Result of FASTA (omim) for pF1KB7332
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB7332, 1032 aa
  1>>>pF1KB7332 1032 - 1032 aa - 1032 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.0019+/-0.000462; mu= 23.4287+/- 0.029
 mean_var=66.6582+/-13.240, 0's: 0 Z-trim(108.3): 97  B-trim: 170 in 1/53
 Lambda= 0.157090
 statistics sampled from 16268 (16366) to 16268 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.536), E-opt: 0.2 (0.192), width:  16
 Scan time: 12.980

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_000876 (OMIM: 192975) integrin alpha-4 isoform  (1032) 6891 1571.8       0
NP_002198 (OMIM: 603963) integrin alpha-9 precurso (1035) 2758 635.1 5.9e-181
NP_001303241 (OMIM: 192975) integrin alpha-4 isofo ( 195) 1330 311.0 4.2e-84
NP_001278423 (OMIM: 191830,604063) integrin alpha- (1048)  967 229.2 9.2e-59
NP_002195 (OMIM: 605025,614748) integrin alpha-3 p (1051)  962 228.1   2e-58
NP_002201 (OMIM: 193210) integrin alpha-V isoform  (1048)  949 225.1 1.6e-57
NP_001138471 (OMIM: 193210) integrin alpha-V isofo (1002)  861 205.2 1.5e-51
NP_002196 (OMIM: 135620) integrin alpha-5 precurso (1049)  837 199.8 6.8e-50
NP_001138472 (OMIM: 193210) integrin alpha-V isofo (1012)  817 195.2 1.5e-48
NP_001107852 (OMIM: 153370) integrin alpha-L isofo (1086)  803 192.1 1.5e-47
XP_005255370 (OMIM: 153370) PREDICTED: integrin al (1169)  803 192.1 1.5e-47
NP_003629 (OMIM: 191830,604063) integrin alpha-8 I (1063)  798 190.9 3.1e-47
NP_000878 (OMIM: 151510) integrin alpha-X isoform  (1163)  796 190.5 4.6e-47
NP_001273304 (OMIM: 151510) integrin alpha-X isofo (1169)  796 190.5 4.6e-47
XP_011544151 (OMIM: 153370) PREDICTED: integrin al (1074)  794 190.0 5.9e-47
XP_006721107 (OMIM: 153370) PREDICTED: integrin al (1087)  794 190.0   6e-47
NP_002200 (OMIM: 153370) integrin alpha-L isoform  (1170)  794 190.0 6.4e-47
XP_005254285 (OMIM: 604789) PREDICTED: integrin al (1086)  760 182.3 1.3e-44
XP_011519665 (OMIM: 604789) PREDICTED: integrin al (1119)  760 182.3 1.3e-44
NP_001004439 (OMIM: 604789) integrin alpha-11 prec (1188)  760 182.3 1.3e-44
XP_011518054 (OMIM: 191830,604063) PREDICTED: inte ( 799)  756 181.3 1.8e-44
XP_011544152 (OMIM: 120980,609939) PREDICTED: inte (1091)  686 165.5 1.4e-39
NP_001139280 (OMIM: 120980,609939) integrin alpha- (1153)  686 165.6 1.5e-39
NP_000623 (OMIM: 120980,609939) integrin alpha-M i (1152)  684 165.1   2e-39
XP_011544140 (OMIM: 602453) PREDICTED: integrin al (1179)  680 164.2 3.8e-39
XP_011544154 (OMIM: 151510) PREDICTED: integrin al ( 798)  665 160.7   3e-38
XP_011544137 (OMIM: 602453) PREDICTED: integrin al (1190)  666 161.0 3.5e-38
NP_005344 (OMIM: 602453) integrin alpha-D isoform  (1161)  658 159.2 1.2e-37
NP_001305114 (OMIM: 602453) integrin alpha-D isofo (1162)  656 158.8 1.6e-37
NP_000410 (OMIM: 187800,273800,607759) integrin al (1039)  655 158.5 1.8e-37
XP_011544143 (OMIM: 602453) PREDICTED: integrin al (1160)  655 158.5 1.9e-37
