Result of FASTA (omim) for pF1KB6555
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB6555, 372 aa
  1>>>pF1KB6555 372 - 372 aa - 372 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.5170+/-0.000323; mu= 12.3676+/- 0.021
 mean_var=108.1054+/-21.293, 0's: 0 Z-trim(118.1): 53  B-trim: 291 in 2/53
 Lambda= 0.123353
 statistics sampled from 30732 (30790) to 30732 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.71), E-opt: 0.2 (0.361), width:  16
 Scan time:  7.900

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_060692 (OMIM: 608120) alpha-parvin [Homo sapien ( 412) 2390 435.7 9.3e-122
XP_005253072 (OMIM: 608120) PREDICTED: alpha-parvi ( 328) 2092 382.6 7.1e-106
NP_037459 (OMIM: 608121) beta-parvin isoform b [Ho ( 364) 1777 326.5 5.8e-89
NP_001003828 (OMIM: 608121) beta-parvin isoform a  ( 397) 1614 297.6 3.3e-80
NP_001230314 (OMIM: 608121) beta-parvin isoform c  ( 327) 1610 296.8 4.7e-80
XP_005261653 (OMIM: 608121) PREDICTED: beta-parvin ( 312) 1541 284.5 2.2e-76
XP_016884281 (OMIM: 608121) PREDICTED: beta-parvin ( 341) 1174 219.2 1.1e-56
NP_001230315 (OMIM: 608121) beta-parvin isoform d  ( 289)  938 177.2 4.3e-44
XP_011528604 (OMIM: 608122) PREDICTED: gamma-parvi ( 398)  859 163.2 9.4e-40
NP_001131077 (OMIM: 608122) gamma-parvin [Homo sap ( 331)  850 161.5 2.5e-39
XP_005261759 (OMIM: 608122) PREDICTED: gamma-parvi ( 331)  850 161.5 2.5e-39
NP_071424 (OMIM: 608122) gamma-parvin [Homo sapien ( 331)  850 161.5 2.5e-39
XP_016884397 (OMIM: 608122) PREDICTED: gamma-parvi ( 317)  786 150.1 6.4e-36
XP_016884396 (OMIM: 608122) PREDICTED: gamma-parvi ( 317)  786 150.1 6.4e-36


>>NP_060692 (OMIM: 608120) alpha-parvin [Homo sapiens]    (412 aa)
 initn: 2390 init1: 2390 opt: 2390  Z-score: 2307.0  bits: 435.7 E(85289): 9.3e-122
Smith-Waterman score: 2390; 100.0% identity (100.0% similar) in 372 aa overlap (1-372:41-412)

                                             10        20        30
pF1KB6                               MATSPQKSPSVPKSPTPKSPPSRKKDDSFL
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 KPQPQSRRRPLRPPSASSASRPARGSLRRAMATSPQKSPSVPKSPTPKSPPSRKKDDSFL
               20        30        40        50        60        70

               40        50        60        70        80        90
pF1KB6 GKLGGTLARRKKAKEVSELQEEGMNAINLPLSPIPFELDPEDTMLEENEVRTMVDPNSRS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 GKLGGTLARRKKAKEVSELQEEGMNAINLPLSPIPFELDPEDTMLEENEVRTMVDPNSRS
               80        90       100       110       120       130

              100       110       120       130       140       150
pF1KB6 DPKLQELMKVLIDWINDVLVGERIIVKDLAEDLYDGQVLQKLFEKLESEKLNVAEVTQSE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 DPKLQELMKVLIDWINDVLVGERIIVKDLAEDLYDGQVLQKLFEKLESEKLNVAEVTQSE
              140       150       160       170       180       190

              160       170       180       190       200       210
pF1KB6 IAQKQKLQTVLEKINETLKLPPRSIKWNVDSVHAKSLVAILHLLVALSQYFRAPIRLPDH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 IAQKQKLQTVLEKINETLKLPPRSIKWNVDSVHAKSLVAILHLLVALSQYFRAPIRLPDH
              200       210       220       230       240       250

              220       230       240       250       260       270
pF1KB6 VSIQVVVVQKREGILQSRQIQEEITGNTEALSGRHERDAFDTLFDHAPDKLNVVKKTLIT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 VSIQVVVVQKREGILQSRQIQEEITGNTEALSGRHERDAFDTLFDHAPDKLNVVKKTLIT
              260       270       280       290       300       310

