FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB5387, 543 aa 1>>>pF1KB5387 543 - 543 aa - 543 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2684+/-0.00099; mu= 18.8039+/- 0.060 mean_var=67.6596+/-13.009, 0's: 0 Z-trim(104.7): 23 B-trim: 0 in 0/50 Lambda= 0.155923 statistics sampled from 8008 (8026) to 8008 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.609), E-opt: 0.2 (0.247), width: 16 Scan time: 3.350 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS5684.1 MCM7 gene_id:4176|Hs108|chr7 ( 543) 3538 805.2 0 CCDS5683.1 MCM7 gene_id:4176|Hs108|chr7 ( 719) 3538 805.3 0 CCDS13915.1 MCM5 gene_id:4174|Hs108|chr22 ( 734) 981 230.1 7.1e-60 CCDS6143.1 MCM4 gene_id:4173|Hs108|chr8 ( 863) 967 227.0 7.2e-59 CCDS75468.1 MCM3 gene_id:4172|Hs108|chr6 ( 818) 949 222.9 1.1e-57 CCDS4940.2 MCM3 gene_id:4172|Hs108|chr6 ( 853) 949 222.9 1.2e-57 CCDS3043.1 MCM2 gene_id:4171|Hs108|chr3 ( 904) 932 219.1 1.8e-56 CCDS56447.1 MCM9 gene_id:254394|Hs108|chr6 (1143) 906 213.3 1.2e-54 CCDS2179.1 MCM6 gene_id:4175|Hs108|chr2 ( 821) 894 210.5 6.1e-54 CCDS13095.1 MCM8 gene_id:84515|Hs108|chr20 ( 824) 705 168.0 3.8e-41 CCDS13094.1 MCM8 gene_id:84515|Hs108|chr20 ( 840) 624 149.8 1.2e-35 CCDS63227.1 MCM8 gene_id:84515|Hs108|chr20 ( 880) 559 135.2 3.1e-31 CCDS63226.1 MCM8 gene_id:84515|Hs108|chr20 ( 793) 461 113.1 1.2e-24 CCDS5121.1 MCM9 gene_id:254394|Hs108|chr6 ( 391) 359 90.0 5.6e-18 >>CCDS5684.1 MCM7 gene_id:4176|Hs108|chr7 (543 aa) initn: 3538 init1: 3538 opt: 3538 Z-score: 4299.0 bits: 805.2 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 3538; 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CCDS13 GNRVTIMGIY-SIKKFGLTTSRGRDRVGVGIRSSYIRVLGI-QVDTDGSGRSFAGAVSPQ 260 270 280 290 300 310 150 160 170 180 190 200 pF1KB5 -REELRQIAE-EDFYEKLAASIAPEIYGHEDVKKALLLLLVGGVDQS-PRGMKIRGNINI .::.:..: . :: .. :::: :.: :.:::. :: :: . : :. ::.::. CCDS13 EEEEFRRLAALPNVYEVISKSIAPSIFGGTDMKKAIACLLFGGSRKRLPDGLTRRGDINL 320 330 340 350 360 370 210 220 230 240 250 260 pF1KB5 CLMGDPGVAKSQLLSYIDRLAPRSQYTTGRGSSGVGLTAAVLRDSVSGELTLEGGALVLA ..::::.::::::..... .: . ::.:.:::..::::.:.:: : .. .::::.::: CCDS13 LMLGDPGTAKSQLLKFVEKCSPIGVYTSGKGSSAAGLTASVMRDPSSRNFIMEGGAMVLA 380 390 400 410 420 430 270 280 290 300 310 320 pF1KB5 DQGVCCIDEFDKMAEADRTAIHEVMEQQTISIAKAGILTTLNARCSILAAANPAYGRYNP : :: :::::::: : ::.::::.::::::::::::: ::::.:::.::::: ..::.. CCDS13 DGGVVCIDEFDKMREDDRVAIHEAMEQQTISIAKAGITTTLNSRCSVLAAANSVFGRWDE 440 450 460 470 480 490 330 340 350 360 