Result of FASTA (ccds) for
pF1KB6366
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB6366, 298 aa
1>>>pF1KB6366 298 - 298 aa - 298 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1539+/-0.000982; mu= 15.7660+/- 0.059
mean_var=59.7186+/-12.349, 0's: 0 Z-trim(103.0): 77 B-trim: 341 in 1/48
Lambda= 0.165966
statistics sampled from 7101 (7185) to 7101 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.584), E-opt: 0.2 (0.221), width: 16
Scan time: 2.010
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS34114.1 SLC25A4 gene_id:291|Hs108|chr4 ( 298) 2004 488.5 2.6e-138
CCDS14578.1 SLC25A5 gene_id:292|Hs108|chrX ( 298) 1817 443.7 7.8e-125
CCDS14114.1 SLC25A6 gene_id:293|Hs108|chrY ( 298) 1813 442.7 1.5e-124
CCDS14114.1 SLC25A6 gene_id:293|Hs108|chrX ( 298) 1813 442.7 1.5e-124
CCDS3733.1 SLC25A31 gene_id:83447|Hs108|chr4 ( 315) 1456 357.3 8.6e-99
CCDS32966.1 SLC25A42 gene_id:284439|Hs108|chr19 ( 318) 431 111.9 6.6e-25
CCDS7280.1 SLC25A16 gene_id:8034|Hs108|chr10 ( 332) 393 102.8 3.7e-22
CCDS31967.1 SLC25A30 gene_id:253512|Hs108|chr13 ( 291) 379 99.4 3.4e-21
CCDS76021.1 SLC25A14 gene_id:9016|Hs108|chrX ( 290) 372 97.7 1.1e-20
CCDS14624.1 SLC25A14 gene_id:9016|Hs108|chrX ( 322) 372 97.7 1.2e-20
CCDS14623.1 SLC25A14 gene_id:9016|Hs108|chrX ( 325) 372 97.7 1.2e-20
CCDS14577.1 SLC25A43 gene_id:203427|Hs108|chrX ( 341) 367 96.5 2.9e-20
CCDS6300.1 SLC25A32 gene_id:81034|Hs108|chr8 ( 315) 355 93.7 2e-19
CCDS8228.1 UCP2 gene_id:7351|Hs108|chr11 ( 309) 322 85.8 4.6e-17
CCDS6890.1 SLC25A25 gene_id:114789|Hs108|chr9 ( 469) 313 83.7 2.9e-16
CCDS48031.1 SLC25A25 gene_id:114789|Hs108|chr9 ( 489) 313 83.7 3e-16
CCDS59146.1 SLC25A25 gene_id:114789|Hs108|chr9 ( 501) 313 83.7 3.1e-16
CCDS35151.1 SLC25A25 gene_id:114789|Hs108|chr9 ( 503) 313 83.7 3.1e-16
CCDS83420.1 SLC25A25 gene_id:114789|Hs108|chr9 ( 515) 313 83.7 3.2e-16
CCDS66539.1 SLC25A30 gene_id:253512|Hs108|chr13 ( 240) 300 80.4 1.4e-15
CCDS55913.1 SLC25A21 gene_id:89874|Hs108|chr14 ( 298) 286 77.1 1.8e-14
CCDS9663.1 SLC25A21 gene_id:89874|Hs108|chr14 ( 299) 286 77.1 1.8e-14
CCDS162.1 SLC25A34 gene_id:284723|Hs108|chr1 ( 304) 277 75.0 7.9e-14
CCDS2779.1 SLC25A20 gene_id:788|Hs108|chr3 ( 301) 259 70.7 1.6e-12
CCDS82067.1 SLC25A35 gene_id:399512|Hs108|chr17 ( 300) 256 69.9 2.6e-12
CCDS32882.1 SLC25A23 gene_id:79085|Hs108|chr19 ( 468) 250 68.6 1e-11
CCDS32156.1 SLC25A29 gene_id:123096|Hs108|chr14 ( 303) 242 66.6 2.6e-11
CCDS45937.1 SLC25A41 gene_id:284427|Hs108|chr19 ( 370) 242 66.6 3.1e-11
CCDS56431.1 SLC25A27 gene_id:9481|Hs108|chr6 ( 245) 239 65.8 3.6e-11
>>CCDS34114.1 SLC25A4 gene_id:291|Hs108|chr4 (298 aa)
initn: 2004 init1: 2004 opt: 2004 Z-score: 2596.6 bits: 488.5 E(32554): 2.6e-138
