Result of FASTA (ccds) for pF1KB7319
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB7319, 839 aa
  1>>>pF1KB7319 839 - 839 aa - 839 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3698+/-0.00105; mu= 20.9084+/- 0.063
 mean_var=74.1290+/-15.297, 0's: 0 Z-trim(104.2): 60  B-trim: 0 in 0/47
 Lambda= 0.148964
 statistics sampled from 7704 (7758) to 7704 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.588), E-opt: 0.2 (0.238), width:  16
 Scan time:  3.130

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS187.1 TAS1R2 gene_id:80834|Hs108|chr1          ( 839) 5677 1230.1       0
CCDS81.1 TAS1R1 gene_id:80835|Hs108|chr1           ( 841) 1841 405.7 1.7e-112
CCDS30556.1 TAS1R3 gene_id:83756|Hs108|chr1        ( 852) 1401 311.2   5e-84
CCDS82.1 TAS1R1 gene_id:80835|Hs108|chr1           ( 587)  937 211.3 3.9e-54
CCDS2834.1 GRM2 gene_id:2912|Hs108|chr3            ( 872)  814 185.0 4.8e-46
CCDS5600.1 GRM3 gene_id:2913|Hs108|chr7            ( 879)  801 182.2 3.4e-45
CCDS3010.1 CASR gene_id:846|Hs108|chr3             (1078)  772 176.0   3e-43
CCDS54632.1 CASR gene_id:846|Hs108|chr3            (1088)  667 153.5 1.9e-36
CCDS8283.1 GRM5 gene_id:2915|Hs108|chr11           (1180)  666 153.3 2.3e-36
CCDS44694.1 GRM5 gene_id:2915|Hs108|chr11          (1212)  666 153.3 2.4e-36
CCDS59011.1 GRM4 gene_id:2914|Hs108|chr6           ( 743)  658 151.4 5.2e-36
CCDS59010.1 GRM4 gene_id:2914|Hs108|chr6           ( 779)  658 151.5 5.4e-36
CCDS47497.1 GRM1 gene_id:2911|Hs108|chr6           ( 906)  654 150.6 1.1e-35
CCDS47696.1 GRM8 gene_id:2918|Hs108|chr7           ( 908)  654 150.6 1.1e-35
CCDS5794.1 GRM8 gene_id:2918|Hs108|chr7            ( 908)  654 150.6 1.1e-35
CCDS64548.1 GRM1 gene_id:2911|Hs108|chr6           ( 908)  654 150.6 1.1e-35
CCDS5209.1 GRM1 gene_id:2911|Hs108|chr6            (1194)  654 150.7 1.4e-35
CCDS4787.1 GRM4 gene_id:2914|Hs108|chr6            ( 912)  618 142.9 2.4e-33
CCDS69184.1 GPRC6A gene_id:222545|Hs108|chr6       ( 855)  605 140.1 1.6e-32
CCDS5112.1 GPRC6A gene_id:222545|Hs108|chr6        ( 926)  605 140.1 1.7e-32
CCDS43042.1 GRM7 gene_id:2917|Hs108|chr3           ( 915)  580 134.7 6.9e-31
CCDS59012.1 GRM4 gene_id:2914|Hs108|chr6           ( 796)  565 131.5 5.8e-30
CCDS4442.1 GRM6 gene_id:2916|Hs108|chr5            ( 877)  546 127.4 1.1e-28
CCDS69185.1 GPRC6A gene_id:222545|Hs108|chr6       ( 751)  534 124.8 5.6e-28
CCDS75432.1 GRM4 gene_id:2914|Hs108|chr6           ( 865)  424 101.2 8.1e-21


