Result of FASTA (ccds) for pF1KB6345
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB6345, 265 aa
  1>>>pF1KB6345 265 - 265 aa - 265 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2342+/-0.000813; mu= 15.2712+/- 0.049
 mean_var=63.5840+/-12.942, 0's: 0 Z-trim(106.7): 26  B-trim: 0 in 0/51
 Lambda= 0.160842
 statistics sampled from 9117 (9140) to 9117 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.648), E-opt: 0.2 (0.281), width:  16
 Scan time:  2.220

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS8793.1 AQP5 gene_id:362|Hs108|chr12            ( 265) 1702 403.4 8.5e-113
CCDS8792.1 AQP2 gene_id:359|Hs108|chr12            ( 271) 1158 277.2 8.6e-75
CCDS31798.1 AQP6 gene_id:363|Hs108|chr12           ( 282)  954 229.8 1.6e-60
CCDS8919.1 MIP gene_id:4284|Hs108|chr12            ( 263)  942 227.0   1e-59
CCDS58617.1 AQP4 gene_id:361|Hs108|chr18           ( 301)  796 193.2 1.8e-49
CCDS11889.1 AQP4 gene_id:361|Hs108|chr18           ( 323)  796 193.2 1.9e-49
CCDS5431.1 AQP1 gene_id:358|Hs108|chr7             ( 269)  751 182.7 2.3e-46
CCDS82244.1 AQP4 gene_id:361|Hs108|chr18           ( 296)  576 142.1 4.2e-34
CCDS10626.1 AQP8 gene_id:343|Hs108|chr16           ( 261)  448 112.4 3.3e-25
CCDS55098.1 AQP1 gene_id:358|Hs108|chr7            ( 186)  421 106.1 1.9e-23
CCDS55097.1 AQP1 gene_id:358|Hs108|chr7            ( 218)  421 106.1 2.2e-23
CCDS55096.1 AQP1 gene_id:358|Hs108|chr7            ( 154)  419 105.5 2.2e-23


>>CCDS8793.1 AQP5 gene_id:362|Hs108|chr12                 (265 aa)
 initn: 1702 init1: 1702 opt: 1702  Z-score: 2138.6  bits: 403.4 E(32554): 8.5e-113
Smith-Waterman score: 1702; 100.0% identity (100.0% similar) in 265 aa overlap (1-265:1-265)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB6 MKKEVCSVAFLKAVFAEFLATLIFVFFGLGSALKWPSALPTILQIALAFGLAIGTLAQAL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 MKKEVCSVAFLKAVFAEFLATLIFVFFGLGSALKWPSALPTILQIALAFGLAIGTLAQAL
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB6 GPVSGGHINPAITLALLVGNQISLLRAFFYVAAQLVGAIAGAGILYGVAPLNARGNLAVN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 GPVSGGHINPAITLALLVGNQISLLRAFFYVAAQLVGAIAGAGILYGVAPLNARGNLAVN
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB6 ALNNNTTQGQAMVVELILTFQLALCIFASTDSRRTSPVGSPALSIGLSVTLGHLVGIYFT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 ALNNNTTQGQAMVVELILTFQLALCIFASTDSRRTSPVGSPALSIGLSVTLGHLVGIYFT
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB6 GCSMNPARSFGPAVVMNRFSPAHWVFWVGPIVGAVLAAILYFYLLFPNSLSLSERVAIIK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 GCSMNPARSFGPAVVMNRFSPAHWVFWVGPIVGAVLAAILYFYLLFPNSLSLSERVAIIK
              190       200       210       220       230       240

              250       260     
pF1KB6 GTYEPDEDWEEQREERKKTMELTTR
       :::::::::::::::::::::::::
CCDS87 GTYEPDEDWEEQREERKKTMELTTR
              250       260     

>>CCDS8792.1 AQP2 gene_id:359|Hs108|chr12                 (271 aa)
 initn: 1170 init1: 892 opt: 1158  Z-score: 1456.2  bits: 277.2 E(32554): 8.6e-75
Smith-Waterman score: 1158; 66.0% identity (90.3% similar) in 259 aa overlap (4-262:3-259)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB6 MKKEVCSVAFLKAVFAEFLATLIFVFFGLGSALKWPSALPTILQIALAFGLAIGTLAQAL
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CCDS87  MWELRSIAFSRAVFAEFLATLLFVFFGLGSALNWPQALPSVLQIAMAFGLGIGTLVQAL
                10        20        30        40        50         

