Result of FASTA (omim) for pF1KB8450
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB8450, 638 aa
  1>>>pF1KB8450 638 - 638 aa - 638 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.5707+/-0.000714; mu= -7.1069+/- 0.044
 mean_var=928.4950+/-209.198, 0's: 0 Z-trim(117.1): 502  B-trim: 0 in 0/53
 Lambda= 0.042091
 statistics sampled from 28206 (28729) to 28206 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.69), E-opt: 0.2 (0.337), width:  16
 Scan time:  8.910

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_005560 (OMIM: 601988) LIM domain kinase 2 isofo ( 638) 4372 282.4 3.3e-75
NP_057952 (OMIM: 601988) LIM domain kinase 2 isofo ( 617) 4080 264.7 7.2e-70
NP_001026971 (OMIM: 601988) LIM domain kinase 2 is ( 686) 3772 246.0 3.2e-64
NP_001191355 (OMIM: 601329) LIM domain kinase 1 is ( 613) 1503 108.2 9.1e-23
NP_002305 (OMIM: 601329) LIM domain kinase 1 isofo ( 647) 1503 108.2 9.4e-23
NP_001305159 (OMIM: 601782) dual specificity testi ( 466)  413 41.8  0.0067
NP_006276 (OMIM: 601782) dual specificity testis-s ( 626)  413 42.0  0.0078
XP_011538802 (OMIM: 604746) PREDICTED: dual specif ( 301)  401 40.7   0.009


>>NP_005560 (OMIM: 601988) LIM domain kinase 2 isoform 2  (638 aa)
 initn: 4372 init1: 4372 opt: 4372  Z-score: 1471.1  bits: 282.4 E(85289): 3.3e-75
Smith-Waterman score: 4372; 100.0% identity (100.0% similar) in 638 aa overlap (1-638:1-638)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MSALAGEDVWRCPGCGDHIAPSQIWYRTVNETWHGSCFRCSECQDSLTNWYYEKDGKLYC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 MSALAGEDVWRCPGCGDHIAPSQIWYRTVNETWHGSCFRCSECQDSLTNWYYEKDGKLYC
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB8 PKDYWGKFGEFCHGCSLLMTGPFMVAGEFKYHPECFACMSCKVIIEDGDAYALVQHATLY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 PKDYWGKFGEFCHGCSLLMTGPFMVAGEFKYHPECFACMSCKVIIEDGDAYALVQHATLY
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB8 CGKCHNEVVLAPMFERLSTESVQEQLPYSVTLISMPATTEGRRGFSVSVESACSNYATTV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 CGKCHNEVVLAPMFERLSTESVQEQLPYSVTLISMPATTEGRRGFSVSVESACSNYATTV
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB8 QVKEVNRMHISPNNRNAIHPGDRILEINGTPVRTLRVEEVEDAISQTSQTLQLLIEHDPV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 QVKEVNRMHISPNNRNAIHPGDRILEINGTPVRTLRVEEVEDAISQTSQTLQLLIEHDPV
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB8 SQRLDQLRLEARLAPHMQNAGHPHALSTLDTKENLEGTLRRRSLRRSNSISKSPGPSSPK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 SQRLDQLRLEARLAPHMQNAGHPHALSTLDTKENLEGTLRRRSLRRSNSISKSPGPSSPK
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB8 EPLLFSRDISRSESLRCSSSYSQQIFRPCDLIHGEVLGKGFFGQAIKVTHKATGKVMVMK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 EPLLFSRDISRSESLRCSSSYSQQIFRPCDLIHGEVLGKGFFGQAIKVTHKATGKVMVMK
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB8 ELIRCDEETQKTFLTEVKVMRSLDHPNVLKFIGVLYKDKKLNLLTEYIEGGTLKDFLRSM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 ELIRCDEETQKTFLTEVKVMRSLDHPNVLKFIGVLYKDKKLNLLTEYIEGGTLKDFLRSM
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB8 DPFPWQQKVRFAKGIASGMAYLHSMCIIHRDLNSHNCLIKLDKTVVVADFGLSRLIVEER
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 DPFPWQQKVRFAKGIASGMAYLHSMCIIHRDLNSHNCLIKLDKTVVVADFGLSRLIVEER
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB8 KRAPMEKATTKKRTLRKNDRKKRYTVVGNPYWMAPEMLNGKSYDETVDIFSFGIVLCEII
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 KRAPMEKATTKKRTLRKNDRKKRYTVVGNPYWMAPEMLNGKSYDETVDIFSFGIVLCEII
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB8 GQVYADPDCLPRTLDFGLNVKLFWEKFVPTDCPPAFFPLAAICCRLEPESRPAFSKLEDS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 GQVYADPDCLPRTLDFGLNVKLFWEKFVPTDCPPAFFPLAAICCRLEPESRPAFSKLEDS
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630        
pF1KB8 FEALSLYLGELGIPLPAELEELDHTVSMQYGLTRDSPP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 FEALSLYLGELGIPLPAELEELDHTVSMQYGLTRDSPP
              610       620       630        