Smith-Waterman score: 2004; 100.0% identity (100.0% similar) in 298 aa overlap (1-298:1-298)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MGDHAWSFLKDFLAGGVAAAVSKTAVAPIERVKLLLQVQHASKQISAEKQYKGIIDCVVR
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CCDS34 MGDHAWSFLKDFLAGGVAAAVSKTAVAPIERVKLLLQVQHASKQISAEKQYKGIIDCVVR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 IPKEQGFLSFWRGNLANVIRYFPTQALNFAFKDKYKQLFLGGVDRHKQFWRYFAGNLASG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 IPKEQGFLSFWRGNLANVIRYFPTQALNFAFKDKYKQLFLGGVDRHKQFWRYFAGNLASG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 GAAGATSLCFVYPLDFARTRLAADVGKGAAQREFHGLGDCIIKIFKSDGLRGLYQGFNVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 GAAGATSLCFVYPLDFARTRLAADVGKGAAQREFHGLGDCIIKIFKSDGLRGLYQGFNVS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 VQGIIIYRAAYFGVYDTAKGMLPDPKNVHIFVSWMIAQSVTAVAGLVSYPFDTVRRRMMM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 VQGIIIYRAAYFGVYDTAKGMLPDPKNVHIFVSWMIAQSVTAVAGLVSYPFDTVRRRMMM
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290
pF1KB6 QSGRKGADIMYTGTVDCWRKIAKDEGAKAFFKGAWSNVLRGMGGAFVLVLYDEIKKYV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 QSGRKGADIMYTGTVDCWRKIAKDEGAKAFFKGAWSNVLRGMGGAFVLVLYDEIKKYV
250 260 270 280 290
>>CCDS14578.1 SLC25A5 gene_id:292|Hs108|chrX (298 aa)
initn: 1817 init1: 1817 opt: 1817 Z-score: 2354.6 bits: 443.7 E(32554): 7.8e-125
Smith-Waterman score: 1817; 89.2% identity (97.3% similar) in 297 aa overlap (1-297:1-297)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MGDHAWSFLKDFLAGGVAAAVSKTAVAPIERVKLLLQVQHASKQISAEKQYKGIIDCVVR
: : : :: :::::::::::.::::::::::::::::::::::::.:.::::::::::::
CCDS14 MTDAAVSFAKDFLAGGVAAAISKTAVAPIERVKLLLQVQHASKQITADKQYKGIIDCVVR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 IPKEQGFLSFWRGNLANVIRYFPTQALNFAFKDKYKQLFLGGVDRHKQFWRYFAGNLASG
:::::: ::::::::::::::::::::::::::::::.::::::.. ::: :::::::::
CCDS14 IPKEQGVLSFWRGNLANVIRYFPTQALNFAFKDKYKQIFLGGVDKRTQFWLYFAGNLASG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 GAAGATSLCFVYPLDFARTRLAADVGKGAAQREFHGLGDCIIKIFKSDGLRGLYQGFNVS
:::::::::::::::::::::::::::..:.:::.:::::..::.::::..:::::::::
CCDS14 GAAGATSLCFVYPLDFARTRLAADVGKAGAEREFRGLGDCLVKIYKSDGIKGLYQGFNVS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 VQGIIIYRAAYFGVYDTAKGMLPDPKNVHIFVSWMIAQSVTAVAGLVSYPFDTVRRRMMM
:::::::::::::.:::::::::::::.:: .::::::.:::::::.:::::::::::::
CCDS14 VQGIIIYRAAYFGIYDTAKGMLPDPKNTHIVISWMIAQTVTAVAGLTSYPFDTVRRRMMM
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290
pF1KB6 QSGRKGADIMYTGTVDCWRKIAKDEGAKAFFKGAWSNVLRGMGGAFVLVLYDEIKKYV
::::::.:::::::.:::::::.:::.::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 QSGRKGTDIMYTGTLDCWRKIARDEGGKAFFKGAWSNVLRGMGGAFVLVLYDEIKKYT
250 260 270 280 290
>>CCDS14114.1 SLC25A6 gene_id:293|Hs108|chrY (298 aa)
