Result of FASTA (omim) for pF1KB4465
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB4465, 2321 aa
  1>>>pF1KB4465 2321 - 2321 aa - 2321 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 12.6269+/-0.000541; mu= -5.8535+/- 0.034
 mean_var=690.7390+/-141.209, 0's: 0 Z-trim(122.4): 609  B-trim: 0 in 0/59
 Lambda= 0.048800
 statistics sampled from 39719 (40425) to 39719 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.743), E-opt: 0.2 (0.474), width:  16
 Scan time: 23.070

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_000426 (OMIM: 125310,130720,600276,615293) neur (2321) 17489 1249.1       0
XP_005259981 (OMIM: 125310,130720,600276,615293) P (2269) 11144 802.4       0
NP_060087 (OMIM: 109730,190198,616028) neurogenic  (2555) 5428 400.0  2e-109
XP_005270958 (OMIM: 102500,600275,610205) PREDICTE (2432) 5232 386.2 2.7e-105
XP_011539822 (OMIM: 102500,600275,610205) PREDICTE (2432) 5232 386.2 2.7e-105
XP_016856862 (OMIM: 102500,600275,610205) PREDICTE (2432) 5232 386.2 2.7e-105
XP_016856861 (OMIM: 102500,600275,610205) PREDICTE (2455) 5232 386.2 2.7e-105
XP_011539821 (OMIM: 102500,600275,610205) PREDICTE (2467) 5232 386.2 2.7e-105
NP_077719 (OMIM: 102500,600275,610205) neurogenic  (2471) 5232 386.2 2.7e-105
NP_001186930 (OMIM: 102500,600275,610205) neurogen (1235) 4915 363.5 9.4e-99
XP_011517019 (OMIM: 109730,190198,616028) PREDICTE (2314) 4706 349.1 3.7e-94
NP_004548 (OMIM: 164951) neurogenic locus notch ho (2003) 2443 189.7 3.1e-46
NP_001136272 (OMIM: 602772,612424) protein eyes sh (3144) 1610 131.3 1.8e-28
NP_001278938 (OMIM: 602772,612424) protein eyes sh (3165) 1610 131.3 1.9e-28
NP_000129 (OMIM: 102370,129600,134797,154700,18490 (2871) 1497 123.3 4.3e-26
XP_016859270 (OMIM: 616634) PREDICTED: sushi, nido (1309) 1300 109.0   4e-22
XP_016859268 (OMIM: 616634) PREDICTED: sushi, nido (1309) 1300 109.0   4e-22
XP_016859269 (OMIM: 616634) PREDICTED: sushi, nido (1309) 1300 109.0   4e-22
XP_016859267 (OMIM: 616634) PREDICTED: sushi, nido (1309) 1300 109.0   4e-22
XP_011509236 (OMIM: 616634) PREDICTED: sushi, nido (1315) 1300 109.0   4e-22
XP_011509235 (OMIM: 616634) PREDICTED: sushi, nido (1351) 1300 109.0 4.1e-22
XP_011509234 (OMIM: 616634) PREDICTED: sushi, nido (1404) 1300 109.0 4.2e-22
NP_001073906 (OMIM: 616634) sushi, nidogen and EGF (1413) 1300 109.0 4.2e-22
XP_016859264 (OMIM: 616634) PREDICTED: sushi, nido (1425) 1300 109.0 4.2e-22
XP_016859263 (OMIM: 616634) PREDICTED: sushi, nido (1434) 1300 109.1 4.2e-22
XP_011509233 (OMIM: 616634) PREDICTED: sushi, nido (1437) 1300 109.1 4.2e-22
XP_016859262 (OMIM: 616634) PREDICTED: sushi, nido (1458) 1300 109.1 4.3e-22
NP_001244895 (OMIM: 172870,600105,604210,613835) p ( 870) 1275 107.0 1.1e-21
XP_016859265 (OMIM: 616634) PREDICTED: sushi, nido (1420) 1269 106.9 1.9e-21
XP_011509239 (OMIM: 616634) PREDICTED: sushi, nido ( 905) 1253 105.5 3.2e-21
XP_016864717 (OMIM: 121050,612570,616118) PREDICTE (2861) 1255 106.3 5.8e-21
NP_001990 (OMIM: 121050,612570,616118) fibrillin-2 (2912) 1255 106.3 5.9e-21
XP_006710469 (OMIM: 604266) PREDICTED: multiple ep (1436) 1245 105.2 6.2e-21
NP_002217 (OMIM: 602570) protein jagged-2 isoform  (1238) 1241 104.8 6.9e-21
XP_016883196 (OMIM: 118450,187500,601920) PREDICTE (1059) 1198 101.7 5.1e-20
NP_000205 (OMIM: 118450,187500,601920) protein jag (1218) 1198 101.8 5.5e-20
XP_011507669 (OMIM: 172870,600105,604210,613835) P (1297) 1190 101.3 8.5e-20
XP_011507667 (OMIM: 172870,600105,604210,613835) P (1349) 1190 101.3 8.7e-20
