Result of FASTA (ccds) for pF1KB6424
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB6424, 340 aa
  1>>>pF1KB6424 340 - 340 aa - 340 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.8632+/-0.0012; mu= 7.9224+/- 0.070
 mean_var=120.2302+/-25.506, 0's: 0 Z-trim(104.8): 201  B-trim: 94 in 2/47
 Lambda= 0.116968
 statistics sampled from 7849 (8083) to 7849 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.608), E-opt: 0.2 (0.248), width:  16
 Scan time:  2.340

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS3230.1 GNB4 gene_id:59345|Hs108|chr3           ( 340) 2321 403.2 1.5e-112
CCDS34.1 GNB1 gene_id:2782|Hs108|chr1              ( 340) 2152 374.7 5.9e-104
CCDS5703.1 GNB2 gene_id:2783|Hs108|chr7            ( 340) 2151 374.6 6.7e-104
CCDS8564.1 GNB3 gene_id:2784|Hs108|chr12           ( 340) 1960 342.3 3.4e-94
CCDS73427.1 GNB3 gene_id:2784|Hs108|chr12          ( 339) 1935 338.1 6.2e-93
CCDS72685.1 GNB1 gene_id:2782|Hs108|chr1           ( 240) 1553 273.5 1.2e-73
CCDS45261.1 GNB5 gene_id:10681|Hs108|chr15         ( 353) 1259 224.0 1.4e-58
CCDS10149.1 GNB5 gene_id:10681|Hs108|chr15         ( 395) 1259 224.1 1.5e-58
CCDS59142.1 PRPF4 gene_id:9128|Hs108|chr9          ( 521)  421 82.7 7.1e-16
CCDS6791.1 PRPF4 gene_id:9128|Hs108|chr9           ( 522)  421 82.7 7.2e-16
CCDS2470.1 DAW1 gene_id:164781|Hs108|chr2          ( 415)  409 80.6 2.4e-15
CCDS6981.1 WDR5 gene_id:11091|Hs108|chr9           ( 334)  401 79.2 5.2e-15
CCDS43876.1 WDR38 gene_id:401551|Hs108|chr9        ( 314)  395 78.2   1e-14
CCDS75898.1 WDR38 gene_id:401551|Hs108|chr9        ( 315)  395 78.2   1e-14
CCDS3012.1 WDR5B gene_id:54554|Hs108|chr3          ( 330)  395 78.2   1e-14
CCDS7547.1 TAF5 gene_id:6877|Hs108|chr10           ( 800)  387 77.1 5.4e-14
CCDS1581.1 TAF5L gene_id:27097|Hs108|chr1          ( 589)  377 75.3 1.4e-13
CCDS34324.1 RACK1 gene_id:10399|Hs108|chr5         ( 317)  344 69.6 3.9e-12
CCDS55859.1 POC1B gene_id:282809|Hs108|chr12       ( 436)  336 68.3 1.3e-11
CCDS54592.1 POC1A gene_id:25886|Hs108|chr3         ( 359)  329 67.1 2.5e-11
CCDS2846.1 POC1A gene_id:25886|Hs108|chr3          ( 407)  329 67.1 2.8e-11
CCDS340.1 SNRNP40 gene_id:9410|Hs108|chr1          ( 357)  326 66.6 3.5e-11
CCDS34078.1 FBXW7 gene_id:55294|Hs108|chr4         ( 589)  329 67.2 3.7e-11
CCDS3778.1 FBXW7 gene_id:55294|Hs108|chr4          ( 627)  329 67.3 3.9e-11
CCDS3777.1 FBXW7 gene_id:55294|Hs108|chr4          ( 707)  329 67.3 4.3e-11
CCDS10788.1 KATNB1 gene_id:10300|Hs108|chr16       ( 655)  328 67.1 4.6e-11
CCDS54591.1 POC1A gene_id:25886|Hs108|chr3         ( 369)  323 66.1 5.2e-11