               70        80        90       100       110       120
pF1KB6 GPVSGGHINPAITLALLVGNQISLLRAFFYVAAQLVGAIAGAGILYGVAPLNARGNLAVN
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CCDS87 GHISGAHINPAVTVACLVGCHVSVLRAAFYVAAQLLGAVAGAALLHEITPADIRGDLAVN
      60        70        80        90       100       110         

              130       140       150       160       170       180
pF1KB6 ALNNNTTQGQAMVVELILTFQLALCIFASTDSRRTSPVGSPALSIGLSVTLGHLVGIYFT
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CCDS87 ALSNSTTAGQAVTVELFLTLQLVLCIFASTDERRGENPGTPALSIGFSVALGHLLGIHYT
     120       130       140       150       160       170         

              190       200       210       220       230       240
pF1KB6 GCSMNPARSFGPAVVMNRFSPAHWVFWVGPIVGAVLAAILYFYLLFPNSLSLSERVAIIK
       :::::::::..:::: ..:.  :::::.::.:::.:...:: :.::: . :::::.:..:
CCDS87 GCSMNPARSLAPAVVTGKFDD-HWVFWIGPLVGAILGSLLYNYVLFPPAKSLSERLAVLK
     180       190       200        210       220       230        

              250       260              
pF1KB6 GTYEPDEDWEEQREERKKTMELTTR         
       :  ::: ::::.. .:....::            
CCDS87 GL-EPDTDWEEREVRRRQSVELHSPQSLPRGTKA
      240        250       260       270 

>>CCDS31798.1 AQP6 gene_id:363|Hs108|chr12                (282 aa)
 initn: 955 init1: 564 opt: 954  Z-score: 1200.1  bits: 229.8 E(32554): 1.6e-60
Smith-Waterman score: 954; 58.5% identity (88.1% similar) in 236 aa overlap (9-244:22-254)

                            10        20        30        40       
pF1KB6              MKKEVCSVAFLKAVFAEFLATLIFVFFGLGSALKWPSALPTILQIAL
                            :. .:.::::::: ..::::.::...::.:::..::::.
CCDS31 MDAVEPGGRGWASMLACRLWKAISRALFAEFLATGLYVFFGVGSVMRWPTALPSVLQIAI
               10        20        30        40        50        60

        50        60        70        80        90       100       
pF1KB6 AFGLAIGTLAQALGPVSGGHINPAITLALLVGNQISLLRAFFYVAAQLVGAIAGAGILYG
       .:.:. .  .:.   .::.: :::.:::.:::..::: ::  ::::::::: .::..:::
CCDS31 TFNLVTAMAVQVTWKASGAHANPAVTLAFLVGSHISLPRAVAYVAAQLVGATVGAALLYG
               70        80        90       100       110       120

       110       120       130       140       150       160       
pF1KB6 VAPLNARGNLAVNALNNNTTQGQAMVVELILTFQLALCIFASTDSRRTSPVGSPALSIGL
       : : . : .:..:.. :... :::..:::.::.::.::.:::::::.::  ::::  ::.
CCDS31 VMPGDIRETLGINVVRNSVSTGQAVAVELLLTLQLVLCVFASTDSRQTS--GSPATMIGI
              130       140       150       160         170        

       170       180       190       200       210       220       
pF1KB6 SVTLGHLVGIYFTGCSMNPARSFGPAVVMNRFSPAHWVFWVGPIVGAVLAAILYFYLLFP
       ::.::::.::.:::::::::::::::.....:. .::::::::..::.::...: ..:::
CCDS31 SVALGHLIGIHFTGCSMNPARSFGPAIIIGKFT-VHWVFWVGPLMGALLASLIYNFVLFP
      180       190       200       210        220       230       

       230       240       250       260            
pF1KB6 NSLSLSERVAIIKGTYEPDEDWEEQREERKKTMELTTR       
       .. .:..:.::. :: :                            
CCDS31 DTKTLAQRLAILTGTVEVGTGAGAGAEPLKKESQPGSGAVEMESV
       240       250       260       270       280  

>>CCDS8919.1 MIP gene_id:4284|Hs108|chr12                 (263 aa)
 initn: 949 init1: 744 opt: 942  Z-score: 1185.5  bits: 227.0 E(32554): 1e-59
Smith-Waterman score: 942; 54.0% identity (85.6% similar) in 263 aa overlap (4-265:3-261)