              280       290       300       310       320       330
pF1KB6 FVNKHLNKLNLEVTELETQFADGVYLVLLMGLLEGYFVPLHSFFLTPDSFEQKVLNVSFA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 FVNKHLNKLNLEVTELETQFADGVYLVLLMGLLEGYFVPLHSFFLTPDSFEQKVLNVSFA
              320       330       340       350       360       370

              340       350       360       370  
pF1KB6 FELMQDGGLEKPKPRPEDIVNCDLKSTLRVLYNLFTKYRNVE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 FELMQDGGLEKPKPRPEDIVNCDLKSTLRVLYNLFTKYRNVE
              380       390       400       410  

>>XP_005253072 (OMIM: 608120) PREDICTED: alpha-parvin is  (328 aa)
 initn: 2092 init1: 2092 opt: 2092  Z-score: 2021.8  bits: 382.6 E(85289): 7.1e-106
Smith-Waterman score: 2092; 100.0% identity (100.0% similar) in 327 aa overlap (46-372:2-328)

          20        30        40        50        60        70     
pF1KB6 TPKSPPSRKKDDSFLGKLGGTLARRKKAKEVSELQEEGMNAINLPLSPIPFELDPEDTML
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005                              MVSELQEEGMNAINLPLSPIPFELDPEDTML
                                            10        20        30 

          80        90       100       110       120       130     
pF1KB6 EENEVRTMVDPNSRSDPKLQELMKVLIDWINDVLVGERIIVKDLAEDLYDGQVLQKLFEK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 EENEVRTMVDPNSRSDPKLQELMKVLIDWINDVLVGERIIVKDLAEDLYDGQVLQKLFEK
              40        50        60        70        80        90 

         140       150       160       170       180       190     
pF1KB6 LESEKLNVAEVTQSEIAQKQKLQTVLEKINETLKLPPRSIKWNVDSVHAKSLVAILHLLV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LESEKLNVAEVTQSEIAQKQKLQTVLEKINETLKLPPRSIKWNVDSVHAKSLVAILHLLV
             100       110       120       130       140       150 

         200       210       220       230       240       250     
pF1KB6 ALSQYFRAPIRLPDHVSIQVVVVQKREGILQSRQIQEEITGNTEALSGRHERDAFDTLFD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 ALSQYFRAPIRLPDHVSIQVVVVQKREGILQSRQIQEEITGNTEALSGRHERDAFDTLFD
             160       170       180       190       200       210 

         260       270       280       290       300       310     
pF1KB6 HAPDKLNVVKKTLITFVNKHLNKLNLEVTELETQFADGVYLVLLMGLLEGYFVPLHSFFL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 HAPDKLNVVKKTLITFVNKHLNKLNLEVTELETQFADGVYLVLLMGLLEGYFVPLHSFFL
             220       230       240       250       260       270 

         320       330       340       350       360       370  
pF1KB6 TPDSFEQKVLNVSFAFELMQDGGLEKPKPRPEDIVNCDLKSTLRVLYNLFTKYRNVE
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 TPDSFEQKVLNVSFAFELMQDGGLEKPKPRPEDIVNCDLKSTLRVLYNLFTKYRNVE
             280       290       300       310       320        

>>NP_037459 (OMIM: 608121) beta-parvin isoform b [Homo s  (364 aa)
 initn: 1733 init1: 1733 opt: 1777  Z-score: 1718.2  bits: 326.5 E(85289): 5.8e-89
Smith-Waterman score: 1777; 75.1% identity (91.0% similar) in 365 aa overlap (10-372:3-364)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB6 MATSPQKSPSVPKSPTPKSPPSRKKDDSFLGKLGGTLARRKKAKEVSELQEEGMNAINLP
                :.:.::::. :   :::.::::::::::::...:.:::.::::: :::: :
NP_037        MSSAPRSPTPR-PRRMKKDESFLGKLGGTLARKRRAREVSDLQEEGKNAINSP
                      10         20        30        40        50  

