGRASFTCLAIWALA
       :  ::  ::.::: :::.::: :: ::..:::.:.::..:  ::    :  .: . : : 
CCDS14 GVLLCNVVTVAFYANMYSSILTMTCISVERFLGVLYPLSSKRWRRRRYAVAACAGTWLLL
             100       110       120       130       140       150 

              240       250       260          270       280       
pF1KB7 IAGVVPLLLKEQTIQVPGLNITTCHDVLNETLLEG---YYAYYFSAFSAVFFFVPLIIST
       .... ::   . :  : .:.: :: :::. :.: .   . .. :. :  ..:..:..:..
CCDS14 LTALSPLARTDLTYPVHALGIITCFDVLKWTMLPSVAMWAVFLFTIF-ILLFLIPFVITV
             160       170       180       190        200       210

       290        300       310       320       330       340      
pF1KB7 VCYV-SIIRCLSSSAVANRSKKSRALFLSAAVFCIFIICFGPTNVLLIVHYSFLSHTSTT
       .::. .:.. : .  . .: .. ::. :.:.:.  :. ::.:.: .:..:  ..:.    
CCDS14 ACYTATILKLLRTEEAHGREQRRRAVGLAAVVLLAFVTCFAPNNFVLLAH--IVSRLFYG
              220       230       240       250       260          

        350       360       370       380       390       400      
pF1KB7 EAAYFAYLLCVCVSSISCCIDPLIYYYASSECQRYVYSILCCKESSDPSSYNSSGQLMAS
       .. : .: : .:.: .. :.::..::.:: : :  .   : :.                 
CCDS14 KSYYHVYKLTLCLSCLNNCLDPFVYYFASREFQLRLREYLGCRRVPRDTLDTRRESLFSA
      270       280       290       300       310       320        

        410       420                 
pF1KB7 KMDTCSSNLNNSIYKKLLT            
                                      
CCDS14 RTTSVRSEAGAHPEGMEGATRPGLQRQESVF
      330       340       350         

>>CCDS14115.1 P2RY8 gene_id:286530|Hs108|chrY             (359 aa)
 initn: 591 init1: 445 opt: 706  Z-score: 711.2  bits: 140.4 E(32554): 2.7e-33
Smith-Waterman score: 706; 35.5% identity (68.4% similar) in 313 aa overlap (83-389:2-311)

             60        70        80        90         100       110
pF1KB7 EPFWEDEEKNESGLTEYRLVSINKSSPLQKQLPAFISEDASG--YLTSSWLTLFVPSVYT
                                     :.:   . : .   .: .  ... .: ::.
CCDS14                              MQVPNSTGPDNATLQMLRNPAIAVALPVVYS
                                            10        20        30 

              120       130       140       150       160       170
pF1KB7 GVFVVSLPLNIMAIVVFILKMKVKKPAVVYMLHLATADVLFVSVLPFKISYYFSGSDWQF
        : .::.: :.... :.  .:  ..:.:..:..:...:....:::::.: :. .   : :
CCDS14 LVAAVSIPGNLFSLWVLCRRMGPRSPSVIFMINLSVTDLMLASVLPFQIYYHCNRHHWVF
              40        50        60        70        80        90 

              180       190       200       210       220       230
pF1KB7 GSELCRFVTAAFYCNMYASILLMTVISIDRFLAVVYPMQSLSWRTLGRASFTCLAIWALA
       :  ::  ::.::: :::.::: :: ::..:::.:.::..:  ::    :  .: . : : 
CCDS14 GVLLCNVVTVAFYANMYSSILTMTCISVERFLGVLYPLSSKRWRRRRYAVAACAGTWLLL
             100       110       120       130       140       150 

              240       250       260          270       280       
pF1KB7 IAGVVPLLLKEQTIQVPGLNITTCHDVLNETLLEG---YYAYYFSAFSAVFFFVPLIIST
       .... ::   . :  : .:.: :: :::. :.: .   . .. :. :  ..:..:..:..
CCDS14 LTALSPLARTDLTYPVHALGIITCFDVLKWTMLPSVAMWAVFLFTIF-ILLFLIPFVITV
             160       170       180       190        200       210

