Result of FASTA (omim) for pF1KB7319
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB7319, 839 aa
  1>>>pF1KB7319 839 - 839 aa - 839 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.8745+/-0.000453; mu= 23.7189+/- 0.028
 mean_var=77.2629+/-15.950, 0's: 0 Z-trim(110.5): 138  B-trim: 625 in 1/52
 Lambda= 0.145911
 statistics sampled from 18675 (18838) to 18675 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.566), E-opt: 0.2 (0.221), width:  16
 Scan time: 10.740

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_689418 (OMIM: 606226) taste receptor type 1 mem ( 839) 5677 1205.6       0
NP_619642 (OMIM: 606225) taste receptor type 1 mem ( 841) 1841 398.1 8.8e-110
XP_016857891 (OMIM: 606225) PREDICTED: taste recep ( 843) 1749 378.7  6e-104
XP_011540505 (OMIM: 606225) PREDICTED: taste recep ( 763) 1715 371.5  8e-102
NP_689414 (OMIM: 605865) taste receptor type 1 mem ( 852) 1402 305.7 5.9e-82
XP_011540508 (OMIM: 606225) PREDICTED: taste recep ( 580) 1122 246.6 2.5e-64
XP_016857924 (OMIM: 605865) PREDICTED: taste recep ( 894)  986 218.1 1.4e-55
XP_016857925 (OMIM: 605865) PREDICTED: taste recep ( 893)  977 216.2 5.2e-55
NP_803884 (OMIM: 606225) taste receptor type 1 mem ( 587)  937 207.6 1.3e-52
XP_016857892 (OMIM: 606225) PREDICTED: taste recep ( 589)  937 207.6 1.3e-52
XP_016861760 (OMIM: 604099) PREDICTED: metabotropi ( 872)  814 181.9 1.1e-44
NP_000830 (OMIM: 604099) metabotropic glutamate re ( 872)  814 181.9 1.1e-44
NP_000831 (OMIM: 601115) metabotropic glutamate re ( 879)  801 179.2 7.3e-44
XP_005247894 (OMIM: 145980,239200,601198,601199,61 ( 917)  772 173.1 5.2e-42
NP_000379 (OMIM: 145980,239200,601198,601199,61289 (1078)  772 173.2 5.8e-42
XP_006713852 (OMIM: 145980,239200,601198,601199,61 (1078)  772 173.2 5.8e-42
XP_016862813 (OMIM: 145980,239200,601198,601199,61 (1078)  772 173.2 5.8e-42
XP_016862814 (OMIM: 145980,239200,601198,601199,61 (1078)  772 173.2 5.8e-42
NP_001171536 (OMIM: 145980,239200,601198,601199,61 (1088)  667 151.1 2.6e-35
NP_000833 (OMIM: 604102) metabotropic glutamate re (1180)  666 150.9 3.2e-35
XP_016873116 (OMIM: 604102) PREDICTED: metabotropi (1180)  666 150.9 3.2e-35
XP_006718891 (OMIM: 604102) PREDICTED: metabotropi (1212)  666 150.9 3.3e-35
XP_011541094 (OMIM: 604102) PREDICTED: metabotropi (1212)  666 150.9 3.3e-35
NP_001137303 (OMIM: 604102) metabotropic glutamate (1212)  666 150.9 3.3e-35
NP_001243741 (OMIM: 604100) metabotropic glutamate ( 743)  658 149.0 7.5e-35
XP_016866282 (OMIM: 604100) PREDICTED: metabotropi ( 779)  658 149.0 7.7e-35
NP_001243742 (OMIM: 604100) metabotropic glutamate ( 779)  658 149.0 7.7e-35
XP_016866281 (OMIM: 604100) PREDICTED: metabotropi ( 832)  658 149.0 8.1e-35
NP_001264995 (OMIM: 604473,614831) metabotropic gl ( 906)  654 148.2 1.5e-34
XP_016866275 (OMIM: 604473,614831) PREDICTED: meta ( 906)  654 148.2 1.5e-34
NP_001264994 (OMIM: 604473,614831) metabotropic gl ( 906)  654 148.2 1.5e-34
XP_016866276 (OMIM: 604473,614831) PREDICTED: meta ( 906)  654 148.2 1.5e-34
XP_016866274 (OMIM: 604473,614831) PREDICTED: meta ( 906)  654 148.2 1.5e-34
XP_011514393 (OMIM: 601116) PREDICTED: metabotropi ( 908)  654 148.2 1.5e-34
NP_001120795 (OMIM: 601116) metabotropic glutamate ( 908)  654 148.2 1.5e-34
XP_011514394 (OMIM: 601116) PREDICTED: metabotropi ( 908)  654 148.2 1.5e-34
XP_006716001 (OMIM: 601116) PREDICTED: metabotropi ( 908)  654 148.2 1.5e-34
NP_000836 (OMIM: 601116) metabotropic glutamate re ( 908)  654 148.2 1.5e-34
NP_001264996 (OMIM: 604473,614831) metabotropic gl ( 908)  654 148.2 1.5e-34
XP_016867563 (OMIM: 601116) PREDICTED: metabotropi ( 908)  654 148.2 1.5e-34
XP_016866273 (OMIM: 604473,614831) PREDICTED: meta (1194)  654 148.4 1.9e-34
XP_016866272 (OMIM: 604473,614831) PREDICTED: meta (1194)  654 148.4 1.9e-34
XP_011534084 (OMIM: 604473,614831) PREDICTED: meta (1194)  654 148.4 1.9e-34
NP_001264993 (OMIM: 604473,614831) metabotropic gl (1194)  654 148.4 1.9e-34
XP_016866279 (OMIM: 604100) PREDICTED: metabotropi ( 912)  618 140.7   3e-32
XP_016866280 (OMIM: 604100) PREDICTED: metabotropi ( 912)  618 140.7   3e-32
NP_000832 (OMIM: 604100) metabotropic glutamate re ( 912)  618 140.7   3e-32
XP_016865965 (OMIM: 613572) PREDICTED: G-protein c ( 558)  605 137.7 1.4e-31
NP_001273284 (OMIM: 613572) G-protein coupled rece ( 855)  605 137.9 1.9e-31
NP_683766 (OMIM: 613572) G-protein coupled recepto ( 926)  605 137.9   2e-31


