Result of FASTA (ccds) for pF1KB8450
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB8450, 638 aa
  1>>>pF1KB8450 638 - 638 aa - 638 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.4643+/-0.00139; mu= -10.7780+/- 0.080
 mean_var=468.8443+/-108.091, 0's: 0 Z-trim(109.7): 419  B-trim: 0 in 0/52
 Lambda= 0.059232
 statistics sampled from 10609 (11080) to 10609 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.69), E-opt: 0.2 (0.34), width:  16
 Scan time:  3.080

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS13891.1 LIMK2 gene_id:3985|Hs108|chr22         ( 638) 4372 389.2  9e-108
CCDS13892.1 LIMK2 gene_id:3985|Hs108|chr22         ( 617) 4080 364.3 2.9e-100
CCDS33637.1 LIMK2 gene_id:3985|Hs108|chr22         ( 686) 3772 338.0 2.6e-92
CCDS56491.1 LIMK1 gene_id:3984|Hs108|chr7          ( 613) 1503 144.0 5.6e-34
CCDS5563.1 LIMK1 gene_id:3984|Hs108|chr7           ( 647) 1503 144.1 5.8e-34


>>CCDS13891.1 LIMK2 gene_id:3985|Hs108|chr22              (638 aa)
 initn: 4372 init1: 4372 opt: 4372  Z-score: 2048.3  bits: 389.2 E(32554): 9e-108
Smith-Waterman score: 4372; 100.0% identity (100.0% similar) in 638 aa overlap (1-638:1-638)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MSALAGEDVWRCPGCGDHIAPSQIWYRTVNETWHGSCFRCSECQDSLTNWYYEKDGKLYC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 MSALAGEDVWRCPGCGDHIAPSQIWYRTVNETWHGSCFRCSECQDSLTNWYYEKDGKLYC
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB8 PKDYWGKFGEFCHGCSLLMTGPFMVAGEFKYHPECFACMSCKVIIEDGDAYALVQHATLY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 PKDYWGKFGEFCHGCSLLMTGPFMVAGEFKYHPECFACMSCKVIIEDGDAYALVQHATLY
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB8 CGKCHNEVVLAPMFERLSTESVQEQLPYSVTLISMPATTEGRRGFSVSVESACSNYATTV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 CGKCHNEVVLAPMFERLSTESVQEQLPYSVTLISMPATTEGRRGFSVSVESACSNYATTV
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB8 QVKEVNRMHISPNNRNAIHPGDRILEINGTPVRTLRVEEVEDAISQTSQTLQLLIEHDPV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 QVKEVNRMHISPNNRNAIHPGDRILEINGTPVRTLRVEEVEDAISQTSQTLQLLIEHDPV
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB8 SQRLDQLRLEARLAPHMQNAGHPHALSTLDTKENLEGTLRRRSLRRSNSISKSPGPSSPK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 SQRLDQLRLEARLAPHMQNAGHPHALSTLDTKENLEGTLRRRSLRRSNSISKSPGPSSPK
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB8 EPLLFSRDISRSESLRCSSSYSQQIFRPCDLIHGEVLGKGFFGQAIKVTHKATGKVMVMK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 EPLLFSRDISRSESLRCSSSYSQQIFRPCDLIHGEVLGKGFFGQAIKVTHKATGKVMVMK
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB8 ELIRCDEETQKTFLTEVKVMRSLDHPNVLKFIGVLYKDKKLNLLTEYIEGGTLKDFLRSM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 ELIRCDEETQKTFLTEVKVMRSLDHPNVLKFIGVLYKDKKLNLLTEYIEGGTLKDFLRSM
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB8 DPFPWQQKVRFAKGIASGMAYLHSMCIIHRDLNSHNCLIKLDKTVVVADFGLSRLIVEER
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 DPFPWQQKVRFAKGIASGMAYLHSMCIIHRDLNSHNCLIKLDKTVVVADFGLSRLIVEER
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB8 KRAPMEKATTKKRTLRKNDRKKRYTVVGNPYWMAPEMLNGKSYDETVDIFSFGIVLCEII
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 KRAPMEKATTKKRTLRKNDRKKRYTVVGNPYWMAPEMLNGKSYDETVDIFSFGIVLCEII
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB8 GQVYADPDCLPRTLDFGLNVKLFWEKFVPTDCPPAFFPLAAICCRLEPESRPAFSKLEDS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 GQVYADPDCLPRTLDFGLNVKLFWEKFVPTDCPPAFFPLAAICCRLEPESRPAFSKLEDS
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630        
pF1KB8 FEALSLYLGELGIPLPAELEELDHTVSMQYGLTRDSPP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 FEALSLYLGELGIPLPAELEELDHTVSMQYGLTRDSPP
              610       620       630        