>>CCDS187.1 TAS1R2 gene_id:80834|Hs108|chr1               (839 aa)
 initn: 5677 init1: 5677 opt: 5677  Z-score: 6588.5  bits: 1230.1 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 5677; 100.0% identity (100.0% similar) in 839 aa overlap (1-839:1-839)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MGPRAKTISSLFFLLWVLAEPAENSDFYLPGDYLLGGLFSLHANMKGIVHLNFLQVPMCK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 MGPRAKTISSLFFLLWVLAEPAENSDFYLPGDYLLGGLFSLHANMKGIVHLNFLQVPMCK
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB7 EYEVKVIGYNLMQAMRFAVEEINNDSSLLPGVLLGYEIVDVCYISNNVQPVLYFLAHEDN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 EYEVKVIGYNLMQAMRFAVEEINNDSSLLPGVLLGYEIVDVCYISNNVQPVLYFLAHEDN
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB7 LLPIQEDYSNYISRVVAVIGPDNSESVMTVANFLSLFLLPQITYSAISDELRDKVRFPAL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 LLPIQEDYSNYISRVVAVIGPDNSESVMTVANFLSLFLLPQITYSAISDELRDKVRFPAL
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB7 LRTTPSADHHIEAMVQLMLHFRWNWIIVLVSSDTYGRDNGQLLGERVARRDICIAFQETL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 LRTTPSADHHIEAMVQLMLHFRWNWIIVLVSSDTYGRDNGQLLGERVARRDICIAFQETL
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB7 PTLQPNQNMTSEERQRLVTIVDKLQQSTARVVVVFSPDLTLYHFFNEVLRQNFTGAVWIA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 PTLQPNQNMTSEERQRLVTIVDKLQQSTARVVVVFSPDLTLYHFFNEVLRQNFTGAVWIA
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB7 SESWAIDPVLHNLTELRHLGTFLGITIQSVPIPGFSEFREWGPQAGPPPLSRTSQSYTCN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 SESWAIDPVLHNLTELRHLGTFLGITIQSVPIPGFSEFREWGPQAGPPPLSRTSQSYTCN
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB7 QECDNCLNATLSFNTILRLSGERVVYSVYSAVYAVAHALHSLLGCDKSTCTKRVVYPWQL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 QECDNCLNATLSFNTILRLSGERVVYSVYSAVYAVAHALHSLLGCDKSTCTKRVVYPWQL
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB7 LEEIWKVNFTLLDHQIFFDPQGDVALHLEIVQWQWDRSQNPFQSVASYYPLQRQLKNIQD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 LEEIWKVNFTLLDHQIFFDPQGDVALHLEIVQWQWDRSQNPFQSVASYYPLQRQLKNIQD
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB7 ISWHTINNTIPMSMCSKRCQSGQKKKPVGIHVCCFECIDCLPGTFLNHTEDEYECQACPN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 ISWHTINNTIPMSMCSKRCQSGQKKKPVGIHVCCFECIDCLPGTFLNHTEDEYECQACPN
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB7 NEWSYQSETSCFKRQLVFLEWHEAPTIAVALLAALGFLSTLAILVIFWRHFQTPIVRSAG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 NEWSYQSETSCFKRQLVFLEWHEAPTIAVALLAALGFLSTLAILVIFWRHFQTPIVRSAG
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB7 GPMCFLMLTLLLVAYMVVPVYVGPPKVSTCLCRQALFPLCFTICISCIAVRSFQIVCAFK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 GPMCFLMLTLLLVAYMVVPVYVGPPKVSTCLCRQALFPLCFTICISCIAVRSFQIVCAFK
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB7 MASRFPRAYSYWVRYQGPYVSMAFITVLKMVIVVIGMLATGLSPTTRTDPDDPKITIVSC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 MASRFPRAYSYWVRYQGPYVSMAFITVLKMVIVVIGMLATGLSPTTRTDPDDPKITIVSC
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KB7 NPNYRNSLLFNTSLDLLLSVVGFSFAYMGKELPTNYNEAKFITLSMTFYFTSSVSLCTFM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 NPNYRNSLLFNTSLDLLLSVVGFSFAYMGKELPTNYNEAKFITLSMTFYFTSSVSLCTFM
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830         
pF1KB7 SAYSGVLVTIVDLLVTVLNLLAISLGYFGPKCYMILFYPERNTPAYFNSMIQGYTMRRD
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 SAYSGVLVTIVDLLVTVLNLLAISLGYFGPKCYMILFYPERNTPAYFNSMIQGYTMRRD
              790       800       810       820       830         