>>NP_057952 (OMIM: 601988) LIM domain kinase 2 isoform 2  (617 aa)
 initn: 4080 init1: 4080 opt: 4080  Z-score: 1375.4  bits: 264.7 E(85289): 7.2e-70
Smith-Waterman score: 4080; 100.0% identity (100.0% similar) in 601 aa overlap (38-638:17-617)

        10        20        30        40        50        60       
pF1KB8 DVWRCPGCGDHIAPSQIWYRTVNETWHGSCFRCSECQDSLTNWYYEKDGKLYCPKDYWGK
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057               MGSYLSVPAYFTSRDLFRCSECQDSLTNWYYEKDGKLYCPKDYWGK
                             10        20        30        40      

        70        80        90       100       110       120       
pF1KB8 FGEFCHGCSLLMTGPFMVAGEFKYHPECFACMSCKVIIEDGDAYALVQHATLYCGKCHNE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 FGEFCHGCSLLMTGPFMVAGEFKYHPECFACMSCKVIIEDGDAYALVQHATLYCGKCHNE
         50        60        70        80        90       100      

       130       140       150       160       170       180       
pF1KB8 VVLAPMFERLSTESVQEQLPYSVTLISMPATTEGRRGFSVSVESACSNYATTVQVKEVNR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 VVLAPMFERLSTESVQEQLPYSVTLISMPATTEGRRGFSVSVESACSNYATTVQVKEVNR
        110       120       130       140       150       160      

       190       200       210       220       230       240       
pF1KB8 MHISPNNRNAIHPGDRILEINGTPVRTLRVEEVEDAISQTSQTLQLLIEHDPVSQRLDQL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 MHISPNNRNAIHPGDRILEINGTPVRTLRVEEVEDAISQTSQTLQLLIEHDPVSQRLDQL
        170       180       190       200       210       220      

       250       260       270       280       290       300       
pF1KB8 RLEARLAPHMQNAGHPHALSTLDTKENLEGTLRRRSLRRSNSISKSPGPSSPKEPLLFSR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 RLEARLAPHMQNAGHPHALSTLDTKENLEGTLRRRSLRRSNSISKSPGPSSPKEPLLFSR
        230       240       250       260       270       280      

       310       320       330       340       350       360       
pF1KB8 DISRSESLRCSSSYSQQIFRPCDLIHGEVLGKGFFGQAIKVTHKATGKVMVMKELIRCDE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 DISRSESLRCSSSYSQQIFRPCDLIHGEVLGKGFFGQAIKVTHKATGKVMVMKELIRCDE
        290       300       310       320       330       340      

       370       380       390       400       410       420       
pF1KB8 ETQKTFLTEVKVMRSLDHPNVLKFIGVLYKDKKLNLLTEYIEGGTLKDFLRSMDPFPWQQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 ETQKTFLTEVKVMRSLDHPNVLKFIGVLYKDKKLNLLTEYIEGGTLKDFLRSMDPFPWQQ
        350       360       370       380       390       400      

