Result of FASTA (ccds) for pF1KB7772
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB7772, 505 aa
  1>>>pF1KB7772 505 - 505 aa - 505 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.5735+/-0.000815; mu= 5.3771+/- 0.049
 mean_var=205.9353+/-40.700, 0's: 0 Z-trim(115.3): 66  B-trim: 114 in 1/52
 Lambda= 0.089374
 statistics sampled from 15755 (15821) to 15755 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.792), E-opt: 0.2 (0.486), width:  16
 Scan time:  4.100

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS43969.1 FOXO4 gene_id:4303|Hs108|chrX          ( 505) 3425 453.9 1.9e-127
CCDS55440.1 FOXO4 gene_id:4303|Hs108|chrX          ( 450) 2640 352.6 5.3e-97
CCDS9371.1 FOXO1 gene_id:2308|Hs108|chr13          ( 655)  944 134.1 4.7e-31
CCDS5068.1 FOXO3 gene_id:2309|Hs108|chr6           ( 673)  926 131.8 2.4e-30


>>CCDS43969.1 FOXO4 gene_id:4303|Hs108|chrX               (505 aa)
 initn: 3425 init1: 3425 opt: 3425  Z-score: 2401.4  bits: 453.9 E(32554): 1.9e-127
Smith-Waterman score: 3425; 100.0% identity (100.0% similar) in 505 aa overlap (1-505:1-505)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MDPGNENSATEAAAIIDLDPDFEPQSRPRSCTWPLPRPEIANQPSEPPEVEPDLGEKVHT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 MDPGNENSATEAAAIIDLDPDFEPQSRPRSCTWPLPRPEIANQPSEPPEVEPDLGEKVHT
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB7 EGRSEPILLPSRLPEPAGGPQPGILGAVTGPRKGGSRRNAWGNQSYAELISQAIESAPEK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 EGRSEPILLPSRLPEPAGGPQPGILGAVTGPRKGGSRRNAWGNQSYAELISQAIESAPEK
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB7 RLTLAQIYEWMVRTVPYFKDKGDSNSSAGWKNSIRHNLSLHSKFIKVHNEATGKSSWWML
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 RLTLAQIYEWMVRTVPYFKDKGDSNSSAGWKNSIRHNLSLHSKFIKVHNEATGKSSWWML
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB7 NPEGGKSGKAPRRRAASMDSSSKLLRGRSKAPKKKPSVLPAPPEGATPTSPVGHFAKWSG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 NPEGGKSGKAPRRRAASMDSSSKLLRGRSKAPKKKPSVLPAPPEGATPTSPVGHFAKWSG
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB7 SPCSRNREEADMWTTFRPRSSSNASSVSTRLSPLRPESEVLAEEIPASVSSYAGGVPPTL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SPCSRNREEADMWTTFRPRSSSNASSVSTRLSPLRPESEVLAEEIPASVSSYAGGVPPTL
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB7 NEGLELLDGLNLTSSHSLLSRSGLSGFSLQHPGVTGPLHTYSSSLFSPAEGPLSAGEGCF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 NEGLELLDGLNLTSSHSLLSRSGLSGFSLQHPGVTGPLHTYSSSLFSPAEGPLSAGEGCF
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB7 SSSQALEALLTSDTPPPPADVLMTQVDPILSQAPTLLLLGGLPSSSKLATGVGLCPKPLE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SSSQALEALLTSDTPPPPADVLMTQVDPILSQAPTLLLLGGLPSSSKLATGVGLCPKPLE
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB7 APGPSSLVPTLSMIAPPPVMASAPIPKALGTPVLTPPTEAASQDRMPQDLDLDMYMENLE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 APGPSSLVPTLSMIAPPPVMASAPIPKALGTPVLTPPTEAASQDRMPQDLDLDMYMENLE
              430       440       450       460       470       480

              490       500     
pF1KB7 CDMDNIISDLMDEGEGLDFNFEPDP
       :::::::::::::::::::::::::
CCDS43 CDMDNIISDLMDEGEGLDFNFEPDP
              490       500     

