Result of FASTA (omim) for pF1KB6345
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB6345, 265 aa
  1>>>pF1KB6345 265 - 265 aa - 265 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.6812+/-0.000357; mu= 18.2513+/- 0.022
 mean_var=62.3258+/-13.006, 0's: 0 Z-trim(113.3): 42  B-trim: 1240 in 1/54
 Lambda= 0.162458
 statistics sampled from 22517 (22559) to 22517 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.625), E-opt: 0.2 (0.265), width:  16
 Scan time:  6.890

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_001642 (OMIM: 600442) aquaporin-5 [Homo sapiens ( 265) 1702 407.4 1.4e-113
XP_005268895 (OMIM: 600442) PREDICTED: aquaporin-5 ( 222) 1304 314.0 1.5e-85
NP_000477 (OMIM: 107777,125800) aquaporin-2 [Homo  ( 271) 1158 279.9 3.5e-75
NP_001643 (OMIM: 601383) aquaporin-6 [Homo sapiens ( 282)  954 232.1 8.8e-61
NP_036196 (OMIM: 154050,615274) lens fiber major i ( 263)  942 229.2 5.9e-60
NP_004019 (OMIM: 600308) aquaporin-4 isoform M23 [ ( 301)  796 195.1 1.3e-49
XP_011524244 (OMIM: 600308) PREDICTED: aquaporin-4 ( 316)  796 195.1 1.3e-49
NP_001641 (OMIM: 600308) aquaporin-4 isoform M1 [H ( 323)  796 195.1 1.4e-49
NP_001304313 (OMIM: 600308) aquaporin-4 isoform M1 ( 352)  796 195.1 1.5e-49
NP_932766 (OMIM: 107776,110450) aquaporin-1 isofor ( 269)  751 184.5 1.8e-46
NP_001316801 (OMIM: 107776,110450) aquaporin-1 iso ( 323)  747 183.6 3.9e-46
NP_001304316 (OMIM: 600308) aquaporin-4 isoform de ( 296)  576 143.5 4.3e-34
XP_016874795 (OMIM: 154050,615274) PREDICTED: lens ( 144)  459 115.8 4.4e-26
XP_011536656 (OMIM: 154050,615274) PREDICTED: lens ( 168)  459 115.9   5e-26
NP_001160 (OMIM: 603750) aquaporin-8 [Homo sapiens ( 261)  448 113.4 4.2e-25
XP_011544124 (OMIM: 603750) PREDICTED: aquaporin-8 ( 262)  448 113.4 4.2e-25
NP_001307564 (OMIM: 602914) aquaporin-9 isoform 2  ( 193)  217 59.2 6.6e-09
NP_066190 (OMIM: 602914) aquaporin-9 isoform 1 [Ho ( 295)  217 59.3 9.1e-09
NP_001305073 (OMIM: 600170,607457) aquaporin-3 iso ( 237)  214 58.6 1.3e-08
XP_011544125 (OMIM: 603750) PREDICTED: aquaporin-8 ( 148)  210 57.5 1.7e-08
NP_004916 (OMIM: 600170,607457) aquaporin-3 isofor ( 292)  212 58.2   2e-08
XP_016870191 (OMIM: 602974,614411) PREDICTED: aqua ( 250)  166 47.3 3.2e-05
XP_016870192 (OMIM: 602974,614411) PREDICTED: aqua ( 250)  166 47.3 3.2e-05
XP_016870194 (OMIM: 602974,614411) PREDICTED: aqua ( 250)  166 47.3 3.2e-05
XP_016870190 (OMIM: 602974,614411) PREDICTED: aqua ( 250)  166 47.3 3.2e-05
XP_016870193 (OMIM: 602974,614411) PREDICTED: aqua ( 250)  166 47.3 3.2e-05
NP_001307565 (OMIM: 602914) aquaporin-9 isoform 3  ( 230)  164 46.8 4.1e-05
NP_001305086 (OMIM: 602974,614411) aquaporin-7 iso ( 256)  163 46.6 5.3e-05
NP_001305087 (OMIM: 602974,614411) aquaporin-7 iso ( 257)  163 46.6 5.3e-05
XP_016870189 (OMIM: 602974,614411) PREDICTED: aqua ( 341)  163 46.7 6.5e-05
NP_001161 (OMIM: 602974,614411) aquaporin-7 isofor ( 342)  163 46.7 6.6e-05
XP_005251510 (OMIM: 602974,614411) PREDICTED: aqua ( 342)  163 46.7 6.6e-05
XP_011516168 (OMIM: 602974,614411) PREDICTED: aqua ( 342)  163 46.7 6.6e-05
NP_536354 (OMIM: 606578) aquaporin-10 [Homo sapien ( 301)  145 42.5  0.0011
XP_011508406 (OMIM: 606578) PREDICTED: aquaporin-1 ( 302)  133 39.7  0.0078


