Result of FASTA (ccds) for pF1KE0513
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE0513, 331 aa
  1>>>pF1KE0513 331 - 331 aa - 331 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8026+/-0.000779; mu= 13.8465+/- 0.047
 mean_var=74.2597+/-14.586, 0's: 0 Z-trim(108.2): 27  B-trim: 11 in 2/51
 Lambda= 0.148832
 statistics sampled from 10029 (10053) to 10029 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.689), E-opt: 0.2 (0.309), width:  16
 Scan time:  2.030

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS14057.1 PARVG gene_id:64098|Hs108|chr22        ( 331) 2133 467.1  9e-132
CCDS58808.1 PARVB gene_id:29780|Hs108|chr22        ( 327)  863 194.4 1.1e-49
CCDS14056.1 PARVB gene_id:29780|Hs108|chr22        ( 364)  863 194.4 1.2e-49
CCDS46724.1 PARVB gene_id:29780|Hs108|chr22        ( 397)  863 194.4 1.3e-49
CCDS44541.2 PARVA gene_id:55742|Hs108|chr11        ( 412)  850 191.6 9.2e-49
CCDS74874.1 PARVB gene_id:29780|Hs108|chr22        ( 289)  513 119.2 4.1e-27


>>CCDS14057.1 PARVG gene_id:64098|Hs108|chr22             (331 aa)
 initn: 2133 init1: 2133 opt: 2133  Z-score: 2479.2  bits: 467.1 E(32554): 9e-132
Smith-Waterman score: 2133; 100.0% identity (100.0% similar) in 331 aa overlap (1-331:1-331)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE0 MEPEFLYDLLQLPKGVEPPAEEELSKGGKKKYLPPTSRKDPKFEELQKVLMEWINATLLP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 MEPEFLYDLLQLPKGVEPPAEEELSKGGKKKYLPPTSRKDPKFEELQKVLMEWINATLLP
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE0 EHIVVRSLEEDMFDGLILHHLFQRLAALKLEAEDIALTATSQKHKLTVVLEAVNRSLQLE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 EHIVVRSLEEDMFDGLILHHLFQRLAALKLEAEDIALTATSQKHKLTVVLEAVNRSLQLE
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE0 EWQAKWSVESIFNKDLLSTLHLLVALAKRFQPDLSLPTNVQVEVITIESTKSGLKSEKLV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 EWQAKWSVESIFNKDLLSTLHLLVALAKRFQPDLSLPTNVQVEVITIESTKSGLKSEKLV
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE0 EQLTEYSTDKDEPPKDVFDELFKLAPEKVNAVKEAIVNFVNQKLDRLGLSVQNLDTQFAD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 EQLTEYSTDKDEPPKDVFDELFKLAPEKVNAVKEAIVNFVNQKLDRLGLSVQNLDTQFAD
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE0 GVILLLLIGQLEGFFLHLKEFYLTPNSPAEMLHNVTLALELLKDEGLLSCPVSPEDIVNK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 GVILLLLIGQLEGFFLHLKEFYLTPNSPAEMLHNVTLALELLKDEGLLSCPVSPEDIVNK
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330 
pF1KE0 DAKSTLRVLYGLFCKHTQKAHRDRTPHGAPN
       :::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 DAKSTLRVLYGLFCKHTQKAHRDRTPHGAPN
              310       320       330 

>>CCDS58808.1 PARVB gene_id:29780|Hs108|chr22             (327 aa)
 initn: 862 init1: 465 opt: 863  Z-score: 1005.6  bits: 194.4 E(32554): 1.1e-49
Smith-Waterman score: 863; 45.2% identity (78.7% similar) in 301 aa overlap (19-316:25-323)

                     10        20        30        40        50    
pF1KE0       MEPEFLYDLLQLPKGVEPPAEEELSKGGKKKYLPPTSRKDPKFEELQKVLMEWI
                               : . .: .. .. .. :::..::::.:: :::..::
CCDS58 MSDLQEEGKNAINSPMSPALVDVHPEDTQLEENEERTMIDPTSKEDPKFKELVKVLLDWI
               10        20        30        40        50        60

           60        70        80        90       100       110    
pF1KE0 NATLLPEHIVVRSLEEDMFDGLILHHLFQRLAALKLEAEDIALTATSQKHKLTVVLEAVN
       : .:. :.:.:..::::..:: .:..:...::. ::.. ... .  .::.:: .:::::.
CCDS58 NDVLVEERIIVKQLEEDLYDGQVLQKLLEKLAGCKLNVAEVTQSEIGQKQKLQTVLEAVH
               70        80        90       100       110       120

