Result of FASTA (ccds) for pF1KB9974
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB9974, 707 aa
  1>>>pF1KB9974 707 - 707 aa - 707 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.3063+/-0.00127; mu= -6.4400+/- 0.077
 mean_var=364.1489+/-71.996, 0's: 0 Z-trim(113.4): 50  B-trim: 0 in 0/53
 Lambda= 0.067210
 statistics sampled from 13949 (13995) to 13949 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.739), E-opt: 0.2 (0.43), width:  16
 Scan time:  4.330

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS13390.1 MMP9 gene_id:4318|Hs108|chr20          ( 707) 4999 499.1 9.1e-141
CCDS10752.1 MMP2 gene_id:4313|Hs108|chr16          ( 660) 1899 198.5 2.6e-50
CCDS45487.1 MMP2 gene_id:4313|Hs108|chr16          ( 610) 1839 192.7 1.4e-48
CCDS76869.1 MMP2 gene_id:4313|Hs108|chr16          ( 584) 1838 192.6 1.4e-48
CCDS8323.1 MMP3 gene_id:4314|Hs108|chr11           ( 477)  611 73.5 8.1e-13
CCDS8324.1 MMP13 gene_id:4322|Hs108|chr11          ( 471)  606 73.0 1.1e-12
CCDS8321.1 MMP10 gene_id:4319|Hs108|chr11          ( 476)  603 72.7 1.4e-12
CCDS8322.1 MMP1 gene_id:4312|Hs108|chr11           ( 469)  580 70.5 6.4e-12


>>CCDS13390.1 MMP9 gene_id:4318|Hs108|chr20               (707 aa)
 initn: 4999 init1: 4999 opt: 4999  Z-score: 2640.7  bits: 499.1 E(32554): 9.1e-141
Smith-Waterman score: 4999; 99.7% identity (99.9% similar) in 707 aa overlap (1-707:1-707)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MSLWQPLVLVLLVLGCCFAAPRQRQSTLVLFPGDLRTNLTDRQLAEEYLYRYGYTRVAEM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 MSLWQPLVLVLLVLGCCFAAPRQRQSTLVLFPGDLRTNLTDRQLAEEYLYRYGYTRVAEM
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB9 RGESKSLGPALLLLQKQLSLPETGELDSATLKAMRTPRCGVPDLGRFQTFEGDLKWHHHN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 RGESKSLGPALLLLQKQLSLPETGELDSATLKAMRTPRCGVPDLGRFQTFEGDLKWHHHN
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB9 ITYWIQNYSEDLPRAVIDDAFARAFALWSAVTPLTFTRVYSRDADIVIQFGVAEHGDGYP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 ITYWIQNYSEDLPRAVIDDAFARAFALWSAVTPLTFTRVYSRDADIVIQFGVAEHGDGYP
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB9 FDGKDGLLAHAFPPGPGIQGDAHFDDDELWSLGKGVVVPTRFGNADGAACHFPFIFEGRS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 FDGKDGLLAHAFPPGPGIQGDAHFDDDELWSLGKGVVVPTRFGNADGAACHFPFIFEGRS
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB9 YSACTTDGRSDGLPWCSTTANYDTDDRFGFCPSERLYTRDGNADGKPCQFPFIFQGQSYS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::
CCDS13 YSACTTDGRSDGLPWCSTTANYDTDDRFGFCPSERLYTQDGNADGKPCQFPFIFQGQSYS
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB9 ACTTDGRSDGYRWCATTANYDRDKLFGFCPTRADSTVMGGNSAGELCVFPFTFLGKEYST
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 ACTTDGRSDGYRWCATTANYDRDKLFGFCPTRADSTVMGGNSAGELCVFPFTFLGKEYST
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB9 CTSEGRGDGRLWCATTSNFDSDKKWGFCPDQGYSLFLVAAHEFGHALGLDHSSVPEALMY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 CTSEGRGDGRLWCATTSNFDSDKKWGFCPDQGYSLFLVAAHEFGHALGLDHSSVPEALMY
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB9 PMYRFTEGPPLHKDDVNGIRHLYGPRPEPEPRPPTTTTPQPTAPPTVCPTGPPTVHPSER
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 PMYRFTEGPPLHKDDVNGIRHLYGPRPEPEPRPPTTTTPQPTAPPTVCPTGPPTVHPSER
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB9 PTAGPTGPPSAGPTGPPTAGPSTATTVPLSPVDDACNVNIFDAIAEIGNQLYLFKDGKYW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 PTAGPTGPPSAGPTGPPTAGPSTATTVPLSPVDDACNVNIFDAIAEIGNQLYLFKDGKYW
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB9 RFSEGRGSRPQGPFLIADKWPALPRKLDSVFEEPLSKKLFFFSGRQVWVYTGASVLGPRR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 RFSEGRGSRPQGPFLIADKWPALPRKLDSVFEERLSKKLFFFSGRQVWVYTGASVLGPRR
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB9 LDKLGLGADVAQVTGALRSGRGKMLLFSGRRLWRFDVKAQMVDPRSASEVDRMFPGVPLD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 LDKLGLGADVAQVTGALRSGRGKMLLFSGRRLWRFDVKAQMVDPRSASEVDRMFPGVPLD
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       
pF1KB9 THDVFQYREKAYFCQDRFYWRVSSRSELNQVDQVGYVTYDILQCPED
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 THDVFQYREKAYFCQDRFYWRVSSRSELNQVDQVGYVTYDILQCPED
              670       680       690       700       