>>NP_001642 (OMIM: 600442) aquaporin-5 [Homo sapiens]     (265 aa)
 initn: 1702 init1: 1702 opt: 1702  Z-score: 2160.1  bits: 407.4 E(85289): 1.4e-113
Smith-Waterman score: 1702; 100.0% identity (100.0% similar) in 265 aa overlap (1-265:1-265)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB6 MKKEVCSVAFLKAVFAEFLATLIFVFFGLGSALKWPSALPTILQIALAFGLAIGTLAQAL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MKKEVCSVAFLKAVFAEFLATLIFVFFGLGSALKWPSALPTILQIALAFGLAIGTLAQAL
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB6 GPVSGGHINPAITLALLVGNQISLLRAFFYVAAQLVGAIAGAGILYGVAPLNARGNLAVN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GPVSGGHINPAITLALLVGNQISLLRAFFYVAAQLVGAIAGAGILYGVAPLNARGNLAVN
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB6 ALNNNTTQGQAMVVELILTFQLALCIFASTDSRRTSPVGSPALSIGLSVTLGHLVGIYFT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ALNNNTTQGQAMVVELILTFQLALCIFASTDSRRTSPVGSPALSIGLSVTLGHLVGIYFT
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB6 GCSMNPARSFGPAVVMNRFSPAHWVFWVGPIVGAVLAAILYFYLLFPNSLSLSERVAIIK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GCSMNPARSFGPAVVMNRFSPAHWVFWVGPIVGAVLAAILYFYLLFPNSLSLSERVAIIK
              190       200       210       220       230       240

              250       260     
pF1KB6 GTYEPDEDWEEQREERKKTMELTTR
       :::::::::::::::::::::::::
NP_001 GTYEPDEDWEEQREERKKTMELTTR
              250       260     

>>XP_005268895 (OMIM: 600442) PREDICTED: aquaporin-5 iso  (222 aa)
 initn: 1304 init1: 1304 opt: 1304  Z-score: 1657.0  bits: 314.0 E(85289): 1.5e-85
Smith-Waterman score: 1304; 100.0% identity (100.0% similar) in 204 aa overlap (1-204:1-204)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB6 MKKEVCSVAFLKAVFAEFLATLIFVFFGLGSALKWPSALPTILQIALAFGLAIGTLAQAL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MKKEVCSVAFLKAVFAEFLATLIFVFFGLGSALKWPSALPTILQIALAFGLAIGTLAQAL
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB6 GPVSGGHINPAITLALLVGNQISLLRAFFYVAAQLVGAIAGAGILYGVAPLNARGNLAVN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 GPVSGGHINPAITLALLVGNQISLLRAFFYVAAQLVGAIAGAGILYGVAPLNARGNLAVN
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB6 ALNNNTTQGQAMVVELILTFQLALCIFASTDSRRTSPVGSPALSIGLSVTLGHLVGIYFT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 ALNNNTTQGQAMVVELILTFQLALCIFASTDSRRTSPVGSPALSIGLSVTLGHLVGIYFT
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB6 GCSMNPARSFGPAVVMNRFSPAHWVFWVGPIVGAVLAAILYFYLLFPNSLSLSERVAIIK
       ::::::::::::::::::::::::                                    
XP_005 GCSMNPARSFGPAVVMNRFSPAHWGLLLSLRGGDTRSVHPSL                  
              190       200       210       220                    