>>CCDS3230.1 GNB4 gene_id:59345|Hs108|chr3                (340 aa)
 initn: 2321 init1: 2321 opt: 2321  Z-score: 2133.9  bits: 403.2 E(32554): 1.5e-112
Smith-Waterman score: 2321; 100.0% identity (100.0% similar) in 340 aa overlap (1-340:1-340)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB6 MSELEQLRQEAEQLRNQIQDARKACNDATLVQITSNMDSVGRIQMRTRRTLRGHLAKIYA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MSELEQLRQEAEQLRNQIQDARKACNDATLVQITSNMDSVGRIQMRTRRTLRGHLAKIYA
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB6 MHWGYDSRLLVSASQDGKLIIWDSYTTNKMHAIPLRSSWVMTCAYAPSGNYVACGGLDNI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MHWGYDSRLLVSASQDGKLIIWDSYTTNKMHAIPLRSSWVMTCAYAPSGNYVACGGLDNI
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB6 CSIYNLKTREGNVRVSRELPGHTGYLSCCRFLDDSQIVTSSGDTTCALWDIETAQQTTTF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 CSIYNLKTREGNVRVSRELPGHTGYLSCCRFLDDSQIVTSSGDTTCALWDIETAQQTTTF
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB6 TGHSGDVMSLSLSPDMRTFVSGACDASSKLWDIRDGMCRQSFTGHVSDINAVSFFPNGYA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 TGHSGDVMSLSLSPDMRTFVSGACDASSKLWDIRDGMCRQSFTGHVSDINAVSFFPNGYA
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB6 FATGSDDATCRLFDLRADQELLLYSHDNIICGITSVAFSKSGRLLLAGYDDFNCNVWDTL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 FATGSDDATCRLFDLRADQELLLYSHDNIICGITSVAFSKSGRLLLAGYDDFNCNVWDTL
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340
pF1KB6 KGDRAGVLAGHDNRVSCLGVTDDGMAVATGSWDSFLRIWN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 KGDRAGVLAGHDNRVSCLGVTDDGMAVATGSWDSFLRIWN
              310       320       330       340

>>CCDS34.1 GNB1 gene_id:2782|Hs108|chr1                   (340 aa)
 initn: 2152 init1: 2152 opt: 2152  Z-score: 1979.8  bits: 374.7 E(32554): 5.9e-104
Smith-Waterman score: 2152; 90.9% identity (96.8% similar) in 340 aa overlap (1-340:1-340)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB6 MSELEQLRQEAEQLRNQIQDARKACNDATLVQITSNMDSVGRIQMRTRRTLRGHLAKIYA
       ::::.:::::::::.:::.:::::: :::: :::.:.: :::::::::::::::::::::
CCDS34 MSELDQLRQEAEQLKNQIRDARKACADATLSQITNNIDPVGRIQMRTRRTLRGHLAKIYA
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB6 MHWGYDSRLLVSASQDGKLIIWDSYTTNKMHAIPLRSSWVMTCAYAPSGNYVACGGLDNI
       :::: ::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MHWGTDSRLLVSASQDGKLIIWDSYTTNKVHAIPLRSSWVMTCAYAPSGNYVACGGLDNI
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB6 CSIYNLKTREGNVRVSRELPGHTGYLSCCRFLDDSQIVTSSGDTTCALWDIETAQQTTTF
       ::::::::::::::::::: ::::::::::::::.::::::::::::::::::.::::::
CCDS34 CSIYNLKTREGNVRVSRELAGHTGYLSCCRFLDDNQIVTSSGDTTCALWDIETGQQTTTF
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB6 TGHSGDVMSLSLSPDMRTFVSGACDASSKLWDIRDGMCRQSFTGHVSDINAVSFFPNGYA
       :::.::::::::.:: : :::::::::.::::.:.:::::.:::: :::::. ::::: :
CCDS34 TGHTGDVMSLSLAPDTRLFVSGACDASAKLWDVREGMCRQTFTGHESDINAICFFPNGNA
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB6 FATGSDDATCRLFDLRADQELLLYSHDNIICGITSVAFSKSGRLLLAGYDDFNCNVWDTL
       :::::::::::::::::::::. :::::::::::::.:::::::::::::::::::::.:
CCDS34 FATGSDDATCRLFDLRADQELMTYSHDNIICGITSVSFSKSGRLLLAGYDDFNCNVWDAL
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340
pF1KB6 KGDRAGVLAGHDNRVSCLGVTDDGMAVATGSWDSFLRIWN
       :.::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::
CCDS34 KADRAGVLAGHDNRVSCLGVTDDGMAVATGSWDSFLKIWN
              310       320       330       340