       290        300       310       320       330       340      
pF1KB7 VCYV-SIIRCLSSSAVANRSKKSRALFLSAAVFCIFIICFGPTNVLLIVHYSFLSHTSTT
       .::. .:.. : .  . .: .. ::. :.:.:.  :. ::.:.: .:..:  ..:.    
CCDS14 ACYTATILKLLRTEEAHGREQRRRAVGLAAVVLLAFVTCFAPNNFVLLAH--IVSRLFYG
              220       230       240       250       260          

        350       360       370       380       390       400      
pF1KB7 EAAYFAYLLCVCVSSISCCIDPLIYYYASSECQRYVYSILCCKESSDPSSYNSSGQLMAS
       .. : .: : .:.: .. :.::..::.:: : :  .   : :.                 
CCDS14 KSYYHVYKLTLCLSCLNNCLDPFVYYFASREFQLRLREYLGCRRVPRDTLDTRRESLFSA
      270       280       290       300       310       320        

        410       420                 
pF1KB7 KMDTCSSNLNNSIYKKLLT            
                                      
CCDS14 RTTSVRSEAGAHPEGMEGATRPGLQRQESVF
      330       340       350         

>>CCDS4031.1 F2RL2 gene_id:2151|Hs108|chr5                (374 aa)
 initn: 668 init1: 334 opt: 676  Z-score: 681.3  bits: 134.9 E(32554): 1.3e-31
Smith-Waterman score: 676; 32.1% identity (65.0% similar) in 377 aa overlap (4-375:2-362)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MGPRRLLLVAACFSLCGPLLSARTRARRPESKATNATLDPRSFLLRNPNDKYEPFWEDEE
          . :...:: . :  : .  ..  .   .. .. ::  ..:    ::. .: :  .  
CCDS40   MKALIFAAAGLLLLLPTFC-QSGMENDTNNLAKPTLPIKTFRGAPPNS-FEEFPFSAL
                 10         20        30        40         50      

               70        80        90       100       110       120
pF1KB7 KNESGLTEYRLVSINKSSPLQKQLPAFISEDASGYLTSSWLTLFVPSVYTGVFVVSLPLN
       .. .: :    .... . : ..     ... . ::::::  : ..:..:  ::::..: :
CCDS40 EGWTGAT----ITVKIKCPEESASHLHVKNATMGYLTSSLSTKLIPAIYLLVFVVGVPAN
         60            70        80        90       100       110  

              130        140       150       160       170         
pF1KB7 IMAIVVFILKMKVKKP-AVVYMLHLATADVLFVSVLPFKISYYFSGSDWQFGSELCRFVT
         :.....: .....  ..:.. .:: :: ::  .:::::.:...:..: ::  ::: .:
CCDS40 --AVTLWMLFFRTRSICTTVFYTNLAIADFLFCVTLPFKIAYHLNGNNWVFGEVLCRATT
              120       130       140       150       160       170

     180       190       200       210       220          230      
pF1KB7 AAFYCNMYASILLMTVISIDRFLAVVYPMQSLSWRTLGRASF---TCLAIWALAIAGVVP
       . :: ::: ::::.. :::.:.::.:.:   ...: : . ..   ::  .:: ..  ..:
CCDS40 VIFYGNMYCSILLLACISINRYLAIVHP---FTYRGLPKHTYALVTCGLVWATVFLYMLP
              180       190          200       210       220       

        240       250       260        270       280       290     
pF1KB7 LLLKEQTIQVPGLNITTCHDVLNETLLEG-YYAYYFSAFSAVFFFVPLIISTVCYVSIIR
       ... .:   .   .::::::: :     . .  ::: ...   :..:...   ::..:::
CCDS40 FFILKQEYYLVQPDITTCHDVHNTCESSSPFQLYYFISLAFFGFLIPFVLIIYCYAAIIR
       230       240       250       260       270       280       

         300       310       320       330       340       350     
pF1KB7 CLSSSAVANRSKKSRALFLSAAVFCIFIICFGPTNVLLIVHYSFLSHTSTTEAAYFAYLL
        :.    :   .    .  :  .. :: :::.:.:..::.:..   ...: .. :: ::.
CCDS40 TLN----AYDHRWLWYVKASLLILVIFTICFAPSNIILIIHHANYYYNNT-DGLYFIYLI
       290           300       310       320       330        340  