>>NP_000477 (OMIM: 107777,125800) aquaporin-2 [Homo sapi  (271 aa)
 initn: 1170 init1: 892 opt: 1158  Z-score: 1470.8  bits: 279.9 E(85289): 3.5e-75
Smith-Waterman score: 1158; 66.0% identity (90.3% similar) in 259 aa overlap (4-262:3-259)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB6 MKKEVCSVAFLKAVFAEFLATLIFVFFGLGSALKWPSALPTILQIALAFGLAIGTLAQAL
          :. :.:: .::::::::::.::::::::::.::.:::..::::.::::.::::.:::
NP_000  MWELRSIAFSRAVFAEFLATLLFVFFGLGSALNWPQALPSVLQIAMAFGLGIGTLVQAL
                10        20        30        40        50         

               70        80        90       100       110       120
pF1KB6 GPVSGGHINPAITLALLVGNQISLLRAFFYVAAQLVGAIAGAGILYGVAPLNARGNLAVN
       : .::.:::::.:.: ::: ..:.::: :::::::.::.:::..:. ..: . ::.::::
NP_000 GHISGAHINPAVTVACLVGCHVSVLRAAFYVAAQLLGAVAGAALLHEITPADIRGDLAVN
      60        70        80        90       100       110         

              130       140       150       160       170       180
pF1KB6 ALNNNTTQGQAMVVELILTFQLALCIFASTDSRRTSPVGSPALSIGLSVTLGHLVGIYFT
       ::.:.:: :::..:::.::.::.:::::::: ::    :.::::::.::.::::.::..:
NP_000 ALSNSTTAGQAVTVELFLTLQLVLCIFASTDERRGENPGTPALSIGFSVALGHLLGIHYT
     120       130       140       150       160       170         

              190       200       210       220       230       240
pF1KB6 GCSMNPARSFGPAVVMNRFSPAHWVFWVGPIVGAVLAAILYFYLLFPNSLSLSERVAIIK
       :::::::::..:::: ..:.  :::::.::.:::.:...:: :.::: . :::::.:..:
NP_000 GCSMNPARSLAPAVVTGKFDD-HWVFWIGPLVGAILGSLLYNYVLFPPAKSLSERLAVLK
     180       190       200        210       220       230        

              250       260              
pF1KB6 GTYEPDEDWEEQREERKKTMELTTR         
       :  ::: ::::.. .:....::            
NP_000 GL-EPDTDWEEREVRRRQSVELHSPQSLPRGTKA
      240        250       260       270 

>>NP_001643 (OMIM: 601383) aquaporin-6 [Homo sapiens]     (282 aa)
 initn: 955 init1: 564 opt: 954  Z-score: 1212.2  bits: 232.1 E(85289): 8.8e-61
Smith-Waterman score: 954; 58.5% identity (88.1% similar) in 236 aa overlap (9-244:22-254)

                            10        20        30        40       
pF1KB6              MKKEVCSVAFLKAVFAEFLATLIFVFFGLGSALKWPSALPTILQIAL
                            :. .:.::::::: ..::::.::...::.:::..::::.
NP_001 MDAVEPGGRGWASMLACRLWKAISRALFAEFLATGLYVFFGVGSVMRWPTALPSVLQIAI
               10        20        30        40        50        60

        50        60        70        80        90       100       
pF1KB6 AFGLAIGTLAQALGPVSGGHINPAITLALLVGNQISLLRAFFYVAAQLVGAIAGAGILYG
       .:.:. .  .:.   .::.: :::.:::.:::..::: ::  ::::::::: .::..:::
NP_001 TFNLVTAMAVQVTWKASGAHANPAVTLAFLVGSHISLPRAVAYVAAQLVGATVGAALLYG
               70        80        90       100       110       120

       110       120       130       140       150       160       
pF1KB6 VAPLNARGNLAVNALNNNTTQGQAMVVELILTFQLALCIFASTDSRRTSPVGSPALSIGL
       : : . : .:..:.. :... :::..:::.::.::.::.:::::::.::  ::::  ::.
NP_001 VMPGDIRETLGINVVRNSVSTGQAVAVELLLTLQLVLCVFASTDSRQTS--GSPATMIGI
              130       140       150       160         170        