          120       130       140       150       160       170    
pF1KE0 RSLQLEEWQAKWSVESIFNKDLLSTLHLLVALAKRFQPDLSLPTNVQVEVITIESTKSGL
         :. . :  .:::.:: .:.:.. :::::.:: .:.  . :: .: :.:..... .. :
CCDS58 DLLRPRGWALRWSVDSIHGKNLVAILHLLVSLAMHFRAPIRLPEHVTVQVVVVRKREGLL
              130       140       150       160       170       180

          180          190       200       210       220       230 
pF1KE0 KSEKLVEQLT---EYSTDKDEPPKDVFDELFKLAPEKVNAVKEAIVNFVNQKLDRLGLSV
       .: .. :.::   :.   . :  .:.:: ::  ::.:...::.....:::..:..:.: :
CCDS58 HSSHISEELTTTTEMMMGRFE--RDAFDTLFDHAPDKLSVVKKSLITFVNKHLNKLNLEV
              190       200         210       220       230        

             240       250       260       270       280       290 
pF1KE0 QNLDTQFADGVILLLLIGQLEGFFLHLKEFYLTPNSPAEMLHNVTLALELLKDEGLLSCP
        .:.::::::: :.::.: :: .:. :..:::::.:  . .:::..:.::. : :: .  
CCDS58 TELETQFADGVYLVLLMGLLEDYFVPLHHFYLTPESFDQKVHNVSFAFELMLDGGLKKPK
      240       250       260       270       280       290        

             300       310       320       330 
pF1KE0 VSPEDIVNKDAKSTLRVLYGLFCKHTQKAHRDRTPHGAPN
       . :::.:: : ::::::::.:: :.               
CCDS58 ARPEDVVNLDLKSTLRVLYNLFTKYKNVE           
      300       310       320                  

>>CCDS14056.1 PARVB gene_id:29780|Hs108|chr22             (364 aa)
 initn: 862 init1: 465 opt: 863  Z-score: 1004.8  bits: 194.4 E(32554): 1.2e-49
Smith-Waterman score: 863; 45.2% identity (78.7% similar) in 301 aa overlap (19-316:62-360)

                           10        20        30        40        
pF1KE0             MEPEFLYDLLQLPKGVEPPAEEELSKGGKKKYLPPTSRKDPKFEELQK
                                     : . .: .. .. .. :::..::::.:: :
CCDS14 KRRAREVSDLQEEGKNAINSPMSPALVDVHPEDTQLEENEERTMIDPTSKEDPKFKELVK
              40        50        60        70        80        90 

       50        60        70        80        90       100        
pF1KE0 VLMEWINATLLPEHIVVRSLEEDMFDGLILHHLFQRLAALKLEAEDIALTATSQKHKLTV
       ::..::: .:. :.:.:..::::..:: .:..:...::. ::.. ... .  .::.:: .
CCDS14 VLLDWINDVLVEERIIVKQLEEDLYDGQVLQKLLEKLAGCKLNVAEVTQSEIGQKQKLQT
             100       110       120       130       140       150 

      110       120       130       140       150       160        
pF1KE0 VLEAVNRSLQLEEWQAKWSVESIFNKDLLSTLHLLVALAKRFQPDLSLPTNVQVEVITIE
       :::::.  :. . :  .:::.:: .:.:.. :::::.:: .:.  . :: .: :.:....
CCDS14 VLEAVHDLLRPRGWALRWSVDSIHGKNLVAILHLLVSLAMHFRAPIRLPEHVTVQVVVVR
             160       170       180       190       200       210 

      170       180          190       200       210       220     
pF1KE0 STKSGLKSEKLVEQLT---EYSTDKDEPPKDVFDELFKLAPEKVNAVKEAIVNFVNQKLD
       . .. :.: .. :.::   :.   . :  .:.:: ::  ::.:...::.....:::..:.
CCDS14 KREGLLHSSHISEELTTTTEMMMGRFE--RDAFDTLFDHAPDKLSVVKKSLITFVNKHLN
             220       230         240       250       260         

         230       240       250       260       270       280     
pF1KE0 RLGLSVQNLDTQFADGVILLLLIGQLEGFFLHLKEFYLTPNSPAEMLHNVTLALELLKDE
       .:.: : .:.::::::: :.::.: :: .:. :..:::::.:  . .:::..:.::. : 
CCDS14 KLNLEVTELETQFADGVYLVLLMGLLEDYFVPLHHFYLTPESFDQKVHNVSFAFELMLDG
     270       280       290       300       310       320         

         290       300       310       320       330 
pF1KE0 GLLSCPVSPEDIVNKDAKSTLRVLYGLFCKHTQKAHRDRTPHGAPN
       :: .  . :::.:: : ::::::::.:: :.               
CCDS14 GLKKPKARPEDVVNLDLKSTLRVLYNLFTKYKNVE           
     330       340       350       360               

>>CCDS46724.1 PARVB gene_id:29780|Hs108|chr22             (397 aa)
 initn: 862 init1: 465 opt: 863  Z-score: 1004.3  bits: 194.4 E(32554): 1.3e-49
Smith-Waterman score: 863; 45.2% identity (78.7% similar) in 301 aa overlap (19-316:95-393)