         360       370       380       390       400       410     
pF1KB7 CVCVSSISCCIDPLIYYYASSECQRYVYSILCCKESSDPSSYNSSGQLMASKMDTCSSNL
        .:..:.. :.::..:.  :                                        
CCDS40 ALCLGSLNSCLDPFLYFLMSKTRNHSTAYLTK                            
            350       360       370                                

>>CCDS58959.1 F2RL2 gene_id:2151|Hs108|chr5               (352 aa)
 initn: 668 init1: 334 opt: 672  Z-score: 677.7  bits: 134.2 E(32554): 2e-31
Smith-Waterman score: 672; 33.7% identity (66.0% similar) in 344 aa overlap (37-375:12-340)

         10        20        30        40        50        60      
pF1KB7 LLVAACFSLCGPLLSARTRARRPESKATNATLDPRSFLLRNPNDKYEPFWEDEEKNESGL
                                     ::  ..:    ::. .: :  .  .. .: 
CCDS58                    MENDTNNLAKPTLPIKTFRGAPPNS-FEEFPFSALEGWTGA
                                  10        20         30        40

         70        80        90       100       110       120      
pF1KB7 TEYRLVSINKSSPLQKQLPAFISEDASGYLTSSWLTLFVPSVYTGVFVVSLPLNIMAIVV
       :    .... . : ..     ... . ::::::  : ..:..:  ::::..: :  :...
CCDS58 T----ITVKIKCPEESASHLHVKNATMGYLTSSLSTKLIPAIYLLVFVVGVPAN--AVTL
                   50        60        70        80        90      

        130        140       150       160       170       180     
pF1KB7 FILKMKVKKP-AVVYMLHLATADVLFVSVLPFKISYYFSGSDWQFGSELCRFVTAAFYCN
       ..: .....  ..:.. .:: :: ::  .:::::.:...:..: ::  ::: .:. :: :
CCDS58 WMLFFRTRSICTTVFYTNLAIADFLFCVTLPFKIAYHLNGNNWVFGEVLCRATTVIFYGN
          100       110       120       130       140       150    

         190       200       210       220          230       240  
pF1KB7 MYASILLMTVISIDRFLAVVYPMQSLSWRTLGRASF---TCLAIWALAIAGVVPLLLKEQ
       :: ::::.. :::.:.::.:.:   ...: : . ..   ::  .:: ..  ..:... .:
CCDS58 MYCSILLLACISINRYLAIVHP---FTYRGLPKHTYALVTCGLVWATVFLYMLPFFILKQ
          160       170          180       190       200       210 

            250       260        270       280       290       300 
pF1KB7 TIQVPGLNITTCHDVLNETLLEG-YYAYYFSAFSAVFFFVPLIISTVCYVSIIRCLSSSA
          .   .::::::: :     . .  ::: ...   :..:...   ::..::: :.   
CCDS58 EYYLVQPDITTCHDVHNTCESSSPFQLYYFISLAFFGFLIPFVLIIYCYAAIIRTLN---
             220       230       240       250       260           

             310       320       330       340       350       360 
pF1KB7 VANRSKKSRALFLSAAVFCIFIICFGPTNVLLIVHYSFLSHTSTTEAAYFAYLLCVCVSS
        :   .    .  :  .. :: :::.:.:..::.:..   ...: .. :: ::. .:..:
CCDS58 -AYDHRWLWYVKASLLILVIFTICFAPSNIILIIHHANYYYNNT-DGLYFIYLIALCLGS
       270       280       290       300       310        320      

             370       380       390       400       410       420 
pF1KB7 ISCCIDPLIYYYASSECQRYVYSILCCKESSDPSSYNSSGQLMASKMDTCSSNLNNSIYK
       .. :.::..:.  :                                              
CCDS58 LNSCLDPFLYFLMSKTRNHSTAYLTK                                  
        330       340       350                                    

>>CCDS12350.1 F2RL3 gene_id:9002|Hs108|chr19              (385 aa)
 initn: 548 init1: 368 opt: 613  Z-score: 618.9  bits: 123.4 E(32554): 3.8e-28
Smith-Waterman score: 613; 33.3% identity (64.9% similar) in 345 aa overlap (72-415:53-384)