               70        80        90       100       110       120
pF1KB6 LSPIPFELDPEDTMLEENEVRTMVDPNSRSDPKLQELMKVLIDWINDVLVGERIIVKDLA
       .::   .. ::::.::::: :::.::.:. :::..::.:::.:::::::: ::::::.: 
NP_037 MSPALVDVHPEDTQLEENEERTMIDPTSKEDPKFKELVKVLLDWINDVLVEERIIVKQLE
             60        70        80        90       100       110  

              130       140       150       160       170          
pF1KB6 EDLYDGQVLQKLFEKLESEKLNVAEVTQSEIAQKQKLQTVLEKINETLKLPPR--SIKWN
       ::::::::::::.::: . ::::::::::::.:::::::::: ... :.  ::  ...:.
NP_037 EDLYDGQVLQKLLEKLAGCKLNVAEVTQSEIGQKQKLQTVLEAVHDLLR--PRGWALRWS
            120       130       140       150       160         170

      180       190       200       210       220       230        
pF1KB6 VDSVHAKSLVAILHLLVALSQYFRAPIRLPDHVSIQVVVVQKREGILQSRQIQEEITGNT
       :::.:.:.:::::::::.:...::::::::.::..:::::.::::.:.: .:.::.: .:
NP_037 VDSIHGKNLVAILHLLVSLAMHFRAPIRLPEHVTVQVVVVRKREGLLHSSHISEELTTTT
              180       190       200       210       220       230

      240       250       260       270       280       290        
pF1KB6 EALSGRHERDAFDTLFDHAPDKLNVVKKTLITFVNKHLNKLNLEVTELETQFADGVYLVL
       : . :: ::::::::::::::::.::::.:::::::::::::::::::::::::::::::
NP_037 EMMMGRFERDAFDTLFDHAPDKLSVVKKSLITFVNKHLNKLNLEVTELETQFADGVYLVL
              240       250       260       270       280       290

      300       310       320       330       340       350        
pF1KB6 LMGLLEGYFVPLHSFFLTPDSFEQKVLNVSFAFELMQDGGLEKPKPRPEDIVNCDLKSTL
       :::::: :::::: :.:::.::.::: ::::::::: ::::.::: ::::.:: ::::::
NP_037 LMGLLEDYFVPLHHFYLTPESFDQKVHNVSFAFELMLDGGLKKPKARPEDVVNLDLKSTL
              300       310       320       330       340       350

      360       370  
pF1KB6 RVLYNLFTKYRNVE
       ::::::::::.:::
NP_037 RVLYNLFTKYKNVE
              360    

>>NP_001003828 (OMIM: 608121) beta-parvin isoform a [Hom  (397 aa)
 initn: 1613 init1: 1613 opt: 1614  Z-score: 1560.9  bits: 297.6 E(85289): 3.3e-80
Smith-Waterman score: 1614; 76.0% identity (91.2% similar) in 329 aa overlap (46-372:71-397)

          20        30        40        50        60        70     
pF1KB6 TPKSPPSRKKDDSFLGKLGGTLARRKKAKEVSELQEEGMNAINLPLSPIPFELDPEDTML
                                     ::.::::: :::: :.::   .. ::::.:
NP_001 SQALMASLAGSLLPGSDRSGVETSEYAQGGVSDLQEEGKNAINSPMSPALVDVHPEDTQL
               50        60        70        80        90       100

          80        90       100       110       120       130     
pF1KB6 EENEVRTMVDPNSRSDPKLQELMKVLIDWINDVLVGERIIVKDLAEDLYDGQVLQKLFEK
       :::: :::.::.:. :::..::.:::.:::::::: ::::::.: ::::::::::::.::
NP_001 EENEERTMIDPTSKEDPKFKELVKVLLDWINDVLVEERIIVKQLEEDLYDGQVLQKLLEK
              110       120       130       140       150       160

         140       150       160       170         180       190   
pF1KB6 LESEKLNVAEVTQSEIAQKQKLQTVLEKINETLKLPPR--SIKWNVDSVHAKSLVAILHL
       : . ::::::::::::.:::::::::: ... :.  ::  ...:.:::.:.:.:::::::
NP_001 LAGCKLNVAEVTQSEIGQKQKLQTVLEAVHDLLR--PRGWALRWSVDSIHGKNLVAILHL
              170       180       190         200       210        