                           10        20        30        40        
pF1KE0             MEPEFLYDLLQLPKGVEPPAEEELSKGGKKKYLPPTSRKDPKFEELQK
                                     : . .: .. .. .. :::..::::.:: :
CCDS46 EYAQGGVSDLQEEGKNAINSPMSPALVDVHPEDTQLEENEERTMIDPTSKEDPKFKELVK
           70        80        90       100       110       120    

       50        60        70        80        90       100        
pF1KE0 VLMEWINATLLPEHIVVRSLEEDMFDGLILHHLFQRLAALKLEAEDIALTATSQKHKLTV
       ::..::: .:. :.:.:..::::..:: .:..:...::. ::.. ... .  .::.:: .
CCDS46 VLLDWINDVLVEERIIVKQLEEDLYDGQVLQKLLEKLAGCKLNVAEVTQSEIGQKQKLQT
          130       140       150       160       170       180    

      110       120       130       140       150       160        
pF1KE0 VLEAVNRSLQLEEWQAKWSVESIFNKDLLSTLHLLVALAKRFQPDLSLPTNVQVEVITIE
       :::::.  :. . :  .:::.:: .:.:.. :::::.:: .:.  . :: .: :.:....
CCDS46 VLEAVHDLLRPRGWALRWSVDSIHGKNLVAILHLLVSLAMHFRAPIRLPEHVTVQVVVVR
          190       200       210       220       230       240    

      170       180          190       200       210       220     
pF1KE0 STKSGLKSEKLVEQLT---EYSTDKDEPPKDVFDELFKLAPEKVNAVKEAIVNFVNQKLD
       . .. :.: .. :.::   :.   . :  .:.:: ::  ::.:...::.....:::..:.
CCDS46 KREGLLHSSHISEELTTTTEMMMGRFE--RDAFDTLFDHAPDKLSVVKKSLITFVNKHLN
          250       260       270         280       290       300  

         230       240       250       260       270       280     
pF1KE0 RLGLSVQNLDTQFADGVILLLLIGQLEGFFLHLKEFYLTPNSPAEMLHNVTLALELLKDE
       .:.: : .:.::::::: :.::.: :: .:. :..:::::.:  . .:::..:.::. : 
CCDS46 KLNLEVTELETQFADGVYLVLLMGLLEDYFVPLHHFYLTPESFDQKVHNVSFAFELMLDG
            310       320       330       340       350       360  

         290       300       310       320       330 
pF1KE0 GLLSCPVSPEDIVNKDAKSTLRVLYGLFCKHTQKAHRDRTPHGAPN
       :: .  . :::.:: : ::::::::.:: :.               
CCDS46 GLKKPKARPEDVVNLDLKSTLRVLYNLFTKYKNVE           
            370       380       390                  

>>CCDS44541.2 PARVA gene_id:55742|Hs108|chr11             (412 aa)
 initn: 885 init1: 427 opt: 850  Z-score: 988.9  bits: 191.6 E(32554): 9.2e-49
Smith-Waterman score: 850; 43.5% identity (78.1% similar) in 301 aa overlap (19-316:110-408)

                           10        20        30        40        
pF1KE0             MEPEFLYDLLQLPKGVEPPAEEELSKGGKKKYLPPTSRKDPKFEELQK
                                     : .  : ..  . .. :.::.:::..::.:
CCDS44 RKKAKEVSELQEEGMNAINLPLSPIPFELDPEDTMLEENEVRTMVDPNSRSDPKLQELMK
      80        90       100       110       120       130         

       50        60        70        80        90       100        
pF1KE0 VLMEWINATLLPEHIVVRSLEEDMFDGLILHHLFQRLAALKLEAEDIALTATSQKHKLTV
       ::..::: .:. :.:.:..: ::..:: .:..::..: . ::.. ... .  .::.:: .
CCDS44 VLIDWINDVLVGERIIVKDLAEDLYDGQVLQKLFEKLESEKLNVAEVTQSEIAQKQKLQT
     140       150       160       170       180       190         

      110       120       130       140       150       160        
pF1KE0 VLEAVNRSLQLEEWQAKWSVESIFNKDLLSTLHLLVALAKRFQPDLSLPTNVQVEVITIE
       ::: .:..:.:   . ::.:.:.  :.:.. :::::::.. :.  . :: .:...:....
CCDS44 VLEKINETLKLPPRSIKWNVDSVHAKSLVAILHLLVALSQYFRAPIRLPDHVSIQVVVVQ
     200       210       220       230       240       250         

      170       180          190       200       210       220     
pF1KE0 STKSGLKSEKLVEQLT---EYSTDKDEPPKDVFDELFKLAPEKVNAVKEAIVNFVNQKLD
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