>>CCDS81.1 TAS1R1 gene_id:80835|Hs108|chr1                (841 aa)
 initn: 1349 init1: 583 opt: 1841  Z-score: 2133.2  bits: 405.7 E(32554): 1.7e-112
Smith-Waterman score: 1841; 37.5% identity (65.5% similar) in 833 aa overlap (16-837:19-837)

                  10         20         30        40        50     
pF1KB7    MGPRAKTISSLFFLLWVLA-EPAENS-DFYLPGDYLLGGLFSLHANMKGIVHLNFLQ
                         :..: . .:.: :: :::::::.::: ::..   . :    .
CCDS81 MLLCTARLVGLQLLISCCWAFACHSTESSPDFTLPGDYLLAGLFPLHSGCLQVRHRP--E
               10        20        30        40        50          

           60        70        80        90       100       110    
pF1KB7 VPMC-KEYEVKVIGYNLMQAMRFAVEEINNDSSLLPGVLLGYEIVDVCYISNNVQPVLYF
       : .: .    .  ::.:.::::..::::::...:::.. :::.. :::  : ::  .:  
CCDS81 VTLCDRSCSFNEHGYHLFQAMRLGVEEINNSTALLPNITLGYQLYDVCSDSANVYATLRV
       60        70        80        90       100       110        

           120       130       140       150       160       170   
pF1KB7 LAHE-DNLLPIQEDYSNYISRVVAVIGPDNSESVMTVANFLSLFLLPQITYSAISDELRD
       :.   .. . .: :  .:   :.::::::... . :.: .:: ::.:.:.:.: :. :  
CCDS81 LSLPGQHHIELQGDLLHYSPTVLAVIGPDSTNRAATTAALLSPFLVPMISYAASSETLSV
      120       130       140       150       160       170        

           180       190       200       210       220       230   
pF1KB7 KVRFPALLRTTPSADHHIEAMVQLMLHFRWNWIIVLVSSDTYGRDNGQLLGERVARRDIC
       : ..:..::: :.  ...:.:: :. .: :.:: .. ::: ::. . : : .... . ::
CCDS81 KRQYPSFLRTIPNDKYQVETMVLLLQKFGWTWISLVGSSDDYGQLGVQALENQATGQGIC
      180       190       200       210       220       230        

           240       250       260       270       280       290   
pF1KB7 IAFQETLPTLQPNQNMTSEERQRLVTIVDKLQQSTARVVVVFSPDLTLYHFFNEVLRQNF
       :::.. .:     . ....::..   .. .: :. : ::::::       ::. :.  :.
CCDS81 IAFKDIMPF----SAQVGDERMQ--CLMRHLAQAGATVVVVFSSRQLARVFFESVVLTNL
      240           250         260       270       280       290  

           300       310       320       330       340          350
pF1KB7 TGAVWIASESWAIDPVLHNLTELRHLGTFLGITIQSVPIPGFSEFREWGPQA---GPPPL
       :: ::.:::.::..  . ..  ....:  ::..::.  .::.. :.:   .:   .: : 
CCDS81 TGKVWVASEAWALSRHITGVPGIQRIGMVLGVAIQKRAVPGLKAFEEAYARADKKAPRPC
            300       310       320       330       340       350  

              360       370       380       390       400       410
pF1KB7 SRTSQSYTCNQECDNCLNATLSFNTILRLSGERVVYSVYSAVYAVAHALHSLLGCDKSTC
        . :   . :: : .:          :.  .   .:..: :::::::.::.:::: ...:
CCDS81 HKGSWC-SSNQLCRECQAFMAHTMPKLKAFSMSSAYNAYRAVYAVAHGLHQLLGCASGAC
             360       370       380       390       400       410 

              420       430       440       450       460          
pF1KB7 TKRVVYPWQLLEEIWKVNFTLLDHQIFFDPQGDVALHLEIVQWQWDRSQNPFQSVAS--Y
       ..  ::::::::.: ::.: :    . :. . :     .:. :.:.  .  :  ..:  .
CCDS81 SRGRVYPWQLLEQIHKVHFLLHKDTVAFNDNRDPLSSYNIIAWDWNGPKWTFTVLGSSTW
             420       430       440       450       460       470 