       430       440       450       460       470       480       
pF1KB8 KVRFAKGIASGMAYLHSMCIIHRDLNSHNCLIKLDKTVVVADFGLSRLIVEERKRAPMEK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 KVRFAKGIASGMAYLHSMCIIHRDLNSHNCLIKLDKTVVVADFGLSRLIVEERKRAPMEK
        410       420       430       440       450       460      

       490       500       510       520       530       540       
pF1KB8 ATTKKRTLRKNDRKKRYTVVGNPYWMAPEMLNGKSYDETVDIFSFGIVLCEIIGQVYADP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 ATTKKRTLRKNDRKKRYTVVGNPYWMAPEMLNGKSYDETVDIFSFGIVLCEIIGQVYADP
        470       480       490       500       510       520      

       550       560       570       580       590       600       
pF1KB8 DCLPRTLDFGLNVKLFWEKFVPTDCPPAFFPLAAICCRLEPESRPAFSKLEDSFEALSLY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 DCLPRTLDFGLNVKLFWEKFVPTDCPPAFFPLAAICCRLEPESRPAFSKLEDSFEALSLY
        530       540       550       560       570       580      

       610       620       630        
pF1KB8 LGELGIPLPAELEELDHTVSMQYGLTRDSPP
       :::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 LGELGIPLPAELEELDHTVSMQYGLTRDSPP
        590       600       610       

>>NP_001026971 (OMIM: 601988) LIM domain kinase 2 isofor  (686 aa)
 initn: 3772 init1: 3772 opt: 3772  Z-score: 1273.9  bits: 246.0 E(85289): 3.2e-64
Smith-Waterman score: 3772; 100.0% identity (100.0% similar) in 554 aa overlap (38-591:17-570)

        10        20        30        40        50        60       
pF1KB8 DVWRCPGCGDHIAPSQIWYRTVNETWHGSCFRCSECQDSLTNWYYEKDGKLYCPKDYWGK
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001               MGSYLSVPAYFTSRDLFRCSECQDSLTNWYYEKDGKLYCPKDYWGK
                             10        20        30        40      

        70        80        90       100       110       120       
pF1KB8 FGEFCHGCSLLMTGPFMVAGEFKYHPECFACMSCKVIIEDGDAYALVQHATLYCGKCHNE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FGEFCHGCSLLMTGPFMVAGEFKYHPECFACMSCKVIIEDGDAYALVQHATLYCGKCHNE
         50        60        70        80        90       100      

       130       140       150       160       170       180       
pF1KB8 VVLAPMFERLSTESVQEQLPYSVTLISMPATTEGRRGFSVSVESACSNYATTVQVKEVNR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VVLAPMFERLSTESVQEQLPYSVTLISMPATTEGRRGFSVSVESACSNYATTVQVKEVNR
        110       120       130       140       150       160      

       190       200       210       220       230       240       
pF1KB8 MHISPNNRNAIHPGDRILEINGTPVRTLRVEEVEDAISQTSQTLQLLIEHDPVSQRLDQL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MHISPNNRNAIHPGDRILEINGTPVRTLRVEEVEDAISQTSQTLQLLIEHDPVSQRLDQL
        170       180       190       200       210       220      

       250       260       270       280       290       300       
pF1KB8 RLEARLAPHMQNAGHPHALSTLDTKENLEGTLRRRSLRRSNSISKSPGPSSPKEPLLFSR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RLEARLAPHMQNAGHPHALSTLDTKENLEGTLRRRSLRRSNSISKSPGPSSPKEPLLFSR
        230       240       250       260       270       280      

       310       320       330       340       350       360       
pF1KB8 DISRSESLRCSSSYSQQIFRPCDLIHGEVLGKGFFGQAIKVTHKATGKVMVMKELIRCDE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DISRSESLRCSSSYSQQIFRPCDLIHGEVLGKGFFGQAIKVTHKATGKVMVMKELIRCDE
        290       300       310       320       330       340      