>>NP_689418 (OMIM: 606226) taste receptor type 1 member   (839 aa)
 initn: 5677 init1: 5677 opt: 5677  Z-score: 6456.0  bits: 1205.6 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 5677; 100.0% identity (100.0% similar) in 839 aa overlap (1-839:1-839)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MGPRAKTISSLFFLLWVLAEPAENSDFYLPGDYLLGGLFSLHANMKGIVHLNFLQVPMCK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_689 MGPRAKTISSLFFLLWVLAEPAENSDFYLPGDYLLGGLFSLHANMKGIVHLNFLQVPMCK
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB7 EYEVKVIGYNLMQAMRFAVEEINNDSSLLPGVLLGYEIVDVCYISNNVQPVLYFLAHEDN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_689 EYEVKVIGYNLMQAMRFAVEEINNDSSLLPGVLLGYEIVDVCYISNNVQPVLYFLAHEDN
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB7 LLPIQEDYSNYISRVVAVIGPDNSESVMTVANFLSLFLLPQITYSAISDELRDKVRFPAL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_689 LLPIQEDYSNYISRVVAVIGPDNSESVMTVANFLSLFLLPQITYSAISDELRDKVRFPAL
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB7 LRTTPSADHHIEAMVQLMLHFRWNWIIVLVSSDTYGRDNGQLLGERVARRDICIAFQETL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_689 LRTTPSADHHIEAMVQLMLHFRWNWIIVLVSSDTYGRDNGQLLGERVARRDICIAFQETL
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB7 PTLQPNQNMTSEERQRLVTIVDKLQQSTARVVVVFSPDLTLYHFFNEVLRQNFTGAVWIA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_689 PTLQPNQNMTSEERQRLVTIVDKLQQSTARVVVVFSPDLTLYHFFNEVLRQNFTGAVWIA
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB7 SESWAIDPVLHNLTELRHLGTFLGITIQSVPIPGFSEFREWGPQAGPPPLSRTSQSYTCN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_689 SESWAIDPVLHNLTELRHLGTFLGITIQSVPIPGFSEFREWGPQAGPPPLSRTSQSYTCN
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB7 QECDNCLNATLSFNTILRLSGERVVYSVYSAVYAVAHALHSLLGCDKSTCTKRVVYPWQL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_689 QECDNCLNATLSFNTILRLSGERVVYSVYSAVYAVAHALHSLLGCDKSTCTKRVVYPWQL
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB7 LEEIWKVNFTLLDHQIFFDPQGDVALHLEIVQWQWDRSQNPFQSVASYYPLQRQLKNIQD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_689 LEEIWKVNFTLLDHQIFFDPQGDVALHLEIVQWQWDRSQNPFQSVASYYPLQRQLKNIQD
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB7 ISWHTINNTIPMSMCSKRCQSGQKKKPVGIHVCCFECIDCLPGTFLNHTEDEYECQACPN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_689 ISWHTINNTIPMSMCSKRCQSGQKKKPVGIHVCCFECIDCLPGTFLNHTEDEYECQACPN
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB7 NEWSYQSETSCFKRQLVFLEWHEAPTIAVALLAALGFLSTLAILVIFWRHFQTPIVRSAG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_689 NEWSYQSETSCFKRQLVFLEWHEAPTIAVALLAALGFLSTLAILVIFWRHFQTPIVRSAG
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB7 GPMCFLMLTLLLVAYMVVPVYVGPPKVSTCLCRQALFPLCFTICISCIAVRSFQIVCAFK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_689 GPMCFLMLTLLLVAYMVVPVYVGPPKVSTCLCRQALFPLCFTICISCIAVRSFQIVCAFK
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB7 MASRFPRAYSYWVRYQGPYVSMAFITVLKMVIVVIGMLATGLSPTTRTDPDDPKITIVSC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_689 MASRFPRAYSYWVRYQGPYVSMAFITVLKMVIVVIGMLATGLSPTTRTDPDDPKITIVSC
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KB7 NPNYRNSLLFNTSLDLLLSVVGFSFAYMGKELPTNYNEAKFITLSMTFYFTSSVSLCTFM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_689 NPNYRNSLLFNTSLDLLLSVVGFSFAYMGKELPTNYNEAKFITLSMTFYFTSSVSLCTFM
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830         
pF1KB7 SAYSGVLVTIVDLLVTVLNLLAISLGYFGPKCYMILFYPERNTPAYFNSMIQGYTMRRD
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_689 SAYSGVLVTIVDLLVTVLNLLAISLGYFGPKCYMILFYPERNTPAYFNSMIQGYTMRRD
              790       800       810       820       830         