>>CCDS13892.1 LIMK2 gene_id:3985|Hs108|chr22              (617 aa)
 initn: 4080 init1: 4080 opt: 4080  Z-score: 1913.6  bits: 364.3 E(32554): 2.9e-100
Smith-Waterman score: 4080; 100.0% identity (100.0% similar) in 601 aa overlap (38-638:17-617)

        10        20        30        40        50        60       
pF1KB8 DVWRCPGCGDHIAPSQIWYRTVNETWHGSCFRCSECQDSLTNWYYEKDGKLYCPKDYWGK
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13               MGSYLSVPAYFTSRDLFRCSECQDSLTNWYYEKDGKLYCPKDYWGK
                             10        20        30        40      

        70        80        90       100       110       120       
pF1KB8 FGEFCHGCSLLMTGPFMVAGEFKYHPECFACMSCKVIIEDGDAYALVQHATLYCGKCHNE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 FGEFCHGCSLLMTGPFMVAGEFKYHPECFACMSCKVIIEDGDAYALVQHATLYCGKCHNE
         50        60        70        80        90       100      

       130       140       150       160       170       180       
pF1KB8 VVLAPMFERLSTESVQEQLPYSVTLISMPATTEGRRGFSVSVESACSNYATTVQVKEVNR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 VVLAPMFERLSTESVQEQLPYSVTLISMPATTEGRRGFSVSVESACSNYATTVQVKEVNR
        110       120       130       140       150       160      

       190       200       210       220       230       240       
pF1KB8 MHISPNNRNAIHPGDRILEINGTPVRTLRVEEVEDAISQTSQTLQLLIEHDPVSQRLDQL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 MHISPNNRNAIHPGDRILEINGTPVRTLRVEEVEDAISQTSQTLQLLIEHDPVSQRLDQL
        170       180       190       200       210       220      

       250       260       270       280       290       300       
pF1KB8 RLEARLAPHMQNAGHPHALSTLDTKENLEGTLRRRSLRRSNSISKSPGPSSPKEPLLFSR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 RLEARLAPHMQNAGHPHALSTLDTKENLEGTLRRRSLRRSNSISKSPGPSSPKEPLLFSR
        230       240       250       260       270       280      

       310       320       330       340       350       360       
pF1KB8 DISRSESLRCSSSYSQQIFRPCDLIHGEVLGKGFFGQAIKVTHKATGKVMVMKELIRCDE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 DISRSESLRCSSSYSQQIFRPCDLIHGEVLGKGFFGQAIKVTHKATGKVMVMKELIRCDE
        290       300       310       320       330       340      

       370       380       390       400       410       420       
pF1KB8 ETQKTFLTEVKVMRSLDHPNVLKFIGVLYKDKKLNLLTEYIEGGTLKDFLRSMDPFPWQQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 ETQKTFLTEVKVMRSLDHPNVLKFIGVLYKDKKLNLLTEYIEGGTLKDFLRSMDPFPWQQ
        350       360       370       380       390       400      

       430       440       450       460       470       480       
pF1KB8 KVRFAKGIASGMAYLHSMCIIHRDLNSHNCLIKLDKTVVVADFGLSRLIVEERKRAPMEK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 KVRFAKGIASGMAYLHSMCIIHRDLNSHNCLIKLDKTVVVADFGLSRLIVEERKRAPMEK
        410       420       430       440       450       460      

       490       500       510       520       530       540       
pF1KB8 ATTKKRTLRKNDRKKRYTVVGNPYWMAPEMLNGKSYDETVDIFSFGIVLCEIIGQVYADP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 ATTKKRTLRKNDRKKRYTVVGNPYWMAPEMLNGKSYDETVDIFSFGIVLCEIIGQVYADP
        470       480       490       500       510       520      

       550       560       570       580       590       600       
pF1KB8 DCLPRTLDFGLNVKLFWEKFVPTDCPPAFFPLAAICCRLEPESRPAFSKLEDSFEALSLY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 DCLPRTLDFGLNVKLFWEKFVPTDCPPAFFPLAAICCRLEPESRPAFSKLEDSFEALSLY
        530       540       550       560       570       580      

       610       620       630        
pF1KB8 LGELGIPLPAELEELDHTVSMQYGLTRDSPP
       :::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 LGELGIPLPAELEELDHTVSMQYGLTRDSPP
        590       600       610       