           200       210       220       230       240       250   
pF1KB6 LVALSQYFRAPIRLPDHVSIQVVVVQKREGILQSRQIQEEITGNTEALSGRHERDAFDTL
       ::.:...::::::::.::..:::::.::::.:.: .:.::.: .:: . :: ::::::::
NP_001 LVSLAMHFRAPIRLPEHVTVQVVVVRKREGLLHSSHISEELTTTTEMMMGRFERDAFDTL
      220       230       240       250       260       270        

           260       270       280       290       300       310   
pF1KB6 FDHAPDKLNVVKKTLITFVNKHLNKLNLEVTELETQFADGVYLVLLMGLLEGYFVPLHSF
       ::::::::.::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::: :
NP_001 FDHAPDKLSVVKKSLITFVNKHLNKLNLEVTELETQFADGVYLVLLMGLLEDYFVPLHHF
      280       290       300       310       320       330        

           320       330       340       350       360       370  
pF1KB6 FLTPDSFEQKVLNVSFAFELMQDGGLEKPKPRPEDIVNCDLKSTLRVLYNLFTKYRNVE
       .:::.::.::: ::::::::: ::::.::: ::::.:: ::::::::::::::::.:::
NP_001 YLTPESFDQKVHNVSFAFELMLDGGLKKPKARPEDVVNLDLKSTLRVLYNLFTKYKNVE
      340       350       360       370       380       390       

>>NP_001230314 (OMIM: 608121) beta-parvin isoform c [Hom  (327 aa)
 initn: 1609 init1: 1609 opt: 1610  Z-score: 1558.2  bits: 296.8 E(85289): 4.7e-80
Smith-Waterman score: 1610; 75.7% identity (91.2% similar) in 329 aa overlap (46-372:1-327)

          20        30        40        50        60        70     
pF1KB6 TPKSPPSRKKDDSFLGKLGGTLARRKKAKEVSELQEEGMNAINLPLSPIPFELDPEDTML
                                     .:.::::: :::: :.::   .. ::::.:
NP_001                               MSDLQEEGKNAINSPMSPALVDVHPEDTQL
                                             10        20        30

          80        90       100       110       120       130     
pF1KB6 EENEVRTMVDPNSRSDPKLQELMKVLIDWINDVLVGERIIVKDLAEDLYDGQVLQKLFEK
       :::: :::.::.:. :::..::.:::.:::::::: ::::::.: ::::::::::::.::
NP_001 EENEERTMIDPTSKEDPKFKELVKVLLDWINDVLVEERIIVKQLEEDLYDGQVLQKLLEK
               40        50        60        70        80        90

         140       150       160       170         180       190   
pF1KB6 LESEKLNVAEVTQSEIAQKQKLQTVLEKINETLKLPPR--SIKWNVDSVHAKSLVAILHL
       : . ::::::::::::.:::::::::: ... :.  ::  ...:.:::.:.:.:::::::
NP_001 LAGCKLNVAEVTQSEIGQKQKLQTVLEAVHDLLR--PRGWALRWSVDSIHGKNLVAILHL
              100       110       120         130       140        

           200       210       220       230       240       250   
pF1KB6 LVALSQYFRAPIRLPDHVSIQVVVVQKREGILQSRQIQEEITGNTEALSGRHERDAFDTL
       ::.:...::::::::.::..:::::.::::.:.: .:.::.: .:: . :: ::::::::
NP_001 LVSLAMHFRAPIRLPEHVTVQVVVVRKREGLLHSSHISEELTTTTEMMMGRFERDAFDTL
      150       160       170       180       190       200        

           260       270       280       290       300       310   
pF1KB6 FDHAPDKLNVVKKTLITFVNKHLNKLNLEVTELETQFADGVYLVLLMGLLEGYFVPLHSF
       ::::::::.::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::: :
NP_001 FDHAPDKLSVVKKSLITFVNKHLNKLNLEVTELETQFADGVYLVLLMGLLEDYFVPLHHF
      210       220       230       240       250       260        

           320       330       340       350       360       370  
pF1KB6 FLTPDSFEQKVLNVSFAFELMQDGGLEKPKPRPEDIVNCDLKSTLRVLYNLFTKYRNVE
       .:::.::.::: ::::::::: ::::.::: ::::.:: ::::::::::::::::.:::
NP_001 YLTPESFDQKVHNVSFAFELMLDGGLKKPKARPEDVVNLDLKSTLRVLYNLFTKYKNVE
      270       280       290       300       310       320       