initn: 1975 init1: 1803 opt: 1813 Z-score: 2349.5 bits: 442.7 E(32554): 1.5e-124
Smith-Waterman score: 1813; 88.3% identity (97.0% similar) in 298 aa overlap (1-298:1-298)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MGDHAWSFLKDFLAGGVAAAVSKTAVAPIERVKLLLQVQHASKQISAEKQYKGIIDCVVR
: ..: :: :::::::.:::.::::::::::::::::::::::::.:.::::::.::.::
CCDS14 MTEQAISFAKDFLAGGIAAAISKTAVAPIERVKLLLQVQHASKQIAADKQYKGIVDCIVR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 IPKEQGFLSFWRGNLANVIRYFPTQALNFAFKDKYKQLFLGGVDRHKQFWRYFAGNLASG
:::::: ::::::::::::::::::::::::::::::.::::::.: :::::::::::::
CCDS14 IPKEQGVLSFWRGNLANVIRYFPTQALNFAFKDKYKQIFLGGVDKHTQFWRYFAGNLASG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 GAAGATSLCFVYPLDFARTRLAADVGKGAAQREFHGLGDCIIKIFKSDGLRGLYQGFNVS
:::::::::::::::::::::::::::....:::.:::::..:: ::::.:::::::.::
CCDS14 GAAGATSLCFVYPLDFARTRLAADVGKSGTEREFRGLGDCLVKITKSDGIRGLYQGFSVS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 VQGIIIYRAAYFGVYDTAKGMLPDPKNVHIFVSWMIAQSVTAVAGLVSYPFDTVRRRMMM
:::::::::::::::::::::::::::.:: :::::::.::::::.::::::::::::::
CCDS14 VQGIIIYRAAYFGVYDTAKGMLPDPKNTHIVVSWMIAQTVTAVAGVVSYPFDTVRRRMMM
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290
pF1KB6 QSGRKGADIMYTGTVDCWRKIAKDEGAKAFFKGAWSNVLRGMGGAFVLVLYDEIKKYV
::::::::::::::::::::: .:::.::::::::::::::::::::::::::.:: .
CCDS14 QSGRKGADIMYTGTVDCWRKIFRDEGGKAFFKGAWSNVLRGMGGAFVLVLYDELKKVI
250 260 270 280 290
>>CCDS14114.1 SLC25A6 gene_id:293|Hs108|chrX (298 aa)
initn: 1975 init1: 1803 opt: 1813 Z-score: 2349.5 bits: 442.7 E(32554): 1.5e-124
Smith-Waterman score: 1813; 88.3% identity (97.0% similar) in 298 aa overlap (1-298:1-298)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MGDHAWSFLKDFLAGGVAAAVSKTAVAPIERVKLLLQVQHASKQISAEKQYKGIIDCVVR
: ..: :: :::::::.:::.::::::::::::::::::::::::.:.::::::.::.::
CCDS14 MTEQAISFAKDFLAGGIAAAISKTAVAPIERVKLLLQVQHASKQIAADKQYKGIVDCIVR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 IPKEQGFLSFWRGNLANVIRYFPTQALNFAFKDKYKQLFLGGVDRHKQFWRYFAGNLASG
:::::: ::::::::::::::::::::::::::::::.::::::.: :::::::::::::
CCDS14 IPKEQGVLSFWRGNLANVIRYFPTQALNFAFKDKYKQIFLGGVDKHTQFWRYFAGNLASG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 GAAGATSLCFVYPLDFARTRLAADVGKGAAQREFHGLGDCIIKIFKSDGLRGLYQGFNVS
:::::::::::::::::::::::::::....:::.:::::..:: ::::.:::::::.::
CCDS14 GAAGATSLCFVYPLDFARTRLAADVGKSGTEREFRGLGDCLVKITKSDGIRGLYQGFSVS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 VQGIIIYRAAYFGVYDTAKGMLPDPKNVHIFVSWMIAQSVTAVAGLVSYPFDTVRRRMMM
:::::::::::::::::::::::::::.:: :::::::.::::::.::::::::::::::
CCDS14 VQGIIIYRAAYFGVYDTAKGMLPDPKNTHIVVSWMIAQTVTAVAGVVSYPFDTVRRRMMM
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290
pF1KB6 QSGRKGADIMYTGTVDCWRKIAKDEGAKAFFKGAWSNVLRGMGGAFVLVLYDEIKKYV
::::::::::::::::::::: .:::.::::::::::::::::::::::::::.:: .