>>CCDS10752.1 MMP2 gene_id:4313|Hs108|chr16               (660 aa)
 initn: 2055 init1: 1226 opt: 1899  Z-score: 1016.6  bits: 198.5 E(32554): 2.6e-50
Smith-Waterman score: 2132; 46.9% identity (68.3% similar) in 715 aa overlap (2-704:9-660)

                      10        20        30        40        50   
pF1KB9        MSLWQPLVLVLLVLGCCFAAPRQRQSTLVLFPGDLRTNLTDRQLAEEYLYR-Y
               .:  ::  .: .::: ..      : .. ::::.  . ::..:: .::   :
CCDS10 MEALMARGALTGPLR-ALCLLGCLLSHAAAAPSPIIKFPGDVAPK-TDKELAVQYLNTFY
               10         20        30        40         50        

             60           70        80        90       100         
pF1KB9 GYTRVAEMRGESKSL---GPALLLLQKQLSLPETGELDSATLKAMRTPRCGVPDLGRFQT
       :  .      :: .:     .:  .:: ..::.::.::. :...:: :::: ::.. .. 
CCDS10 GCPK------ESCNLFVLKDTLKKMQKFFGLPQTGDLDQNTIETMRKPRCGNPDVANYNF
       60              70        80        90       100       110  

     110       120       130       140       150       160         
pF1KB9 FEGDLKWHHHNITYWIQNYSEDLPRAVIDDAFARAFALWSAVTPLTFTRVYSRDADIVIQ
       :    :: ...::: : .:. ::   ..:::::::: .:: :::: :.:... .:::.:.
CCDS10 FPRKPKWDKNQITYRIIGYTPDLDPETVDDAFARAFQVWSDVTPLRFSRIHDGEADIMIN
            120       130       140       150       160       170  

     170       180       190       200       210       220         
pF1KB9 FGVAEHGDGYPFDGKDGLLAHAFPPGPGIQGDAHFDDDELWSLGKGVVVPTRFGNADGAA
       ::  ::::::::::::::::::: :: :. ::.::::::::.::.: :: ...:::::  
CCDS10 FGRWEHGDGYPFDGKDGLLAHAFAPGTGVGGDSHFDDDELWTLGEGQVVRVKYGNADGEY
            180       190       200       210       220       230  

     230       240       250       260       270       280         
pF1KB9 CHFPFIFEGRSYSACTTDGRSDGLPWCSTTANYDTDDRFGFCPSERLYTRDGNADGKPCQ
       :.:::.:.:. :..::  :::::. ::::: :.. : ..:::: : :.:  :::.:.::.
CCDS10 CKFPFLFNGKEYNSCTDTGRSDGFLWCSTTYNFEKDGKYGFCPHEALFTMGGNAEGQPCK
            240       250       260       270       280       290  

     290       300       310       320       330       340         
pF1KB9 FPFIFQGQSYSACTTDGRSDGYRWCATTANYDRDKLFGFCPTRADSTVMGGNSAGELCVF
       ::: ::: ::..:::.::.::::::.:: .::::: .::::  : ::: :::: :  :::
CCDS10 FPFRFQGTSYDSCTTEGRTDGYRWCGTTEDYDRDKKYGFCPETAMSTV-GGNSEGAPCVF
            300       310       320       330       340        350 

     350       360       370       380       390       400         
pF1KB9 PFTFLGKEYSTCTSEGRGDGRLWCATTSNFDSDKKWGFCPDQGYSLFLVAAHEFGHALGL
       ::::::..: .::: ::.::..:::::.:.:.:.:::::::::::::::::::::::.::
CCDS10 PFTFLGNKYESCTSAGRSDGKMWCATTANYDDDRKWGFCPDQGYSLFLVAAHEFGHAMGL
             360       370       380       390       400       410 

     410       420       430       440       450       460         
pF1KB9 DHSSVPEALMYPMYRFTEGPPLHKDDVNGIRHLYGPRPEPEPRPPTTTTPQPTAPPTVCP
       .::. : ::: :.: .:..  : .::..::..:::  :. .                   
CCDS10 EHSQDPGALMAPIYTYTKNFRLSQDDIKGIQELYGASPDID-----------------LG
             420       430       440       450                     

     470       480       490       500       510       520         
pF1KB9 TGPPTVHPSERPTAGPTGPPSAGPTGPPTAGPSTATTVPLSPVDDACNVNI-FDAIAEIG
       :::        :: ::. :                         . :. .: ::.::.: 
CCDS10 TGPT-------PTLGPVTP-------------------------EICKQDIVFDGIAQIR
                 460                                470       480  

      530       540       550       560       570       580        
pF1KB9 NQLYLFKDGKYWRFSEGRGSRPQGPFLIADKWPALPRKLDSVFEEPLSKKLFFFSGRQVW
       .....:::   ::    : ..:.::.:.:  :: ::.:.:.:.: :  .:  ::.: . :
CCDS10 GEIFFFKDRFIWRTVTPR-DKPMGPLLVATFWPELPEKIDAVYEAPQEEKAVFFAGNEYW
            490       500        510       520       530       540 