               10        20        30         40        50         
pF1KB6 MKKEVCSVAFLKAVFAEFLATLIFVFFGLGSALKW-PSALPTILQIALAFGLAIGTLAQA
          :. :..: .:.::::.:::..:::::::.:.: :. :  .::.:.:::::..::.:.
CCDS89  MWELRSASFWRAIFAEFFATLFYVFFGLGSSLRWAPGPLH-VLQVAMAFGLALATLVQS
                10        20        30        40         50        

      60        70        80        90       100       110         
pF1KB6 LGPVSGGHINPAITLALLVGNQISLLRAFFYVAAQLVGAIAGAGILYGVAPLNARGNLAV
       .: .::.:.:::.:.:.:::.:.:::::: :.::::.::.:::..::.:.:  .:::::.
CCDS89 VGHISGAHVNPAVTFAFLVGSQMSLLRAFCYMAAQLLGAVAGAAVLYSVTPPAVRGNLAL
       60        70        80        90       100       110        

     120       130       140       150       160       170         
pF1KB6 NALNNNTTQGQAMVVELILTFQLALCIFASTDSRRTSPVGSPALSIGLSVTLGHLVGIYF
       :.:.  .. ::: .::..::.:..:::::. : ::.. .:: ::..:.:..:::: :.:.
CCDS89 NTLHPAVSVGQATTVEIFLTLQFVLCIFATYDERRNGQLGSVALAVGFSLALGHLFGMYY
      120       130       140       150       160       170        

     180       190       200       210       220       230         
pF1KB6 TGCSMNPARSFGPAVVMNRFSPAHWVFWVGPIVGAVLAAILYFYLLFPNSLSLSERVAII
       :: .:::::::.::.. . :.  :::.:::::.:. :...:: .::::   :.:::....
CCDS89 TGAGMNPARSFAPAILTGNFT-NHWVYWVGPIIGGGLGSLLYDFLLFPRLKSISERLSVL
      180       190        200       210       220       230       

     240       250       260       
pF1KB6 KGTYEPDEDWEEQREERKKTMELTTR  
       ::. .:: . . : :   . .::.:.  
CCDS89 KGA-KPDVS-NGQPEVTGEPVELNTQAL
       240         250       260   

>>CCDS58617.1 AQP4 gene_id:361|Hs108|chr18                (301 aa)
 initn: 806 init1: 555 opt: 796  Z-score: 1001.5  bits: 193.2 E(32554): 1.8e-49
Smith-Waterman score: 796; 50.2% identity (77.2% similar) in 263 aa overlap (3-254:5-266)

                 10        20        30           40         50    
pF1KB6   MKKEVCSVAFLKAVFAEFLATLIFVFFGLGSALKWPSA---LPT-ILQIALAFGLAIG
           : : . :: ::: ::::: ::::...:::...: ..   ::. .. :.: :::.:.
CCDS58 MVAFKGVWTQAFWKAVTAEFLAMLIFVLLSLGSTINWGGTEKPLPVDMVLISLCFGLSIA
               10        20        30        40        50        60

           60        70        80        90       100       110    
pF1KB6 TLAQALGPVSGGHINPAITLALLVGNQISLLRAFFYVAAQLVGAIAGAGILYGVAPLNAR
       :..: .: .::::::::.:.:..   .::. .. ::.::: .::: :::::: :.: .. 
CCDS58 TMVQCFGHISGGHINPAVTVAMVCTRKISIAKSVFYIAAQCLGAIIGAGILYLVTPPSVV
               70        80        90       100       110       120

          120       130       140       150       160       170    
pF1KB6 GNLAVNALNNNTTQGQAMVVELILTFQLALCIFASTDSRRTSPVGSPALSIGLSVTLGHL
       :.:.:. ...: : :....::::.::::.. :::: ::.::. .:: ::.::.::..:::
CCDS58 GGLGVTMVHGNLTAGHGLLVELIITFQLVFTIFASCDSKRTDVTGSIALAIGFSVAIGHL
              130       140       150       160       170       180

