Result of FASTA (ccds) for pF1KB8538
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB8538, 898 aa
  1>>>pF1KB8538 898 - 898 aa - 898 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.4623+/-0.00114; mu= 15.7663+/- 0.069
 mean_var=101.3714+/-19.731, 0's: 0 Z-trim(104.0): 27  B-trim: 0 in 0/52
 Lambda= 0.127385
 statistics sampled from 7672 (7688) to 7672 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.587), E-opt: 0.2 (0.236), width:  16
 Scan time:  3.390

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS43329.1 TNPO1 gene_id:3842|Hs108|chr5          ( 898) 6065 1126.2       0
CCDS4016.1 TNPO1 gene_id:3842|Hs108|chr5           ( 890) 6005 1115.1       0
CCDS45992.1 TNPO2 gene_id:30000|Hs108|chr19        ( 887) 5240 974.6       0
CCDS45991.1 TNPO2 gene_id:30000|Hs108|chr19        ( 897) 4491 836.9       0
CCDS62228.1 KPNB1 gene_id:3837|Hs108|chr17         ( 731)  310 68.5 5.2e-11
CCDS11513.1 KPNB1 gene_id:3837|Hs108|chr17         ( 876)  310 68.5   6e-11


>>CCDS43329.1 TNPO1 gene_id:3842|Hs108|chr5               (898 aa)
 initn: 6065 init1: 6065 opt: 6065  Z-score: 6025.8  bits: 1126.2 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 6065; 100.0% identity (100.0% similar) in 898 aa overlap (1-898:1-898)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MVWDRQTKMEYEWKPDEQGLQQILQLLKESQSPDTTIQRTVQQKLEQLNQYPDFNNYLIF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 MVWDRQTKMEYEWKPDEQGLQQILQLLKESQSPDTTIQRTVQQKLEQLNQYPDFNNYLIF
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB8 VLTKLKSEDEPTRSLSGLILKNNVKAHFQNFPNGVTDFIKSECLNNIGDSSPLIRATVGI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 VLTKLKSEDEPTRSLSGLILKNNVKAHFQNFPNGVTDFIKSECLNNIGDSSPLIRATVGI
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB8 LITTIASKGELQNWPDLLPKLCSLLDSEDYNTCEGAFGALQKICEDSAEILDSDVLDRPL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LITTIASKGELQNWPDLLPKLCSLLDSEDYNTCEGAFGALQKICEDSAEILDSDVLDRPL
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB8 NIMIPKFLQFFKHSSPKIRSHAVACVNQFIISRTQALMLHIDSFIENLFALAGDEEPEVR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 NIMIPKFLQFFKHSSPKIRSHAVACVNQFIISRTQALMLHIDSFIENLFALAGDEEPEVR
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB8 KNVCRALVMLLEVRMDRLLPHMHNIVEYMLQRTQDQDENVALEACEFWLTLAEQPICKDV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 KNVCRALVMLLEVRMDRLLPHMHNIVEYMLQRTQDQDENVALEACEFWLTLAEQPICKDV
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB8 LVRHLPKLIPVLVNGMKYSDIDIILLKGDVEEDETIPDSEQDIRPRFHRSRTVAQQHDED
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LVRHLPKLIPVLVNGMKYSDIDIILLKGDVEEDETIPDSEQDIRPRFHRSRTVAQQHDED
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB8 GIEEEDDDDDEIDDDDTISDWNLRKCSAAALDVLANVYRDELLPHILPLLKELLFHHEWV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 GIEEEDDDDDEIDDDDTISDWNLRKCSAAALDVLANVYRDELLPHILPLLKELLFHHEWV
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB8 VKESGILVLGAIAEGCMQGMIPYLPELIPHLIQCLSDKKALVRSITCWTLSRYAHWVVSQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 VKESGILVLGAIAEGCMQGMIPYLPELIPHLIQCLSDKKALVRSITCWTLSRYAHWVVSQ
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB8 PPDTYLKPLMTELLKRILDSNKRVQEAACSAFATLEEEACTELVPYLAYILDTLVFAFSK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 PPDTYLKPLMTELLKRILDSNKRVQEAACSAFATLEEEACTELVPYLAYILDTLVFAFSK
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB8 YQHKNLLILYDAIGTLADSVGHHLNKPEYIQMLMPPLIQKWNMLKDEDKDLFPLLECLSS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 YQHKNLLILYDAIGTLADSVGHHLNKPEYIQMLMPPLIQKWNMLKDEDKDLFPLLECLSS
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB8 VATALQSGFLPYCEPVYQRCVNLVQKTLAQAMLNNAQPDQYEAPDKDFMIVALDLLSGLA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 VATALQSGFLPYCEPVYQRCVNLVQKTLAQAMLNNAQPDQYEAPDKDFMIVALDLLSGLA
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB8 EGLGGNIEQLVARSNILTLMYQCMQDKMPEVRQSSFALLGDLTKACFQHVKPCIADFMPI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 EGLGGNIEQLVARSNILTLMYQCMQDKMPEVRQSSFALLGDLTKACFQHVKPCIADFMPI
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KB8 LGTNLNPEFISVCNNATWAIGEISIQMGIEMQPYIPMVLHQLVEIINRPNTPKTLLENTA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LGTNLNPEFISVCNNATWAIGEISIQMGIEMQPYIPMVLHQLVEIINRPNTPKTLLENTA
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KB8 ITIGRLGYVCPQEVAPMLQQFIRPWCTSLRNIRDNEEKDSAFRGICTMISVNPSGVIQDF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 ITIGRLGYVCPQEVAPMLQQFIRPWCTSLRNIRDNEEKDSAFRGICTMISVNPSGVIQDF
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890        
pF1KB8 IFFCDAVASWINPKDDLRDMFCKILHGFKNQVGDENWRRFSDQFPLPLKERLAAFYGV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 IFFCDAVASWINPKDDLRDMFCKILHGFKNQVGDENWRRFSDQFPLPLKERLAAFYGV
              850       860       870       880       890        