      590          600       610        620       630        640   
pF1KB9 VYTGASVL--G-PRRLDKLGLGADVAQVTGALR-SGRGKMLLFSGRRLWRFD-VKAQMVD
       .:. ::.:  : :. : .:::  :: .: .:.  :   :  .:.: ..::.. :: .: :
CCDS10 IYS-ASTLERGYPKPLTSLGLPPDVQRVDAAFNWSKNKKTYIFAGDKFWRYNEVKKKM-D
              550       560       570       580       590          

           650         660       670       680       690       700 
pF1KB9 PRSASEVDRMFPGVP--LDTHDVFQYREKAYFCQDRFYWRVSSRSELNQVDQVGYVTYDI
       :   . .   . ..:  ::.   .:   ..:: .  .: .. ..: :..: . : .  : 
CCDS10 PGFPKLIADAWNAIPDNLDAVVDLQGGGHSYFFKGAYYLKLENQS-LKSV-KFGSIKSDW
     600       610       620       630       640         650       

             
pF1KB9 LQCPED
       : :   
CCDS10 LGC   
       660   

>>CCDS45487.1 MMP2 gene_id:4313|Hs108|chr16               (610 aa)
 initn: 2006 init1: 1226 opt: 1839  Z-score: 985.7  bits: 192.7 E(32554): 1.4e-48
Smith-Waterman score: 2072; 48.5% identity (70.0% similar) in 646 aa overlap (67-704:20-610)

         40        50        60        70        80        90      
pF1KB9 TNLTDRQLAEEYLYRYGYTRVAEMRGESKSLGPALLLLQKQLSLPETGELDSATLKAMRT
                                     :  .:  .:: ..::.::.::. :...:: 
CCDS45            MQYLNTFYGCPKESCNLFVLKDTLKKMQKFFGLPQTGDLDQNTIETMRK
                          10        20        30        40         

        100       110       120       130       140       150      
pF1KB9 PRCGVPDLGRFQTFEGDLKWHHHNITYWIQNYSEDLPRAVIDDAFARAFALWSAVTPLTF
       :::: ::.. .. :    :: ...::: : .:. ::   ..:::::::: .:: :::: :
CCDS45 PRCGNPDVANYNFFPRKPKWDKNQITYRIIGYTPDLDPETVDDAFARAFQVWSDVTPLRF
      50        60        70        80        90       100         

        160       170       180       190       200       210      
pF1KB9 TRVYSRDADIVIQFGVAEHGDGYPFDGKDGLLAHAFPPGPGIQGDAHFDDDELWSLGKGV
       .:... .:::.:.::  ::::::::::::::::::: :: :. ::.::::::::.::.: 
CCDS45 SRIHDGEADIMINFGRWEHGDGYPFDGKDGLLAHAFAPGTGVGGDSHFDDDELWTLGEGQ
     110       120       130       140       150       160         

        220       230       240       250       260       270      
pF1KB9 VVPTRFGNADGAACHFPFIFEGRSYSACTTDGRSDGLPWCSTTANYDTDDRFGFCPSERL
       :: ...:::::  :.:::.:.:. :..::  :::::. ::::: :.. : ..:::: : :
CCDS45 VVRVKYGNADGEYCKFPFLFNGKEYNSCTDTGRSDGFLWCSTTYNFEKDGKYGFCPHEAL
     170       180       190       200       210       220         

        280       290       300       310       320       330      
pF1KB9 YTRDGNADGKPCQFPFIFQGQSYSACTTDGRSDGYRWCATTANYDRDKLFGFCPTRADST
       .:  :::.:.::.::: ::: ::..:::.::.::::::.:: .::::: .::::  : ::
CCDS45 FTMGGNAEGQPCKFPFRFQGTSYDSCTTEGRTDGYRWCGTTEDYDRDKKYGFCPETAMST
     230       240       250       260       270       280         

        340       350       360       370       380       390      
pF1KB9 VMGGNSAGELCVFPFTFLGKEYSTCTSEGRGDGRLWCATTSNFDSDKKWGFCPDQGYSLF
       : :::: :  :::::::::..: .::: ::.::..:::::.:.:.:.:::::::::::::
CCDS45 V-GGNSEGAPCVFPFTFLGNKYESCTSAGRSDGKMWCATTANYDDDRKWGFCPDQGYSLF
     290        300       310       320       330       340        

        400       410       420       430       440       450      
pF1KB9 LVAAHEFGHALGLDHSSVPEALMYPMYRFTEGPPLHKDDVNGIRHLYGPRPEPEPRPPTT
       ::::::::::.::.::. : ::: :.: .:..  : .::..::..:::  :. .      
CCDS45 LVAAHEFGHAMGLEHSQDPGALMAPIYTYTKNFRLSQDDIKGIQELYGASPDID------
      350       360       370       380       390       400        

        460       470       480       490       500       510      
pF1KB9 TTPQPTAPPTVCPTGPPTVHPSERPTAGPTGPPSAGPTGPPTAGPSTATTVPLSPVDDAC
                    :::        :: ::. :                         . :
CCDS45 -----------LGTGPT-------PTLGPVTP-------------------------EIC
                              410                                  