       370       380       390       400       410       420       
pF1KB8 ETQKTFLTEVKVMRSLDHPNVLKFIGVLYKDKKLNLLTEYIEGGTLKDFLRSMDPFPWQQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ETQKTFLTEVKVMRSLDHPNVLKFIGVLYKDKKLNLLTEYIEGGTLKDFLRSMDPFPWQQ
        350       360       370       380       390       400      

       430       440       450       460       470       480       
pF1KB8 KVRFAKGIASGMAYLHSMCIIHRDLNSHNCLIKLDKTVVVADFGLSRLIVEERKRAPMEK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KVRFAKGIASGMAYLHSMCIIHRDLNSHNCLIKLDKTVVVADFGLSRLIVEERKRAPMEK
        410       420       430       440       450       460      

       490       500       510       520       530       540       
pF1KB8 ATTKKRTLRKNDRKKRYTVVGNPYWMAPEMLNGKSYDETVDIFSFGIVLCEIIGQVYADP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ATTKKRTLRKNDRKKRYTVVGNPYWMAPEMLNGKSYDETVDIFSFGIVLCEIIGQVYADP
        470       480       490       500       510       520      

       550       560       570       580       590       600       
pF1KB8 DCLPRTLDFGLNVKLFWEKFVPTDCPPAFFPLAAICCRLEPESRPAFSKLEDSFEALSLY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::                
NP_001 DCLPRTLDFGLNVKLFWEKFVPTDCPPAFFPLAAICCRLEPESRAPPGAAGEGPGCADDE
        530       540       550       560       570       580      

       610       620       630                                     
pF1KB8 LGELGIPLPAELEELDHTVSMQYGLTRDSPP                             
                                                                   
NP_001 GPVRRQGKVTIKYDPKELRKHLNLEEWILEQLTRLYDCQEEEISELEIDVDELLDMESDD
        590       600       610       620       630       640      

>>NP_001191355 (OMIM: 601329) LIM domain kinase 1 isofor  (613 aa)
 initn: 2128 init1: 578 opt: 1503  Z-score: 529.7  bits: 108.2 E(85289): 9.1e-23
Smith-Waterman score: 2217; 56.2% identity (79.0% similar) in 594 aa overlap (39-623:17-591)

       10        20        30        40        50        60        
pF1KB8 VWRCPGCGDHIAPSQIWYRTVNETWHGSCFRCSECQDSLTNWYYEKDGKLYCPKDYWGKF
                                     .: .:. ::.. ::::::.:.: ::::...
NP_001               MLLASAPRRRRFLQRAKCCDCSASLSHQYYEKDGQLFCKKDYWARY
                             10        20        30        40      

       70        80         90       100       110       120       
pF1KB8 GEFCHGCSLLMT-GPFMVAGEFKYHPECFACMSCKVIIEDGDAYALVQHATLYCGKCHNE
       :: :::::  .: :  :::::.::::::: :..: ..: :::.:.::.:. ::::.:. .
NP_001 GESCHGCSEQITKGLVMVAGELKYHPECFICLTCGTFIGDGDTYTLVEHSKLYCGHCYYQ
         50        60        70        80        90       100      

       130       140       150       160       170             180 
pF1KB8 VVLAPMFERLSTESVQEQLPYSVTLISMPATTEGRRGFSVSVES-----AC-SNYATTVQ
       .:..:..:..  .:   .::..:::.:.::...:.::.:::..      .: .... ::.
NP_001 TVVTPVIEQILPDSPGSHLPHTVTLVSIPASSHGKRGLSVSIDPPHGPPGCGTEHSHTVR
        110       120       130       140       150       160      

             190       200       210       220       230       240 
pF1KB8 VKEVNRMHISPNNRNAIHPGDRILEINGTPVRTLRVEEVEDAISQTSQTLQLLIEHDPVS
       :. :.   .::. .:.:: :::::::::::.:.. ..:..  :..::. ::: .::::  
NP_001 VQGVDPGCMSPDVKNSIHVGDRILEINGTPIRNVPLDEIDLLIQETSRLLQLTLEHDP--
        170       180       190       200       210       220      