XP_011544138 (OMIM: 602453) PREDICTED: integrin al (1189)  652 157.9 3.1e-37
XP_011544145 (OMIM: 602453) PREDICTED: integrin al (1028)  647 156.7 6.1e-37
XP_016878704 (OMIM: 602453) PREDICTED: integrin al (1164)  647 156.7 6.8e-37
XP_011544139 (OMIM: 602453) PREDICTED: integrin al (1189)  647 156.7 6.9e-37
XP_016858117 (OMIM: 604042) PREDICTED: integrin al ( 796)  643 155.7 9.4e-37
XP_016858116 (OMIM: 604042) PREDICTED: integrin al ( 835)  643 155.7 9.8e-37
XP_016858112 (OMIM: 604042) PREDICTED: integrin al (1180)  644 156.1 1.1e-36
XP_011508385 (OMIM: 604042) PREDICTED: integrin al (1002)  643 155.8 1.1e-36
NP_001289970 (OMIM: 604042) integrin alpha-10 isof (1024)  643 155.8 1.1e-36
NP_001289969 (OMIM: 604042) integrin alpha-10 isof (1036)  643 155.8 1.2e-36
XP_016858115 (OMIM: 604042) PREDICTED: integrin al (1100)  643 155.8 1.2e-36
XP_005277493 (OMIM: 604042) PREDICTED: integrin al (1105)  643 155.8 1.2e-36
XP_016858113 (OMIM: 604042) PREDICTED: integrin al (1143)  643 155.8 1.3e-36
XP_016858114 (OMIM: 604042) PREDICTED: integrin al (1143)  643 155.8 1.3e-36
NP_003628 (OMIM: 604042) integrin alpha-10 isoform (1167)  643 155.8 1.3e-36
XP_016858111 (OMIM: 604042) PREDICTED: integrin al (1181)  643 155.8 1.3e-36
XP_011544141 (OMIM: 602453) PREDICTED: integrin al (1173)  642 155.6 1.5e-36
XP_005268907 (OMIM: 600536,613204) PREDICTED: inte ( 979)  634 153.7 4.6e-36
XP_005268903 (OMIM: 600536,613204) PREDICTED: inte (1024)  634 153.7 4.7e-36


>>NP_000876 (OMIM: 192975) integrin alpha-4 isoform 1 pr  (1032 aa)
 initn: 6891 init1: 6891 opt: 6891  Z-score: 8431.9  bits: 1571.8 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 6891; 100.0% identity (100.0% similar) in 1032 aa overlap (1-1032:1-1032)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MAWEARREPGPRRAAVRETVMLLLCLGVPTGRPYNVDTESALLYQGPHNTLFGYSVVLHS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 MAWEARREPGPRRAAVRETVMLLLCLGVPTGRPYNVDTESALLYQGPHNTLFGYSVVLHS
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB7 HGANRWLLVGAPTANWLANASVINPGAIYRCRIGKNPGQTCEQLQLGSPNGEPCGKTCLE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 HGANRWLLVGAPTANWLANASVINPGAIYRCRIGKNPGQTCEQLQLGSPNGEPCGKTCLE
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB7 ERDNQWLGVTLSRQPGENGSIVTCGHRWKNIFYIKNENKLPTGGCYGVPPDLRTELSKRI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 ERDNQWLGVTLSRQPGENGSIVTCGHRWKNIFYIKNENKLPTGGCYGVPPDLRTELSKRI
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB7 APCYQDYVKKFGENFASCQAGISSFYTKDLIVMGAPGSSYWTGSLFVYNITTNKYKAFLD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 APCYQDYVKKFGENFASCQAGISSFYTKDLIVMGAPGSSYWTGSLFVYNITTNKYKAFLD
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB7 KQNQVKFGSYLGYSVGAGHFRSQHTTEVVGGAPQHEQIGKAYIFSIDEKELNILHEMKGK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 KQNQVKFGSYLGYSVGAGHFRSQHTTEVVGGAPQHEQIGKAYIFSIDEKELNILHEMKGK
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB7 KLGSYFGASVCAVDLNADGFSDLLVGAPMQSTIREEGRVFVYINSGSGAVMNAMETNLVG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 KLGSYFGASVCAVDLNADGFSDLLVGAPMQSTIREEGRVFVYINSGSGAVMNAMETNLVG