      470       480       490       500       510       520        
pF1KB7 YPLQRQLKNIQDISWHTINNTIPMSMCSKRCQSGQKKKPVGIHVCCFECIDCLPGTFLNH
        :.: .. :   :.::  .: .: :.::. :  :...  .:.: :::::. :  :::::.
CCDS81 SPVQLNI-NETKIQWHGKDNQVPKSVCSSDCLEGHQRVVTGFHHCCFECVPCGAGTFLNK
              480       490       500       510       520       530

      530       540       550       560       570       580        
pF1KB7 TEDEYECQACPNNEWSYQSETSCFKRQLVFLEWHEAPTIAVALLAALGFLSTLAILVIFW
       . : :.:: : ..::. ..  .:: : .:::  .:  . ..    .: .:  :.   .: 
CCDS81 S-DLYRCQPCGKEEWAPEGSQTCFPRTVVFLALREHTSWVLLAANTLLLLLLLGTAGLFA
               540       550       560       570       580         

      590       600       610       620       630       640        
pF1KB7 RHFQTPIVRSAGGPMCFLMLTLLLVAYMVVPVYVGPPKVSTCLCRQALFPLCFTICISCI
        :..::.:::::: .:::::  : ..   .  . : :   .:: ::::: : ::: .::.
CCDS81 WHLDTPVVRSAGGRLCFLMLGSLAAGSGSLYGFFGEPTRPACLLRQALFALGFTIFLSCL
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pF1KB7 AVRSFQIVCAFKMASRFPRAYSYWVRYQGPYVSMAFITVLKMVIVVIGMLATGLSPTTRT
       .:::::..  ::.... :  :  ::. .:  . . . .. ...: .  ...    :. : 
CCDS81 TVRSFQLIIIFKFSTKVPTFYHAWVQNHGAGLFVMISSAAQLLICLTWLVVWTPLPA-RE
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           :..... :. .  ::: :  ..  . :::. .:. .:.::.:: :::::: .:.:.
CCDS81 YQRFPHLVMLECTET--NSLGFILAFLYNGLLSISAFACSYLGKDLPENYNEAKCVTFSL
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pF1KB7 TFYFTSSVSLCTFMSAYSGVLVTIVDLLVTVLNLLAISLGYFGPKCYMILFYPERNTPAY
        : :.: ... :  :.:.:  .  ..... . .: .   ::: ::::.::  :. :.  .
CCDS81 LFNFVSWIAFFTTASVYDGKYLPAANMMAGLSSLSSGFGGYFLPKCYVILCRPDLNSTEH
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CCDS30 RPSSPVCTRFSSNGLLWAL--AMKMAVEEINNKSDLLPGLRLGYDLFDTCSEPVVAMKPS
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CCDS30 LMFLAKAGSRDIAAYCNYTQYQPRVLAVIGPHSSELAMVTGKFFSFFLMPQVSYGASMEL
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CCDS30 LSARETFPSFFRTVPSDRVQLTAAAELLQEFGWNWVAALGSDDEYGRQGLSIFSALAAAR
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pF1KB7 DICIAFQETLPTLQPNQNMTSEERQRLVTIVDKLQQSTARVVVVFSPDLTLYHFFNEVLR
        :::: .  .:  . ...  .    ..  .. ...::...::..:.   . . .::  . 
CCDS30 GICIAHEGLVPLPRADDSRLG----KVQDVLHQVNQSSVQVVLLFASVHAAHALFNYSIS
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CCDS30 SRLSPKVWVASEAWLTSDLVMGLPGMAQMGTVLGFLQRGAQLHEFPQYVKTHLALATDPA
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pF1KB7 ----LSRTSQSY---TCNQECDNCLNATLSFNTILRLSGERVVYSVYSAVYAVAHALHSL
           :..  :.    . .:.: .:   ::. :.   :. ... .:::.:::.::.:::. 
CCDS30 FCSALGEREQGLEEDVVGQRCPQCDCITLQ-NVSAGLNHHQT-FSVYAAVYSVAQALHNT
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pF1KB7 LGCDKSTC-TKRVVYPWQLLEEIWKVNFTLLDHQIFFDPQGDVALHLEIVQWQWDRSQNP
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CCDS30 LQCNASGCPAQDPVKPWQLLENMYNLTFHVGGLPLRFDSSGNVDMEYDLKLWVWQGSVPR
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pF1KB7 FQSVASYYPLQRQLKNIQDISWHTINNTIPMSMCSKRCQSGQKKKPVGIHVCCFECIDCL
       ...:. .    :  .    : ::: .:  :.: ::..:: :: ..  :.: ::..:.:: 
CCDS30 LHDVGRFNGSLRTER--LKIRWHTSDNQKPVSRCSRQCQEGQVRRVKGFHSCCYDCVDCE
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CCDS30 AGSY-RQNPDDIACTFCGQDEWSPERSTRCFRRRSRFLAWGEPAVLLLLLLLSLALGLVL