370 380 pF1KB5 RRSLEQNIQLPAALLSRFDLLWLIQDRPDRDNDLRLAQHITYVHQHSRQPPSQFE-PLDM .. :.::.. ..:::::......:. ... :. ::.:. .: . . : .:. CCDS13 TKG-EDNIDFMPTILSRFDMIFIVKDEHNEERDVMLAKHVITLHVSALTQTQAVEGEIDL 500 510 520 530 540 550 390 400 410 420 430 pF1KB5 KLMRRYIAMCREK-QPMVPESLADYITAAYVEMRREA-WASKDATYTSA-----RTLLAI ....::.:: : : . :. . :. :: : .:. :. : : :: CCDS13 AKLKKFIAYCRVKCGPRLSAEAAEKLKNRYIIMRSGARQHERDSDRRSSIPITVRQLEAI 560 570 580 590 600 610 440 450 460 470 480 490 pF1KB5 LRLSTALARLRMVDVVEKEDVNEAIRLMEMSKDSLLGDKGQTARTQRPADVIFATVRELV .:.. ::..... . . ::.::.::...: CCDS13 VRIAEALSKMKLQPFATEADVEEALRLFQVSTLDAALSGTLSGVEGFTSQEDQEMLSRIE 620 630 640 650 660 670 500 510 520 530 540 pF1KB5 SGGRSVRFSEAEQRCVSRGFTPAQFQAALDEYEELNVWQVNASRTRITFV CCDS13 KQLKRRFAIGSQVSEHSIIKDFTKQKYPEHAIHKVLQLMLRRGEIQHRMQRKVLYRLK 680 690 700 710 720 730 >>CCDS6143.1 MCM4 gene_id:4173|Hs108|chr8 (863 aa) initn: 934 init1: 696 opt: 967 Z-score: 1170.4 bits: 227.0 E(32554): 7.2e-59 Smith-Waterman score: 1079; 38.4% identity (68.3% similar) in 542 aa overlap (1-524:299-826) 10 20 30 pF1KB5 MVVATYTCDQCGAETYQPIQSPTFMPLIMC : : . :. :. : .. . .: CCDS61 KNMRNLNPEDIDQLITISGMVIRTSQLIPEMQEAFFQCQVCAHTTRVEMDRGRIAEPSVC 270 280 290 300 310 320 40 50 60 70 80 90 pF1KB5 PSQECQTNRSGGRLYLQTRGSRFIKFQEMKMQEHSDQVPVGNIPRSITVLVEGENTRIAQ .:.:..: . : : : : .:.:: ...:.:. :... ...... . .: CCDS61 --GRCHTTHS---MALIHNRSLFSDKQMIKLQESPEDMPAGQTPHTVILFAHNDLVDKVQ 330 340 350 360 370 380 100 110 120 130 140 pF1KB5 PGDHVSVTGIFLPI-LRTGFRQVVQGLLSETYLEAHRIVKMNKSED---DESGAGELTRE :::.:.::::. . .:.. : . .:.... . : . .. :: . .: : CCDS61 PGDRVNVTGIYRAVPIRVNPRVSNVKSVYKTHIDVIHYRKTDAKRLHGLDEEAEQKLFSE 390 400 410 420 430 440 150 160 170 180 190 pF1KB5 E----LRQIAEE-DFYEKLAASIAPEIYGHEDVKKALLLLLVGGV--DQSPRGM-KIRGN . :...... :.::.::...:: :: :::.::..:: : ::. : : : :.:.. CCDS61 KRVELLKELSRKPDIYERLASALAPSIYEHEDIKKGILLQLFGGTRKDFSHTGRGKFRAE 450 460 470 480 490 500 200 210 220 230 240 250 pF1KB5 INICLMGDPGVAKSQLLSYIDRLAPRSQYTTGRGSSGVGLTAAVLRDSVSGELTLEGGAL ::: : ::::..:::::.:. :.::.:::.:.:::.::::: :..: . .:.:. ::: CCDS61 INILLCGDPGTSKSQLLQYVYNLVPRGQYTSGKGSSAVGLTAYVMKDPETRQLVLQTGAL 510 520 530 540 550 560 260 270 280 290 300 310 pF1KB5 VLADQGVCCIDEFDKMAEADRTAIHEVMEQQTISIAKAGILTTLNARCSILAAANPAYGR ::.:.:.::::::::: :. :...::::::::.:::::::. :::: :.:::::: .. CCDS61 VLSDNGICCIDEFDKMNESTRSVLHEVMEQQTLSIAKAGIICQLNARTSVLAAANPIESQ 570 580 590 600 610 620 320 330 340 350 360 370 pF1KB5 YNPRRSLEQNIQLPAALLSRFDLLWLIQDRPDRDNDLRLAQHITYVHQHSRQPPSQFEPL .::... .::::: .:::::::..:. : :. : :::.:.. .. .:.. .. : : CCDS61 WNPKKTTIENIQLPHTLLSRFDLIFLLLDPQDEAYDRRLAHHLVALYYQSEEQ-AEEELL 630 640 650 660 670 680 380 390 400 410 420 430 pF1KB5 DMKLMRRYIAMCREK-QPMVPESLADYITAAYVEMRREAWASKDATYTSARTLLAILRLS :: ... :::. . .: . : .. . :::.::. .:. . . : : ...::. CCDS61 DMAVLKDYIAYAHSTIMPRLSEEASQALIEAYVDMRK-IGSSRGMVSAYPRQLESLIRLA 690 700 710 720 730 740 440 450 460 470 480 490 pF1KB5 TALARLRMVDVVEKEDVNEAIRLMEMSKDSLLGDKGQTARTQRPA--DV-IFATVRELVS : :..:. . :: ::.:: :: ...: :.: : . :. :..: .: CCDS61 EAHAKVRLSNKVEAIDVEEAKRLH---REAL----KQSATDPRTGIVDISILTTGMSATS 750 760 770 780 790 500 510 520 530 540 pF1KB5 GGRSVRFSEAEQRCV-SRGFTPA-QFQAALDEYEELNVWQVNASRTRITFV :. ...:: .. . :.: ::: ..: ... CCDS61 RKRKEELAEALKKLILSKGKTPALKYQQLFEDIRGQSDIAITKDMFEEALRALADDDFLT 800 810 820 830 840 850 CCDS61 VTGKTVRLL 860 >>CCDS75468.1 MCM3 gene_id:4172|Hs108|chr6 (818 aa) initn: 821 init1: 735 opt: 949 Z-score: 1148.8 bits: 222.9 E(32554): 1.1e-57 Smith-Waterman score: 1017; 38.8% identity (65.3% similar) in 510 aa overlap (27-479:175-679) 10 20 30 40 50 pF1KB5 MVVATYTCDQCGAETYQPIQSPTFMPLIMCPSQECQTNRSGGRLYLQTR-G-SRFI :. ::. ... :.:. : : . CCDS75 SLVRPKVVRSVHYCPATKKTIERRYSDLTTLVAFPSSSVYPTKDEENNPLETEYGLSVYK 150 160 170 180 190 200 60 70 80 90 100 110 pF1KB5 KFQEMKMQEHSDQVPVGNIPRSITVLVEGENTRIAQPGDHVSVTGIF--LPILRTGFRQV : . .:: ...:.:..:::. :... . . :.:::.:.:.: . :: . :. CCDS75 DHQTITIQEMPEKAPAGQLPRSVDVILDDDLVDKAKPGDRVQVVGTYRCLPGKKGGY--- 210 220 230 240 250 260 120 130 140 150 160 170 pF1KB5 VQGLLSETYLEAHRIVKMNKSEDDESGAGELTR-EELRQIAEEDFYEKLAASIAPEIYGH ..: . .: : : . .:.:. . .: .... ... . .:....:: :.:: :.:: CCDS75 TSGTF-RTVLIACNVKQMSKDAQPSFSAEDIAKIKKFSKTRSKDIFDQLAKSLAPSIHGH 270 280 290 300 310 320 180 190 200 210 220 230 pF1KB5 EDVKKALLLLLVGGVDQS-PRGMKIRGNINICLMGDPGVAKSQLLSYIDRLAPRSQYTTG . ::::.: ::.:::... : .:::.::: :.:::.::::::: :. :::. ::: CCDS75 DYVKKAILCLLLGGVERDLENGSHIRGDINILLIGDPSVAKSQLLRYVLCTAPRAIPTTG 330 340 350 360 370 380 240 250 260 270 280 290 pF1KB5 RGSSGVGLTAAVLRDSVSGELTLEGGALVLADQGVCCIDEFDKMAEADRTAIHEVMEQQT :::::::::::: :. .:: ::.::.::::.:: ::::::::.. ::::::::::: CCDS75 RGSSGVGLTAAVTTDQETGERRLEAGAMVLADRGVVCIDEFDKMSDMDRTAIHEVMEQGR 390 400 410 420 430 440 300 310 320 330 340 350 pF1KB5 ISIAKAGILTTLNARCSILAAANPAYGRYNPRRSLEQNIQLPAALLSRFDLLWLIQDRPD ..:::::: . ::::::.::::::.::::. .. .:: : .::::::::... :. : CCDS75 VTIAKAGIHARLNARCSVLAAANPVYGRYDQYKTPMENIGLQDSLLSRFDLLFIMLDQMD 450 460 