>>CCDS55440.1 FOXO4 gene_id:4303|Hs108|chrX               (450 aa)
 initn: 2640 init1: 2640 opt: 2640  Z-score: 1855.0  bits: 352.6 E(32554): 5.3e-97
Smith-Waterman score: 2925; 89.1% identity (89.1% similar) in 505 aa overlap (1-505:1-450)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MDPGNENSATEAAAIIDLDPDFEPQSRPRSCTWPLPRPEIANQPSEPPEVEPDLGEKVHT
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::   
CCDS55 MDPGNENSATEAAAIIDLDPDFEPQSRPRSCTWPLPRPEIANQPSEPPEVEPDLGEK---
               10        20        30        40        50          

               70        80        90       100       110       120
pF1KB7 EGRSEPILLPSRLPEPAGGPQPGILGAVTGPRKGGSRRNAWGNQSYAELISQAIESAPEK
                                                           ::::::::
CCDS55 ----------------------------------------------------AIESAPEK
                                                            60     

              130       140       150       160       170       180
pF1KB7 RLTLAQIYEWMVRTVPYFKDKGDSNSSAGWKNSIRHNLSLHSKFIKVHNEATGKSSWWML
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 RLTLAQIYEWMVRTVPYFKDKGDSNSSAGWKNSIRHNLSLHSKFIKVHNEATGKSSWWML
          70        80        90       100       110       120     

              190       200       210       220       230       240
pF1KB7 NPEGGKSGKAPRRRAASMDSSSKLLRGRSKAPKKKPSVLPAPPEGATPTSPVGHFAKWSG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 NPEGGKSGKAPRRRAASMDSSSKLLRGRSKAPKKKPSVLPAPPEGATPTSPVGHFAKWSG
         130       140       150       160       170       180     

              250       260       270       280       290       300
pF1KB7 SPCSRNREEADMWTTFRPRSSSNASSVSTRLSPLRPESEVLAEEIPASVSSYAGGVPPTL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 SPCSRNREEADMWTTFRPRSSSNASSVSTRLSPLRPESEVLAEEIPASVSSYAGGVPPTL
         190       200       210       220       230       240     

              310       320       330       340       350       360
pF1KB7 NEGLELLDGLNLTSSHSLLSRSGLSGFSLQHPGVTGPLHTYSSSLFSPAEGPLSAGEGCF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 NEGLELLDGLNLTSSHSLLSRSGLSGFSLQHPGVTGPLHTYSSSLFSPAEGPLSAGEGCF
         250       260       270       280       290       300     

              370       380       390       400       410       420
pF1KB7 SSSQALEALLTSDTPPPPADVLMTQVDPILSQAPTLLLLGGLPSSSKLATGVGLCPKPLE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 SSSQALEALLTSDTPPPPADVLMTQVDPILSQAPTLLLLGGLPSSSKLATGVGLCPKPLE
         310       320       330       340       350       360     

              430       440       450       460       470       480
pF1KB7 APGPSSLVPTLSMIAPPPVMASAPIPKALGTPVLTPPTEAASQDRMPQDLDLDMYMENLE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 APGPSSLVPTLSMIAPPPVMASAPIPKALGTPVLTPPTEAASQDRMPQDLDLDMYMENLE
         370       380       390       400       410       420     

              490       500     
pF1KB7 CDMDNIISDLMDEGEGLDFNFEPDP
       :::::::::::::::::::::::::
CCDS55 CDMDNIISDLMDEGEGLDFNFEPDP
         430       440       450

>>CCDS9371.1 FOXO1 gene_id:2308|Hs108|chr13               (655 aa)
 initn: 1247 init1: 699 opt: 944  Z-score: 671.0  bits: 134.1 E(32554): 4.7e-31
Smith-Waterman score: 1010; 42.4% identity (62.5% similar) in 512 aa overlap (8-477:96-571)