NP_957705 (OMIM: 172870,600105,604210,613835) prot (1406) 1190 101.3 8.9e-20
XP_011539189 (OMIM: 604266) PREDICTED: multiple ep (1395) 1173 100.1   2e-19
XP_016856341 (OMIM: 172870,600105,604210,613835) P (1451) 1160 99.2 3.9e-19
NP_660142 (OMIM: 602570) protein jagged-2 isoform  (1200) 1156 98.8 4.3e-19
NP_001244894 (OMIM: 172870,600105,604210,613835) p (1382) 1101 95.0 6.8e-18
NP_620711 (OMIM: 607299) delta and Notch-like epid ( 737) 1008 88.1 4.3e-16
XP_011516858 (OMIM: 219730,609720,616220) PREDICTE (1276)  986 86.9 1.8e-15
NP_775960 (OMIM: 219730,609720,616220) protein cru (1285)  962 85.2 5.7e-15
NP_699197 (OMIM: 611691) sushi, von Willebrand fac (3571)  959 85.5 1.2e-14
XP_011516859 (OMIM: 219730,609720,616220) PREDICTE (1220)  942 83.8 1.5e-14
XP_011516860 (OMIM: 219730,609720,616220) PREDICTE (1220)  942 83.8 1.5e-14
XP_011525684 (OMIM: 604710,613177) PREDICTED: late (1554)  945 84.1 1.5e-14


>>NP_000426 (OMIM: 125310,130720,600276,615293) neurogen  (2321 aa)
 initn: 17489 init1: 17489 opt: 17489  Z-score: 6675.2  bits: 1249.1 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 17489; 100.0% identity (100.0% similar) in 2321 aa overlap (1-2321:1-2321)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB4 MGPGARGRRRRRRPMSPPPPPPPVRALPLLLLLAGPGAAAPPCLDGSPCANGGRCTQLPS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 MGPGARGRRRRRRPMSPPPPPPPVRALPLLLLLAGPGAAAPPCLDGSPCANGGRCTQLPS
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB4 REAACLCPPGWVGERCQLEDPCHSGPCAGRGVCQSSVVAGTARFSCRCPRGFRGPDCSLP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 REAACLCPPGWVGERCQLEDPCHSGPCAGRGVCQSSVVAGTARFSCRCPRGFRGPDCSLP
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB4 DPCLSSPCAHGARCSVGPDGRFLCSCPPGYQGRSCRSDVDECRVGEPCRHGGTCLNTPGS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 DPCLSSPCAHGARCSVGPDGRFLCSCPPGYQGRSCRSDVDECRVGEPCRHGGTCLNTPGS
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB4 FRCQCPAGYTGPLCENPAVPCAPSPCRNGGTCRQSGDLTYDCACLPGFEGQNCEVNVDDC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 FRCQCPAGYTGPLCENPAVPCAPSPCRNGGTCRQSGDLTYDCACLPGFEGQNCEVNVDDC
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB4 PGHRCLNGGTCVDGVNTYNCQCPPEWTGQFCTEDVDECQLQPNACHNGGTCFNTLGGHSC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 PGHRCLNGGTCVDGVNTYNCQCPPEWTGQFCTEDVDECQLQPNACHNGGTCFNTLGGHSC
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB4 VCVNGWTGESCSQNIDDCATAVCFHGATCHDRVASFYCACPMGKTGLLCHLDDACVSNPC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 VCVNGWTGESCSQNIDDCATAVCFHGATCHDRVASFYCACPMGKTGLLCHLDDACVSNPC
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB4 HEDAICDTNPVNGRAICTCPPGFTGGACDQDVDECSIGANPCEHLGRCVNTQGSFLCQCG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 HEDAICDTNPVNGRAICTCPPGFTGGACDQDVDECSIGANPCEHLGRCVNTQGSFLCQCG
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB4 RGYTGPRCETDVNECLSGPCRNQATCLDRIGQFTCICMAGFTGTYCEVDIDECQSSPCVN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 RGYTGPRCETDVNECLSGPCRNQATCLDRIGQFTCICMAGFTGTYCEVDIDECQSSPCVN
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB4 GGVCKDRVNGFSCTCPSGFSGSTCQLDVDECASTPCRNGAKCVDQPDGYECRCAEGFEGT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 GGVCKDRVNGFSCTCPSGFSGSTCQLDVDECASTPCRNGAKCVDQPDGYECRCAEGFEGT
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB4 LCDRNVDDCSPDPCHHGRCVDGIASFSCACAPGYTGTRCESQVDECRSQPCRHGGKCLDL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 LCDRNVDDCSPDPCHHGRCVDGIASFSCACAPGYTGTRCESQVDECRSQPCRHGGKCLDL