>>CCDS4016.1 TNPO1 gene_id:3842|Hs108|chr5                (890 aa)
 initn: 6005 init1: 6005 opt: 6005  Z-score: 5966.2  bits: 1115.1 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 6005; 100.0% identity (100.0% similar) in 890 aa overlap (9-898:1-890)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MVWDRQTKMEYEWKPDEQGLQQILQLLKESQSPDTTIQRTVQQKLEQLNQYPDFNNYLIF
               ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40         MEYEWKPDEQGLQQILQLLKESQSPDTTIQRTVQQKLEQLNQYPDFNNYLIF
                       10        20        30        40        50  

               70        80        90       100       110       120
pF1KB8 VLTKLKSEDEPTRSLSGLILKNNVKAHFQNFPNGVTDFIKSECLNNIGDSSPLIRATVGI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 VLTKLKSEDEPTRSLSGLILKNNVKAHFQNFPNGVTDFIKSECLNNIGDSSPLIRATVGI
             60        70        80        90       100       110  

              130       140       150       160       170       180
pF1KB8 LITTIASKGELQNWPDLLPKLCSLLDSEDYNTCEGAFGALQKICEDSAEILDSDVLDRPL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 LITTIASKGELQNWPDLLPKLCSLLDSEDYNTCEGAFGALQKICEDSAEILDSDVLDRPL
            120       130       140       150       160       170  

              190       200       210       220       230       240
pF1KB8 NIMIPKFLQFFKHSSPKIRSHAVACVNQFIISRTQALMLHIDSFIENLFALAGDEEPEVR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 NIMIPKFLQFFKHSSPKIRSHAVACVNQFIISRTQALMLHIDSFIENLFALAGDEEPEVR
            180       190       200       210       220       230  

              250       260       270       280       290       300
pF1KB8 KNVCRALVMLLEVRMDRLLPHMHNIVEYMLQRTQDQDENVALEACEFWLTLAEQPICKDV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 KNVCRALVMLLEVRMDRLLPHMHNIVEYMLQRTQDQDENVALEACEFWLTLAEQPICKDV
            240       250       260       270       280       290  