             250       260       270       280       290       300 
pF1KB8 QRLDQLRLEARLAPHMQNAGHPHALSTLDTKENLEGTLRRRSLRRSNSISKSPGPSSPKE
           .  :   :.:. .  . :    . ..     .. :.. . :: ::..::: .:   
NP_001 ----HDTLGHGLGPETSPLSSPAYTPSGEAG----SSARQKPVLRSCSIDRSPGAGSLGS
              230       240       250           260       270      

             310       320       330       340       350       360 
pF1KB8 PLLFSRDISRSESLRCSSSYSQQIFRPCDLIHGEVLGKGFFGQAIKVTHKATGKVMVMKE
       :    .:..::::::      ..:::: ::::::::::: :::::::::. ::.::::::
NP_001 PASQRKDLGRSESLRVVCR-PHRIFRPSDLIHGEVLGKGCFGQAIKVTHRETGEVMVMKE
        280       290        300       310       320       330     

             370       380       390       400       410       420 
pF1KB8 LIRCDEETQKTFLTEVKVMRSLDHPNVLKFIGVLYKDKKLNLLTEYIEGGTLKDFLRSMD
       ::: :::::.::: :::::: :.:::::::::::::::.::..::::.::::. ...:::
NP_001 LIRFDEETQRTFLKEVKVMRCLEHPNVLKFIGVLYKDKRLNFITEYIKGGTLRGIIKSMD
         340       350       360       370       380       390     

              430       440       450       460       470       480
pF1KB8 P-FPWQQKVRFAKGIASGMAYLHSMCIIHRDLNSHNCLIKLDKTVVVADFGLSRLIVEER
         .::.:.: ::: ::::::::::: ::::::::::::.. .:.::::::::.::.:.: 
NP_001 SQYPWSQRVSFAKDIASGMAYLHSMNIIHRDLNSHNCLVRENKNVVVADFGLARLMVDE-
         400       410       420       430       440       450     

              490       500       510       520       530       540
pF1KB8 KRAPMEKATTKKRTLRKNDRKKRYTVVGNPYWMAPEMLNGKSYDETVDIFSFGIVLCEII
       :  :        :.:.: :::::::::::::::::::.::.:::: ::.:::::::::::
NP_001 KTQP-----EGLRSLKKPDRKKRYTVVGNPYWMAPEMINGRSYDEKVDVFSFGIVLCEII
               460       470       480       490       500         

              550       560       570       580       590       600
pF1KB8 GQVYADPDCLPRTLDFGLNVKLFWEKFVPTDCPPAFFPLAAICCRLEPESRPAFSKLEDS
       :.: :::: ::::.::::::. : ... : .:::.:::... :: :.::.::.: :::  
NP_001 GRVNADPDYLPRTMDFGLNVRGFLDRYCPPNCPPSFFPITVRCCDLDPEKRPSFVKLEHW
     510       520       530       540       550       560         

               610       620       630               
pF1KB8 FEALSLYL-GELGIPLPAELEELDHTVSMQYGLTRDSPP       
       .:.: ..: :.:  ::  .::.::                      
NP_001 LETLRMHLAGHL--PLGPQLEQLDRGFWETYRRGESGLPAHPEVPD
     570       580         590       600       610   

>>NP_002305 (OMIM: 601329) LIM domain kinase 1 isoform 1  (647 aa)
 initn: 2186 init1: 578 opt: 1503  Z-score: 529.5  bits: 108.2 E(85289): 9.4e-23
Smith-Waterman score: 2308; 55.2% identity (78.5% similar) in 627 aa overlap (6-623:19-625)

                            10        20        30        40       
pF1KB8              MSALAGEDVWRCPGCGDHIAPSQIWYRTVNETWHGSCFRCSECQDSL
                         : ..  : .::..:  .: . ...:  ::..:::: .:. ::
NP_002 MRLTLLCCTWREERMGEEGSELPVCASCGQRIYDGQ-YLQALNADWHADCFRCCDCSASL
               10        20        30         40        50         