       170       180       190       200       210       220       
pF1KB6 SVTLGHLVGIYFTGCSMNPARSFGPAVVMNRFSPAHWVFWVGPIVGAVLAAILYFYLLFP
       ::.::::.::.:::::::::::::::.....:. .::::::::..::.::...: ..:::
NP_001 SVALGHLIGIHFTGCSMNPARSFGPAIIIGKFT-VHWVFWVGPLMGALLASLIYNFVLFP
      180       190       200       210        220       230       

       230       240       250       260            
pF1KB6 NSLSLSERVAIIKGTYEPDEDWEEQREERKKTMELTTR       
       .. .:..:.::. :: :                            
NP_001 DTKTLAQRLAILTGTVEVGTGAGAGAEPLKKESQPGSGAVEMESV
       240       250       260       270       280  

>>NP_036196 (OMIM: 154050,615274) lens fiber major intri  (263 aa)
 initn: 949 init1: 744 opt: 942  Z-score: 1197.4  bits: 229.2 E(85289): 5.9e-60
Smith-Waterman score: 942; 54.0% identity (85.6% similar) in 263 aa overlap (4-265:3-261)

               10        20        30         40        50         
pF1KB6 MKKEVCSVAFLKAVFAEFLATLIFVFFGLGSALKW-PSALPTILQIALAFGLAIGTLAQA
          :. :..: .:.::::.:::..:::::::.:.: :. :  .::.:.:::::..::.:.
NP_036  MWELRSASFWRAIFAEFFATLFYVFFGLGSSLRWAPGPLH-VLQVAMAFGLALATLVQS
                10        20        30        40         50        

      60        70        80        90       100       110         
pF1KB6 LGPVSGGHINPAITLALLVGNQISLLRAFFYVAAQLVGAIAGAGILYGVAPLNARGNLAV
       .: .::.:.:::.:.:.:::.:.:::::: :.::::.::.:::..::.:.:  .:::::.
NP_036 VGHISGAHVNPAVTFAFLVGSQMSLLRAFCYMAAQLLGAVAGAAVLYSVTPPAVRGNLAL
       60        70        80        90       100       110        

     120       130       140       150       160       170         
pF1KB6 NALNNNTTQGQAMVVELILTFQLALCIFASTDSRRTSPVGSPALSIGLSVTLGHLVGIYF
       :.:.  .. ::: .::..::.:..:::::. : ::.. .:: ::..:.:..:::: :.:.
NP_036 NTLHPAVSVGQATTVEIFLTLQFVLCIFATYDERRNGQLGSVALAVGFSLALGHLFGMYY
      120       130       140       150       160       170        

     180       190       200       210       220       230         
pF1KB6 TGCSMNPARSFGPAVVMNRFSPAHWVFWVGPIVGAVLAAILYFYLLFPNSLSLSERVAII
       :: .:::::::.::.. . :.  :::.:::::.:. :...:: .::::   :.:::....
NP_036 TGAGMNPARSFAPAILTGNFT-NHWVYWVGPIIGGGLGSLLYDFLLFPRLKSISERLSVL
      180       190        200       210       220       230       

     240       250       260       
pF1KB6 KGTYEPDEDWEEQREERKKTMELTTR  
       ::. .:: . . : :   . .::.:.  
NP_036 KGA-KPDVS-NGQPEVTGEPVELNTQAL
       240         250       260   

>>NP_004019 (OMIM: 600308) aquaporin-4 isoform M23 [Homo  (301 aa)
 initn: 806 init1: 555 opt: 796  Z-score: 1011.7  bits: 195.1 E(85289): 1.3e-49
Smith-Waterman score: 796; 50.2% identity (77.2% similar) in 263 aa overlap (3-254:5-266)

                 10        20        30           40         50    
pF1KB6   MKKEVCSVAFLKAVFAEFLATLIFVFFGLGSALKWPSA---LPT-ILQIALAFGLAIG
           : : . :: ::: ::::: ::::...:::...: ..   ::. .. :.: :::.:.
NP_004 MVAFKGVWTQAFWKAVTAEFLAMLIFVLLSLGSTINWGGTEKPLPVDMVLISLCFGLSIA
               10        20        30        40        50        60