              50        60        70        80        90       100 
pF1KB7 SFLLRNPNDKYEPFWEDEEKNESGLTEYRLVSINKSSPLQKQLPAFISEDASGYLTSSWL
                                     :  : :. :.  ::     :.:  :  .:.
CCDS12 PSVYDESGSTGGGDDSTPSILPAPRGYPGQVCANDSDTLE--LP-----DSSRALLLGWV
             30        40        50        60               70     

              110       120       130       140       150       160
pF1KB7 -TLFVPSVYTGVFVVSLPLNIMAIVVFILKMKVKKPAVVYMLHLATADVLFVSVLPFKIS
        : .::..:  :.::.:: : .:. :.  .   . :... ...::.::.:.. .:: .:.
CCDS12 PTRLVPALYGLVLVVGLPANGLALWVLATQAP-RLPSTMLLMNLAAADLLLALALPPRIA
          80        90       100        110       120       130    

              170       180       190       200       210       220
pF1KB7 YYFSGSDWQFGSELCRFVTAAFYCNMYASILLMTVISIDRFLAVVYPMQSLSWRTLGRAS
       :.. :. : ::   ::..:::.: .::.:.::....:.::.::.:.:... . :    : 
CCDS12 YHLRGQRWPFGEAACRLATAALYGHMYGSVLLLAAVSLDRYLALVHPLRARALRGRRLAL
          140       150       160       170       180       190    

              230       240       250       260       270       280
pF1KB7 FTCLAIWALAIAGVVPLLLKEQTIQVPGLNITTCHDVLNETLLEGYYAYYFSAFSAVFFF
         :.: : .: : ..:: :..::...   . . :::.:      ...   :. .. .  :
CCDS12 GLCMAAWLMAAALALPLTLQRQTFRLARSDRVLCHDALPLDAQASHWQPAFTCLALLGCF
          200       210       220       230       240       250    

              290       300       310       320       330       340
pF1KB7 VPLIISTVCYVSIIRCLSSSAVANRSKKSRALFLSAAVFCIFIICFGPTNVLLIVHYSFL
       .::.   .:: . .. :..:.     . ..:: :.:.:.   .  : :.:.::..:::  
CCDS12 LPLLAMLLCYGATLHTLAASG----RRYGHALRLTAVVLASAVAFFVPSNLLLLLHYSDP
          260       270           280       290       300       310

              350       360       370       380       390       400
pF1KB7 SHTSTTEAAYFAYLLCVCVSSISCCIDPLIYYYASSECQRYVYSILCCKESSDPSSYNSS
       :  :.    : ::.  . .:... :.::.::::.:.: .  : . :  .  .:  . ..:
CCDS12 S-PSAWGNLYGAYVPSLALSTLNSCVDPFIYYYVSAEFRDKVRAGLFQRSPGDTVASKAS
               320       330       340       350       360         

              410       420     
pF1KB7 GQLMASKMDTCSSNLNNSIYKKLLT
       ..  .  : : :: :          
CCDS12 AEGGSRGMGTHSSLLQ         
     370       380              

>>CCDS9410.1 LPAR6 gene_id:10161|Hs108|chr13              (344 aa)
 initn: 470 init1: 361 opt: 611  Z-score: 617.5  bits: 123.0 E(32554): 4.5e-28
Smith-Waterman score: 611; 34.8% identity (68.1% similar) in 282 aa overlap (108-382:23-302)

        80        90       100       110       120       130       
pF1KB7 SPLQKQLPAFISEDASGYLTSSWLTLFVPSVYTGVFVVSLPLNIMAIVVFILKMKVKKPA
                                     ... :::..:  : .:: .::  .::.. .
CCDS94         MVSVNSSHCFYNDSFKYTLYGCMFSMVFVLGLISNCVAIYIFICVLKVRNET
                       10        20        30        40        50  

       140       150       160       170       180       190       
pF1KB7 VVYMLHLATADVLFVSVLPFKISYYFSGSDWQFGSELCRFVTAAFYCNMYASILLMTVIS
       ..::..:: .:.::: .:::.: .::.  .: ::. ::.. .  :: :::.:::..: ::
CCDS94 TTYMINLAMSDLLFVFTLPFRI-FYFTTRNWPFGDLLCKISVMLFYTNMYGSILFLTCIS
             60        70         80        90       100       110 