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB7 SDKYAARFGESIVNLGDIDNDGFEDVAIGAPQEDDLQGAIYIYNGRADGISSTFSQRIEG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 SDKYAARFGESIVNLGDIDNDGFEDVAIGAPQEDDLQGAIYIYNGRADGISSTFSQRIEG
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB7 LQISKSLSMFGQSISGQIDADNNGYVDVAVGAFRSDSAVLLRTRPVVIVDASLSHPESVN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 LQISKSLSMFGQSISGQIDADNNGYVDVAVGAFRSDSAVLLRTRPVVIVDASLSHPESVN
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB7 RTKFDCVENGWPSVCIDLTLCFSYKGKEVPGYIVLFYNMSLDVNRKAESPPRFYFSSNGT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 RTKFDCVENGWPSVCIDLTLCFSYKGKEVPGYIVLFYNMSLDVNRKAESPPRFYFSSNGT
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB7 SDVITGSIQVSSREANCRTHQAFMRKDVRDILTPIQIEAAYHLGPHVISKRSTEEFPPLQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 SDVITGSIQVSSREANCRTHQAFMRKDVRDILTPIQIEAAYHLGPHVISKRSTEEFPPLQ
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB7 PILQQKKEKDIMKKTINFARFCAHENCSADLQVSAKIGFLKPHENKTYLAVGSMKTLMLN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 PILQQKKEKDIMKKTINFARFCAHENCSADLQVSAKIGFLKPHENKTYLAVGSMKTLMLN
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB7 VSLFNAGDDAYETTLHVKLPVGLYFIKILELEEKQINCEVTDNSGVVQLDCSIGYIYVDH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 VSLFNAGDDAYETTLHVKLPVGLYFIKILELEEKQINCEVTDNSGVVQLDCSIGYIYVDH
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KB7 LSRIDISFLLDVSSLSRAEEDLSITVHATCENEEEMDNLKHSRVTVAIPLKYEVKLTVHG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 LSRIDISFLLDVSSLSRAEEDLSITVHATCENEEEMDNLKHSRVTVAIPLKYEVKLTVHG
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KB7 FVNPTSFVYGSNDENEPETCMVEKMNLTFHVINTGNSMAPNVSVEIMVPNSFSPQTDKLF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 FVNPTSFVYGSNDENEPETCMVEKMNLTFHVINTGNSMAPNVSVEIMVPNSFSPQTDKLF
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KB7 NILDVQTTTGECHFENYQRVCALEQQKSAMQTLKGIVRFLSKTDKRLLYCIKADPHCLNF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 NILDVQTTTGECHFENYQRVCALEQQKSAMQTLKGIVRFLSKTDKRLLYCIKADPHCLNF
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KB7 LCNFGKMESGKEASVHIQLEGRPSILEMDETSALKFEIRATGFPEPNPRVIELNKDENVA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 LCNFGKMESGKEASVHIQLEGRPSILEMDETSALKFEIRATGFPEPNPRVIELNKDENVA
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KB7 HVLLEGLHHQRPKRYFTIVIISSSLLLGLIVLLLISYVMWKAGFFKRQYKSILQEENRRD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 HVLLEGLHHQRPKRYFTIVIISSSLLLGLIVLLLISYVMWKAGFFKRQYKSILQEENRRD
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030  
pF1KB7 SWSYINSKSNDD
       ::::::::::::
NP_000 SWSYINSKSNDD
             1030  

>>NP_002198 (OMIM: 603963) integrin alpha-9 precursor [H  (1035 aa)
 initn: 1687 init1: 1156 opt: 2758  Z-score: 3369.7  bits: 635.1 E(85289): 5.9e-181