>>CCDS5703.1 GNB2 gene_id:2783|Hs108|chr7                 (340 aa)
 initn: 2151 init1: 2151 opt: 2151  Z-score: 1978.9  bits: 374.6 E(32554): 6.7e-104
Smith-Waterman score: 2151; 90.0% identity (97.9% similar) in 340 aa overlap (1-340:1-340)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB6 MSELEQLRQEAEQLRNQIQDARKACNDATLVQITSNMDSVGRIQMRTRRTLRGHLAKIYA
       ::::::::::::::::::.::::::.:.::.:::...: :::::::::::::::::::::
CCDS57 MSELEQLRQEAEQLRNQIRDARKACGDSTLTQITAGLDPVGRIQMRTRRTLRGHLAKIYA
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB6 MHWGYDSRLLVSASQDGKLIIWDSYTTNKMHAIPLRSSWVMTCAYAPSGNYVACGGLDNI
       :::: ::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::.:::::::::
CCDS57 MHWGTDSRLLVSASQDGKLIIWDSYTTNKVHAIPLRSSWVMTCAYAPSGNFVACGGLDNI
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB6 CSIYNLKTREGNVRVSRELPGHTGYLSCCRFLDDSQIVTSSGDTTCALWDIETAQQTTTF
       ::::.:::::::::::::::::::::::::::::.::.:::::::::::::::.:::. :
CCDS57 CSIYSLKTREGNVRVSRELPGHTGYLSCCRFLDDNQIITSSGDTTCALWDIETGQQTVGF
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB6 TGHSGDVMSLSLSPDMRTFVSGACDASSKLWDIRDGMCRQSFTGHVSDINAVSFFPNGYA
       .:::::::::::.:: ::::::::::: ::::.::.::::.: :: ::::::.:::::::
CCDS57 AGHSGDVMSLSLAPDGRTFVSGACDASIKLWDVRDSMCRQTFIGHESDINAVAFFPNGYA
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB6 FATGSDDATCRLFDLRADQELLLYSHDNIICGITSVAFSKSGRLLLAGYDDFNCNVWDTL
       :.::::::::::::::::::::.::::::::::::::::.:::::::::::::::.::..
CCDS57 FTTGSDDATCRLFDLRADQELLMYSHDNIICGITSVAFSRSGRLLLAGYDDFNCNIWDAM
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340
pF1KB6 KGDRAGVLAGHDNRVSCLGVTDDGMAVATGSWDSFLRIWN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::
CCDS57 KGDRAGVLAGHDNRVSCLGVTDDGMAVATGSWDSFLKIWN
              310       320       330       340