       200       210       220       230       240       250       
pF1KB7 IDRFLAVVYPMQSLSWRTLGRASFTCLAIWALAIAGVVPLLLKEQTIQVPGLNIT-TCHD
       .:::::.:::..: . ::   :...: ..:  .:.: .: ..  :. .  : : . .: .
CCDS94 VDRFLAIVYPFKSKTLRTKRNAKIVCTGVWLTVIGGSAPAVFV-QSTHSQGNNASEACFE
             120       130       140       150        160       170

        260       270       280       290       300         310    
pF1KB7 VLNETLLEGYYAYYFSAFSAVFFFVPLIISTVCYVSIIRCLSSSAVANRSK--KSRALFL
        . :.  . : .     .  : ::.:::....:   ... :.. .. .:::  :...: .
CCDS94 NFPEATWKTYLSRIVIFIEIVGFFIPLILNVTCSSMVLKTLTKPVTLSRSKINKTKVLKM
              180       190       200       210       220       230

          320       330       340           350       360       370
pF1KB7 SAAVFCIFIICFGPTNVLLIVHYSFLSHT----STTEAAYFAYLLCVCVSSISCCIDPLI
         . . :: .:: : :. ::..    ..:    :.. :.   : . .:..  .::.::..
CCDS94 IFVHLIIFCFCFVPYNINLILYSLVRTQTFVNCSVVAAVRTMYPITLCIAVSNCCFDPIV
              240       250       260       270       280       290

              380       390       400       410       420     
pF1KB7 YYYASSECQRYVYSILCCKESSDPSSYNSSGQLMASKMDTCSSNLNNSIYKKLLT
       ::..:.  :  .                                           
CCDS94 YYFTSDTIQNSIKMKNWSVRRSDFRFSEVHGAENFIQHNLQTLKSKIFDNESAA 
              300       310       320       330       340     

>>CCDS2148.1 GPR17 gene_id:2840|Hs108|chr2                (367 aa)
 initn: 530 init1: 359 opt: 584  Z-score: 590.5  bits: 118.1 E(32554): 1.4e-26
Smith-Waterman score: 584; 32.7% identity (63.8% similar) in 315 aa overlap (103-412:60-365)

             80        90       100       110       120       130  
pF1KB7 SINKSSPLQKQLPAFISEDASGYLTSSWLTLFVPSVYTGVFVVSLPLNIMAIVVFILKMK
                                     ..  : :   :...:  : .:. .::   :
CCDS21 NGLEVAPPGLITNFSLATAEQCGQETPLENMLFASFYLLDFILALVGNTLALWLFIRDHK
      30        40        50        60        70        80         

            140       150       160       170       180       190  
pF1KB7 VKKPAVVYMLHLATADVLFVSVLPFKISYYFSGSDWQFGSELCRFVTAAFYCNMYASILL
          :: :...:::.::.  : ::: .. :.:::. : ::   ::..   :: :::::: .
CCDS21 SGTPANVFLMHLAVADLSCVLVLPTRLVYHFSGNHWPFGEIACRLTGFLFYLNMYASIYF
      90       100       110       120       130       140         

            200       210       220       230       240       250  
pF1KB7 MTVISIDRFLAVVYPMQSLSWRTLGRASFTCLAIWALAIAGVVPLLLKEQTIQVPGLNIT
       .: :: :::::.:.:..::. :    : ..:  .:... ....:::.. ::.:       
CCDS21 LTCISADRFLAIVHPVKSLKLRRPLYAHLACAFLWVVVAVAMAPLLVSPQTVQ-------
     150       160       170       180       190       200         

            260       270       280       290       300       310  
pF1KB7 TCHDVLNETLLEGYYAYYFSAFSAVFFFVPLIISTVCYVSIIRCLSSSAVANRSKKSRAL
       : : :.   : .   ...  .  :: :  :.: ...::. ::: : ..  ...  :..:.
CCDS21 TNHTVVCLQLYREKASHHALVSLAVAFTFPFITTVTCYLLIIRSLRQGLRVEKRLKTKAV
            210       220       230       240       250       260  