          180       190       200       210       220              
pF1KB6 VGIYFTGCSMNPARSFGPAVVMNRFSPAHWVFWVGPIVGAVLAAILYFYLLFPN------
        .: .:: ::::::::::::.:. .   ::..:::::.:::::. :: :.. :.      
CCDS58 FAINYTGASMNPARSFGPAVIMGNWE-NHWIYWVGPIIGAVLAGGLYEYVFCPDVEFKRR
              190       200        210       220       230         

       230       240       250       260                           
pF1KB6 -SLSLSERVAIIKGTYEPDEDWEEQREERKKTMELTTR                      
        . ..:. .   ::.:   :: . : :                                 
CCDS58 FKEAFSKAAQQTKGSYMEVEDNRSQVETDDLILKPGVVHVIDVDRGEEKKGKDQSGEVLS
     240       250       260       270       280       290         

>>CCDS11889.1 AQP4 gene_id:361|Hs108|chr18                (323 aa)
 initn: 806 init1: 555 opt: 796  Z-score: 1001.1  bits: 193.2 E(32554): 1.9e-49
Smith-Waterman score: 796; 50.2% identity (77.2% similar) in 263 aa overlap (3-254:27-288)

                                       10        20        30      
pF1KB6                         MKKEVCSVAFLKAVFAEFLATLIFVFFGLGSALKWP
                                 : : . :: ::: ::::: ::::...:::...: 
CCDS11 MSDRPTARRWGKCGPLCTRENIMVAFKGVWTQAFWKAVTAEFLAMLIFVLLSLGSTINWG
               10        20        30        40        50        60

            40         50        60        70        80        90  
pF1KB6 SA---LPT-ILQIALAFGLAIGTLAQALGPVSGGHINPAITLALLVGNQISLLRAFFYVA
       ..   ::. .. :.: :::.:.:..: .: .::::::::.:.:..   .::. .. ::.:
CCDS11 GTEKPLPVDMVLISLCFGLSIATMVQCFGHISGGHINPAVTVAMVCTRKISIAKSVFYIA
               70        80        90       100       110       120

            100       110       120       130       140       150  
pF1KB6 AQLVGAIAGAGILYGVAPLNARGNLAVNALNNNTTQGQAMVVELILTFQLALCIFASTDS
       :: .::: :::::: :.: .. :.:.:. ...: : :....::::.::::.. :::: ::
CCDS11 AQCLGAIIGAGILYLVTPPSVVGGLGVTMVHGNLTAGHGLLVELIITFQLVFTIFASCDS
              130       140       150       160       170       180

            160       170       180       190       200       210  
pF1KB6 RRTSPVGSPALSIGLSVTLGHLVGIYFTGCSMNPARSFGPAVVMNRFSPAHWVFWVGPIV
       .::. .:: ::.::.::..::: .: .:: ::::::::::::.:. .   ::..:::::.
CCDS11 KRTDVTGSIALAIGFSVAIGHLFAINYTGASMNPARSFGPAVIMGNWE-NHWIYWVGPII
              190       200       210       220        230         

            220              230       240       250       260     
pF1KB6 GAVLAAILYFYLLFPN-------SLSLSERVAIIKGTYEPDEDWEEQREERKKTMELTTR
       :::::. :: :.. :.       . ..:. .   ::.:   :: . : :           
CCDS11 GAVLAGGLYEYVFCPDVEFKRRFKEAFSKAAQQTKGSYMEVEDNRSQVETDDLILKPGVV
     240       250       260       270       280       290         

CCDS11 HVIDVDRGEEKKGKDQSGEVLSSV
     300       310       320   

>>CCDS5431.1 AQP1 gene_id:358|Hs108|chr7                  (269 aa)
 initn: 742 init1: 524 opt: 751  Z-score: 945.8  bits: 182.7 E(32554): 2.3e-46
Smith-Waterman score: 751; 46.6% identity (77.2% similar) in 268 aa overlap (1-257:1-267)

               10        20        30               40        50   
pF1KB6 MKKEVCSVAFLKAVFAEFLATLIFVFFGLGSAL--KWP-----SALPTILQIALAFGLAI
       : .:  .  : .:: :::::: .:::...::::  :.:     .:.   ....:::::.:
CCDS54 MASEFKKKLFWRAVVAEFLATTLFVFISIGSALGFKYPVGNNQTAVQDNVKVSLAFGLSI
               10        20        30        40        50        60