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pF1KB7 AILVIFWRHFQTPIVRSAGGPM-CFLMLTLLLVAYMVVPVYVGPPKVSTCLCRQALFPLC
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CCDS30 AALGLFVHHRDSPLVQASGGPLACFGLVCLGLVCLSVL-LFPGQPSPARCLAQQPLSHLP
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       .: :.: . ... .:    ..   .    :  .:  ::.. .. . .. . ...     .
CCDS30 LTGCLSTLFLQAAEIFVESELPLSWADRLSGCLR--GPWAWLVVLLAMLVEVALCTWYLV
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pF1KB7 GLSPTTRTDPDD-PKITIVSCNPNYRNSLLFNTSLDLLLSVVGFSFAYMGKELPTNYNEA
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CCDS30 AFPPEVVTDWHMLPTEALVHCRTRSWVSFGLAHATNATLAFLCFLGTFLVRSQPGCYNRA
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pF1KB7 KFITLSMTFYFTSSVSLCTFMSAYSGVLVTIVDLLVTVLNLLAISLGYFGPKCYMILFYP
       . .:..:  :: . ::.  ...  . ::   :.. . .: .:.:  ..  :.::...  :
CCDS30 RGLTFAMLAYFITWVSFVPLLANVQVVLRPAVQMGALLLCVLGILAAFHLPRCYLLMRQP
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         ::: .:                       
CCDS30 GLNTPEFFLGGGPGDAQGQNDGNTGNQGKHE
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CCDS82 HGYHLFQAMRLGVEEINNSTALLPNITLGYQLYDVCSDSANVYATLRVLSLPGQHHI-EL
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        . .   . .. ...: :   ... :  .. :.   .:::.: ::.: :    . :. . 
CCDS82 QGDLLHYSPTVLAVIGPDSTNRAATTAALLSPFLVPMLLEQIHKVHFLLHKDTVAFNDNR
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CCDS82 DPLSSYNIIAWDWNGPKWTFTVLGSSTWSPVQLNINETK-IQWHGKDNQVPKSVCSSDCL
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pF1KB7 SGQKKKPVGIHVCCFECIDCLPGTFLNHTEDEYECQACPNNEWSYQSETSCFKRQLVFLE
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CCDS82 EGHQRVVTGFHHCCFECVPCGAGTFLNKS-DLYRCQPCGKEEWAPEGSQTCFPRTVVFLA
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CCDS82 LREHTSWVLLAANTLLLLLLLGTAGLFAWHLDTPVVRSAGGRLCFLMLGSLAAGSGSLYG
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CCDS82 FFGEPTRPACLLRQALFALGFTIFLSCLTVRSFQLIIIFKFSTKVPTFYHAWVQNHGAGL
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CCDS82 FVMISSAAQLLICLTWLVVWTPLPA-REYQRFPHLVMLECTET--NSLGFILAFLYNGLL
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CCDS82 SISAFACSYLGKDLPENYNEAKCVTFSLLFNFVSWIAFFTTASVYDGKYLPAANMMAGLS
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pF1KB7 NLLAISLGYFGPKCYMILFYPERNTPAYFNSMIQGYTMRRD  
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CCDS82 SLSSGFGGYFLPKCYVILCRPDLNSTEHFQASIQDYTRRCGST
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>>CCDS2834.1 GRM2 gene_id:2912|Hs108|chr3                 (872 aa)
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pF1KB7 MGPRAKTISSLFFLLW-VLAEPAENSDFYLPGDYLLGGLFSLHANMKGIVHLNFLQVPMC
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CCDS28   MGSLLALLALLLLWGAVAEGPAKKVLTLEGDLVLGGLFPVH--QKGGPAEDCGPV---
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pF1KB7 KEYEVKVIGYNLMQAMRFAVEEINNDSSLLPGVLLGYEIVDVCYI-SNNVQPVLYFLAHE
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CCDS28 NEHR----GIQRLEAMLFALDRINRDPHLLPGVRLGAHILDSCSKDTHALEQALDFVRAS
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pF1KB7 -----DNLLPIQEDYS-----NYISRVVAVIGPDNSESVMTVANFLSLFLLPQITYSAIS
            :.   :  : :     .  . ...::: . :.  . :::.: :: .:::.:.. :