              310       320       330       340       350       360
pF1KB8 LVRHLPKLIPVLVNGMKYSDIDIILLKGDVEEDETIPDSEQDIRPRFHRSRTVAQQHDED
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 LVRHLPKLIPVLVNGMKYSDIDIILLKGDVEEDETIPDSEQDIRPRFHRSRTVAQQHDED
            300       310       320       330       340       350  

              370       380       390       400       410       420
pF1KB8 GIEEEDDDDDEIDDDDTISDWNLRKCSAAALDVLANVYRDELLPHILPLLKELLFHHEWV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 GIEEEDDDDDEIDDDDTISDWNLRKCSAAALDVLANVYRDELLPHILPLLKELLFHHEWV
            360       370       380       390       400       410  

              430       440       450       460       470       480
pF1KB8 VKESGILVLGAIAEGCMQGMIPYLPELIPHLIQCLSDKKALVRSITCWTLSRYAHWVVSQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 VKESGILVLGAIAEGCMQGMIPYLPELIPHLIQCLSDKKALVRSITCWTLSRYAHWVVSQ
            420       430       440       450       460       470  

              490       500       510       520       530       540
pF1KB8 PPDTYLKPLMTELLKRILDSNKRVQEAACSAFATLEEEACTELVPYLAYILDTLVFAFSK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 PPDTYLKPLMTELLKRILDSNKRVQEAACSAFATLEEEACTELVPYLAYILDTLVFAFSK
            480       490       500       510       520       530  

              550       560       570       580       590       600
pF1KB8 YQHKNLLILYDAIGTLADSVGHHLNKPEYIQMLMPPLIQKWNMLKDEDKDLFPLLECLSS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 YQHKNLLILYDAIGTLADSVGHHLNKPEYIQMLMPPLIQKWNMLKDEDKDLFPLLECLSS
            540       550       560       570       580       590  

              610       620       630       640       650       660
pF1KB8 VATALQSGFLPYCEPVYQRCVNLVQKTLAQAMLNNAQPDQYEAPDKDFMIVALDLLSGLA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 VATALQSGFLPYCEPVYQRCVNLVQKTLAQAMLNNAQPDQYEAPDKDFMIVALDLLSGLA
            600       610       620       630       640       650  

              670       680       690       700       710       720
pF1KB8 EGLGGNIEQLVARSNILTLMYQCMQDKMPEVRQSSFALLGDLTKACFQHVKPCIADFMPI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 EGLGGNIEQLVARSNILTLMYQCMQDKMPEVRQSSFALLGDLTKACFQHVKPCIADFMPI
            660       670       680       690       700       710  

              730       740       750       760       770       780
pF1KB8 LGTNLNPEFISVCNNATWAIGEISIQMGIEMQPYIPMVLHQLVEIINRPNTPKTLLENTA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 LGTNLNPEFISVCNNATWAIGEISIQMGIEMQPYIPMVLHQLVEIINRPNTPKTLLENTA
            720       730       740       750       760       770  

              790       800       810       820       830       840
pF1KB8 ITIGRLGYVCPQEVAPMLQQFIRPWCTSLRNIRDNEEKDSAFRGICTMISVNPSGVIQDF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 ITIGRLGYVCPQEVAPMLQQFIRPWCTSLRNIRDNEEKDSAFRGICTMISVNPSGVIQDF
            780       790       800       810       820       830  

              850       860       870       880       890        
pF1KB8 IFFCDAVASWINPKDDLRDMFCKILHGFKNQVGDENWRRFSDQFPLPLKERLAAFYGV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 IFFCDAVASWINPKDDLRDMFCKILHGFKNQVGDENWRRFSDQFPLPLKERLAAFYGV
            840       850       860       870       880       890