>>CCDS33637.1 LIMK2 gene_id:3985|Hs108|chr22              (686 aa)
 initn: 3772 init1: 3772 opt: 3772  Z-score: 1770.8  bits: 338.0 E(32554): 2.6e-92
Smith-Waterman score: 3772; 100.0% identity (100.0% similar) in 554 aa overlap (38-591:17-570)

        10        20        30        40        50        60       
pF1KB8 DVWRCPGCGDHIAPSQIWYRTVNETWHGSCFRCSECQDSLTNWYYEKDGKLYCPKDYWGK
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33               MGSYLSVPAYFTSRDLFRCSECQDSLTNWYYEKDGKLYCPKDYWGK
                             10        20        30        40      

        70        80        90       100       110       120       
pF1KB8 FGEFCHGCSLLMTGPFMVAGEFKYHPECFACMSCKVIIEDGDAYALVQHATLYCGKCHNE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 FGEFCHGCSLLMTGPFMVAGEFKYHPECFACMSCKVIIEDGDAYALVQHATLYCGKCHNE
         50        60        70        80        90       100      

       130       140       150       160       170       180       
pF1KB8 VVLAPMFERLSTESVQEQLPYSVTLISMPATTEGRRGFSVSVESACSNYATTVQVKEVNR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 VVLAPMFERLSTESVQEQLPYSVTLISMPATTEGRRGFSVSVESACSNYATTVQVKEVNR
        110       120       130       140       150       160      

       190       200       210       220       230       240       
pF1KB8 MHISPNNRNAIHPGDRILEINGTPVRTLRVEEVEDAISQTSQTLQLLIEHDPVSQRLDQL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 MHISPNNRNAIHPGDRILEINGTPVRTLRVEEVEDAISQTSQTLQLLIEHDPVSQRLDQL
        170       180       190       200       210       220      

       250       260       270       280       290       300       
pF1KB8 RLEARLAPHMQNAGHPHALSTLDTKENLEGTLRRRSLRRSNSISKSPGPSSPKEPLLFSR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 RLEARLAPHMQNAGHPHALSTLDTKENLEGTLRRRSLRRSNSISKSPGPSSPKEPLLFSR
        230       240       250       260       270       280      

       310       320       330       340       350       360       
pF1KB8 DISRSESLRCSSSYSQQIFRPCDLIHGEVLGKGFFGQAIKVTHKATGKVMVMKELIRCDE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 DISRSESLRCSSSYSQQIFRPCDLIHGEVLGKGFFGQAIKVTHKATGKVMVMKELIRCDE
        290       300       310       320       330       340      

       370       380       390       400       410       420       
pF1KB8 ETQKTFLTEVKVMRSLDHPNVLKFIGVLYKDKKLNLLTEYIEGGTLKDFLRSMDPFPWQQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 ETQKTFLTEVKVMRSLDHPNVLKFIGVLYKDKKLNLLTEYIEGGTLKDFLRSMDPFPWQQ
        350       360       370       380       390       400      

       430       440       450       460       470       480       
pF1KB8 KVRFAKGIASGMAYLHSMCIIHRDLNSHNCLIKLDKTVVVADFGLSRLIVEERKRAPMEK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 KVRFAKGIASGMAYLHSMCIIHRDLNSHNCLIKLDKTVVVADFGLSRLIVEERKRAPMEK
        410       420       430       440       450       460      

       490       500       510       520       530       540       
pF1KB8 ATTKKRTLRKNDRKKRYTVVGNPYWMAPEMLNGKSYDETVDIFSFGIVLCEIIGQVYADP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 ATTKKRTLRKNDRKKRYTVVGNPYWMAPEMLNGKSYDETVDIFSFGIVLCEIIGQVYADP
        470       480       490       500       510       520      

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pF1KB8 DCLPRTLDFGLNVKLFWEKFVPTDCPPAFFPLAAICCRLEPESRPAFSKLEDSFEALSLY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::                
CCDS33 DCLPRTLDFGLNVKLFWEKFVPTDCPPAFFPLAAICCRLEPESRAPPGAAGEGPGCADDE
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pF1KB8 LGELGIPLPAELEELDHTVSMQYGLTRDSPP                             
                                                                   
CCDS33 GPVRRQGKVTIKYDPKELRKHLNLEEWILEQLTRLYDCQEEEISELEIDVDELLDMESDD
        590       600       610       620       630       640      

>>CCDS56491.1 LIMK1 gene_id:3984|Hs108|chr7               (613 aa)
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Smith-Waterman score: 2217; 56.2% identity (79.0% similar) in 594 aa overlap (39-623:17-591)