CCDS28 LSRGADGSRHICPDGSYATHGDAPTAITGVIGGSYSDVSIQVANLLRLFQIPQISYASTS
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        .: :: :.  . ::.:    . .::....  : :... ...:   :: ..:    :  :
CCDS28 AKLSDKSRYDYFARTVPPDFFQAKAMAEILRFFNWTYVSTVASEGDYG-ETGIEAFELEA
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pF1KB7 R-RDICIAFQETLPTLQPNQNMTSEERQRLVTIVDKLQQSTARVVVVFSPDLTLYHFFNE
       : :.::.: .: .     .. :.    . .:  .  ::. .:::.:.:. .    ...  
CCDS28 RARNICVATSEKV-----GRAMSRAAFEGVVRAL--LQKPSARVAVLFTRSEDARELLAA
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         : : .. .:.::..: :.. :. . .:    :. . : . : ::  :. . .    :.
CCDS28 SQRLN-ASFTWVASDGWGALESVVAG-SEGAAEGA-ITIELASYPISDFASYFQSLDPWN
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        . .:       : . :. .  .:   .:     . .  :  .. : .::::.:::::..
CCDS28 NSRNPWFREFWEQRFRCSFRQRDCAAHSL---RAVPFEQESKIMFVVNAVYAMAHALHNM
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           : ..:  :   : :   .: .. . .:.:          ... ::  ::   . .:
CCDS28 HRALCPNTTRLCDAMRPVNGRRLYKDFVLNVKFDAPFRPADTHNEVRFDRFGDGIGRYNI
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         . .   ..  .:.:.  :  .    . . : : . . . .: : ::. : ... :.  
CCDS28 FTYLRAGSGRYRYQKVG--YWAEGLTLDTSLIPWASPSAGPLPASRCSEPCLQNEVKSVQ
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pF1KB7 GIHVCCFECIDCLPGTFLNHTEDEYECQACPNNEWSYQSETSCFKRQLVFLEWHEAPTIA
         .:::. :: : :    ..  ::. :  :  . :   : :.::.    ...: .: ...
CCDS28 PGEVCCWLCIPCQP---YEYRLDEFTCADCGLGYWPNASLTGCFELPQEYIRWGDAWAVG
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pF1KB7 VALLAALGFLSTLAILVIFWRHFQTPIVRSAGGPMCFLMLTLLLVAYMVVPVYVGPPKVS
        . .: :: :.:: .: .: ::  ::.:...:  .:...:  ... : .. .... :...
CCDS28 PVTIACLGALATLFVLGVFVRHNATPVVKASGRELCYILLGGVFLCYCMTFIFIAKPSTA
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pF1KB7 TCLCRQALFPLCFTICISCIAVRSFQIVCAFKMASRFPRAYSYWVRYQGPYVSMAFITVL
       .:  :.  .   :..: : . ... .:.  :  :    :  .   :. .:  ..:.  .:
CCDS28 VCTLRRLGLGTAFSVCYSALLTKTNRIARIFGGA----REGAQRPRFISPASQVAICLAL
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pF1KB7 ---KMVIVVIGMLATGLSPTTRTDPDDPKITIVSCNPNYRN-SLLFNTSLDLLLSVVGFS
          ...:::  ... . .   .: :.  ... . ::  .:. :.: . . ..:: ..   
CCDS28 ISGQLLIVVAWLVVEAPGTGKETAPERREVVTLRCN--HRDASMLGSLAYNVLLIALCTL
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pF1KB7 FAYMGKELPTNYNEAKFITLSMTFYFTSSVSLCTFMSAY----SGVLVTIVDLLVTVLNL
       .:.  .. : :.:::::: ..:   .:. .   .:.  .    :   :  . . :.:   
CCDS28 YAFKTRKCPENFNEAKFIGFTM---YTTCIIWLAFLPIFYVTSSDYRVQTTTMCVSVSLS
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pF1KB7 LAISLG-YFGPKCYMILFYPERNTPAYFNSMIQGYTMRRD                    
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CCDS28 GSVVLGCLFAPKLHIILFQPQKNVVSHRAPTSRFGSAAARASSSLGQGSGSQFVPTVCNG
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CCDS56 TRLQVLTLALFSKGFLLSLGDHNFLRREIKIEGDLVLGGLFPI--NEKGT------GTEE
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CCDS56 CGRIN-EDRGIQRLEAMLFAIDEINKDDYLLPGVKLGVHILDTCSRDTYALEQSLEFVRA
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CCDS56 SLTKVDEAEYMCPDGSYAIQENIPLLIAGVIGGSYSSVSIQVANLLRLFQIPQISYASTS
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pF1KB7 DELRDKVRFPALLRTTPSADHHIEAMVQLMLHFRWNWIIVLVSSDTYGRDNGQLLGERVA