>>CCDS45992.1 TNPO2 gene_id:30000|Hs108|chr19             (887 aa)
 initn: 3274 init1: 3274 opt: 5240  Z-score: 5206.5  bits: 974.6 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 5240; 85.5% identity (95.7% similar) in 890 aa overlap (12-898:2-887)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MVWDRQTKMEYEWKPDEQGLQQILQLLKESQSPDTTIQRTVQQKLEQLNQYPDFNNYLIF
                  .:.::::::::.:::::.::::.:. :: ::.::.::::.:::::::::
CCDS45           MDWQPDEQGLQQVLQLLKDSQSPNTATQRIVQDKLKQLNQFPDFNNYLIF
                         10        20        30        40        50

               70        80        90       100       110       120
pF1KB8 VLTKLKSEDEPTRSLSGLILKNNVKAHFQNFPNGVTDFIKSECLNNIGDSSPLIRATVGI
       :::.:::::::::::::::::::::::.:.::  :.::::.::::::::.: :::::.::
CCDS45 VLTRLKSEDEPTRSLSGLILKNNVKAHYQSFPPPVADFIKQECLNNIGDASSLIRATIGI
               60        70        80        90       100       110

              130       140       150       160       170       180
pF1KB8 LITTIASKGELQNWPDLLPKLCSLLDSEDYNTCEGAFGALQKICEDSAEILDSDVLDRPL
       :::::::::::: ::.:::.::.::.:::::::::::::::::::::.:.::::.:.:::
CCDS45 LITTIASKGELQMWPELLPQLCNLLNSEDYNTCEGAFGALQKICEDSSELLDSDALNRPL
              120       130       140       150       160       170

              190       200       210       220       230       240
pF1KB8 NIMIPKFLQFFKHSSPKIRSHAVACVNQFIISRTQALMLHIDSFIENLFALAGDEEPEVR
       ::::::::::::: ::::::::.:::::::..:.:::: .::.:::.::::: :..::::
CCDS45 NIMIPKFLQFFKHCSPKIRSHAIACVNQFIMDRAQALMDNIDTFIEHLFALAVDDDPEVR
              180       190       200       210       220       230

              250       260       270       280       290       300
pF1KB8 KNVCRALVMLLEVRMDRLLPHMHNIVEYMLQRTQDQDENVALEACEFWLTLAEQPICKDV
       ::::::::::::::.:::.::::.:..::::::::.::::::::::::::::::::::.:
CCDS45 KNVCRALVMLLEVRIDRLIPHMHSIIQYMLQRTQDHDENVALEACEFWLTLAEQPICKEV
              240       250       260       270       280       290

              310       320       330       340       350          
pF1KB8 LVRHLPKLIPVLVNGMKYSDIDIILLKGDVEEDETIPDSEQDIRPRFHRSRTVAQQHDE-
       :. :: .:::.::::::::.::::::::::::::..:::::::.::::.::::.  :.  
CCDS45 LASHLVQLIPILVNGMKYSEIDIILLKGDVEEDEAVPDSEQDIKPRFHKSRTVTLPHEAE
              300       310       320       330       340       350

       360       370       380       390       400       410       
pF1KB8 --DGIEEEDDDDDEIDDDDTISDWNLRKCSAAALDVLANVYRDELLPHILPLLKELLFHH
         :: :. .::::    ::..:::::::::::::::::::.:.:::::.::::: :::: 
CCDS45 RPDGSEDAEDDDD----DDALSDWNLRKCSAAALDVLANVFREELLPHLLPLLKGLLFHP
              360           370       380       390       400      

       420       430       440       450       460       470       
pF1KB8 EWVVKESGILVLGAIAEGCMQGMIPYLPELIPHLIQCLSDKKALVRSITCWTLSRYAHWV
       :::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::.:::::::::::
CCDS45 EWVVKESGILVLGAIAEGCMQGMVPYLPELIPHLIQCLSDKKALVRSIACWTLSRYAHWV
        410       420       430       440       450       460      