CCDS14 QSGRKGADIMYTGTVDCWRKIFRDEGGKAFFKGAWSNVLRGMGGAFVLVLYDELKKVI
250 260 270 280 290
>>CCDS3733.1 SLC25A31 gene_id:83447|Hs108|chr4 (315 aa)
initn: 1449 init1: 1262 opt: 1456 Z-score: 1887.1 bits: 357.3 E(32554): 8.6e-99
Smith-Waterman score: 1456; 73.7% identity (91.5% similar) in 293 aa overlap (5-297:17-307)
10 20 30 40
pF1KB6 MGDHAWSFLKDFLAGGVAAAVSKTAVAPIERVKLLLQVQHASKQISAE
: :: ::.::::::::::::::::::::::::::: .::::: :
CCDS37 MHREPAKKKAEKRLFDASSFGKDLLAGGVAAAVSKTAVAPIERVKLLLQVQASSKQISPE
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB6 KQYKGIIDCVVRIPKEQGFLSFWRGNLANVIRYFPTQALNFAFKDKYKQLFLGGVDRHKQ
.:::..::.::::.::::.:::::::::::::::::::::::::::::::..::...::
CCDS37 ARYKGMVDCLVRIPREQGFFSFWRGNLANVIRYFPTQALNFAFKDKYKQLFMSGVNKEKQ
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KB6 FWRYFAGNLASGGAAGATSLCFVYPLDFARTRLAADVGKGAAQREFHGLGDCIIKIFKSD
:::.: .:::::::::::::: :::::::::::..:.::: .:.:.::::::.:: :::
CCDS37 FWRWFLANLASGGAAGATSLCVVYPLDFARTRLGVDIGKGPEERQFKGLGDCIMKIAKSD
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KB6 GLRGLYQGFNVSVQGIIIYRAAYFGVYDTAKGMLPDPKNVHIFVSWMIAQSVTAVAGLVS
:. ::::::.:::::::.:::.:::.:::.::.:: ::.. ..::..::: ::. .:..:
CCDS37 GIAGLYQGFGVSVQGIIVYRASYFGAYDTVKGLLPKPKKTPFLVSFFIAQVVTTCSGILS
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KB6 YPFDTVRRRMMMQSGRKGADIMYTGTVDCWRKIAKDEGAKAFFKGAWSNVLRGMGGAFVL
:::::::::::::::. : .: ::.::. :: . :: ..::.::.:::::: :::.::
CCDS37 YPFDTVRRRMMMQSGE--AKRQYKGTLDCFVKIYQHEGISSFFRGAFSNVLRGTGGALVL
250 260 270 280 290
290
pF1KB6 VLYDEIKKYV
::::.::..
CCDS37 VLYDKIKEFFHIDIGGR
300 310
>>CCDS32966.1 SLC25A42 gene_id:284439|Hs108|chr19 (318 aa)
initn: 392 init1: 117 opt: 431 Z-score: 560.7 bits: 111.9 E(32554): 6.6e-25
Smith-Waterman score: 431; 32.9% identity (63.7% similar) in 289 aa overlap (3-281:29-295)
10 20 30
pF1KB6 MGDHAWSFLKDFLAGGVAAAVSKTAVAPIERVKL
:: . :...:.:..:.:..::::::..:.:.
CCDS32 MGNGVKEGPVRLHEDAEAVLSSSVSSKRDHR-QVLSSLLSGALAGALAKTAVAPLDRTKI
10 20 30 40 50
40 50 60 70 80 90
pF1KB6 LLQVQHASKQISAEKQYKGIIDCVVRIPKEQGFLSFWRGNLANVIRYFPTQALNFAFKDK
..:: .::..::.. .. . . ..::::.:::: :...: : :..:. ...