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CCDS56 AKLSDKSRYDYFARTVPPDFYQAKAMAEILRFFNWTYVSTVASEGDYG-ETGIEAFEQEA
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pF1KB7 R-RDICIAFQETLPTLQPNQNMTSEERQRLVTIVDKLQQSTARVVVVFSPDLTLYHFFNE
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CCDS56 RLRNICIATAEKVGRSNIRKSYDS-------VIRELLQKPNARVVVLFMRSDDSRELIAA
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pF1KB7 VLRQNFTGAVWIASESWAIDPVLHNLTELRHLGTFLGITIQSVPIPGFSE-FREWGPQAG
       . : : .. .:.::..:. .  . . .:    :. . . . : :.  :.. :.  .:  .
CCDS56 ASRAN-ASFTWVASDGWGAQESIIKGSEHVAYGA-ITLELASQPVRQFDRYFQSLNPYNN
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pF1KB7 P-PPLSRT--SQSYTCNQE--------CDNCLNATLSFNTILRLSGERVVYSVYSAVYAV
          :  :    :.. :. .        ::. : :  : :       :  .. : .::::.
CCDS56 HRNPWFRDFWEQKFQCSLQNKRNHRRVCDKHL-AIDSSN----YEQESKIMFVVNAVYAM
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pF1KB7 AHALHSLLG--CDKST--CTK-RVVYPWQLLEE-IWKVNFTL-------LDHQIFFDPQG
       :::::..    : ..:  :   ...   .: .. . :.:::         :  . ::  :
CCDS56 AHALHKMQRTLCPNTTKLCDAMKILDGKKLYKDYLLKINFTAPFNPNKDADSIVKFDTFG
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pF1KB7 DVALHLEIVQWQWDRSQNPFQSVASYYPLQRQLKNIQDISWHTINNTIPMSMCSKRCQSG
       :   . .. ..:   ..  . .:. .        ....: :    :..: :.::  :  .
CCDS56 DGMGRYNVFNFQNVGGKYSYLKVGHWAETLSL--DVNSIHWS--RNSVPTSQCSDPCAPN
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pF1KB7 QKKKPVGIHVCCFECIDCLPGTFLNHTEDEYECQACPNNEWSYQSETSCFKRQLVFLEWH
       . :.     :::. :: : :  .:    ::. :. : ...:   . :.:.     ...:.
CCDS56 EMKNMQPGDVCCWICIPCEPYEYLA---DEFTCMDCGSGQWPTADLTGCYDLPEDYIRWE
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pF1KB7 EAPTIAVALLAALGFLSTLAILVIFWRHFQTPIVRSAGGPMCFLMLTLLLVAYMVVPVYV
       .: .:. . .: :::. :  ....: .: .::.:...:  .:...:  . ..: ..  ..
CCDS56 DAWAIGPVTIACLGFMCTCMVVTVFIKHNNTPLVKASGRELCYILLFGVGLSYCMTFFFI
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pF1KB7 GPPKVSTCLCRQALFPLCFTICISCIAVRSFQIVCAF---KMASRFPRAYSYWVRYQGPY
       . :.   :  :.  .   :.:: : . ...  :.  :   : ... :.  :       : 
CCDS56 AKPSPVICALRRLGLGSSFAICYSALLTKTNCIARIFDGVKNGAQRPKFIS-------PS
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pF1KB7 VSMAFITVLKMVIVVIGMLATGL---SPTTR--TDPDDPKITIVSCNPNYRNSLLFNTSL
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CCDS56 -SQVFIC-LGLILVQIVMVSVWLILEAPGTRRYTLAEKRETVILKCNVK-DSSMLISLTY
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pF1KB7 DLLLSVVGFSFAYMGKELPTNYNEAKFITLSMTFYFTSSVSLCTFMSAYSGVLVTIVDLL
       :..: ..   .:.  .. : :.:::::: ..:   .:. .   .:.  .    ::  :  
CCDS56 DVILVILCTVYAFKTRKCPENFNEAKFIGFTM---YTTCIIWLAFLPIF---YVTSSDYR
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pF1KB7 VTVLNL-LAISL-GY------FGPKCYMILFYPERNTPAYFNSMIQGYTMRRD       
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CCDS56 VQTTTMCISVSLSGFVVLGCLFAPKVHIILFQPQKNVVTHRLHLNRFSVSGTGTTYSQSS
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CCDS56 ASTYVPTVCNGREVLDSTTSSL
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>>CCDS3010.1 CASR gene_id:846|Hs108|chr3                  (1078 aa)
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Smith-Waterman score: 1412; 31.7% identity (61.2% similar) in 859 aa overlap (31-823:30-868)