       480       490       500       510       520       530       
pF1KB8 VSQPPDTYLKPLMTELLKRILDSNKRVQEAACSAFATLEEEACTELVPYLAYILDTLVFA
       :::::: .::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::.:::::::::
CCDS45 VSQPPDMHLKPLMTELLKRILDGNKRVQEAACSAFATLEEEACTELVPYLSYILDTLVFA
        470       480       490       500       510       520      

       540       550       560       570       580       590       
pF1KB8 FSKYQHKNLLILYDAIGTLADSVGHHLNKPEYIQMLMPPLIQKWNMLKDEDKDLFPLLEC
       :.::::::::::::::::::::::::::.::::: :::::::::: ::::::::::::::
CCDS45 FGKYQHKNLLILYDAIGTLADSVGHHLNQPEYIQKLMPPLIQKWNELKDEDKDLFPLLEC
        530       540       550       560       570       580      

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pF1KB8 LSSVATALQSGFLPYCEPVYQRCVNLVQKTLAQAMLNNAQPDQYEAPDKDFMIVALDLLS
       ::::::::::::::::::::::::.::::::::::. . .:.::::::::::::::::::
CCDS45 LSSVATALQSGFLPYCEPVYQRCVTLVQKTLAQAMMYTQHPEQYEAPDKDFMIVALDLLS
        590       600       610       620       630       640      

       660       670       680       690       700       710       
pF1KB8 GLAEGLGGNIEQLVARSNILTLMYQCMQDKMPEVRQSSFALLGDLTKACFQHVKPCIADF
       ::::::::..:::::::::.::..:::::.:::::::::::::::::::: :::::::.:
CCDS45 GLAEGLGGHVEQLVARSNIMTLLFQCMQDSMPEVRQSSFALLGDLTKACFIHVKPCIAEF
        650       660       670       680       690       700      

       720       730       740       750       760       770       
pF1KB8 MPILGTNLNPEFISVCNNATWAIGEISIQMGIEMQPYIPMVLHQLVEIINRPNTPKTLLE
       :::::::::::::::::::::::::: .::: :::::. :::..::::::::::::::::
CCDS45 MPILGTNLNPEFISVCNNATWAIGEICMQMGAEMQPYVQMVLNNLVEIINRPNTPKTLLE
        710       720       730       740       750       760      

       780       790       800       810       820       830       
pF1KB8 NTAITIGRLGYVCPQEVAPMLQQFIRPWCTSLRNIRDNEEKDSAFRGICTMISVNPSGVI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::.:::.::.
CCDS45 NTAITIGRLGYVCPQEVAPMLQQFIRPWCTSLRNIRDNEEKDSAFRGICMMIGVNPGGVV
        770       780       790       800       810       820      

       840       850       860       870       880       890       
pF1KB8 QDFIFFCDAVASWINPKDDLRDMFCKILHGFKNQVGDENWRRFSDQFPLPLKERLAAFYG
       :::::::::::::..::::::::: :::::::.:::..::..::.:::  ::::::::::
CCDS45 QDFIFFCDAVASWVSPKDDLRDMFYKILHGFKDQVGEDNWQQFSEQFPPLLKERLAAFYG
        830       840       850       860       870       880      

        
pF1KB8 V
       :
CCDS45 V
        

>>CCDS45991.1 TNPO2 gene_id:30000|Hs108|chr19             (897 aa)
 initn: 3260 init1: 2523 opt: 4491  Z-score: 4462.5  bits: 836.9 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 5210; 84.6% identity (94.7% similar) in 900 aa overlap (12-898:2-897)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MVWDRQTKMEYEWKPDEQGLQQILQLLKESQSPDTTIQRTVQQKLEQLNQYPDFNNYLIF
                  .:.::::::::.:::::.::::.:. :: ::.::.::::.:::::::::
CCDS45           MDWQPDEQGLQQVLQLLKDSQSPNTATQRIVQDKLKQLNQFPDFNNYLIF
                         10        20        30        40        50