            320       330           340       350       360        
pF1KB7 FLSAAVFCIFIICFGPTNV---LLIVHY-SFLSHTSTTEAAYFAYLLCVCVSSISCCIDP
        . : :. ::..:: : .:   . ..:: :  .  .: .   .:  .  :..:..  .::
CCDS21 RMIAIVLAIFLVCFVPYHVNRSVYVLHYRSHGASCATQRILALANRITSCLTSLNGALDP
            270       280       290       300       310       320  

      370       380       390        400       410       420     
pF1KB7 LIYYYASSECQRYVYSILCCKE-SSDPSSYNSSGQLMASKMDTCSSNLNNSIYKKLLT
       ..:.... . .. . ..:: :. .. : :..  :.   :.... :             
CCDS21 IMYFFVAEKFRHALCNLLCGKRLKGPPPSFE--GKTNESSLSAKSEL           
            330       340       350         360                  

>>CCDS14441.1 LPAR4 gene_id:2846|Hs108|chrX               (370 aa)
 initn: 475 init1: 222 opt: 560  Z-score: 566.7  bits: 113.7 E(32554): 3e-25
Smith-Waterman score: 560; 31.7% identity (68.7% similar) in 284 aa overlap (107-383:44-323)

         80        90       100       110       120       130      
pF1KB7 SSPLQKQLPAFISEDASGYLTSSWLTLFVPSVYTGVFVVSLPLNIMAIVVFILKMKVKKP
                                     .::. ::...:  : ... :: ..::... 
CCDS14 SNSSLRPRLGNATANNTCIVDDSFKYNLNGAVYSVVFILGLITNSVSLFVFCFRMKMRSE
            20        30        40        50        60        70   

        140       150       160       170       180       190      
pF1KB7 AVVYMLHLATADVLFVSVLPFKISYYFSGSDWQFGSELCRFVTAAFYCNMYASILLMTVI
       ..... .::..:.::: .::::: : :.   : ::. ::..  .::  :.:.:.:..: :
CCDS14 TAIFITNLAVSDLLFVCTLPFKIFYNFN-RHWPFGDTLCKISGTAFLTNIYGSMLFLTCI
            80        90       100        110       120       130  

        200       210       220       230       240       250      
pF1KB7 SIDRFLAVVYPMQSLSWRTLGRASFTCLAIWALAIAGVVPLLLKEQTIQVPGLNITTCHD
       :.:::::.:::..: . ::   ....: ..: :...: .   :  .: .: . . ::: .
CCDS14 SVDRFLAIVYPFRSRTIRTRRNSAIVCAGVWILVLSGGISASL-FSTTNVNNAT-TTCFE
            140       150       160       170        180        190

        260       270       280       290       300         310    
pF1KB7 VLNETLLEGYYAYYFSAFSAVFFFVPLIISTVCYVSIIRCLSSSAVANR--SKKSRALFL
        ... . . : .     . .: :..:::... :   ..: : . :. ..  ..:...: .
CCDS14 GFSKRVWKTYLSKITIFIEVVGFIIPLILNVSCSSVVLRTLRKPATLSQIGTNKKKVLKM
              200       210       220       230       240       250

          320       330       340            350       360         
pF1KB7 SAAVFCIFIICFGPTNVLLIVHYSFLSHTSTTEA-----AYFAYLLCVCVSSISCCIDPL
        .. . .:..:: : : .:.. :...   . :.      : . : . .:.....::.::.
CCDS14 ITVHMAVFVVCFVPYNSVLFL-YALVRSQAITNCFLERFAKIMYPITLCLATLNCCFDPF
              260       270        280       290       300         

     370       380       390       400       410       420         
pF1KB7 IYYYASSECQRYVYSILCCKESSDPSSYNSSGQLMASKMDTCSSNLNNSIYKKLLT    
       :::..    :.  :                                              
CCDS14 IYYFTLESFQKSFYINAHIRMESLFKTETPLTTKPSLPAIQEEVSDQTTNNGGELMLEST
     310       320       330       340       350       360         




425 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Fri Nov 11 16:59:03 2016 done: Fri Nov 11 16:59:03 2016
 Total Scan time:  2.950 Total Display time:  0.060

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
Inquiries or Suggestions ?
Send a message to flexiclone AT kazusagt.com