Smith-Waterman score: 2773; 42.1% identity (70.2% similar) in 1037 aa overlap (11-1025:7-1031)

               10         20        30        40        50         
pF1KB7 MAWEARREPGPRRAA-VRETVMLLLCLGVPTGRPYNVDTESALLYQGPHNTLFGYSVVLH
                 :: :. .:  .. :.  :.:.:  ::.: .  . .::: ...:::.:. :
NP_002     MGGPAAPRGAGRLRALLLALVVAGIPAG-AYNLDPQRPVHFQGPADSFFGYAVLEH
                   10        20         30        40        50     

      60        70        80        90       100         110       
pF1KB7 SHGANRWLLVGAPTANWLANASVINPGAIYRCRIGKNPGQTCEQLQL--GSPNGEPCGKT
        :  .::.::::: :.   . :: .:::...::.  :: . : .:..  :.  :  ::::
NP_002 FHDNTRWVLVGAPKADSKYSPSVKSPGAVFKCRVHTNPDRRCTELDMARGKNRGTSCGKT
          60        70        80        90       100       110     

       120       130       140       150       160       170       
pF1KB7 CLEERDNQWLGVTLSRQPGENGSIVTCGHRWKNIFYIKNENKLPTGGCYGVPPDLRTELS
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pF1KB7 KRIAPCYQDYVKKFGENFASCQAGISSFYTKDLIVMGAPGSSYWTGSLFVYNITTNKYKA
       . . :::..: ::.::. .::::::..:.:..:.::::::: ::.:.. : :.: : :  
NP_002 RTLIPCYEEYKKKYGEEHGSCQAGIAGFFTEELVVMGAPGSFYWAGTIKVLNLTDNTYLK
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       . :.  . .  .::::.: ::::    : .::::::: . :::.:::  :..  ....  
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       . .:::.:::::.:.::::::.::.::::::::: : ::.::.: :::: :.::. . . 
NP_002 QASGKKMGSYFGSSLCAVDLNGDGLSDLLVGAPMFSEIRDEGQVTVYINRGNGALEEQL-
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         :.:.  : :.:::::..: :.::::: :::::::.:::. ::.:::.: : ::   .:
NP_002 -ALTGDGAYNAHFGESIASLDDLDNDGFPDVAIGAPKEDDFAGAVYIYHGDAGGIVPQYS
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       ... : .:.  : :::::::: :: :.::: ::.:::: :::.::::.:::. ::.:.  
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pF1KB7 PESVNRTKFDCVENGWPSVCIDLTLCFSYKGKEVPGYIVLFYNMSLDVNRKAESP-PRFY
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NP_002 PGSINITAPQCHDGQQPVNCLNVTTCFSFHGKHVPGEIGLNYVLMADVAKKEKGQMPRVY
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pF1KB7 FSSNG-TSDVITGSIQVSSREANCRTHQAFMRKDVRDILTPIQIEAAYHLGPHVISKRST
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NP_002 FVLLGETMGQVTEKLQLTYMEETCRHYVAHVKRRVQDVISPIVFEAAYSLSEHVTGEEE-
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pF1KB7 EEFPPLQPILQQKKEKDIMKKTIN-FARFCAHENCSADLQVSAKIGFLKPHENKTYLAVG
       .:.::: :.:. :: . : .:. . : : :  :.:.::::...:. . .  :.  :::.:
NP_002 RELPPLTPVLRWKKGQKIAQKNQTVFERNCRSEDCAADLQLQGKLLLSSMDEKTLYLALG
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pF1KB7 SMKTLMLNVSLFNAGDDAYETTLHVKLPVGLYFIKILELEEKQINCEVTDNSGVVQLDCS
       ..:.. ::.:. : :::::....  ..   :.::.. . ::  :.::. ...    : ::
NP_002 AVKNISLNISISNLGDDAYDANVSFNVSRELFFINMWQKEEMGISCELLESD---FLKCS
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pF1KB7 IGYIYVDHLSRIDISFLLDVSSLSRAEEDLSITVHATCENEEEMDNLKHSRVTVAIPLKY
       .:. ..   :. ..: ..:.: ::  :: ::. : :   : :. ..:. . ... .:: .