>>CCDS8564.1 GNB3 gene_id:2784|Hs108|chr12                (340 aa)
 initn: 1960 init1: 1960 opt: 1960  Z-score: 1804.7  bits: 342.3 E(32554): 3.4e-94
Smith-Waterman score: 1960; 79.7% identity (95.0% similar) in 340 aa overlap (1-340:1-340)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB6 MSELEQLRQEAEQLRNQIQDARKACNDATLVQITSNMDSVGRIQMRTRRTLRGHLAKIYA
       :.:.::::::::::..:: :::::: :.::....:... :::.:::::::::::::::::
CCDS85 MGEMEQLRQEAEQLKKQIADARKACADVTLAELVSGLEVVGRVQMRTRRTLRGHLAKIYA
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB6 MHWGYDSRLLVSASQDGKLIIWDSYTTNKMHAIPLRSSWVMTCAYAPSGNYVACGGLDNI
       :::. ::.::::::::::::.::::::::.::::::::::::::::::::.::::::::.
CCDS85 MHWATDSKLLVSASQDGKLIVWDSYTTNKVHAIPLRSSWVMTCAYAPSGNFVACGGLDNM
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB6 CSIYNLKTREGNVRVSRELPGHTGYLSCCRFLDDSQIVTSSGDTTCALWDIETAQQTTTF
       :::::::.:::::.::::: .:::::::::::::..:::::::::::::::::.:: :.:
CCDS85 CSIYNLKSREGNVKVSRELSAHTGYLSCCRFLDDNNIVTSSGDTTCALWDIETGQQKTVF
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB6 TGHSGDVMSLSLSPDMRTFVSGACDASSKLWDIRDGMCRQSFTGHVSDINAVSFFPNGYA
       .::.:: :::..:::.  :.:::::::.::::.:.: :::.:::: :::::. ::::: :
CCDS85 VGHTGDCMSLAVSPDFNLFISGACDASAKLWDVREGTCRQTFTGHESDINAICFFPNGEA
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB6 FATGSDDATCRLFDLRADQELLLYSHDNIICGITSVAFSKSGRLLLAGYDDFNCNVWDTL
       . ::::::.::::::::::::. .::..::::::::::: :::::.::::::::::::..
CCDS85 ICTGSDDASCRLFDLRADQELICFSHESIICGITSVAFSLSGRLLFAGYDDFNCNVWDSM
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340
pF1KB6 KGDRAGVLAGHDNRVSCLGVTDDGMAVATGSWDSFLRIWN
       :..:.:.:.:::::::::::: ::::::::::::::.:::
CCDS85 KSERVGILSGHDNRVSCLGVTADGMAVATGSWDSFLKIWN
              310       320       330       340

>>CCDS73427.1 GNB3 gene_id:2784|Hs108|chr12               (339 aa)
 initn: 1069 init1: 1010 opt: 1935  Z-score: 1781.9  bits: 338.1 E(32554): 6.2e-93
Smith-Waterman score: 1935; 79.4% identity (94.7% similar) in 340 aa overlap (1-340:1-339)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB6 MSELEQLRQEAEQLRNQIQDARKACNDATLVQITSNMDSVGRIQMRTRRTLRGHLAKIYA
       :.:.::::::::::..:: :::::: :.::....:... :::.:::::::::::::::::
CCDS73 MGEMEQLRQEAEQLKKQIADARKACADVTLAELVSGLEVVGRVQMRTRRTLRGHLAKIYA
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB6 MHWGYDSRLLVSASQDGKLIIWDSYTTNKMHAIPLRSSWVMTCAYAPSGNYVACGGLDNI
       :::. ::.::::::::::::.::::::::.::::::::::::::::::::.::::::::.
CCDS73 MHWATDSKLLVSASQDGKLIVWDSYTTNKVHAIPLRSSWVMTCAYAPSGNFVACGGLDNM
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB6 CSIYNLKTREGNVRVSRELPGHTGYLSCCRFLDDSQIVTSSGDTTCALWDIETAQQTTTF
       :::::::.:::::.::::: .:::::::::::::..::::::::: :::::::.:: :.:
CCDS73 CSIYNLKSREGNVKVSRELSAHTGYLSCCRFLDDNNIVTSSGDTT-ALWDIETGQQKTVF
              130       140       150       160        170         

              190       200       210       220       230       240
pF1KB6 TGHSGDVMSLSLSPDMRTFVSGACDASSKLWDIRDGMCRQSFTGHVSDINAVSFFPNGYA
       .::.:: :::..:::.  :.:::::::.::::.:.: :::.:::: :::::. ::::: :
CCDS73 VGHTGDCMSLAVSPDFNLFISGACDASAKLWDVREGTCRQTFTGHESDINAICFFPNGEA
     180       190       200       210       220       230         

              250       260       270       280       290       300
pF1KB6 FATGSDDATCRLFDLRADQELLLYSHDNIICGITSVAFSKSGRLLLAGYDDFNCNVWDTL
       . ::::::.::::::::::::. .::..::::::::::: :::::.::::::::::::..
CCDS73 ICTGSDDASCRLFDLRADQELICFSHESIICGITSVAFSLSGRLLFAGYDDFNCNVWDSM
     240       250       260       270       280       290         

              310       320       330       340
pF1KB6 KGDRAGVLAGHDNRVSCLGVTDDGMAVATGSWDSFLRIWN
       :..:.:.:.:::::::::::: ::::::::::::::.:::
CCDS73 KSERVGILSGHDNRVSCLGVTADGMAVATGSWDSFLKIWN
     300       310       320       330         