           60        70        80        90       100       110    
pF1KB6 TLAQALGPVSGGHINPAITLALLVGNQISLLRAFFYVAAQLVGAIAGAGILYGVAPLNAR
       :..: .: .::::::::.:.:..   .::. .. ::.::: .::: :::::: :.: .. 
NP_004 TMVQCFGHISGGHINPAVTVAMVCTRKISIAKSVFYIAAQCLGAIIGAGILYLVTPPSVV
               70        80        90       100       110       120

          120       130       140       150       160       170    
pF1KB6 GNLAVNALNNNTTQGQAMVVELILTFQLALCIFASTDSRRTSPVGSPALSIGLSVTLGHL
       :.:.:. ...: : :....::::.::::.. :::: ::.::. .:: ::.::.::..:::
NP_004 GGLGVTMVHGNLTAGHGLLVELIITFQLVFTIFASCDSKRTDVTGSIALAIGFSVAIGHL
              130       140       150       160       170       180

          180       190       200       210       220              
pF1KB6 VGIYFTGCSMNPARSFGPAVVMNRFSPAHWVFWVGPIVGAVLAAILYFYLLFPN------
        .: .:: ::::::::::::.:. .   ::..:::::.:::::. :: :.. :.      
NP_004 FAINYTGASMNPARSFGPAVIMGNWE-NHWIYWVGPIIGAVLAGGLYEYVFCPDVEFKRR
              190       200        210       220       230         

       230       240       250       260                           
pF1KB6 -SLSLSERVAIIKGTYEPDEDWEEQREERKKTMELTTR                      
        . ..:. .   ::.:   :: . : :                                 
NP_004 FKEAFSKAAQQTKGSYMEVEDNRSQVETDDLILKPGVVHVIDVDRGEEKKGKDQSGEVLS
     240       250       260       270       280       290         

>>XP_011524244 (OMIM: 600308) PREDICTED: aquaporin-4 iso  (316 aa)
 initn: 806 init1: 555 opt: 796  Z-score: 1011.4  bits: 195.1 E(85289): 1.3e-49
Smith-Waterman score: 796; 50.2% identity (77.2% similar) in 263 aa overlap (3-254:20-281)

                                10        20        30           40
pF1KB6                  MKKEVCSVAFLKAVFAEFLATLIFVFFGLGSALKWPSA---LP
                          : : . :: ::: ::::: ::::...:::...: ..   ::
XP_011 MFEIKCGPLCTRENIMVAFKGVWTQAFWKAVTAEFLAMLIFVLLSLGSTINWGGTEKPLP
               10        20        30        40        50        60

                50        60        70        80        90         
pF1KB6 T-ILQIALAFGLAIGTLAQALGPVSGGHINPAITLALLVGNQISLLRAFFYVAAQLVGAI
       . .. :.: :::.:.:..: .: .::::::::.:.:..   .::. .. ::.::: .:::
XP_011 VDMVLISLCFGLSIATMVQCFGHISGGHINPAVTVAMVCTRKISIAKSVFYIAAQCLGAI
               70        80        90       100       110       120

     100       110       120       130       140       150         
pF1KB6 AGAGILYGVAPLNARGNLAVNALNNNTTQGQAMVVELILTFQLALCIFASTDSRRTSPVG
        :::::: :.: .. :.:.:. ...: : :....::::.::::.. :::: ::.::. .:
XP_011 IGAGILYLVTPPSVVGGLGVTMVHGNLTAGHGLLVELIITFQLVFTIFASCDSKRTDVTG
              130       140       150       160       170       180

     160       170       180       190       200       210         
pF1KB6 SPALSIGLSVTLGHLVGIYFTGCSMNPARSFGPAVVMNRFSPAHWVFWVGPIVGAVLAAI
       : ::.::.::..::: .: .:: ::::::::::::.:. .   ::..:::::.:::::. 
XP_011 SIALAIGFSVAIGHLFAINYTGASMNPARSFGPAVIMGNWE-NHWIYWVGPIIGAVLAGG
              190       200       210       220        230         

     220              230       240       250       260            
pF1KB6 LYFYLLFPN-------SLSLSERVAIIKGTYEPDEDWEEQREERKKTMELTTR       
       :: :.. :.       . ..:. .   ::.:   :: . : :                  
XP_011 LYEYVFCPDVEFKRRFKEAFSKAAQQTKGSYMEVEDNRSQVETDDLILKPGVVHVIDVDR
     240       250       260       270       280       290         