       10        20        30        40        50        60        
pF1KB8 VWRCPGCGDHIAPSQIWYRTVNETWHGSCFRCSECQDSLTNWYYEKDGKLYCPKDYWGKF
                                     .: .:. ::.. ::::::.:.: ::::...
CCDS56               MLLASAPRRRRFLQRAKCCDCSASLSHQYYEKDGQLFCKKDYWARY
                             10        20        30        40      

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pF1KB8 GEFCHGCSLLMT-GPFMVAGEFKYHPECFACMSCKVIIEDGDAYALVQHATLYCGKCHNE
       :: :::::  .: :  :::::.::::::: :..: ..: :::.:.::.:. ::::.:. .
CCDS56 GESCHGCSEQITKGLVMVAGELKYHPECFICLTCGTFIGDGDTYTLVEHSKLYCGHCYYQ
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pF1KB8 VVLAPMFERLSTESVQEQLPYSVTLISMPATTEGRRGFSVSVES-----AC-SNYATTVQ
       .:..:..:..  .:   .::..:::.:.::...:.::.:::..      .: .... ::.
CCDS56 TVVTPVIEQILPDSPGSHLPHTVTLVSIPASSHGKRGLSVSIDPPHGPPGCGTEHSHTVR
        110       120       130       140       150       160      

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pF1KB8 VKEVNRMHISPNNRNAIHPGDRILEINGTPVRTLRVEEVEDAISQTSQTLQLLIEHDPVS
       :. :.   .::. .:.:: :::::::::::.:.. ..:..  :..::. ::: .::::  
CCDS56 VQGVDPGCMSPDVKNSIHVGDRILEINGTPIRNVPLDEIDLLIQETSRLLQLTLEHDP--
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pF1KB8 QRLDQLRLEARLAPHMQNAGHPHALSTLDTKENLEGTLRRRSLRRSNSISKSPGPSSPKE
           .  :   :.:. .  . :    . ..     .. :.. . :: ::..::: .:   
CCDS56 ----HDTLGHGLGPETSPLSSPAYTPSGEAG----SSARQKPVLRSCSIDRSPGAGSLGS
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pF1KB8 PLLFSRDISRSESLRCSSSYSQQIFRPCDLIHGEVLGKGFFGQAIKVTHKATGKVMVMKE
       :    .:..::::::      ..:::: ::::::::::: :::::::::. ::.::::::
CCDS56 PASQRKDLGRSESLRVVCR-PHRIFRPSDLIHGEVLGKGCFGQAIKVTHRETGEVMVMKE
        280       290        300       310       320       330     

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pF1KB8 LIRCDEETQKTFLTEVKVMRSLDHPNVLKFIGVLYKDKKLNLLTEYIEGGTLKDFLRSMD
       ::: :::::.::: :::::: :.:::::::::::::::.::..::::.::::. ...:::
CCDS56 LIRFDEETQRTFLKEVKVMRCLEHPNVLKFIGVLYKDKRLNFITEYIKGGTLRGIIKSMD
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pF1KB8 P-FPWQQKVRFAKGIASGMAYLHSMCIIHRDLNSHNCLIKLDKTVVVADFGLSRLIVEER
         .::.:.: ::: ::::::::::: ::::::::::::.. .:.::::::::.::.:.: 
CCDS56 SQYPWSQRVSFAKDIASGMAYLHSMNIIHRDLNSHNCLVRENKNVVVADFGLARLMVDE-
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pF1KB8 KRAPMEKATTKKRTLRKNDRKKRYTVVGNPYWMAPEMLNGKSYDETVDIFSFGIVLCEII
       :  :        :.:.: :::::::::::::::::::.::.:::: ::.:::::::::::
CCDS56 KTQP-----EGLRSLKKPDRKKRYTVVGNPYWMAPEMINGRSYDEKVDVFSFGIVLCEII
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pF1KB8 GQVYADPDCLPRTLDFGLNVKLFWEKFVPTDCPPAFFPLAAICCRLEPESRPAFSKLEDS
       :.: :::: ::::.::::::. : ... : .:::.:::... :: :.::.::.: :::  
CCDS56 GRVNADPDYLPRTMDFGLNVRGFLDRYCPPNCPPSFFPITVRCCDLDPEKRPSFVKLEHW
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pF1KB8 FEALSLYL-GELGIPLPAELEELDHTVSMQYGLTRDSPP       
       .:.: ..: :.:  ::  .::.::                      
CCDS56 LETLRMHLAGHL--PLGPQLEQLDRGFWETYRRGESGLPAHPEVPD
     570       580         590       600       610   