               70        80        90       100       110       120
pF1KB8 VLTKLKSEDEPTRSLSGLILKNNVKAHFQNFPNGVTDFIKSECLNNIGDSSPLIRATVGI
       :::.:::::::::::::::::::::::.:.::  :.::::.::::::::.: :::::.::
CCDS45 VLTRLKSEDEPTRSLSGLILKNNVKAHYQSFPPPVADFIKQECLNNIGDASSLIRATIGI
               60        70        80        90       100       110

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pF1KB8 LITTIASKGELQNWPDLLPKLCSLLDSEDYNTCEGAFGALQKICEDSAEILDSDVLDRPL
       :::::::::::: ::.:::.::.::.:::::::::::::::::::::.:.::::.:.:::
CCDS45 LITTIASKGELQMWPELLPQLCNLLNSEDYNTCEGAFGALQKICEDSSELLDSDALNRPL
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pF1KB8 NIMIPKFLQFFKHSSPKIRSHAVACVNQFIISRTQALMLHIDSFIENLFALAGDEEPEVR
       ::::::::::::: ::::::::.:::::::..:.:::: .::.:::.::::: :..::::
CCDS45 NIMIPKFLQFFKHCSPKIRSHAIACVNQFIMDRAQALMDNIDTFIEHLFALAVDDDPEVR
              180       190       200       210       220       230

              250       260       270       280       290       300
pF1KB8 KNVCRALVMLLEVRMDRLLPHMHNIVEYMLQRTQDQDENVALEACEFWLTLAEQPICKDV
       ::::::::::::::.:::.::::.:..::::::::.::::::::::::::::::::::.:
CCDS45 KNVCRALVMLLEVRIDRLIPHMHSIIQYMLQRTQDHDENVALEACEFWLTLAEQPICKEV
              240       250       260       270       280       290

              310       320       330       340       350          
pF1KB8 LVRHLPKLIPVLVNGMKYSDIDIILLKGDVEEDETIPDSEQDIRPRFHRSRTVAQQHDE-
       :. :: .:::.::::::::.::::::::::::::..:::::::.::::.::::.  :.  
CCDS45 LASHLVQLIPILVNGMKYSEIDIILLKGDVEEDEAVPDSEQDIKPRFHKSRTVTLPHEAE
              300       310       320       330       340       350

       360       370       380       390       400       410       
pF1KB8 --DGIEEEDDDDDEIDDDDTISDWNLRKCSAAALDVLANVYRDELLPHILPLLKELLFHH
         :: :. .::::    ::..:::::::::::::::::::.:.:::::.::::: :::: 
CCDS45 RPDGSEDAEDDDD----DDALSDWNLRKCSAAALDVLANVFREELLPHLLPLLKGLLFHP
              360           370       380       390       400      

       420       430       440       450       460       470       
pF1KB8 EWVVKESGILVLGAIAEGCMQGMIPYLPELIPHLIQCLSDKKALVRSITCWTLSRYAHWV
       :::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::.:::::::::::
CCDS45 EWVVKESGILVLGAIAEGCMQGMVPYLPELIPHLIQCLSDKKALVRSIACWTLSRYAHWV
        410       420       430       440       450       460      

       480       490       500       510       520       530       
pF1KB8 VSQPPDTYLKPLMTELLKRILDSNKRVQEAACSAFATLEEEACTELVPYLAYILDTLVFA
       :::::: .::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::.:::::::::
CCDS45 VSQPPDMHLKPLMTELLKRILDGNKRVQEAACSAFATLEEEACTELVPYLSYILDTLVFA
        470       480       490       500       510       520      

       540       550       560       570       580       590       
pF1KB8 FSKYQHKNLLILYDAIGTLADSVGHHLNKPEYIQMLMPPLIQKWNMLKDEDKDLFPLLEC
       :.::::::::::::::::::::::::::.::::: :::::::::: ::::::::::::::
CCDS45 FGKYQHKNLLILYDAIGTLADSVGHHLNQPEYIQKLMPPLIQKWNELKDEDKDLFPLLEC
        530       540       550       560       570       580      