>>CCDS72685.1 GNB1 gene_id:2782|Hs108|chr1                (240 aa)
 initn: 1553 init1: 1553 opt: 1553  Z-score: 1435.7  bits: 273.5 E(32554): 1.2e-73
Smith-Waterman score: 1553; 91.2% identity (97.1% similar) in 240 aa overlap (101-340:1-240)

               80        90       100       110       120       130
pF1KB6 VSASQDGKLIIWDSYTTNKMHAIPLRSSWVMTCAYAPSGNYVACGGLDNICSIYNLKTRE
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72                               MTCAYAPSGNYVACGGLDNICSIYNLKTRE
                                             10        20        30

              140       150       160       170       180       190
pF1KB6 GNVRVSRELPGHTGYLSCCRFLDDSQIVTSSGDTTCALWDIETAQQTTTFTGHSGDVMSL
       ::::::::: ::::::::::::::.::::::::::::::::::.:::::::::.::::::
CCDS72 GNVRVSRELAGHTGYLSCCRFLDDNQIVTSSGDTTCALWDIETGQQTTTFTGHTGDVMSL
               40        50        60        70        80        90

              200       210       220       230       240       250
pF1KB6 SLSPDMRTFVSGACDASSKLWDIRDGMCRQSFTGHVSDINAVSFFPNGYAFATGSDDATC
       ::.:: : :::::::::.::::.:.:::::.:::: :::::. ::::: :::::::::::
CCDS72 SLAPDTRLFVSGACDASAKLWDVREGMCRQTFTGHESDINAICFFPNGNAFATGSDDATC
              100       110       120       130       140       150

              260       270       280       290       300       310
pF1KB6 RLFDLRADQELLLYSHDNIICGITSVAFSKSGRLLLAGYDDFNCNVWDTLKGDRAGVLAG
       :::::::::::. :::::::::::::.:::::::::::::::::::::.::.::::::::
CCDS72 RLFDLRADQELMTYSHDNIICGITSVSFSKSGRLLLAGYDDFNCNVWDALKADRAGVLAG
              160       170       180       190       200       210

              320       330       340
pF1KB6 HDNRVSCLGVTDDGMAVATGSWDSFLRIWN
       ::::::::::::::::::::::::::.:::
CCDS72 HDNRVSCLGVTDDGMAVATGSWDSFLKIWN
              220       230       240

>>CCDS45261.1 GNB5 gene_id:10681|Hs108|chr15              (353 aa)
 initn: 1302 init1: 621 opt: 1259  Z-score: 1165.1  bits: 224.0 E(32554): 1.4e-58
Smith-Waterman score: 1259; 52.2% identity (78.9% similar) in 341 aa overlap (4-339:12-352)

                       10        20        30        40        50  
pF1KB6         MSELEQLRQEAEQLRNQIQDARKACNDATLVQITSNMDSVGRIQMRTRRTLR
                  : .:..:::.:...... :   .:. : :..  ....:.. :.:::::.
CCDS45 MATEGLHENETLASLKSEAESLKGKLEEERAKLHDVELHQVAERVEALGQFVMKTRRTLK
               10        20        30        40        50        60

             60        70        80        90       100       110  
pF1KB6 GHLAKIYAMHWGYDSRLLVSASQDGKLIIWDSYTTNKMHAIPLRSSWVMTCAYAPSGNYV
       ::  :.  : :  :.: .::.:::::.:.:::.:::: ::. .  .:::.:::::::  .
CCDS45 GHGNKVLCMDWCKDKRRIVSSSQDGKVIVWDSFTTNKEHAVTMPCTWVMACAYAPSGCAI
               70        80        90       100       110       120

            120        130        140       150        160         
pF1KB6 ACGGLDNICSIYNLK-TREGNVRVSRE-LPGHTGYLSCCRFLD-DSQIVTSSGDTTCALW
       ::::::: ::.: :   .. :. .... .  ::.::: : : . : ::.:.::: :::::
CCDS45 ACGGLDNKCSVYPLTFDKNENMAAKKKSVAMHTNYLSACSFTNSDMQILTASGDGTCALW
              130       140       150       160       170       180