>>CCDS5563.1 LIMK1 gene_id:3984|Hs108|chr7                (647 aa)
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                         : ..  : .::..:  .: . ...:  ::..:::: .:. ::
CCDS55 MRLTLLCCTWREERMGEEGSELPVCASCGQRIYDGQ-YLQALNADWHADCFRCCDCSASL
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pF1KB8 TNWYYEKDGKLYCPKDYWGKFGEFCHGCSLLMT-GPFMVAGEFKYHPECFACMSCKVIIE
       .. ::::::.:.: ::::...:: :::::  .: :  :::::.::::::: :..: ..: 
CCDS55 SHQYYEKDGQLFCKKDYWARYGESCHGCSEQITKGLVMVAGELKYHPECFICLTCGTFIG
      60        70        80        90       100       110         

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pF1KB8 DGDAYALVQHATLYCGKCHNEVVLAPMFERLSTESVQEQLPYSVTLISMPATTEGRRGFS
       :::.:.::.:. ::::.:. ..:..:..:..  .:   .::..:::.:.::...:.::.:
CCDS55 DGDTYTLVEHSKLYCGHCYYQTVVTPVIEQILPDSPGSHLPHTVTLVSIPASSHGKRGLS
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pF1KB8 VSVES-----AC-SNYATTVQVKEVNRMHISPNNRNAIHPGDRILEINGTPVRTLRVEEV
       ::..      .: .... ::.:. :.   .::. .:.:: :::::::::::.:.. ..:.
CCDS55 VSIDPPHGPPGCGTEHSHTVRVQGVDPGCMSPDVKNSIHVGDRILEINGTPIRNVPLDEI
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pF1KB8 EDAISQTSQTLQLLIEHDPVSQRLDQLRLEARLAPHMQNAGHPHALSTLDTKENLEGTLR
       .  :..::. ::: .::::      .  :   :.:. .  . :    . ..     .. :
CCDS55 DLLIQETSRLLQLTLEHDP------HDTLGHGLGPETSPLSSPAYTPSGEAG----SSAR
     240       250             260       270       280             

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pF1KB8 RRSLRRSNSISKSPGPSSPKEPLLFSRDISRSESLRCSSSYSQQIFRPCDLIHGEVLGKG
       .. . :: ::..::: .:   :    .:..::::::      ..:::: :::::::::::
CCDS55 QKPVLRSCSIDRSPGAGSLGSPASQRKDLGRSESLRVVCR-PHRIFRPSDLIHGEVLGKG
     290       300       310       320        330       340        

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pF1KB8 FFGQAIKVTHKATGKVMVMKELIRCDEETQKTFLTEVKVMRSLDHPNVLKFIGVLYKDKK
        :::::::::. ::.::::::::: :::::.::: :::::: :.:::::::::::::::.
CCDS55 CFGQAIKVTHRETGEVMVMKELIRFDEETQRTFLKEVKVMRCLEHPNVLKFIGVLYKDKR
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pF1KB8 LNLLTEYIEGGTLKDFLRSMDP-FPWQQKVRFAKGIASGMAYLHSMCIIHRDLNSHNCLI
       ::..::::.::::. ...:::  .::.:.: ::: ::::::::::: ::::::::::::.
CCDS55 LNFITEYIKGGTLRGIIKSMDSQYPWSQRVSFAKDIASGMAYLHSMNIIHRDLNSHNCLV
      410       420       430       440       450       460        

     460       470       480       490       500       510         
pF1KB8 KLDKTVVVADFGLSRLIVEERKRAPMEKATTKKRTLRKNDRKKRYTVVGNPYWMAPEMLN
       . .:.::::::::.::.:.: :  :        :.:.: :::::::::::::::::::.:
CCDS55 RENKNVVVADFGLARLMVDE-KTQP-----EGLRSLKKPDRKKRYTVVGNPYWMAPEMIN
      470       480        490            500       510       520  

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pF1KB8 GKSYDETVDIFSFGIVLCEIIGQVYADPDCLPRTLDFGLNVKLFWEKFVPTDCPPAFFPL
       :.:::: ::.::::::::::::.: :::: ::::.::::::. : ... : .:::.:::.
CCDS55 GRSYDEKVDVFSFGIVLCEIIGRVNADPDYLPRTMDFGLNVRGFLDRYCPPNCPPSFFPI
            530       540       550       560       570       580  

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pF1KB8 AAICCRLEPESRPAFSKLEDSFEALSLYL-GELGIPLPAELEELDHTVSMQYGLTRDSPP
       .. :: :.::.::.: :::  .:.: ..: :.:  ::  .::.::               
CCDS55 TVRCCDLDPEKRPSFVKLEHWLETLRMHLAGHL--PLGPQLEQLDRGFWETYRRGESGLP
            590       600       610         620       630       640

CCDS55 AHPEVPD
              




638 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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