                                      10        20        30       
pF1KB7                        MDPGNENSATEAAAIIDLDPDFEPQSRPRSCTWPLPR
                                     .:. :::   :  ::  :.   .:  : : 
CCDS93 VSADFMSNLSLLEESEDFPQAPGSVAAAVAAAAAAAATGGLCGDF--QGPEAGCLHPAP-
          70        80        90       100       110         120   

        40        50        60        70        80        90       
pF1KB7 PEIANQPSEPPEVEPDLGEKVHTEGRSEPILLPSRLPEPAGGPQPGILGAVTGPRKGGS-
             :. ::   :             :.     .:  :.::  :       :::..: 
CCDS93 ------PQPPP---PG------------PLSQHPPVPPAAAGPLAG------QPRKSSSS
                                 130       140             150     

        100       110       120       130       140       150      
pF1KB7 RRNAWGNQSYAELISQAIESAPEKRLTLAQIYEWMVRTVPYFKDKGDSNSSAGWKNSIRH
       ::::::: :::.::..::::. ::::::.:::::::..::::::::::::::::::::::
CCDS93 RRNAWGNLSYADLITKAIESSAEKRLTLSQIYEWMVKSVPYFKDKGDSNSSAGWKNSIRH
         160       170       180       190       200       210     

        160       170       180       190       200       210      
pF1KB7 NLSLHSKFIKVHNEATGKSSWWMLNPEGGKSGKAPRRRAASMDSSSKLLRGRSKAPKKKP
       :::::::::.:.::.::::::::::::::::::.:::::::::..::. ..::.: ::: 
CCDS93 NLSLHSKFIRVQNEGTGKSSWWMLNPEGGKSGKSPRRRAASMDNNSKFAKSRSRAAKKKA
         220       230       240       250       260       270     

        220       230       240       250       260       270      
pF1KB7 SVLPAPPEGATPTSPVGHFAKWSGSPCSRNREEADMWTTFRPRSSSNASSVSTRLSPLRP
       : : .  :::   :: ..:.:: .:: :.. .. : :.:::::.:::::..: ::::.  
CCDS93 S-LQSGQEGAGD-SPGSQFSKWPASPGSHSNDDFDNWSTFRPRTSSNASTISGRLSPIMT
          280        290       300       310       320       330   

        280             290       300            310       320     
pF1KB7 ESEVLAE-EI-----PASVSSYAGGVPPTLN----EGLE-LLDGLNLTSSHSLLSRSGLS
       :.. :.: ..     : :....:. .:   .    :..: :::.::: :: . :. :  :
CCDS93 EQDDLGEGDVHSMVYPPSAAKMASTLPSLSEISNPENMENLLDNLNLLSSPTSLTVSTQS
           340       350       360       370       380       390   

                          330       340        350       360       
pF1KB7 G------------F-----SLQHPGVTGPLHTYSSSLFSP-AEGPLSAGEGCFSS----S
       .            :     ::. :. .   .::..: .::  . :... .   ::    :
CCDS93 SPGTMMQQTPCYSFAPPNTSLNSPSPNYQKYTYGQSSMSPLPQMPIQTLQDNKSSYGGMS
           400       410       420       430       440       450   

                 370       380       390       400         410     
pF1KB7 QA------LEALLTSDTPPPPADVLMTQVDPILSQAPTLLLLGG--LPSSSKLATGVGLC
       :       :. :::::.::   :. :: ::: ..: :.  .::   . . ... .  :  
CCDS93 QYNCAPGLLKELLTSDSPPH-NDI-MTPVDPGVAQ-PNSRVLGQNVMMGPNSVMSTYGSQ
           460       470         480        490       500       510

         420       430       440       450       460       470     
pF1KB7 PKPLEAPGPSSLVPTLSMIAPPPVMASAPIPKALGTPVLTPPTEAASQDRMPQDLDLDMY
        .  .  .::: .   .      .. . :.:....:   :   .  .: . : .. :   
CCDS93 ASHNKMMNPSSHTHP-GHAQQTSAVNGRPLPHTVSTMPHTSGMNRLTQVKTPVQVPLPHP
              520        530       540       550       560         