NP_002 VGFPFMRSKSKYEFSVIFDTSHLSGEEEVLSFIVTAQSGNTERSESLHDNTLVLMVPLMH
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pF1KB7 EVKLTVHGFVNPTSFVYG-SNDEN-----EPETCMVEKMNLTFHVINTGNSMAPNVSVEI
       ::  .. :...::::::: : :       .   :  . .:.:..: ::: :  :. :: :
NP_002 EVDTSITGIMSPTSFVYGESVDAANFIQLDDLECHFQPINITLQVYNTGPSTLPGSSVSI
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pF1KB7 MVPNSFSPQTDKLFNILD--VQTTTGECHFENYQRVCALEQQKSAMQTLKGIVRFLSKTD
         :: .:    ..:.. .  :    :.: :..    : . :..  .  .. :  :..:. 
NP_002 SFPNRLSSGGAEMFHVQEMVVGQEKGNCSFQKNPTPCIIPQEQENI--FHTIFAFFTKSG
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       ...: : :    ::.  :::. . . .  .. : .     ::. : .:...:  ::    
NP_002 RKVLDCEKPGISCLTAHCNFSALAKEESRTIDIYMLLNTEILKKDSSSVIQFMSRAKVKV
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pF1KB7 EPNPRVIEL--NKDENVAHVLLEGLHHQRPKRYFTIVIISSSLLLGLIVLLLISYVMWKA
       .:  ::.:.  .. :.:. :..:.::. .:. : .  ::. :::.:....::.. ..:: 
NP_002 DPALRVVEIAHGNPEEVT-VVFEALHNLEPRGYVVGWIIAISLLVGILIFLLLAVLLWKM
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pF1KB7 GFFKRQYKSILQ-EENRR---DSWSYINSKSNDD
       :::.:.:: :.. :.::.   :::...       
NP_002 GFFRRRYKEIIEAEKNRKENEDSWDWVQKNQ   
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HGANRWLLVGAPTANWLANASVINPGAIYRCRIGKNPGQTCEQLQLGSPNGEPCGKTCLE
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       :::::  ..:.                                                 
NP_001 APCYQGSISKYRART                                             
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>>NP_001278423 (OMIM: 191830,604063) integrin alpha-8 Is  (1048 aa)
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Smith-Waterman score: 1174; 26.4% identity (58.8% similar) in 1074 aa overlap (22-1029:27-1045)

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pF1KB7 VVLHSHGANRW-LLVGAPTANWLANASVINPGAIYRCRIGKNPGQTCEQLQLGSPNGEPC
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NP_001 VDFHIPDARTASVLVGAPKAN-TSQPDIVEGGAVYYCPWPAEGSAQCRQIPFDTTNNRKI
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pF1KB7 ---G-KTCLEERDNQWLGVTLSRQPGENGSIVTCG--HRWKNIFYIKNENKLPTGGCYGV
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NP_001 RVNGTKEPIEFKSNQWFGATVK---AHKGKVVACAPLYHWRTL--KPTPEKDPVGTCYVA
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pF1KB7 PPDLRTELSKRIAPCYQDYVKKFGENFASCQAGIS-SFYTKDLIVMGAPGSSYWTGSLF-
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NP_001 IQNFSA--YAEFSPCRNSNADPEGQGY--CQAGFSLDFYKNGDLIVGGPGSFYWQGQVIT
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pF1KB7 --VYNITTN-KYKAFL-----DKQNQVKFGSYLGYSVGAGHFRSQHTTEVVGGAPQHEQI
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NP_001 ASVADIIANYSFKDILRKLAGEKQTEVAPASY-----------DDSYLELVAGIPRGAQ-
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pF1KB7 GKAYIFSIDEKELNILHEMKGKKLGSYFGASVCAVDLNADGFSDLLVGAPM------QST
       . .:.  :.  ........ :....:::: .: . :.:.::..:.:::::.      .:.