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB4 VDKYLCRCPSGTTGVNCEVNIDDCASNPCTFGVCRDGINRYDCVCQPGFTGPLCNVEINE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 VDKYLCRCPSGTTGVNCEVNIDDCASNPCTFGVCRDGINRYDCVCQPGFTGPLCNVEINE
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB4 CASSPCGEGGSCVDGENGFRCLCPPGSLPPLCLPPSHPCAHEPCSHGICYDAPGGFRCVC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 CASSPCGEGGSCVDGENGFRCLCPPGSLPPLCLPPSHPCAHEPCSHGICYDAPGGFRCVC
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KB4 EPGWSGPRCSQSLARDACESQPCRAGGTCSSDGMGFHCTCPPGVQGRQCELLSPCTPNPC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 EPGWSGPRCSQSLARDACESQPCRAGGTCSSDGMGFHCTCPPGVQGRQCELLSPCTPNPC
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KB4 EHGGRCESAPGQLPVCSCPQGWQGPRCQQDVDECAGPAPCGPHGICTNLAGSFSCTCHGG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 EHGGRCESAPGQLPVCSCPQGWQGPRCQQDVDECAGPAPCGPHGICTNLAGSFSCTCHGG
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KB4 YTGPSCDQDINDCDPNPCLNGGSCQDGVGSFSCSCLPGFAGPRCARDVDECLSNPCGPGT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 YTGPSCDQDINDCDPNPCLNGGSCQDGVGSFSCSCLPGFAGPRCARDVDECLSNPCGPGT
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KB4 CTDHVASFTCTCPPGYGGFHCEQDLPDCSPSSCFNGGTCVDGVNSFSCLCRPGYTGAHCQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 CTDHVASFTCTCPPGYGGFHCEQDLPDCSPSSCFNGGTCVDGVNSFSCLCRPGYTGAHCQ
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KB4 HEADPCLSRPCLHGGVCSAAHPGFRCTCLESFTGPQCQTLVDWCSRQPCQNGGRCVQTGA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 HEADPCLSRPCLHGGVCSAAHPGFRCTCLESFTGPQCQTLVDWCSRQPCQNGGRCVQTGA
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KB4 YCLCPPGWSGRLCDIRSLPCREAAAQIGVRLEQLCQAGGQCVDEDSSHYCVCPEGRTGSH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 YCLCPPGWSGRLCDIRSLPCREAAAQIGVRLEQLCQAGGQCVDEDSSHYCVCPEGRTGSH
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KB4 CEQEVDPCLAQPCQHGGTCRGYMGGYMCECLPGYNGDNCEDDVDECASQPCQHGGSCIDL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 CEQEVDPCLAQPCQHGGTCRGYMGGYMCECLPGYNGDNCEDDVDECASQPCQHGGSCIDL
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KB4 VARYLCSCPPGTLGVLCEINEDDCGPGPPLDSGPRCLHNGTCVDLVGGFRCTCPPGYTGL
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       ::.::::.: . ::::::::.:::::: :.:: ::.:::::::.::::::: :.:.:: :
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pF1KB4 SFLCQCGRGYTGPRCETDVNECLSGPCRNQATCLDRIGQFTCICMAGFTGTYCEVDIDEC
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NP_060 SFECQCLQGYTGPRCEIDVNECVSNPCQNDATCLDQIGEFQCICMPGYEGVHCEVNTDEC
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pF1KB4 AEGFEGTLCDRNVDDCSPDPCHHGRCVDGIASFSCACAPGYTGTRCESQVDECRSQPCRH
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NP_060 TEGYTGTHCEVDIDECDPDPCHYGSCKDGVATFTCLCRPGYTGHHCETNINECSSQPCRH
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NP_060 GGTCQDRDNAYLCFCLKGTTGPNCEINLDDCASSPCDSGTCLDKIDGYECACEPGYTGSM
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pF1KB4 PEELLRSSADFLQRLSAILRTSLRFRLDAHGQAMVFPYH--RPSPGSEPRARRELAP---
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pF1KB4 GGYMCECLPGYNGDNCEDDVDECASQPCQHGGSCIDLVARYLCSCPPGTLGVLCEINEDD
       ::: :::.:::.: ::: .:::: .::::.::.::::: .. ::::::: :.::: : ::
NP_077 GGYRCECVPGYQGVNCEYEVDECQNQPCQNGGTCIDLVNHFKCSCPPGTRGLLCEENIDD
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pF1KB4 CGPGPPLDSGPRCLHNGTCVDLVGGFRCTCPPGYTGLRCEADINECRSGACHAAHTRDCL
       :.       ::.::..: :.: .::. : : ::..: :::.::::: :. : .  . ::.