        520        530       540       550       560       570     
pF1KB9 NVNI-FDAIAEIGNQLYLFKDGKYWRFSEGRGSRPQGPFLIADKWPALPRKLDSVFEEPL
       . .: ::.::.: .....:::   ::    : ..:.::.:.:  :: ::.:.:.:.: : 
CCDS45 KQDIVFDGIAQIRGEIFFFKDRFIWRTVTPR-DKPMGPLLVATFWPELPEKIDAVYEAPQ
     420       430       440       450        460       470        

         580       590          600       610        620       630 
pF1KB9 SKKLFFFSGRQVWVYTGASVL--G-PRRLDKLGLGADVAQVTGALR-SGRGKMLLFSGRR
        .:  ::.: . :.:. ::.:  : :. : .:::  :: .: .:.  :   :  .:.: .
CCDS45 EEKAVFFAGNEYWIYS-ASTLERGYPKPLTSLGLPPDVQRVDAAFNWSKNKKTYIFAGDK
      480       490        500       510       520       530       

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pF1KB9 LWRFD-VKAQMVDPRSASEVDRMFPGVP--LDTHDVFQYREKAYFCQDRFYWRVSSRSEL
       .::.. :: .: ::   . .   . ..:  ::.   .:   ..:: .  .: .. ..: :
CCDS45 FWRYNEVKKKM-DPGFPKLIADAWNAIPDNLDAVVDLQGGGHSYFFKGAYYLKLENQS-L
       540        550       560       570       580       590      

      690       700       
pF1KB9 NQVDQVGYVTYDILQCPED
       ..: . : .  : : :   
CCDS45 KSV-KFGSIKSDWLGC   
          600       610   

>>CCDS76869.1 MMP2 gene_id:4313|Hs108|chr16               (584 aa)
 initn: 2006 init1: 1226 opt: 1838  Z-score: 985.4  bits: 192.6 E(32554): 1.4e-48
Smith-Waterman score: 2071; 48.7% identity (70.3% similar) in 639 aa overlap (74-704:1-584)

            50        60        70        80        90       100   
pF1KB9 LAEEYLYRYGYTRVAEMRGESKSLGPALLLLQKQLSLPETGELDSATLKAMRTPRCGVPD
                                     .:: ..::.::.::. :...:: :::: ::
CCDS76                               MQKFFGLPQTGDLDQNTIETMRKPRCGNPD
                                             10        20        30

           110       120       130       140       150       160   
pF1KB9 LGRFQTFEGDLKWHHHNITYWIQNYSEDLPRAVIDDAFARAFALWSAVTPLTFTRVYSRD
       .. .. :    :: ...::: : .:. ::   ..:::::::: .:: :::: :.:... .
CCDS76 VANYNFFPRKPKWDKNQITYRIIGYTPDLDPETVDDAFARAFQVWSDVTPLRFSRIHDGE
               40        50        60        70        80        90

           170       180       190       200       210       220   
pF1KB9 ADIVIQFGVAEHGDGYPFDGKDGLLAHAFPPGPGIQGDAHFDDDELWSLGKGVVVPTRFG
       :::.:.::  ::::::::::::::::::: :: :. ::.::::::::.::.: :: ...:
CCDS76 ADIMINFGRWEHGDGYPFDGKDGLLAHAFAPGTGVGGDSHFDDDELWTLGEGQVVRVKYG
              100       110       120       130       140       150

           230       240       250       260       270       280   
pF1KB9 NADGAACHFPFIFEGRSYSACTTDGRSDGLPWCSTTANYDTDDRFGFCPSERLYTRDGNA
       ::::  :.:::.:.:. :..::  :::::. ::::: :.. : ..:::: : :.:  :::
CCDS76 NADGEYCKFPFLFNGKEYNSCTDTGRSDGFLWCSTTYNFEKDGKYGFCPHEALFTMGGNA
              160       170       180       190       200       210

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pF1KB9 DGKPCQFPFIFQGQSYSACTTDGRSDGYRWCATTANYDRDKLFGFCPTRADSTVMGGNSA
       .:.::.::: ::: ::..:::.::.::::::.:: .::::: .::::  : ::: :::: 
CCDS76 EGQPCKFPFRFQGTSYDSCTTEGRTDGYRWCGTTEDYDRDKKYGFCPETAMSTV-GGNSE
              220       230       240       250       260          

           350       360       370       380       390       400   
pF1KB9 GELCVFPFTFLGKEYSTCTSEGRGDGRLWCATTSNFDSDKKWGFCPDQGYSLFLVAAHEF
       :  :::::::::..: .::: ::.::..:::::.:.:.:.::::::::::::::::::::
CCDS76 GAPCVFPFTFLGNKYESCTSAGRSDGKMWCATTANYDDDRKWGFCPDQGYSLFLVAAHEF
     270       280       290       300       310       320         