470 480 490 500 360 370 380 pF1KB5 RDNDLRLAQHITYVHQHSRQP--------P---------------SQFEPLDMKL----- ..: ....:. .:.. : : : :: . : .. CCDS75 PEQDREISDHVLRMHRY-RAPGEQDGDAMPLGSAVDILATDDPNFSQEDQQDTQIYEKHD 510 520 530 540 550 390 400 410 420 pF1KB5 ------------------MRRYIAMCREKQPMVPESLADYITAAYVEMRREAWASKDATY :..:: . . .:.. . : ::. : ..: . :.:.. CCDS75 NLLHGTKKKKEKMVSAAFMKKYIHVAKIIKPVLTQESATYIAEEYSRLRSQDSMSSDTAR 560 570 580 590 600 610 430 440 450 460 470 pF1KB5 TS---ARTLLAILRLSTALARLRMVDVVEKEDVNEAIRLMEMS--KDSLLGDKGQTARTQ :: :::: ...::.:: :. :: .:. .:..::..:.... : : .: . :.. CCDS75 TSPVTARTLETLIRLATAHAKARMSKTVDLQDAEEAVELVQYAYFKKVLEKEKKRKKRSE 620 630 640 650 660 670 480 490 500 510 520 530 pF1KB5 RPADVIFATVRELVSGGRSVRFSEAEQRCVSRGFTPAQFQAALDEYEELNVWQVNASRTR CCDS75 DESETEDEEEKSQEDQEQKRKRRKTRQPDAKDGDSYDPYDFSDTEEEMPQVHTPKTADSQ 680 690 700 710 720 730 >>CCDS4940.2 MCM3 gene_id:4172|Hs108|chr6 (853 aa) initn: 821 init1: 735 opt: 949 Z-score: 1148.6 bits: 222.9 E(32554): 1.2e-57 Smith-Waterman score: 1017; 38.8% identity (65.3% similar) in 510 aa overlap (27-479:210-714) 10 20 30 40 50 pF1KB5 MVVATYTCDQCGAETYQPIQSPTFMPLIMCPSQECQTNRSGGRLYLQTR-G-SRFI :. ::. ... :.:. : : . CCDS49 SLVRPKVVRSVHYCPATKKTIERRYSDLTTLVAFPSSSVYPTKDEENNPLETEYGLSVYK 180 190 200 210 220 230 60 70 80 90 100 110 pF1KB5 KFQEMKMQEHSDQVPVGNIPRSITVLVEGENTRIAQPGDHVSVTGIF--LPILRTGFRQV : . .:: ...:.:..:::. :... . . :.:::.:.:.: . :: . :. CCDS49 DHQTITIQEMPEKAPAGQLPRSVDVILDDDLVDKAKPGDRVQVVGTYRCLPGKKGGY--- 240 250 260 270 280 290 120 130 140 150 160 170 pF1KB5 VQGLLSETYLEAHRIVKMNKSEDDESGAGELTR-EELRQIAEEDFYEKLAASIAPEIYGH ..: . .: : : . .:.:. . .: .... ... . .:....:: :.:: :.:: CCDS49 TSGTF-RTVLIACNVKQMSKDAQPSFSAEDIAKIKKFSKTRSKDIFDQLAKSLAPSIHGH 300 310 320 330 340 350 180 190 200 210 220 230 pF1KB5 EDVKKALLLLLVGGVDQS-PRGMKIRGNINICLMGDPGVAKSQLLSYIDRLAPRSQYTTG . ::::.: ::.:::... : .:::.::: :.:::.::::::: :. :::. ::: CCDS49 DYVKKAILCLLLGGVERDLENGSHIRGDINILLIGDPSVAKSQLLRYVLCTAPRAIPTTG 360 370 380 390 400 410 240 250 260 270 280 290 pF1KB5 RGSSGVGLTAAVLRDSVSGELTLEGGALVLADQGVCCIDEFDKMAEADRTAIHEVMEQQT :::::::::::: :. .:: ::.::.::::.:: ::::::::.. ::::::::::: CCDS49 RGSSGVGLTAAVTTDQETGERRLEAGAMVLADRGVVCIDEFDKMSDMDRTAIHEVMEQGR 420 430 440 450 460 470 300 310 320 330 340 350 pF1KB5 ISIAKAGILTTLNARCSILAAANPAYGRYNPRRSLEQNIQLPAALLSRFDLLWLIQDRPD ..:::::: . ::::::.::::::.::::. .. .:: : .::::::::... :. : CCDS49 VTIAKAGIHARLNARCSVLAAANPVYGRYDQYKTPMENIGLQDSLLSRFDLLFIMLDQMD 480 490 500 510 520 530 