NP_077 CA------RGPHCLNGGQCMDRIGGYSCRCLPGFAGERCEGDINECLSNPCSSEGSLDCI
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pF1KB4 QDPGGGFRCLCHAGFSGPRCQTVLSPCESQPCQHGGQCR-PSPGPGGGLTFTCHCAQPFW
       :  .  . :.:...:.: .:.: .. : ..:: .:: :   :  : :   : :.:   : 
NP_077 QLTND-YLCVCRSAFTGRHCETFVDVCPQMPCLNGGTCAVASNMPDG---FICRCPPGFS
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pF1KB4 GPRCERVARSCRELQCPVGVPCQQTPRGPRCACPPGLSGPSCRSFPGSPPGASNASCAAA
       : ::.    :: ...:  :  : .:  :::: ::   :  .:.:           .::..
NP_077 GARCQS---SCGQVKCRKGEQCVHTASGPRCFCP---SPRDCES-----------GCASS
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pF1KB4 PCLHGGSCRPAPLAPFFRCACAQGWTGPRCEAPAAAPEVSEEP-RCPRAACQAKRGDQRC
       :: :::::.:    :.. : ::  ..: :::  .: :  :  :  :    :  :  :  :
NP_077 PCQHGGSCHPQRQPPYYSCQCAPPFSGSRCELYTAPP--STPPATCLSQYCADKARDGVC
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pF1KB4 DRECNSPGCGWDGGDCSLSVGDPWRQCEA-LQCWRLFNNSRCDPACSSPACLYDNFDCHA
       :. ::: .: ::::::::.. .:: .: . : ::  .:: .::  :..  ::.:::.:. 
NP_077 DEACNSHACQWDGGDCSLTMENPWANCSSPLPCWDYINN-QCDELCNTVECLFDNFECQ-
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pF1KB4 GGRERTCNPVYEKYCADHFADGRCDQGCNTEECGWDGLDCASEVPALLARGVLVLTVLLP
        :  .::.  :.::::::: :..::::::.:::::::::::.. :  ::.:.::..::.:
NP_077 -GNSKTCK--YDKYCADHFKDNHCDQGCNSEECGWDGLDCAADQPENLAEGTLVIVVLMP
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pF1KB4 PEELLRSSADFLQRLSAILRTSLRFRLDAHGQAMVFPYH--RPSPGSEPRARRELAP---
       ::.::... .::. :...:.:.::.. :..:. ::.::.  . .  .. :  :.  :   
NP_077 PEQLLQDARSFLRALGTLLHTNLRIKRDSQGELMVYPYYGEKSAAMKKQRMTRRSLPGEQ
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pF1KB4 --EVIGSVVMLEIDNRLCLQSPENDHCFPDAQSAADYLGALSAVERLDFPYPLRDVRGEP
         :: :: :.:::::: :.:  ..:::: ....::  : :  :..   . ::: .: .: 
NP_077 EQEVAGSKVFLEIDNRQCVQ--DSDHCFKNTDAAAALL-ASHAIQGT-LSYPLVSVVSES
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pF1KB4 LEPPEPSVPLLPLLVAGAVLLLVILVLGVMVARRKREHSTLWFPEGFSLHKDVASGHKGR
       : : . .  :: ::....:..: :..:::..:.:::.:..::.::::.:..: ::.:: :
NP_077 LTPERTQ--LLYLLAVAVVIILFIILLGVIMAKRKRKHGSLWLPEGFTLRRD-ASNHK-R
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pF1KB4 REPVGQDALGMKNMAKGES---LMGEVATD-WMDTECPEAKRLKVEEPGMGAEE--AVDC
       ::::::::.:.::..   :   :.:  ... :.: : :. :..:.:. .. .::   .: 
NP_077 REPVGQDAVGLKNLSVQVSEANLIGTGTSEHWVDDEGPQPKKVKAEDEALLSEEDDPIDR
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pF1KB4 RQWTQHHLVAADIRVAPAMALTPPQGDADADGMDVNVRGPDGFTPLMLASFCGGALEPMP
       : :::.:: ::::: .:..::::::.. ..: .::::::::: :::::::. ::. . . 