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pF1KB9 GHALGLDHSSVPEALMYPMYRFTEGPPLHKDDVNGIRHLYGPRPEPEPRPPTTTTPQPTA
       :::.::.::. : ::: :.: .:..  : .::..::..:::  :. .             
CCDS76 GHAMGLEHSQDPGALMAPIYTYTKNFRLSQDDIKGIQELYGASPDID-------------
     330       340       350       360       370                   

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pF1KB9 PPTVCPTGPPTVHPSERPTAGPTGPPSAGPTGPPTAGPSTATTVPLSPVDDACNVNI-FD
             :::        :: ::. :                         . :. .: ::
CCDS76 ----LGTGPT-------PTLGPVTP-------------------------EICKQDIVFD
            380              390                                400

            530       540       550       560       570       580  
pF1KB9 AIAEIGNQLYLFKDGKYWRFSEGRGSRPQGPFLIADKWPALPRKLDSVFEEPLSKKLFFF
       .::.: .....:::   ::    : ..:.::.:.:  :: ::.:.:.:.: :  .:  ::
CCDS76 GIAQIRGEIFFFKDRFIWRTVTPR-DKPMGPLLVATFWPELPEKIDAVYEAPQEEKAVFF
              410       420        430       440       450         

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pF1KB9 SGRQVWVYTGASVL--G-PRRLDKLGLGADVAQVTGALR-SGRGKMLLFSGRRLWRFD-V
       .: . :.:. ::.:  : :. : .:::  :: .: .:.  :   :  .:.: ..::.. :
CCDS76 AGNEYWIYS-ASTLERGYPKPLTSLGLPPDVQRVDAAFNWSKNKKTYIFAGDKFWRYNEV
     460        470       480       490       500       510        

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pF1KB9 KAQMVDPRSASEVDRMFPGVP--LDTHDVFQYREKAYFCQDRFYWRVSSRSELNQVDQVG
       : .: ::   . .   . ..:  ::.   .:   ..:: .  .: .. ..: :..: . :
CCDS76 KKKM-DPGFPKLIADAWNAIPDNLDAVVDLQGGGHSYFFKGAYYLKLENQS-LKSV-KFG
      520        530       540       550       560        570      

         700       
pF1KB9 YVTYDILQCPED
        .  : : :   
CCDS76 SIKSDWLGC   
         580       

>>CCDS8323.1 MMP3 gene_id:4314|Hs108|chr11                (477 aa)
 initn: 992 init1: 582 opt: 611  Z-score: 343.6  bits: 73.5 E(32554): 8.1e-13
Smith-Waterman score: 673; 28.3% identity (45.5% similar) in 693 aa overlap (8-689:6-459)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MSLWQPLVLVLLVLGCCFAAPRQRQSTLVLFPGDLRTNLTDRQLAEEYLYRYGYTRVAEM
              .:.:: .. : : :         . :  : . :. .:...::  : :    ..
CCDS83   MKSLPILLLLCVAVCSAYP---------LDGAARGEDTSMNLVQKYLENY-YDLKKDV
                 10                 20        30        40         

                 70           80        90       100       110     
pF1KB9 RG--ESKSLGPA---LLLLQKQLSLPETGELDSATLKAMRTPRCGVPDLGRFQTFEGDLK
       .   . :. ::.   .  .:: :.:  ::.::: ::..:: :::::::.:.:.:: :  :
CCDS83 KQFVRRKDSGPVVKKIREMQKFLGLEVTGKLDSDTLEVMRKPRCGVPDVGHFRTFPGIPK
       50        60        70        80        90       100        

         120       130       140       150       160       170     
pF1KB9 WHHHNITYWIQNYSEDLPRAVIDDAFARAFALWSAVTPLTFTRVYSRDADIVIQFGVAEH
       :.. ..:: : ::. :::. ..:.:  .:. .:  ::::::.:.:  .:::.:.:.: ::
CCDS83 WRKTHLTYRIVNYTPDLPKDAVDSAVEKALKVWEEVTPLTFSRLYEGEADIMISFAVREH
      110       120       130       140       150       160        

         180       190       200       210       220       230     
pF1KB9 GDGYPFDGKDGLLAHAFPPGPGIQGDAHFDDDELWSLGKGVVVPTRFGNADGAACHFPFI
       :: :::::  ..::::. :::::.::::::::: :.                        
CCDS83 GDFYPFDGPGNVLAHAYAPGPGINGDAHFDDDEQWT------------------------
      170       180       190       200                            

         240       250       260       270       280       290     
pF1KB9 FEGRSYSACTTDGRSDGLPWCSTTANYDTDDRFGFCPSERLYTRDGNADGKPCQFPFIFQ
                                                                   
CCDS83 ------------------------------------------------------------
                                                                   

         300       310       320       330       340       350     
pF1KB9 GQSYSACTTDGRSDGYRWCATTANYDRDKLFGFCPTRADSTVMGGNSAGELCVFPFTFLG
                                             :.:                   
CCDS83 -------------------------------------KDTT-------------------
                                                                   

         360       370       380       390       400       410     
pF1KB9 KEYSTCTSEGRGDGRLWCATTSNFDSDKKWGFCPDQGYSLFLVAAHEFGHALGLDHSSVP
                                           : .::::::::.::.::: ::.  
CCDS83 ------------------------------------GTNLFLVAAHEIGHSLGLFHSANT
                                          210       220       230  