360 370 380 pF1KB5 RDNDLRLAQHITYVHQHSRQP--------P---------------SQFEPLDMKL----- ..: ....:. .:.. : : : :: . : .. CCDS49 PEQDREISDHVLRMHRY-RAPGEQDGDAMPLGSAVDILATDDPNFSQEDQQDTQIYEKHD 540 550 560 570 580 590 390 400 410 420 pF1KB5 ------------------MRRYIAMCREKQPMVPESLADYITAAYVEMRREAWASKDATY :..:: . . .:.. . : ::. : ..: . :.:.. CCDS49 NLLHGTKKKKEKMVSAAFMKKYIHVAKIIKPVLTQESATYIAEEYSRLRSQDSMSSDTAR 600 610 620 630 640 650 430 440 450 460 470 pF1KB5 TS---ARTLLAILRLSTALARLRMVDVVEKEDVNEAIRLMEMS--KDSLLGDKGQTARTQ :: :::: ...::.:: :. :: .:. .:..::..:.... : : .: . :.. CCDS49 TSPVTARTLETLIRLATAHAKARMSKTVDLQDAEEAVELVQYAYFKKVLEKEKKRKKRSE 660 670 680 690 700 710 480 490 500 510 520 530 pF1KB5 RPADVIFATVRELVSGGRSVRFSEAEQRCVSRGFTPAQFQAALDEYEELNVWQVNASRTR CCDS49 DESETEDEEEKSQEDQEQKRKRRKTRQPDAKDGDSYDPYDFSDTEEEMPQVHTPKTADSQ 720 730 740 750 760 770 >>CCDS3043.1 MCM2 gene_id:4171|Hs108|chr3 (904 aa) initn: 926 init1: 628 opt: 932 Z-score: 1127.5 bits: 219.1 E(32554): 1.8e-56 Smith-Waterman score: 1043; 38.0% identity (68.9% similar) in 489 aa overlap (1-461:322-798) 10 20 pF1KB5 MVVATYTCDQCG--AETYQPIQSPTFMPLI . .. :.:..:. . :. : CCDS30 EELRSLRQLHLNQLIRTSGVVTSCTGVLPQLSMVKYNCNKCNFVLGPFCQSQNQEVKPG- 300 310 320 330 340 350 30 40 50 60 70 80 pF1KB5 MCPSQECQTNRSGGRLYLQTRGSRFIKFQEMKMQEHSDQVPVGNIPRSITVLVEGENTRI :: ::: :.: . .. . . . ..:....:: .: .: .::: ... .. . CCDS30 SCP--ECQ---SAGPFEVNMEETIYQNYQRIRIQESPGKVAAGRLPRSKDAILLADLVDS 360 370 380 390 400 90 100 110 120 130 140 pF1KB5 AQPGDHVSVTGIFLPILRTGFRQVVQGL-LSETYLEAHRIVKMNKSEDDESGAGELTREE .:::.. .:::. : ....:. . : . :....: .:.. ..:::: :. CCDS30 CKPGDEIELTGIYHNNY-DGSLNTANGFPVFATVILANHVAK----KDNKVAVGELTDED 410 420 430 440 450 460 150 160 170 180 190 200 pF1KB5 LRQIA----EEDFYEKLAASIAPEIYGHEDVKKALLLLLVGGVDQSPRG-MKIRGNINIC ...:. .... ::. ::::: ::::::.:..: : : :: ..: : :.::.::. CCDS30 VKMITSLSKDQQIGEKIFASIAPSIYGHEDIKRGLALALFGGEPKNPGGKHKVRGDINVL 470 480 490 500 510 520 210 220 230 240 250 260 pF1KB5 LMGDPGVAKSQLLSYIDRLAPRSQYTTGRGSSGVGLTAAVLRDSVSGELTLEGGALVLAD : ::::.::::.:.::.... :. .:::.:.:.::::: : : :: : :::.::::::: CCDS30 LCGDPGTAKSQFLKYIEKVSSRAIFTTGQGASAVGLTAYVQRHPVSREWTLEAGALVLAD 530 540 550 560 570 580 270 280 290 300 310 320 pF1KB5 QGVCCIDEFDKMAEADRTAIHEVMEQQTISIAKAGILTTLNARCSILAAANPAYGRYNPR .::: ::::::: . :::.:::.::::.:::.::::.:.:.:::...::::: :::.: CCDS30 RGVCLIDEFDKMNDQDRTSIHEAMEQQSISISKAGIVTSLQARCTVIAAANPIGGRYDPS 590 600 610 620 630 640 330 340 350 360 pF1KB5 