>>XP_005261653 (OMIM: 608121) PREDICTED: beta-parvin iso  (312 aa)
 initn: 1540 init1: 1540 opt: 1541  Z-score: 1492.2  bits: 284.5 E(85289): 2.2e-76
Smith-Waterman score: 1541; 75.8% identity (91.4% similar) in 314 aa overlap (61-372:1-312)

               40        50        60        70        80        90
pF1KB6 GKLGGTLARRKKAKEVSELQEEGMNAINLPLSPIPFELDPEDTMLEENEVRTMVDPNSRS
                                     .::   .. ::::.::::: :::.::.:. 
XP_005                               MSPALVDVHPEDTQLEENEERTMIDPTSKE
                                             10        20        30

              100       110       120       130       140       150
pF1KB6 DPKLQELMKVLIDWINDVLVGERIIVKDLAEDLYDGQVLQKLFEKLESEKLNVAEVTQSE
       :::..::.:::.:::::::: ::::::.: ::::::::::::.::: . :::::::::::
XP_005 DPKFKELVKVLLDWINDVLVEERIIVKQLEEDLYDGQVLQKLLEKLAGCKLNVAEVTQSE
               40        50        60        70        80        90

              160       170         180       190       200        
pF1KB6 IAQKQKLQTVLEKINETLKLPPR--SIKWNVDSVHAKSLVAILHLLVALSQYFRAPIRLP
       :.:::::::::: ... :.  ::  ...:.:::.:.:.:::::::::.:...::::::::
XP_005 IGQKQKLQTVLEAVHDLLR--PRGWALRWSVDSIHGKNLVAILHLLVSLAMHFRAPIRLP
              100         110       120       130       140        

      210       220       230       240       250       260        
pF1KB6 DHVSIQVVVVQKREGILQSRQIQEEITGNTEALSGRHERDAFDTLFDHAPDKLNVVKKTL
       .::..:::::.::::.:.: .:.::.: .:: . :: ::::::::::::::::.::::.:
XP_005 EHVTVQVVVVRKREGLLHSSHISEELTTTTEMMMGRFERDAFDTLFDHAPDKLSVVKKSL
      150       160       170       180       190       200        

      270       280       290       300       310       320        
pF1KB6 ITFVNKHLNKLNLEVTELETQFADGVYLVLLMGLLEGYFVPLHSFFLTPDSFEQKVLNVS
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::: :.:::.::.::: :::
XP_005 ITFVNKHLNKLNLEVTELETQFADGVYLVLLMGLLEDYFVPLHHFYLTPESFDQKVHNVS
      210       220       230       240       250       260        

      330       340       350       360       370  
pF1KB6 FAFELMQDGGLEKPKPRPEDIVNCDLKSTLRVLYNLFTKYRNVE
       :::::: ::::.::: ::::.:: ::::::::::::::::.:::
XP_005 FAFELMLDGGLKKPKARPEDVVNLDLKSTLRVLYNLFTKYKNVE
      270       280       290       300       310  

>>XP_016884281 (OMIM: 608121) PREDICTED: beta-parvin iso  (341 aa)
 initn: 1130 init1: 1130 opt: 1174  Z-score: 1138.6  bits: 219.2 E(85289): 1.1e-56
Smith-Waterman score: 1588; 69.0% identity (84.7% similar) in 365 aa overlap (10-372:3-341)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB6 MATSPQKSPSVPKSPTPKSPPSRKKDDSFLGKLGGTLARRKKAKEVSELQEEGMNAINLP
                :.:.::::. :   :::.::::::::::::...:.:::.::::: :::: :
XP_016        MSSAPRSPTPR-PRRMKKDESFLGKLGGTLARKRRAREVSDLQEEGKNAINSP
                      10         20        30        40        50  

               70        80        90       100       110       120
pF1KB6 LSPIPFELDPEDTMLEENEVRTMVDPNSRSDPKLQELMKVLIDWINDVLVGERIIVKDLA
       .::   .. ::::.::::: :::.::.:. :::..::.:::.:::::::: ::::::.: 
XP_016 MSPALVDVHPEDTQLEENEERTMIDPTSKEDPKFKELVKVLLDWINDVLVEERIIVKQLE
             60        70        80        90       100       110  