     170       180       190         200       210       220       
pF1KB6 DIETAQQTTTFTGHSGDVMSLSLSPDMR--TFVSGACDASSKLWDIRDGMCRQSFTGHVS
       :.:..:   .: ::..::. :.:.:.    :::::.:: .. .::.:.:.: :.:  : :
CCDS45 DVESGQLLQSFHGHGADVLCLDLAPSETGNTFVSGGCDKKAMVWDMRSGQCVQAFETHES
              190       200       210       220       230       240

       230       240       250       260       270       280       
pF1KB6 DINAVSFFPNGYAFATGSDDATCRLFDLRADQELLLYSHDNIICGITSVAFSKSGRLLLA
       :::.: ..:.: :::.:::::::::.:::::.:. .::...:: : .:: :: :::::.:
CCDS45 DINSVRYYPSGDAFASGSDDATCRLYDLRADREVAIYSKESIIFGASSVDFSLSGRLLFA
              250       260       270       280       290       300

       290       300       310       320       330       340
pF1KB6 GYDDFNCNVWDTLKGDRAGVLAGHDNRVSCLGVTDDGMAVATGSWDSFLRIWN
       ::.:.. ::::.:::.:...: ::.:::: : :. :: :  .::::  ::.: 
CCDS45 GYNDYTINVWDVLKGSRVSILFGHENRVSTLRVSPDGTAFCSGSWDHTLRVWA
              310       320       330       340       350   

>>CCDS10149.1 GNB5 gene_id:10681|Hs108|chr15              (395 aa)
 initn: 1302 init1: 621 opt: 1259  Z-score: 1164.4  bits: 224.1 E(32554): 1.5e-58
Smith-Waterman score: 1259; 52.2% identity (78.9% similar) in 341 aa overlap (4-339:54-394)

                                          10        20        30   
pF1KB6                            MSELEQLRQEAEQLRNQIQDARKACNDATLVQI
                                     : .:..:::.:...... :   .:. : :.
CCDS10 RPVFKKSQQLSYCSTCAEIMATEGLHENETLASLKSEAESLKGKLEEERAKLHDVELHQV
            30        40        50        60        70        80   

            40        50        60        70        80        90   
pF1KB6 TSNMDSVGRIQMRTRRTLRGHLAKIYAMHWGYDSRLLVSASQDGKLIIWDSYTTNKMHAI
       .  ....:.. :.:::::.::  :.  : :  :.: .::.:::::.:.:::.:::: ::.
CCDS10 AERVEALGQFVMKTRRTLKGHGNKVLCMDWCKDKRRIVSSSQDGKVIVWDSFTTNKEHAV
            90       100       110       120       130       140   

           100       110       120        130        140       150 
pF1KB6 PLRSSWVMTCAYAPSGNYVACGGLDNICSIYNLK-TREGNVRVSRE-LPGHTGYLSCCRF
        .  .:::.:::::::  .::::::: ::.: :   .. :. .... .  ::.::: : :
CCDS10 TMPCTWVMACAYAPSGCAIACGGLDNKCSVYPLTFDKNENMAAKKKSVAMHTNYLSACSF
           150       160       170       180       190       200   

              160       170       180       190         200        
pF1KB6 LD-DSQIVTSSGDTTCALWDIETAQQTTTFTGHSGDVMSLSLSPDMR--TFVSGACDASS
        . : ::.:.::: ::::::.:..:   .: ::..::. :.:.:.    :::::.:: ..
CCDS10 TNSDMQILTASGDGTCALWDVESGQLLQSFHGHGADVLCLDLAPSETGNTFVSGGCDKKA
           210       220       230       240       250       260   

      210       220       230       240       250       260        
pF1KB6 KLWDIRDGMCRQSFTGHVSDINAVSFFPNGYAFATGSDDATCRLFDLRADQELLLYSHDN
        .::.:.:.: :.:  : ::::.: ..:.: :::.:::::::::.:::::.:. .::...
CCDS10 MVWDMRSGQCVQAFETHESDINSVRYYPSGDAFASGSDDATCRLYDLRADREVAIYSKES
           270       280       290       300       310       320   