       600       610       620       630       640       650       
pF1KB8 LSSVATALQSGFLPYCEPVYQRCVNLVQKTLAQAMLNNAQPDQYEAPDKDFMIVALDLLS
       ::::::::::::::::::::::::.::::::::::. . .:.::::::::::::::::::
CCDS45 LSSVATALQSGFLPYCEPVYQRCVTLVQKTLAQAMMYTQHPEQYEAPDKDFMIVALDLLS
        590       600       610       620       630       640      

       660       670       680       690       700       710       
pF1KB8 GLAEGLGGNIEQLVARSNILTLMYQCMQDKMPEVRQSSFALLGDLTKACFQHVKPCIADF
       ::::::::..:::::::::.::..:::::.:::::::::::::::::::: :::::::.:
CCDS45 GLAEGLGGHVEQLVARSNIMTLLFQCMQDSMPEVRQSSFALLGDLTKACFIHVKPCIAEF
        650       660       670       680       690       700      

       720       730       740       750       760       770       
pF1KB8 MPILGTNLNPEFISVCNNATWAIGEISIQMGIEMQPYIPMVLHQLVEIINRPNTPKTLLE
       :::::::::::::::::::::::::: .::: :::::. :::..::::::::::::::::
CCDS45 MPILGTNLNPEFISVCNNATWAIGEICMQMGAEMQPYVQMVLNNLVEIINRPNTPKTLLE
        710       720       730       740       750       760      

                 780       790       800       810       820       
pF1KB8 NT----------AITIGRLGYVCPQEVAPMLQQFIRPWCTSLRNIRDNEEKDSAFRGICT
       ::          ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: 
CCDS45 NTGRLTSPSAIPAITIGRLGYVCPQEVAPMLQQFIRPWCTSLRNIRDNEEKDSAFRGICM
        770       780       790       800       810       820      

       830       840       850       860       870       880       
pF1KB8 MISVNPSGVIQDFIFFCDAVASWINPKDDLRDMFCKILHGFKNQVGDENWRRFSDQFPLP
       ::.:::.::.:::::::::::::..::::::::: :::::::.:::..::..::.:::  
CCDS45 MIGVNPGGVVQDFIFFCDAVASWVSPKDDLRDMFYKILHGFKDQVGEDNWQQFSEQFPPL
        830       840       850       860       870       880      

       890        
pF1KB8 LKERLAAFYGV
       :::::::::::
CCDS45 LKERLAAFYGV
        890       

>>CCDS62228.1 KPNB1 gene_id:3837|Hs108|chr17              (731 aa)
 initn: 279 init1: 168 opt: 310  Z-score: 311.2  bits: 68.5 E(32554): 5.2e-11
Smith-Waterman score: 404; 24.7% identity (52.7% similar) in 575 aa overlap (235-762:39-594)

          210       220       230         240       250            
pF1KB8 CVNQFIISRTQALMLHIDSFIENLFALAGDEEP--EVRKNVCRALVMLLE---VRMDRLL
                                     :::  .:.  .  ::.  ::   . .:.  
CCDS62 IGYICQDIDPEQLQDKSNEILTAIIQGMRKEEPSNNVKLAATNALLNSLEFTKANFDKE-
       10        20        30        40        50        60        

     260       270       280       290       300        310        
pF1KB8 PHMHNIVEYMLQRTQDQDENVALEACEFWLTLAEQPICKDVLVRHL-PKLIPVLVNGMKY
        . : :.. . . ::  :  : . : .  . .  . .  . .  .. : :. . ...:: 
CCDS62 SERHFIMQVVCEATQCPDTRVRVAALQNLVKI--MSLYYQYMETYMGPALFAITIEAMK-
        70        80        90         100       110       120     

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pF1KB8 SDIDIILLKG--------DVEEDETIPDSE--QDIRPRFHRSRTVAQ---QHDEDGIEEE
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CCDS11 AIEASEAAEQGRPPEHTSKFYAKGALQYLVPILTQTLTKQDENDDDD---DWNPCKAAGV
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