XP_011 GEEKKGKDQSGEVLSSV
     300       310      

>>NP_001641 (OMIM: 600308) aquaporin-4 isoform M1 [Homo   (323 aa)
 initn: 806 init1: 555 opt: 796  Z-score: 1011.3  bits: 195.1 E(85289): 1.4e-49
Smith-Waterman score: 796; 50.2% identity (77.2% similar) in 263 aa overlap (3-254:27-288)

                                       10        20        30      
pF1KB6                         MKKEVCSVAFLKAVFAEFLATLIFVFFGLGSALKWP
                                 : : . :: ::: ::::: ::::...:::...: 
NP_001 MSDRPTARRWGKCGPLCTRENIMVAFKGVWTQAFWKAVTAEFLAMLIFVLLSLGSTINWG
               10        20        30        40        50        60

            40         50        60        70        80        90  
pF1KB6 SA---LPT-ILQIALAFGLAIGTLAQALGPVSGGHINPAITLALLVGNQISLLRAFFYVA
       ..   ::. .. :.: :::.:.:..: .: .::::::::.:.:..   .::. .. ::.:
NP_001 GTEKPLPVDMVLISLCFGLSIATMVQCFGHISGGHINPAVTVAMVCTRKISIAKSVFYIA
               70        80        90       100       110       120

            100       110       120       130       140       150  
pF1KB6 AQLVGAIAGAGILYGVAPLNARGNLAVNALNNNTTQGQAMVVELILTFQLALCIFASTDS
       :: .::: :::::: :.: .. :.:.:. ...: : :....::::.::::.. :::: ::
NP_001 AQCLGAIIGAGILYLVTPPSVVGGLGVTMVHGNLTAGHGLLVELIITFQLVFTIFASCDS
              130       140       150       160       170       180

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pF1KB6 RRTSPVGSPALSIGLSVTLGHLVGIYFTGCSMNPARSFGPAVVMNRFSPAHWVFWVGPIV
       .::. .:: ::.::.::..::: .: .:: ::::::::::::.:. .   ::..:::::.
NP_001 KRTDVTGSIALAIGFSVAIGHLFAINYTGASMNPARSFGPAVIMGNWE-NHWIYWVGPII
              190       200       210       220        230         

            220              230       240       250       260     
pF1KB6 GAVLAAILYFYLLFPN-------SLSLSERVAIIKGTYEPDEDWEEQREERKKTMELTTR
       :::::. :: :.. :.       . ..:. .   ::.:   :: . : :           
NP_001 GAVLAGGLYEYVFCPDVEFKRRFKEAFSKAAQQTKGSYMEVEDNRSQVETDDLILKPGVV
     240       250       260       270       280       290         

NP_001 HVIDVDRGEEKKGKDQSGEVLSSV
     300       310       320   

>>NP_001304313 (OMIM: 600308) aquaporin-4 isoform M1x [H  (352 aa)
 initn: 806 init1: 555 opt: 796  Z-score: 1010.8  bits: 195.1 E(85289): 1.5e-49
Smith-Waterman score: 796; 50.2% identity (77.2% similar) in 263 aa overlap (3-254:27-288)

                                       10        20        30      
pF1KB6                         MKKEVCSVAFLKAVFAEFLATLIFVFFGLGSALKWP
                                 : : . :: ::: ::::: ::::...:::...: 
NP_001 MSDRPTARRWGKCGPLCTRENIMVAFKGVWTQAFWKAVTAEFLAMLIFVLLSLGSTINWG
               10        20        30        40        50        60

            40         50        60        70        80        90  
pF1KB6 SA---LPT-ILQIALAFGLAIGTLAQALGPVSGGHINPAITLALLVGNQISLLRAFFYVA
       ..   ::. .. :.: :::.:.:..: .: .::::::::.:.:..   .::. .. ::.:
NP_001 GTEKPLPVDMVLISLCFGLSIATMVQCFGHISGGHINPAVTVAMVCTRKISIAKSVFYIA
               70        80        90       100       110       120