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pF1KB7 MGPRAKTISSLFFLLWVLAEPAENSDFYLPGDYLLGGLFSLHANMKGIVHLNFLQVPM--
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CCDS30  MAFYSCCWVLLALTWHTSAYGPDQRAQKKGDIILGGLFPIHFGVAAK-DQDLKSRPESV
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pF1KB7 -CKEYEVKVIGYNLMQAMRFAVEEINNDSSLLPGVLLGYEIVDVCY-ISNNVQPVLYFLA
        : .:. .  :.  .::: ::.::::.. .:::.. :::.: :.:  .:. .. .: :.:
CCDS30 ECIRYNFR--GFRWLQAMIFAIEEINSSPALLPNLTLGYRIFDTCNTVSKALEATLSFVA
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pF1KB7 HED-NLLPIQE--DYSNYISRVVAVIGPDNSESVMTVANFLSLFLLPQITYSAISDELRD
       ..  . : ..:  . :..:  ..::.:  .:    .:::.:.:: .::..:.. :  : .
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CCDS54 QELEDEIIFITCHEGSLMALGFLIGYTCLLAAICFFFAFKSRKLPENFNEAKFITFSMLI
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CCDS82 MVLLLILSVLLLKEDVRGSAQSSERRVVAHMPGDIIIGALFSVH-HQPTVDKVHERKCGA
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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