            60        70        80        90       100       110   
pF1KB6 GTLAQALGPVSGGHINPAITLALLVGNQISLLRAFFYVAAQLVGAIAGAGILYGVAPLNA
       .::::..: .::.:.:::.::.::.. :::..::..:. :: ::::....:: :..   .
CCDS54 ATLAQSVGHISGAHLNPAVTLGLLLSCQISIFRALMYIIAQCVGAIVATAILSGITSSLT
               70        80        90       100       110       120

           120       130       140       150       160       170   
pF1KB6 RGNLAVNALNNNTTQGQAMVVELILTFQLALCIFASTDSRRTSPVGSPALSIGLSVTLGH
        ..:. : : .....::.. .:.: :.::.::..:.:: :: .  ::  :.:::::.:::
CCDS54 GNSLGRNDLADGVNSGQGLGIEIIGTLQLVLCVLATTDRRRRDLGGSAPLAIGLSVALGH
              130       140       150       160       170       180

           180       190       200       210       220       230   
pF1KB6 LVGIYFTGCSMNPARSFGPAVVMNRFSPAHWVFWVGPIVGAVLAAILYFYLLFPNSLSLS
       :..: .:::..::::::: ::. . ::  ::.:::::..:..::...: ..: : : .:.
CCDS54 LLAIDYTGCGINPARSFGSAVITHNFS-NHWIFWVGPFIGGALAVLIYDFILAPRSSDLT
              190       200        210       220       230         

            240          250       260     
pF1KB6 ERVAI-IKGT---YEPDEDWEEQREERKKTMELTTR
       .:: .  .:    :. : :  ..: : :        
CCDS54 DRVKVWTSGQVEEYDLDADDINSRVEMKPK      
     240       250       260               

>>CCDS82244.1 AQP4 gene_id:361|Hs108|chr18                (296 aa)
 initn: 678 init1: 465 opt: 576  Z-score: 725.8  bits: 142.1 E(32554): 4.2e-34
Smith-Waterman score: 612; 44.1% identity (68.8% similar) in 263 aa overlap (3-254:27-261)

                                       10        20        30      
pF1KB6                         MKKEVCSVAFLKAVFAEFLATLIFVFFGLGSALKWP
                                 : : . :: ::: ::::: ::::...:::...: 
CCDS82 MSDRPTARRWGKCGPLCTRENIMVAFKGVWTQAFWKAVTAEFLAMLIFVLLSLGSTINWG
               10        20        30        40        50        60

            40         50        60        70        80        90  
pF1KB6 SA---LPT-ILQIALAFGLAIGTLAQALGPVSGGHINPAITLALLVGNQISLLRAFFYVA
       ..   ::. .. :.: :::.:.:..: .: .::::::::.:.:..   .::. .. ::.:
CCDS82 GTEKPLPVDMVLISLCFGLSIATMVQCFGHISGGHINPAVTVAMVCTRKISIAKSVFYIA
               70        80        90       100       110       120

            100       110       120       130       140       150  
pF1KB6 AQLVGAIAGAGILYGVAPLNARGNLAVNALNNNTTQGQAMVVELILTFQLALCIFASTDS
       :: .::: :::::: :.: .. :.:.:. ...: : :....::::.::::.. :::: ::
CCDS82 AQCLGAIIGAGILYLVTPPSVVGGLGVTMVHGNLTAGHGLLVELIITFQLVFTIFASCDS
              130       140       150       160       170       180

            160       170       180       190       200       210  
pF1KB6 RRTSPVGSPALSIGLSVTLGHLVGIYFTGCSMNPARSFGPAVVMNRFSPAHWVFWVGPIV
       .::. .:: ::.::.::..::: .::                            :::::.
CCDS82 KRTDVTGSIALAIGFSVAIGHLFAIY----------------------------WVGPII
              190       200                                   210  

            220              230       240       250       260     
pF1KB6 GAVLAAILYFYLLFPN-------SLSLSERVAIIKGTYEPDEDWEEQREERKKTMELTTR
       :::::. :: :.. :.       . ..:. .   ::.:   :: . : :           
CCDS82 GAVLAGGLYEYVFCPDVEFKRRFKEAFSKAAQQTKGSYMEVEDNRSQVETDDLILKPGVV
            220       230       240       250       260       270  

CCDS82 HVIDVDRGEEKKGKDQSGEVLSSV
            280       290      

>>CCDS10626.1 AQP8 gene_id:343|Hs108|chr16                (261 aa)
 initn: 441 init1: 197 opt: 448  Z-score: 566.1  bits: 112.4 E(32554): 3.3e-25
Smith-Waterman score: 448; 37.7% identity (72.6% similar) in 215 aa overlap (10-220:34-244)