            100       110       120       130       140       150  
pF1KB6 AQLVGAIAGAGILYGVAPLNARGNLAVNALNNNTTQGQAMVVELILTFQLALCIFASTDS
       :: .::: :::::: :.: .. :.:.:. ...: : :....::::.::::.. :::: ::
NP_001 AQCLGAIIGAGILYLVTPPSVVGGLGVTMVHGNLTAGHGLLVELIITFQLVFTIFASCDS
              130       140       150       160       170       180

            160       170       180       190       200       210  
pF1KB6 RRTSPVGSPALSIGLSVTLGHLVGIYFTGCSMNPARSFGPAVVMNRFSPAHWVFWVGPIV
       .::. .:: ::.::.::..::: .: .:: ::::::::::::.:. .   ::..:::::.
NP_001 KRTDVTGSIALAIGFSVAIGHLFAINYTGASMNPARSFGPAVIMGNWE-NHWIYWVGPII
              190       200       210       220        230         

            220              230       240       250       260     
pF1KB6 GAVLAAILYFYLLFPN-------SLSLSERVAIIKGTYEPDEDWEEQREERKKTMELTTR
       :::::. :: :.. :.       . ..:. .   ::.:   :: . : :           
NP_001 GAVLAGGLYEYVFCPDVEFKRRFKEAFSKAAQQTKGSYMEVEDNRSQVETDDLILKPGVV
     240       250       260       270       280       290         

NP_001 HVIDVDRGEEKKGKDQSGEVLSSVXLEDRTESRQDSLELSSDFLPPIKETDLL
     300       310       320       330       340       350  

>>NP_932766 (OMIM: 107776,110450) aquaporin-1 isoform 1   (269 aa)
 initn: 742 init1: 524 opt: 751  Z-score: 955.4  bits: 184.5 E(85289): 1.8e-46
Smith-Waterman score: 751; 46.6% identity (77.2% similar) in 268 aa overlap (1-257:1-267)

               10        20        30               40        50   
pF1KB6 MKKEVCSVAFLKAVFAEFLATLIFVFFGLGSAL--KWP-----SALPTILQIALAFGLAI
       : .:  .  : .:: :::::: .:::...::::  :.:     .:.   ....:::::.:
NP_932 MASEFKKKLFWRAVVAEFLATTLFVFISIGSALGFKYPVGNNQTAVQDNVKVSLAFGLSI
               10        20        30        40        50        60

            60        70        80        90       100       110   
pF1KB6 GTLAQALGPVSGGHINPAITLALLVGNQISLLRAFFYVAAQLVGAIAGAGILYGVAPLNA
       .::::..: .::.:.:::.::.::.. :::..::..:. :: ::::....:: :..   .
NP_932 ATLAQSVGHISGAHLNPAVTLGLLLSCQISIFRALMYIIAQCVGAIVATAILSGITSSLT
               70        80        90       100       110       120

           120       130       140       150       160       170   
pF1KB6 RGNLAVNALNNNTTQGQAMVVELILTFQLALCIFASTDSRRTSPVGSPALSIGLSVTLGH
        ..:. : : .....::.. .:.: :.::.::..:.:: :: .  ::  :.:::::.:::
NP_932 GNSLGRNDLADGVNSGQGLGIEIIGTLQLVLCVLATTDRRRRDLGGSAPLAIGLSVALGH
              130       140       150       160       170       180

           180       190       200       210       220       230   
pF1KB6 LVGIYFTGCSMNPARSFGPAVVMNRFSPAHWVFWVGPIVGAVLAAILYFYLLFPNSLSLS
       :..: .:::..::::::: ::. . ::  ::.:::::..:..::...: ..: : : .:.
NP_932 LLAIDYTGCGINPARSFGSAVITHNFS-NHWIFWVGPFIGGALAVLIYDFILAPRSSDLT
              190       200        210       220       230         

            240          250       260     
pF1KB6 ERVAI-IKGT---YEPDEDWEEQREERKKTMELTTR
       .:: .  .:    :. : :  ..: : :        
NP_932 DRVKVWTSGQVEEYDLDADDINSRVEMKPK      
     240       250       260               




265 residues in 1 query   sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Fri Nov  4 22:46:49 2016 done: Fri Nov  4 22:46:50 2016
 Total Scan time:  6.890 Total Display time:  0.000

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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