RSLEQNIQLPAALLSRFDLLWLIQDRPDRDNDLRLAQHI--TYVHQH------------- .. .:..: ..::::.: ...: : .: ::. . ..:..: CCDS30 LTFSENVDLTEPIISRFDILCVVRDTVDPVQDEMLARFVVGSHVRHHPSNKEEEGLANGS 650 660 670 680 690 700 370 380 390 400 410 420 pF1KB5 SRQP--PSQF--EPLDMKLMRRYIAMCREK-QPMVPESLADYITAAYVEMRREAWASKDA . .: :. . ::: ......:: . .:. .: . . : .. : ..:.:. :. . CCDS30 AAEPAMPNTYGVEPLPQEVLKKYIIYAKERVHPKLNQMDQDKVAKMYSDLRKESMATGSI 710 720 730 740 750 760 430 440 450 460 470 480 pF1KB5 TYTSARTLLAILRLSTALARLRMVDVVEKEDVNEAIRLMEMSKDSLLGDKGQTARTQRPA : .: . ...:.. : ::... : : ..::: :::.: CCDS30 PIT-VRHIESMIRMAEAHARIHLRDYVIEDDVNMAIRVMLESFIDTQKFSVMRSMRKTFA 770 780 790 800 810 490 500 510 520 530 540 pF1KB5 DVIFATVRELVSGGRSVRFSEAEQRCVSRGFTPAQFQAALDEYEELNVWQVNASRTRITF CCDS30 RYLSFRRDNNELLLFILKQLVAEQVTYQRNRFGAQQDTIEVPEKDLVDKARQINIHNLSA 820 830 840 850 860 870 >>CCDS56447.1 MCM9 gene_id:254394|Hs108|chr6 (1143 aa) initn: 464 init1: 308 opt: 906 Z-score: 1094.4 bits: 213.3 E(32554): 1.2e-54 Smith-Waterman score: 918; 37.0% identity (65.9% similar) in 484 aa overlap (6-470:145-611) 10 20 30 pF1KB5 MVVATYTCDQCGAETYQPI---QSPTFMPLIMCPS : :..: : :: ::: CCDS56 PKTKDVGHFLSVTGTVIRTSLVKVLEFERDYMCNKCKHVFVIKADFEQYYTFCRPSSCPS 120 130 140 150 160 170 40 50 60 70 80 90 pF1KB5 QE-CQTNRSGGRLYLQTRGSRFIKFQEMKMQEHSDQVPVGNIPRSITVLVEGENTRIAQP : :.... :.. .: .::.:.::. ... ::.::::. :..: . . . CCDS56 LESCDSSKFTCLSGLSSSPTRCRDYQEIKIQEQVQRLSVGSIPRSMKVILEDDLVDSCKS 180 190 200 210 220 230 100 110 120 130 140 150 pF1KB5 GDHVSVTGIFLPILRTGFRQVVQGLLSETYLEAHRIVKMNKSEDDESGAGELTREELRQI :: ... :: . . :.: :. . : :.:. : ..: .:...: . ::. : CCDS56 GDDLTIYGIVMQRWKP-FQQDVRCEV-EIVLKANYI-QVN----NEQSSGIIMDEEV-QK 240 250 260 270 280 160 170 180 190 pF1KB5 AEEDFYEK-----------LAASIAPEIYGHEDVKKALLLLLVGGVDQSP-RGMKIRGNI :::.: . ::. :...: :: :. ..:.::.... : ..::. CCDS56 EFEDFWEYYKSDPFAGRNVILASLCPQVFGMYLVKLAVAMVLAGGIQRTDATGTRVRGES 290 300 310 320 330 340 200 210 220 230 240 250 pF1KB5 NICLMGDPGVAKSQLLSYIDRLAPRSQYTTGRGSSGVGLTAAVLRDSVSGELTLEGGALV .. :.::::..:::.:.: ...::: ::: ::...:::.....: ::: .::.:::: CCDS56 HLLLVGDPGTGKSQFLKYAAKITPRSVLTTGIGSTSAGLTVTAVKD--SGEWNLEAGALV 350 360 370 380 390 400 260 270 280 290 300 310 pF1KB5 LADQGVCCIDEFDKMAEADRTAIHEVMEQQTISIAKAGILTTLNARCSILAAANPAYGRY ::: :.::::::... : :::.:::.:::::::.::::.. ::.: .::::.:: :.: CCDS56 LADAGLCCIDEFNSLKEHDRTSIHEAMEQQTISVAKAGLVCKLNTRTTILAATNPK-GQY 410 420 430 440 450 460 320 330 340 350 360 370 pF1KB5 NPRRSLEQNIQLPAALLSRFDLLWLIQDRPDRDNDLRLAQHITYVHQHSRQPPSQFEPL- .:..:. :: : . :::::::. .. : ..: : ... : ... ::. : : CCDS56 DPQESVSVNIALGSPLLSRFDLILVLLDTKNEDWDRIISSFIL----ENKGYPSKSEKLW 470 480 490 500 510 380 390 400 410 420 430 pF1KB5 DMKLMRRYIAMCREKQPMVPESLADYITAAYVEMRREAWASKDATYTSARTLLAILRLST .:. :. :. . :. :: . . ... . : .:.:.. ..:. :. : : ...::. CCDS56 SMEKMKTYFCLIRNLQPTLSD-VGNQVLLRYYQMQRQS-DCRNAARTTIRLLESLIRLAE 520 530 540 550 560 570 440 450 460 470 480 490 pF1KB5 ALARLRMVDVVEKEDVNEAIRLME--MSKDSLLGDKGQTARTQRPADVIFATVRELVSGG : ::: . :.: ::. .. .:: :. .::: CCDS56 AHARLMFRDTVTLEDAITVVSVMESSMQGGALLGGVNALHTSFPENPGEQYQRQCELILE 580 590 600 610 620 630 500 510 520 530 540 pF1KB5 RSVRFSEAEQRCVSRGFTPAQFQAALDEYEELNVWQVNASRTRITFV CCDS56 KLELQSLLSEELRRLERLQNQSVHQSQPRVLEVETTPGSLRNGPGEESNFRTSSQQEINY 640 650 660 670 680 690 >>CCDS2179.1 MCM6 gene_id:4175|Hs108|chr2 (821 aa) initn: 941 init1: 725 opt: 894 Z-score: 1081.9 bits: 210.5 E(32554): 6.1e-54 Smith-Waterman score: 990; 38.6% identity (69.3% similar) in 482 aa overlap (29-464:179-655) 10 20 30 40 50 pF1KB5 MVVATYTCDQCGAETYQPIQSPTFMPLIMCPSQECQTNRSGGRLYLQTRGSRFIKFQE .: . : . : :. :.: :::. ::. CCDS21 PELVSGTFLCLDCQTVIRDVEQQFKYTQPNICRNPVCANRR---RFLLDTNKSRFVDFQK 150 160 170 180 190 200 60 70 80 90 100 110 pF1KB5 MKMQEHSDQVPVGNIPRSITVLVEGENTRIAQPGDHVSVTGIFLPI-----LRT-GFRQV ...:: . ..: :.::::. :....: .. :: ::. . :: .. . : : : : CCDS21 VRIQETQAELPRGSIPRSLEVILRAEAVESAQAGDKCDFTGTLIVVPDVSKLSTPGARAE 210 220 230 240 250 260 120 130 pF1KB5 -------VQGLLSETY--LEA-------HRIV---------------KMNKSEDD--ESG :.: .: :.: .:.: : ..:.. :: CCDS21 TNSRVSGVDGYETEGIRGLRALGVRDLSYRLVFLACCVAPTNPRFGGKELRDEEQTAESI 270 280 290 300 310 320 140 150 160 170 180 190 pF1KB5 AGELTREELRQIAE----EDFYEKLAASIAPEIYGHEDVKKALLLLLVGGVDQSP-RGMK ...: .: ... : ...:..: .:. : :.:...::...::.: ::: .. .: . CCDS21 KNQMTVKEWEKVFEMSQDKNLYHNLCTSLFPTIHGNDEVKRGVLLMLFGGVPKTTGEGTS 330 340 350 360 370 380 200 210 220 230 240 250 pF1KB5 IRGNINICLMGDPGVAKSQLLSYIDRLAPRSQYTTGRGSSGVGLTAAVLRDSVSGELTLE .::.::.:..:::..::::.:.......::. ::.:..::..::::::.:: : :...: CCDS21 LRGDINVCIVGDPSTAKSQFLKHVEEFSPRAVYTSGKASSAAGLTAAVVRDEESHEFVIE 390 400 410 420 430 440 260 270 280 290 300 310 pF1KB5 GGALVLADQGVCCIDEFDKMAEADRTAIHEVMEQQTISIAKAGILTTLNARCSILAAANP .:::.:::.::::::::::: :..::::.::::::::.:::. .::::: :::::::: CCDS21 AGALMLADNGVCCIDEFDKMDVRDQVAIHEAMEQQTISITKAGVKATLNARTSILAAANP 450 460 470 480 490 500 320 330 340 350 360 370 pF1KB5 AYGRYNPRRSLEQNIQLPAALLSRFDLLWLIQDRPDRDNDLRLAQHITYVHQHSRQPPSQ :.:. .::.:::.: : ..:::::.... :. .. .: .:..: : ::: : CCDS21 ISGHYDRSKSLKQNINLSAPIMSRFDLFFILVDECNEVTDYAIARRI--VDLHSRIEESI 510 520 530 540 550 560 380 390 400 410 420 430 pF1KB5 FEPLDMKLMRRYIAMCREKQPMVPESLADYITAAYVEMRRE--AWASKDATYTSARTLLA . .. .:::. . :. .: . . :.:. : ..:.. . ..:.. ..: : . CCDS21 DRVYSLDDIRRYLLFARQFKPKISKESEDFIVEQYKHLRQRDGSGVTKSSWRITVRQLES 570 580 590 600 610 620 440 450 460 470 480 490 pF1KB5 ILRLSTALARLRMVDVVEKEDVNEAIRLMEMSKDSLLGDKGQTARTQRPADVIFATVREL ..::: :.::.. : :. . :.::.::.. : CCDS21 MIRLSEAMARMHCCDEVQPKHVKEAFRLLNKSIIRVETPDVNLDQEEEIQMEVDEGAGGI 630 640 650 660 670 680 500 510 520 530 540 pF1KB5 VSGGRSVRFSEAEQRCVSRGFTPAQFQAALDEYEELNVWQVNASRTRITFV CCDS21 NGHADSPAPVNGINGYNEDINQESAPKASLRLGFSEYCRISNLIVLHLRKVEEEEDESAL 690 700 710 720 730 740 >>CCDS13095.1 MCM8 gene_id:84515|Hs108|chr20 (824 aa) initn: 507 init1: 287 opt: 705 Z-score: 852.1 bits: 168.0 E(32554): 3.8e-41 Smith-Waterman score: 789; 32.6% identity (59.7% similar) in 516 aa overlap (6-470:240-734) 10 20 30 pF1KB5 MVVATYTCDQCGAETYQPIQSPTFMPLIMCPSQEC . : :: :. . . :: : CCDS13 VRANYYGKYIALRGTVVRVSNIKPLCTKMAFLCAACGEIQSFPLPDGKYSLPTKCPVPVC 210 220 230 240 250 260 40 50 60 70 80 90 pF1KB5 QTNRSGGRLYLQTRGSRF---IKFQEMKMQE--HSDQVPVGNIPRSITVLVEGENTRIAQ . :: . :.: . . .: .:.:: .:: .: :::.: . . . CCDS13 R-----GRSFTALRSSPLTVTMDWQSIKIQELMSDDQREAGRIPRTIECELVHDLVDSCV 270 280 290 300 310 320 100 110 120 130 140 pF1KB5 PGDHVSVTGIFLPILRTGFRQVVQGLLSETYLEAHRIVKMNKSEDD-ESGA-GELTREEL ::: :..::: :.. . . . : ..::: . : :.. ..: CCDS13 PGDTVTITGIVK----------VSNAEEANSISNSKGQKTKSSEDGCKHGMLMEFSLKDL 330 340 350 360 370 150 160 170 180 190 200 pF1KB5 RQI----AEEDFYEKLAASIAPEIYGHEDVKKALLLLLVGG----VDQSPRGMKIRGNIN : :::.... .. :. : :.::: :: .: : : :: .:.. : . :::. . CCDS13 YAIQEIQAEENLFKLIVNSLCPVIFGHELVKAGLALALFGGSQKYADDKNR-IPIRGDPH 380 390 400 410 420 430 210 220 230 240 250 260 pF1KB5 ICLMGDPGVAKSQLLSYIDRLAPRSQYTTGRGSSGVGLTAAVLRDSVSGELTLEGGALVL : ..::::..:::.:. .:::. :. : .. :::... .:: ::...::.::::: CCDS13 ILVVGDPGLGKSQMLQAACNVAPRGVYVCGNTTTTSGLTVTLSKDSSSGDFALEAGALVL 440 450 460 470 480 490 270 280 290 300 310 320 pF1KB5 ADQGVCCIDEFDKMAEADRTAIHEVMEQQTISIAKAGILTTLNARCSILAAANPAYGRYN .:::.: :::::::.. .. :. :.::::.::.::::.. .: :: ::.:::::. :.:: CCDS13 GDQGICGIDEFDKMGN-QHQALLEAMEQQSISLAKAGVVCSLPARTSIIAAANPVGGHYN 500 510 520 530 540 550 330 340 350 360 pF1KB5 PRRSLEQNIQLPAALLSRFDLLWLIQDRPDRDNDLRLAQHITYVHQH------------- ... .:... .::::::::.... : :.. .: :..:. .. 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