NP_001 NFGYVSIINSTDMTFIQNFTGEQMASYFGYTVVVSDVNSDGLDDVLVGAPLFMEREFESN
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pF1KB7 IREEGRVFVYINSGSGAVMNAMETNLVGSDKYAARFGESIVNLGDIDNDGFEDVAIGAP-
        :: :....:.. .:  ..      :.:.. .. ::: ....:::...::..:.:::.: 
NP_001 PREVGQIYLYLQVSS--LLFRDPQILTGTETFG-RFGSAMAHLGDLNQDGYNDIAIGVPF
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pF1KB7 QEDDLQGAIYIYNGRADGISSTFSQRIEGLQISKSL-SMFGQSISGQIDADNNGYVDVAV
          : .: . ::::  ::...  :: ..:.  :... : :: .. :. : :.: : :. :
NP_001 AGKDQRGKVLIYNGNKDGLNTKPSQVLQGVWASHAVPSGFGFTLRGDSDIDKNDYPDLIV
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pF1KB7 GAFRSDSAVLLRTRPVVIVDASLS-HPESVNRTKFDC-VENGWPSV-CIDLTLCFSYKGK
       ::: . .... :.:::: :::.:  ::  .:  .  : : ..  :. :..: .: :  :.
NP_001 GAFGTGKVAVYRARPVVTVDAQLLLHPMIINLENKTCQVPDSMTSAACFSLRVCASVTGQ
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pF1KB7 EVPGYIVLFYNMSLDVNRKAESPPRFYFSSNGTSDVITGSIQVSSREANCRTHQAFMRKD
        . . :::. ...::  ..  .  :  : .:  .  .   .   ..  .:.   ...: .
NP_001 SIANTIVLMAEVQLDSLKQKGAIKRTLFLDNHQAHRVFPLVIKRQKSHQCQDFIVYLRDE
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pF1KB7 V--RDILTPIQIEAAYHLGPHVISKRSTEEFPPLQPILQQKKEKDIMKKTINFARFCAHE
       .  :: :.::.:   : :   .. :.. :    ..:::.  .: .:...  ..   :...
NP_001 TEFRDKLSPINISLNYSLDESTF-KEGLE----VKPILNYYRE-NIVSEQAHILVDCGED
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pF1KB7 N-CSADLQVSAKIGFLKPHENKTYLAVGSMKTLMLNVSLFNAGDDAYETTLHVKLPVGLY
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pF1KB7 FVYINSGSGAVMNAMETNLVGSDKYAARFGESIVNLGDIDNDGFEDVAIGAPQEDDLQGA
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pF1KB7 IYIYNGRADGISSTFSQRIEGLQIS-KSLSMFGQSISGQIDADNNGYVDVAVGAFRSDSA
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NP_002 VYIYHSSSKGLLRQPQQVIHGEKLGLPGLATFGYSLSGQMDVDENFYPDLLVGSL-SDHI
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pF1KB7 VLLRTRPVV-IVDASLSHPESVNRTKFDCVENGWPSVCIDLTLCFSY-KGKEVPGY---I
       ::::.:::. ::  .:  :. .      :. ..    :... :::.: ..   :.:   :
NP_002 VLLRARPVINIVHKTLV-PRPAVLDPALCTATS----CVQVELCFAYNQSAGNPNYRRNI
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       .: :..  : .:.   :::. :...  : :. : .  :  :  :.  . ..  ..:: : 
NP_002 TLAYTLEADRDRR---PPRLRFAGS-ESAVFHGFF--SMPEMRCQKLELLLMDNLRDKLR
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pF1KB7 PIQIEAAYHLGPHVISKRSTEEFPPLQ--PILQQKKEKDIMKKTINFARFCAHEN-CSAD
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NP_002 LLLSSVRPPGACQANETIFCELGNPFKRNQRMELLIAFEVIGVTLHTR-DLQVQLQLSTS
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pF1KB7 SRAEED----LSITVHATCENEEEMDNLKHSRVTVAIPLKYEVKLTVHGFVNPTSFVYGS
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NP_002 SHQDNLWPMILTLLVDYTLQTSLSMVNHRLQSFFGGTVMGESGMKTVEDVGSPLKYEFQV
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pF1KB7 NDENEPET---CMVEKMNLTFHVINTGNSMAPNVSVEIMVPNSFS----PQTDKLFNILD
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NP_002 GPMGEGLVGLGTLVLGLEWPYEVSNGKWLLYPT---EITVHGNGSWPCRPPGD-LINPLN
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pF1KB7 VQTTT-GECHFENYQRVCALEQ---QKSAMQTLKGIVRFLSKTDKRLLYCIKADPHCLNF
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NP_002 LTLSDPGDRPSSPQRRRRQLDPGGGQGPPPVTLAAAKKAKSET---VLTCATGRAHCVWL
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pF1KB7 LCNFGKMESGKEASVHIQLEGRPSILEMDETSALKFEIRATGFPEPN-PRVIELNKDE--
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pF1KB7 --NVAHVLLEGLHHQRPKRYFTIVIISSSLLLGLIVLLLISYVMWKAGFFKRQYKSILQE
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pF1KB7 ENRRDSWSYINSKSNDD     
        .:.                  