                                    10        20        30         
pF1KB6                      MKKEVCSVAFLKAVFAEFLATLIFVFFGLGSALKWPSAL
                                     :..  ..:.:.. .:.:.:  :...  .. 
CCDS10 EIAMCEPEFGNDKAREPSVGGRWRVSWYERFVQPCLVELLGSALFIFIGCLSVIE-NGTD
            10        20        30        40        50         60  

      40        50        60        70         80        90        
pF1KB6 PTILQIALAFGLAIGTLAQALGPVSGGHINPAITLA-LLVGNQISLLRAFFYVAAQLVGA
         .:: ::: :::.: .  .:: .::::.:::..:: .:.:. ..:.  . : ..::.:.
CCDS10 TGLLQPALAHGLALGLVIATLGNISGGHFNPAVSLAAMLIGG-LNLVMLLPYWVSQLLGG
             70        80        90       100        110       120 

      100       110       120       130          140       150     
pF1KB6 IAGAGILYGVAPLNARGNLAVNALNNNTTQGQ---AMVVELILTFQLALCIFASTDSRRT
       . ::..  .:.: .   : .  :. .   :::   :.:.:.:::  ::: .  .. ...:
CCDS10 MLGAALAKAVSPEERFWNASGAAFVTVQEQGQVAGALVAEIILTTLLALAVCMGAINEKT
             130       140       150       160       170       180 

         160       170       180       190       200       210     
pF1KB6 SPVGSPALSIGLSVTLGHLVGIYFTGCSMNPARSFGPAVVMNRFSPAHWVFWVGPIVGAV
       .   .: .:::..::.  :.:   .:  :::::.:::::: :...  ::..:.::.....
CCDS10 KGPLAP-FSIGFAVTVDILAGGPVSGGCMNPARAFGPAVVANHWN-FHWIYWLGPLLAGL
              190       200       210       220        230         

         220       230       240       250       260     
pF1KB6 LAAILYFYLLFPNSLSLSERVAIIKGTYEPDEDWEEQREERKKTMELTTR
       :...:                                             
CCDS10 LVGLLIRCFIGDGKTRLILKAR                            
     240       250       260                             

>>CCDS55098.1 AQP1 gene_id:358|Hs108|chr7                 (186 aa)
 initn: 414 init1: 281 opt: 421  Z-score: 534.4  bits: 106.1 E(32554): 1.9e-23
Smith-Waterman score: 421; 44.8% identity (75.3% similar) in 154 aa overlap (110-257:32-184)

      80        90       100       110       120         130       
pF1KB6 NQISLLRAFFYVAAQLVGAIAGAGILYGVAPLNARGNLAVNA--LNNNTTQGQAMVVELI
                                     ::.  : .. ..  : .....::.. .:.:
CCDS55 PGARPLPLVLVPQNTLAWMQLDAKAPAHPRPLQLLGRVGPGSRQLADGVNSGQGLGIEII
              10        20        30        40        50        60 

       140       150       160       170       180       190       
pF1KB6 LTFQLALCIFASTDSRRTSPVGSPALSIGLSVTLGHLVGIYFTGCSMNPARSFGPAVVMN
        :.::.::..:.:: :: .  ::  :.:::::.::::..: .:::..::::::: ::. .
CCDS55 GTLQLVLCVLATTDRRRRDLGGSAPLAIGLSVALGHLLAIDYTGCGINPARSFGSAVITH
              70        80        90       100       110       120 

       200       210       220       230        240          250   
pF1KB6 RFSPAHWVFWVGPIVGAVLAAILYFYLLFPNSLSLSERVAI-IKGT---YEPDEDWEEQR
        ::  ::.:::::..:..::...: ..: : : .:..:: .  .:    :. : :  ..:
CCDS55 NFS-NHWIFWVGPFIGGALAVLIYDFILAPRSSDLTDRVKVWTSGQVEEYDLDADDINSR
              130       140       150       160       170       180

           260     
pF1KB6 EERKKTMELTTR
        : :        
CCDS55 VEMKPK      
                   




265 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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 start: Fri Nov  4 22:46:49 2016 done: Fri Nov  4 22:46:49 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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