        50        60        70        80         90       100      
pF1KB8 TNWYYEKDGKLYCPKDYWGKFGEFCHGCSLLMT-GPFMVAGEFKYHPECFACMSCKVIIE
       .. ::::::.:.: ::::...:: :::::  .: :  :::::.::::::: :..: ..: 
NP_002 SHQYYEKDGQLFCKKDYWARYGESCHGCSEQITKGLVMVAGELKYHPECFICLTCGTFIG
      60        70        80        90       100       110         

        110       120       130       140       150       160      
pF1KB8 DGDAYALVQHATLYCGKCHNEVVLAPMFERLSTESVQEQLPYSVTLISMPATTEGRRGFS
       :::.:.::.:. ::::.:. ..:..:..:..  .:   .::..:::.:.::...:.::.:
NP_002 DGDTYTLVEHSKLYCGHCYYQTVVTPVIEQILPDSPGSHLPHTVTLVSIPASSHGKRGLS
     120       130       140       150       160       170         

        170             180       190       200       210       220
pF1KB8 VSVES-----AC-SNYATTVQVKEVNRMHISPNNRNAIHPGDRILEINGTPVRTLRVEEV
       ::..      .: .... ::.:. :.   .::. .:.:: :::::::::::.:.. ..:.
NP_002 VSIDPPHGPPGCGTEHSHTVRVQGVDPGCMSPDVKNSIHVGDRILEINGTPIRNVPLDEI
     180       190       200       210       220       230         

              230       240       250       260       270       280
pF1KB8 EDAISQTSQTLQLLIEHDPVSQRLDQLRLEARLAPHMQNAGHPHALSTLDTKENLEGTLR
       .  :..::. ::: .::::      .  :   :.:. .  . :    . ..     .. :
NP_002 DLLIQETSRLLQLTLEHDP------HDTLGHGLGPETSPLSSPAYTPSGEAG----SSAR
     240       250             260       270       280             

              290       300       310       320       330       340
pF1KB8 RRSLRRSNSISKSPGPSSPKEPLLFSRDISRSESLRCSSSYSQQIFRPCDLIHGEVLGKG
       .. . :: ::..::: .:   :    .:..::::::      ..:::: :::::::::::
NP_002 QKPVLRSCSIDRSPGAGSLGSPASQRKDLGRSESLRVVCR-PHRIFRPSDLIHGEVLGKG
     290       300       310       320        330       340        

              350       360       370       380       390       400
pF1KB8 FFGQAIKVTHKATGKVMVMKELIRCDEETQKTFLTEVKVMRSLDHPNVLKFIGVLYKDKK
        :::::::::. ::.::::::::: :::::.::: :::::: :.:::::::::::::::.
NP_002 CFGQAIKVTHRETGEVMVMKELIRFDEETQRTFLKEVKVMRCLEHPNVLKFIGVLYKDKR
      350       360       370       380       390       400        

              410       420        430       440       450         
pF1KB8 LNLLTEYIEGGTLKDFLRSMDP-FPWQQKVRFAKGIASGMAYLHSMCIIHRDLNSHNCLI
       ::..::::.::::. ...:::  .::.:.: ::: ::::::::::: ::::::::::::.
NP_002 LNFITEYIKGGTLRGIIKSMDSQYPWSQRVSFAKDIASGMAYLHSMNIIHRDLNSHNCLV
      410       420       430       440       450       460        

     460       470       480       490       500       510         
pF1KB8 KLDKTVVVADFGLSRLIVEERKRAPMEKATTKKRTLRKNDRKKRYTVVGNPYWMAPEMLN
       . .:.::::::::.::.:.: :  :        :.:.: :::::::::::::::::::.:
NP_002 RENKNVVVADFGLARLMVDE-KTQP-----EGLRSLKKPDRKKRYTVVGNPYWMAPEMIN
      470       480        490            500       510       520  