NP_077 RPWTQQHLEAADIRRTPSLALTPPQAEQEVDVLDVNVRGPDGCTPLMLASLRGGSSD-LS
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pF1KB4 TEEDEADDTSASIISDLICQGAQLGARTDRTGETALHLAARYARADAAKRLLDAGADTNA
        :...:.:.::.::.::. :::.: :.:::::: ::::::::.::::::::::::::.::
NP_077 DEDEDAEDSSANIITDLVYQGASLQAQTDRTGEMALHLAARYSRADAAKRLLDAGADANA
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pF1KB4 QDHSGRTPLHTAVTADAQGVFQILIRNRSTDLDARMADGSTALILAARLAVEGMVEELIA
       ::. :: :::.::.:::::::::::::: ::::::: ::.: ::::::::::::: ::: 
NP_077 QDNMGRCPLHAAVAADAQGVFQILIRNRVTDLDARMNDGTTPLILAARLAVEGMVAELIN
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pF1KB4 SHADVNAVDELGKSALHWAAAVNNVEATLALLKNGANKDMQDSKEETPLFLAAREGSYEA
        .:::::::. :::::::::::::::::: :::::::.::::.:::::::::::::::::
NP_077 CQADVNAVDDHGKSALHWAAAVNNVEATLLLLKNGANRDMQDNKEETPLFLAAREGSYEA
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pF1KB4 AKLLLDHFANREITDHLDRLPRDVAQERLHQDIVRLLDQPSGPRSPPGP---HGLGPLLC
       ::.::::::::.::::.::::::::..:.:.:::::::. .   ::::     .:.:..:
NP_077 AKILLDHFANRDITDHMDRLPRDVARDRMHHDIVRLLDEYNVTPSPPGTVLTSALSPVIC
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pF1KB4 PPGAFLPGLKAAQSGSKKSRRPPGKAGLGPQGP---------RGRGKKLTLACPGPLADS
        :.  . .:: .  : :::::: .:. .  . :         .:  .: .:.    :..:
NP_077 GPNRSFLSLKHTPMG-KKSRRPSAKSTMPTSLPNLAKEAKDAKGSRRKKSLSEKVQLSES
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pF1KB4 SVTLSPVDSLDSPRPF----GGPP--ASPGGF-----PL---EGPYAAATAT-AVSLAQL
       ::::::::::.::. .     . :  .::: .     :.    .: : . :  :.:...:
NP_077 SVTLSPVDSLESPHTYVSDTTSSPMITSPGILQASPNPMLATAAPPAPVHAQHALSFSNL
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pF1KB4 --------GG----PGRAGLGRQ-----PPGGCVLSLGLLNPVAVPLDWA-RLP-PPAPP
               :.    :. . :  .     : .: . ::. :.:: :: ::  :.    .  
NP_077 HEMQPLAHGASTVLPSVSQLLSHHHIVSPGSGSAGSLSRLHPVPVPADWMNRMEVNETQY
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pF1KB4 GPSFLLPLAPGPQLLNPGTPVSPQERPPPYLAVPGHGEEYPAAGAHSSPPKARFLRVPS-
       .  : . :::. .  .::  ..:: :::      :.    :    .  :: . :  .:. 