>>NP_619642 (OMIM: 606225) taste receptor type 1 member   (841 aa)
 initn: 1349 init1: 583 opt: 1841  Z-score: 2091.9  bits: 398.1 E(85289): 8.8e-110
Smith-Waterman score: 1841; 37.5% identity (65.5% similar) in 833 aa overlap (16-837:19-837)

                  10         20         30        40        50     
pF1KB7    MGPRAKTISSLFFLLWVLA-EPAENS-DFYLPGDYLLGGLFSLHANMKGIVHLNFLQ
                         :..: . .:.: :: :::::::.::: ::..   . :    .
NP_619 MLLCTARLVGLQLLISCCWAFACHSTESSPDFTLPGDYLLAGLFPLHSGCLQVRHRP--E
               10        20        30        40        50          

           60        70        80        90       100       110    
pF1KB7 VPMC-KEYEVKVIGYNLMQAMRFAVEEINNDSSLLPGVLLGYEIVDVCYISNNVQPVLYF
       : .: .    .  ::.:.::::..::::::...:::.. :::.. :::  : ::  .:  
NP_619 VTLCDRSCSFNEHGYHLFQAMRLGVEEINNSTALLPNITLGYQLYDVCSDSANVYATLRV
       60        70        80        90       100       110        

           120       130       140       150       160       170   
pF1KB7 LAHE-DNLLPIQEDYSNYISRVVAVIGPDNSESVMTVANFLSLFLLPQITYSAISDELRD
       :.   .. . .: :  .:   :.::::::... . :.: .:: ::.:.:.:.: :. :  
NP_619 LSLPGQHHIELQGDLLHYSPTVLAVIGPDSTNRAATTAALLSPFLVPMISYAASSETLSV
      120       130       140       150       160       170        

           180       190       200       210       220       230   
pF1KB7 KVRFPALLRTTPSADHHIEAMVQLMLHFRWNWIIVLVSSDTYGRDNGQLLGERVARRDIC
       : ..:..::: :.  ...:.:: :. .: :.:: .. ::: ::. . : : .... . ::
NP_619 KRQYPSFLRTIPNDKYQVETMVLLLQKFGWTWISLVGSSDDYGQLGVQALENQATGQGIC
      180       190       200       210       220       230        

           240       250       260       270       280       290   
pF1KB7 IAFQETLPTLQPNQNMTSEERQRLVTIVDKLQQSTARVVVVFSPDLTLYHFFNEVLRQNF
       :::.. .:     . ....::..   .. .: :. : ::::::       ::. :.  :.
NP_619 IAFKDIMPF----SAQVGDERMQ--CLMRHLAQAGATVVVVFSSRQLARVFFESVVLTNL
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       .: .   ::: ::::.::  :. :.  .:.. :: :: :    
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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