         480       490       500                                   
pF1KB7 MENLECDMDNIISDLMDEGEGLDFNFEPDP                              
       :.                                                          
CCDS93 MQMSALGGYSSVSSCNGYGRMGLLHQEKLPSDLDGMFIERLDCDMESIIRNDLMDGDTLD
     570       580       590       600       610       620         

>>CCDS5068.1 FOXO3 gene_id:2309|Hs108|chr6                (673 aa)
 initn: 1263 init1: 740 opt: 926  Z-score: 658.3  bits: 131.8 E(32554): 2.4e-30
Smith-Waterman score: 1057; 43.5% identity (61.9% similar) in 480 aa overlap (25-395:25-498)

               10        20        30        40                  50
pF1KB7 MDPGNENSATEAAAIIDLDPDFEPQSRPRSCTWPLPRPEIANQPSEP----------PEV
                               ::::::::::: :::.  .:..:          :: 
CCDS50 MAEAPASPAPLSPLEVELDPEFEPQSRPRSCTWPLQRPELQASPAKPSGETAADSMIPEE
               10        20        30        40        50        60

                                               60                  
pF1KB7 EPD------------------------LGE--------KVHTEGRSEP------------
       : :                        ::         .: . : ..:            
CCDS50 EDDEDDEDGGGRAGSAMAIGGGGGSGTLGSGLLLEDSARVLAPGGQDPGSGPATAAGGLS
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pF1KB7 ----ILLPSRLPEPAGGPQPGILGAVTGPRKGGSRRNAWGNQSYAELISQAIESAPEKRL
            ::  . : :   ::::  :.   ::: .:::::::: :::.::..::::.:.:::
CCDS50 GGTQALLQPQQPLPP--PQPGAAGGSGQPRKCSSRRNAWGNLSYADLITRAIESSPDKRL
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       ::.:::::::: ::::::::::::::::::::::::::::.:..:.::.:::::::..::
CCDS50 TLSQIYEWMVRCVPYFKDKGDSNSSAGWKNSIRHNLSLHSRFMRVQNEGTGKSSWWIINP
      180       190       200       210       220       230        

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pF1KB7 EGGKSGKAPRRRAASMDSSSKLLRGRSKAPKKKPSVLPAPPEGATPTSPVGHFAKWSGSP
       .::::::::::::.:::.:.:  ..:..: ::: ..: . ::.:   :: ....:: :::
CCDS50 DGGKSGKAPRRRAVSMDNSNKYTKSRGRAAKKK-AALQTAPESADD-SP-SQLSKWPGSP
      240       250       260       270        280         290     

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pF1KB7 CSRNREEADMWTTFRPRSSSNASSVSTRLSPLRPESE---VLAEEIPAS---VSSYAGGV
        ::. .: : :: :: :..::::.:: ::::.   .:   :  .. : :    :: :.  
CCDS50 TSRSSDELDAWTDFRSRTNSNASTVSGRLSPIMASTELDEVQDDDAPLSPMLYSSSASLS
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pF1KB7 P----P---------------TLNEGL------ELLDGLNLTSSH-----SLLSRSGLSG
       :    :               .::.::      .:::...:  :.     .:..::.   
CCDS50 PSVSKPCTVELPRLTDMAGTMNLNDGLTENLMDDLLDNITLPPSQPSPTGGLMQRSSSFP
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pF1KB7 FSLQHPGVTGPLHTYSSSLFSPA------EGPLSAGE----GCFSS-----SQALEALLT
       .. .  :. .:  ...:..:.:.      ..:... .    . :::     .:.:. :::
CCDS50 YTTKGSGLGSPTSSFNSTVFGPSSLNSLRQSPMQTIQENKPATFSSMSHYGNQTLQDLLT
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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