NP_002 AKRQKAEMKSQPSETERLTDDY
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pF1KB7 HSHGANRWLLVGAPTANWLANASVINPGAIYRCRIGKNPGQTCEQLQLGSPNGEPCGKTC
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NP_002 PSASSRMFLLVGAPKAN-TTQPGIVEGGQVLKCDWSST--RRCQPIEFDATGNRDYAKDD
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NP_002 PLEFKSHQWFGASVRSKQD----KILACAPLYHWRT--EMKQERE-PVGTCF-LQDGTKT
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NP_002 ---VEYAPCRSQDIDADGQGF--CQGGFSIDFTKADRVLLGGPGSFYWQGQLISDQVAEI
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pF1KB7 ---FVYNITTNKYKAFL-DKQNQVKFG-SYLGYSVGAGHFRSQHTTEVVGGAPQHEQ-IG
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NP_001 -NPMKAGTQLLAGLRFSVHQQSEMDTSVKFDLQIQSSNLFDKVSPVVSHKVDLAVLAAVE
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NP_001 IRGVSSPDHIFLPIPNWEHKENPETEEDVGPVVQH--IYELRNNGPSSFSKAMLHLQWPY
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pF1KB7 SFSPQTDKLFNILDVQTTTGECHFENYQRVCALEQQKSAMQTLK--GIVRFLSKTD----
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NP_001 KYNNNT--LLYILHYDID-GPMNCTSDMEINPLRIKISSLQTTEKNDTVAGQGERDHLIT
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NP_001 KRDLALSEGDIHTLGCGVAQCLKIVCQVGRLDRGKSAILYVKSLLWTETFMNKENQNHSY
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pF1KB7 EIRATG------FPEPNPRVIELNKDENVAHVLLEGLHHQRPKRYFTIVIISSSLLLGLI
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NP_001 SLKSSASFNVIEFPYKNLPIEDITNSTLVTTNVTWGI--QPAPMPVPVWVIILAVLAGLL
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NP_001 LLAVLVFVMYRMGFFKR-VRPPQEEQEREQLQPHENGEGNSET
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       .          :.  .: .. ::.:.:. :  :  .::..:.  . :..    :.  . :
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NP_002 WQGQILSATQEQIAESYYPEYLINLVQGQLQTRQASSIYDDSYLGYSVAVGEFSGDDTED
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NP_002 SFCLNASGKHVADSIGFTVELQLDWQKQKGGVRRALFLASRQATLTQTLLIQNGARE-DC
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         .   :...: :  :::. . .:    ..:..::  :. ..: :.    :.:.  :::.
NP_002 QILLD-CGEDNICVPDLQLEV-FG----EQNHVYL--GDKNALNLTFHAQNVGEGGAYEA
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NP_002 ELRVTAPPEAEYSGLVRHPGNFSSLSCDYFAVNQSRLLVCDLGNPMKAGASLWG-GLRFT
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pF1KB7 VSSLSRAEEDLSITVHATCENEEEMDNLKHSRVTVAIPLKYEVKLTVHGFVNPTSFVYGS
       :  :  ... ...  .   .:   ..: . . :.  . .. ....:..:  .: . ..  