         420        430         440       450       460       470  
pF1KB9 EALMYPMYR-FTEGPP--LHKDDVNGIRHLYGPRPEPEPRPPTTTTPQPTAPPTVCPTGP
       ::::::.:. .:.     : .::.:::. ::::       :: .    : .:  . :: :
CCDS83 EALMYPLYHSLTDLTRFRLSQDDINGIQSLYGP-------PPDS----PETP--LVPTEP
            240       250       260                  270           

            480       490       500       510       520       530  
pF1KB9 PTVHPSERPTAGPTGPPSAGPTGPPTAGPSTATTVPLSPVDDACNVNIFDAIAEIGNQLY
                      ::   :  : .  :. .                :::.. . ... 
CCDS83 V--------------PPE--PGTPANCDPALS----------------FDAVSTLRGEIL
     280                       290                       300       

            540       550       560       570       580       590  
pF1KB9 LFKDGKYWRFSEGRGSRPQGPFLIADKWPALPRKLDSVFEEPLSKKLFFFSGRQVWVYTG
       .::: ..:: :  :  .:.   ::.. ::.::  .:...:   .  .:.:.: : :.  :
CCDS83 IFKDRHFWRKSL-RKLEPEL-HLISSFWPSLPSGVDAAYEVTSKDLVFIFKGNQFWAIRG
       310        320        330       340       350       360     

              600       610       620        630       640         
pF1KB9 ASVLG--PRRLDKLGLGADVAQVTGALRSG-RGKMLLFSGRRLWRFDVKAQMVDPRSASE
         : .  :: .  ::.   : .. .:. .  ..:  .:   . :::: : . ..:   ..
CCDS83 NEVRAGYPRGIHTLGFPPTVRKIDAAISDKEKNKTYFFVEDKYWRFDEKRNSMEPGFPKQ
         370       380       390       400       410       420     

     650       660       670       680       690       700       
pF1KB9 VDRMFPGVPLDTHDVFQYREKAYFCQDRFYWRVSSRSELNQVDQVGYVTYDILQCPED
       . . :::.      ::.  : ..:    ...  ::. :..                  
CCDS83 IAEDFPGIDSKIDAVFE--EFGFF----YFFTGSSQLEFDPNAKKVTHTLKSNSWLNC
         430       440             450       460       470       

>>CCDS8324.1 MMP13 gene_id:4322|Hs108|chr11               (471 aa)
 initn: 1063 init1: 568 opt: 606  Z-score: 341.1  bits: 73.0 E(32554): 1.1e-12
Smith-Waterman score: 696; 28.8% identity (45.5% similar) in 674 aa overlap (41-704:35-471)

               20        30        40        50         60         
pF1KB9 LLVLGCCFAAPRQRQSTLVLFPGDLRTNLTDRQLAEEYLYRYGY-TRVAEMRGES--KSL
                                     : :.::.::  : . : .: .  :.  .:.
CCDS83 VLAAFLFLSWTHCRALPLPSGGDEDDLSEEDLQFAERYLRSYYHPTNLAGILKENAASSM
           10        20        30        40        50        60    

        70        80        90       100       110       120       
pF1KB9 GPALLLLQKQLSLPETGELDSATLKAMRTPRCGVPDLGRFQTFEGDLKWHHHNITYWIQN
          :  .:. ..:  ::.::. :: .:. :::::::.:....:   ::: . :.:: : :
CCDS83 TERLREMQSFFGLEVTGKLDDNTLDVMKKPRCGVPDVGEYNVFPRTLKWSKMNLTYRIVN
           70        80        90       100       110       120    

       130       140       150       160       170       180       
pF1KB9 YSEDLPRAVIDDAFARAFALWSAVTPLTFTRVYSRDADIVIQFGVAEHGDGYPFDGKDGL
       :. :. .. .. :: .:: .:: ::::.:::...  :::.:.::. :::: ::::: .::
CCDS83 YTPDMTHSEVEKAFKKAFKVWSDVTPLNFTRLHDGIADIMISFGIKEHGDFYPFDGPSGL
          130       140       150       160       170       180    

       190       200       210       220       230       240       
pF1KB9 LAHAFPPGPGIQGDAHFDDDELWSLGKGVVVPTRFGNADGAACHFPFIFEGRSYSACTTD
       :::::::::.  ::::::::: :                                     
CCDS83 LAHAFPPGPNYGGDAHFDDDETW-------------------------------------
          190       200                                            

       250       260       270       280       290       300       
pF1KB9 GRSDGLPWCSTTANYDTDDRFGFCPSERLYTRDGNADGKPCQFPFIFQGQSYSACTTDGR
                                                                   
CCDS83 ------------------------------------------------------------
                                                                   

       310       320       330       340       350       360       
pF1KB9 SDGYRWCATTANYDRDKLFGFCPTRADSTVMGGNSAGELCVFPFTFLGKEYSTCTSEGRG
                                                                   
CCDS83 ------------------------------------------------------------
                                                                   

       370       380       390       400       410       420       
pF1KB9 DGRLWCATTSNFDSDKKWGFCPDQGYSLFLVAAHEFGHALGLDHSSVPEALMYPMYRFTE
              :.:.            .::.:::::::::::.::::::. : :::.:.: .: 
CCDS83 -------TSSS------------KGYNLFLVAAHEFGHSLGLDHSKDPGALMFPIYTYT-
              210                   220       230       240        