      270       280       290       300       310       320        
pF1KB6 IICGITSVAFSKSGRLLLAGYDDFNCNVWDTLKGDRAGVLAGHDNRVSCLGVTDDGMAVA
       :: : .:: :: :::::.:::.:.. ::::.:::.:...: ::.:::: : :. :: :  
CCDS10 IIFGASSVDFSLSGRLLFAGYNDYTINVWDVLKGSRVSILFGHENRVSTLRVSPDGTAFC
           330       340       350       360       370       380   

      330       340
pF1KB6 TGSWDSFLRIWN
       .::::  ::.: 
CCDS10 SGSWDHTLRVWA
           390     

>>CCDS59142.1 PRPF4 gene_id:9128|Hs108|chr9               (521 aa)
 initn: 510 init1: 254 opt: 421  Z-score: 398.4  bits: 82.7 E(32554): 7.1e-16
Smith-Waterman score: 422; 29.2% identity (59.1% similar) in 298 aa overlap (62-339:237-518)

              40        50        60        70        80        90 
pF1KB6 QITSNMDSVGRIQMRTRRTLRGHLAKIYAMHWGYDSRLLVSASQDGKLIIWDSYTTNKMH
                                     :.. .:..:..:  .:   .:.    : .:
CCDS59 TSQMQELHKSLRSLNNFCSQIGDDRPISYCHFSPNSKMLATACWSGLCKLWSVPDCNLLH
        210       220       230       240       250       260      

             100                110       120       130            
pF1KB6 AIPLRSSWVMTCAYAPSG---------NYVACGGLDNICSIYNLKTRE------GN-VRV
       ..  ... : . .. :..         : ..:.. :.  ....: . :      :. :::
CCDS59 TLRGHNTNVGAIVFHPKSTVSLDPKDVNLASCAA-DGSVKLWSLDSDEPVADIEGHTVRV
        270       280       290       300        310       320     

         140       150       160       170       180       190     
pF1KB6 SRELPGHTGYLSCCRFLDDSQIVTSSGDTTCALWDIETAQQTTTFTGHSGDVMSLSLSPD
       .: .   .:     :::      :.  : .  :::.:. ..     :::  :.....  :
CCDS59 ARVMWHPSG-----RFLG-----TTCYDRSWRLWDLEAQEEILHQEGHSMGVYDIAFHQD
         330                 340       350       360       370     

         200       210       220       230       240       250     
pF1KB6 MRTFVSGACDASSKLWDIRDGMCRQSFTGHVSDINAVSFFPNGYAFATGSDDATCRLFDL
            .:. :: ...::.: : : . . ::...: ...: :::: .:::: : ::...::
CCDS59 GSLAGTGGLDAFGRVWDLRTGRCIMFLEGHLKEIYGINFSPNGYHIATGSGDNTCKVWDL
         380       390       400       410       420       430     

         260          270       280        290       300       310 
pF1KB6 RADQELLLYS---HDNIICGITSVAFSK-SGRLLLAGYDDFNCNVWDTLKGDRAGVLAGH
       :  :.  .:.   :.:.. :   : :    : .::.:  : . ..:     .   .::::
CCDS59 R--QRRCVYTIPAHQNLVTG---VKFEPIHGNFLLTGAYDNTAKIWTHPGWSPLKTLAGH
           440       450          460       470       480       490

             320       330       340  
pF1KB6 DNRVSCLGVTDDGMAVATGSWDSFLRIWN  
       ...:  : ...::. .:: :.:  ...:   
CCDS59 EGKVMGLDISSDGQLIATCSYDRTFKLWMAE
              500       510       520 

>>CCDS6791.1 PRPF4 gene_id:9128|Hs108|chr9                (522 aa)
 initn: 510 init1: 254 opt: 421  Z-score: 398.4  bits: 82.7 E(32554): 7.2e-16
Smith-Waterman score: 422; 29.2% identity (59.1% similar) in 298 aa overlap (62-339:238-519)

              40        50        60        70        80        90 
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                                     :.. .:..:..:  .:   .:.    : .:
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