NP_002 VPHLRDTKKTIQFDFQILSKN---LNNSQSDVVSFRLSVEAQAQVTLNGVSKPEAVLFPV
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pF1KB7 TTTG-ECHFENYQRVCALEQQKSA----MQTLKGIVRFLSKTDKRLLYCIKADPHCLNFL
        .:: .:  ..     .:: .  .    .:  ..  :  ...  ..: : .:.  :. . 
NP_002 RVTGLNCTTNHPINPKGLELDPEGSLHHQQKREAPSRSSASSGPQILKCPEAE--CFRLR
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pF1KB7 CNFGKMESGKEASV--HIQLEGRPSILEMDETSALKFEIRATGFPEPN---PRVIELNKD
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NP_002 CELGPLHQQESQSLQLHFRVWAKTFLQREHQPFSLQCEAVYKALKMPYRILPRQLP-QKE
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NP_002 KAQLKPPATSDA    
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NP_001 ---------LQDGTKTV--EYAPCRSRQLISDQVAEIVSKYDPN---------VYSIKYN
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       .  :   .  :. :  :::::::..: : ..   . :.:.:.  . .: .::.  : :..
NP_001 NQLA--TRTAQAIFDDSYLGYSVAVGDFNGDGIDDFVSGVPRAARTLGMVYIY--DGKNM
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pF1KB7 NILHEMKGKKLGSYFGASVCAVDLNADGFSDLLVGAPM------QSTIREEGRVFVYINS
       . :... :.....::: :: :.:.:.: ..:...:::.      .. ..: :.: : .. 
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pF1KB7 GSGAVMNAMETNLVGSDKYAARFGESIVNLGDIDNDGFEDVAIGAPQE-DDLQGAIYIYN
       .::   . . :.: : . .: ::: .:. :::.:.:::.:.::.::   .: .: .::.:
NP_001 ASG---DFQTTKLNGFEVFA-RFGSAIAPLGDLDQDGFNDIAIAAPYGGEDKKGIVYIFN
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pF1KB7 GRADGISSTFSQRIEGLQISKSLS-MFGQSISGQIDADNNGYVDVAVGAFRSDSAVLLRT
       ::. :.... :: .::   ..:.   :: :..:  : :.::: :. ::::  : :.: :.
NP_001 GRSTGLNAVPSQILEGQWAARSMPPSFGYSMKGATDIDKNGYPDLIVGAFGVDRAILYRA
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pF1KB7 RPVVIVDASLS-HPESVNRTKFDCVENG--WPSVCIDLTLCFSYKGKEV-PGYIVLFYNM
       :::. :.:.:  .:  .:. .  :   :      :... .:..  :: : :  . .  ..
NP_001 RPVITVNAGLEVYPSILNQDNKTCSLPGTALKVSCFNVRFCLKADGKGVLPRKLNFQVEL
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pF1KB7 SLDVNRKAESPPR-FYFSSNGTSDVITGSIQVSSREANCRTHQAFMR--KDVRDILTPIQ
        ::  ..  .  : ... : . :   . .:. ..   .:.   :..:  .. :: :::: 
NP_001 LLDKLKQKGAIRRALFLYSRSPSHSKNMTISRGGL-MQCEELIAYLRDESEFRDKLTPIT
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pF1KB7 IEAAYHLGPHVISKRSTEEFPPLQPILQQKKEKDIMKKTINFARFCAHEN-CSADLQVSA
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NP_001 IFMEYRL-----DYRTAADTTGLQPILNQFTPANISRQA-HILLDCGEDNVCKPKLEVS-
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pF1KB7 KIGFLKPHENKTYLAVGSMKTLMLNVSLFNAGDDAYETTLHVKLPVGLYFIKILELEEK-
           .   ..: :  .:. . : : :.  : :. :::. : :..:.   :: ... .:  
NP_001 ----VDSDQKKIY--IGDDNPLTLIVKAQNQGEGAYEAELIVSIPLQADFIGVVRNNEAL
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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