NP_077 NEMFGMVLAPA-EGTHPG--IAPQSRPPE-----GKHITTPR---EPLPPIVTFQLIPKG
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pF1KB4 --EHPYLTPSPESPEHWASPSP-PSLSDWSEST--PSPATATGAMATTTGALPAQPLPLS
          .:  .:.:.:    :  .: :.. .  : .  :: :  :. :    : .    ::  
NP_077 SIAQPAGAPQPQSTCPPAVAGPLPTMYQIPEMARLPSVAFPTAMMPQQDGQVAQTILPAY
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pF1KB4 VPSSLAQAQTQLGPQPEVTPKRQVLA                                  
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NP_077 HPFPASVGKYPTPPSQHSYASSNAAERTPSHSGHLQGEHPYLTPSPESPDQWSSSSPHSA
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>>NP_001186930 (OMIM: 102500,600275,610205) neurogenic l  (1235 aa)
 initn: 4115 init1: 2003 opt: 4915  Z-score: 1894.0  bits: 363.5 E(85289): 9.4e-99
Smith-Waterman score: 5322; 54.9% identity (75.2% similar) in 1162 aa overlap (42-1155:67-1220)

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pF1KB4 RRPMSPPPPPPPVRALPLLLLLAGPGAAAPPCLDGSPCANGGRCT-QLPSREAACLCPPG
                                     :: . . : ::: :. :    .:.: :  :
NP_001 NEGMCVTYHNGTGYCKCPEGFLGEYCQHRDPC-EKNRCQNGGTCVAQAMLGKATCRCASG
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pF1KB4 WVGERCQLED--PCH-SGPCAGRGVCQSSVVAGTARFSCRCPRGFRGPDCSLPDPCLSSP
       ..:: ::     ::  : :: . :.:.   . .   . : :  :: : .:.  : ::: :
NP_001 FTGEDCQYSTSHPCFVSRPCLNGGTCH---MLSRDTYECTCQVGFTGKECQWTDACLSHP
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pF1KB4 CAHGARCSVGPDGRFLCSCPPGYQGRSCRSDVDECRVGEPCRHGGTCLNTPGSFRCQCPA
       ::.:. :..  . .: :.:  :. :..:..::.:: .   :.::::::: :::..:::: 
NP_001 CANGSTCTTVAN-QFSCKCLTGFTGQKCETDVNECDIPGHCQHGGTCLNLPGSYQCQCPQ
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pF1KB4 GYTGPLCENPAVPCAPSPCRNGGTCRQSGDLTYDCACLPGFEGQNCEVNVDDCPGHRCLN
       :.::  :..  :::::::: :::::::.::.:..: :::::::..:: :.::::.::: :
NP_001 GFTGQYCDSLYVPCAPSPCVNGGTCRQTGDFTFECNCLPGFEGSTCERNIDDCPNHRCQN
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pF1KB4 GGTCVDGVNTYNCQCPPEWTGQFCTEDVDECQLQPNACHNGGTCFNTLGGHSCVCVNGWT
       ::.::::::::::.:::.::::::::::::: ::::::.::::: :  ::..:::::::.
NP_001 GGVCVDGVNTYNCRCPPQWTGQFCTEDVDECLLQPNACQNGGTCANRNGGYGCVCVNGWS
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pF1KB4 GESCSQNIDDCATAVCFHGATCHDRVASFYCACPMGKTGLLCHLDDACVSNPCHEDAICD
       :..::.:::::: : :  :.:: :::::: : :: ::.::::::::::.:::::. :.::
NP_001 GDDCSENIDDCAFASCTPGSTCIDRVASFSCMCPEGKAGLLCHLDDACISNPCHKGALCD
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pF1KB4 TNPVNGRAICTCPPGFTGGACDQDVDECSIG-ANPCEHLGRCVNTQGSFLCQCGRGYTGP
       :::.::. ::::: :. :. : .:::::... .::::: :.::::.:.: :.: .::.::
NP_001 TNPLNGQYICTCPQGYKGADCTEDVDECAMANSNPCEHAGKCVNTDGAFHCECLKGYAGP
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pF1KB4 RCETDVNECLSGPCRNQATCLDRIGQFTCICMAGFTGTYCEVDIDECQSSPCVNGGVCKD
       ::: :.::: : ::.:.:::::.:: :::.:: :: :..::..:.::::.::::.: : :
NP_001 RCEMDINECHSDPCQNDATCLDKIGGFTCLCMPGFKGVHCELEINECQSNPCVNNGQCVD
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pF1KB4 RVNGFSCTCPSGFSGSTCQLDVDECASTPCRNGAKCVDQPDGYECRCAEGFEGTLCDRNV
       .:: :.: :: ::.: .::.:.:.:.:::: :::::.:.:.::::.:: :: :.::..:.
NP_001 KVNRFQCLCPPGFTGPVCQIDIDDCSSTPCLNGAKCIDHPNGYECQCATGFTGVLCEENI
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pF1KB4 DDCSPDPCHHGRCVDGIASFSCACAPGYTGTRCESQVDECRSQPCRHGGKCLDLVDKYLC
       :.:.:::::::.: ::: :..: : ::: :. : .:.::: :.:: . :.:.:::. : :
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