       430          440        450       460       470       480   
pF1KB9 GPP---LHKDDVNGIRHLYGPRPE-PEPRPPTTTTPQPTAPPTVCPTGPPTVHPSERPTA
       :     :  :::.::. ::::  : :.:. : :        :  :        ::     
CCDS83 GKSHFMLPDDDVQGIQSLYGPGDEDPNPKHPKT--------PDKC-------DPS-----
       250       260       270       280                           

           490       500       510       520       530       540   
pF1KB9 GPTGPPSAGPTGPPTAGPSTATTVPLSPVDDACNVNIFDAIAEIGNQLYLFKDGKYWRFS
                                ::          .:::. . .. ..:::  .::. 
CCDS83 -------------------------LS----------LDAITSLRGETMIFKDRFFWRLH
                                          290       300       310  

           550       560       570       580       590         600 
pF1KB9 EGRGSRPQGPFLIADKWPALPRKLDSVFEEPLSKKLFFFSGRQVWVYTGASVL-G-PRRL
         . .     ::  . :: :: ..:...:.:    .:.: ::. :. .: ..: : :...
CCDS83 PQQVDAEL--FLTKSFWPELPNRIDAAYEHPSHDLIFIFRGRKFWALNGYDILEGYPKKI
            320         330       340       350       360       370

             610        620       630       640       650       660
pF1KB9 DKLGLGADVAQVTGALR-SGRGKMLLFSGRRLWRFDVKAQMVDPRSASEVDRMFPGVPLD
       ..:::  .: ....:..    :: ::::: ..::.:   ...:      ... :::.   
CCDS83 SELGLPKEVKKISAAVHFEDTGKTLLFSGNQVWRYDDTNHIMDKDYPRLIEEDFPGIGDK
              380       390       400       410       420       430

              670       680       690       700       
pF1KB9 THDVFQYREKAYFCQDRFYWRVSSRSELNQVDQVGYVTYDILQCPED
       .  :..     :: .  . .. :  :  :.. .: . . .:: :   
CCDS83 VDAVYEKNGYIYFFNGPIQFEYSIWS--NRIVRV-MPANSILWC   
              440       450         460        470    

>>CCDS8321.1 MMP10 gene_id:4319|Hs108|chr11               (476 aa)
 initn: 980 init1: 564 opt: 603  Z-score: 339.4  bits: 72.7 E(32554): 1.4e-12
Smith-Waterman score: 657; 28.6% identity (43.8% similar) in 676 aa overlap (9-673:7-448)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MSLWQPLVLVLLVLGCCFAAPRQRQSTLVLFPGDLRTNLTDRQLAEEYLYRYGYTRVAEM
               :::: :  : : :         . :  . . ....::..:: .: :.   ..
CCDS83   MMHLAFLVLLCLPVCSAYP---------LSGAAKEEDSNKDLAQQYLEKY-YNLEKDV
                 10                 20        30        40         

                   70        80        90       100       110      
pF1KB9 ----RGESKSLGPALLLLQKQLSLPETGELDSATLKAMRTPRCGVPDLGRFQTFEGDLKW
           : .:. .   .  .:: :.:  ::.::. ::..:: :::::::.:.:..: :  ::
CCDS83 KQFRRKDSNLIVKKIQGMQKFLGLEVTGKLDTDTLEVMRKPRCGVPDVGHFSSFPGMPKW
       50        60        70        80        90       100        

        120       130       140       150       160       170      
pF1KB9 HHHNITYWIQNYSEDLPRAVIDDAFARAFALWSAVTPLTFTRVYSRDADIVIQFGVAEHG
       .. ..:: : ::. :::: ..:.:. .:. .:  ::::::.:.:  .:::.:.:.: :::
CCDS83 RKTHLTYRIVNYTPDLPRDAVDSAIEKALKVWEEVTPLTFSRLYEGEADIMISFAVKEHG
      110       120       130       140       150       160        

        180       190       200       210       220       230      
pF1KB9 DGYPFDGKDGLLAHAFPPGPGIQGDAHFDDDELWSLGKGVVVPTRFGNADGAACHFPFIF
       : : :::    ::::.:::::. :: :::::: :                          
CCDS83 DFYSFDGPGHSLAHAYPPGPGLYGDIHFDDDEKW--------------------------
      170       180       190       200                            

        240       250       260       270       280       290      
pF1KB9 EGRSYSACTTDGRSDGLPWCSTTANYDTDDRFGFCPSERLYTRDGNADGKPCQFPFIFQG
                                                :.:..              
CCDS83 -----------------------------------------TEDAS--------------
                                                                   

        300       310       320       330       340       350      
pF1KB9 QSYSACTTDGRSDGYRWCATTANYDRDKLFGFCPTRADSTVMGGNSAGELCVFPFTFLGK
                                                                   