CCDS32 IFQV--SSKRFSAKEAFRVLYYTYL----NEGFLSLWRGNSATMVRVVPYAAIQFSAHEE
60 70 80 90 100 110
100 110 120 130 140 150
pF1KB6 YKQL---FLGGVDRHKQFW-RYFAGNLASGGAAGATSLCFVYPLDFARTRLAADVGKGAA
::.. . : . : : ::: :: :.:. ..::::..:.:.:. . :
CCDS32 YKRILGSYYGFRGEALPPWPRLFAGALA-----GTTAASLTYPLDLVRARMAV-TPKEMY
120 130 140 150 160
160 170 180 190 200
pF1KB6 QREFHGLGDCIIKIFKSDGLRGLYQGFNVSVQGIIIYRAAYFGVYDTAKGM---LPDPKN
. :: .:.: . .::. ::.:: .: :.: : . : .:.: :.. ..
CCDS32 SNIFH----VFIRISREEGLKTLYHGFMPTVLGVIPYAGLSFFTYETLKSLHREYSGRRQ
170 180 190 200 210 220
210 220 230 240 250 260
pF1KB6 VHIFVSWMIAQSVTAVAGLVSYPFDTVRRRMMMQ--SGRKGADIMYTGTVDCWRKIAKDE
. : ... . .. .:::.:.:::::. .: :.: : : :...:
CCDS32 PYPFERMIFGACAGLIGQSASYPLDVVRRRMQTAGVTGYPRASIART-----LRTIVREE
230 240 250 260 270
270 280 290
pF1KB6 GA-KAFFKGAWSNVLRGMGGAFVLVLYDEIKKYV
:: ....:: : ..:
CCDS32 GAVRGLYKGLSMNWVKGPIAVGISFTTFDLMQILLRHLQS
280 290 300 310
>>CCDS7280.1 SLC25A16 gene_id:8034|Hs108|chr10 (332 aa)
initn: 341 init1: 126 opt: 393 Z-score: 511.2 bits: 102.8 E(32554): 3.7e-22
Smith-Waterman score: 402; 30.9% identity (60.6% similar) in 317 aa overlap (3-297:33-328)
10 20 30
pF1KB6 MGDHAWSFLKDFLAGGVAAAVSKTAVAPIERV
: : :..:::::.:. .::.:::..::
CCDS72 AATAAAALAAADPPPAMPQAAGAGGPTTRRDFYW--LRSFLAGGIAGCCAKTTVAPLDRV
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KB6 KLLLQVQ-HASKQISAEKQYKGIIDCVVRIPKEQGFLSFWRGNLANVIRYFPTQALNFAF
:.:::.. : :.. :... . .:...:::....:: : .:: :: :..:
CCDS72 KVLLQAHNHHYKHL-------GVFSALRAVPQKEGFLGLYKGNGAMMIRIFPYGAIQFMA
70 80 90 100 110
100 110 120 130 140
pF1KB6 KDKYKQLFLG--GVDRHKQFWRYFAGNLASGGAAGATSLCFVYPLDFARTRLAADVGKGA
..:: :. :.. : . : .::..: : :.. .::::..:.::: .: ::
CCDS72 FEHYKTLITTKLGISGHVH--RLMAGSMA-----GMTAVICTYPLDMVRVRLAFQV-KG-
120 130 140 150 160
150 160 170 180 190 200
pF1KB6 AQREFHGLGDCIIKIF-KSDGLRGLYQGFNVSVQGIIIYRAAYFGVYDTAKG--------
.. . :. . :. : :. :.:.:. .. :. : .. : .. : :.
CCDS72 -EHSYTGIIHAFKTIYAKEGGFFGFYRGLMPTILGMAPYAGVSFFTFGTLKSVGLSHAPT
170 180 190 200 210 220
210 220 230 240 250
pF1KB6 MLPDPK----NVHIF---VSWMIAQSVTAVAGLVSYPFDTVRRRMMMQSGRKGADIMYTG
.: :. :: .. :. . . . :.: .:::::..:::: : : ..
CCDS72 LLGRPSSDNPNVLVLKTHVNLLCGGVAGAIAQTISYPFDVTRRRM--QLGTVLPEFEKCL
230 240 250 260 270 280
260 270 280 290
pF1KB6 TV-DCWRKIAKDEGA-KAFFKGAWSNVLRGMGG-AFVLVLYDEIKKYV
:. : . . .: :....: : .: . . : ... :. .:..
CCDS72 TMRDTMKYVYGHHGIRKGLYRGLSLNYIRCIPSQAVAFTTYELMKQFFHLN
290 300 310 320 330
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CCDS14 WKHEGFFALYKGFWPNWLRLGPWNIIFFITYEQLKRLQI
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18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]