              130       140       150       160       170          
pF1KB6 EDLYDGQVLQKLFEKLESEKLNVAEVTQSEIAQKQKLQTVLEKINETLKLPPR--SIKWN
       ::::::::::::.::: . ::::::::::::.:::::::::: ... :.  ::  ...:.
XP_016 EDLYDGQVLQKLLEKLAGCKLNVAEVTQSEIGQKQKLQTVLEAVHDLLR--PRGWALRWS
            120       130       140       150       160         170

      180       190       200       210       220       230        
pF1KB6 VDSVHAKSLVAILHLLVALSQYFRAPIRLPDHVSIQVVVVQKREGILQSRQIQEEITGNT
       :::.:.:.:::::::::.:...::::::::.::..:::::.::::.:.: .:.::.: .:
XP_016 VDSIHGKNLVAILHLLVSLAMHFRAPIRLPEHVTVQVVVVRKREGLLHSSHISEELTTTT
              180       190       200       210       220       230

      240       250       260       270       280       290        
pF1KB6 EALSGRHERDAFDTLFDHAPDKLNVVKKTLITFVNKHLNKLNLEVTELETQFADGVYLVL
       : . :: ::::::::::::::::.::::                       :::::::::
XP_016 EMMMGRFERDAFDTLFDHAPDKLSVVKK-----------------------FADGVYLVL
              240       250                              260       

      300       310       320       330       340       350        
pF1KB6 LMGLLEGYFVPLHSFFLTPDSFEQKVLNVSFAFELMQDGGLEKPKPRPEDIVNCDLKSTL
       :::::: :::::: :.:::.::.::: ::::::::: ::::.::: ::::.:: ::::::
XP_016 LMGLLEDYFVPLHHFYLTPESFDQKVHNVSFAFELMLDGGLKKPKARPEDVVNLDLKSTL
       270       280       290       300       310       320       

      360       370  
pF1KB6 RVLYNLFTKYRNVE
       ::::::::::.:::
XP_016 RVLYNLFTKYKNVE
       330       340 

>>NP_001230315 (OMIM: 608121) beta-parvin isoform d [Hom  (289 aa)
 initn: 937 init1: 937 opt: 938  Z-score: 912.7  bits: 177.2 E(85289): 4.3e-44
Smith-Waterman score: 1352; 68.8% identity (84.1% similar) in 314 aa overlap (61-372:1-289)

               40        50        60        70        80        90
pF1KB6 GKLGGTLARRKKAKEVSELQEEGMNAINLPLSPIPFELDPEDTMLEENEVRTMVDPNSRS
                                     .::   .. ::::.::::: :::.::.:. 
NP_001                               MSPALVDVHPEDTQLEENEERTMIDPTSKE
                                             10        20        30

              100       110       120       130       140       150
pF1KB6 DPKLQELMKVLIDWINDVLVGERIIVKDLAEDLYDGQVLQKLFEKLESEKLNVAEVTQSE
       :::..::.:::.:::::::: ::::::.: ::::::::::::.::: . :::::::::::
NP_001 DPKFKELVKVLLDWINDVLVEERIIVKQLEEDLYDGQVLQKLLEKLAGCKLNVAEVTQSE
               40        50        60        70        80        90

              160       170         180       190       200        
pF1KB6 IAQKQKLQTVLEKINETLKLPPR--SIKWNVDSVHAKSLVAILHLLVALSQYFRAPIRLP
       :.:::::::::: ... :.  ::  ...:.:::.:.:.:::::::::.:...::::::::
NP_001 IGQKQKLQTVLEAVHDLLR--PRGWALRWSVDSIHGKNLVAILHLLVSLAMHFRAPIRLP
              100         110       120       130       140        

      210       220       230       240       250       260        
pF1KB6 DHVSIQVVVVQKREGILQSRQIQEEITGNTEALSGRHERDAFDTLFDHAPDKLNVVKKTL
       .::..:::::.::::.:.: .:.::.: .:: . :: ::::::::::::::::.::::  
NP_001 EHVTVQVVVVRKREGLLHSSHISEELTTTTEMMMGRFERDAFDTLFDHAPDKLSVVKK--
      150       160       170       180       190       200        