     520       530       540       550       560       570         
pF1KB8 GKSYDETVDIFSFGIVLCEIIGQVYADPDCLPRTLDFGLNVKLFWEKFVPTDCPPAFFPL
       :.:::: ::.::::::::::::.: :::: ::::.::::::. : ... : .:::.:::.
NP_002 GRSYDEKVDVFSFGIVLCEIIGRVNADPDYLPRTMDFGLNVRGFLDRYCPPNCPPSFFPI
            530       540       550       560       570       580  

     580       590       600        610       620       630        
pF1KB8 AAICCRLEPESRPAFSKLEDSFEALSLYL-GELGIPLPAELEELDHTVSMQYGLTRDSPP
       .. :: :.::.::.: :::  .:.: ..: :.:  ::  .::.::               
NP_002 TVRCCDLDPEKRPSFVKLEHWLETLRMHLAGHL--PLGPQLEQLDRGFWETYRRGESGLP
            590       600       610         620       630       640

NP_002 AHPEVPD
              

>>NP_001305159 (OMIM: 601782) dual specificity testis-sp  (466 aa)
 initn: 414 init1: 296 opt: 413  Z-score: 173.0  bits: 41.8 E(85289): 0.0067
Smith-Waterman score: 413; 47.2% identity (68.3% similar) in 142 aa overlap (496-637:47-181)

         470       480       490       500       510       520     
pF1KB8 VVADFGLSRLIVEERKRAPMEKATTKKRTLRKNDRKKRYTVVGNPYWMAPEMLNGKSYDE
                                     :.. ::.  .:::.:::::::.: :. :::
NP_001 GRSGSTWPWTLPEACGTCTPKVYFTATSHPREGARKEPLAVVGSPYWMAPEVLRGELYDE
         20        30        40        50        60        70      

         530       540       550       560       570       580     
pF1KB8 TVDIFSFGIVLCEIIGQVYADPDCLPRTLDFGLNVKLFWEKFVPTDCPPAFFPLAAICCR
        .:.:.:::::::.:..: :::: :::: ::::.:  : . .:  :::  :. ::  :: 
NP_001 KADVFAFGIVLCELIARVPADPDYLPRTEDFGLDVPAF-RTLVGDDCPLPFLLLAIHCCN
         80        90       100       110        120       130     

         590       600       610       620       630               
pF1KB8 LEPESRPAFSKLEDSFEALSLYLGELGIPLPAELEELDHTVSMQYGLTRDSPP       
       ::: .:  :... . .: .   : .:  : :     : :.   : ...: .:        
NP_001 LEPSTRAPFTEITQHLEWI---LEQLPEPAPLTRTALTHN---QGSVARGGPSATLPRPD
         140       150          160       170          180         

NP_001 PRLSRSRSDLFLPPSPESPPNWGDNLTRVNPFSLREDLRGGKIKLLDTPSKPVLPLVPPS
     190       200       210       220       230       240         

>>NP_006276 (OMIM: 601782) dual specificity testis-speci  (626 aa)
 initn: 789 init1: 296 opt: 413  Z-score: 171.9  bits: 42.0 E(85289): 0.0078
Smith-Waterman score: 778; 41.2% identity (65.8% similar) in 330 aa overlap (311-637:37-341)

              290       300       310       320       330       340
pF1KB8 RRSLRRSNSISKSPGPSSPKEPLLFSRDISRSESLRCSSSYSQQIFRPCDLIHGEVLGKG
                                     :  : :   :  ... :  :.  .: .: :
NP_006 PLRGPGPGPGEVPGEGPPGPGGTGGGPGRGRPSSYRALRSAVSSLARVDDFHCAEKIGAG
         10        20        30        40        50        60      

              350       360       370       380       390       400
pF1KB8 FFGQAIKVTHKATGKVMVMKELIRCDEETQKTFLTEVKVMRSLDHPNVLKFIGVLYKDKK
       ::... :: :. .:.:::.: . .   .  .: : ::..:  : :::.:.:.::  .. .
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