CCDS83 ------------------------------------------------------------
                                                                   

        360       370       380       390       400       410      
pF1KB9 EYSTCTSEGRGDGRLWCATTSNFDSDKKWGFCPDQGYSLFLVAAHEFGHALGLDHSSVPE
                                          : .::::::::.::.::: ::.  :
CCDS83 -----------------------------------GTNLFLVAAHELGHSLGLFHSANTE
                                          210       220       230  

        420        430         440       450       460       470   
pF1KB9 ALMYPMYR-FTEGPP--LHKDDVNGIRHLYGPRPEPEPRPPTTTTPQPTAPPTVCPTGPP
       :::::.:  :::     : .::::::. ::::       ::..:  .: .:    :.:  
CCDS83 ALMYPLYNSFTELAQFRLSQDDVNGIQSLYGP-------PPASTE-EPLVPTKSVPSG--
            240       250       260              270        280    

           480       490       500       510       520       530   
pF1KB9 TVHPSERPTAGPTGPPSAGPTGPPTAGPSTATTVPLSPVDDACNVNIFDAIAEIGNQLYL
           :: :                            .  : : .   ::::. . ..  .
CCDS83 ----SEMP----------------------------AKCDPALS---FDAISTLRGEYLF
                                            290          300       

           540       550        560       570       580       590  
pF1KB9 FKDGKYWRFSEGRGSRPQGPF-LIADKWPALPRKLDSVFEEPLSKKLFFFSGRQVWVYTG
       :::  .:: :.     :.  : ::.  ::.::  ::...:      .:.:.: . :.  :
CCDS83 FKDRYFWRRSHWN---PEPEFHLISAFWPSLPSYLDAAYEVNSRDTVFIFKGNEFWAIRG
       310       320          330       340       350       360    

              600       610       620        630       640         
pF1KB9 ASVLG--PRRLDKLGLGADVAQVTGALRSG-RGKMLLFSGRRLWRFDVKAQMVDPRSASE
         : .  :: .  ::.   . .. .:. .  . :  .:.. . :::: ..: ..      
CCDS83 NEVQAGYPRGIHTLGFPPTIRKIDAAVSDKEKKKTYFFAADKYWRFDENSQSMEQGFPRL
          370       380       390       400       410       420    

     650       660       670       680       690       700       
pF1KB9 VDRMFPGVPLDTHDVFQYREKAYFCQDRFYWRVSSRSELNQVDQVGYVTYDILQCPED
       .   ::::   .  :.:     ::                                  
CCDS83 IADDFPGVEPKVDAVLQAFGFFYFFSGSSQFEFDPNARMVTHILKSNSWLHC      
          430       440       450       460       470            

>>CCDS8322.1 MMP1 gene_id:4312|Hs108|chr11                (469 aa)
 initn: 904 init1: 527 opt: 580  Z-score: 327.5  bits: 70.5 E(32554): 6.4e-12
Smith-Waterman score: 580; 48.6% identity (71.9% similar) in 185 aa overlap (31-211:20-204)

               10        20        30        40        50          
pF1KB9 MSLWQPLVLVLLVLGCCFAAPRQRQSTLVLFPGDLRTNLTDRQLAEEYLYRY----GYTR
                                     ::. :.:.  : .:...:: .:    .  :
CCDS83            MHSFPPLLLLLFWGVVSHSFPATLETQEQDVDLVQKYLEKYYNLKNDGR
                          10        20        30        40         

         60        70        80        90       100       110      
pF1KB9 VAEMRGESKSLGPALLLLQKQLSLPETGELDSATLKAMRTPRCGVPDLGRFQTFEGDLKW
        .: : .:  .   :  .:. ..:  ::. :. :::.:. :::::::...:   ::. .:
CCDS83 QVEKRRNSGPVVEKLKQMQEFFGLKVTGKPDAETLKVMKQPRCGVPDVAQFVLTEGNPRW
      50        60        70        80        90       100         

        120       130       140       150       160       170      
pF1KB9 HHHNITYWIQNYSEDLPRAVIDDAFARAFALWSAVTPLTFTRVYSRDADIVIQFGVAEHG
       .. ..:: :.::. ::::: .: :. .:: ::: :::::::.:   .:::.:.:  ..: 
CCDS83 EQTHLTYRIENYTPDLPRADVDHAIEKAFQLWSNVTPLTFTKVSEGQADIMISFVRGDHR
     110       120       130       140       150       160         

        180       190       200       210       220       230      
pF1KB9 DGYPFDGKDGLLAHAFPPGPGIQGDAHFDDDELWSLGKGVVVPTRFGNADGAACHFPFIF
       :. ::::  : ::::: ::::: ::::::.:: :.                         
CCDS83 DNSPFDGPGGNLAHAFQPGPGIGGDAHFDEDERWTNNFREYNLHRVAAHELGHSLGLSHS
     170       180       190       200       210       220         

        240       250       260       270       280       290      
pF1KB9 EGRSYSACTTDGRSDGLPWCSTTANYDTDDRFGFCPSERLYTRDGNADGKPCQFPFIFQG
                                                                   
CCDS83 TDIGALMYPSYTFSGDVQLAQDDIDGIQAIYGRSQNPVQPIGPQTPKACDSKLTFDAITT
     230       240       250       260       270       280         




707 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Sat Nov  5 15:02:52 2016 done: Sat Nov  5 15:02:53 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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