      270       280       290       300       310       320        
pF1KB6 ITFVNKHLNKLNLEVTELETQFADGVYLVLLMGLLEGYFVPLHSFFLTPDSFEQKVLNVS
                            ::::::::::::::: :::::: :.:::.::.::: :::
NP_001 ---------------------FADGVYLVLLMGLLEDYFVPLHHFYLTPESFDQKVHNVS
                             210       220       230       240     

      330       340       350       360       370  
pF1KB6 FAFELMQDGGLEKPKPRPEDIVNCDLKSTLRVLYNLFTKYRNVE
       :::::: ::::.::: ::::.:: ::::::::::::::::.:::
NP_001 FAFELMLDGGLKKPKARPEDVVNLDLKSTLRVLYNLFTKYKNVE
         250       260       270       280         

>>XP_011528604 (OMIM: 608122) PREDICTED: gamma-parvin is  (398 aa)
 initn: 885 init1: 427 opt: 859  Z-score: 834.7  bits: 163.2 E(85289): 9.4e-40
Smith-Waterman score: 859; 42.4% identity (76.1% similar) in 335 aa overlap (39-368:53-383)

       10        20        30        40        50          60      
pF1KB6 PSVPKSPTPKSPPSRKKDDSFLGKLGGTLARRKKAKEVSELQE-EGMNAINL-PLSPIPF
                                     ..:.: : :.::  :.:.   :  :  .: 
XP_011 SNWTGAGGRAGSQPFVGDGTLGTPNFCWDHKEKRAAE-SQLQAWEAMEPEFLYDLLQLPK
             30        40        50         60        70        80 

         70         80        90       100       110       120     
pF1KB6 ELDPE-DTMLEENEVRTMVDPNSRSDPKLQELMKVLIDWINDVLVGERIIVKDLAEDLYD
        ..:  .  : ..  . .. :.::.:::..::.:::..::: .:. :.:.:..: ::..:
XP_011 GVEPPAEEELSKGGKKKYLPPTSRKDPKFEELQKVLMEWINATLLPEHIVVRSLEEDMFD
              90       100       110       120       130       140 

         130       140       150       160       170       180     
pF1KB6 GQVLQKLFEKLESEKLNVAEVTQSEIAQKQKLQTVLEKINETLKLPPRSIKWNVDSVHAK
       : .:..::..: . ::.. ... .  .::.:: .::: .:..:.:   . ::.:.:.  :
XP_011 GLILHHLFQRLAALKLEAEDIALTATSQKHKLTVVLEAVNRSLQLEEWQAKWSVESIFNK
             150       160       170       180       190       200 

         190       200       210       220       230       240     
pF1KB6 SLVAILHLLVALSQYFRAPIRLPDHVSIQVVVVQKREGILQSRQIQEEITGNTEALSGRH
       .:.. :::::::.. :.  . :: .:...:..... .. :.:... :..:   :  . . 
XP_011 DLLSTLHLLVALAKRFQPDLSLPTNVQVEVITIESTKSGLKSEKLVEQLT---EYSTDKD
             210       220       230       240       250           

           250       260       270       280       290       300   
pF1KB6 E--RDAFDTLFDHAPDKLNVVKKTLITFVNKHLNKLNLEVTELETQFADGVYLVLLMGLL
       :  .:.:: ::  ::.:.:.::.....:::..:..:.: : .:.::::::: :.::.: :
XP_011 EPPKDVFDELFKLAPEKVNAVKEAIVNFVNQKLDRLGLSVQNLDTQFADGVILLLLIGQL
      260       270       280       290       300       310        

           310       320       330       340       350       360   
pF1KB6 EGYFVPLHSFFLTPDSFEQKVLNVSFAFELMQDGGLEKPKPRPEDIVNCDLKSTLRVLYN
       ::.:. :. :.:::.:  . . ::..:.::..: :: .    :::::: : ::::::::.
XP_011 EGFFLHLKEFYLTPNSPAEMLHNVTLALELLKDEGLLSCPVSPEDIVNKDAKSTLRVLYG
      320       330       340       350       360       370        

           370             
pF1KB6 LFTKYRNVE           
       :: :.               
XP_011 LFCKHTQKAHRDRTPHGAPN
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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